FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE1172, 628 aa 1>>>pF1KE1172 628 - 628 aa - 628 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.6846+/-0.00207; mu= 14.7135+/- 0.124 mean_var=297.5984+/-58.495, 0's: 0 Z-trim(103.7): 995 B-trim: 30 in 1/52 Lambda= 0.074346 statistics sampled from 6435 (7514) to 6435 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.543), E-opt: 0.2 (0.231), width: 16 Scan time: 3.390 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS33091.1 ZNF528 gene_id:84436|Hs108|chr19 ( 628) 4436 491.1 1.8e-138 CCDS46164.1 ZNF880 gene_id:400713|Hs108|chr19 ( 577) 2770 312.4 1.1e-84 CCDS82391.1 ZNF160 gene_id:90338|Hs108|chr19 ( 782) 2262 258.1 3.2e-68 CCDS12859.1 ZNF160 gene_id:90338|Hs108|chr19 ( 818) 2262 258.2 3.3e-68 CCDS12854.1 ZNF83 gene_id:55769|Hs108|chr19 ( 516) 2168 247.7 2.8e-65 CCDS33097.1 ZNF347 gene_id:84671|Hs108|chr19 ( 839) 2110 241.9 2.7e-63 CCDS54314.1 ZNF347 gene_id:84671|Hs108|chr19 ( 840) 2110 241.9 2.7e-63 CCDS12503.1 ZNF569 gene_id:148266|Hs108|chr19 ( 686) 2102 240.9 4.4e-63 CCDS46167.1 ZNF808 gene_id:388558|Hs108|chr19 ( 903) 2095 240.3 8.4e-63 CCDS46169.1 ZNF665 gene_id:79788|Hs108|chr19 ( 678) 2064 236.8 7.3e-62 CCDS59372.1 ZNF726 gene_id:730087|Hs108|chr19 ( 616) 2061 236.4 8.7e-62 CCDS46172.1 ZNF813 gene_id:126017|Hs108|chr19 ( 617) 2043 234.5 3.3e-61 CCDS46162.1 ZNF836 gene_id:162962|Hs108|chr19 ( 936) 2012 231.4 4.1e-60 CCDS12851.1 ZNF610 gene_id:162963|Hs108|chr19 ( 462) 2001 229.7 6.5e-60 CCDS74322.1 ZNF91 gene_id:7644|Hs108|chr19 (1159) 2006 230.9 7.1e-60 CCDS42541.1 ZNF91 gene_id:7644|Hs108|chr19 (1191) 2006 231.0 7.2e-60 CCDS33090.1 ZNF616 gene_id:90317|Hs108|chr19 ( 781) 2001 230.1 8.5e-60 CCDS32983.1 ZNF254 gene_id:9534|Hs108|chr19 ( 659) 1995 229.4 1.2e-59 CCDS12498.1 ZNF420 gene_id:147923|Hs108|chr19 ( 688) 1990 228.9 1.8e-59 CCDS4624.1 ZNF184 gene_id:7738|Hs108|chr6 ( 751) 1986 228.5 2.5e-59 CCDS74472.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 616) 1984 228.1 2.7e-59 CCDS74471.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 658) 1984 228.2 2.8e-59 CCDS12970.2 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 670) 1984 228.2 2.8e-59 CCDS54329.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 682) 1984 228.2 2.8e-59 CCDS46170.1 ZNF845 gene_id:91664|Hs108|chr19 ( 970) 1973 227.3 7.6e-59 CCDS42537.1 ZNF429 gene_id:353088|Hs108|chr19 ( 674) 1959 225.5 1.8e-58 CCDS74350.1 ZNF850 gene_id:342892|Hs108|chr19 (1058) 1960 225.9 2.1e-58 CCDS59379.1 ZNF850 gene_id:342892|Hs108|chr19 (1090) 1960 226.0 2.1e-58 CCDS54258.1 ZNF540 gene_id:163255|Hs108|chr19 ( 628) 1955 225.0 2.3e-58 CCDS46166.1 ZNF534 gene_id:147658|Hs108|chr19 ( 661) 1947 224.2 4.3e-58 CCDS46165.1 ZNF534 gene_id:147658|Hs108|chr19 ( 674) 1947 224.2 4.4e-58 CCDS33096.1 ZNF816 gene_id:125893|Hs108|chr19 ( 651) 1946 224.1 4.6e-58 CCDS33093.2 ZNF28 gene_id:7576|Hs108|chr19 ( 718) 1941 223.6 7.1e-58 CCDS46102.1 ZNF226 gene_id:7769|Hs108|chr19 ( 803) 1941 223.7 7.5e-58 CCDS82388.1 ZNF841 gene_id:284371|Hs108|chr19 ( 808) 1930 222.5 1.7e-57 CCDS46161.1 ZNF841 gene_id:284371|Hs108|chr19 ( 924) 1930 222.6 1.8e-57 CCDS42539.1 ZNF676 gene_id:163223|Hs108|chr19 ( 588) 1920 221.2 3e-57 CCDS11180.1 ZNF624 gene_id:57547|Hs108|chr17 ( 865) 1921 221.6 3.4e-57 CCDS56092.1 ZNF568 gene_id:374900|Hs108|chr19 ( 580) 1914 220.6 4.7e-57 CCDS59367.1 ZNF43 gene_id:7594|Hs108|chr19 ( 803) 1915 220.9 5.2e-57 CCDS12413.2 ZNF43 gene_id:7594|Hs108|chr19 ( 809) 1915 220.9 5.2e-57 CCDS74321.1 ZNF43 gene_id:7594|Hs108|chr19 ( 818) 1915 220.9 5.2e-57 CCDS46784.1 ZNF860 gene_id:344787|Hs108|chr3 ( 632) 1911 220.3 6.2e-57 CCDS31940.1 ZNF84 gene_id:7637|Hs108|chr12 ( 738) 1905 219.8 1e-56 CCDS75846.1 ZNF658 gene_id:26149|Hs108|chr9 (1059) 1906 220.2 1.2e-56 CCDS42636.1 ZNF17 gene_id:7565|Hs108|chr19 ( 662) 1899 219.1 1.5e-56 CCDS46045.1 ZNF30 gene_id:90075|Hs108|chr19 ( 623) 1895 218.6 2e-56 CCDS46044.1 ZNF30 gene_id:90075|Hs108|chr19 ( 624) 1895 218.6 2e-56 CCDS59368.1 ZNF729 gene_id:100287226|Hs108|chr19 (1252) 1899 219.5 2.1e-56 CCDS77297.1 ZNF546 gene_id:339327|Hs108|chr19 ( 810) 1894 218.7 2.5e-56 >>CCDS33091.1 ZNF528 gene_id:84436|Hs108|chr19 (628 aa) initn: 4436 init1: 4436 opt: 4436 Z-score: 2599.4 bits: 491.1 E(32554): 1.8e-138 Smith-Waterman score: 4436; 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CCDS82 MLENYWNLVSLGLCHFDMNIISMLEEGKEPWTVK 10 20 30 80 90 pF1KE1 SEEKIANDPDGRECIKGVNT--------------ERSSK--------------------- : ::: : ::.::: : :.:: CCDS82 SCVKIARKPRTPECVKGVVTDIPPKCTIKDLLPKEKSSTEAVFHTVVLERHESPDIEDFS 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE1 ------------------LGSNAG-------------------NKPCKNQLGFTFQLHLS :. : :: .:::: .:. :: CCDS82 FKEPQKNVHDFECQWRDDTGNYKGVLMAQKEGKRDQRDRRDIENKLMNNQLGVSFHSHLP 100 110 120 130 140 150 120 130 140 150 160 170 pF1KE1 DLQLFQAERKISGCKHFEKPVSDNSSVSPLEKISSSVKSHLLNKYRNNFDHAPLLPQEQK .:::::.: :. :.. :: ....::::::..: :::..: .:: ....: :: :..: CCDS82 ELQLFQGEGKMYECNQVEKSTNNGSSVSPLQQIPSSVQTHRSKKY-HELNHFSLLTQRRK 160 170 180 190 200 210 180 190 200 210 220 230 pF1KE1 AHIREKAYKCNEHGQVFRASASLTNQV-IHNADNPYKCSECGKVFSCSSKLVIHRRMHTG :. : ::::: :..: ...::.. ::....:::::::::.:. :.:.::. .::: CCDS82 ANSCGKPYKCNECGKAFTQNSNLTSHRRIHSGEKPYKCSECGKTFTVRSNLTIHQVIHTG 220 230 240 250 260 270 240 250 260 270 280 290 pF1KE1 EKPYKCHECGKLFSSNSNLSQHQRIHTGEKPYKCHECDKVFRSSSKLAQHQRIHTGEKPY :::::::::::.: :: :. :.:::::::::::.:: :.::. :.:. :: :::::::. 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CCDS82 CGKVFRYNSYLGRHRRVHTGEKPYKCNECGKAFSMHSNLATHQVIHTGTKPFKCNECSKV 400 410 420 430 440 450 420 430 440 450 460 470 pF1KE1 FSQKSDLIRHRKTHTDEKPYKCNKCGTAFREFSDLTAHFLIHSGEKPYECKECGKVFRYK :.:.:.: ::. :: :::::::.:: :: :.::.: ::::::::.: :::: : : CCDS82 FTQNSQLANHRRIHTGEKPYKCNECGKAFSVRSSLTTHQAIHSGEKPYKCIECGKSFTQK 460 470 480 490 500 510 480 490 500 510 520 530 pF1KE1 SSLTSHHRIHTGEKPYKCNRCGKVFSRSSNLVCHQKIHTGEKPYKCNQCGKVFNQASYLT : : ::. ::.::::::::.:::::...:.:. : ..::::::::::.::..:.. : :: CCDS82 SHLRSHRGIHSGEKPYKCNECGKVFAQTSQLARHWRVHTGEKPYKCNDCGRAFSDRSSLT 520 530 540 550 560 570 540 550 560 570 580 590 pF1KE1 RHQIIHTGERPYRCSKCGKAFRGCSGLTAHLAIHTEKKSHECKECGKIFTQKSSLTNHHR :: :::::.::.: .:::.:: : :..: ::: .: ..:.:::: :...:.::.:. CCDS82 FHQAIHTGEKPYKCHECGKVFRHNSYLATHRRIHTGEKPYKCNECGKAFSMHSNLTTHKV 580 590 600 610 620 630 600 610 620 pF1KE1 IHIGEKPYKCTLCSKVFSHNSDLAQHQRVHS :: :::::::. :.:::..:: ::.:::.:. 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CCDS33 TGEKPYKCNECGKVFTQNSHLARHRGIHTGEKPYKCNECGKVFRHNSYLSRHQRIHTGEK 570 580 590 600 610 620 550 560 570 580 590 600 pF1KE1 PYRCSKCGKAFRGCSGLTAHLAIHTEKKSHECKECGKIFTQKSSLTNHHRIHIGEKPYKC ::. .. :::: :.::.: .::: .: ..:.::::.:::.: :. :.:.: : :::.: CCDS33 PYKYNEYGKAFSEHSNLTTHQVIHTGEKPYKCNECGKVFTQNSHLARHRRVHTGGKPYQC 630 640 650 660 670 680 610 620 pF1KE1 TLCSKVFSHNSDLAQHQRVHS . :.:.::..: ::.:::::. CCDS33 NECGKAFSQTSKLARHQRVHTGEKPYECNQCGKAFSVRSSLTTHQAIHTGKKPYKCNECG 690 700 710 720 730 740 >-- initn: 1829 init1: 496 opt: 563 Z-score: 353.2 bits: 75.9 E(32554): 2.4e-13 Smith-Waterman score: 583; 67.2% identity (83.2% similar) in 119 aa overlap (265-383:705-820) 240 250 260 270 280 290 pF1KE1 HTGEKPYKCHECGKLFSSNSNLSQHQRIHTGEKPYKCHECDKVFRSSSKLAQHQRIHTGE :::::.:..: :.: :.:. :: ::::. 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CCDS54 HTGGKPYQCNECGKAFSQTSKLARHQRVHTGEKPYECNQCGKAFSVRSSLTTHQAIHTGK 680 690 700 710 720 730 300 310 320 330 340 350 pF1KE1 KPYKCHECDKVFNQIAHLVRHQKIHTGEKPYSCNKCGKVFSRHSYLAEHQTVHTGEKPYK :::::.:: :::.: .::.::. ::::::::.::.:::.::. : ::.:: .::::::: CCDS54 KPYKCNECGKVFTQNSHLARHRGIHTGEKPYKCNECGKAFSQTSKLARHQRIHTGEKPY- 740 750 760 770 780 790 360 370 380 390 400 410 pF1KE1 CEECGKAFSVRSSLITHQLIHTGRKPYKCKECDKVFGRKCFLTSHQRIHTRERPYGCSQC :::: ::. ::: ::: :::: ::::: CCDS54 --ECGKPFSICSSLTTHQTIHTGGKPYKCNVWKVLKSEFKPCKPSQNS 800 810 820 830 840 >>CCDS12503.1 ZNF569 gene_id:148266|Hs108|chr19 (686 aa) initn: 7185 init1: 1851 opt: 2102 Z-score: 1246.1 bits: 240.9 E(32554): 4.4e-63 Smith-Waterman score: 2123; 48.3% identity (73.8% similar) in 640 aa overlap (1-628:1-629) 10 20 30 40 50 60 pF1KE1 MALTQGPLKFMDVAIEFSQEEWKCLDPAQRTLYRDVMLENYRNLVSLGICLPDLSVTSML :. .:: . : ::::.:.::::: :::::: :::.:::::: ::...: . .: : CCDS12 MTESQGTVTFKDVAIDFTQEEWKRLDPAQRKLYRNVMLENYNNLITVGYPFTKPDVIFKL 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 pF1KE1 EQKRDPWTLQSE--------EKIANDPDGRE---CIKGVNTERSSKLGSNAGNKPCKNQL ::...::... : : . : .. .. :... .. : . ::. :.... CCDS12 EQEEEPWVMEEEVLRRHWQGEIWGVDEHQKNQDRLLRQVEVKFQKTLTEEKGNE-CQKKF 70 80 90 100 110 110 120 130 140 150 160 pF1KE1 GFTFQLHLSDLQLFQAERKISGCKHFEKPVSDNSSVSPLEKISSSVKSHLLNKYRNNFDH . .: :. ::. : ..... : : . : . ..:: :. : . .... CCDS12 ANVFPLN-SDF--FPSRHNLYEYDLFGKCLEHNFDCH------NNVKC-LMRKEHCEYNE 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 pF1KE1 APLLPQEQKAHIREKAYKCNEHGQVFRASASLTNQV-IHNADNPYKCSECGKVFSCSSKL ....:. .:::. :. : . .: .. ::....::.::.: :.:: . :: CCDS12 PVKSYGNSSSHFVITPFKCNHCGKGFNQTLDLIRHLRIHTGEKPYECSNCRKAFSHKEKL 170 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 pF1KE1 VIHRRMHTGEKPYKCHECGKLFSSNSNLSQHQRIHTGEKPYKCHECDKVFRSSSKLAQHQ . : ..:. :. :::.:::: : . ::: .::::::::::: :.::.: : ..:.: .:. CCDS12 IKHYKIHSREQSYKCNECGKAFIKMSNLIRHQRIHTGEKPYACKECEKSFSQKSNLIDHE 230 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 pF1KE1 RIHTGEKPYKCHECDKVFNQIAHLVRHQKIHTGEKPYSCNKCGKVFSRHSYLAEHQTVHT .::::::::.:.:: :.:.: :. :::.:::::::.::.:::.: : . :: :. :: CCDS12 KIHTGEKPYECNECGKAFSQKQSLIAHQKVHTGEKPYACNECGKAFPRIASLALHMRSHT 290 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 pF1KE1 GEKPYKCEECGKAFSVRSSLITHQLIHTGRKPYKCKECDKVFGRKCFLTSHQRIHTRERP :::::::..:::::: : :: : ::::.:::.:.:: :.:... :: :.: :: :.: CCDS12 GEKPYKCDKCGKAFSQFSMLIIHVRIHTGEKPYECNECGKAFSQSSALTVHMRSHTGEKP 350 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 pF1KE1 YGCSQCGKIFSQKSDLIRHRKTHTDEKPYKCNKCGTAFREFSDLTAHFLIHSGEKPYECK : :..: : ::.:...: :.: :: ::::.::.:: :: ..:.:. : ::.::::: :: CCDS12 YECKECRKAFSHKKNFITHQKIHTREKPYECNECGKAFIQMSNLVRHQRIHTGEKPYICK 410 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 pF1KE1 ECGKVFRYKSSLTSHHRIHTGEKPYKCNRCGKVFSRSSNLVCHQKIHTGEKPYKCNQCGK ::::.: ::.: .:..::.:::::.::.:::.::...:.. :::.::::::: ::.::: CCDS12 ECGKAFSQKSNLIAHEKIHSGEKPYECNECGKAFSQKQNFITHQKVHTGEKPYDCNECGK 470 480 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 pF1KE1 VFNQASYLTRHQIIHTGERPYRCSKCGKAFRGCSGLTAHLAIHTEKKSHECKECGKIFTQ .:.: . :: : ::::.::.:.:::::: :: :. :. :: .: . :.:::: :.: CCDS12 AFSQIASLTLHLRSHTGEKPYECDKCGKAFSQCSLLNLHMRSHTGEKPYVCNECGKAFSQ 530 540 550 560 570 580 590 600 610 620 pF1KE1 KSSLTNHHRIHIGEKPYKCTLCSKVFSHNSDLAQHQRVHS ..:: : : : :::::.:. :.:.::..:.:. : : :. 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CCDS46 ERNGHEAPTTKIKKLTGSTDQHDHRHAGNKPIKDQLGSSFYSHLPELHIFQIKGEIAN-- 130 140 150 160 170 140 150 160 170 180 190 pF1KE1 HFEKPVSDNSSVSPLEKISSSVKSHLLNKYRNNFDHAPLLPQEQKAHIREKAYKCNEHGQ ..:: .:: :::: ..:: . :. :.: :: .. ::::.:..:.:::.. ::: :. CCDS46 QLEKSTSDASSVSTSQRISCRPQIHISNNYGNNPLNSSLLPQKQEVHMREKSFPCNESGK 180 190 200 210 220 230 200 210 220 230 240 250 pF1KE1 VFRASASLT-NQVIHNADNPYKCSECGKVFSCSSKLVIHRRMHTGEKPYKCHECGKLFSS .: :. : .:. : .:. :::. :::.:. .. :. ::: :::::::::.:::: :: CCDS46 AFNCSSLLRKHQIPHLGDKQYKCDVCGKLFNHKQYLACHRRCHTGEKPYKCKECGKSFSY 240 250 260 270 280 290 260 270 280 290 300 310 pF1KE1 NSNLSQHQRIHTGEKPYKCHECDKVFRSSSKLAQHQRIHTGEKPYKCHECDKVFNQIAHL .:.:. :.:.::: :::::.:: ::::..: :. :. ::::::::::.:: :.::: .:: CCDS46 KSSLTCHHRLHTGVKPYKCNECGKVFRQNSALVIHKAIHTGEKPYKCNECGKAFNQQSHL 300 310 320 330 340 350 320 330 340 350 360 370 pF1KE1 VRHQKIHTGEKPYSCNKCGKVFSRHSYLAEHQTVHTGEKPYKCEECGKAFSVRSSLITHQ :::..::: :::.:. : :.:. :::::.: .:.::: :::.::::::. .::: :. 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