Result of FASTA (ccds) for pFN21AE5622
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KE5622, 536 aa
  1>>>pF1KE5622 536 - 536 aa - 536 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.2254+/-0.00103; mu= 5.1004+/- 0.062
 mean_var=145.7213+/-29.201, 0's: 0 Z-trim(108.3): 37  B-trim: 4 in 1/51
 Lambda= 0.106246
 statistics sampled from 10096 (10120) to 10096 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.666), E-opt: 0.2 (0.311), width:  16
 Scan time:  2.660

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS60052.1 EYA3 gene_id:2140|Hs108|chr1           ( 536) 3459 542.1 5.9e-154
CCDS60051.1 EYA3 gene_id:2140|Hs108|chr1           ( 527) 3234 507.7 1.4e-143
CCDS60050.1 EYA3 gene_id:2140|Hs108|chr1           ( 520) 2476 391.5 1.3e-108
CCDS316.1 EYA3 gene_id:2140|Hs108|chr1             ( 573) 2476 391.5 1.4e-108
CCDS75523.1 EYA4 gene_id:2070|Hs108|chr6           ( 585) 1496 241.3 2.4e-63
CCDS5166.1 EYA4 gene_id:2070|Hs108|chr6            ( 639) 1496 241.3 2.6e-63
CCDS75521.1 EYA4 gene_id:2070|Hs108|chr6           ( 645) 1487 239.9 6.8e-63
CCDS43506.1 EYA4 gene_id:2070|Hs108|chr6           ( 616) 1479 238.7 1.5e-62
CCDS5165.1 EYA4 gene_id:2070|Hs108|chr6            ( 639) 1479 238.7 1.6e-62
CCDS75750.1 EYA1 gene_id:2138|Hs108|chr8           ( 586) 1455 235.0 1.9e-61
CCDS47873.1 EYA1 gene_id:2138|Hs108|chr8           ( 559) 1443 233.1 6.4e-61
CCDS34906.1 EYA1 gene_id:2138|Hs108|chr8           ( 592) 1443 233.1 6.8e-61
CCDS13403.1 EYA2 gene_id:2139|Hs108|chr20          ( 538) 1302 211.5   2e-54
CCDS34907.1 EYA1 gene_id:2138|Hs108|chr8           ( 557)  931 154.7 2.7e-37
CCDS54471.1 EYA2 gene_id:2139|Hs108|chr20          ( 459)  798 134.2 3.1e-31


>>CCDS60052.1 EYA3 gene_id:2140|Hs108|chr1                (536 aa)
 initn: 3459 init1: 3459 opt: 3459  Z-score: 2877.5  bits: 542.1 E(32554): 5.9e-154
Smith-Waterman score: 3459; 100.0% identity (100.0% similar) in 536 aa overlap (1-536:1-536)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE5 MEEEQDLPEQPVKKAKMQESGEQTISQVSNPDVSDQKPETSSLASNLPMSEEIMTCTDYI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 MEEEQDLPEQPVKKAKMQESGEQTISQVSNPDVSDQKPETSSLASNLPMSEEIMTCTDYI
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE5 PRSSNDYTSQMYSAKPYAHILSVPVSETAYPGQTQYQTLQQTQPYAVYPQATQTYGLPPF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 PRSSNDYTSQMYSAKPYAHILSVPVSETAYPGQTQYQTLQQTQPYAVYPQATQTYGLPPF
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE5 ASSTNASLISTSSTIANIPAAAVASISNQDYPTYTILGQNQYQACYPSSSFGVTGQTNSD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 ASSTNASLISTSSTIANIPAAAVASISNQDYPTYTILGQNQYQACYPSSSFGVTGQTNSD
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE5 AESTTLAATTYQSEKPSVMAPAPAAQRLSSGDPSTSPSLSQTTPSKDTDDQSRKNMTSKN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 AESTTLAATTYQSEKPSVMAPAPAAQRLSSGDPSTSPSLSQTTPSKDTDDQSRKNMTSKN
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE5 RGKRKADATSSQDSELERVFLWDLDETIIIFHSLLTGSYAQKYGKDPTVVIGSGLTMEEM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 RGKRKADATSSQDSELERVFLWDLDETIIIFHSLLTGSYAQKYGKDPTVVIGSGLTMEEM
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE5 IFEVADTHLFFNDLEECDQVHVEDVASDDNGQDLSNYSFSTDGFSGSGGSGSHGSSVGVQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 IFEVADTHLFFNDLEECDQVHVEDVASDDNGQDLSNYSFSTDGFSGSGGSGSHGSSVGVQ
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KE5 GGVDWMRKLAFRYRKVREIYDKHKSNVGGLLSPQRKEALQRLRAEIEVLTDSWLGTALKS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 GGVDWMRKLAFRYRKVREIYDKHKSNVGGLLSPQRKEALQRLRAEIEVLTDSWLGTALKS
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KE5 LLLIQSRKNCVNVLITTTQLVPALAKVLLYGLGEIFPIENIYSATKIGKESCFERIVSRF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 LLLIQSRKNCVNVLITTTQLVPALAKVLLYGLGEIFPIENIYSATKIGKESCFERIVSRF
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530      
pF1KE5 GKKVTYVVIGDGRDEEIAAKQQLYFLDMEALGCQLEPTALILFIQLSGNLSNYNKL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 GKKVTYVVIGDGRDEEIAAKQQLYFLDMEALGCQLEPTALILFIQLSGNLSNYNKL
              490       500       510       520       530      

>>CCDS60051.1 EYA3 gene_id:2140|Hs108|chr1                (527 aa)
 initn: 3313 init1: 3234 opt: 3234  Z-score: 2691.2  bits: 507.7 E(32554): 1.4e-143
Smith-Waterman score: 3234; 99.8% identity (100.0% similar) in 502 aa overlap (1-502:1-502)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE5 MEEEQDLPEQPVKKAKMQESGEQTISQVSNPDVSDQKPETSSLASNLPMSEEIMTCTDYI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 MEEEQDLPEQPVKKAKMQESGEQTISQVSNPDVSDQKPETSSLASNLPMSEEIMTCTDYI
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE5 PRSSNDYTSQMYSAKPYAHILSVPVSETAYPGQTQYQTLQQTQPYAVYPQATQTYGLPPF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 PRSSNDYTSQMYSAKPYAHILSVPVSETAYPGQTQYQTLQQTQPYAVYPQATQTYGLPPF
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE5 ASSTNASLISTSSTIANIPAAAVASISNQDYPTYTILGQNQYQACYPSSSFGVTGQTNSD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 ASSTNASLISTSSTIANIPAAAVASISNQDYPTYTILGQNQYQACYPSSSFGVTGQTNSD
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE5 AESTTLAATTYQSEKPSVMAPAPAAQRLSSGDPSTSPSLSQTTPSKDTDDQSRKNMTSKN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 AESTTLAATTYQSEKPSVMAPAPAAQRLSSGDPSTSPSLSQTTPSKDTDDQSRKNMTSKN
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE5 RGKRKADATSSQDSELERVFLWDLDETIIIFHSLLTGSYAQKYGKDPTVVIGSGLTMEEM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 RGKRKADATSSQDSELERVFLWDLDETIIIFHSLLTGSYAQKYGKDPTVVIGSGLTMEEM
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE5 IFEVADTHLFFNDLEECDQVHVEDVASDDNGQDLSNYSFSTDGFSGSGGSGSHGSSVGVQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 IFEVADTHLFFNDLEECDQVHVEDVASDDNGQDLSNYSFSTDGFSGSGGSGSHGSSVGVQ
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KE5 GGVDWMRKLAFRYRKVREIYDKHKSNVGGLLSPQRKEALQRLRAEIEVLTDSWLGTALKS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 GGVDWMRKLAFRYRKVREIYDKHKSNVGGLLSPQRKEALQRLRAEIEVLTDSWLGTALKS
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KE5 LLLIQSRKNCVNVLITTTQLVPALAKVLLYGLGEIFPIENIYSATKIGKESCFERIVSRF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 LLLIQSRKNCVNVLITTTQLVPALAKVLLYGLGEIFPIENIYSATKIGKESCFERIVSRF
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530      
pF1KE5 GKKVTYVVIGDGRDEEIAAKQQLYFLDMEALGCQLEPTALILFIQLSGNLSNYNKL
       :::::::::::::::::::::.                                  
CCDS60 GKKVTYVVIGDGRDEEIAAKQHNMPFWRITNHGDLVSLHQALELDFL         
              490       500       510       520                

>>CCDS60050.1 EYA3 gene_id:2140|Hs108|chr1                (520 aa)
 initn: 2978 init1: 2439 opt: 2476  Z-score: 2063.4  bits: 391.5 E(32554): 1.3e-108
Smith-Waterman score: 2795; 90.5% identity (90.7% similar) in 495 aa overlap (54-502:1-495)

            30        40        50        60        70        80   
pF1KE5 TISQVSNPDVSDQKPETSSLASNLPMSEEIMTCTDYIPRSSNDYTSQMYSAKPYAHILSV
                                     ::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60                               MTCTDYIPRSSNDYTSQMYSAKPYAHILSV
                                             10        20        30

            90       100       110       120                       
pF1KE5 PVSETAYPGQTQYQTLQQTQPYAVYPQATQTYGLPPF-----------------------
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::                       
CCDS60 PVSETAYPGQTQYQTLQQTQPYAVYPQATQTYGLPPFGALWPGMKPESGLIQTPSPSQHS
               40        50        60        70        80        90

                                     130       140       150       
pF1KE5 -----------------------ASSTNASLISTSSTIANIPAAAVASISNQDYPTYTIL
                              :::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 VLTCTTGLTTSQPSPAHYSYPIQASSTNASLISTSSTIANIPAAAVASISNQDYPTYTIL
              100       110       120       130       140       150

       160       170       180       190       200       210       
pF1KE5 GQNQYQACYPSSSFGVTGQTNSDAESTTLAATTYQSEKPSVMAPAPAAQRLSSGDPSTSP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 GQNQYQACYPSSSFGVTGQTNSDAESTTLAATTYQSEKPSVMAPAPAAQRLSSGDPSTSP
              160       170       180       190       200       210

       220       230       240       250       260       270       
pF1KE5 SLSQTTPSKDTDDQSRKNMTSKNRGKRKADATSSQDSELERVFLWDLDETIIIFHSLLTG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 SLSQTTPSKDTDDQSRKNMTSKNRGKRKADATSSQDSELERVFLWDLDETIIIFHSLLTG
              220       230       240       250       260       270

       280       290       300       310       320       330       
pF1KE5 SYAQKYGKDPTVVIGSGLTMEEMIFEVADTHLFFNDLEECDQVHVEDVASDDNGQDLSNY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 SYAQKYGKDPTVVIGSGLTMEEMIFEVADTHLFFNDLEECDQVHVEDVASDDNGQDLSNY
              280       290       300       310       320       330

       340       350       360       370       380       390       
pF1KE5 SFSTDGFSGSGGSGSHGSSVGVQGGVDWMRKLAFRYRKVREIYDKHKSNVGGLLSPQRKE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 SFSTDGFSGSGGSGSHGSSVGVQGGVDWMRKLAFRYRKVREIYDKHKSNVGGLLSPQRKE
              340       350       360       370       380       390

       400       410       420       430       440       450       
pF1KE5 ALQRLRAEIEVLTDSWLGTALKSLLLIQSRKNCVNVLITTTQLVPALAKVLLYGLGEIFP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 ALQRLRAEIEVLTDSWLGTALKSLLLIQSRKNCVNVLITTTQLVPALAKVLLYGLGEIFP
              400       410       420       430       440       450

       460       470       480       490       500       510       
pF1KE5 IENIYSATKIGKESCFERIVSRFGKKVTYVVIGDGRDEEIAAKQQLYFLDMEALGCQLEP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.               
CCDS60 IENIYSATKIGKESCFERIVSRFGKKVTYVVIGDGRDEEIAAKQHNMPFWRITNHGDLVS
              460       470       480       490       500       510

       520       530      
pF1KE5 TALILFIQLSGNLSNYNKL
                          
CCDS60 LHQALELDFL         
              520         

>>CCDS316.1 EYA3 gene_id:2140|Hs108|chr1                  (573 aa)
 initn: 3268 init1: 2439 opt: 2476  Z-score: 2062.7  bits: 391.5 E(32554): 1.4e-108
Smith-Waterman score: 3037; 91.2% identity (91.4% similar) in 534 aa overlap (15-502:15-548)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE5 MEEEQDLPEQPVKKAKMQESGEQTISQVSNPDVSDQKPETSSLASNLPMSEEIMTCTDYI
                     ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MEEEQDLPEQPVKKAKMQESGEQTISQVSNPDVSDQKPETSSLASNLPMSEEIMTCTDYI
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE5 PRSSNDYTSQMYSAKPYAHILSVPVSETAYPGQTQYQTLQQTQPYAVYPQATQTYGLPPF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 PRSSNDYTSQMYSAKPYAHILSVPVSETAYPGQTQYQTLQQTQPYAVYPQATQTYGLPPF
               70        80        90       100       110       120

                                                            130    
pF1KE5 ----------------------------------------------ASSTNASLISTSST
                                                     ::::::::::::::
CCDS31 GALWPGMKPESGLIQTPSPSQHSVLTCTTGLTTSQPSPAHYSYPIQASSTNASLISTSST
              130       140       150       160       170       180

          140       150       160       170       180       190    
pF1KE5 IANIPAAAVASISNQDYPTYTILGQNQYQACYPSSSFGVTGQTNSDAESTTLAATTYQSE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 IANIPAAAVASISNQDYPTYTILGQNQYQACYPSSSFGVTGQTNSDAESTTLAATTYQSE
              190       200       210       220       230       240

          200       210       220       230       240       250    
pF1KE5 KPSVMAPAPAAQRLSSGDPSTSPSLSQTTPSKDTDDQSRKNMTSKNRGKRKADATSSQDS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 KPSVMAPAPAAQRLSSGDPSTSPSLSQTTPSKDTDDQSRKNMTSKNRGKRKADATSSQDS
              250       260       270       280       290       300

          260       270       280       290       300       310    
pF1KE5 ELERVFLWDLDETIIIFHSLLTGSYAQKYGKDPTVVIGSGLTMEEMIFEVADTHLFFNDL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 ELERVFLWDLDETIIIFHSLLTGSYAQKYGKDPTVVIGSGLTMEEMIFEVADTHLFFNDL
              310       320       330       340       350       360

          320       330       340       350       360       370    
pF1KE5 EECDQVHVEDVASDDNGQDLSNYSFSTDGFSGSGGSGSHGSSVGVQGGVDWMRKLAFRYR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 EECDQVHVEDVASDDNGQDLSNYSFSTDGFSGSGGSGSHGSSVGVQGGVDWMRKLAFRYR
              370       380       390       400       410       420

          380       390       400       410       420       430    
pF1KE5 KVREIYDKHKSNVGGLLSPQRKEALQRLRAEIEVLTDSWLGTALKSLLLIQSRKNCVNVL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 KVREIYDKHKSNVGGLLSPQRKEALQRLRAEIEVLTDSWLGTALKSLLLIQSRKNCVNVL
              430       440       450       460       470       480

          440       450       460       470       480       490    
pF1KE5 ITTTQLVPALAKVLLYGLGEIFPIENIYSATKIGKESCFERIVSRFGKKVTYVVIGDGRD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 ITTTQLVPALAKVLLYGLGEIFPIENIYSATKIGKESCFERIVSRFGKKVTYVVIGDGRD
              490       500       510       520       530       540

          500       510       520       530      
pF1KE5 EEIAAKQQLYFLDMEALGCQLEPTALILFIQLSGNLSNYNKL
       :::::::.                                  
CCDS31 EEIAAKQHNMPFWRITNHGDLVSLHQALELDFL         
              550       560       570            

>>CCDS75523.1 EYA4 gene_id:2070|Hs108|chr6                (585 aa)
 initn: 1734 init1: 1269 opt: 1496  Z-score: 1250.8  bits: 241.3 E(32554): 2.4e-63
Smith-Waterman score: 1602; 50.3% identity (72.1% similar) in 541 aa overlap (13-502:28-560)

                              10          20        30        40   
pF1KE5                MEEEQDLPEQPVKKAKMQE--SGEQTISQVSNPDVSDQKPETSSL
                                  .. .::.  : .  ..  ..:  :  .  . : 
CCDS75 MEDSQDLNEQSVKKTCTESDVSQSQNSRSMEMQDLASPHTLVGGGDTPGSSKLEKSNLSS
               10        20        30        40        50        60

            50        60        70        80          90       100 
pF1KE5 ASNLPMSEEIMTCTDYIPRSSNDYTSQMYSAKPYAHILSVPVSET--AYPGQTQYQTLQQ
       .:    .  ..: . : :::...:. :.: .::: ::::.:...:  :: :::::. .::
CCDS75 TSVTTNGTGVITSSGYSPRSAHQYSPQLYPSKPYPHILSTPAAQTMSAYAGQTQYSGMQQ
               70        80        90       100       110       120

             110       120              130                        
pF1KE5 TQPYAVYPQATQTYGLPPF-------ASSTNASLISTSSTIAN-----------------
          :..: :. : :.:: .       : .:...: .:.: . .                 
CCDS75 PAVYTAYSQTGQPYSLPTYDLGVMLPAIKTESGLSQTQSPLQSGCLSYSPGFSTPQPGQT
              130       140       150       160       170       180

            140                        150       160       170     
pF1KE5 -----IPAAAVA---------SISN--------QDYPTYTILGQNQYQACYPSSSFGVTG
            .:... :         :.::        ::::.:: .:::::   : .:..:.  
CCDS75 PYSYQMPGSSFAPSSTIYANNSVSNSTNFSGSQQDYPSYTAFGQNQYAQYYSASTYGAYM
              190       200       210       220       230       240

         180       190       200       210       220       230     
pF1KE5 QTNSDAESTTLAATTYQSEKPSVMAPAPAAQRLSSGDPSTSPSLSQTTPSKDTDDQSRKN
        .:. :..:  ...::: ..     :. . :  .  :   :::    :: :: :... ..
CCDS75 TSNNTADGTPSSTSTYQLQES---LPGLTNQP-GEFDTMQSPS----TPIKDLDERTCRS
              250       260           270           280       290  

         240        250       260       270       280       290    
pF1KE5 MTSKNRGK-RKADATSSQDSELERVFLWDLDETIIIFHSLLTGSYAQKYGKDPTVVIGSG
         ::.::. :: . .   ::.:::::.::::::::.::::::::::::::::: ...  :
CCDS75 SGSKSRGRGRKNNPSPPPDSDLERVFVWDLDETIIVFHSLLTGSYAQKYGKDPPMAVTLG
            300       310       320       330       340       350  

          300       310       320       330       340       350    
pF1KE5 LTMEEMIFEVADTHLFFNDLEECDQVHVEDVASDDNGQDLSNYSFSTDGFSGSGGSGSHG
       : ::::::..:::::::::::::::::..::.:::::::::.:::.:::: ....:..  
CCDS75 LRMEEMIFNLADTHLFFNDLEECDQVHIDDVSSDDNGQDLSTYSFATDGFHAAASSANLC
            360       370       380       390       400       410  

          360       370       380       390       400       410    
pF1KE5 SSVGVQGGVDWMRKLAFRYRKVREIYDKHKSNVGGLLSPQRKEALQRLRAEIEVLTDSWL
         .::.::::::::::::::.:.:.:. .:.::::::.: ...:  .:::::: ::::::
CCDS75 LPTGVRGGVDWMRKLAFRYRRVKELYNTYKNNVGGLLGPAKRDAWLQLRAEIEGLTDSWL
            420       430       440       450       460       470  

          420       430       440       450       460       470    
pF1KE5 GTALKSLLLIQSRKNCVNVLITTTQLVPALAKVLLYGLGEIFPIENIYSATKIGKESCFE
        .::::: .:..:.::.:::.:::::.:::::::::.::  :::::::::::::::::::
CCDS75 TNALKSLSIISTRSNCINVLVTTTQLIPALAKVLLYSLGGAFPIENIYSATKIGKESCFE
            480       490       500       510       520       530  

          480       490       500       510       520       530    
pF1KE5 RIVSRFGKKVTYVVIGDGRDEEIAAKQQLYFLDMEALGCQLEPTALILFIQLSGNLSNYN
       ::::::: ..:::::::::::: ::.:.                                
CCDS75 RIVSRFGTNITYVVIGDGRDEEHAANQHNMPFWRISSHSDLLALHQALELEYL       
            540       550       560       570       580            

>>CCDS5166.1 EYA4 gene_id:2070|Hs108|chr6                 (639 aa)
 initn: 1734 init1: 1269 opt: 1496  Z-score: 1250.1  bits: 241.3 E(32554): 2.6e-63
Smith-Waterman score: 1599; 51.2% identity (73.2% similar) in 523 aa overlap (29-502:100-614)

                 10        20        30        40        50        
pF1KE5   MEEEQDLPEQPVKKAKMQESGEQTISQVSNPDVSDQKPETSSLASNLPMSEEIMTCTD
                                     ..:  :..   :.. ..   ..  ..: . 
CCDS51 GENMTVLNTADWLLSCNTPSSATMSLLAVKTEPLNSSETTATTGDGALDTFTGSVITSSG
      70        80        90       100       110       120         

       60        70        80          90       100       110      
pF1KE5 YIPRSSNDYTSQMYSAKPYAHILSVPVSET--AYPGQTQYQTLQQTQPYAVYPQATQTYG
       : :::...:. :.: .::: ::::.:...:  :: :::::. .::   :..: :. : :.
CCDS51 YSPRSAHQYSPQLYPSKPYPHILSTPAAQTMSAYAGQTQYSGMQQPAVYTAYSQTGQPYS
     130       140       150       160       170       180         

        120              130                             140       
pF1KE5 LPPF-------ASSTNASLISTSSTIAN----------------------IPAAAVA---
       :: .       : .:...: .:.: . .                      .:... :   
CCDS51 LPTYDLGVMLPAIKTESGLSQTQSPLQSGCLSYSPGFSTPQPGQTPYSYQMPGSSFAPSS
     190       200       210       220       230       240         

                        150       160       170       180       190
pF1KE5 ------SISN--------QDYPTYTILGQNQYQACYPSSSFGVTGQTNSDAESTTLAATT
             :.::        ::::.:: .:::::   : .:..:.   .:. :..:  ...:
CCDS51 TIYANNSVSNSTNFSGSQQDYPSYTAFGQNQYAQYYSASTYGAYMTSNNTADGTPSSTST
     250       260       270       280       290       300         

              200       210       220       230       240          
pF1KE5 YQSEKPSVMAPAPAAQRLSSGDPSTSPSLSQTTPSKDTDDQSRKNMTSKNRGK-RKADAT
       :: ..     :. . :  .  :   :::    :: :: :... ..  ::.::. :: . .
CCDS51 YQLQES---LPGLTNQP-GEFDTMQSPS----TPIKDLDERTCRSSGSKSRGRGRKNNPS
     310          320        330           340       350       360 

     250       260       270       280       290       300         
pF1KE5 SSQDSELERVFLWDLDETIIIFHSLLTGSYAQKYGKDPTVVIGSGLTMEEMIFEVADTHL
          ::.:::::.::::::::.::::::::::::::::: ...  :: ::::::..:::::
CCDS51 PPPDSDLERVFVWDLDETIIVFHSLLTGSYAQKYGKDPPMAVTLGLRMEEMIFNLADTHL
             370       380       390       400       410       420 

     310       320       330       340       350       360         
pF1KE5 FFNDLEECDQVHVEDVASDDNGQDLSNYSFSTDGFSGSGGSGSHGSSVGVQGGVDWMRKL
       ::::::::::::..::.:::::::::.:::.:::: ....:..    .::.:::::::::
CCDS51 FFNDLEECDQVHIDDVSSDDNGQDLSTYSFATDGFHAAASSANLCLPTGVRGGVDWMRKL
             430       440       450       460       470       480 

     370       380       390       400       410       420         
pF1KE5 AFRYRKVREIYDKHKSNVGGLLSPQRKEALQRLRAEIEVLTDSWLGTALKSLLLIQSRKN
       :::::.:.:.:. .:.::::::.: ...:  .:::::: :::::: .::::: .:..:.:
CCDS51 AFRYRRVKELYNTYKNNVGGLLGPAKRDAWLQLRAEIEGLTDSWLTNALKSLSIISTRSN
             490       500       510       520       530       540 

     430       440       450       460       470       480         
pF1KE5 CVNVLITTTQLVPALAKVLLYGLGEIFPIENIYSATKIGKESCFERIVSRFGKKVTYVVI
       :.:::.:::::.:::::::::.::  :::::::::::::::::::::::::: ..:::::
CCDS51 CINVLVTTTQLIPALAKVLLYSLGGAFPIENIYSATKIGKESCFERIVSRFGTNITYVVI
             550       560       570       580       590       600 

     490       500       510       520       530      
pF1KE5 GDGRDEEIAAKQQLYFLDMEALGCQLEPTALILFIQLSGNLSNYNKL
       ::::::: ::.:.                                  
CCDS51 GDGRDEEHAANQHNMPFWRISSHSDLLALHQALELEYL         
             610       620       630                  

>>CCDS75521.1 EYA4 gene_id:2070|Hs108|chr6                (645 aa)
 initn: 1673 init1: 1252 opt: 1487  Z-score: 1242.6  bits: 239.9 E(32554): 6.8e-63
Smith-Waterman score: 1590; 50.2% identity (73.7% similar) in 524 aa overlap (29-502:100-620)

                 10        20        30        40        50        
pF1KE5   MEEEQDLPEQPVKKAKMQESGEQTISQVSNPDVSDQKPETSSLASNLPMSEEIMTCTD
                                     ..:  :..   :.. ..   ..  ..: . 
CCDS75 GENMTVLNTADWLLSCNTPSSATMSLLAVKTEPLNSSETTATTGDGALDTFTGSVITSSG
      70        80        90       100       110       120         

       60        70        80          90       100       110      
pF1KE5 YIPRSSNDYTSQMYSAKPYAHILSVPVSET--AYPGQTQYQTLQQTQPYAVYPQATQTYG
       : :::...:. :.: .::: ::::.:...:  :: :::::. .::   :..: :. : :.
CCDS75 YSPRSAHQYSPQLYPSKPYPHILSTPAAQTMSAYAGQTQYSGMQQPAVYTAYSQTGQPYS
     130       140       150       160       170       180         

        120              130                             140       
pF1KE5 LPPF-------ASSTNASLISTSSTIAN----------------------IPAAAVA---
       :: .       : .:...: .:.: . .                      .:... :   
CCDS75 LPTYDLGVMLPAIKTESGLSQTQSPLQSGCLSYSPGFSTPQPGQTPYSYQMPGSSFAPSS
     190       200       210       220       230       240         

                        150       160       170       180       190
pF1KE5 ------SISN--------QDYPTYTILGQNQYQACYPSSSFGVTGQTNSDAESTTLAATT
             :.::        ::::.:: .:::::   : .:..:.   .:. :..:  ...:
CCDS75 TIYANNSVSNSTNFSGSQQDYPSYTAFGQNQYAQYYSASTYGAYMTSNNTADGTPSSTST
     250       260       270       280       290       300         

              200       210        220       230       240         
pF1KE5 YQSEKPSVMAPAPAAQRLSSGDPSTSPSL-SQTTPSKDTDDQSRKNMTSKNRGK-RKADA
       :: ..     :. . :  ..  :.   .. : .:: :: :... ..  ::.::. :: . 
CCDS75 YQLQES---LPGLTNQPGTDLHPGEFDTMQSPSTPIKDLDERTCRSSGSKSRGRGRKNNP
     310          320       330       340       350       360      

      250       260       270       280       290       300        
pF1KE5 TSSQDSELERVFLWDLDETIIIFHSLLTGSYAQKYGKDPTVVIGSGLTMEEMIFEVADTH
       .   ::.:::::.::::::::.::::::::::::::::: ...  :: ::::::..::::
CCDS75 SPPPDSDLERVFVWDLDETIIVFHSLLTGSYAQKYGKDPPMAVTLGLRMEEMIFNLADTH
        370       380       390       400       410       420      

      310       320       330       340       350       360        
pF1KE5 LFFNDLEECDQVHVEDVASDDNGQDLSNYSFSTDGFSGSGGSGSHGSSVGVQGGVDWMRK
       :::::::::::::..::.:::::::::.:::.:::: ....:..    .::.::::::::
CCDS75 LFFNDLEECDQVHIDDVSSDDNGQDLSTYSFATDGFHAAASSANLCLPTGVRGGVDWMRK
        430       440       450       460       470       480      

      370       380       390       400       410       420        
pF1KE5 LAFRYRKVREIYDKHKSNVGGLLSPQRKEALQRLRAEIEVLTDSWLGTALKSLLLIQSRK
       ::::::.:.:.:. .:.::::::.: ...:  .:::::: :::::: .::::: .:..:.
CCDS75 LAFRYRRVKELYNTYKNNVGGLLGPAKRDAWLQLRAEIEGLTDSWLTNALKSLSIISTRS
        490       500       510       520       530       540      

      430       440       450       460       470       480        
pF1KE5 NCVNVLITTTQLVPALAKVLLYGLGEIFPIENIYSATKIGKESCFERIVSRFGKKVTYVV
       ::.:::.:::::.:::::::::.::  :::::::::::::::::::::..:::.::.:::
CCDS75 NCINVLVTTTQLIPALAKVLLYSLGGAFPIENIYSATKIGKESCFERIMQRFGRKVVYVV
        550       560       570       580       590       600      

      490       500       510       520       530      
pF1KE5 IGDGRDEEIAAKQQLYFLDMEALGCQLEPTALILFIQLSGNLSNYNKL
       :::: .:: :::..                                  
CCDS75 IGDGVEEEQAAKKHNMPFWRISSHSDLLALHQALELEYL         
        610       620       630       640              

>>CCDS43506.1 EYA4 gene_id:2070|Hs108|chr6                (616 aa)
 initn: 1717 init1: 1252 opt: 1479  Z-score: 1236.3  bits: 238.7 E(32554): 1.5e-62
Smith-Waterman score: 1585; 50.0% identity (72.9% similar) in 532 aa overlap (20-502:68-591)

                          10        20        30        40         
pF1KE5            MEEEQDLPEQPVKKAKMQESGEQTISQVSNPDVSDQKPETSSLASNLPM
                                     .: . ..  ..:  :..   :.. ..   .
CCDS43 PHTLVGGGDTPGSSKLEKSNLSSTSVTTNGTGVSLLAVKTEPLNSSETTATTGDGALDTF
        40        50        60        70        80        90       

      50        60        70        80          90       100       
pF1KE5 SEEIMTCTDYIPRSSNDYTSQMYSAKPYAHILSVPVSET--AYPGQTQYQTLQQTQPYAV
       .  ..: . : :::...:. :.: .::: ::::.:...:  :: :::::. .::   :..
CCDS43 TGSVITSSGYSPRSAHQYSPQLYPSKPYPHILSTPAAQTMSAYAGQTQYSGMQQPAVYTA
       100       110       120       130       140       150       

       110       120              130                              
pF1KE5 YPQATQTYGLPPF-------ASSTNASLISTSSTIAN----------------------I
       : :. : :.:: .       : .:...: .:.: . .                      .
CCDS43 YSQTGQPYSLPTYDLGVMLPAIKTESGLSQTQSPLQSGCLSYSPGFSTPQPGQTPYSYQM
       160       170       180       190       200       210       

      140                        150       160       170       180 
pF1KE5 PAAAVA---------SISN--------QDYPTYTILGQNQYQACYPSSSFGVTGQTNSDA
       :... :         :.::        ::::.:: .:::::   : .:..:.   .:. :
CCDS43 PGSSFAPSSTIYANNSVSNSTNFSGSQQDYPSYTAFGQNQYAQYYSASTYGAYMTSNNTA
       220       230       240       250       260       270       

             190       200       210       220       230       240 
pF1KE5 ESTTLAATTYQSEKPSVMAPAPAAQRLSSGDPSTSPSLSQTTPSKDTDDQSRKNMTSKNR
       ..:  ...::: ..     :. . :  .  :   :::    :: :: :... ..  ::.:
CCDS43 DGTPSSTSTYQLQES---LPGLTNQP-GEFDTMQSPS----TPIKDLDERTCRSSGSKSR
       280       290          300        310           320         

              250       260       270       280       290       300
pF1KE5 GK-RKADATSSQDSELERVFLWDLDETIIIFHSLLTGSYAQKYGKDPTVVIGSGLTMEEM
       :. :: . .   ::.:::::.::::::::.::::::::::::::::: ...  :: ::::
CCDS43 GRGRKNNPSPPPDSDLERVFVWDLDETIIVFHSLLTGSYAQKYGKDPPMAVTLGLRMEEM
     330       340       350       360       370       380         

              310       320       330       340       350       360
pF1KE5 IFEVADTHLFFNDLEECDQVHVEDVASDDNGQDLSNYSFSTDGFSGSGGSGSHGSSVGVQ
       ::..:::::::::::::::::..::.:::::::::.:::.:::: ....:..    .::.
CCDS43 IFNLADTHLFFNDLEECDQVHIDDVSSDDNGQDLSTYSFATDGFHAAASSANLCLPTGVR
     390       400       410       420       430       440         

              370       380       390       400       410       420
pF1KE5 GGVDWMRKLAFRYRKVREIYDKHKSNVGGLLSPQRKEALQRLRAEIEVLTDSWLGTALKS
       ::::::::::::::.:.:.:. .:.::::::.: ...:  .:::::: :::::: .::::
CCDS43 GGVDWMRKLAFRYRRVKELYNTYKNNVGGLLGPAKRDAWLQLRAEIEGLTDSWLTNALKS
     450       460       470       480       490       500         

              430       440       450       460       470       480
pF1KE5 LLLIQSRKNCVNVLITTTQLVPALAKVLLYGLGEIFPIENIYSATKIGKESCFERIVSRF
       : .:..:.::.:::.:::::.:::::::::.::  :::::::::::::::::::::..::
CCDS43 LSIISTRSNCINVLVTTTQLIPALAKVLLYSLGGAFPIENIYSATKIGKESCFERIMQRF
     510       520       530       540       550       560         

              490       500       510       520       530      
pF1KE5 GKKVTYVVIGDGRDEEIAAKQQLYFLDMEALGCQLEPTALILFIQLSGNLSNYNKL
       :.::.::::::: .:: :::..                                  
CCDS43 GRKVVYVVIGDGVEEEQAAKKHNMPFWRISSHSDLLALHQALELEYL         
     570       580       590       600       610               

>>CCDS5165.1 EYA4 gene_id:2070|Hs108|chr6                 (639 aa)
 initn: 1717 init1: 1252 opt: 1479  Z-score: 1236.1  bits: 238.7 E(32554): 1.6e-62
Smith-Waterman score: 1582; 50.7% identity (73.2% similar) in 523 aa overlap (29-502:100-614)

                 10        20        30        40        50        
pF1KE5   MEEEQDLPEQPVKKAKMQESGEQTISQVSNPDVSDQKPETSSLASNLPMSEEIMTCTD
                                     ..:  :..   :.. ..   ..  ..: . 
CCDS51 GENMTVLNTADWLLSCNTPSSATMSLLAVKTEPLNSSETTATTGDGALDTFTGSVITSSG
      70        80        90       100       110       120         

       60        70        80          90       100       110      
pF1KE5 YIPRSSNDYTSQMYSAKPYAHILSVPVSET--AYPGQTQYQTLQQTQPYAVYPQATQTYG
       : :::...:. :.: .::: ::::.:...:  :: :::::. .::   :..: :. : :.
CCDS51 YSPRSAHQYSPQLYPSKPYPHILSTPAAQTMSAYAGQTQYSGMQQPAVYTAYSQTGQPYS
     130       140       150       160       170       180         

        120              130                             140       
pF1KE5 LPPF-------ASSTNASLISTSSTIAN----------------------IPAAAVA---
       :: .       : .:...: .:.: . .                      .:... :   
CCDS51 LPTYDLGVMLPAIKTESGLSQTQSPLQSGCLSYSPGFSTPQPGQTPYSYQMPGSSFAPSS
     190       200       210       220       230       240         

                        150       160       170       180       190
pF1KE5 ------SISN--------QDYPTYTILGQNQYQACYPSSSFGVTGQTNSDAESTTLAATT
             :.::        ::::.:: .:::::   : .:..:.   .:. :..:  ...:
CCDS51 TIYANNSVSNSTNFSGSQQDYPSYTAFGQNQYAQYYSASTYGAYMTSNNTADGTPSSTST
     250       260       270       280       290       300         

              200       210       220       230       240          
pF1KE5 YQSEKPSVMAPAPAAQRLSSGDPSTSPSLSQTTPSKDTDDQSRKNMTSKNRGK-RKADAT
       :: ..     :. . :  .  :   :::    :: :: :... ..  ::.::. :: . .
CCDS51 YQLQES---LPGLTNQP-GEFDTMQSPS----TPIKDLDERTCRSSGSKSRGRGRKNNPS
     310          320        330           340       350       360 

     250       260       270       280       290       300         
pF1KE5 SSQDSELERVFLWDLDETIIIFHSLLTGSYAQKYGKDPTVVIGSGLTMEEMIFEVADTHL
          ::.:::::.::::::::.::::::::::::::::: ...  :: ::::::..:::::
CCDS51 PPPDSDLERVFVWDLDETIIVFHSLLTGSYAQKYGKDPPMAVTLGLRMEEMIFNLADTHL
             370       380       390       400       410       420 

     310       320       330       340       350       360         
pF1KE5 FFNDLEECDQVHVEDVASDDNGQDLSNYSFSTDGFSGSGGSGSHGSSVGVQGGVDWMRKL
       ::::::::::::..::.:::::::::.:::.:::: ....:..    .::.:::::::::
CCDS51 FFNDLEECDQVHIDDVSSDDNGQDLSTYSFATDGFHAAASSANLCLPTGVRGGVDWMRKL
             430       440       450       460       470       480 

     370       380       390       400       410       420         
pF1KE5 AFRYRKVREIYDKHKSNVGGLLSPQRKEALQRLRAEIEVLTDSWLGTALKSLLLIQSRKN
       :::::.:.:.:. .:.::::::.: ...:  .:::::: :::::: .::::: .:..:.:
CCDS51 AFRYRRVKELYNTYKNNVGGLLGPAKRDAWLQLRAEIEGLTDSWLTNALKSLSIISTRSN
             490       500       510       520       530       540 

     430       440       450       460       470       480         
pF1KE5 CVNVLITTTQLVPALAKVLLYGLGEIFPIENIYSATKIGKESCFERIVSRFGKKVTYVVI
       :.:::.:::::.:::::::::.::  :::::::::::::::::::::..:::.::.::::
CCDS51 CINVLVTTTQLIPALAKVLLYSLGGAFPIENIYSATKIGKESCFERIMQRFGRKVVYVVI
             550       560       570       580       590       600 

     490       500       510       520       530      
pF1KE5 GDGRDEEIAAKQQLYFLDMEALGCQLEPTALILFIQLSGNLSNYNKL
       ::: .:: :::..                                  
CCDS51 GDGVEEEQAAKKHNMPFWRISSHSDLLALHQALELEYL         
             610       620       630                  

>>CCDS75750.1 EYA1 gene_id:2138|Hs108|chr8                (586 aa)
 initn: 1483 init1: 1268 opt: 1455  Z-score: 1216.8  bits: 235.0 E(32554): 1.9e-61
Smith-Waterman score: 1522; 48.3% identity (71.9% similar) in 540 aa overlap (12-502:30-561)

                                 10        20        30        40  
pF1KE5                   MEEEQDLPEQPVKKAKMQESGEQTISQVSNPDVSDQKPETSS
                                    ... .:  .: .. ..   :  :..   :..
CCDS75 MEMQDLTSPHSRLSGSSESPSGPKLGNSHINSNSMTPNGTEVKTE---PMSSSETASTTA
               10        20        30        40           50       

             50        60         70        80         90          
pF1KE5 LASNLPMSEEIMTCTDYIPRSSNDYTS-QMYSAKPYAHILSVPVSET-AYPGQTQYQT-L
        .:   .:   .  ... :: .....  :.: .::: ::: .: :.: :  ::::. : .
CCDS75 DGSLNNFSGSAIGSSSFSPRPTHQFSPPQIYPSKPYPHILPTPSSQTMAAYGQTQFTTGM
        60        70        80        90       100       110       

     100       110                                           120   
pF1KE5 QQTQPYAVYPQATQTYGL----------------P--------------------PFASS
       ::.  ::.:::  : ::.                :                    :.. .
CCDS75 QQATAYATYPQPGQPYGISSYGIKTEGGLSQSQSPGQTGFLSYGTSFSTPQPGQAPYSYQ
       120       130       140       150       160       170       

           130           140       150       160       170         
pF1KE5 TNASLISTSSTI----ANIPAAAVASISNQDYPTYTILGQNQYQACYPSSSFGVTGQTNS
        ..: ..::: :     ..  ..  . :.::::.:  .::.::   : :: . .  .:.:
CCDS75 MQGSSFTTSSGIYTGNNSLTNSSGFNSSQQDYPSYPSFGQGQYAQYYNSSPYPAHYMTSS
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     180        190       200       210         220        230     
pF1KE5 DAESTTLAAT-TYQSEKPSVMAPAPAAQRLSSGDPSTSPSL--SQTTPSKDTD-DQSRK-
       ..  :: ... ::: ..:    :.  ...  . ::..  :   : .:: ::.: :. :. 
CCDS75 NTSPTTPSTNATYQLQEP----PSGITSQAVT-DPTAEYSTIHSPSTPIKDSDSDRLRRG
       240       250           260        270       280       290  

           240       250       260       270       280       290   
pF1KE5 -NMTSKNRGKRKADATSSQDSELERVFLWDLDETIIIFHSLLTGSYAQKYGKDPTVVIGS
        .  :..::.:. . .   ::.:::::.::::::::.::::::::::..::.:: . .. 
CCDS75 SDGKSRGRGRRNNNPSPPPDSDLERVFIWDLDETIIVFHSLLTGSYANRYGRDPPTSVSL
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pF1KE5 GLTMEEMIFEVADTHLFFNDLEECDQVHVEDVASDDNGQDLSNYSFSTDGFSGSGGSGSH
       :: ::::::..:::::::::::::::::..::.:::::::::.:.:.:::: ... :.. 
CCDS75 GLRMEEMIFNLADTHLFFNDLEECDQVHIDDVSSDDNGQDLSTYNFGTDGFPAAATSANL
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pF1KE5 GSSVGVQGGVDWMRKLAFRYRKVREIYDKHKSNVGGLLSPQRKEALQRLRAEIEVLTDSW
         ..::.::::::::::::::.:.:::. .:.::::::.: ..::  .::::::.:::::
CCDS75 CLATGVRGGVDWMRKLAFRYRRVKEIYNTYKNNVGGLLGPAKREAWLQLRAEIEALTDSW
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       :  :::.: ::.:: ::::.:.:::::.:::::::::::: .::::::::::::::::::
CCDS75 LTLALKALSLIHSRTNCVNILVTTTQLIPALAKVLLYGLGIVFPIENIYSATKIGKESCF
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       :::..:::.::.::::::: .:: .::..                               
CCDS75 ERIIQRFGRKVVYVVIGDGVEEEQGAKKHAMPFWRISSHSDLMALHHALELEYL      
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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