Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE1197
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE1197, 917 aa
1>>>pF1KE1197 917 - 917 aa - 917 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 11.0149+/-0.00108; mu= -2.0291+/- 0.065
mean_var=415.0316+/-85.294, 0's: 0 Z-trim(115.3): 146 B-trim: 0 in 0/53
Lambda= 0.062955
statistics sampled from 15705 (15852) to 15705 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.767), E-opt: 0.2 (0.487), width: 16
Scan time: 4.390
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS14387.1 AR gene_id:367|Hs108|chrX ( 920) 6298 586.9 5.7e-167
CCDS43965.1 AR gene_id:367|Hs108|chrX ( 388) 2608 251.4 2.4e-66
CCDS8310.1 PGR gene_id:5241|Hs108|chr11 ( 933) 1516 152.6 3.2e-36
CCDS4278.1 NR3C1 gene_id:2908|Hs108|chr5 ( 777) 1335 136.1 2.5e-31
CCDS34258.1 NR3C1 gene_id:2908|Hs108|chr5 ( 778) 1330 135.6 3.4e-31
CCDS59229.1 PGR gene_id:5241|Hs108|chr11 ( 339) 1267 129.5 1e-29
CCDS47298.1 NR3C1 gene_id:2908|Hs108|chr5 ( 742) 1199 123.7 1.3e-27
CCDS3772.1 NR3C2 gene_id:4306|Hs108|chr4 ( 984) 872 94.1 1.3e-18
CCDS54811.1 NR3C2 gene_id:4306|Hs108|chr4 ( 867) 696 78.1 8e-14
>>CCDS14387.1 AR gene_id:367|Hs108|chrX (920 aa)
initn: 3269 init1: 3269 opt: 6298 Z-score: 3111.2 bits: 586.9 E(32554): 5.7e-167
Smith-Waterman score: 6298; 99.6% identity (99.7% similar) in 920 aa overlap (1-917:1-920)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MEVQLGLGRVYPRPPSKTYRGAFQNLFQSVREVIQNPGPRHPEAASAAPPGASLLLLQQQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 MEVQLGLGRVYPRPPSKTYRGAFQNLFQSVREVIQNPGPRHPEAASAAPPGASLLLLQQQ
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 QQQQQQQQQQQQQQQQQQQQETSPRQQQQQQGEDGSPQAHRRGPTGYLVLDEEQQPSQPQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 QQQQQQQQQQQQQQQQQQQQETSPRQQQQQQGEDGSPQAHRRGPTGYLVLDEEQQPSQPQ
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 SALECHPERGCVPEPGAAVAASKGLPQQLPAPPDEDDSAAPSTLSLLGPTFPGLSSCSAD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 SALECHPERGCVPEPGAAVAASKGLPQQLPAPPDEDDSAAPSTLSLLGPTFPGLSSCSAD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 LKDILSEASTMQLLQQQQQEAVSEGSSSGRAREASGAPTSSKDNYLGGTSTISDNAKELC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 LKDILSEASTMQLLQQQQQEAVSEGSSSGRAREASGAPTSSKDNYLGGTSTISDNAKELC
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 KAVSVSMGLGVEALEHLSPGEQLRGDCMYAPLLGVPPAVRPTPCAPLAECKGSLLDDSAG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 KAVSVSMGLGVEALEHLSPGEQLRGDCMYAPLLGVPPAVRPTPCAPLAECKGSLLDDSAG
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 KSTEDTAEYSPFKGGYTKGLEGESLGCSGSAAAGSSGTLELPSTLSLYKSGALDEAAAYQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 KSTEDTAEYSPFKGGYTKGLEGESLGCSGSAAAGSSGTLELPSTLSLYKSGALDEAAAYQ
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 SRDYYNFPLALAGPPPPPPPPHPHARIKLENPLDYGSAWAAAAAQCRYGDLASLHGAGAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 SRDYYNFPLALAGPPPPPPPPHPHARIKLENPLDYGSAWAAAAAQCRYGDLASLHGAGAA
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470
pF1KE1 GPGSGSPSAAASSSWHTLFTAEEGQLYGPCGGGGSGGGGGGGGGGGGGGG---EAGAVAP
::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::: :::::::
CCDS14 GPGSGSPSAAASSSWHTLFTAEEGQLYGPCGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGEAGAVAP
430 440 450 460 470 480
480 490 500 510 520 530
pF1KE1 YGYTRPPQGLAGQESDFTAPDVWYPGGMVSRVPYPSPTCVKSEMGPWMDSYSGPYGDMRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 YGYTRPPQGLAGQESDFTAPDVWYPGGMVSRVPYPSPTCVKSEMGPWMDSYSGPYGDMRL
490 500 510 520 530 540
540 550 560 570 580 590
pF1KE1 ETARDHVLPIDYYFPPQKTCLICGDEASGCHYGALTCGSCKVFFKRAAEGKQKYLCASRN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 ETARDHVLPIDYYFPPQKTCLICGDEASGCHYGALTCGSCKVFFKRAAEGKQKYLCASRN
550 560 570 580 590 600
600 610 620 630 640 650
pF1KE1 DCTIDKFRRKNCPSCRLRKCYEAGMTLGARKLKKLGNLKLQEEGEASSTTSPTEETTQKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 DCTIDKFRRKNCPSCRLRKCYEAGMTLGARKLKKLGNLKLQEEGEASSTTSPTEETTQKL
610 620 630 640 650 660
660 670 680 690 700 710
pF1KE1 TVSHIEGYECQPIFLNVLEAIEPGVVCAGHDNNQPDSFAALLSSLNELGERQLVHVVKWA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 TVSHIEGYECQPIFLNVLEAIEPGVVCAGHDNNQPDSFAALLSSLNELGERQLVHVVKWA
670 680 690 700 710 720
720 730 740 750 760 770
pF1KE1 KALPGFRNLHVDDQMAVIQYSWMGLMVFAMGWRSFTNVNSRMLYFAPDLVFNEYRMHKSR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 KALPGFRNLHVDDQMAVIQYSWMGLMVFAMGWRSFTNVNSRMLYFAPDLVFNEYRMHKSR
730 740 750 760 770 780
780 790 800 810 820 830
pF1KE1 MYSQCVRMRHLSQEFGWLQITPQEFLCMKALLLFSIIPVDGLKNQKFFDELRMNYIKELD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 MYSQCVRMRHLSQEFGWLQITPQEFLCMKALLLFSIIPVDGLKNQKFFDELRMNYIKELD
790 800 810 820 830 840
840 850 860 870 880 890
pF1KE1 RIIACKRKNPTSCSRRFYQLTKLLDSVQPIARELHQFTFDLLIKSHMVSVDFPEMMAEII
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 RIIACKRKNPTSCSRRFYQLTKLLDSVQPIARELHQFTFDLLIKSHMVSVDFPEMMAEII
850 860 870 880 890 900
900 910
pF1KE1 SVQVPKILSGKVKPIYFHTQ
::::::::::::::::::::
CCDS14 SVQVPKILSGKVKPIYFHTQ
910 920
>>CCDS43965.1 AR gene_id:367|Hs108|chrX (388 aa)
initn: 2608 init1: 2608 opt: 2608 Z-score: 1304.5 bits: 251.4 E(32554): 2.4e-66
Smith-Waterman score: 2608; 100.0% identity (100.0% similar) in 381 aa overlap (537-917:8-388)
510 520 530 540 550 560
pF1KE1 SRVPYPSPTCVKSEMGPWMDSYSGPYGDMRLETARDHVLPIDYYFPPQKTCLICGDEASG
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 MILWLHSLETARDHVLPIDYYFPPQKTCLICGDEASG
10 20 30
570 580 590 600 610 620
pF1KE1 CHYGALTCGSCKVFFKRAAEGKQKYLCASRNDCTIDKFRRKNCPSCRLRKCYEAGMTLGA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 CHYGALTCGSCKVFFKRAAEGKQKYLCASRNDCTIDKFRRKNCPSCRLRKCYEAGMTLGA
40 50 60 70 80 90
630 640 650 660 670 680
pF1KE1 RKLKKLGNLKLQEEGEASSTTSPTEETTQKLTVSHIEGYECQPIFLNVLEAIEPGVVCAG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 RKLKKLGNLKLQEEGEASSTTSPTEETTQKLTVSHIEGYECQPIFLNVLEAIEPGVVCAG
100 110 120 130 140 150
690 700 710 720 730 740
pF1KE1 HDNNQPDSFAALLSSLNELGERQLVHVVKWAKALPGFRNLHVDDQMAVIQYSWMGLMVFA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 HDNNQPDSFAALLSSLNELGERQLVHVVKWAKALPGFRNLHVDDQMAVIQYSWMGLMVFA
160 170 180 190 200 210
750 760 770 780 790 800
pF1KE1 MGWRSFTNVNSRMLYFAPDLVFNEYRMHKSRMYSQCVRMRHLSQEFGWLQITPQEFLCMK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 MGWRSFTNVNSRMLYFAPDLVFNEYRMHKSRMYSQCVRMRHLSQEFGWLQITPQEFLCMK
220 230 240 250 260 270
810 820 830 840 850 860
pF1KE1 ALLLFSIIPVDGLKNQKFFDELRMNYIKELDRIIACKRKNPTSCSRRFYQLTKLLDSVQP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 ALLLFSIIPVDGLKNQKFFDELRMNYIKELDRIIACKRKNPTSCSRRFYQLTKLLDSVQP
280 290 300 310 320 330
870 880 890 900 910
pF1KE1 IARELHQFTFDLLIKSHMVSVDFPEMMAEIISVQVPKILSGKVKPIYFHTQ
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 IARELHQFTFDLLIKSHMVSVDFPEMMAEIISVQVPKILSGKVKPIYFHTQ
340 350 360 370 380
>>CCDS8310.1 PGR gene_id:5241|Hs108|chr11 (933 aa)
initn: 1573 init1: 980 opt: 1516 Z-score: 763.8 bits: 152.6 E(32554): 3.2e-36
Smith-Waterman score: 1610; 35.9% identity (60.6% similar) in 950 aa overlap (42-917:46-933)
20 30 40 50 60 70
pF1KE1 PRPPSKTYRGAFQNLFQSVREVIQNPGPRHPEAASAAPPGASLLLLQQQQQQQQQQQQQQ
::. :: : . . ::. . : :. ....
CCDS83 GGPPSPEVGSPLLCRPAAGPFPGSQTSDTLPEV-SAIPISLDGLLFPRPCQGQDPSDEKT
20 30 40 50 60 70
80 90 100 110 120
pF1KE1 QQQQQQQQQETSPRQQQQQQGEDGSPQAHRRGPTGYL--VLDEEQQPSQPQSALECHPER
:.::. .. : . . . .: :: .. . .: : ::: :: : .. .:
CCDS83 QDQQSLSDVEGAYSRAEATRGAGGSSSSPPEKDSGLLDSVLDTLLAPSGPGQS---QPS-
80 90 100 110 120 130
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 GCVPEPGAAVAASKGL-PQQLPAPPDEDDSAAPSTLSLLGPTFP------GLSSCSADLK
: :. :..: : .:: :: :::.: .:.: . : :: .: .
CCDS83 ---P-PACEVTSSWCLFGPELP----EDPPAAPATQRVLSPLMSRSGCKVGDSSGTAAAH
140 150 160 170 180
190 200 210 220
pF1KE1 DILSE--ASTMQLL---------------QQQQQEAVSEGSSSGRAREASGAPT-SSKDN
.: . . . ::: . : :: .: : :..: ..:
CCDS83 KVLPRGLSPARQLLLPASESPHWSGAPVKPSPQAAAVEVEEEDGSESEESAGPLLKGKPR
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260
pF1KE1 YLGGTSTISDNA---------------KELCKAVSVSMGLGVEALEHLSPGEQLRG----
:::... . : :: . . ..: :: ..::.. .
CCDS83 ALGGAAAGGGAAAVPPGAAAGGVALVPKEDSRFSAPRVAL-VEQDAPMAPGRSPLATTVM
250 260 270 280 290 300
270 280 290 300 310 320
pF1KE1 DCMYAPLLGVPPAVRPTPCAPLAECKGSLLDDSAGKSTEDTAEYSPFKGGYTKGLEGESL
: ...:.: . :. . : : .. : .:: .. . : .. : :.
CCDS83 DFIHVPILPLNHALLAARTRQLLEDES--YDGGAGAASAFAPPRSSPCASSTPVAVGDFP
310 320 330 340 350
330 340 350 360 370
pF1KE1 GCSGSA-AAGSSGTLEL-----PSTLSLYKSGALDEAAAYQSRDYY---NFPLALAGPPP
:. : .. . : : .:.. . ::.: . :.: : :. :
CCDS83 DCAYPPDAEPKDDAYPLYSDFQPPALKIKEEEEGAEASARSPRSYLVAGANPAAFPDFPL
360 370 380 390 400 410
380 390 400 410 420 430
pF1KE1 PPPPPHPHARIKLENPLDYGSAWAAAAAQCRYGDLASLHGAGAAGPGSGSPSAAASSSWH
:::: : : :. : :. .: .:.:.:.: :.:.::.
CCDS83 GPPPPLP--------P---------RATPSRPGE-----AAVTAAPASASVSSASSSGST
420 430 440 450
440 450 460 470 480
pF1KE1 T---LFTAE-----EGQLYGP-CGGGGSGG---GGGGGGGGGGGGGEAGAVAPYGYTRPP
:. :: .: . : : . :..: : . ..... ::: :: : :
CCDS83 LECILYKAEGAPPQQGPFAPPPCKAPGASGCLLPRDGLPSTSASAAAAGA-APALY--PA
460 470 480 490 500 510
490 500 510 520 530 540
pF1KE1 QGLAGQESDFTAPDVWYPGGMVSR-VPYPSPTCVKSEMGPWMDSYSGPYGDMRLETARDH
:: : :.. : ...... .: : :... : .: .. ..
CCDS83 LGLNGL------PQLGYQAAVLKEGLPQVYP--------PYLN-Y------LRPDSEASQ
520 530 540 550
550 560 570 580 590 600
pF1KE1 VLPIDYYFPPQKTCLICGDEASGCHYGALTCGSCKVFFKRAAEGKQKYLCASRNDCTIDK
.. ::: ::::::::::::::.::::::::::::: ::...::::.:::: .::
CCDS83 SPQYSFESLPQKICLICGDEASGCHYGVLTCGSCKVFFKRAMEGQHNYLCAGRNDCIVDK
560 570 580 590 600 610
610 620 630 640 650
pF1KE1 FRRKNCPSCRLRKCYEAGMTLGARKLKKLGNLKLQEEGEASSTTSP------TEETTQKL
.::::::.:::::: .:::.::.::.::...... . .: . .: .. .:..
CCDS83 IRRKNCPACRLRKCCQAGMVLGGRKFKKFNKVRVVRALDAVALPQPVGVPNESQALSQRF
620 630 640 650 660 670
660 670 680 690 700 710
pF1KE1 TVSHIEGYECQPIFLNVLEAIEPGVVCAGHDNNQPDSFAALLSSLNELGERQLVHVVKWA
: : . . : ..:.: .::: :. :::::..::. ..::.:::.::::::. ::::.
CCDS83 TFSPGQDIQLIPPLINLLMSIEPDVIYAGHDNTKPDTSSSLLTSLNQLGERQLLSVVKWS
680 690 700 710 720 730
720 730 740 750 760 770
pF1KE1 KALPGFRNLHVDDQMAVIQYSWMGLMVFAMGWRSFTNVNSRMLYFAPDLVFNEYRMHKSR
:.::::::::.:::...::::::.::::..::::. .:...::::::::..:: ::..:
CCDS83 KSLPGFRNLHIDDQITLIQYSWMSLMVFGLGWRSYKHVSGQMLYFAPDLILNEQRMKESS
740 750 760 770 780 790
780 790 800 810 820 830
pF1KE1 MYSQCVRMRHLSQEFGWLQITPQEFLCMKALLLFSIIPVDGLKNQKFFDELRMNYIKELD
.:: :. : .. ::: ::.. .::::::.:::.. ::..::..: :.:.: .::.::
CCDS83 FYSLCLTMWQIPQEFVKLQVSQEEFLCMKVLLLLNTIPLEGLRSQTQFEEMRSSYIRELI
800 810 820 830 840 850
840 850 860 870 880 890
pF1KE1 RIIACKRKNPTSCSRRFYQLTKLLDSVQPIARELHQFTFDLLIKSHMVSVDFPEMMAEII
. :. ..:. .: :.::::::::::... ....:: . .. .:.:. .::.:::::.:.:
CCDS83 KAIGLRQKGVVSSSQRFYQLTKLLDNLHDLVKQLHLYCLNTFIQSRALSVEFPEMMSEVI
860 870 880 890 900 910
900 910
pF1KE1 SVQVPKILSGKVKPIYFHTQ
..:.::::.: :::. :: .
CCDS83 AAQLPKILAGMVKPLLFHKK
920 930
>>CCDS4278.1 NR3C1 gene_id:2908|Hs108|chr5 (777 aa)
initn: 1352 init1: 751 opt: 1335 Z-score: 675.9 bits: 136.1 E(32554): 2.5e-31
Smith-Waterman score: 1338; 47.7% identity (73.4% similar) in 436 aa overlap (485-917:368-777)
460 470 480 490 500 510
pF1KE1 SGGGGGGGGGGGGGGGEAGAVAPYGYTRPPQGLAGQESDFTAPDVWYPGGMVSRVPYPSP
:: .:... . . .:: : : ::
CCDS42 TASLSQQQDQKPIFNVIPPIPVGSENWNRCQG-SGDDNLTSLGTLNFPGRTVFSNGYSSP
340 350 360 370 380 390
520 530 540 550 560 570
pF1KE1 TCVKSEMGPWMDSYSGPYGDMRLETARDHVLPIDYYFPPQKTCLICGDEASGCHYGALTC
. : : : : : .. :. :: : ::.:.:::::::::.:::
CCDS42 S-----MRP--DVSSPPSSSSTATTG-----------PPPKLCLVCSDEASGCHYGVLTC
400 410 420 430
580 590 600 610 620 630
pF1KE1 GSCKVFFKRAAEGKQKYLCASRNDCTIDKFRRKNCPSCRLRKCYEAGMTLGARKLKKLGN
::::::::::.::...::::.:::: :::.::::::.:: ::: .:::.: ::: ::
CCDS42 GSCKVFFKRAVEGQHNYLCAGRNDCIIDKIRRKNCPACRYRKCLQAGMNLEARKTKK---
440 450 460 470 480 490
640 650 660 670 680 690
pF1KE1 LKLQEEGEASSTTSPTEETTQK---LTVSHIEGYECQPIFLNVLEAIEPGVVCAGHDNNQ
:.. : ..::. ..::... :. . : ....::.::: :. ::.:..
CCDS42 -KIK--GIQQATTGVSQETSENPGNKTIVPATLPQLTPTLVSLLEVIEPEVLYAGYDSSV
500 510 520 530 540 550
700 710 720 730 740 750
pF1KE1 PDSFAALLSSLNELGERQLVHVVKWAKALPGFRNLHVDDQMAVIQYSWMGLMVFAMGWRS
::: ....:: :: ::.. .::::::.:::::::.::::...::::: ::.::.::::
CCDS42 PDSTWRIMTTLNMLGGRQVIAAVKWAKAIPGFRNLHLDDQMTLLQYSWMFLMAFALGWRS
560 570 580 590 600 610
760 770 780 790 800 810
pF1KE1 FTNVNSRMLYFAPDLVFNEYRMHKSRMYSQCVRMRHLSQEFGWLQITPQEFLCMKALLLF
. . .. .: :::::..:: :: ::.:: .: ..:.:. ::.. .:.::::.:::.
CCDS42 YRQSSANLLCFAPDLIINEQRMTLPCMYDQCKHMLYVSSELHRLQVSYEEYLCMKTLLLL
620 630 640 650 660 670
820 830 840 850 860 870
pF1KE1 SIIPVDGLKNQKFFDELRMNYIKELDRIIACKRKNPTSCSRRFYQLTKLLDSVQPIAREL
: .: ::::.:..:::.::.::::: . :. .. : .. .:::::::::::.. ....:
CCDS42 SSVPKDGLKSQELFDEIRMTYIKELGKAIVKREGNSSQNWQRFYQLTKLLDSMHEVVENL
680 690 700 710 720 730
880 890 900 910
pF1KE1 HQFTFDLLIKSHMVSVDFPEMMAEIISVQVPKILSGKVKPIYFHTQ
.. :. .. . : :..::::.::::. :.:: .:..: . :: .
CCDS42 LNYCFQTFLDKTM-SIEFPEMLAEIITNQIPKYSNGNIKKLLFHQK
740 750 760 770
>>CCDS34258.1 NR3C1 gene_id:2908|Hs108|chr5 (778 aa)
initn: 1151 init1: 751 opt: 1330 Z-score: 673.5 bits: 135.6 E(32554): 3.4e-31
Smith-Waterman score: 1333; 47.8% identity (73.2% similar) in 437 aa overlap (485-917:368-778)
460 470 480 490 500 510
pF1KE1 SGGGGGGGGGGGGGGGEAGAVAPYGYTRPPQGLAGQESDFTAPDVWYPGGMVSRVPYPSP
:: .:... . . .:: : : ::
CCDS34 TASLSQQQDQKPIFNVIPPIPVGSENWNRCQG-SGDDNLTSLGTLNFPGRTVFSNGYSSP
340 350 360 370 380 390
520 530 540 550 560 570
pF1KE1 TCVKSEMGPWMDSYSGPYGDMRLETARDHVLPIDYYFPPQKTCLICGDEASGCHYGALTC
. : : : : : .. :. :: : ::.:.:::::::::.:::
CCDS34 S-----MRP--DVSSPPSSSSTATTG-----------PPPKLCLVCSDEASGCHYGVLTC
400 410 420 430
580 590 600 610 620 630
pF1KE1 GSCKVFFKRAAEGKQK-YLCASRNDCTIDKFRRKNCPSCRLRKCYEAGMTLGARKLKKLG
::::::::::.::.:. ::::.:::: :::.::::::.:: ::: .:::.: ::: ::
CCDS34 GSCKVFFKRAVEGRQHNYLCAGRNDCIIDKIRRKNCPACRYRKCLQAGMNLEARKTKK--
440 450 460 470 480 490
640 650 660 670 680 690
pF1KE1 NLKLQEEGEASSTTSPTEETTQK---LTVSHIEGYECQPIFLNVLEAIEPGVVCAGHDNN
:.. : ..::. ..::... :. . : ....::.::: :. ::.:..
CCDS34 --KIK--GIQQATTGVSQETSENPGNKTIVPATLPQLTPTLVSLLEVIEPEVLYAGYDSS
500 510 520 530 540 550
700 710 720 730 740 750
pF1KE1 QPDSFAALLSSLNELGERQLVHVVKWAKALPGFRNLHVDDQMAVIQYSWMGLMVFAMGWR
::: ....:: :: ::.. .::::::.:::::::.::::...::::: ::.::.:::
CCDS34 VPDSTWRIMTTLNMLGGRQVIAAVKWAKAIPGFRNLHLDDQMTLLQYSWMFLMAFALGWR
560 570 580 590 600 610
760 770 780 790 800 810
pF1KE1 SFTNVNSRMLYFAPDLVFNEYRMHKSRMYSQCVRMRHLSQEFGWLQITPQEFLCMKALLL
:. . .. .: :::::..:: :: ::.:: .: ..:.:. ::.. .:.::::.:::
CCDS34 SYRQSSANLLCFAPDLIINEQRMTLPCMYDQCKHMLYVSSELHRLQVSYEEYLCMKTLLL
620 630 640 650 660 670
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pF1KE1 FSIIPVDGLKNQKFFDELRMNYIKELDRIIACKRKNPTSCSRRFYQLTKLLDSVQPIARE
.: .: ::::.:..:::.::.::::: . :. .. : .. .:::::::::::.. ....
CCDS34 LSSVPKDGLKSQELFDEIRMTYIKELGKAIVKREGNSSQNWQRFYQLTKLLDSMHEVVEN
680 690 700 710 720 730
880 890 900 910
pF1KE1 LHQFTFDLLIKSHMVSVDFPEMMAEIISVQVPKILSGKVKPIYFHTQ
: .. :. .. . : :..::::.::::. :.:: .:..: . :: .
CCDS34 LLNYCFQTFLDKTM-SIEFPEMLAEIITNQIPKYSNGNIKKLLFHQK
740 750 760 770
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560 570 580 590 600 610
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::...::::.:::: .::.::::::.::::
CCDS59 MEGQHNYLCAGRNDCIVDKIRRKNCPACRLR
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620 630 640 650 660
pF1KE1 KCYEAGMTLGARKLKKLGNLKLQEEGEASSTTSP------TEETTQKLTVSHIEGYECQP
:: .:::.::.::.::...... . .: . .: .. .:..: : . . :
CCDS59 KCCQAGMVLGGRKFKKFNKVRVVRALDAVALPQPVGVPNESQALSQRFTFSPGQDIQLIP
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pF1KE1 IFLNVLEAIEPGVVCAGHDNNQPDSFAALLSSLNELGERQLVHVVKWAKALPGFRNLHVD
..:.: .::: :. :::::..::. ..::.:::.::::::. ::::.:.::::::::.:
CCDS59 PLINLLMSIEPDVIYAGHDNTKPDTSSSLLTSLNQLGERQLLSVVKWSKSLPGFRNLHID
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pF1KE1 DQMAVIQYSWMGLMVFAMGWRSFTNVNSRMLYFAPDLVFNEYRMHKSRMYSQCVRMRHLS
::...::::::.::::..::::. .:...::::::::..:: ::..: .:: :. : ..
CCDS59 DQITLIQYSWMSLMVFGLGWRSYKHVSGQMLYFAPDLILNEQRMKESSFYSLCLTMWQIP
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pF1KE1 QEFGWLQITPQEFLCMKALLLFSIIPVDGLKNQKFFDELRMNYIKELDRIIACKRKNPTS
::: ::.. .::::::.:::.. ::..::..: :.:.: .::.:: . :. ..:. .:
CCDS59 QEFVKLQVSQEEFLCMKVLLLLNTIPLEGLRSQTQFEEMRSSYIRELIKAIGLRQKGVVS
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850 860 870 880 890 900
pF1KE1 CSRRFYQLTKLLDSVQPIARELHQFTFDLLIKSHMVSVDFPEMMAEIISVQVPKILSGKV
:.::::::::::... ....:: . .. .:.:. .::.:::::.:.:..:.::::.: :
CCDS59 SSQRFYQLTKLLDNLHDLVKQLHLYCLNTFIQSRALSVEFPEMMSEVIAAQLPKILAGMV
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910
pF1KE1 KPIYFHTQ
::. :: .
CCDS59 KPLLFHKK
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:: .:... . . .:: : : ::
CCDS47 TASLSQQQDQKPIFNVIPPIPVGSENWNRCQG-SGDDNLTSLGTLNFPGRTVFSNGYSSP
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pF1KE1 TCVKSEMGPWMDSYSGPYGDMRLETARDHVLPIDYYFPPQKTCLICGDEASGCHYGALTC
. : : : : : .. :. :: : ::.:.:::::::::.:::
CCDS47 S-----MRP--DVSSPPSSSSTATTG-----------PPPKLCLVCSDEASGCHYGVLTC
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pF1KE1 GSCKVFFKRAAEGKQKYLCASRNDCTIDKFRRKNCPSCRLRKCYEAGMTLGARKLKKLGN
::::::::::.::...::::.:::: :::.::::::.:: ::: .:::.: ::: ::
CCDS47 GSCKVFFKRAVEGQHNYLCAGRNDCIIDKIRRKNCPACRYRKCLQAGMNLEARKTKK---
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pF1KE1 LKLQEEGEASSTTSPTEETTQK---LTVSHIEGYECQPIFLNVLEAIEPGVVCAGHDNNQ
:.. : ..::. ..::... :. . : ....::.::: :. ::.:..
CCDS47 -KIK--GIQQATTGVSQETSENPGNKTIVPATLPQLTPTLVSLLEVIEPEVLYAGYDSSV
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::: ....:: :: ::.. .::::::.:::::::.::::...::::: ::.::.::::
CCDS47 PDSTWRIMTTLNMLGGRQVIAAVKWAKAIPGFRNLHLDDQMTLLQYSWMFLMAFALGWRS
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pF1KE1 FTNVNSRMLYFAPDLVFNEYRMHKSRMYSQCVRMRHLSQEFGWLQITPQEFLCMKALLLF
. . .. .: :::::..:: :: ::.:: .: ..:.:. ::.. .:.::::.:::.
CCDS47 YRQSSANLLCFAPDLIINEQRMTLPCMYDQCKHMLYVSSELHRLQVSYEEYLCMKTLLLL
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: .: ::::.:..:::.::.::::: . :. .. : .. .:::::::::::..
CCDS47 SSVPKDGLKSQELFDEIRMTYIKELGKAIVKREGNSSQNWQRFYQLTKLLDSMHENVMWL
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pF1KE1 HQFTFDLLIKSHMVSVDFPEMMAEIISVQVPKILSGKVKPIYFHTQ
CCDS47 KPESTSHTLI
740
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pF1KE1 LLQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQETSPRQQQQQQGEDGSPQAHRRGPTGYLVLDEEQQ
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120 130 140 150 160 170
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.: :.: : : :. . . :..: . :. . . : .::. : :. :
CCDS37 GHRP-STLSCVNTPLRSFMSDSGSSVNG--GVMRAVVKSPIMCHEKSPSVCSPLNMTSSV
150 160 170 180 190 200
180 190 200 210 220
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: :..: :. .. : . : . .. ..:: : .:: :.: ::
CCDS37 CSPAGINSVSSTTASFGSFPVHSPITQGTPLTCSPNVENRGSRSHSPAHASNVGSPLSSP
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230 240 250 260 270
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. . :.::. .. :.. : :: .: .: :.. . : . .:
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270 280 290 300 310 320
280 290 300 310 320
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:. : : . :.:. . . . :::.:: :: : . . . : : :
CCDS37 LSSPAASTVGSICSPVNNAFSYTASGTSAGSSTLRDVVPSPDTQEKGAQEVPFPKTEEVE
330 340 350 360 370 380
330 340 350 360 370 380
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: . . : .: :.. . .. .::.. .. . . : ... : :
CCDS37 S-----AISNGVTGQLNIVQYIKPEPDGAFS-SSCLGGNSKINSDSSFSVPIKQESTKHS
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390 400 410 420 430
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. ... ::. . :: .. . : :: : : :: . ...
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440 450 460 470 480 490
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..:. : : .. :.. : ..:: . . :: . . .: . . :. :.:
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500 510 520 530 540 550
500 510 520 530 540
pF1KE1 ----TAPDVWYP-GGMVSRVPYPSPTCVKSEMGPWMDSYSGPYGDMRLETARDHVLPIDY
: . : : . :: :. :. : : :. .. ..:
CCDS37 PPVNTLVESWKSHGDLSSRRSDGYPVL---EYIPENVS-SSTLRSVSTGSSR--------
560 570 580 590
550 560 570 580 590 600
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:.: ::.:::::::::::..::::::::::::.::...::::.:::: :::.:::::
CCDS37 ---PSKICLVCGDEASGCHYGVVTCGSCKVFFKRAVEGQHNYLCAGRNDCIIDKIRRKNC
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610 620 630 640 650
pF1KE1 PSCRLRKCYEAGMTLGARKLKKLGNLK-LQEEG-----------------EASSTTSPTE
:.:::.:: .:::.::::: ::::.:: ..:: :... .:..
CCDS37 PACRLQKCLQAGMNLGARKSKKLGKLKGIHEEQPQQQQPPPPPPPPQSPEEGTTYIAPAK
660 670 680 690 700 710
660 670 680 690 700
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: ... : .. . : . ::: ::: .: ::.:...::. :::.::.:. .
CCDS37 EPSVNTALVPQLSTISRALTPSPVMVLENIEPEIVYAGYDSSKPDTAENLLSTLNRLAGK
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pF1KE1 QLVHVVKWAKALPGFRNLHVDDQMAVIQYSWMGLMVFAMGWRSFTNVNSRMLYFAPDLVF
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770 780 790 800 810 820
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:: .::.: :: : :...: .: ::.: .:. ::.:::.: :: ::::.: :.:.
CCDS37 NEEKMHQSAMYELCQGMHQISLQFVRLQLTFEEYTIMKVLLLLSTIPKDGLKSQAAFEEM
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830 840 850 860 870 880
pF1KE1 RMNYIKELDRIIACKRKNPTSCSRRFYQLTKLLDSVQPIARELHQFTFDLLIKSHMVSVD
: :::::: .... .: . .:::::::::::.. .. .: .: : . .:: ..:.
CCDS37 RTNYIKELRKMVTKCPNNSGQSWQRFYQLTKLLDSMHDLVSDLLEFCFYTFRESHALKVE
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pF1KE1 FPEMMAEIISVQVPKILSGKVKPIYFHTQ
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CCDS37 FPAMLVEIISDQLPKVESGNAKPLYFHRK
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CCDS54 TELESKELSATVAESMGLYMDSVRDADYSYEQQNQQG-SMSP-AKIYQNVEQLVKFYKGN
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pF1KE1 PSQPQSALEC--HPERGCVPEPGAAVAASKGLPQQLPAPPDEDDSAAPSTLSLLGPTF--
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CCDS54 GHRP-STLSCVNTPLRSFMSDSGSSVNG--GVMRAVVKSPIMCHEKSPSVCSPLNMTSSV
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180 190 200 210 220
pF1KE1 --P-GLSSCSADLKDILSEASTMQLLQQQ----QQEAVSEGSSSGRAREAS--GAPTSSK
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CCDS54 CSPAGINSVSSTTASFGSFPVHSPITQGTPLTCSPNVENRGSRSHSPAHASNVGSPLSSP
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230 240 250 260 270
pF1KE1 DNYLGGTSTISDNAKELCKAVS-VSMGLGVEALEHLS-PGEQLRGDC-MYAP-------L
. . :.::. .. :.. : :: .: .: :.. . : . .:
CCDS54 LSSM--KSSISSPPSH-CSVKSPVSSPNNVTLRSSVSSPANINNSRCSVSSPSNTNNRST
270 280 290 300 310 320
280 290 300 310 320
pF1KE1 LGVPPAVR-PTPCAPLAEC-KGSLLDDSAGKST-------EDTAEYSPFKGGYTKGLEGE
:. : : . :.:. . . . :::.:: :: : . . . : : :
CCDS54 LSSPAASTVGSICSPVNNAFSYTASGTSAGSSTLRDVVPSPDTQEKGAQEVPFPKTEEVE
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330 340 350 360 370 380
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: . . : .: :.. . .. .::.. .. . . : ... : :
CCDS54 S-----AISNGVTGQLNIVQYIKPEPDGAFS-SSCLGGNSKINSDSSFSVPIKQESTKHS
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390 400 410 420 430
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. ... ::. . :: .. . : :: : : :: . ...
CCDS54 CSGTSFKGNPTVNPFPFMDGSYFSFMDDK----DYYSLSGILGPPVPGFDGNCEGSGFPV
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440 450 460 470 480 490
pF1KE1 HTLFTAEEGQLYGPCGGGGSGGGGGGGGGGGGGGGEAGAVAPYGYTRPPQGLAGQE-SDF
..:. : : .. :.. : ..:: . . :: . . .: . . :. :.:
CCDS54 GIKQEPDDGSYY-PEASIPSSAIVGVNSGGQSFHYRIGAQGTISLSRSARDQSFQHLSSF
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pF1KE1 ----TAPDVWYP-GGMVSRVPYPSPTCVKSEMGPWMDSYSGPYGDMRLETARDHVLPIDY
: . : : . :: :. :. : . :. .. ..:
CCDS54 PPVNTLVESWKSHGDLSSRRSDGYPVL---EYIP-ENVSSSTLRSVSTGSSR--------
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550 560 570 580 590 600
pF1KE1 YFPPQKTCLICGDEASGCHYGALTCGSCKVFFKRAAEGKQKYLCASRNDCTIDKFRRKNC
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CCDS54 ---PSKICLVCGDEASGCHYGVVTCGSCKVFFKRAVEGQHNYLCAGRNDCIIDKIRRKNC
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610 620 630 640 650 660
pF1KE1 PSCRLRKCYEAGMTLGARKLKKLGNLKLQEEGEASSTTSPTEETTQKLTVSHIEGYECQP
:.:::.:: .:::.::
CCDS54 PACRLQKCLQAGMNLG--------------------------------------------
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::.:: ..
CCDS54 ----------------------------------------------------GFKNLPLE
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CCDS54 LQFVRLQLTFEEYTIMKVLLLLSTIPKDGLKSQAAFEEMRTNYIKELRKMVTKCPNNSGQ
740 750 760 770 780 790
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CCDS54 SWQRFYQLTKLLDSMHDLVSDLLEFCFYTFRESHALKVEFPAMLVEIISDQLPKVESGNA
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pF1KE1 KPIYFHTQ
::.::: .
CCDS54 KPLYFHRK
860
917 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sun Nov 6 20:06:53 2016 done: Sun Nov 6 20:06:54 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]