Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE1590
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE1590, 1168 aa
1>>>pF1KE1590 1168 - 1168 aa - 1168 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.0748+/-0.000921; mu= 9.9668+/- 0.055
mean_var=142.7275+/-29.282, 0's: 0 Z-trim(110.3): 76 B-trim: 0 in 0/52
Lambda= 0.107355
statistics sampled from 11426 (11500) to 11426 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.694), E-opt: 0.2 (0.353), width: 16
Scan time: 5.750
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS33972.1 TBC1D1 gene_id:23216|Hs108|chr4 (1168) 7754 1213.3 0
CCDS58897.1 TBC1D1 gene_id:23216|Hs108|chr4 (1159) 4238 668.7 2.2e-191
CCDS66563.1 TBC1D4 gene_id:9882|Hs108|chr13 (1235) 2315 370.9 1.1e-101
CCDS41901.1 TBC1D4 gene_id:9882|Hs108|chr13 (1298) 2179 349.8 2.4e-95
CCDS66564.1 TBC1D4 gene_id:9882|Hs108|chr13 (1290) 2175 349.2 3.7e-95
CCDS6848.2 RABGAP1 gene_id:23637|Hs108|chr9 (1069) 732 125.7 5.9e-28
CCDS1314.1 RABGAP1L gene_id:9910|Hs108|chr1 ( 815) 629 109.7 3e-23
CCDS12188.1 EVI5L gene_id:115704|Hs108|chr19 ( 794) 584 102.7 3.6e-21
CCDS30774.1 EVI5 gene_id:7813|Hs108|chr1 ( 810) 583 102.6 4.1e-21
CCDS76179.1 EVI5 gene_id:7813|Hs108|chr1 ( 821) 580 102.1 5.7e-21
CCDS54209.1 EVI5L gene_id:115704|Hs108|chr19 ( 805) 574 101.2 1.1e-20
CCDS53492.1 USP6NL gene_id:9712|Hs108|chr10 ( 828) 440 80.4 1.9e-14
CCDS44357.1 USP6NL gene_id:9712|Hs108|chr10 ( 845) 440 80.4 2e-14
CCDS13874.1 TBC1D10A gene_id:83874|Hs108|chr22 ( 508) 416 76.6 1.7e-13
CCDS56227.1 TBC1D10A gene_id:83874|Hs108|chr22 ( 515) 416 76.6 1.7e-13
CCDS10676.2 TBC1D10B gene_id:26000|Hs108|chr16 ( 808) 412 76.1 3.9e-13
CCDS9534.2 GRTP1 gene_id:79774|Hs108|chr13 ( 336) 397 73.6 9e-13
CCDS14002.1 SGSM3 gene_id:27352|Hs108|chr22 ( 749) 403 74.7 9.5e-13
CCDS66591.1 GRTP1 gene_id:79774|Hs108|chr13 ( 344) 393 73.0 1.4e-12
CCDS8162.1 TBC1D10C gene_id:374403|Hs108|chr11 ( 446) 394 73.2 1.6e-12
CCDS32301.2 TBC1D2B gene_id:23102|Hs108|chr15 ( 914) 380 71.1 1.3e-11
CCDS45314.1 TBC1D2B gene_id:23102|Hs108|chr15 ( 963) 380 71.2 1.4e-11
CCDS59137.1 TBC1D2 gene_id:55357|Hs108|chr9 ( 468) 374 70.1 1.4e-11
CCDS47136.1 TBC1D9 gene_id:23158|Hs108|chr4 (1266) 377 70.7 2.4e-11
CCDS75865.1 TBC1D2 gene_id:55357|Hs108|chr9 ( 928) 374 70.2 2.6e-11
>>CCDS33972.1 TBC1D1 gene_id:23216|Hs108|chr4 (1168 aa)
initn: 7754 init1: 7754 opt: 7754 Z-score: 6492.4 bits: 1213.3 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 7754; 99.9% identity (99.9% similar) in 1168 aa overlap (1-1168:1-1168)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MEPITFTARKHLLSNEVSVDFGLQLVGSLPVHSLTTMPMLPWVVAEVRRLSRQSTRKEPV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 MEPITFTARKHLLSNEVSVDFGLQLVGSLPVHSLTTMPMLPWVVAEVRRLSRQSTRKEPV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 TKQVRLCVSPSGLRCEPEPGRSQQWDPLIYSSIFECKPQRVHKLIHNSHDPSYFACLIKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 TKQVRLCVSPSGLRCEPEPGRSQQWDPLIYSSIFECKPQRVHKLIHNSHDPSYFACLIKE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 DAVHRQSICYVFKADDQTKVPEIISSIRQAGKIARQEELHCPSEFDDTFSKKFEVLFCGR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 DAVHRQSICYVFKADDQTKVPEIISSIRQAGKIARQEELHCPSEFDDTFSKKFEVLFCGR
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 VTVAHKKAPPALIDECIEKFNHVSGSRGSESPRPNPPHAAPTGSQEPGRRPMRKSFSQPG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::
CCDS33 VTVAHKKAPPALIDECIEKFNHVSGSRGSESPRPNPPHAAPTGSQEPVRRPMRKSFSQPG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 LRSLAFRKELQDGGLRSSGFFSSFEESDIENHLISGHNIVQPTDIEENRTMLFTIGQSEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 LRSLAFRKELQDGGLRSSGFFSSFEESDIENHLISGHNIVQPTDIEENRTMLFTIGQSEV
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 YLISPDTKKIALEKNFKEISFCSQGIRHVDHFGFICRESSGGGGFHFVCYVFQCTNEALV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 YLISPDTKKIALEKNFKEISFCSQGIRHVDHFGFICRESSGGGGFHFVCYVFQCTNEALV
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 DEIMMTLKQAFTVAAVQQTAKAPAQLCEGCPLQSLHKLCERIEGMNSSKTKLELQKHLTT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 DEIMMTLKQAFTVAAVQQTAKAPAQLCEGCPLQSLHKLCERIEGMNSSKTKLELQKHLTT
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE1 LTNQEQATIFEEVQKLRPRNEQRENELIISFLRCLYEEKQKEHIHIGEMKQTSQMAAENI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 LTNQEQATIFEEVQKLRPRNEQRENELIISFLRCLYEEKQKEHIHIGEMKQTSQMAAENI
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE1 GSELPPSATRFRLDMLKNKAKRSLTESLESILSRGNKARGLQEHSISVDLDSSLSSTLSN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 GSELPPSATRFRLDMLKNKAKRSLTESLESILSRGNKARGLQEHSISVDLDSSLSSTLSN
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE1 TSKEPSVCEKEALPISESSFKLLGSSEDLSSDSESHLPEEPAPLSPQQAFRRRANTLSHF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 TSKEPSVCEKEALPISESSFKLLGSSEDLSSDSESHLPEEPAPLSPQQAFRRRANTLSHF
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE1 PIECQEPPQPARGSPGVSQRKLMRYHSVSTETPHERKDFESKANHLGDSGGTPVKTRRHS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 PIECQEPPQPARGSPGVSQRKLMRYHSVSTETPHERKDFESKANHLGDSGGTPVKTRRHS
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE1 WRQQIFLRVATPQKACDSSSRYEDYSELGELPPRSPLEPVCEDGPFGPPPEEKKRTSREL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 WRQQIFLRVATPQKACDSSSRYEDYSELGELPPRSPLEPVCEDGPFGPPPEEKKRTSREL
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE1 RELWQKAILQQILLLRMEKENQKLQASENDLLNKRLKLDYEEITPCLKEVTTVWEKMLST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 RELWQKAILQQILLLRMEKENQKLQASENDLLNKRLKLDYEEITPCLKEVTTVWEKMLST
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE1 PGRSKIKFDMEKMHSAVGQGVPRHHRGEIWKFLAEQFHLKHQFPSKQQPKDVPYKELLKQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 PGRSKIKFDMEKMHSAVGQGVPRHHRGEIWKFLAEQFHLKHQFPSKQQPKDVPYKELLKQ
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KE1 LTSQQHAILIDLGRTFPTHPYFSAQLGAGQLSLYNILKAYSLLDQEVGYCQGLSFVAGIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 LTSQQHAILIDLGRTFPTHPYFSAQLGAGQLSLYNILKAYSLLDQEVGYCQGLSFVAGIL
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KE1 LLHMSEEEAFKMLKFLMFDMGLRKQYRPDMIILQIQMYQLSRLLHDYHRDLYNHLEEHEI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 LLHMSEEEAFKMLKFLMFDMGLRKQYRPDMIILQIQMYQLSRLLHDYHRDLYNHLEEHEI
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KE1 GPSLYAAPWFLTMFASQFPLGFVARVFDMIFLQGTEVIFKVALSLLGSHKPLILQHENLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 GPSLYAAPWFLTMFASQFPLGFVARVFDMIFLQGTEVIFKVALSLLGSHKPLILQHENLE
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KE1 TIVDFIKSTLPNLGLVQMEKTINQVFEMDIAKQLQAYEVEYHVLQEELIDSSPLSDNQRM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 TIVDFIKSTLPNLGLVQMEKTINQVFEMDIAKQLQAYEVEYHVLQEELIDSSPLSDNQRM
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KE1 DKLEKTNSSLRKQNLDLLEQLQVANGRIQSLEATIEKLLSSESKLKQAMLTLELERSALL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 DKLEKTNSSLRKQNLDLLEQLQVANGRIQSLEATIEKLLSSESKLKQAMLTLELERSALL
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160
pF1KE1 QTVEELRRRSAEPSDREPECTQPEPTGD
::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 QTVEELRRRSAEPSDREPECTQPEPTGD
1150 1160
>>CCDS58897.1 TBC1D1 gene_id:23216|Hs108|chr4 (1159 aa)
initn: 6242 init1: 4238 opt: 4238 Z-score: 3549.5 bits: 668.7 E(32554): 2.2e-191
Smith-Waterman score: 6655; 84.2% identity (84.3% similar) in 1262 aa overlap (1-1168:1-1159)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MEPITFTARKHLLSNEVSVDFGLQLVGSLPVHSLTTMPMLPWVVAEVRRLSRQSTRKEPV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 MEPITFTARKHLLSNEVSVDFGLQLVGSLPVHSLTTMPMLPWVVAEVRRLSRQSTRKEPV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 TKQVRLCVSPSGLRCEPEPGRSQQWDPLIYSSIFECKPQRVHKLIHNSHDPSYFACLIKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 TKQVRLCVSPSGLRCEPEPGRSQQWDPLIYSSIFECKPQRVHKLIHNSHDPSYFACLIKE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 DAVHRQSICYVFKADDQTKVPEIISSIRQAGKIARQEELHCPSEFDDTFSKKFEVLFCGR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 DAVHRQSICYVFKADDQTKVPEIISSIRQAGKIARQEELHCPSEFDDTFSKKFEVLFCGR
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 VTVAHKKAPPALIDECIEKFNHVSGSRGSESPRPNPPHAAPTGSQEPGRRPMRKSFSQPG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::
CCDS58 VTVAHKKAPPALIDECIEKFNHVSGSRGSESPRPNPPHAAPTGSQEPVRRPMRKSFSQPG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 LRSLAFRKELQDGGLRSSGFFSSFEESDIENHLISGHNIVQPTDIEENRTMLFTIGQSEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 LRSLAFRKELQDGGLRSSGFFSSFEESDIENHLISGHNIVQPTDIEENRTMLFTIGQSEV
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 YLISPDTKKIALEKNFKEISFCSQGIRHVDHFGFICRESSGGGGFHFVCYVFQCTNEALV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 YLISPDTKKIALEKNFKEISFCSQGIRHVDHFGFICRESSGGGGFHFVCYVFQCTNEALV
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 DEIMMTLKQAFTVAAVQQTAKAPAQLCEGCPLQSLHKLCERIEGMNSSKTKLELQKHLTT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 DEIMMTLKQAFTVAAVQQTAKAPAQLCEGCPLQSLHKLCERIEGMNSSKTKLELQKHLTT
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE1 LTNQEQATIFEEVQKLRPRNEQRENELIISFLRCLYEEKQKEHIHIGEMKQTSQMAAENI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 LTNQEQATIFEEVQKLRPRNEQRENELIISFLRCLYEEKQKEHIHIGEMKQTSQMAAENI
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE1 GSELPPSATRFRLDMLKNKAKRSLTESLESILSRGNKARGLQEHSISVDLDSSLSSTLSN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 GSELPPSATRFRLDMLKNKAKRSLTESLESILSRGNKARGLQEHSISVDLDSSLSSTLSN
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE1 TSKEPSVCEKEALPISESSFKLLGSSEDLSSDSESHLPEEPAPLSPQQAFRRRANTLSHF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 TSKEPSVCEKEALPISESSFKLLGSSEDLSSDSESHLPEEPAPLSPQQAFRRRANTLSHF
550 560 570 580 590 600
610 620 630
pF1KE1 PIECQEPPQPARGSPGVSQRKLMRYHSVSTETPHER------------------------
::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 PIECQEPPQPARGSPGVSQRKLMRYHSVSTETPHERNVDPSPVGESKHRPGQSSAPAPPP
610 620 630 640 650 660
pF1KE1 ------------------------------------------------------------
CCDS58 RLNPSASSPNFFKYLKHNSSGEQSGNAVPKSISYRNALRKKLHSSSSVPNFLKFLAPVDE
670 680 690 700 710 720
640 650 660 670 680
pF1KE1 ----------KDFESKANHLGDSGGTPVKTRRHSWRQQIFLRVATPQKACDSSSRYEDYS
.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 NNTSDFMNTKRDFESKANHLGDSGGTPVKTRRHSWRQQIFLRVATPQKACDSSSRYEDYS
730 740 750 760 770 780
690 700 710 720 730 740
pF1KE1 ELGELPPRSPLEPVCEDGPFGPPPEEKKRTSRELRELWQKAILQQILLLRMEKENQKLQA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 ELGELPPRSPLEPVCEDGPFGPPPEEKKRTSRELRELWQKAILQQILLLRMEKENQKLQA
790 800 810 820 830 840
750 760 770 780 790 800
pF1KE1 SENDLLNKRLKLDYEEITPCLKEVTTVWEKMLSTPGRSKIKFDMEKMHSAVGQGVPRHHR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 SENDLLNKRLKLDYEEITPCLKEVTTVWEKMLSTPGRSKIKFDMEKMHSAVGQGVPRHHR
850 860 870 880 890 900
810 820 830 840 850 860
pF1KE1 GEIWKFLAEQFHLKHQFPSKQQPKDVPYKELLKQLTSQQHAILIDLGRTFPTHPYFSAQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 GEIWKFLAEQFHLKHQFPSKQQPKDVPYKELLKQLTSQQHAILIDLGRTFPTHPYFSAQL
910 920 930 940 950 960
870 880 890 900 910 920
pF1KE1 GAGQLSLYNILKAYSLLDQEVGYCQGLSFVAGILLLHMSEEEAFKMLKFLMFDMGLRKQY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 GAGQLSLYNILKAYSLLDQEVGYCQGLSFVAGILLLHMSEEEAFKMLKFLMFDMGLRKQY
970 980 990 1000 1010 1020
930 940 950 960 970 980
pF1KE1 RPDMIILQIQMYQLSRLLHDYHRDLYNHLEEHEIGPSLYAAPWFLTMFASQFPLGFVARV
::::::::
CCDS58 RPDMIILQ----------------------------------------------------
990 1000 1010 1020 1030 1040
pF1KE1 FDMIFLQGTEVIFKVALSLLGSHKPLILQHENLETIVDFIKSTLPNLGLVQMEKTINQVF
:::::::::
CCDS58 ---------------------------------------------------MEKTINQVF
1030
1050 1060 1070 1080 1090 1100
pF1KE1 EMDIAKQLQAYEVEYHVLQEELIDSSPLSDNQRMDKLEKTNSSLRKQNLDLLEQLQVANG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 EMDIAKQLQAYEVEYHVLQEELIDSSPLSDNQRMDKLEKTNSSLRKQNLDLLEQLQVANG
1040 1050 1060 1070 1080 1090
1110 1120 1130 1140 1150 1160
pF1KE1 RIQSLEATIEKLLSSESKLKQAMLTLELERSALLQTVEELRRRSAEPSDREPECTQPEPT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 RIQSLEATIEKLLSSESKLKQAMLTLELERSALLQTVEELRRRSAEPSDREPECTQPEPT
1100 1110 1120 1130 1140 1150
pF1KE1 GD
::
CCDS58 GD
>>CCDS66563.1 TBC1D4 gene_id:9882|Hs108|chr13 (1235 aa)
initn: 3397 init1: 1520 opt: 2315 Z-score: 1939.4 bits: 370.9 E(32554): 1.1e-101
Smith-Waterman score: 3657; 51.3% identity (72.9% similar) in 1208 aa overlap (21-1160:36-1214)
10 20 30 40 50
pF1KE1 MEPITFTARKHLLSNEVSVDFGLQLVGSLPVHSLTTMPMLPWVVAEVRRL
: : ::. . ::.:::::..::.::
CCDS66 CIQDEPFPHPLEPEPGVSAQPGPGKPSDKRFRLWYVGGSCLDHRTTLPMLPWLMAEIRRR
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90
pF1KE1 SRQSTRK---EPVTKQVRLCVSPSGLRCEPEPG---------RSQQWDPLIYSSIFECKP
:.. :....: : .: ::: : :: . : .: .. ::: :
CCDS66 SQKPEAGGCGAPAAREVILVLSAPFLRCVPAPGAGASGGTSPSATQPNPAVF--IFEHKA
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KE1 QRVHKLIHNSHDPSYFACLIKE--DAVHRQSICYVFKADDQTKVPEIISSIRQAGKIARQ
:.. ..:::::: .::: ::: : . : :.::.: : ..::..:::::: .: : .
CCDS66 QHISRFIHNSHDLTYFAYLIKAQPDDPESQMACHVFRATDPSQVPDVISSIRQLSKAAMK
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200
pF1KE1 EELHCPSEFDDTF--SKKFEVLFCGRVTVAHKKAPPALIDECIEKFN-H------VSG-S
:. . .. .:.: :.:::::.::.:::.::::: .:::.:.:::. : ..: .
CCDS66 EDAKPSKDNEDAFYNSQKFEVLYCGKVTVTHKKAPSSLIDDCMEKFSLHEQQRLKIQGEQ
190 200 210 220 230 240
210 220 230 240
pF1KE1 RGSE--------------SPRPNPPHAA---------PTGSQEPGRRPMRKSFSQPGLRS
:: . :: :. : :.:...:. : : . :..
CCDS66 RGPDPGEDLADLEVVVPGSPGDCLPEEADGTDTHLGLPAGASQPALTSSRVCFPERILED
250 260 270 280 290 300
250 260 270 280 290
pF1KE1 LAF--RKELQDGGLRSSGFFSSFEE----SDIENHLISGHNIVQPTDIEENRTMLFTIGQ
.: ..:... .: .: :. . . :. . :::.: :.:::::: .:.
CCDS66 SGFDEQQEFRSRCSSVTGVQRRVHEGSQKSQPRRRHASAPSHVQPSDSEKNRTMLFQVGR
310 320 330 340 350 360
300 310 320 330 340 350
pF1KE1 SEVYLISPDTKKIALEKNFKEISFCSQGIRHVDHFGFICRESSGGGGFHFVCYVFQCTNE
:. :::::::...::::::.:: :::::.:::::::::::: : ...::::::..:
CCDS66 FEINLISPDTKSVVLEKNFKDISSCSQGIKHVDHFGFICRESPEPGLSQYICYVFQCASE
370 380 390 400 410 420
360 370 380 390 400 410
pF1KE1 ALVDEIMMTLKQAFTVAAVQQTAKAPAQLCEGCPLQSLHKLCERIEGMNSSKTKLELQKH
.::::.:.::::::..::. :.::. .:::.::..:::::::::::. ..:: .:.:
CCDS66 SLVDEVMLTLKQAFSTAAALQSAKTQIKLCEACPMHSLHKLCERIEGLYPPRAKLVIQRH
430 440 450 460 470 480
420 430 440 450 460 470
pF1KE1 LTTLTNQEQATIFEEVQKLRPRNEQRENELIISFLRCLYEEKQKEHIHIGEMKQTSQMAA
:..::..::: :::.:::..: ..:.::::.: :: : : ::: :.:::: .: .
CCDS66 LSSLTDNEQADIFERVQKMKPVSDQEENELVILHLRQLCEAKQKTHVHIGEGPSTIS---
490 500 510 520 530 540
480 490 500 510 520 530
pF1KE1 ENIGSELPPSAT---RFRLDMLKNKAKRSLTESLESILSRG-NKARGLQEHSISVDLDSS
.: .: .:: ::.::.:::::::::: :::.:.::: :. :: : . ..:
CCDS66 ---NSTIPENATSSGRFKLDILKNKAKRSLTSSLENIFSRGANRMRGRLGSVDSFERSNS
550 560 570 580 590
540 550 560 570 580 590
pF1KE1 LSSTLSNTSKEPSVCEKEALPISESSFKLLGSSEDLSSDSESHLPEEPAPLSPQQAFRRR
:.: ::. : ..: .: :.. . .::: . ::: ::::
CCDS66 LAS------------EKDYSP-GDSPPGTPPASP--PSSAWQTFPEEDSD-SPQ--FRRR
600 610 620 630
600 610 620 630 640 650
pF1KE1 ANTLSHFPIECQEPPQPARGSPGVSQRKLMRYHSVSTETPHE-RKDFESKANHLGDS-GG
:.:.:: : .. . : . :.: : . : :: : .. . : ::
CCDS66 AHTFSHPPSSTKRKLNLQDGRAQGVRSPLLRQSSSEQCSDGEGRKRTSSTCSNESLSVGG
640 650 660 670 680 690
660 670 680 690 700
pF1KE1 TPVKTRRHSWRQQIFLRVATPQKACDSSSRYEDYSELGELPPRSPLEPVCEDGPF-----
: : :: ::::.::::::.:.. :. . .: . .:: : ::: :. :. :.
CCDS66 TSVTPRRISWRQRIFLRVASPMNKSPSAMQQQDGLDRNELLPLSPLSPTMEEEPLVVFLS
700 710 720 730 740 750
710 720 730 740 750 760
pF1KE1 ---GPPPEEKKRTSRELRELWQKAILQQILLLRMEKENQKLQASENDLLNKRLKLDYEEI
: :... :.::: ::.::: :::::::::::::::.::...: ....::::::.
CCDS66 GEDDPEKIEERKKSKELRSLWRKAIHQQILLLRMEKENQKLEASRDELQSRKVKLDYEEV
760 770 780 790 800 810
770 780 790 800 810 820
pF1KE1 TPCLKEVTTVWEKMLSTPGRSKIKFDMEKMHSAVGQGVPRHHRGEIWKFLAEQFHLKHQF
: ::: .:.: : . :.::. ::: .:. . .:::. .:::::.::: :..:.:..
CCDS66 GACQKEVLITWDKKLLN-CRAKIRCDMEDIHTLLKEGVPKSRRGEIWQFLALQYRLRHRL
820 830 840 850 860 870
830 840 850 860 870 880
pF1KE1 PSKQQPKDVPYKELLKQLTSQQHAILIDLGRTFPTHPYFSAQLGAGQLSLYNILKAYSLL
:.:::: :. :::::::::.::::::.:::::::::::::.::: :::::.:.:::::::
CCDS66 PNKQQPPDISYKELLKQLTAQQHAILVDLGRTFPTHPYFSVQLGPGQLSLFNLLKAYSLL
880 890 900 910 920 930
890 900 910 920 930 940
pF1KE1 DQEVGYCQGLSFVAGILLLHMSEEEAFKMLKFLMFDMGLRKQYRPDMIILQIQMYQLSRL
:.:::::::.:::::.::::::::.::.::::::.:.:.::::::::. :::::::::::
CCDS66 DKEVGYCQGISFVAGVLLLHMSEEQAFEMLKFLMYDLGFRKQYRPDMMSLQIQMYQLSRL
940 950 960 970 980 990
950 960 970 980 990 1000
pF1KE1 LHDYHRDLYNHLEEHEIGPSLYAAPWFLTMFASQFPLGFVARVFDMIFLQGTEVIFKVAL
::::::::::::::.::.:::::::::::.::::: :::::::::.::::::::::::::
CCDS66 LHDYHRDLYNHLEENEISPSLYAAPWFLTLFASQFSLGFVARVFDIIFLQGTEVIFKVAL
1000 1010 1020 1030 1040 1050
1010 1020 1030 1040 1050 1060
pF1KE1 SLLGSHKPLILQHENLETIVDFIKSTLPNLGLVQMEKTINQVFEMDIAKQLQAYEVEYHV
:::.:.. ::.. :..:.::.:.:.:::... .::: :.:::::::.:::.::::::::
CCDS66 SLLSSQETLIMECESFENIVEFLKNTLPDMNTSEMEKIITQVFEMDISKQLHAYEVEYHV
1060 1070 1080 1090 1100 1110
1070 1080 1090 1100 1110 1120
pF1KE1 LQEELIDSS-PLSDNQRMDKLEKTNSSLRKQNLDLLEQLQVANGRIQSLEATIEKLLSSE
::.:: .:: :.. ..:::..::.:..::.::::.::::. .::.::...:.::. :
CCDS66 LQDELQESSYSCEDSETLEKLERANSQLKRQNMDLLEKLQVAHTKIQALESNLENLLTRE
1120 1130 1140 1150 1160 1170
1130 1140 1150 1160
pF1KE1 SKLKQAMLTLELERSALLQTVEELRRRSAEPSDREPECTQPEPTGD
.:.:. . ::: :. : .:::.::. :.: .:
CCDS66 TKMKSLIRTLEQEKMAYQKTVEQLRK--LLPADALVNCDLLLRDLNCNPNNKAKIGNKP
1180 1190 1200 1210 1220 1230
>>CCDS41901.1 TBC1D4 gene_id:9882|Hs108|chr13 (1298 aa)
initn: 3397 init1: 1520 opt: 2179 Z-score: 1825.2 bits: 349.8 E(32554): 2.4e-95
Smith-Waterman score: 3466; 49.9% identity (71.3% similar) in 1200 aa overlap (73-1160:91-1277)
50 60 70 80 90
pF1KE1 VVAEVRRLSRQSTRKEPVTKQVRLCVSPSGLRCEPEPG---------RSQQWDPLIYSSI
::: : :: . : .: .. :
CCDS41 EIRRRSQKPEAGGCGAPAAREVILVLSAPFLRCVPAPGAGASGGTSPSATQPNPAVF--I
70 80 90 100 110
100 110 120 130 140 150
pF1KE1 FECKPQRVHKLIHNSHDPSYFACLIKE--DAVHRQSICYVFKADDQTKVPEIISSIRQAG
:: : :.. ..:::::: .::: ::: : . : :.::.: : ..::..:::::: .
CCDS41 FEHKAQHISRFIHNSHDLTYFAYLIKAQPDDPESQMACHVFRATDPSQVPDVISSIRQLS
120 130 140 150 160 170
160 170 180 190 200
pF1KE1 KIARQEELHCPSEFDDTF--SKKFEVLFCGRVTVAHKKAPPALIDECIEKFN-H------
: : .:. . .. .:.: :.:::::.::.:::.::::: .:::.:.:::. :
CCDS41 KAAMKEDAKPSKDNEDAFYNSQKFEVLYCGKVTVTHKKAPSSLIDDCMEKFSLHEQQRLK
180 190 200 210 220 230
210 220 230
pF1KE1 VSG-SRGSE--------------SPRPNPPHAA---------PTGSQEPGRRPMRKSFSQ
..: .:: . :: :. : :.:...:. : : .
CCDS41 IQGEQRGPDPGEDLADLEVVVPGSPGDCLPEEADGTDTHLGLPAGASQPALTSSRVCFPE
240 250 260 270 280 290
240 250 260 270 280 290
pF1KE1 PGLRSLAF--RKELQDGGLRSSGFFSSFEE----SDIENHLISGHNIVQPTDIEENRTML
:.. .: ..:... .: .: :. . . :. . :::.: :.:::::
CCDS41 RILEDSGFDEQQEFRSRCSSVTGVQRRVHEGSQKSQPRRRHASAPSHVQPSDSEKNRTML
300 310 320 330 340 350
300 310 320 330 340 350
pF1KE1 FTIGQSEVYLISPDTKKIALEKNFKEISFCSQGIRHVDHFGFICRESSGGGGFHFVCYVF
: .:. :. :::::::...::::::.:: :::::.:::::::::::: : ...::::
CCDS41 FQVGRFEINLISPDTKSVVLEKNFKDISSCSQGIKHVDHFGFICRESPEPGLSQYICYVF
360 370 380 390 400 410
360 370 380 390 400 410
pF1KE1 QCTNEALVDEIMMTLKQAFTVAAVQQTAKAPAQLCEGCPLQSLHKLCERIEGMNSSKTKL
::..:.::::.:.::::::..::. :.::. .:::.::..:::::::::::. ..::
CCDS41 QCASESLVDEVMLTLKQAFSTAAALQSAKTQIKLCEACPMHSLHKLCERIEGLYPPRAKL
420 430 440 450 460 470
420 430 440 450 460 470
pF1KE1 ELQKHLTTLTNQEQATIFEEVQKLRPRNEQRENELIISFLRCLYEEKQKEHIHIGEMKQT
.:.::..::..::: :::.:::..: ..:.::::.: :: : : ::: :.:::: .:
CCDS41 VIQRHLSSLTDNEQADIFERVQKMKPVSDQEENELVILHLRQLCEAKQKTHVHIGEGPST
480 490 500 510 520 530
480 490 500 510 520
pF1KE1 SQMAAENIGSELPPSAT---RFRLDMLKNKAKRSLTESLESILSRG-NKARGLQEHSISV
. .: .: .:: ::.::.:::::::::: :::.:.::: :. :: :
CCDS41 IS------NSTIPENATSSGRFKLDILKNKAKRSLTSSLENIFSRGANRMRGRLGSVDSF
540 550 560 570 580 590
530 540 550 560 570 580
pF1KE1 DLDSSLSSTLSNTSKEPSVCEKEALPISESSFKLLGSSEDLSSD-------SESHLPEEP
. ..::.: . . . : : : :... . :: .: . :: :
CCDS41 ERSNSLASEKDYSPGDSPPGTPPASPPS-SAWQTF-PEEDSDSPQFRRRAHTFSHPPSST
600 610 620 630 640 650
590 600 610
pF1KE1 ---------------APL----SPQQ-----AFRR---RANTLSHFPIECQEPPQPARGS
.:: : .: . :: ..:. : .: :. .
CCDS41 KRKLNLQDGRAQGVRSPLLRQSSSEQCSNLSSVRRMYKESNSSSSLPSLHTSFSAPSFTA
660 670 680 690 700 710
620 630 640 650
pF1KE1 PGV-------SQRKLMRYHS-VSTETPHERKDFESK-------ANHLGDSGGTPVKTRRH
:. : : .:.. . .: : .: :.. .:. . ::: : ::
CCDS41 PSFLKSFYQNSGRLSPQYENEIRQDTASESSDGEGRKRTSSTCSNESLSVGGTSVTPRRI
720 730 740 750 760 770
660 670 680 690 700 710
pF1KE1 SWRQQIFLRVATPQKACDSSSRYEDYSELGELPPRSPLEPVCEDGPF--------GPPPE
::::.::::::.:.. :. . .: . .:: : ::: :. :. :. :
CCDS41 SWRQRIFLRVASPMNKSPSAMQQQDGLDRNELLPLSPLSPTMEEEPLVVFLSGEDDPEKI
780 790 800 810 820 830
720 730 740 750 760 770
pF1KE1 EKKRTSRELRELWQKAILQQILLLRMEKENQKLQASENDLLNKRLKLDYEEITPCLKEVT
:... :.::: ::.::: :::::::::::::::.::...: ....::::::. : :::
CCDS41 EERKKSKELRSLWRKAIHQQILLLRMEKENQKLEASRDELQSRKVKLDYEEVGACQKEVL
840 850 860 870 880 890
780 790 800 810 820 830
pF1KE1 TVWEKMLSTPGRSKIKFDMEKMHSAVGQGVPRHHRGEIWKFLAEQFHLKHQFPSKQQPKD
.:.: : :.::. ::: .:. . .:::. .:::::.::: :..:.:..:.:::: :
CCDS41 ITWDKKL-LNCRAKIRCDMEDIHTLLKEGVPKSRRGEIWQFLALQYRLRHRLPNKQQPPD
900 910 920 930 940
840 850 860 870 880 890
pF1KE1 VPYKELLKQLTSQQHAILIDLGRTFPTHPYFSAQLGAGQLSLYNILKAYSLLDQEVGYCQ
. :::::::::.::::::.:::::::::::::.::: :::::.:.::::::::.::::::
CCDS41 ISYKELLKQLTAQQHAILVDLGRTFPTHPYFSVQLGPGQLSLFNLLKAYSLLDKEVGYCQ
950 960 970 980 990 1000
900 910 920 930 940 950
pF1KE1 GLSFVAGILLLHMSEEEAFKMLKFLMFDMGLRKQYRPDMIILQIQMYQLSRLLHDYHRDL
:.:::::.::::::::.::.::::::.:.:.::::::::. :::::::::::::::::::
CCDS41 GISFVAGVLLLHMSEEQAFEMLKFLMYDLGFRKQYRPDMMSLQIQMYQLSRLLHDYHRDL
1010 1020 1030 1040 1050 1060
960 970 980 990 1000 1010
pF1KE1 YNHLEEHEIGPSLYAAPWFLTMFASQFPLGFVARVFDMIFLQGTEVIFKVALSLLGSHKP
::::::.::.:::::::::::.::::: :::::::::.:::::::::::::::::.:..
CCDS41 YNHLEENEISPSLYAAPWFLTLFASQFSLGFVARVFDIIFLQGTEVIFKVALSLLSSQET
1070 1080 1090 1100 1110 1120
1020 1030 1040 1050 1060 1070
pF1KE1 LILQHENLETIVDFIKSTLPNLGLVQMEKTINQVFEMDIAKQLQAYEVEYHVLQEELIDS
::.. :..:.::.:.:.:::... .::: :.:::::::.:::.::::::::::.:: .:
CCDS41 LIMECESFENIVEFLKNTLPDMNTSEMEKIITQVFEMDISKQLHAYEVEYHVLQDELQES
1130 1140 1150 1160 1170 1180
1080 1090 1100 1110 1120 1130
pF1KE1 S-PLSDNQRMDKLEKTNSSLRKQNLDLLEQLQVANGRIQSLEATIEKLLSSESKLKQAML
: :.. ..:::..::.:..::.::::.::::. .::.::...:.::. :.:.:. .
CCDS41 SYSCEDSETLEKLERANSQLKRQNMDLLEKLQVAHTKIQALESNLENLLTRETKMKSLIR
1190 1200 1210 1220 1230 1240
1140 1150 1160
pF1KE1 TLELERSALLQTVEELRRRSAEPSDREPECTQPEPTGD
::: :. : .:::.::. :.: .:
CCDS41 TLEQEKMAYQKTVEQLRK--LLPADALVNCDLLLRDLNCNPNNKAKIGNKP
1250 1260 1270 1280 1290
>>CCDS66564.1 TBC1D4 gene_id:9882|Hs108|chr13 (1290 aa)
initn: 3397 init1: 1520 opt: 2175 Z-score: 1821.9 bits: 349.2 E(32554): 3.7e-95
Smith-Waterman score: 3486; 49.5% identity (70.9% similar) in 1219 aa overlap (62-1160:80-1269)
40 50 60 70 80
pF1KE1 HSLTTMPMLPWVVAEVRRLSRQSTRKEPVTKQVRLCVSPSGLRCEPEPG---------RS
..: : .: ::: : :: .
CCDS66 TTLPMLPWLMAEIRRRSQKPEAGGCGAPAAREVILVLSAPFLRCVPAPGAGASGGTSPSA
50 60 70 80 90 100
90 100 110 120 130 140
pF1KE1 QQWDPLIYSSIFECKPQRVHKLIHNSHDPSYFACLIKE--DAVHRQSICYVFKADDQTKV
: .: .. ::: : :.. ..:::::: .::: ::: : . : :.::.: : ..:
CCDS66 TQPNPAVF--IFEHKAQHISRFIHNSHDLTYFAYLIKAQPDDPESQMACHVFRATDPSQV
110 120 130 140 150 160
150 160 170 180 190
pF1KE1 PEIISSIRQAGKIARQEELHCPSEFDDTF--SKKFEVLFCGRVTVAHKKAPPALIDECIE
:..:::::: .: : .:. . .. .:.: :.:::::.::.:::.::::: .:::.:.:
CCDS66 PDVISSIRQLSKAAMKEDAKPSKDNEDAFYNSQKFEVLYCGKVTVTHKKAPSSLIDDCME
170 180 190 200 210 220
200 210 220
pF1KE1 KFN-H------VSG-SRGSE--------------SPRPNPPHAA---------PTGSQEP
::. : ..: .:: . :: :. : :.:...:
CCDS66 KFSLHEQQRLKIQGEQRGPDPGEDLADLEVVVPGSPGDCLPEEADGTDTHLGLPAGASQP
230 240 250 260 270 280
230 240 250 260 270 280
pF1KE1 GRRPMRKSFSQPGLRSLAF--RKELQDGGLRSSGFFSSFEE----SDIENHLISGHNIVQ
. : : . :.. .: ..:... .: .: :. . . :. . ::
CCDS66 ALTSSRVCFPERILEDSGFDEQQEFRSRCSSVTGVQRRVHEGSQKSQPRRRHASAPSHVQ
290 300 310 320 330 340
290 300 310 320 330 340
pF1KE1 PTDIEENRTMLFTIGQSEVYLISPDTKKIALEKNFKEISFCSQGIRHVDHFGFICRESSG
:.: :.:::::: .:. :. :::::::...::::::.:: :::::.::::::::::::
CCDS66 PSDSEKNRTMLFQVGRFEINLISPDTKSVVLEKNFKDISSCSQGIKHVDHFGFICRESPE
350 360 370 380 390 400
350 360 370 380 390 400
pF1KE1 GGGFHFVCYVFQCTNEALVDEIMMTLKQAFTVAAVQQTAKAPAQLCEGCPLQSLHKLCER
: ...::::::..:.::::.:.::::::..::. :.::. .:::.::..::::::::
CCDS66 PGLSQYICYVFQCASESLVDEVMLTLKQAFSTAAALQSAKTQIKLCEACPMHSLHKLCER
410 420 430 440 450 460
410 420 430 440 450 460
pF1KE1 IEGMNSSKTKLELQKHLTTLTNQEQATIFEEVQKLRPRNEQRENELIISFLRCLYEEKQK
:::. ..:: .:.::..::..::: :::.:::..: ..:.::::.: :: : : :::
CCDS66 IEGLYPPRAKLVIQRHLSSLTDNEQADIFERVQKMKPVSDQEENELVILHLRQLCEAKQK
470 480 490 500 510 520
470 480 490 500 510
pF1KE1 EHIHIGEMKQTSQMAAENIGSELPPSAT---RFRLDMLKNKAKRSLTESLESILSRG-NK
:.:::: .: . .: .: .:: ::.::.:::::::::: :::.:.::: :.
CCDS66 THVHIGEGPSTIS------NSTIPENATSSGRFKLDILKNKAKRSLTSSLENIFSRGANR
530 540 550 560 570 580
520 530 540 550 560 570
pF1KE1 ARGLQEHSISVDLDSSLSSTLSNTSKEPSVCEKEALPISESSFKLLGSSEDLSSDSESHL
:: : . ..::.: ::. : ..: .: :.. . .
CCDS66 MRGRLGSVDSFERSNSLAS------------EKDYSP-GDSPPGTPPASP--PSSAWQTF
590 600 610 620
580 590 600 610
pF1KE1 PEEPAPLSPQQAFRRRANTLSHFP------IECQEPPQPARGSPGVSQ------------
::: . ::: :::::.:.:: : .. :. . :: . :
CCDS66 PEEDSD-SPQ--FRRRAHTFSHPPSSTKRKLNLQDGRAQGVRSPLLRQSSSEQCSNLSSV
630 640 650 660 670 680
620 630 640
pF1KE1 RKLMRYHSVSTETPHERKDFESKA----------------------NHLGDS--------
:.... . :. : . .: . . :...:.
CCDS66 RRMYKESNSSSSLPSLHTSFSAPSFTAPSFLKSFYQNSGRLSPQYENEISDGEGRKRTSS
690 700 710 720 730 740
650 660 670 680 690 700
pF1KE1 ---------GGTPVKTRRHSWRQQIFLRVATPQKACDSSSRYEDYSELGELPPRSPLEPV
::: : :: ::::.::::::.:.. :. . .: . .:: : ::: :.
CCDS66 TCSNESLSVGGTSVTPRRISWRQRIFLRVASPMNKSPSAMQQQDGLDRNELLPLSPLSPT
750 760 770 780 790 800
710 720 730 740 750
pF1KE1 CEDGPF--------GPPPEEKKRTSRELRELWQKAILQQILLLRMEKENQKLQASENDLL
:. :. : :... :.::: ::.::: :::::::::::::::.::...:
CCDS66 MEEEPLVVFLSGEDDPEKIEERKKSKELRSLWRKAIHQQILLLRMEKENQKLEASRDELQ
810 820 830 840 850 860
760 770 780 790 800 810
pF1KE1 NKRLKLDYEEITPCLKEVTTVWEKMLSTPGRSKIKFDMEKMHSAVGQGVPRHHRGEIWKF
....::::::. : ::: .:.: : :.::. ::: .:. . .:::. .:::::.:
CCDS66 SRKVKLDYEEVGACQKEVLITWDKKL-LNCRAKIRCDMEDIHTLLKEGVPKSRRGEIWQF
870 880 890 900 910 920
820 830 840 850 860 870
pF1KE1 LAEQFHLKHQFPSKQQPKDVPYKELLKQLTSQQHAILIDLGRTFPTHPYFSAQLGAGQLS
:: :..:.:..:.:::: :. :::::::::.::::::.:::::::::::::.::: ::::
CCDS66 LALQYRLRHRLPNKQQPPDISYKELLKQLTAQQHAILVDLGRTFPTHPYFSVQLGPGQLS
930 940 950 960 970 980
880 890 900 910 920 930
pF1KE1 LYNILKAYSLLDQEVGYCQGLSFVAGILLLHMSEEEAFKMLKFLMFDMGLRKQYRPDMII
:.:.::::::::.:::::::.:::::.::::::::.::.::::::.:.:.::::::::.
CCDS66 LFNLLKAYSLLDKEVGYCQGISFVAGVLLLHMSEEQAFEMLKFLMYDLGFRKQYRPDMMS
990 1000 1010 1020 1030 1040
940 950 960 970 980 990
pF1KE1 LQIQMYQLSRLLHDYHRDLYNHLEEHEIGPSLYAAPWFLTMFASQFPLGFVARVFDMIFL
:::::::::::::::::::::::::.::.:::::::::::.::::: :::::::::.:::
CCDS66 LQIQMYQLSRLLHDYHRDLYNHLEENEISPSLYAAPWFLTLFASQFSLGFVARVFDIIFL
1050 1060 1070 1080 1090 1100
1000 1010 1020 1030 1040 1050
pF1KE1 QGTEVIFKVALSLLGSHKPLILQHENLETIVDFIKSTLPNLGLVQMEKTINQVFEMDIAK
::::::::::::::.:.. ::.. :..:.::.:.:.:::... .::: :.:::::::.:
CCDS66 QGTEVIFKVALSLLSSQETLIMECESFENIVEFLKNTLPDMNTSEMEKIITQVFEMDISK
1110 1120 1130 1140 1150 1160
1060 1070 1080 1090 1100 1110
pF1KE1 QLQAYEVEYHVLQEELIDSS-PLSDNQRMDKLEKTNSSLRKQNLDLLEQLQVANGRIQSL
::.::::::::::.:: .:: :.. ..:::..::.:..::.::::.::::. .::.:
CCDS66 QLHAYEVEYHVLQDELQESSYSCEDSETLEKLERANSQLKRQNMDLLEKLQVAHTKIQAL
1170 1180 1190 1200 1210 1220
1120 1130 1140 1150 1160
pF1KE1 EATIEKLLSSESKLKQAMLTLELERSALLQTVEELRRRSAEPSDREPECTQPEPTGD
:...:.::. :.:.:. . ::: :. : .:::.::. :.: .:
CCDS66 ESNLENLLTRETKMKSLIRTLEQEKMAYQKTVEQLRK--LLPADALVNCDLLLRDLNCNP
1230 1240 1250 1260 1270 1280
CCDS66 NNKAKIGNKP
1290
>>CCDS6848.2 RABGAP1 gene_id:23637|Hs108|chr9 (1069 aa)
initn: 642 init1: 542 opt: 732 Z-score: 615.3 bits: 125.7 E(32554): 5.9e-28
Smith-Waterman score: 742; 32.7% identity (63.5% similar) in 455 aa overlap (711-1160:484-916)
690 700 710 720 730 740
pF1KE1 RYEDYSELGELPPRSPLEPVCEDGPFGPPPEEKKRTSRELRELWQKAILQQILLLRMEKE
:..: :. .: :.. .: .. :
CCDS68 LKLKQIKQRERKNNTDTLYEVVCLESESERERRKTTASPSVRLPQSG--SQSSVIPSPPE
460 470 480 490 500 510
750 760 770 780 790 800
pF1KE1 NQKLQASENDLLNKRLKLDYEEITPCLKEVTTVWEKMLSTPGRSKIKFDMEKMHSAVGQG
... . ... ::. .. : : ... .: ..:: . ... ... : : .:
CCDS68 DDEEEDNDEPLLSGSGDVSKE----CAEKILETWGELLSK-WHLNLNVRPKQLSSLVRNG
520 530 540 550 560
810 820 830 840 850 860
pF1KE1 VPRHHRGEIWKFLAEQFHLKHQFPSKQQPKDVPYKELLKQLTSQQHAILIDLGRTFPTHP
::. :::.:..:: : . .. : :. :. . . :. :: :..::::.:
CCDS68 VPEALRGEVWQLLA-GCHNNDHLVEK-------YRILITKESPQDSAITRDINRTFPAHD
570 580 590 600 610
870 880 890 900 910 920
pF1KE1 YFSAQLGAGQLSLYNILKAYSLLDQEVGYCQGLSFVAGILLLHMSEEEAFKMLKFLMFDM
::. : :: :::.: ::::. :.:.::::: ::.:..::::: ::.::..: .:::.
CCDS68 YFKDTGGDGQDSLYKICKAYSVYDEEIGYCQGQSFLAAVLLLHMPEEQAFSVLVKIMFDY
620 630 640 650 660 670
930 940 950 960 970 980
pF1KE1 GLRKQYRPDMIILQIQMYQLSRLLHDYHRDLYNHLEEHEIGPSLYAAPWFLTMFASQFPL
:::. .. .. :. ..::: ::...: :::::. . . .::. ::::.:...:::
CCDS68 GLRELFKQNFEDLHCKFYQLERLMQEYIPDLYNHFLDISLEAHMYASQWFLTLFTAKFPL
680 690 700 710 720 730
990 1000 1010 1020 1030
pF1KE1 GFVARVFDMIFLQGTEVIFKVALSLLGSHKPLILQHENLETIVDFIKSTLPNLGLVQ--M
.: ...:... .: :::.:::.:: . : .: ..: . :.. ::. .
CCDS68 YMVFHIIDLLLCEGISVIFNVALGLLKTSKDDLLL-TDFEGALKFFRVQLPKRYRSEENA
740 750 760 770 780 790
1040 1050 1060 1070 1080 1090
pF1KE1 EKTINQVFEMDIA-KQLQAYEVEYHVLQEELIDS-SPLSDNQRMDK-LEKTNSSLRKQNL
.: .. . .: :. :.:. :: :::...:. .. .:. .: .. :...: :...:
CCDS68 KKLMELACNMKISQKKLKKYEKEYHTMREQQAQQEDPIERFERENRRLQEANMRLEQEND
800 810 820 830 840 850
1100 1110 1120 1130 1140 1150
pF1KE1 DLLEQLQVANGRIQSLEATIEKLLSSESKLKQAMLTLELERSALLQTVEELRRRSAEPSD
:: ..: . : : . : ..: : : . .. :... :: :: : ..
CCDS68 DLAHEL------VTSKIALRKDLDNAEEKADALNKELLMTKQKLIDAEEEKRRLEEESAQ
860 870 880 890 900 910
1160
pF1KE1 REPECTQPEPTGD
. :
CCDS68 LKEMCRRELDKAESEIKKNSSIIGDYKQICSQLSERLEKQQTANKVEIEKIRQKVDDCER
920 930 940 950 960 970
>>CCDS1314.1 RABGAP1L gene_id:9910|Hs108|chr1 (815 aa)
initn: 567 init1: 524 opt: 629 Z-score: 531.0 bits: 109.7 E(32554): 3e-23
Smith-Waterman score: 640; 34.8% identity (69.0% similar) in 313 aa overlap (766-1074:505-807)
740 750 760 770 780 790
pF1KE1 RMEKENQKLQASENDLLNKRLKLDYEEITPCLKEVTTVWEKMLSTPGRSKIKFDMEKMHS
: ... : ..:. .:.. . . .
CCDS13 GGGPMSPQDDEAEEESDNELSSGTGDVSKDCPEKILYSWGELLGK-WHSNLGARPKGLST
480 490 500 510 520 530
800 810 820 830 840 850
pF1KE1 AVGQGVPRHHRGEIWKFLAEQFHLKHQFPSKQQPKDVPYKELLKQLTSQQHAILIDLGRT
: .:::. :.:.:..:: : .. . .. :. :. . ..:. .: :. ::
CCDS13 LVKSGVPEALRAEVWQLLA-GCHDNQAMLDR-------YRILITKDSAQESVITRDIHRT
540 550 560 570 580
860 870 880 890 900 910
pF1KE1 FPTHPYFSAQLGAGQLSLYNILKAYSLLDQEVGYCQGLSFVAGILLLHMSEEEAFKMLKF
::.: ::. : :: :::.: ::::. :...::::: ::.:..::::: ::.:: .:
CCDS13 FPAHDYFKDTGGDGQESLYKICKAYSVYDEDIGYCQGQSFLAAVLLLHMPEEQAFCVLVK
590 600 610 620 630 640
920 930 940 950 960 970
pF1KE1 LMFDMGLRKQYRPDMIILQIQMYQLSRLLHDYHRDLYNHLEEHEIGPSLYAAPWFLTMFA
.:.:.::: :: .. :. ..::: ::... ::..:. . .. .::. ::::.:.
CCDS13 IMYDYGLRDLYRNNFEDLHCKFYQLERLMQEQLPDLHSHFSDLNLEAHMYASQWFLTLFT
650 660 670 680 690 700
980 990 1000 1010 1020 1030
pF1KE1 SQFPLGFVARVFDMIFLQGTEVIFKVALSLLGSHKPLILQHENLETIVDFIKSTLPNLGL
..::: .: ...:... .: ..::.:::.:: . : .:: ..: . :.. ::.
CCDS13 AKFPLCMVFHIIDLLLCEGLNIIFHVALALLKTSKEDLLQ-ADFEGALKFFRVQLPKRYR
710 720 730 740 750 760
1040 1050 1060 1070 1080 1090
pF1KE1 VQ--MEKTINQVFEMDI-AKQLQAYEVEYHVLQE-ELIDSSPLSDNQRMDKLEKTNSSLR
.. .. ..:. .. . .:.:. :: ::....: .: . .:.
CCDS13 AEENARRLMEQACNIKVPTKKLKKYEKEYQTMRESQLQQEDPMDRYKFVYL
770 780 790 800 810
1100 1110 1120 1130 1140 1150
pF1KE1 KQNLDLLEQLQVANGRIQSLEATIEKLLSSESKLKQAMLTLELERSALLQTVEELRRRSA
>>CCDS12188.1 EVI5L gene_id:115704|Hs108|chr19 (794 aa)
initn: 523 init1: 523 opt: 584 Z-score: 493.5 bits: 102.7 E(32554): 3.6e-21
Smith-Waterman score: 626; 31.1% identity (66.7% similar) in 351 aa overlap (797-1145:112-446)
770 780 790 800 810 820
pF1KE1 LKEVTTVWEKMLSTPGRSKIKFDMEKMHSAVGQGVPRHHRGEIWKFLAEQFHLKHQFPSK
. .:.:.: :. .:..: . : :
CCDS12 LEEDTWILWGRIANEWEEWRRRKEKLLKELIRKGIPHHFRAIVWQLLCSATDM----PVK
90 100 110 120 130
830 840 850 860 870 880
pF1KE1 QQPKDVPYKELLKQLTSQQHAILIDLGRTFPTHPYFSAQLGAGQLSLYNILKAYSLLDQE
.: :.::::. . .. : :..::.: : .:..: . :: :.:..:::::.:.:
CCDS12 NQ-----YSELLKMSSPCEKLIRRDIARTYPEHEFFKGQDSLGQEVLFNVMKAYSLVDRE
140 150 160 170 180 190
890 900 910 920 930 940
pF1KE1 VGYCQGLSFVAGILLLHMSEEEAFKMLKFLMFDMGLRKQYRPDMIILQIQMYQLSRLLHD
:::::: .:..:.::..: ::::: .. :: .. ::. ..:.: : . .::. .:..
CCDS12 VGYCQGSAFIVGLLLMQMPEEEAFCVFVRLMQEYRLRELFKPSMAELGLCIYQFEYMLQE
200 210 220 230 240 250
950 960 970 980 990 1000
pF1KE1 YHRDLYNHLEEHEIGPSLYAAPWFLTMFASQFPLGFVARVFDMIFLQGTEVIFKVALSLL
:: .:.. . . :.::. ::::.: . ::: ..::::... .: :..:.:.:.::
CCDS12 QLPDLNTHFRSQSFHTSMYASSWFLTLFLTTFPLPVATRVFDIFMYEGLEIVFRVGLALL
260 270 280 290 300 310
1010 1020 1030 1040 1050 1060
pF1KE1 GSHKPLILQHENLETIVDFIKSTLPNLGLVQMEKTINQVFEMDIA-KQLQAYEVEYHVLQ
.. ..: . .: . .... ..:. .: . ..... :... : :: ...
CCDS12 QVNQAELMQLD-MEGMSQYFQRVIPHQFDSCPDKLVLKAYQVKYNPKKMKRLEKEYAAMK
320 330 340 350 360 370
1070 1080 1090 1100 1110 1120
pF1KE1 EELIDSSPLSDNQRMDKLEKTNSSLRKQNLDLLEQLQVANGRIQSLEATIEKLLSS-ESK
:. . .. .. .: .:.. : :: .. ::. ::. .. . .:.. :. ...
CCDS12 -----SKEMEEQIEIKRL-RTENRLLKQRIETLEKGQVTRAQEAEENYVIKRELAVVRQQ
380 390 400 410 420
1130 1140 1150 1160
pF1KE1 LKQAMLTLELERSALLQTVEELRRRSAEPSDREPECTQPEPTGD
..: :. .:.. : :.
CCDS12 CSSAAEDLQKAQSTIRQLQEQQENPRLTEDFVSHLETELEQSRLRETETLGALREMQDKV
430 440 450 460 470 480
>>CCDS30774.1 EVI5 gene_id:7813|Hs108|chr1 (810 aa)
initn: 521 init1: 521 opt: 583 Z-score: 492.5 bits: 102.6 E(32554): 4.1e-21
Smith-Waterman score: 628; 27.4% identity (62.5% similar) in 493 aa overlap (664-1155:44-500)
640 650 660 670 680 690
pF1KE1 HERKDFESKANHLGDSGGTPVKTRRHSWRQQIFLRVATPQKACDSSSRYEDYSELGELPP
:. .::.:. . ..: : : :
CCDS30 SGKQVATDKVAEKLSSTLSWVKNTVSHTVSQMASQVASPSTSLHTTSSSTTLST-PALSP
20 30 40 50 60 70
700 710 720 730 740 750
pF1KE1 RSPLEPVCEDGPFGPPPEEKKRTSRELRELWQKAILQQILLLRMEKENQKLQASENDLLN
:: . .: . ::..: : : .:. :... : .. .. ...: .
CCDS30 SSPSQLSPDDLELLAKLEEQNR----LLETDSKS-LRSVNGSRRNSGSSLVSSSSA---S
80 90 100 110 120
760 770 780 790 800 810
pF1KE1 KRLKLDYEEITPCLKEVTTVWEKMLSTPGRSKIKFDMEKMHSAVGQGVPRHHRGEIWKFL
. :. :. .... :: . :.: . ..... : .:.:.: :. .:..:
CCDS30 SNLSHLEEDSWILWGRIVNEWEDV-----RKKKEKQVKEL---VHKGIPHHFRAIVWQLL
130 140 150 160 170
820 830 840 850 860 870
pF1KE1 AEQFHLKHQFPSKQQPKDVPYKELLKQLTSQQHAILIDLGRTFPTHPYFSAQLGAGQLSL
...: :.: :.::::. . .. : :..::.: : .:. . . :: :
CCDS30 CSA----QSMPIKDQ-----YSELLKMTSPCEKLIRRDIARTYPEHNFFKEKDSLGQEVL
180 190 200 210 220
880 890 900 910 920 930
pF1KE1 YNILKAYSLLDQEVGYCQGLSFVAGILLLHMSEEEAFKMLKFLMFDMGLRKQYRPDMIIL
.:..:::::.:.::::::: .:..:.::..: ::::: .. :: :. ::. ..:.: :
CCDS30 FNVMKAYSLVDREVGYCQGSAFIVGLLLMQMPEEEAFCVFVKLMQDYRLRELFKPSMAEL
230 240 250 260 270 280
940 950 960 970 980 990
pF1KE1 QIQMYQLSRLLHDYHRDLYNHLEEHEIGPSLYAAPWFLTMFASQFPLGFVARVFDMIFLQ
. :::. ..... .:. :.. . . :.::. ::::.: . ::: ...:.::... .
CCDS30 GLCMYQFECMIQEHLPELFVHFQSQSFHTSMYASSWFLTIFLTTFPLPIATRIFDIFMSE
290 300 310 320 330 340
1000 1010 1020 1030 1040 1050
pF1KE1 GTEVIFKVALSLLGSHKPLILQHENLETIVDFIKSTLPNLGLVQMEKTINQVFEMDI-AK
: :..:.:.:.:: .. ..: . .: ... .....:. .: :. .... .:
CCDS30 GLEIVFRVGLALLQMNQAELMQLD-MEGMLQHFQKVIPHQFDGVPDKLIQAAYQVKYNSK
350 360 370 380 390 400
1060 1070 1080 1090 1100 1110
pF1KE1 QLQAYEVEYHVLQEELIDSSPLSDNQRMDKLEKTNSSLRKQNLDLLEQLQVANGRIQSLE
... : :: . : .. . .. .. .: .:.. : :: .. ::. . ... ...
CCDS30 KMKKLEKEYTT-----IKTKEMEEQVEIKRL-RTENRLLKQRIETLEKHKCSSNYNEDFV
410 420 430 440 450 460
1120 1130 1140 1150 1160
pF1KE1 ATIEKLLSSESKLKQAMLTLELERSALLQTVEELRRRSAEPSDREPECTQPEPTGD
.:: : ...:..: :.. . . : ....:. :
CCDS30 LQLEKELV-QARLSEAESQCALKE--MQDKVLDIEKRNNSLPDENNIARLQEELIAVKLR
470 480 490 500 510
CCDS30 EAEAIMGLKELRQQVKDLEEHWQRHLARTTGRWKDPPKKNAMNELQDELMTIRLREAETQ
520 530 540 550 560 570
>>CCDS76179.1 EVI5 gene_id:7813|Hs108|chr1 (821 aa)
initn: 552 init1: 521 opt: 580 Z-score: 489.9 bits: 102.1 E(32554): 5.7e-21
Smith-Waterman score: 627; 28.1% identity (62.0% similar) in 502 aa overlap (664-1155:44-511)
640 650 660 670 680 690
pF1KE1 HERKDFESKANHLGDSGGTPVKTRRHSWRQQIFLRVATPQKACDSSSRYEDYSELGELPP
:. .::.:. . ..: : : :
CCDS76 SGKQVATDKVAEKLSSTLSWVKNTVSHTVSQMASQVASPSTSLHTTSSSTTLST-PALSP
20 30 40 50 60 70
700 710 720 730 740 750
pF1KE1 RSPLEPVCEDGPFGPPPEEKKRTSRELRELWQKAILQQILLLRMEKENQKLQASENDLLN
:: . .: . ::..: : : .:. :... : .. .. ...: .
CCDS76 SSPSQLSPDDLELLAKLEEQNR----LLETDSKS-LRSVNGSRRNSGSSLVSSSSA---S
80 90 100 110 120
760 770 780 790 800 810
pF1KE1 KRLKLDYEEITPCLKEVTTVWEKMLSTPGRSKIKFDMEKMHSAVGQGVPRHHRGEIWKFL
. :. :. .... :: . :.: . ..... : .:.:.: :. .:..:
CCDS76 SNLSHLEEDSWILWGRIVNEWEDV-----RKKKEKQVKEL---VHKGIPHHFRAIVWQLL
130 140 150 160 170
820 830 840 850 860 870
pF1KE1 AEQFHLKHQFPSKQQPKDVPYKELLKQLTSQQHAILIDLGRTFPTHPYFSAQLGAGQLSL
...: :.: :.::::. . .. : :..::.: : .:. . . :: :
CCDS76 CSA----QSMPIKDQ-----YSELLKMTSPCEKLIRRDIARTYPEHNFFKEKDSLGQEVL
180 190 200 210 220
880 890 900 910 920 930
pF1KE1 YNILKAYSLLDQEVGYCQGLSFVAGILLLHMSEEEAFKMLKFLMFDMGLRKQYRPDMIIL
.:..:::::.:.::::::: .:..:.::..: ::::: .. :: :. ::. ..:.: :
CCDS76 FNVMKAYSLVDREVGYCQGSAFIVGLLLMQMPEEEAFCVFVKLMQDYRLRELFKPSMAEL
230 240 250 260 270 280
940 950 960 970 980 990
pF1KE1 QIQMYQLSRLLHDYHRDLYNHLEEHEIGPSLYAAPWFLTMFASQFPLGFVARVFDMIFLQ
. :::. ..... .:. :.. . . :.::. ::::.: . ::: ...:.::... .
CCDS76 GLCMYQFECMIQEHLPELFVHFQSQSFHTSMYASSWFLTIFLTTFPLPIATRIFDIFMSE
290 300 310 320 330 340
1000 1010 1020 1030 1040 1050
pF1KE1 GTEVIFKVALSLLGSHKPLILQHENLETIVDFIKSTLPNLGLVQMEKTINQVFEMDI-AK
: :..:.:.:.:: .. ..: . .: ... .....:. .: :. .... .:
CCDS76 GLEIVFRVGLALLQMNQAELMQLD-MEGMLQHFQKVIPHQFDGVPDKLIQAAYQVKYNSK
350 360 370 380 390 400
1060 1070 1080 1090 1100
pF1KE1 QLQAYEVEYHVLQ----EELIDSSPL-SDN----QRMDKLEKTNSSLRKQNLDLLEQLQV
... : :: ... :: .. . : ..: ::.. ::: ..:: : : : .
CCDS76 KMKKLEKEYTTIKTKEMEEQVEIKRLRTENRLLKQRIETLEKESASLA----DRLIQHKC
410 420 430 440 450 460
1110 1120 1130 1140 1150 1160
pF1KE1 ANGRIQSLEATIEKLLSSESKLKQAMLTLELERSALLQTVEELRRRSAEPSDREPECTQP
... ... .:: : ...:..: :.. . . : ....:. :
CCDS76 SSNYNEDFVLQLEKELV-QARLSEAESQCALKE--MQDKVLDIEKRNNSLPDENNIARLQ
470 480 490 500 510
pF1KE1 EPTGD
CCDS76 EELIAVKLREAEAIMGLKELRQQVKDLEEHWQRHLARTTGRWKDPPKKNAMNELQDELMT
520 530 540 550 560 570
1168 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sat Nov 5 19:35:22 2016 done: Sat Nov 5 19:35:23 2016
Total Scan time: 5.750 Total Display time: 0.420
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]