Result of FASTA (omim) for
pFN21AE1056
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE1056, 1270 aa
1>>>pF1KE1056 1270 - 1270 aa - 1270 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.1019+/-0.000477; mu= 16.0299+/- 0.030
mean_var=192.0101+/-39.275, 0's: 0 Z-trim(115.6): 266 B-trim: 661 in 1/53
Lambda= 0.092558
statistics sampled from 25846 (26141) to 25846 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.642), E-opt: 0.2 (0.306), width: 16
Scan time: 13.460
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_001348 (OMIM: 603115) ATP-dependent RNA helicas (1270) 8558 1157.0 0
NP_001107869 (OMIM: 612767) ATP-dependent RNA heli ( 994) 1542 220.0 6.3e-56
NP_065916 (OMIM: 612767) ATP-dependent RNA helicas (1008) 1072 157.3 4.9e-37
XP_016865224 (OMIM: 616530) PREDICTED: probable AT ( 971) 892 133.2 8.3e-30
NP_001332905 (OMIM: 616530) probable ATP-dependent (1130) 892 133.3 9.2e-30
XP_016865222 (OMIM: 616530) PREDICTED: probable AT (1139) 892 133.3 9.2e-30
XP_011541888 (OMIM: 616530) PREDICTED: probable AT (1162) 892 133.3 9.3e-30
NP_001332904 (OMIM: 616530) probable ATP-dependent (1268) 892 133.4 9.9e-30
XP_016865220 (OMIM: 616530) PREDICTED: probable AT (1277) 892 133.4 9.9e-30
XP_011541884 (OMIM: 616530) PREDICTED: probable AT (1406) 892 133.4 1.1e-29
NP_073739 (OMIM: 616530) probable ATP-dependent RN (1430) 892 133.4 1.1e-29
XP_016865219 (OMIM: 616530) PREDICTED: probable AT (1430) 892 133.4 1.1e-29
XP_011541883 (OMIM: 616530) PREDICTED: probable AT (1439) 892 133.4 1.1e-29
NP_001332894 (OMIM: 612720) ATP-dependent RNA heli ( 733) 772 117.1 4.6e-25
NP_001332893 (OMIM: 612720) ATP-dependent RNA heli (1318) 772 117.3 6.8e-25
NP_061903 (OMIM: 612720) ATP-dependent RNA helicas (1369) 772 117.4 6.9e-25
XP_016861406 (OMIM: 616423) PREDICTED: putative AT (1155) 732 111.9 2.5e-23
NP_055781 (OMIM: 616423) putative ATP-dependent RN (1155) 732 111.9 2.5e-23
XP_016861405 (OMIM: 616423) PREDICTED: putative AT (1157) 732 111.9 2.5e-23
XP_006713096 (OMIM: 616423) PREDICTED: putative AT (1162) 732 111.9 2.5e-23
XP_016861404 (OMIM: 616423) PREDICTED: putative AT (1162) 732 111.9 2.5e-23
XP_011531800 (OMIM: 616423) PREDICTED: putative AT (1166) 732 111.9 2.5e-23
XP_011531799 (OMIM: 616423) PREDICTED: putative AT (1166) 732 111.9 2.5e-23
XP_011531798 (OMIM: 616423) PREDICTED: putative AT (1166) 732 111.9 2.5e-23
NP_001317919 (OMIM: 616423) putative ATP-dependent (1166) 732 111.9 2.5e-23
XP_011531796 (OMIM: 616423) PREDICTED: putative AT (1194) 732 112.0 2.6e-23
XP_011531797 (OMIM: 616423) PREDICTED: putative AT (1194) 732 112.0 2.6e-23
NP_619520 (OMIM: 616423) putative ATP-dependent RN (1194) 732 112.0 2.6e-23
XP_011531795 (OMIM: 616423) PREDICTED: putative AT (1228) 732 112.0 2.6e-23
XP_016861403 (OMIM: 616423) PREDICTED: putative AT (1238) 732 112.0 2.6e-23
XP_011531793 (OMIM: 616423) PREDICTED: putative AT (1265) 732 112.0 2.7e-23
XP_011531792 (OMIM: 616423) PREDICTED: putative AT (1265) 732 112.0 2.7e-23
XP_011531794 (OMIM: 616423) PREDICTED: putative AT (1265) 732 112.0 2.7e-23
XP_005259500 (OMIM: 615475) PREDICTED: probable AT (1143) 629 98.2 3.4e-19
NP_055496 (OMIM: 615475) probable ATP-dependent RN (1143) 629 98.2 3.4e-19
XP_011525852 (OMIM: 615475) PREDICTED: probable AT (1143) 629 98.2 3.4e-19
XP_011525853 (OMIM: 615475) PREDICTED: probable AT (1143) 629 98.2 3.4e-19
XP_016879402 (OMIM: 605584) PREDICTED: pre-mRNA-sp (1192) 568 90.1 1e-16
XP_005256326 (OMIM: 605584) PREDICTED: pre-mRNA-sp (1192) 568 90.1 1e-16
XP_011521786 (OMIM: 605584) PREDICTED: pre-mRNA-sp (1227) 568 90.1 1e-16
XP_011521787 (OMIM: 605584) PREDICTED: pre-mRNA-sp (1227) 568 90.1 1e-16
NP_054722 (OMIM: 605584) pre-mRNA-splicing factor (1227) 568 90.1 1e-16
NP_001309145 (OMIM: 600396) ATP-dependent RNA heli ( 945) 530 84.9 2.9e-15
NP_001309146 (OMIM: 600396) ATP-dependent RNA heli (1129) 530 85.0 3.3e-15
NP_001309149 (OMIM: 600396) ATP-dependent RNA heli (1152) 530 85.0 3.3e-15
NP_001309148 (OMIM: 600396) ATP-dependent RNA heli (1169) 530 85.0 3.3e-15
NP_001309147 (OMIM: 600396) ATP-dependent RNA heli (1179) 530 85.0 3.4e-15
NP_001289552 (OMIM: 600396) ATP-dependent RNA heli (1181) 530 85.0 3.4e-15
NP_001309150 (OMIM: 600396) ATP-dependent RNA heli (1218) 530 85.0 3.4e-15
NP_004932 (OMIM: 600396) ATP-dependent RNA helicas (1220) 530 85.0 3.4e-15
>>NP_001348 (OMIM: 603115) ATP-dependent RNA helicase A (1270 aa)
initn: 8558 init1: 8558 opt: 8558 Z-score: 6187.1 bits: 1157.0 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 8558; 100.0% identity (100.0% similar) in 1270 aa overlap (1-1270:1-1270)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MGDVKNFLYAWCGKRKMTPSYEIRAVGNKNRQKFMCEVQVEGYNYTGMGNSTNKKDAQSN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MGDVKNFLYAWCGKRKMTPSYEIRAVGNKNRQKFMCEVQVEGYNYTGMGNSTNKKDAQSN
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 AARDFVNYLVRINEIKSEEVPAFGVASPPPLTDTPDTTANAEGDLPTTMGGPLPPHLALK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 AARDFVNYLVRINEIKSEEVPAFGVASPPPLTDTPDTTANAEGDLPTTMGGPLPPHLALK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 AENNSEVGASGYGVPGPTWDRGANLKDYYSRKEEQEVQATLESEEVDLNAGLHGNWTLEN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 AENNSEVGASGYGVPGPTWDRGANLKDYYSRKEEQEVQATLESEEVDLNAGLHGNWTLEN
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 AKARLNQYFQKEKIQGEYKYTQVGPDHNRSFIAEMTIYIKQLGRRIFAREHGSNKKLAAQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 AKARLNQYFQKEKIQGEYKYTQVGPDHNRSFIAEMTIYIKQLGRRIFAREHGSNKKLAAQ
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 SCALSLVRQLYHLGVVEAYSGLTKKKEGETVEPYKVNLSQDLEHQLQNIIQELNLEILPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SCALSLVRQLYHLGVVEAYSGLTKKKEGETVEPYKVNLSQDLEHQLQNIIQELNLEILPP
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 PEDPSVPVALNIGKLAQFEPSQRQNQVGVVPWSPPQSNWNPWTSSNIDEGPLAFATPEQI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PEDPSVPVALNIGKLAQFEPSQRQNQVGVVPWSPPQSNWNPWTSSNIDEGPLAFATPEQI
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 SMDLKNELMYQLEQDHDLQAILQERELLPVKKFESEILEAISQNSVVIIRGATGCGKTTQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SMDLKNELMYQLEQDHDLQAILQERELLPVKKFESEILEAISQNSVVIIRGATGCGKTTQ
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE1 VPQFILDDFIQNDRAAECNIVVTQPRRISAVSVAERVAFERGEEPGKSCGYSVRFESILP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VPQFILDDFIQNDRAAECNIVVTQPRRISAVSVAERVAFERGEEPGKSCGYSVRFESILP
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE1 RPHASIMFCTVGVLLRKLEAGIRGISHVIVDEIHERDINTDFLLVVLRDVVQAYPEVRIV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RPHASIMFCTVGVLLRKLEAGIRGISHVIVDEIHERDINTDFLLVVLRDVVQAYPEVRIV
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE1 LMSATIDTSMFCEYFFNCPIIEVYGRTYPVQEYFLEDCIQMTHFVPPPKDKKKKDKDDDG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LMSATIDTSMFCEYFFNCPIIEVYGRTYPVQEYFLEDCIQMTHFVPPPKDKKKKDKDDDG
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE1 GEDDDANCNLICGDEYGPETRLSMSQLNEKETPFELIEALLKYIETLNVPGAVLVFLPGW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GEDDDANCNLICGDEYGPETRLSMSQLNEKETPFELIEALLKYIETLNVPGAVLVFLPGW
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE1 NLIYTMQKHLEMNPHFGSHRYQILPLHSQIPREEQRKVFDPVPVGVTKVILSTNIAETSI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 NLIYTMQKHLEMNPHFGSHRYQILPLHSQIPREEQRKVFDPVPVGVTKVILSTNIAETSI
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE1 TINDVVYVIDSCKQKVKLFTAHNNMTNYATVWASKTNLEQRKGRAGRVRPGFCFHLCSRA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TINDVVYVIDSCKQKVKLFTAHNNMTNYATVWASKTNLEQRKGRAGRVRPGFCFHLCSRA
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE1 RFERLETHMTPEMFRTPLHEIALSIKLLRLGGIGQFLAKAIEPPPLDAVIEAEHTLRELD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RFERLETHMTPEMFRTPLHEIALSIKLLRLGGIGQFLAKAIEPPPLDAVIEAEHTLRELD
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KE1 ALDANDELTPLGRILAKLPIEPRFGKMMIMGCIFYVGDAICTIAAATCFPEPFINEGKRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ALDANDELTPLGRILAKLPIEPRFGKMMIMGCIFYVGDAICTIAAATCFPEPFINEGKRL
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KE1 GYIHRNFAGNRFSDHVALLSVFQAWDDARMGGEEAEIRFCEHKRLNMATLRMTWEAKVQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GYIHRNFAGNRFSDHVALLSVFQAWDDARMGGEEAEIRFCEHKRLNMATLRMTWEAKVQL
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KE1 KEILINSGFPEDCLLTQVFTNTGPDNNLDVVISLLAFGVYPNVCYHKEKRKILTTEGRNA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KEILINSGFPEDCLLTQVFTNTGPDNNLDVVISLLAFGVYPNVCYHKEKRKILTTEGRNA
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KE1 LIHKSSVNCPFSSQDMKYPSPFFVFGEKIRTRAISAKGMTLVTPLQLLLFASKKVQSDGQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LIHKSSVNCPFSSQDMKYPSPFFVFGEKIRTRAISAKGMTLVTPLQLLLFASKKVQSDGQ
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KE1 IVLVDDWIKLQISHEAAACITGLRAAMEALVVEVTKQPAIISQLDPVNERMLNMIRQISR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 IVLVDDWIKLQISHEAAACITGLRAAMEALVVEVTKQPAIISQLDPVNERMLNMIRQISR
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KE1 PSAAGINLMIGSTRYGDGPRPPKMARYDNGSGYRRGGSSYSGGGYGGGYSSGGYGSGGYG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PSAAGINLMIGSTRYGDGPRPPKMARYDNGSGYRRGGSSYSGGGYGGGYSSGGYGSGGYG
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KE1 GSANSFRAGYGAGVGGGYRGVSRGGFRGNSGGDYRGPSGGYRGSGGFQRGGGRGAYGTGY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GSANSFRAGYGAGVGGGYRGVSRGGFRGNSGGDYRGPSGGYRGSGGFQRGGGRGAYGTGY
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270
pF1KE1 FGQGRGGGGY
::::::::::
NP_001 FGQGRGGGGY
1270
>>NP_001107869 (OMIM: 612767) ATP-dependent RNA helicase (994 aa)
initn: 1348 init1: 673 opt: 1542 Z-score: 1125.1 bits: 220.0 E(85289): 6.3e-56
Smith-Waterman score: 1648; 37.2% identity (67.1% similar) in 817 aa overlap (345-1125:161-957)
320 330 340 350 360 370
pF1KE1 LAQFEPSQRQNQVGVVPWSPPQSNWNPWTSSNIDEGPLAFATPEQISMDLKNELMYQLEQ
: ::. . .. . : ..:. .:..
NP_001 KNTPCSENKLDIQEKKLINQEKKMFRIRNRSYIDRDSEYLLQENEPDGTLDQKLLEDLQK
140 150 160 170 180 190
380 390 400 410 420 430
pF1KE1 D-HDLQAI-LQE-RELLPVKKFESEILEAISQNSVVIIRGATGCGKTTQVPQFILDDFIQ
.::. : .:. :: :: ...:... :....:..: : ::::::::: :::::..:.
NP_001 KKNDLRYIEMQHFREKLPSYGMQKELVNLIDNHQVTVISGETGCGKTTQVTQFILDNYIE
200 210 220 230 240 250
440 450 460 470 480
pF1KE1 NDRAAECNIVVTQPRRISAVSVAERVAFERGEE--PGKSCGYSVRFESILPRPHASIMFC
... : :: ::::::::.::::::: ::.: :.: ::..:..: ::: ..::..:
NP_001 RGKGSACRIVCTQPRRISAISVAERVAAERAESCGSGNSTGYQIRLQSRLPRKQGSILYC
260 270 280 290 300 310
490 500 510 520 530 540
pF1KE1 TVGVLLRKLEAG--IRGISHVIVDEIHERDINTDFLLVVLRDVVQAYPEVRIVLMSATID
:.:..:. :.. . ..::...::::::....: :..:..:... .....:::::..
NP_001 TTGIILQWLQSDPYLSSVSHIVLDEIHERNLQSDVLMTVVKDLLNFRSDLKVILMSATLN
320 330 340 350 360 370
550 560 570 580 590
pF1KE1 TSMFCEYFFNCPIIEVYGRTYPVQEYFLEDCIQMTHFVPPPKDKKKKDK--------DDD
. : ::: :::.:.. : :.:: ::.::: :. ..:: :..... : . .
NP_001 AEKFSEYFGNCPMIHIPGFTFPVVEYLLEDVIEKIRYVPEQKEHRSQFKRGFMQGHVNRQ
380 390 400 410 420 430
600 610 620 630 640 650
pF1KE1 GGEDDDANCNLICGD-------EYGPETRLSMSQLNEKETPFELIEALLKYIETLNVPGA
:. .: . : .:. : . .... .. ..:: ::..:: . ::
NP_001 EKEEKEAIYKERWPDYVRELRRRYSASTVDVIEMMEDDKVDLNLIVALIRYIVLEEEDGA
440 450 460 470 480 490
660 670 680 690 700 710
pF1KE1 VLVFLPGWNLIYTMQKHLEMNPHFGSHRYQILPLHSQIPREEQRKVFDPVPVGVTKVILS
.:::::::. : :.. : . : : .: .:: .: :: :....
NP_001 ILVFLPGWDNISTLHDLLMSQVMFKS--------------VNQTQVFKRTPPGVRKIVIA
500 510 520 530
720 730 740 750 760 770
pF1KE1 TNIAETSITINDVVYVIDSCKQKVKLFTAHNNMTNYATVWASKTNLEQRKGRAGRVRPGF
::::::::::.:::::::. : : : ..::...... :.::.: .:::::::::.::
NP_001 TNIAETSITIDDVVYVIDGGKIKETHFDTQNNISTMSAEWVSKANAKQRKGRAGRVQPGH
540 550 560 570 580 590
780 790 800 810 820 830
pF1KE1 CFHLCSRARFERLETHMTPEMFRTPLHEIALSIKLLRLGGIGQFLAKAIEPPPLDAVIEA
:.:: . : :. .. ::..::::.:. :.::.::::::. ::.. ..:: .::. .
NP_001 CYHLYNGLRASLLDDYQLPEILRTPLEELCLQIKILRLGGIAYFLSRLMDPPSNEAVLLS
600 610 620 630 640 650
840 850 860 870 880 890
pF1KE1 EHTLRELDALDANDELTPLGRILAKLPIEPRFGKMMIMGCIFYVGDAICTIAAATCFPEP
. : ::.::: ..:::::: ::.::.::..:::...: .: : . ::::. : .:
NP_001 IRHLMELNALDKQEELTPLGVHLARLPVEPHIGKMILFGALFCCLDPVLTIAASLSFKDP
660 670 680 690 700 710
900 910 920 930 940
pF1KE1 FINE-GK-RLGYIHRN-FAGNRFSDHVALLSVFQAWDDARMGGEEAEIRFCEHKRLNMAT
:. :: ... .:. .: . :::......:..:..:: : . : .: . :. :
NP_001 FVIPLGKEKIADARRKELAKDTRSDHLTVVNAFEGWEEARRRGFRYEKDYCWEYFLSSNT
720 730 740 750 760 770
950 960 970 980 990 1000
pF1KE1 LRMTWEAKVQLKEILINSGFPEDCLLTQVFTNTGPDNNLDVVISLLAFGVYPNVCYHK--
:.: . : :. : :...:: . . .: . ::. .. ... :.::.: .
NP_001 LQMLHNMKGQFAEHLLGAGFVSSRNPKDPESNINSDNE-KIIKAVICAGLYPKVAKIRLN
780 790 800 810 820 830
1010 1020 1030 1040 1050 1060
pF1KE1 --EKRKILT----TEGRNALIHKSSVNCPFSSQDMKYPSPFFVFGEKIRTRAISAKGMTL
.:::.. :.: : .: .::: . :..: .... :.:: .: :
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pF1KE1 CFHLCSRARFERLETHMTPEMFRTPLHEIALSIKLLRLGGIGQFLAKAIEPPPLDAVIEA
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:. :: ... .:. .: . :::......:..:..:: : . : .: . :. :
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pF1KE1 VTPLQLLLFASK-KVQSDG--QIVLVDDWIKLQISHEAAACITGLRAAMEALVVEVTKQP
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NP_065 VSPYCLLFFGGDISIQKDNDQETIAVDEWIVFQSPARIAHLVKELRKELDILLQEKIESP
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pF1KE1 AIISQLDPVNERMLNMIRQISRPSAAGINLMIGSTRYGDGPRPPKMARYDNGSGYRRGGS
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NP_065 HPVDWNDTKSRDCAVLSAIIDLIKTQEKATPRNFPPRFQDGYYS
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.:: : ::: . .. . ..: :: . :. :.:::. . .. .:: .
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. .:.: ::. .: ::... . .:.:... .
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pF1KE1 RYGDGPRPPKMARYDNGSGYRRGGSSYSGGGYGGGYSSGGYGSGGYGGSANSFRAGYGAG
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XP_016 MAGDSTLSTVTHVIVDEVHERDRFSDFLLTKLRDLLQKH
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pF1KE1 PEVRIVLMSATIDTSMFCEYFFNCPIIEVYGRTYPVQEYFLEDCIQMTHFVPPPKDKKKK
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pF1KE1 DKD----------------------------------------DDGGE-------DDDAN
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pF1KE1 -----------------------------------------------EYGPETRLSMSQL
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pF1KE1 N--------------------EKETPFELIEALLKYIETLNVPGAVLVFLPGWNLIYTMQ
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: ... :. :... ::::.::: .::::. :: : : :::.. :..::... .
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.:: : ::: . .. . ..: :: . :. :.:::. . .. .:: .
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... .: .:: : ..: :. .... : :. : . . . :::
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. .:.: ::. .: ::... . .:.:... .
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:::. . :: ..: .. . :. ::.: .. : . . . .. ..::.. :
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pF1KE1 VTPLQLLLF------ASKKVQ--------------SDGQI----------VLVDDWIKLQ
:::. .:.: ::. .: ::... . .:.:...
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pF1KE1 ATPEQISMDLKNELMYQLEQDHDLQAILQERELLPVKKFESEILEAISQNSVVIIRGATG
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XP_016 MSKTSGRLNNGIPQIPVKRGESEFDSFRQSLPVFEKQEEIVKIIKENKVVLIVGETG
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pF1KE1 CGKTTQVPQFILDDFIQNDRAAECNIVVTQPRRISAVSVAERVAFERGEEPGKSCGYSVR
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XP_016 SGKTTQIPQFLLDDCFKN--GIPCRIFCTQPRRLAAIAVAERVAAERRERIGQTIGYQIR
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pF1KE1 QAYPEVRIVLMSATIDTSMFCEYFFNCPIIEVYGRTYPVQEYFLEDCIQMTHFVPPPKDK
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XP_016 QKHPTLKLILSSAALDVNLFIRYFGSCPVIYIQGRPFEVKEMFLEDILRTTGYTNKEMLK
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XP_016 VQTNGSDLSAEDRELLKAYHHSFDDEKVDLDLIMHLLYNICHSCDAGAVLIFLPGYDEIV
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XP_016 GLRDRILFDDKRFADSTHRYQVFMLHSNMQTSDQKKVLKNPPAGVRKIILSTNIAETSIT
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pF1KE1 INDVVYVIDSCKQKVKLFTAHNNMTNYATVWASKTNLEQRKGRAGRVRPGFCFHLCSRAR
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XP_016 VNDVVFVIDSGKVKEKSFDALNFVTMLKMVWISKASAIQRKGRAGRCRPGICFRLFSRLR
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pF1KE1 DALDANDELTPLGRILAKLPIEPRFGKMMIMGCIFYVGDAICTIAAATCFPEPFI----N
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XP_016 DAMDTWEDLTELGYHLADLPVEPHLGKMVLCAVVLKCLDPILTIACTLAYRDPFVLPTQA
660 670 680 690 700 710
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pF1KE1 EGKRLGYIHRN-FAGNRFSDHVALLSVFQAWDDARMGGEEAEIRFCEHKRLNMATLRMTW
:: ... :. :... ::::.::: .::::. :: : : :::.. :..::...
XP_016 SQKRAAMLCRKRFTAGAFSDHMALLRAFQAWQKARSDGWERA--FCEKNFLSQATMEIII
720 730 740 750 760 770
960 970 980 990 1000 1010
pF1KE1 EAKVQLKEILINSGFPEDCLLTQVFTNTGPDNNLDVVISLLAFGVYPNVCYHKEKRKILT
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XP_016 GMRTQLLGQLRASGFVRARGGGDIRDVNTNSENWAVVKAALVAGMYPNLVHVDRENLVLT
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