Result of FASTA (ccds) for
pFN21AB5059
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB5059, 622 aa
1>>>pF1KB5059 622 - 622 aa - 622 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.6561+/-0.000917; mu= 13.1599+/- 0.055
mean_var=112.2134+/-21.619, 0's: 0 Z-trim(108.8): 71 B-trim: 12 in 1/52
Lambda= 0.121074
statistics sampled from 10388 (10459) to 10388 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.685), E-opt: 0.2 (0.321), width: 16
Scan time: 3.590
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS4427.1 DDX41 gene_id:51428|Hs108|chr5 ( 622) 4111 729.3 3.5e-210
CCDS34240.1 DDX46 gene_id:9879|Hs108|chr5 (1031) 966 180.1 1.2e-44
CCDS75306.1 DDX46 gene_id:9879|Hs108|chr5 (1032) 966 180.1 1.2e-44
CCDS46706.1 DDX17 gene_id:10521|Hs108|chr22 ( 731) 932 174.1 5.8e-43
CCDS33646.1 DDX17 gene_id:10521|Hs108|chr22 ( 729) 930 173.7 7.4e-43
CCDS54855.1 DDX4 gene_id:54514|Hs108|chr5 ( 575) 881 165.1 2.3e-40
CCDS4977.1 DDX43 gene_id:55510|Hs108|chr6 ( 648) 877 164.5 4.1e-40
CCDS47208.1 DDX4 gene_id:54514|Hs108|chr5 ( 690) 874 163.9 6.2e-40
CCDS54854.1 DDX4 gene_id:54514|Hs108|chr5 ( 704) 874 164.0 6.3e-40
CCDS3969.1 DDX4 gene_id:54514|Hs108|chr5 ( 724) 874 164.0 6.4e-40
CCDS55404.1 DDX3X gene_id:1654|Hs108|chrX ( 646) 851 159.9 9.5e-39
CCDS14782.1 DDX3Y gene_id:8653|Hs108|chrY ( 660) 851 159.9 9.7e-39
CCDS43931.1 DDX3X gene_id:1654|Hs108|chrX ( 662) 851 159.9 9.7e-39
CCDS13416.1 DDX27 gene_id:55661|Hs108|chr20 ( 796) 749 142.2 2.6e-33
CCDS32704.1 DDX42 gene_id:11325|Hs108|chr17 ( 938) 737 140.1 1.3e-32
CCDS11659.1 DDX5 gene_id:1655|Hs108|chr17 ( 614) 724 137.7 4.3e-32
CCDS82190.1 DDX5 gene_id:1655|Hs108|chr17 ( 614) 724 137.7 4.3e-32
CCDS11323.1 DDX52 gene_id:11056|Hs108|chr17 ( 599) 719 136.8 7.8e-32
CCDS35214.1 DDX53 gene_id:168400|Hs108|chrX ( 631) 643 123.6 8.1e-28
CCDS8342.1 DDX10 gene_id:1662|Hs108|chr11 ( 875) 632 121.7 4e-27
CCDS2120.1 DDX18 gene_id:8886|Hs108|chr2 ( 670) 629 121.1 4.6e-27
CCDS30964.1 DDX59 gene_id:83479|Hs108|chr1 ( 619) 600 116.1 1.5e-25
CCDS3282.1 EIF4A2 gene_id:1974|Hs108|chr3 ( 407) 566 110.0 6.3e-24
CCDS11767.1 EIF4A3 gene_id:9775|Hs108|chr17 ( 411) 560 109.0 1.3e-23
CCDS12390.1 DDX49 gene_id:54555|Hs108|chr19 ( 483) 560 109.0 1.5e-23
CCDS11113.1 EIF4A1 gene_id:1973|Hs108|chr17 ( 406) 556 108.3 2.1e-23
CCDS8655.1 DDX47 gene_id:51202|Hs108|chr12 ( 455) 549 107.1 5.4e-23
CCDS12308.1 DDX39A gene_id:10212|Hs108|chr19 ( 427) 533 104.2 3.6e-22
CCDS4697.1 DDX39B gene_id:7919|Hs108|chr6 ( 428) 532 104.1 4.1e-22
CCDS31907.1 DDX54 gene_id:79039|Hs108|chr12 ( 881) 535 104.8 5e-22
CCDS44984.1 DDX54 gene_id:79039|Hs108|chr12 ( 882) 535 104.8 5e-22
CCDS8770.1 DDX23 gene_id:9416|Hs108|chr12 ( 820) 527 103.4 1.3e-21
CCDS44751.1 DDX6 gene_id:1656|Hs108|chr11 ( 483) 491 96.9 6.4e-20
CCDS31211.1 DDX21 gene_id:9188|Hs108|chr10 ( 783) 484 95.9 2.2e-19
CCDS73144.1 DDX21 gene_id:9188|Hs108|chr10 ( 715) 467 92.9 1.6e-18
CCDS9251.1 DDX55 gene_id:57696|Hs108|chr12 ( 600) 462 91.9 2.6e-18
CCDS7283.1 DDX50 gene_id:79009|Hs108|chr10 ( 737) 442 88.5 3.4e-17
CCDS6952.1 DDX31 gene_id:64794|Hs108|chr9 ( 585) 401 81.3 4e-15
CCDS58511.1 EIF4A1 gene_id:1973|Hs108|chr17 ( 347) 386 78.5 1.6e-14
CCDS82009.1 DDX19A gene_id:55308|Hs108|chr16 ( 447) 386 78.6 2e-14
CCDS10889.1 DDX19A gene_id:55308|Hs108|chr16 ( 478) 386 78.6 2.1e-14
CCDS81646.1 DDX25 gene_id:29118|Hs108|chr11 ( 369) 379 77.3 4e-14
CCDS42187.1 DDX19B gene_id:11269|Hs108|chr16 ( 370) 378 77.1 4.5e-14
CCDS44766.1 DDX25 gene_id:29118|Hs108|chr11 ( 483) 379 77.4 5e-14
CCDS32475.1 DDX19B gene_id:11269|Hs108|chr16 ( 448) 378 77.2 5.3e-14
CCDS58478.1 DDX19B gene_id:11269|Hs108|chr16 ( 453) 378 77.2 5.3e-14
CCDS10888.1 DDX19B gene_id:11269|Hs108|chr16 ( 479) 378 77.2 5.6e-14
CCDS842.1 DDX20 gene_id:11218|Hs108|chr1 ( 824) 333 69.5 2e-11
>>CCDS4427.1 DDX41 gene_id:51428|Hs108|chr5 (622 aa)
initn: 4111 init1: 4111 opt: 4111 Z-score: 3886.8 bits: 729.3 E(32554): 3.5e-210
Smith-Waterman score: 4111; 100.0% identity (100.0% similar) in 622 aa overlap (1-622:1-622)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MEESEPERKRARTDEVPAGGSRSEAEDEDDEDYVPYVPLRQRRQLLLQKLLQRRRKGAAE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 MEESEPERKRARTDEVPAGGSRSEAEDEDDEDYVPYVPLRQRRQLLLQKLLQRRRKGAAE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 EEQQDSGSEPRGDEDDIPLGPQSNVSLLDQHQHLKEKAEARKESAKEKQLKEEEKILESV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 EEQQDSGSEPRGDEDDIPLGPQSNVSLLDQHQHLKEKAEARKESAKEKQLKEEEKILESV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 AEGRALMSVKEMAKGITYDDPIKTSWTPPRYVLSMSEERHERVRKKYHILVEGDGIPPPI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 AEGRALMSVKEMAKGITYDDPIKTSWTPPRYVLSMSEERHERVRKKYHILVEGDGIPPPI
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 KSFKEMKFPAAILRGLKKKGIHHPTPIQIQGIPTILSGRDMIGIAFTGSGKTLVFTLPVI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 KSFKEMKFPAAILRGLKKKGIHHPTPIQIQGIPTILSGRDMIGIAFTGSGKTLVFTLPVI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 MFCLEQEKRLPFSKREGPYGLIICPSRELARQTHGILEYYCRLLQEDSSPLLRCALCIGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 MFCLEQEKRLPFSKREGPYGLIICPSRELARQTHGILEYYCRLLQEDSSPLLRCALCIGG
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 MSVKEQMETIRHGVHMMVATPGRLMDLLQKKMVSLDICRYLALDEADRMIDMGFEGDIRT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 MSVKEQMETIRHGVHMMVATPGRLMDLLQKKMVSLDICRYLALDEADRMIDMGFEGDIRT
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 IFSYFKGQRQTLLFSATMPKKIQNFAKSALVKPVTINVGRAGAASLDVIQEVEYVKEEAK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 IFSYFKGQRQTLLFSATMPKKIQNFAKSALVKPVTINVGRAGAASLDVIQEVEYVKEEAK
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 MVYLLECLQKTPPPVLIFAEKKADVDAIHEYLLLKGVEAVAIHGGKDQEERTKAIEAFRE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 MVYLLECLQKTPPPVLIFAEKKADVDAIHEYLLLKGVEAVAIHGGKDQEERTKAIEAFRE
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB5 GKKDVLVATDVASKGLDFPAIQHVINYDMPEEIENYVHRIGRTGRSGNTGIATTFINKAC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 GKKDVLVATDVASKGLDFPAIQHVINYDMPEEIENYVHRIGRTGRSGNTGIATTFINKAC
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB5 DESVLMDLKALLLEAKQKVPPVLQVLHCGDESMLDIGGERGCAFCGGLGHRITDCPKLEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 DESVLMDLKALLLEAKQKVPPVLQVLHCGDESMLDIGGERGCAFCGGLGHRITDCPKLEA
550 560 570 580 590 600
610 620
pF1KB5 MQTKQVSNIGRKDYLAHSSMDF
::::::::::::::::::::::
CCDS44 MQTKQVSNIGRKDYLAHSSMDF
610 620
>>CCDS34240.1 DDX46 gene_id:9879|Hs108|chr5 (1031 aa)
initn: 1004 init1: 293 opt: 966 Z-score: 914.7 bits: 180.1 E(32554): 1.2e-44
Smith-Waterman score: 971; 33.0% identity (62.1% similar) in 631 aa overlap (10-613:186-803)
10 20 30
pF1KB5 MEESEPERKRARTDEVPAGGSRSEAEDEDDEDYVPYVPL
. . .:. : . : .:.:::: :
CCDS34 LEEEMRKRKERVEKWREEQRKKAMENIGELKKEIEEMKQGKKWSLEDDDDDEDD-PAEAE
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40 50 60 70 80 90
pF1KB5 RQRRQLLLQKL--LQRRRKGAAEEEQQ-DSGSEPRGDEDDIPLGPQSN--VSLLDQHQHL
.. .. ..: :. . . :: .. . : : .. :: . :... .. .
CCDS34 KEGNEMEGEELDPLDAYMEEVKEEVKKFNMRSVKGGGGNEKKSGPTVTKVVTVVTTKKAV
220 230 240 250 260 270
100 110 120 130 140
pF1KB5 ----KEKAEARK--ESAKEKQLKEEEKILESVAEG-----RALMSVKEMAKGITYDDPIK
:.:.: . ..: : . .::: :... : : :. . .: : :. :
CCDS34 VDSDKKKGELMENDQDAMEYSSEEEEVDLQTALTGYQTKQRKLLEPVDHGK-IEYEPFRK
280 290 300 310 320 330
150 160 170 180 190 200
pF1KB5 TSWTPPRYVLSMSEERHERVRKKYH-ILVEGDGIPPPIKSFKEMKFPAAILRGLKKKGIH
. .. . .::.:. . : ... : :.: : : ::::. . . :: .:::.: .
CCDS34 NFYVEVPELAKMSQEEVNVFRLEMEGITVKGKGCPKPIKSWVQCGISMKILNSLKKHGYE
340 350 360 370 380 390
210 220 230 240 250 260
pF1KB5 HPTPIQIQGIPTILSGRDMIGIAFTGSGKTLVFTLPVIMFCLEQEKRLPFSKREGPYGLI
.::::: :.::.:.::::.:::: ::::::..: ::.. ..:.. . . ::: ..:
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270 280 290 300 310 320
pF1KB5 ICPSRELARQTHGILEYYCRLLQEDSSPLLRCALCIGGMSVKEQMETIRHGVHMMVATPG
. :.:::: : . :. ... . :: . :: ...::. ...:....: :::
CCDS34 MTPTRELALQ----ITKECKKFSKTLG--LRVVCVYGGTGISEQIAELKRGAEIIVCTPG
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330 340 350 360 370
pF1KB5 RLMDLLQK---KMVSLDICRYLALDEADRMIDMGFEGDIRTIFSYFKGQRQTLLFSATMP
:..:.: ....: :..:::::::.::::: .. : . . .:::..::::.:
CCDS34 RMIDMLAANSGRVTNLRRVTYVVLDEADRMFDMGFEPQVMRIVDNVRPDRQTVMFSATFP
510 520 530 540 550 560
380 390 400 410 420 430
pF1KB5 KKIQNFAKSALVKPVTINVGRAGAASLDVIQEVEYVKEEAKMVYLLECL--QKTPPPVLI
. .. .:. : ::. ..:: ... :: :.: ..:: :.. ::: : . :.:
CCDS34 RAMEALARRILSKPIEVQVGGRSVVCSDVEQQVIVIEEEKKFLKLLELLGHYQESGSVII
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440 450 460 470 480 490
pF1KB5 FAEKKADVDAIHEYLLLKGVEAVAIHGGKDQEERTKAIEAFREGKKDVLVATDVASKGLD
:..:. .:.. . :. . ...::: :: .: . :. :..: .::::.::..:::
CCDS34 FVDKQEHADGLLKDLMRASYPCMSLHGGIDQYDRDSIINDFKNGTCKLLVATSVAARGLD
630 640 650 660 670 680
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pF1KB5 FPAIQHVINYDMPEEIENYVHRIGRTGRSGNTGIATTFINKACDESVLMDLKALLLEAKQ
. :.::. :.. :.:::: :::::.:: : : :::.. . . .::: : .
CCDS34 VKHLILVVNYSCPNHYEDYVHRAGRTGRAGNKGYAYTFITEDQARYAGDIIKALELSGTA
690 700 710 720 730 740
560 570 580 590 600 610
pF1KB5 KVPPVLQVLHCGDESMLDIGGE---RGCAFCGGLGHRITDCPKLEAMQTK--QVSNIGRK
::: :. : ... :. .. .: .: : .. . . : . : : . .: .
CCDS34 -VPPDLEKLWSDFKDQQKAEGKIIKKSSGF-SGKGFKFDETEQALANERKKLQKAALGLQ
750 760 770 780 790 800
620
pF1KB5 DYLAHSSMDF
:
CCDS34 DSDDEDAAVDIDEQIESMFNSKKRVKDMAAPGTSSVPAPTAGNAEKLEIAKRLALRINAQ
810 820 830 840 850 860
>>CCDS75306.1 DDX46 gene_id:9879|Hs108|chr5 (1032 aa)
initn: 1004 init1: 293 opt: 966 Z-score: 914.7 bits: 180.1 E(32554): 1.2e-44
Smith-Waterman score: 971; 33.0% identity (62.1% similar) in 631 aa overlap (10-613:186-803)
10 20 30
pF1KB5 MEESEPERKRARTDEVPAGGSRSEAEDEDDEDYVPYVPL
. . .:. : . : .:.:::: :
CCDS75 LEEEMRKRKERVEKWREEQRKKAMENIGELKKEIEEMKQGKKWSLEDDDDDEDD-PAEAE
160 170 180 190 200 210
40 50 60 70 80 90
pF1KB5 RQRRQLLLQKL--LQRRRKGAAEEEQQ-DSGSEPRGDEDDIPLGPQSN--VSLLDQHQHL
.. .. ..: :. . . :: .. . : : .. :: . :... .. .
CCDS75 KEGNEMEGEELDPLDAYMEEVKEEVKKFNMRSVKGGGGNEKKSGPTVTKVVTVVTTKKAV
220 230 240 250 260 270
100 110 120 130 140
pF1KB5 ----KEKAEARK--ESAKEKQLKEEEKILESVAEG-----RALMSVKEMAKGITYDDPIK
:.:.: . ..: : . .::: :... : : :. . .: : :. :
CCDS75 VDSDKKKGELMENDQDAMEYSSEEEEVDLQTALTGYQTKQRKLLEPVDHGK-IEYEPFRK
280 290 300 310 320 330
150 160 170 180 190 200
pF1KB5 TSWTPPRYVLSMSEERHERVRKKYH-ILVEGDGIPPPIKSFKEMKFPAAILRGLKKKGIH
. .. . .::.:. . : ... : :.: : : ::::. . . :: .:::.: .
CCDS75 NFYVEVPELAKMSQEEVNVFRLEMEGITVKGKGCPKPIKSWVQCGISMKILNSLKKHGYE
340 350 360 370 380 390
210 220 230 240 250 260
pF1KB5 HPTPIQIQGIPTILSGRDMIGIAFTGSGKTLVFTLPVIMFCLEQEKRLPFSKREGPYGLI
.::::: :.::.:.::::.:::: ::::::..: ::.. ..:.. . . ::: ..:
CCDS75 KPTPIQTQAIPAIMSGRDLIGIAKTGSGKTIAFLLPMFRHIMDQRS---LEEGEGPIAVI
400 410 420 430 440 450
270 280 290 300 310 320
pF1KB5 ICPSRELARQTHGILEYYCRLLQEDSSPLLRCALCIGGMSVKEQMETIRHGVHMMVATPG
. :.:::: : . :. ... . :: . :: ...::. ...:....: :::
CCDS75 MTPTRELALQ----ITKECKKFSKTLG--LRVVCVYGGTGISEQIAELKRGAEIIVCTPG
460 470 480 490 500
330 340 350 360 370
pF1KB5 RLMDLLQK---KMVSLDICRYLALDEADRMIDMGFEGDIRTIFSYFKGQRQTLLFSATMP
:..:.: ....: :..:::::::.::::: .. : . . .:::..::::.:
CCDS75 RMIDMLAANSGRVTNLRRVTYVVLDEADRMFDMGFEPQVMRIVDNVRPDRQTVMFSATFP
510 520 530 540 550 560
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pF1KB5 KKIQNFAKSALVKPVTINVGRAGAASLDVIQEVEYVKEEAKMVYLLECL--QKTPPPVLI
. .. .:. : ::. ..:: ... :: :.: ..:: :.. ::: : . :.:
CCDS75 RAMEALARRILSKPIEVQVGGRSVVCSDVEQQVIVIEEEKKFLKLLELLGHYQESGSVII
570 580 590 600 610 620
440 450 460 470 480 490
pF1KB5 FAEKKADVDAIHEYLLLKGVEAVAIHGGKDQEERTKAIEAFREGKKDVLVATDVASKGLD
:..:. .:.. . :. . ...::: :: .: . :. :..: .::::.::..:::
CCDS75 FVDKQEHADGLLKDLMRASYPCMSLHGGIDQYDRDSIINDFKNGTCKLLVATSVAARGLD
630 640 650 660 670 680
500 510 520 530 540 550
pF1KB5 FPAIQHVINYDMPEEIENYVHRIGRTGRSGNTGIATTFINKACDESVLMDLKALLLEAKQ
. :.::. :.. :.:::: :::::.:: : : :::.. . . .::: : .
CCDS75 VKHLILVVNYSCPNHYEDYVHRAGRTGRAGNKGYAYTFITEDQARYAGDIIKALELSGTA
690 700 710 720 730 740
560 570 580 590 600 610
pF1KB5 KVPPVLQVLHCGDESMLDIGGE---RGCAFCGGLGHRITDCPKLEAMQTK--QVSNIGRK
::: :. : ... :. .. .: .: : .. . . : . : : . .: .
CCDS75 -VPPDLEKLWSDFKDQQKAEGKIIKKSSGF-SGKGFKFDETEQALANERKKLQKAALGLQ
750 760 770 780 790 800
620
pF1KB5 DYLAHSSMDF
:
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CCDS33 DRQTLMWSATWPKEVRQLAEDFLRDYTQINVGNLELSANHNILQIVDVCMESEKDHKLIQ
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CCDS33 LMEEIMAEKENKTIIFVETKRRCDDLTRRMRRDGWPAMCIHGDKSQPERDWVLNEFRSGK
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CCDS33 APILIATDVASRGLDVEDVKFVINYDYPNSSEDYVHRIGRTARSTNKGTAYTFFTPGNLK
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CCDS33 QA-RELIKVLEEANQAINPKLMQLVDHRGGGGGGGGRSRYRTTSSANNPNLMYQDECDRR
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CCDS54 KKKADFIATFLCQEKISTTSIHGDREQREREQALGDFRFGKCPVLVATSVAARGLDIENV
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170 180 190 200 210 220
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CCDS49 ITWDDLKDGEKRPIPNPTCTFDDAFQCYPE-VMENIKKAGFQKPTPIQSQAWPIVLQGID
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230 240 250 260 270
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340 350 360 370 380 390
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400 410 420 430 440 450
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460 470 480 490 500 510
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.. . ..:: ..:..: ::.: :. :: .:.:::.::.::: . :: :.:.:..::.
CCDS49 NISVESLHGDREQRDREKALENFKTGKVRILIATDLASRGLDVHDVTHVYNFDFPRNIEE
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520 530 540 550 560 570
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CCDS49 YVHRIGRTGRAGRTGVSITTLTRN-DWRVASELINILERANQSIPEELVSMAERFKAHQQ
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580 590 600 610 620
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CCDS49 KREMERKMERPQGRPKKFH
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CCDS47 NRGFSNSRFEDGDSSGFWRESSNDCEDNPTRNRGFSKRGDNDLDPDECMQRTGGLFGSRR
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100 110 120 130 140
pF1KB5 HL------KEKAEARKESAKEKQLKEEEKILESVAEGRALMSVKEMAKGITYDD---PIK
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CCDS47 PVLSGTGNGDTSQSRSGSGSERG--GYKGLNEEVITGSGKNSWKSEAEGGESSDTQGPKV
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CCDS47 TYIPPPPPEDEDSIFAHYQTGINFDKYDTILVEVSGHDAPPAILTFEEANLCQTLNNNIA
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CCDS47 KAGYTKLTPVQKYSIPIILAGRDLMACAQTGSGKTAAFLLPILAHMMHDGITASRFKELQ
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CCDS47 MFSATFPEEIQRLAAEFLKSNYLFVAVGQVGGACRDVQQTVLQVGQFSKREKLVEILRNI
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pF1KB5 PPP-VLIFAEKKADVDAIHEYLLLKGVEAVAIHGGKDQEERTKAIEAFREGKKDVLVATD
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CCDS47 GDERTMVFVETKKKADFIATFLCQEKISTTSIHGDREQREREQALGDFRFGKCPVLVATS
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pF1KB5 VASKGLDFPAIQHVINYDMPEEIENYVHRIGRTGRSGNTGIATTFINKACDESVLMDLKA
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CCDS47 VAARGLDIENVQHVINFDLPSTIDEYVHRIGRTGRCGNTGRAISFFDLESDNHLAQPLVK
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pF1KB5 LLLEAKQKVPPVLQVLHCGDESMLDIGGERGCAFCGGLGHRITDCPKLEAMQTKQVSNIG
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CCDS47 VLTDAQQDVPAWLEEIAFSTYIPGFSGSTRGNVFASVDTRKGKSTLNTAGFSSSQAPNPV
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620
pF1KB5 RKDYLAHSSMDF
CCDS47 DDESWD
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pF1KB5 LDQHQHLKEKAEARKESAKEKQLKEEEKILESVAEGRALMSVKEMAKGITYDDPIKTSWT
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CCDS54 RPVLSGTGNGDTSQSRSGSGSERGGYKGLNEEVITGSGKNSWKSEAEGGESSDTQGPKVT
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pF1KB5 -----PPRYVLSMSEERHERVR-KKYH-ILVE--GDGIPPPIKSFKEMKFPAAILRGLKK
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CCDS54 YIPPPPPEDEDSIFAHYQTGINFDKYDTILVEVSGHDAPPAILTFEEANLCQTLNNNIAK
230 240 250 260 270 280
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pF1KB5 KGIHHPTPIQIQGIPTILSGRDMIGIAFTGSGKTLVFTLPVIMFCLEQEKRLP-FSKREG
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CCDS54 AGYTKLTPVQKYSIPIILAGRDLMACAQTGSGKTAAFLLPILAHMMHDGITASRFKELQE
290 300 310 320 330 340
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CCDS54 PECIIVAPTRELVNQIY--LE--ARKFSFGTC--VRAVVIYGGTQLGHSIRQIVQGCNIL
350 360 370 380 390
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