FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB3246, 1042 aa 1>>>pF1KB3246 1042 - 1042 aa - 1042 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.9802+/-0.000464; mu= 23.5626+/- 0.029 mean_var=66.2783+/-13.802, 0's: 0 Z-trim(109.3): 216 B-trim: 486 in 1/51 Lambda= 0.157539 statistics sampled from 17201 (17436) to 17201 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.534), E-opt: 0.2 (0.204), width: 16 Scan time: 13.980 The best scores are: opt bits E(85289) NP_733765 (OMIM: 101900,108740,124200) sarcoplasmi (1042) 6865 1570.2 0 NP_001672 (OMIM: 101900,108740,124200) sarcoplasmi ( 997) 6510 1489.5 0 XP_005253945 (OMIM: 101900,108740,124200) PREDICTE ( 999) 6510 1489.5 0 XP_011536704 (OMIM: 101900,108740,124200) PREDICTE ( 999) 6510 1489.5 0 NP_004311 (OMIM: 108730,601003) sarcoplasmic/endop ( 994) 5599 1282.5 0 NP_775293 (OMIM: 108730,601003) sarcoplasmic/endop (1001) 5599 1282.5 0 XP_011522191 (OMIM: 601929) PREDICTED: sarcoplasmi (1024) 5191 1189.8 0 XP_011522190 (OMIM: 601929) PREDICTED: sarcoplasmi (1028) 5191 1189.8 0 NP_777618 (OMIM: 601929) sarcoplasmic/endoplasmic (1029) 5191 1189.8 0 NP_777616 (OMIM: 601929) sarcoplasmic/endoplasmic (1029) 5191 1189.8 0 XP_011522187 (OMIM: 601929) PREDICTED: sarcoplasmi (1042) 5191 1189.8 0 NP_777615 (OMIM: 601929) sarcoplasmic/endoplasmic (1043) 5191 1189.8 0 NP_777614 (OMIM: 601929) sarcoplasmic/endoplasmic (1044) 5191 1189.8 0 NP_777613 (OMIM: 601929) sarcoplasmic/endoplasmic (1052) 5191 1189.8 0 XP_016880181 (OMIM: 601929) PREDICTED: sarcoplasmi (1062) 5191 1189.8 0 XP_011522186 (OMIM: 601929) PREDICTED: sarcoplasmi (1069) 5191 1189.8 0 XP_011522184 (OMIM: 601929) PREDICTED: sarcoplasmi (1084) 5191 1189.8 0 XP_011522183 (OMIM: 601929) PREDICTED: sarcoplasmi (1114) 5191 1189.8 0 NP_777617 (OMIM: 601929) sarcoplasmic/endoplasmic ( 998) 5183 1187.9 0 NP_005164 (OMIM: 601929) sarcoplasmic/endoplasmic ( 999) 5183 1187.9 0 NP_001273004 (OMIM: 108730,601003) sarcoplasmic/en ( 869) 4930 1130.4 0 XP_016880182 (OMIM: 601929) PREDICTED: sarcoplasmi (1020) 4793 1099.3 0 XP_011522194 (OMIM: 601929) PREDICTED: sarcoplasmi ( 540) 2705 624.5 4.7e-178 XP_011510988 (OMIM: 169600,604384) PREDICTED: calc ( 671) 723 174.1 2.3e-42 NP_001186113 (OMIM: 169600,604384) calcium-transpo ( 903) 723 174.2 2.9e-42 NP_055197 (OMIM: 169600,604384) calcium-transporti ( 919) 723 174.2 2.9e-42 NP_001186108 (OMIM: 169600,604384) calcium-transpo ( 919) 723 174.2 2.9e-42 NP_001186112 (OMIM: 169600,604384) calcium-transpo ( 923) 723 174.2 2.9e-42 XP_005247415 (OMIM: 169600,604384) PREDICTED: calc ( 933) 723 174.2 2.9e-42 NP_001001487 (OMIM: 169600,604384) calcium-transpo ( 939) 723 174.2 2.9e-42 XP_016861653 (OMIM: 169600,604384) PREDICTED: calc ( 939) 723 174.2 2.9e-42 NP_001186111 (OMIM: 169600,604384) calcium-transpo ( 944) 723 174.2 3e-42 NP_001001486 (OMIM: 169600,604384) calcium-transpo ( 949) 723 174.2 3e-42 XP_005247412 (OMIM: 169600,604384) PREDICTED: calc ( 949) 723 174.2 3e-42 XP_005247413 (OMIM: 169600,604384) PREDICTED: calc ( 949) 723 174.2 3e-42 NP_001186110 (OMIM: 169600,604384) calcium-transpo ( 953) 723 174.2 3e-42 NP_001186109 (OMIM: 169600,604384) calcium-transpo ( 973) 723 174.3 3e-42 XP_005247411 (OMIM: 169600,604384) PREDICTED: calc ( 983) 723 174.3 3e-42 NP_001001485 (OMIM: 169600,604384) calcium-transpo ( 888) 717 172.9 7.2e-42 NP_001186114 (OMIM: 169600,604384) calcium-transpo ( 888) 717 172.9 7.2e-42 NP_001278383 (OMIM: 613082) calcium-transporting A ( 795) 687 166.0 7.5e-40 NP_055676 (OMIM: 613082) calcium-transporting ATPa ( 946) 687 166.1 8.6e-40 XP_011521789 (OMIM: 613082) PREDICTED: calcium-tra ( 632) 623 151.4 1.5e-35 NP_000695 (OMIM: 137216) potassium-transporting AT (1035) 563 137.9 2.8e-31 XP_011507884 (OMIM: 607321) PREDICTED: sodium/pota ( 970) 559 137.0 5e-31 NP_653300 (OMIM: 607321) sodium/potassium-transpor (1029) 559 137.0 5.3e-31 NP_000693 (OMIM: 104290,182340,602481) sodium/pota (1020) 511 126.1 1e-27 NP_001667 (OMIM: 182360) potassium-transporting AT (1039) 499 123.4 6.7e-27 NP_001172014 (OMIM: 182360) potassium-transporting (1045) 499 123.4 6.8e-27 XP_016856850 (OMIM: 182310) PREDICTED: sodium/pota ( 992) 493 122.0 1.7e-26 >>NP_733765 (OMIM: 101900,108740,124200) sarcoplasmic/en (1042 aa) initn: 6865 init1: 6865 opt: 6865 Z-score: 8423.4 bits: 1570.2 E(85289): 0 Smith-Waterman score: 6865; 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100.0% identity (100.0% similar) in 993 aa overlap (1-993:1-993) 10 20 30 40 50 60 pF1KB3 MENAHTKTVEEVLGHFGVNESTGLSLEQVKKLKERWGSNELPAEEGKTLLELVIEQFEDL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 MENAHTKTVEEVLGHFGVNESTGLSLEQVKKLKERWGSNELPAEEGKTLLELVIEQFEDL 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KB3 LVRILLLAACISFVLAWFEEGEETITAFVEPFVILLILVANAIVGVWQERNAENAIEALK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 LVRILLLAACISFVLAWFEEGEETITAFVEPFVILLILVANAIVGVWQERNAENAIEALK 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KB3 EYEPEMGKVYRQDRKSVQRIKAKDIVPGDIVEIAVGDKVPADIRLTSIKSTTLRVDQSIL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 EYEPEMGKVYRQDRKSVQRIKAKDIVPGDIVEIAVGDKVPADIRLTSIKSTTLRVDQSIL 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KB3 TGESVSVIKHTDPVPDPRAVNQDKKNMLFSGTNIAAGKAMGVVVATGVNTEIGKIRDEMV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 TGESVSVIKHTDPVPDPRAVNQDKKNMLFSGTNIAAGKAMGVVVATGVNTEIGKIRDEMV 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KB3 ATEQERTPLQQKLDEFGEQLSKVISLICIAVWIINIGHFNDPVHGGSWIRGAIYYFKIAV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 ATEQERTPLQQKLDEFGEQLSKVISLICIAVWIINIGHFNDPVHGGSWIRGAIYYFKIAV 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KB3 ALAVAAIPEGLPAVITTCLALGTRRMAKKNAIVRSLPSVETLGCTSVICSDKTGTLTTNQ :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 ALAVAAIPEGLPAVITTCLALGTRRMAKKNAIVRSLPSVETLGCTSVICSDKTGTLTTNQ 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 pF1KB3 MSVCRMFILDRVEGDTCSLNEFTITGSTYAPIGEVHKDDKPVNCHQYDGLVELATICALC :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 MSVCRMFILDRVEGDTCSLNEFTITGSTYAPIGEVHKDDKPVNCHQYDGLVELATICALC 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 pF1KB3 NDSALDYNEAKGVYEKVGEATETALTCLVEKMNVFDTELKGLSKIERANACNSVIKQLMK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 NDSALDYNEAKGVYEKVGEATETALTCLVEKMNVFDTELKGLSKIERANACNSVIKQLMK 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 pF1KB3 KEFTLEFSRDRKSMSVYCTPNKPSRTSMSKMFVKGAPEGVIDRCTHIRVGSTKVPMTSGV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 KEFTLEFSRDRKSMSVYCTPNKPSRTSMSKMFVKGAPEGVIDRCTHIRVGSTKVPMTSGV 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 590 600 pF1KB3 KQKIMSVIREWGSGSDTLRCLALATHDNPLRREEMHLEDSANFIKYETNLTFVGCVGMLD :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 KQKIMSVIREWGSGSDTLRCLALATHDNPLRREEMHLEDSANFIKYETNLTFVGCVGMLD 550 560 570 580 590 600 610 620 630 640 650 660 pF1KB3 PPRIEVASSVKLCRQAGIRVIMITGDNKGTAVAICRRIGIFGQDEDVTSKAFTGREFDEL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 PPRIEVASSVKLCRQAGIRVIMITGDNKGTAVAICRRIGIFGQDEDVTSKAFTGREFDEL 610 620 630 640 650 660 670 680 690 700 710 720 pF1KB3 NPSAQRDACLNARCFARVEPSHKSKIVEFLQSFDEITAMTGDGVNDAPALKKAEIGIAMG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 NPSAQRDACLNARCFARVEPSHKSKIVEFLQSFDEITAMTGDGVNDAPALKKAEIGIAMG 670 680 690 700 710 720 730 740 750 760 770 780 pF1KB3 SGTAVAKTASEMVLADDNFSTIVAAVEEGRAIYNNMKQFIRYLISSNVGEVVCIFLTAAL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 SGTAVAKTASEMVLADDNFSTIVAAVEEGRAIYNNMKQFIRYLISSNVGEVVCIFLTAAL 730 740 750 760 770 780 790 800 810 820 830 840 pF1KB3 GFPEALIPVQLLWVNLVTDGLPATALGFNPPDLDIMNKPPRNPKEPLISGWLFFRYLAIG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 GFPEALIPVQLLWVNLVTDGLPATALGFNPPDLDIMNKPPRNPKEPLISGWLFFRYLAIG 790 800 810 820 830 840 850 860 870 880 890 900 pF1KB3 CYVGAATVGAAAWWFIAADGGPRVSFYQLSHFLQCKEDNPDFEGVDCAIFESPYPMTMAL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 CYVGAATVGAAAWWFIAADGGPRVSFYQLSHFLQCKEDNPDFEGVDCAIFESPYPMTMAL 850 860 870 880 890 900 910 920 930 940 950 960 pF1KB3 SVLVTIEMCNALNSLSENQSLLRMPPWENIWLVGSICLSMSLHFLILYVEPLPLIFQITP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 SVLVTIEMCNALNSLSENQSLLRMPPWENIWLVGSICLSMSLHFLILYVEPLPLIFQITP 910 920 930 940 950 960 970 980 990 1000 1010 1020 pF1KB3 LNVTQWLMVLKISLPVILMDETLKFVARNYLEPGKECVQPATKSCSFSACTDGISWPFVL ::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 LNVTQWLMVLKISLPVILMDETLKFVARNYLEPVLSSEL 970 980 990 1030 1040 pF1KB3 LIMPLVIWVYSTDTNFSDMFWS >>NP_004311 (OMIM: 108730,601003) sarcoplasmic/endoplasm (994 aa) initn: 5597 init1: 2887 opt: 5599 Z-score: 6868.6 bits: 1282.5 E(85289): 0 Smith-Waterman score: 5599; 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