FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE2563, 995 aa 1>>>pF1KE2563 995 - 995 aa - 995 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.9717+/-0.00089; mu= 14.3936+/- 0.054 mean_var=120.7036+/-24.132, 0's: 0 Z-trim(109.4): 119 B-trim: 76 in 1/51 Lambda= 0.116739 statistics sampled from 10737 (10857) to 10737 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.69), E-opt: 0.2 (0.334), width: 16 Scan time: 3.270 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS9350.1 STARD13 gene_id:90627|Hs108|chr13 ( 995) 6739 1146.8 0 CCDS9349.1 STARD13 gene_id:90627|Hs108|chr13 (1105) 6739 1146.8 0 CCDS9348.1 STARD13 gene_id:90627|Hs108|chr13 (1113) 6739 1146.8 0 CCDS55201.1 DLC1 gene_id:10395|Hs108|chr8 (1017) 3237 557.0 7.1e-158 CCDS5990.1 DLC1 gene_id:10395|Hs108|chr8 (1091) 3237 557.0 7.5e-158 CCDS83253.1 DLC1 gene_id:10395|Hs108|chr8 (1125) 3237 557.0 7.7e-158 CCDS5989.1 DLC1 gene_id:10395|Hs108|chr8 (1528) 3237 557.1 9.9e-158 CCDS14390.1 STARD8 gene_id:9754|Hs108|chrX (1023) 2302 399.5 1.8e-110 CCDS48134.1 STARD8 gene_id:9754|Hs108|chrX (1103) 2302 399.5 1.9e-110 CCDS34535.1 ARHGAP18 gene_id:93663|Hs108|chr6 ( 663) 347 70.1 1.7e-11 >>CCDS9350.1 STARD13 gene_id:90627|Hs108|chr13 (995 aa) initn: 6739 init1: 6739 opt: 6739 Z-score: 6135.5 bits: 1146.8 E(32554): 0 Smith-Waterman score: 6739; 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CCDS55 MKLEISPHRKRSDDSDEDEPCAISGKWTFQRDSKRWSRLEEFDVFSPKQDLVPGSPDDSH 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 pF1KE2 MRNTTSSESVLTDLSE-PEVCSIHSESSGGS-DSRSQPGQ-------------CCTDNPV .. : ..: :::: :: :..: :: :: :.. :.. : ..: . CCDS55 PKDGPSPGGTLMDLSERQEVSSVRSLSSTGSLPSHAPPSEDAATPRTNSVISVCSSSNLA 70 80 90 100 110 120 110 120 130 140 150 160 pF1KE2 MLDAPLVSSSLPQPPRDVLNHPFHPK-NEKPTRARAKSFLKRMETLRGKGAH-GRHKGSG : . .:::.: ... . : : .:: ......:.:::::.:. :..: ..::. . CCDS55 GNDDSF--GSLPSP-KELSSFSFSMKGHEKTAKSKTRSLLKRMESLKLKSSHHSKHKAPS 130 140 150 160 170 170 180 190 200 210 pF1KE2 RTGGLVISGPMLQQ--EPESFKAMQCIQIP--NGDLQNSPPPACRKGLPCSGKSSGESSP . : :.::::.::. . :..: ..:..: ::. : : . .... : ..:. :: CCDS55 KLG-LIISGPILQEGMDEEKLKQLNCVEISALNGNRINVPM-VRKRSVSNSTQTSSSSSQ 180 190 200 210 220 230 220 230 240 250 260 270 pF1KE2 SEHSSSGVSTPC--LKERKCHEANKRGGMYLEDLDVLAGTALPDAGDQSRMHEFHSQENL :: .::.:::: . :. ::: ::::: .: . ... .. .:. .. :. CCDS55 SE-TSSAVSTPSPVTRTRSLSACNKRVGMYLEGFDPFNQSTFNNVVEQNFKNRESYPEDT 240 250 260 270 280 290 280 290 300 310 320 pF1KE2 VVHIPKDHKPGTFPKALSIESLSPTDSSNGVNWRTGS------ISLGREQVPGA-RE-PR : .::.:::::::::::. :.::. ....::::::: ::: ::. . .: : CCDS55 VFYIPEDHKPGTFPKALTNGSFSPSGNNGSVNWRTGSFHGPGHISLRRENSSDSPKELKR 300 310 320 330 340 350 330 340 350 360 370 380 pF1KE2 LMASCHRASRVSIYDNVPGSHLYASTGDLLDLEKDDLFPHLDDILQHVNGLQEVVDDWSK .: .::.::::::::: ::.:.::: :::..:.::.::::: ::.:.:..:..::. CCDS55 RNSSSSMSSRLSIYDNVPGSILYSSSGDLADLENEDIFPELDDILYHVKGMQRIVNQWSE 360 370 380 390 400 410 390 400 410 420 430 440 pF1KE2 DVLPELQTHDTLVGEPGLSTFPS-PNQITLDFEGNSVSEGRTTPSDVERDVTSLNESEPP : .. ..: ..: :: :.:: :: :.. ::::::.. .:::: : : CCDS55 KFSDEGDSDSAL---DSVSPCPSSPKQIHLD-----VDNDRTTPSDLDSTGNSLNEPEEP 420 430 440 450 460 450 460 470 480 490 500 pF1KE2 G-VRDRRDSGVGASLTRPNR-RLRWNSFQLSHQPRPAPASPHISSQTASQLSLLQRFSLL . . .:::::::::::: :: ::::.::: ::.: .: .:. :...:..:::..::: CCDS55 SEIPERRDSGVGASLTRSNRHRLRWHSFQSSHRPSLNSVSLQINCQSVAQMNLLQKYSLL 470 480 490 500 510 520 510 520 530 540 550 560 pF1KE2 RLTAIMEKHSMSNKHGWTWSVPKFMKRMKVPDYKDKAVFGVPLIVHVQRTGQPLPQSIQQ .:::..::.. :::::..:.:::::::.:::::::..:::::: :.:::::::::::::: CCDS55 KLTALLEKYTPSNKHGFSWAVPKFMKRIKVPDYKDRSVFGVPLTVNVQRTGQPLPQSIQQ 530 540 550 560 570 580 570 580 590 600 610 620 pF1KE2 ALRYLRSNCLDQVGLFRKSGVKSRIHALRQMNENFPENVNYEDQSAYDVADMVKQFFRDL :.::::..:::::::::::::::::.:::::::. . :::: :::::::::.::.:::: CCDS55 AMRYLRNHCLDQVGLFRKSGVKSRIQALRQMNEGAIDCVNYEGQSAYDVADMLKQYFRDL 590 600 610 620 630 640 630 640 650 660 670 680 pF1KE2 PEPLFTNKLSETFLHIYQYVSKEQRLQAVQAAILLLADENREVLQTLLCFLNDVVNLVEE ::::.:::::::::.::::: :.:::::..:::.:: ::::::::::: ::.::. :.: CCDS55 PEPLMTNKLSETFLQIYQYVPKDQRLQAIKAAIMLLPDENREVLQTLLYFLSDVTAAVKE 650 660 670 680 690 700 690 700 710 720 730 740 pF1KE2 NQMTPMNLAVCLAPSLFHLNLLKKE-SSPRVIQKKYATGKPDQKDLNENLAAAQGLAHMI ::::: :::::::::::::: ::.: :::::.:.: . ::::::::::::::.::::::: CCDS55 NQMTPTNLAVCLAPSLFHLNTLKRENSSPRVMQRKQSLGKPDQKDLNENLAATQGLAHMI 710 720 730 740 750 760 750 760 770 780 790 800 pF1KE2 MECDRLFEVPHELVAQSRNSYVEAEIHVPTLEELGTQLEESGATFHTYLNHLIQGLQKEA :: .::.::.:. .. ::::.: :.. ::: :: ....: .. .:. ..:: ::. CCDS55 AECKKLFQVPEEM-SRCRNSYTEQELKPLTLEALGHLGNDDSADYQHFLQDCVDGLFKEV 770 780 790 800 810 820 810 820 830 840 850 860 pF1KE2 KEKFKGWVTCSSTDNTDLAFKKVGDGNPLKLWKASVEVEAPPSVVLNRVLRERHLWDEDF ::::::::. :......:..:::..: ::.::.. .:: : : .:.:.:.:.:::: :. CCDS55 KEKFKGWVSYSTSEQAELSYKKVSEGPPLRLWRSVIEVPAVPEEILKRLLKEQHLWDVDL 830 840 850 860 870 880 870 880 890 900 910 920 pF1KE2 VQWKVVETLDRQTEIYQYVLNSMAPHPSRDFVVLRTWKTDLPKGMCTLVSLSVEHEEAQL .. ::.: :: :::::::: :::::::.::.::::::.:.:::: :.:. ::.:..: . CCDS55 LDSKVIEILDSQTEIYQYVQNSMAPHPARDYVVLRTWRTNLPKGACALLLTSVDHDRAPV 890 900 910 920 930 940 930 940 950 960 970 980 pF1KE2 LGGVRAVVMDSQYLIEPCGSGKSRLTHICRIDLKGHSPEWYSKGFGHLCAAEVARIRNSF .: ::. :. :.::::::: :::.::..::.::.:: ::::.:.:::::::::..::.:: CCDS55 VG-VRVNVLLSRYLIEPCGPGKSKLTYMCRVDLRGHMPEWYTKSFGHLCAAEVVKIRDSF 950 960 970 980 990 1000 990 pF1KE2 QPLIAEGPETKI . .: .:: CCDS55 SNQNTETKDTKSR 1010 >>CCDS5990.1 DLC1 gene_id:10395|Hs108|chr8 (1091 aa) initn: 2933 init1: 1828 opt: 3237 Z-score: 2947.4 bits: 557.0 E(32554): 7.5e-158 Smith-Waterman score: 3454; 54.2% identity (78.5% similar) in 1031 aa overlap (1-994:75-1089) 10 20 pF1KE2 MKLDVNFQRKKGDDSDEEDLC-ISNKWTFQ :::... .::..:::::.. : ::.::::: CCDS59 SLVKREHDFLDRDAIEALCRRLNTLNKCAVMKLEISPHRKRSDDSDEDEPCAISGKWTFQ 50 60 70 80 90 100 30 40 50 60 70 80 pF1KE2 RTSRRWSRVDDLYTLLPRGDR-NGSPGGTGMRNTTSSESVLTDLSE-PEVCSIHSESSGG : :.::::.... .. :. : ::: . .. : ..: :::: :: :..: :: : CCDS59 RDSKRWSRLEEFDVFSPKQDLVPGSPDDSHPKDGPSPGGTLMDLSERQEVSSVRSLSSTG 110 120 130 140 150 160 90 100 110 120 130 pF1KE2 S-DSRSQPGQ-------------CCTDNPVMLDAPLVSSSLPQPPRDVLNHPFHPK-NEK : :.. :.. : ..: . : . .:::.: ... . : : .:: CCDS59 SLPSHAPPSEDAATPRTNSVISVCSSSNLAGNDDSF--GSLPSP-KELSSFSFSMKGHEK 170 180 190 200 210 220 140 150 160 170 180 pF1KE2 PTRARAKSFLKRMETLRGKGAH-GRHKGSGRTGGLVISGPMLQQ--EPESFKAMQCIQIP ......:.:::::.:. :..: ..::. .. : :.::::.::. . :..: ..:..: CCDS59 TAKSKTRSLLKRMESLKLKSSHHSKHKAPSKLG-LIISGPILQEGMDEEKLKQLNCVEIS 230 240 250 260 270 280 190 200 210 220 230 240 pF1KE2 --NGDLQNSPPPACRKGLPCSGKSSGESSPSEHSSSGVSTPC--LKERKCHEANKRGGMY ::. : : . .... : ..:. :: :: .::.:::: . :. ::: ::: CCDS59 ALNGNRINVPM-VRKRSVSNSTQTSSSSSQSE-TSSAVSTPSPVTRTRSLSACNKRVGMY 290 300 310 320 330 250 260 270 280 290 300 pF1KE2 LEDLDVLAGTALPDAGDQSRMHEFHSQENLVVHIPKDHKPGTFPKALSIESLSPTDSSNG :: .: . ... .. .:. .. :. : .::.:::::::::::. :.::. .... CCDS59 LEGFDPFNQSTFNNVVEQNFKNRESYPEDTVFYIPEDHKPGTFPKALTNGSFSPSGNNGS 340 350 360 370 380 390 310 320 330 340 350 pF1KE2 VNWRTGS------ISLGREQVPGA-RE-PRLMASCHRASRVSIYDNVPGSHLYASTGDLL ::::::: ::: ::. . .: : .: .::.::::::::: ::.:.::: CCDS59 VNWRTGSFHGPGHISLRRENSSDSPKELKRRNSSSSMSSRLSIYDNVPGSILYSSSGDLA 400 410 420 430 440 450 360 370 380 390 400 410 pF1KE2 DLEKDDLFPHLDDILQHVNGLQEVVDDWSKDVLPELQTHDTLVGEPGLSTFPS-PNQITL :::..:.::.::::: ::.:.:..:..::. : .. ..: ..: :: :.:: : CCDS59 DLENEDIFPELDDILYHVKGMQRIVNQWSEKFSDEGDSDSAL---DSVSPCPSSPKQIHL 460 470 480 490 500 510 420 430 440 450 460 470 pF1KE2 DFEGNSVSEGRTTPSDVERDVTSLNESEPPG-VRDRRDSGVGASLTRPNR-RLRWNSFQL : :.. ::::::.. .:::: : :. . .:::::::::::: :: ::::.::: CCDS59 D-----VDNDRTTPSDLDSTGNSLNEPEEPSEIPERRDSGVGASLTRSNRHRLRWHSFQS 520 530 540 550 560 570 480 490 500 510 520 530 pF1KE2 SHQPRPAPASPHISSQTASQLSLLQRFSLLRLTAIMEKHSMSNKHGWTWSVPKFMKRMKV ::.: .: .:. :...:..:::..:::.:::..::.. :::::..:.:::::::.:: CCDS59 SHRPSLNSVSLQINCQSVAQMNLLQKYSLLKLTALLEKYTPSNKHGFSWAVPKFMKRIKV 580 590 600 610 620 630 540 550 560 570 580 590 pF1KE2 PDYKDKAVFGVPLIVHVQRTGQPLPQSIQQALRYLRSNCLDQVGLFRKSGVKSRIHALRQ :::::..:::::: :.:::::::::::::::.::::..:::::::::::::::::.:::: CCDS59 PDYKDRSVFGVPLTVNVQRTGQPLPQSIQQAMRYLRNHCLDQVGLFRKSGVKSRIQALRQ 640 650 660 670 680 690 600 610 620 630 640 650 pF1KE2 MNENFPENVNYEDQSAYDVADMVKQFFRDLPEPLFTNKLSETFLHIYQYVSKEQRLQAVQ :::. . :::: :::::::::.::.::::::::.:::::::::.::::: :.:::::.. CCDS59 MNEGAIDCVNYEGQSAYDVADMLKQYFRDLPEPLMTNKLSETFLQIYQYVPKDQRLQAIK 700 710 720 730 740 750 660 670 680 690 700 710 pF1KE2 AAILLLADENREVLQTLLCFLNDVVNLVEENQMTPMNLAVCLAPSLFHLNLLKKE-SSPR :::.:: ::::::::::: ::.::. :.:::::: :::::::::::::: ::.: :::: CCDS59 AAIMLLPDENREVLQTLLYFLSDVTAAVKENQMTPTNLAVCLAPSLFHLNTLKRENSSPR 760 770 780 790 800 810 720 730 740 750 760 770 pF1KE2 VIQKKYATGKPDQKDLNENLAAAQGLAHMIMECDRLFEVPHELVAQSRNSYVEAEIHVPT :.:.: . ::::::::::::::.::::::: :: .::.::.:. .. ::::.: :.. : CCDS59 VMQRKQSLGKPDQKDLNENLAATQGLAHMIAECKKLFQVPEEM-SRCRNSYTEQELKPLT 820 830 840 850 860 780 790 800 810 820 830 pF1KE2 LEELGTQLEESGATFHTYLNHLIQGLQKEAKEKFKGWVTCSSTDNTDLAFKKVGDGNPLK :: :: ....: .. .:. ..:: ::.::::::::. :......:..:::..: ::. CCDS59 LEALGHLGNDDSADYQHFLQDCVDGLFKEVKEKFKGWVSYSTSEQAELSYKKVSEGPPLR 870 880 890 900 910 920 840 850 860 870 880 890 pF1KE2 LWKASVEVEAPPSVVLNRVLRERHLWDEDFVQWKVVETLDRQTEIYQYVLNSMAPHPSRD ::.. .:: : : .:.:.:.:.:::: :... ::.: :: :::::::: :::::::.:: CCDS59 LWRSVIEVPAVPEEILKRLLKEQHLWDVDLLDSKVIEILDSQTEIYQYVQNSMAPHPARD 930 940 950 960 970 980 900 910 920 930 940 950 pF1KE2 FVVLRTWKTDLPKGMCTLVSLSVEHEEAQLLGGVRAVVMDSQYLIEPCGSGKSRLTHICR .::::::.:.:::: :.:. ::.:..: ..: ::. :. :.::::::: :::.::..:: CCDS59 YVVLRTWRTNLPKGACALLLTSVDHDRAPVVG-VRVNVLLSRYLIEPCGPGKSKLTYMCR 990 1000 1010 1020 1030 1040 960 970 980 990 pF1KE2 IDLKGHSPEWYSKGFGHLCAAEVARIRNSFQPLIAEGPETKI .::.:: ::::.:.:::::::::..::.::. .: .:: CCDS59 VDLRGHMPEWYTKSFGHLCAAEVVKIRDSFSNQNTETKDTKSR 1050 1060 1070 1080 1090 >>CCDS83253.1 DLC1 gene_id:10395|Hs108|chr8 (1125 aa) initn: 3243 init1: 1828 opt: 3237 Z-score: 2947.2 bits: 557.0 E(32554): 7.7e-158 Smith-Waterman score: 3454; 54.2% identity (78.5% similar) in 1031 aa overlap (1-994:109-1123) 10 20 pF1KE2 MKLDVNFQRKKGDDSDEEDLC-ISNKWTFQ :::... .::..:::::.. : ::.::::: CCDS83 SLVKREHDFLDRDAIEALCRRLNTLNKCAVMKLEISPHRKRSDDSDEDEPCAISGKWTFQ 80 90 100 110 120 130 30 40 50 60 70 80 pF1KE2 RTSRRWSRVDDLYTLLPRGDR-NGSPGGTGMRNTTSSESVLTDLSE-PEVCSIHSESSGG : :.::::.... .. :. : ::: . .. : ..: :::: :: :..: :: : CCDS83 RDSKRWSRLEEFDVFSPKQDLVPGSPDDSHPKDGPSPGGTLMDLSERQEVSSVRSLSSTG 140 150 160 170 180 190 90 100 110 120 130 pF1KE2 S-DSRSQPGQ-------------CCTDNPVMLDAPLVSSSLPQPPRDVLNHPFHPK-NEK : :.. :.. : ..: . : . .:::.: ... . : : .:: CCDS83 SLPSHAPPSEDAATPRTNSVISVCSSSNLAGNDDSF--GSLPSP-KELSSFSFSMKGHEK 200 210 220 230 240 250 140 150 160 170 180 pF1KE2 PTRARAKSFLKRMETLRGKGAH-GRHKGSGRTGGLVISGPMLQQ--EPESFKAMQCIQIP ......:.:::::.:. :..: ..::. .. : :.::::.::. . :..: ..:..: CCDS83 TAKSKTRSLLKRMESLKLKSSHHSKHKAPSKLG-LIISGPILQEGMDEEKLKQLNCVEIS 260 270 280 290 300 310 190 200 210 220 230 240 pF1KE2 --NGDLQNSPPPACRKGLPCSGKSSGESSPSEHSSSGVSTPC--LKERKCHEANKRGGMY ::. : : . .... : ..:. :: :: .::.:::: . :. ::: ::: CCDS83 ALNGNRINVPM-VRKRSVSNSTQTSSSSSQSE-TSSAVSTPSPVTRTRSLSACNKRVGMY 320 330 340 350 360 370 250 260 270 280 290 300 pF1KE2 LEDLDVLAGTALPDAGDQSRMHEFHSQENLVVHIPKDHKPGTFPKALSIESLSPTDSSNG :: .: . ... .. .:. .. :. : .::.:::::::::::. :.::. .... 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CCDS59 LEALGHLGNDDSADYQHFLQDCVDGLFKEVKEKFKGWVSYSTSEQAELSYKKVSEGPPLR 1310 1320 1330 1340 1350 1360 840 850 860 870 880 890 pF1KE2 LWKASVEVEAPPSVVLNRVLRERHLWDEDFVQWKVVETLDRQTEIYQYVLNSMAPHPSRD ::.. .:: : : .:.:.:.:.:::: :... ::.: :: :::::::: :::::::.:: CCDS59 LWRSVIEVPAVPEEILKRLLKEQHLWDVDLLDSKVIEILDSQTEIYQYVQNSMAPHPARD 1370 1380 1390 1400 1410 1420 900 910 920 930 940 950 pF1KE2 FVVLRTWKTDLPKGMCTLVSLSVEHEEAQLLGGVRAVVMDSQYLIEPCGSGKSRLTHICR .::::::.:.:::: :.:. ::.:..: ..: ::. :. :.::::::: :::.::..:: CCDS59 YVVLRTWRTNLPKGACALLLTSVDHDRAPVVG-VRVNVLLSRYLIEPCGPGKSKLTYMCR 1430 1440 1450 1460 1470 1480 960 970 980 990 pF1KE2 IDLKGHSPEWYSKGFGHLCAAEVARIRNSFQPLIAEGPETKI .::.:: ::::.:.:::::::::..::.::. .: .:: CCDS59 VDLRGHMPEWYTKSFGHLCAAEVVKIRDSFSNQNTETKDTKSR 1490 1500 1510 1520 >>CCDS14390.1 STARD8 gene_id:9754|Hs108|chrX (1023 aa) initn: 2617 init1: 1252 opt: 2302 Z-score: 2096.8 bits: 399.5 E(32554): 1.8e-110 Smith-Waterman score: 2616; 44.4% identity (63.4% similar) in 1096 aa overlap (1-995:9-1023) 10 20 30 40 50 pF1KE2 MKLDVNFQRKKGDDSDEEDLC-ISNKWTFQRTSRRWSRVDDLYTLLPRGDRN :::.:.:: :...::.::. : ::..:.::. :. :: : :. . 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CCDS14 YRAKNWAATSAGGSGANTRK--AWEAWPVAS--FRHPQWTHRGDCLVHVPGDHKPGTFPR 180 190 200 210 220 230 300 310 320 330 340 pF1KE2 ALSIESLSPTDSSNGVNWRTGSISLGREQVPGAREPRLMASC-HRASRVSIYDNVPGSHL .:::::: : :. ..:. : : : : .:: .:..: :::.: .: CCDS14 SLSIESLCPEDGHRLADWQPGR----RWGCEGRR-----GSCGSTGSHASTYDNLP--EL 240 250 260 270 280 350 360 370 380 390 pF1KE2 Y--------ASTGDLLDLEKDDLFPHLDDILQHVNGLQEVVDDWSKDVLPELQTHD---- : : . : : :. . ::::::::: :::. :. ::. . :.: : CCDS14 YPAEPVMVGAEAEDEDDEESGGSYAHLDDILQHVWGLQQRVELWSRAMYPDLGPGDEEEE 290 300 310 320 330 340 400 pF1KE2 ---TLV----------------------GE------------------------------ . : :: CCDS14 EATSSVEIATVEVKCQAEALSQMEVPAHGESPAWAQAEVQPAVLAPAQAPAEAEPVAQEE 350 360 370 380 390 400 410 420 430 440 pF1KE2 ---PGLSTFPSPNQITLD---------F-------EGNSVSEGRTTPSDVERDVTSLNES :. . :.: : . . : ::.:.:. .. :... . .:.::. CCDS14 AEAPAPAPAPAPAQDSEQEAHSGGEPTFASSLSVEEGHSISDTVASSSELDSSGNSMNEA 410 420 430 440 450 460 450 460 470 480 490 pF1KE2 EPPGV---------RDRRDSGVGASLTRPNRRLRWNSFQLSHQPRPAPASPHISSQTASQ : : :.::::::::::::: :.:::.::: ::.: : .:. : :.: CCDS14 EAAGPLAGLQASMPRERRDSGVGASLTRPCRKLRWHSFQNSHRPSLNSESLEINRQFAGQ 470 480 490 500 510 520 500 510 520 530 540 550 pF1KE2 LSLLQRFSLLRLTAIMEKHSMSNKHGWTWSVPKFMKRMKVPDYKDKAVFGVPLIVHVQRT ..::.. :::::::.:::... .:.::.::.::::.: :.:::. . ::::: ..::::: CCDS14 INLLHKGSLLRLTAFMEKYTVPHKQGWVWSMPKFMRRNKTPDYRGQHVFGVPPLIHVQRT 530 540 550 560 570 580 560 570 580 590 600 610 pF1KE2 GQPLPQSIQQALRYLRSNCLDQVGLFRKSGVKSRIHALRQMNENFPENVNYEDQSAYDVA :::::::::::.:::::.::::::.::::::::::. ::::::. :.:: :: ::::::: CCDS14 GQPLPQSIQQAMRYLRSQCLDQVGIFRKSGVKSRIQNLRQMNETSPDNVCYEGQSAYDVA 590 600 610 620 630 640 620 630 640 650 660 670 pF1KE2 DMVKQFFRDLPEPLFTNKLSETFLHIYQYVSKEQRLQAVQAAILLLADENREVLQTLLCF :..::.:::::::.::.::. :::.::: . :.: : :.::: ::: ::::::::::: : CCDS14 DLLKQYFRDLPEPIFTSKLTTTFLQIYQLLPKDQWLAAAQAATLLLPDENREVLQTLLYF 650 660 670 680 690 700 680 690 700 710 720 730 pF1KE2 LNDVVNLVEENQMTPMNLAVCLAPSLFHLNLLKKES-SPRVIQKKYATGKPDQKDLNENL :.:... .:::::: :::::::::.::::. ::.: :::. .:. :.: .::..:. CCDS14 LSDIAS-AEENQMTAGNLAVCLAPSIFHLNVSKKDSPSPRIKSKRSLIGRPGPRDLSDNM 710 720 730 740 750 760 740 750 760 770 780 790 pF1KE2 AAAQGLAHMIMECDRLFEVPHELVAQSRNSYVEAEIHVP--TLEELGTQLEESGATFHTY ::.:::.::: .: .::.::...: : .:: ::. : .: :: : . .:... : CCDS14 AATQGLSHMISDCKKLFQVPQDMVLQLCSSYSAAELSPPGPALAEL-RQAQAAGVSLSLY 770 780 790 800 810 800 810 820 830 840 850 pF1KE2 LNHLIQGLQKEAKEKFKGWVTCSSTDNTDLAFKKVGDGNPLKLWKASVEVEAPPSVVLNR ... :: : ..: :.::::.. . ..:.:: .:. ::.::.:::::.:: :::.:::.: CCDS14 MEENIQDLLRDAAERFKGWMSVPGPQHTELACRKAPDGHPLRLWKASTEVAAPPAVVLHR 820 830 840 850 860 870 860 870 880 890 900 910 pF1KE2 VLRERHLWDEDFVQWKVVETLDRQTEIYQYVLNSMAPHPSRDFVVLRTWKTDLPKGMCTL ::::: :::::... .:.:.: .:.:.:: .:::::: ::::::: :..:::.: : : CCDS14 VLRERALWDEDLLRAQVLEALMPGVELYHYVTDSMAPHPCRDFVVLRMWRSDLPRGGCLL 880 890 900 910 920 930 920 930 940 950 960 970 pF1KE2 VSLSVEHEEAQLLGGVRAVVMDSQYLIEPCGSGKSRLTHICRIDLKGHSPEWYSKGFGHL :: :.. :. .::::... ::::.:::: :.:::::::: ::.:.::.::.: :::: CCDS14 VSQSLDPEQPVPESGVRALMLTSQYLMEPCGLGRSRLTHICRADLRGRSPDWYNKVFGHL 940 950 960 970 980 990 980 990 pF1KE2 CAAEVARIRNSFQPLIAEGPETKI :: :::.::.:: : : :::::. CCDS14 CAMEVAKIRDSFPTLQAAGPETKL 1000 1010 1020 >>CCDS48134.1 STARD8 gene_id:9754|Hs108|chrX (1103 aa) initn: 2617 init1: 1252 opt: 2302 Z-score: 2096.3 bits: 399.5 E(32554): 1.9e-110 Smith-Waterman score: 2616; 44.4% identity (63.4% similar) in 1096 aa overlap (1-995:89-1103) 10 20 pF1KE2 MKLDVNFQRKKGDDSDEEDLC-ISNKWTFQ :::.:.:: :...::.::. : ::..:.:: CCDS48 GSVKKNHGFLDEDSLGALCRRLMTLNNCASMKLEVHFQSKQNEDSEEEEQCTISSHWAFQ 60 70 80 90 100 110 30 40 50 60 70 80 pF1KE2 RTSRRWSRVDDLYTLLPRGDRNG-SPGGTGMRNTTSSESVLTDLSEPEVCSIHSESSGGS . :. :: : :. . .: . :. :.: :::::.:: . : CCDS48 QESKCWS---------PMGSSDLLAPPSPGLPATSSCESVLTELSATSLPVITVSLPPEP 120 130 140 150 160 90 100 110 120 130 140 pF1KE2 DSRSQPGQCCTDNPVMLDAPLVSSSLPQPPRDVLNHPFHPKNEKPTRARAKSFLKRMETL . ::. : : ::.: . : :... : : .::::..:.: CCDS48 ADLPLPGRA----PSSSDRPLLSPTQGQEG---------PQDKAKKRHRNRSFLKHLESL 170 180 190 200 210 150 160 170 180 190 200 pF1KE2 RGKGAHGRHKGSGRTGGLVISGPMLQQEPESFKAMQCIQIPNGDLQNSPPPACRKGLPCS : :.. :: : :: ..:: : CCDS48 R------RKEKSGSQ----------QAEP----------------KHSPAT--------S 220 230 210 220 230 240 250 260 pF1KE2 GKSSGESSPSEHSSSGVSTPCLKERKCHEANKRGGMYLEDLDVLAGTALPDAGDQSRMHE : : : : .: : . . . : :.. :: . : : : :. : . CCDS48 EKVSKAS--SFRSCRGFLSAGFYRAKNWAATSAGGSGANTRK--AWEAWPVAS--FRHPQ 240 250 260 270 280 290 270 280 290 300 310 320 pF1KE2 FHSQENLVVHIPKDHKPGTFPKALSIESLSPTDSSNGVNWRTGSISLGREQVPGAREPRL . . . .::.: ::::::::..:::::: : :. ..:. : : : : CCDS48 WTHRGDCLVHVPGDHKPGTFPRSLSIESLCPEDGHRLADWQPGR----RWGCEGRR---- 300 310 320 330 340 330 340 350 360 370 pF1KE2 MASC-HRASRVSIYDNVPGSHLY--------ASTGDLLDLEKDDLFPHLDDILQHVNGLQ .:: .:..: :::.: .:: : . : : :. . ::::::::: ::: CCDS48 -GSCGSTGSHASTYDNLP--ELYPAEPVMVGAEAEDEDDEESGGSYAHLDDILQHVWGLQ 350 360 370 380 390 380 390 400 pF1KE2 EVVDDWSKDVLPELQTHD-------TLV----------------------GE-------- . :. ::. . :.: : . : :: CCDS48 QRVELWSRAMYPDLGPGDEEEEEATSSVEIATVEVKCQAEALSQMEVPAHGESPAWAQAE 400 410 420 430 440 450 410 420 pF1KE2 -------------------------PGLSTFPSPNQITLD---------F-------EGN :. . :.: : . . : ::. 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CCDS48 HICRADLRGRSPDWYNKVFGHLCAMEVAKIRDSFPTLQAAGPETKL 1060 1070 1080 1090 1100 >>CCDS34535.1 ARHGAP18 gene_id:93663|Hs108|chr6 (663 aa) initn: 300 init1: 266 opt: 347 Z-score: 320.1 bits: 70.1 E(32554): 1.7e-11 Smith-Waterman score: 366; 26.5% identity (60.5% similar) in 370 aa overlap (417-766:206-539) 390 400 410 420 430 pF1KE2 KDVLPELQTHDTLVGEPGLSTFPSPNQITLDFEGNSVSEGRTTP--------SDVERDVT : .: :.: . : .:.. .:. CCDS34 AQQRESKETAPGGTESQSLRTNENKYQGRDDEASNLVGEEKLIPPEETPAPETDINLEVS 180 190 200 210 220 230 440 450 460 470 480 490 pF1KE2 ----SLNESEPPGVRDRRDSGVGASLTRPNRRLRWNSFQLSHQPRPAPASPHISSQTASQ .::..: . ....: :.: :. :: :. .. .:.. . .. CCDS34 FAEQALNQKESSKEKIQKSKGDDATL--PSFRL----------PKDKTGTTRIGDLAPQD 240 250 260 270 280 500 510 520 530 540 550 pF1KE2 LSLLQRFSLLRLTAIMEKHSMSNKHGWTWSVPKFMKRMKVPDYKDKAVFGVPLIVHV--- .. . ...:..:::... .. :. .: .:. ::...: ::: . . CCDS34 MKKVCHLALIELTALYDVLGIELKQ---------QKAVKIKT-KDSGLFCVPLTALLEQD 290 300 310 320 330 560 570 580 590 600 pF1KE2 QRT--GQPLPQSIQQALRYLRSNCLDQVGLFRKSGVKSRIHALRQ-MNENFPENV-NYED :: :. .: .:. . .. :. ::.: :. ::. : : .. .: :.. :.:. CCDS34 QRKVPGMRIPLIFQKLISRIEERGLETEGLLRIPGAAIRIKNLCQELEAKFYEGTFNWES 340 350 360 370 380 390 610 620 630 640 650 660 pF1KE2 QSAYDVADMVKQFFRDLPEPLFTNKLSETFLHIYQYVSKEQRLQAVQAAILLLADENREV . .:.:...: :.:.::.::.. . ..: . . .:.:.:::.. ..:: : ::.. CCDS34 VKQHDAASLLKLFIRELPQPLLSVEYLKAFQAVQNLPTKKQQLQALNLLVILLPDANRDT 400 410 420 430 440 450 670 680 690 700 710 720 pF1KE2 LQTLLCFLNDVVNLVEENQMTPMNLAVCLAPSLFHLNLLKKESSPRVIQKKYATGKPDQK :..:: ::. :.. :.:.:: ::.:. .::.:: . : .:: :.... . 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