Result of FASTA (ccds) for
pFN21AB9558
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB9558, 683 aa
1>>>pF1KB9558 683 - 683 aa - 683 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.0879+/-0.00108; mu= 14.4390+/- 0.065
mean_var=236.2922+/-44.380, 0's: 0 Z-trim(113.6): 953 B-trim: 0 in 0/53
Lambda= 0.083435
statistics sampled from 13185 (14212) to 13185 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.757), E-opt: 0.2 (0.437), width: 16
Scan time: 4.130
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS10499.1 ZNF263 gene_id:10127|Hs108|chr16 ( 683) 4839 596.0 5.7e-170
CCDS10329.2 ZSCAN2 gene_id:54993|Hs108|chr15 ( 614) 1284 168.0 3.5e-41
CCDS12501.1 ZNF383 gene_id:163087|Hs108|chr19 ( 475) 1242 162.8 1e-39
CCDS45463.1 ZNF629 gene_id:23361|Hs108|chr16 ( 869) 1241 163.1 1.6e-39
CCDS233.1 ZNF436 gene_id:80818|Hs108|chr1 ( 470) 1224 160.7 4.5e-39
CCDS12959.2 ZNF551 gene_id:90233|Hs108|chr19 ( 670) 1199 157.9 4.5e-38
CCDS74472.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 616) 1198 157.7 4.6e-38
CCDS74471.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 658) 1198 157.7 4.8e-38
CCDS12970.2 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 670) 1198 157.7 4.9e-38
CCDS54329.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 682) 1198 157.8 4.9e-38
CCDS31940.1 ZNF84 gene_id:7637|Hs108|chr12 ( 738) 1195 157.4 6.6e-38
CCDS6437.1 ZNF16 gene_id:7564|Hs108|chr8 ( 682) 1194 157.3 6.9e-38
CCDS4440.1 ZFP2 gene_id:80108|Hs108|chr5 ( 461) 1190 156.6 7.6e-38
CCDS69562.1 ZNF34 gene_id:80778|Hs108|chr8 ( 539) 1188 156.4 9.8e-38
CCDS47945.1 ZNF34 gene_id:80778|Hs108|chr8 ( 560) 1188 156.4 1e-37
CCDS11179.2 ZNF287 gene_id:57336|Hs108|chr17 ( 761) 1187 156.5 1.3e-37
CCDS55282.1 ZNF250 gene_id:58500|Hs108|chr8 ( 555) 1183 155.8 1.5e-37
CCDS34972.1 ZNF250 gene_id:58500|Hs108|chr8 ( 560) 1183 155.8 1.5e-37
CCDS4624.1 ZNF184 gene_id:7738|Hs108|chr6 ( 751) 1181 155.8 2.1e-37
CCDS56105.1 ZNF835 gene_id:90485|Hs108|chr19 ( 537) 1178 155.2 2.3e-37
CCDS33090.1 ZNF616 gene_id:90317|Hs108|chr19 ( 781) 1176 155.2 3.3e-37
CCDS76895.1 ZNF23 gene_id:7571|Hs108|chr16 ( 585) 1169 154.2 5e-37
CCDS10900.1 ZNF23 gene_id:7571|Hs108|chr16 ( 643) 1169 154.2 5.3e-37
CCDS47352.1 ZNF879 gene_id:345462|Hs108|chr5 ( 563) 1168 154.0 5.4e-37
CCDS58688.1 ZNF211 gene_id:10520|Hs108|chr19 ( 503) 1166 153.7 5.9e-37
CCDS58687.1 ZNF211 gene_id:10520|Hs108|chr19 ( 555) 1166 153.8 6.3e-37
CCDS12957.1 ZNF211 gene_id:10520|Hs108|chr19 ( 564) 1166 153.8 6.3e-37
CCDS12956.1 ZNF211 gene_id:10520|Hs108|chr19 ( 577) 1166 153.8 6.4e-37
CCDS74468.1 ZNF211 gene_id:10520|Hs108|chr19 ( 616) 1166 153.8 6.7e-37
CCDS58686.1 ZNF211 gene_id:10520|Hs108|chr19 ( 629) 1166 153.9 6.8e-37
CCDS12968.1 ZNF606 gene_id:80095|Hs108|chr19 ( 792) 1163 153.6 9.9e-37
CCDS12947.1 ZNF71 gene_id:58491|Hs108|chr19 ( 489) 1158 152.7 1.1e-36
CCDS12497.1 ZNF345 gene_id:25850|Hs108|chr19 ( 488) 1154 152.3 1.6e-36
CCDS46043.1 ZNF181 gene_id:339318|Hs108|chr19 ( 570) 1155 152.5 1.6e-36
CCDS32990.2 ZNF181 gene_id:339318|Hs108|chr19 ( 571) 1155 152.5 1.6e-36
CCDS12495.1 ZNF567 gene_id:163081|Hs108|chr19 ( 616) 1155 152.5 1.7e-36
CCDS6787.1 ZFP37 gene_id:7539|Hs108|chr9 ( 630) 1155 152.5 1.7e-36
CCDS65109.1 ZFP37 gene_id:7539|Hs108|chr9 ( 631) 1155 152.5 1.7e-36
CCDS65110.1 ZFP37 gene_id:7539|Hs108|chr9 ( 645) 1155 152.5 1.7e-36
CCDS74349.1 ZNF567 gene_id:163081|Hs108|chr19 ( 647) 1155 152.6 1.7e-36
CCDS11180.1 ZNF624 gene_id:57547|Hs108|chr17 ( 865) 1152 152.4 2.6e-36
CCDS46169.1 ZNF665 gene_id:79788|Hs108|chr19 ( 678) 1150 152.0 2.7e-36
CCDS12504.1 ZNF570 gene_id:148268|Hs108|chr19 ( 536) 1148 151.6 2.8e-36
CCDS82409.1 ZNF418 gene_id:147686|Hs108|chr19 ( 591) 1148 151.7 2.9e-36
CCDS74355.1 ZNF570 gene_id:148268|Hs108|chr19 ( 592) 1148 151.7 2.9e-36
CCDS42642.1 ZNF418 gene_id:147686|Hs108|chr19 ( 676) 1148 151.7 3.2e-36
CCDS82410.1 ZNF418 gene_id:147686|Hs108|chr19 ( 697) 1148 151.8 3.2e-36
CCDS32440.1 ZNF267 gene_id:10308|Hs108|chr16 ( 743) 1147 151.7 3.6e-36
CCDS42537.1 ZNF429 gene_id:353088|Hs108|chr19 ( 674) 1145 151.4 4.1e-36
CCDS33091.1 ZNF528 gene_id:84436|Hs108|chr19 ( 628) 1139 150.6 6.4e-36
>>CCDS10499.1 ZNF263 gene_id:10127|Hs108|chr16 (683 aa)
initn: 4839 init1: 4839 opt: 4839 Z-score: 3164.9 bits: 596.0 E(32554): 5.7e-170
Smith-Waterman score: 4839; 100.0% identity (100.0% similar) in 683 aa overlap (1-683:1-683)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MASGPGSQEREGLLIVKLEEDCAWSQELPPPDPGPSPEASHLRFRRFRFQEAAGPREALS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 MASGPGSQEREGLLIVKLEEDCAWSQELPPPDPGPSPEASHLRFRRFRFQEAAGPREALS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 RLQELCHGWLRPEMRTKEQILELLVLEQFLTILPQEIQSRVQELHPESGEEAVTLVEDMQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 RLQELCHGWLRPEMRTKEQILELLVLEQFLTILPQEIQSRVQELHPESGEEAVTLVEDMQ
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 RELGRLRQQVTNHGRGTEVLLEEPLPLETARESPSFKLEPMETERSPGPRLQELLGPSPQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 RELGRLRQQVTNHGRGTEVLLEEPLPLETARESPSFKLEPMETERSPGPRLQELLGPSPQ
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB9 RDPQAVKERALSAPWLSLFPPEGNMEDKEMTGPQLPESLEDVAMYISQEEWGHQDPSKRA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 RDPQAVKERALSAPWLSLFPPEGNMEDKEMTGPQLPESLEDVAMYISQEEWGHQDPSKRA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB9 LSRDTVQESYENVDSLESHIPSQEVPGTQVGQGGKLWDPSVQSCKEGLSPRGPAPGEEKF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 LSRDTVQESYENVDSLESHIPSQEVPGTQVGQGGKLWDPSVQSCKEGLSPRGPAPGEEKF
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 ENLEGVPSVCSENIHPQVLLPDQARGEVPWSPELGRPHDRSQGDWAPPPEGGMEQALAGA
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB9 SSGRELGRPKELQPKKLHLCPLCGKNFSNNSNLIRHQRIHAAERLCMGVDCTEIFGGNPR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 SSGRELGRPKELQPKKLHLCPLCGKNFSNNSNLIRHQRIHAAERLCMGVDCTEIFGGNPR
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB9 FLSLHRAHLGEEAHKCLECGKCFSQNTHLTRHQRTHTGEKPYQCNICGKCFSCNSNLHRH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 FLSLHRAHLGEEAHKCLECGKCFSQNTHLTRHQRTHTGEKPYQCNICGKCFSCNSNLHRH
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB9 QRTHTGEKPYKCPECGEIFAHSSNLLRHQRIHTGERPYKCPECGKSFSRSSHLVIHERTH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 QRTHTGEKPYKCPECGEIFAHSSNLLRHQRIHTGERPYKCPECGKSFSRSSHLVIHERTH
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB9 ERERLYPFSECGEAVSDSTPFLTNHGAHKAEKKLFECLTCGKSFRQGMHLTRHQRTHTGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 ERERLYPFSECGEAVSDSTPFLTNHGAHKAEKKLFECLTCGKSFRQGMHLTRHQRTHTGE
550 560 570 580 590 600
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pF1KB9 KPYKCTLCGENFSHRSNLIRHQRIHTGEKPYTCHECGDSFSHSSNRIRHLRTHTGERPYK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 KPYKCTLCGENFSHRSNLIRHQRIHTGEKPYTCHECGDSFSHSSNRIRHLRTHTGERPYK
610 620 630 640 650 660
670 680
pF1KB9 CSECGESFSRSSRLMSHQRTHTG
:::::::::::::::::::::::
CCDS10 CSECGESFSRSSRLMSHQRTHTG
670 680
>>CCDS10329.2 ZSCAN2 gene_id:54993|Hs108|chr15 (614 aa)
initn: 739 init1: 739 opt: 1284 Z-score: 852.8 bits: 168.0 E(32554): 3.5e-41
Smith-Waterman score: 1328; 37.8% identity (59.8% similar) in 679 aa overlap (8-683:26-582)
10 20 30 40
pF1KB9 MASGPGSQEREGLLIVKLEEDCAWSQELPPPDPGPSPEASHL
::.: .. ::.: .: :: . :: :
CCDS10 MMAADIPRVTTPLSSLVQVPQEEDRQEEEVTTMI-LEDD-SWVQEAVLQEDGPESEPFPQ
10 20 30 40 50
50 60 70 80 90 100
pF1KB9 RFRRFRFQEAA--GPREALSRLQELCHGWLRPEMRTKEQILELLVLEQFLTILPQEIQSR
. :: . ::. ::.::.:::. :::::..::::.: :.::.:::.
CCDS10 SAGKGGPQEEVTRGPQGALGRLRELCRRWLRPEVHTKEQML---------TMLPKEIQAW
60 70 80 90 100
110 120 130 140 150 160
pF1KB9 VQELHPESGEEAVTLVEDMQRELGRLRQQVTNHGRGTEVLLEEPLPLETARESPSFKLEP
.:: .:::.:::..::::. . : .. .:...
CCDS10 LQEHRPESSEEAAALVEDLTQTL----------------------------QDSDFEIQ-
110 120 130 140
170 180 190 200 210 220
pF1KB9 METERSPGPRLQELLGPSPQRDPQAVKERALSAPWLSLFPPEGNMEDKEMTGPQLPESLE
.: : . ..: .: :. .:: ::.
CCDS10 --SEN----------GENCNQD---------------MFENESRKIFSEM-----PEG--
150 160
230 240 250 260 270 280
pF1KB9 DVAMYISQEEWGHQDPSKRALSRDTVQESYENVDSLESHIPSQEVPGTQVGQGGKLWDPS
: :.: .. . ::. ... :..: :... : :.: :
CCDS10 --------ESAQHSD-GESDFERDA------GIQRLQGHSPGED-HGEVVSQ-----DRE
170 180 190 200
290 300 310 320 330 340
pF1KB9 VQSCKEGLSPRGPAPGEEKFENLEGVPSVCSENIHPQVLLPDQARGEVPWSPELGRPHDR
: . :: .: ::. .: :. :.... . : . : . :. . .
CCDS10 VGQLI-GL--QGTYLGEKPYE----CPQ-CGKTFSRKSHLITHER------THTGEKYYK
210 220 230 240 250
350 360 370 380 390
pF1KB9 SQGDWAPPPEGGMEQALAGASSGRELGRPKELQP-KKLHLCPLCGKNFSNNSNLIRHQRI
. : : . :.: ...: . . .: . : :::.:: ..::: ::::
CCDS10 CD-------ECG-----KSFSDGSNFSRHQTTHTGEKPYKCRDCGKSFSRSANLITHQRI
260 270 280 290
400 410 420 430 440 450
pF1KB9 HAAERLCMGVDCTEIFGGNPRFLSLHRAHLGEEAHKCLECGKCFSQNTHLTRHQRTHTGE
:..:. . ..: . :. .: ... .:.: ::. ..: :::: :.. . :. :: ::::
CCDS10 HTGEKPFQCAECGKSFSRSPNLIAHQRTHTGEKPYSCPECGKSFGNRSSLNTHQGIHTGE
300 310 320 330 340 350
460 470 480 490 500 510
pF1KB9 KPYQCNICGKCFSCNSNLHRHQRTHTGEKPYKCPECGEIFAHSSNLLRHQRIHTGERPYK
:::.:. ::. :: :::: :::: ::::::::: .::. :..:: :. :.: ::::.::.
CCDS10 KPYECKECGESFSYNSNLIRHQRIHTGEKPYKCTDCGQRFSQSSALITHRRTHTGEKPYQ
360 370 380 390 400 410
520 530 540 550 560 570
pF1KB9 CPECGKSFSRSSHLVIHERTHERERLYPFSECGEAVSDSTPFLTNHGAHKAEKKLFECLT
: ::::::::::.:. :.::: :. : . ::.. :.:. .....: : .:: .::::
CCDS10 CSECGKSFSRSSNLATHRRTHMVEKPYKCGVCGKSFSQSSSLIAHQGMHTGEKP-YECLT
420 430 440 450 460 470
580 590 600 610 620 630
pF1KB9 CGKSFRQGMHLTRHQRTHTGEKPYKCTLCGENFSHRSNLIRHQRIHTGEKPYTCHECGDS
::.:: . .: .::: :::::::::. ::. ::.::.:. ::: ::::::: : :: :
CCDS10 CGESFSWSSNLLKHQRIHTGEKPYKCSECGKCFSQRSQLVVHQRTHTGEKPYKCLMCGKS
480 490 500 510 520 530
640 650 660 670 680
pF1KB9 FSHSSNRIRHLRTHTGERPYKCSECGESFSRSSRLMSHQRTHTG
::..: . : :.: :..::.: :::..:: .: :. ::: :::
CCDS10 FSRGSILVMHQRAHLGDKPYRCPECGKGFSWNSVLIIHQRIHTGEKPYKCPECGKGFSNS
540 550 560 570 580 590
CCDS10 SNFITHQRTHMKEKLY
600 610
>>CCDS12501.1 ZNF383 gene_id:163087|Hs108|chr19 (475 aa)
initn: 695 init1: 695 opt: 1242 Z-score: 826.6 bits: 162.8 E(32554): 1e-39
Smith-Waterman score: 1242; 42.6% identity (66.0% similar) in 476 aa overlap (221-682:10-473)
200 210 220 230 240 250
pF1KB9 LSAPWLSLFPPEGNMEDKEMTGPQLPESLEDVAMYISQEEWGHQDPSKRALSRDTVQESY
::.. .::::: :: .: : ::.. :.:
CCDS12 MAEGSVMFSDVSIDFSQEEWDCLDPVQRDLYRDVMLENY
10 20 30
260 270 280 290 300
pF1KB9 ENVDSLESHIPSQEVPGTQVGQGGKLWDPSVQSCKEGLSPRGPAPGEEKFENLEG-VPSV
:. :. . :. .: . . :: . : . . . :: . : :. .:. : .
CCDS12 GNLVSMGLYTPKPQVI-SLLEQGKEPWMVGRELTR-GLCSDLESMCETKLLSLKKEVYEI
40 50 60 70 80 90
310 320 330 340 350
pF1KB9 --CSENIHPQVL--LPDQARGEV-----PWSPELGRPHDR-SQGDWAPP--PEGGMEQAL
:...: . : .. :.: . .:: :. . :: ..: : .. :
CCDS12 ELCQREIMGLTKHGLEYSSFGDVLEYRSHLAKQLGYPNGHFSQEIFTPEYMPTFIQQTFL
100 110 120 130 140 150
360 370 380 390 400 410
pF1KB9 AGASSGRELGRPKELQPKKLHLCPLCGKNFSNNSNLIRHQRIHAAERLCMGVDCTEIFGG
. . . :: : : ::: ::.::..:.::::: .:. .: ..:.
CCDS12 TLHQIINNEDRPYE--------CKKCGKAFSQNSQFIQHQRIHIGEKSYECKECGKFFSC
160 170 180 190 200
420 430 440 450 460 470
pF1KB9 NPRFLSLHRAHLGEEAHKCLECGKCFSQNTHLTRHQRTHTGEKPYQCNICGKCFSCNSNL
. . . : ::. .: :::: :: ...:..::: :::.:::.:. ::: :: :::
CCDS12 GSHVTRHLKIHTGEKPFECKECGKAFSCSSYLSQHQRIHTGKKPYECKECGKAFSYCSNL
210 220 230 240 250 260
480 490 500 510 520 530
pF1KB9 HRHQRTHTGEKPYKCPECGEIFAHSSNLLRHQRIHTGERPYKCPECGKSFSRSSHLVIHE
::: :::::::.: ::. :..::.:..: ::::::.::.: ::::.:..::.:: :.
CCDS12 IDHQRIHTGEKPYECKVCGKAFTKSSQLFQHARIHTGEKPYECKECGKAFTQSSKLVQHQ
270 280 290 300 310 320
540 550 560 570 580 590
pF1KB9 RTHERERLYPFSECGEAVSDSTPFLTNHG-AHKAEKKLFECLTCGKSFRQGMHLTRHQRT
: : :. : .:::.: :... :::: : .:: ..: :::.: :. .: .:::
CCDS12 RIHTGEKPYECKECGKAFSSGSA-LTNHQRIHTGEKP-YDCKECGKAFTQSSQLRQHQRI
330 340 350 360 370 380
600 610 620 630 640 650
pF1KB9 HTGEKPYKCTLCGENFSHRSNLIRHQRIHTGEKPYTCHECGDSFSHSSNRIRHLRTHTGE
:.::::..: ::. :.. :.:..:::::: :::: :.::: .:.. :: :::: ::::
CCDS12 HAGEKPFECLECGKAFTQNSQLFQHQRIHTDEKPYECNECGKAFNKCSNLTRHLRIHTGE
390 400 410 420 430 440
660 670 680
pF1KB9 RPYKCSECGESFSRSSRLMSHQRTHTG
.::.:.:::..:: .: :. :: ::
CCDS12 KPYNCKECGKAFSSGSDLIRHQGIHTNK
450 460 470
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CCDS45 PECGKSFSQSSNLITHVRTHMDENLFVCSDCGKAFLEAHELEQHRVIHERGKTPARRAQG
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CCDS23 DLYRDVMQENYGNVVSLDFEIRSENEVNPKQEISE-------DVQ---FGTTSERPAENA
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CCDS23 GEKPYECEECGKSFSRSSHLAQHQRTHTGEKPYECNECGRGFSERSDLIKHYRVHTGERP
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CCDS23 KGFTQSSNLITHQRVHTGEKPYECTECEKSFSRSSALIKHKRVHTD
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CCDS12 RPYECSDREKAFIHKSEFIHHQRRHTGGVRHECGECRKTFSYKSNLIEHQRVHTGERPYE
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CCDS12 GKSFSCKSELIQHQRIHSGERPYECRECGKSFRQFSNLIRHRSIHTGDRPYECSECEKSF
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CCDS12 SGLIQHRRLHTGERPYECSECGKSFSQSASLIQHQRVHTGERPYECSECGKSFSQSSSLI
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CCDS12 QHQRGHTGERPYECSQCGKPFTHKSDLIQHQRVHTGERPYECSECGKSFSRKSNLIRHRR
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CCDS12 VHTEERP
670
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CCDS74 EKPDLNVLQKTCVKEK-------PYKCQEC--------GKAFSH---SSALIEHHRTHTG
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CCDS74 AFRQSTHLTQHQRIHTGEKPYECNDCGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQ
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CCDS74 LAPLIQHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQSSLLIEHQRIHTKEKPYGCNECGKSFSHSSSL
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CCDS74 SQHERTHTGEKPYECHDCGKSFRQSTHLTQHRRIHTGEKPYACRDCGKAFTHSSSLTKHQ
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CCDS74 MTPGVRVSTDPEQVTFEDVVVGFSQEEWGQLKPAQRTLYR
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CCDS74 LKQGI----SEEISNSVILVERFLWDGLWYCRGEDTEGHWEWSCESLESLAVPVAFTPVK
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CCDS74 TPVLEQWQRNGFGENISLNPDLPHQPMTPERQSPHTWGTRGKREKPDLNVLQKTCVKEKP
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CCDS74 YKCQECGKAFSHSSALIEHHRTHTGERPYECHECLKGFRNSSALTKHQRIHTGEKPYKCT
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CCDS74 QCGRTFNQIAPLIQHQRTHTGEKPYECSECGKSFSFRSSFSQHERTHTGEKPYECSECGK
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CCDS74 AFRQSIHLTQHLRIHTGEKPYQCGECGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECHECGKAFTQ
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CCDS74 ITPLIQHQRTHTGEKP-YECGECGKAFSQSTLLTEHRRIHTGEKPYGCNECGKTFSHSSS
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CCDS74 LSQHERTHTGEKPYECSQCGKAFRQSTHLTQHQRIHTGEKPYECNDCGKAFSHSSSLTKH
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CCDS74 QRIHTGEKPYECNQCGRAFSQLAPLIQHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQSSLLIEHQRIH
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>--
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CCDS74 TGEKPYECNDCGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQLAPLIQHQRIHTGEK
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CCDS74 PYECNQCGRAFSQSSLLIEHQRIHTKEKPYGCNECGKSFSHSSSLSQHERTHTGEKPY--
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550 560 570 580 590 600
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CCDS74 ---------------------------ECHDCGKSFRQSTHLTQHRRIHTGEKPYACRDC
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CCDS74 GKAFTHSSSLTKHQRTHTG
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CCDS12 MTPGVRVSTDPEQVTFEDVVVGFSQEEWGQLKPAQRTLYR
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CCDS12 DVMLDTFRLLVSVGHWLPKPNVI-SLLEQEAELW--AVESRLPQGVYPE--IKGHFQFLL
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:::.: :::. : .: .: .: ::::::.::.: ::::.::.:: :. :.: : :. :
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:::.: .. ::.. .. .: .:: .:: :::.: :. ::.:.: ::::::: :.
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]