Result of FASTA (omim) for pFN21AB8733
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB8733, 488 aa
  1>>>pF1KB8733 488 - 488 aa - 488 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
  60827320 residues in 85289 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.8387+/-0.000544; mu= -2.5416+/- 0.033
 mean_var=310.8356+/-64.144, 0's: 0 Z-trim(117.4): 275  B-trim: 1401 in 1/54
 Lambda= 0.072746
 statistics sampled from 28996 (29292) to 28996 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.7), E-opt: 0.2 (0.343), width:  16
 Scan time: 10.690

The best scores are:                                      opt bits E(85289)
NP_742013 (OMIM: 605700) E3 ubiquitin-protein liga ( 488) 3292 359.6 1.1e-98
NP_067076 (OMIM: 605700) E3 ubiquitin-protein liga ( 518) 1786 201.6 4.5e-51
NP_003132 (OMIM: 109092) E3 ubiquitin-protein liga ( 475) 1225 142.7 2.2e-33
NP_660215 (OMIM: 607868) E3 ubiquitin-protein liga ( 468) 1156 135.4 3.4e-31
XP_016857901 (OMIM: 607868) PREDICTED: E3 ubiquiti ( 467) 1149 134.7 5.6e-31
NP_060543 (OMIM: 613184) E3 ubiquitin-protein liga ( 485) 1133 133.0 1.8e-30
XP_011542511 (OMIM: 606123) PREDICTED: E3 ubiquiti ( 477) 1086 128.1 5.5e-29
XP_006711842 (OMIM: 606123) PREDICTED: E3 ubiquiti ( 477) 1086 128.1 5.5e-29
NP_001020111 (OMIM: 606123) E3 ubiquitin-protein l ( 477) 1086 128.1 5.5e-29
NP_057186 (OMIM: 606123) E3 ubiquitin-protein liga ( 477) 1086 128.1 5.5e-29
XP_011542512 (OMIM: 606123) PREDICTED: E3 ubiquiti ( 477) 1086 128.1 5.5e-29
XP_011542513 (OMIM: 606123) PREDICTED: E3 ubiquiti ( 450)  997 118.7 3.4e-26
NP_892030 (OMIM: 616017) E3 ubiquitin-protein liga ( 500)  934 112.1 3.6e-24
NP_291027 (OMIM: 610530) E3 ubiquitin-protein liga ( 630)  869 105.4 4.8e-22
NP_060677 (OMIM: 616755) E3 ubiquitin-protein liga ( 475)  862 104.6 6.6e-22
XP_016857118 (OMIM: 616755) PREDICTED: E3 ubiquiti ( 555)  861 104.5 7.9e-22
NP_001268380 (OMIM: 612548) E3 ubiquitin-protein l ( 487)  812 99.3 2.5e-20
NP_835226 (OMIM: 612548) E3 ubiquitin-protein liga ( 487)  812 99.3 2.5e-20
XP_011514091 (OMIM: 612548) PREDICTED: E3 ubiquiti ( 486)  808 98.9 3.4e-20
NP_001268379 (OMIM: 612548) E3 ubiquitin-protein l ( 486)  808 98.9 3.4e-20
XP_006714995 (OMIM: 610530) PREDICTED: E3 ubiquiti ( 520)  807 98.8 3.8e-20
XP_006714992 (OMIM: 610530) PREDICTED: E3 ubiquiti ( 543)  807 98.8   4e-20
NP_963921 (OMIM: 610530) E3 ubiquitin-protein liga ( 518)  788 96.8 1.5e-19
XP_006714993 (OMIM: 610530) PREDICTED: E3 ubiquiti ( 541)  788 96.9 1.6e-19
XP_006714994 (OMIM: 610530) PREDICTED: E3 ubiquiti ( 525)  784 96.4 2.1e-19
NP_001003818 (OMIM: 607564) tripartite motif-conta ( 516)  769 94.8 6.1e-19
NP_477514 (OMIM: 607564) tripartite motif-containi ( 488)  760 93.9 1.1e-18
NP_439893 (OMIM: 605701) tripartite motif-containi ( 395)  704 87.9 5.7e-17
NP_006769 (OMIM: 605701) tripartite motif-containi ( 481)  704 88.0 6.5e-17
NP_006065 (OMIM: 606559) E3 ubiquitin-protein liga ( 498)  690 86.5 1.8e-16
NP_065091 (OMIM: 606124) tripartite motif-containi ( 452)  689 86.4 1.9e-16
NP_067629 (OMIM: 605684) tripartite motif-containi ( 488)  684 85.9 2.8e-16
NP_001003827 (OMIM: 605684) tripartite motif-conta ( 488)  684 85.9 2.8e-16
NP_001186502 (OMIM: 606559) E3 ubiquitin-protein l ( 494)  671 84.5 7.3e-16
NP_741983 (OMIM: 617007) tripartite motif-containi ( 493)  670 84.4 7.9e-16
NP_542783 (OMIM: 616017) E3 ubiquitin-protein liga ( 341)  663 83.5   1e-15
XP_016878725 (OMIM: 134610,249100,608107) PREDICTE ( 780)  669 84.5 1.2e-15
XP_011512527 (OMIM: 605701) PREDICTED: tripartite  ( 413)  660 83.3 1.4e-15
NP_001128327 (OMIM: 606123) E3 ubiquitin-protein l ( 343)  658 83.0 1.5e-15
NP_000234 (OMIM: 134610,249100,608107) pyrin isofo ( 781)  666 84.2 1.5e-15
NP_001008275 (OMIM: 613288) tripartite motif-conta ( 477)  661 83.5 1.5e-15
XP_011512525 (OMIM: 605701) PREDICTED: tripartite  ( 499)  660 83.4 1.6e-15
XP_011512523 (OMIM: 605701) PREDICTED: tripartite  ( 499)  660 83.4 1.6e-15
XP_011512524 (OMIM: 605701) PREDICTED: tripartite  ( 499)  660 83.4 1.6e-15
NP_001291425 (OMIM: 613184) E3 ubiquitin-protein l ( 262)  650 82.1 2.1e-15
XP_005253240 (OMIM: 608487) PREDICTED: tripartite  ( 493)  656 83.0 2.2e-15
NP_149023 (OMIM: 608487) tripartite motif-containi ( 493)  656 83.0 2.2e-15
XP_016856908 (OMIM: 606123) PREDICTED: E3 ubiquiti ( 262)  648 81.9 2.5e-15
XP_016856907 (OMIM: 606123) PREDICTED: E3 ubiquiti ( 262)  648 81.9 2.5e-15
XP_011538873 (OMIM: 111620,111750,609017) PREDICTE ( 468)  651 82.4   3e-15


>>NP_742013 (OMIM: 605700) E3 ubiquitin-protein ligase T  (488 aa)
 initn: 3292 init1: 3292 opt: 3292  Z-score: 1892.4  bits: 359.6 E(85289): 1.1e-98
Smith-Waterman score: 3292; 100.0% identity (100.0% similar) in 488 aa overlap (1-488:1-488)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB8 MAETSLLEAGASAASTAAALENLQVEASCSVCLEYLKEPVIIECGHNFCKACITRWWEDL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_742 MAETSLLEAGASAASTAAALENLQVEASCSVCLEYLKEPVIIECGHNFCKACITRWWEDL
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB8 ERDFPCPVCRKTSRYRSLRPNRQLGSMVEIAKQLQAVKRKIRDESLCPQHHEALSLFCYE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_742 ERDFPCPVCRKTSRYRSLRPNRQLGSMVEIAKQLQAVKRKIRDESLCPQHHEALSLFCYE
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB8 DQEAVCLICAISHTHRAHTVVPLDDATQEYKEKLQKCLEPLEQKLQEITRCKSSEEKKPG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_742 DQEAVCLICAISHTHRAHTVVPLDDATQEYKEKLQKCLEPLEQKLQEITRCKSSEEKKPG
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB8 ELKRLVESRRQQILREFEELHRRLDEEQQVLLSRLEEEEQDILQRLRENAAHLGDKRRDL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_742 ELKRLVESRRQQILREFEELHRRLDEEQQVLLSRLEEEEQDILQRLRENAAHLGDKRRDL
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB8 AHLAAEVEGKCLQSGFEMLKDVKSTLEKCEKVKTMEVTSVSIELEKNFSNFPRQYFALRK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_742 AHLAAEVEGKCLQSGFEMLKDVKSTLEKCEKVKTMEVTSVSIELEKNFSNFPRQYFALRK
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB8 ILKQLIADVTLDPETAHPNLVLSEDRKSVKFVETRLRDLPDTPRRFTFYPCVLATEGFTS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_742 ILKQLIADVTLDPETAHPNLVLSEDRKSVKFVETRLRDLPDTPRRFTFYPCVLATEGFTS
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB8 GRHYWEVEVGDKTHWAVGVCRDSVSRKGELTPLPETGYWRVRLWNGDKYAATTTPFTPLH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_742 GRHYWEVEVGDKTHWAVGVCRDSVSRKGELTPLPETGYWRVRLWNGDKYAATTTPFTPLH
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB8 IKVKPKRVGIFLDYEAGTLSFYNVTDRSHIYTFTDTFTEKLWPLFYPGIRAGRKNAAPLT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_742 IKVKPKRVGIFLDYEAGTLSFYNVTDRSHIYTFTDTFTEKLWPLFYPGIRAGRKNAAPLT
              430       440       450       460       470       480

               
pF1KB8 IRPPTDWE
       ::::::::
NP_742 IRPPTDWE
               

>>NP_067076 (OMIM: 605700) E3 ubiquitin-protein ligase T  (518 aa)
 initn: 1786 init1: 1786 opt: 1786  Z-score: 1037.9  bits: 201.6 E(85289): 4.5e-51
Smith-Waterman score: 3222; 94.2% identity (94.2% similar) in 518 aa overlap (1-488:1-518)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB8 MAETSLLEAGASAASTAAALENLQVEASCSVCLEYLKEPVIIECGHNFCKACITRWWEDL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_067 MAETSLLEAGASAASTAAALENLQVEASCSVCLEYLKEPVIIECGHNFCKACITRWWEDL
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB8 ERDFPCPVCRKTSRYRSLRPNRQLGSMVEIAKQLQAVKRKIRDESLCPQHHEALSLFCYE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_067 ERDFPCPVCRKTSRYRSLRPNRQLGSMVEIAKQLQAVKRKIRDESLCPQHHEALSLFCYE
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB8 DQEAVCLICAISHTHRAHTVVPLDDATQEYKEKLQKCLEPLEQKLQEITRCKSSEEKKPG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_067 DQEAVCLICAISHTHRAHTVVPLDDATQEYKEKLQKCLEPLEQKLQEITRCKSSEEKKPG
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB8 ELKRLVESRRQQILREFEELHRRLDEEQQVLLSRLEEEEQDILQRLRENAAHLGDKRRDL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_067 ELKRLVESRRQQILREFEELHRRLDEEQQVLLSRLEEEEQDILQRLRENAAHLGDKRRDL
              190       200       210       220       230       240

              250       260                                     270
pF1KB8 AHLAAEVEGKCLQSGFEMLKDVKSTLEK------------------------------CE
       ::::::::::::::::::::::::::::                              ::
NP_067 AHLAAEVEGKCLQSGFEMLKDVKSTLEKNIPRKFGGSLSTICPRDHKALLGLVKEINRCE
              250       260       270       280       290       300

              280       290       300       310       320       330
pF1KB8 KVKTMEVTSVSIELEKNFSNFPRQYFALRKILKQLIADVTLDPETAHPNLVLSEDRKSVK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_067 KVKTMEVTSVSIELEKNFSNFPRQYFALRKILKQLIADVTLDPETAHPNLVLSEDRKSVK
              310       320       330       340       350       360

              340       350       360       370       380       390
pF1KB8 FVETRLRDLPDTPRRFTFYPCVLATEGFTSGRHYWEVEVGDKTHWAVGVCRDSVSRKGEL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_067 FVETRLRDLPDTPRRFTFYPCVLATEGFTSGRHYWEVEVGDKTHWAVGVCRDSVSRKGEL
              370       380       390       400       410       420

              400       410       420       430       440       450
pF1KB8 TPLPETGYWRVRLWNGDKYAATTTPFTPLHIKVKPKRVGIFLDYEAGTLSFYNVTDRSHI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_067 TPLPETGYWRVRLWNGDKYAATTTPFTPLHIKVKPKRVGIFLDYEAGTLSFYNVTDRSHI
              430       440       450       460       470       480

              460       470       480        
pF1KB8 YTFTDTFTEKLWPLFYPGIRAGRKNAAPLTIRPPTDWE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_067 YTFTDTFTEKLWPLFYPGIRAGRKNAAPLTIRPPTDWE
              490       500       510        

>>NP_003132 (OMIM: 109092) E3 ubiquitin-protein ligase T  (475 aa)
 initn: 1218 init1: 470 opt: 1225  Z-score: 720.2  bits: 142.7 E(85289): 2.2e-33
Smith-Waterman score: 1225; 41.8% identity (69.9% similar) in 471 aa overlap (15-483:2-464)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB8 MAETSLLEAGASAASTAAALENLQVEASCSVCLEYLKEPVIIECGHNFCKACITRWWEDL
                     ..:: :  .  :..: .::. . ::: :::::.::. ::..  .  
NP_003              MASAARLTMMWEEVTCPICLDPFVEPVSIECGHSFCQECISQVGKG-
                            10        20        30        40       

               70        80        90       100       110       120
pF1KB8 ERDFPCPVCRKTSRYRSLRPNRQLGSMVEIAKQLQAVKRKIRDESLCPQHHEALSLFCYE
            :::::.    ..:::::::..::.  :...   :.  .   :  : : : ::: .
NP_003 -GGSVCPVCRQRFLLKNLRPNRQLANMVNNLKEISQEAREGTQGERCAVHGERLHLFCEK
          50        60        70        80        90       100     

              130       140       150       160       170       180
pF1KB8 DQEAVCLICAISHTHRAHTVVPLDDATQEYKEKLQKCLEPLEQKLQEITRCKSSEEKKPG
       : .:.: .:: :. :: :..:::..:.:::.::::  :  :..: .   . .     : .
NP_003 DGKALCWVCAQSRKHRDHAMVPLEEAAQEYQEKLQVALGELRRKQELAEKLEVEIAIKRA
         110       120       130       140       150       160     

              190       200       210       220       230       240
pF1KB8 ELKRLVESRRQQILREFEELHRRLDEEQQVLLSRLEEEEQDILQRLRENAAHLGDKRRDL
       . :. ::.....:  :: . .  : ::.:  :..::..:.. :. : :. :.:... . :
NP_003 DWKKTVETQKSRIHAEFVQQKNFLVEEEQRQLQELEKDEREQLRILGEKEAKLAQQSQAL
         170       180       190       200       210       220     

              250       260       270       280       290       300
pF1KB8 AHLAAEVEGKCLQSGFEMLKDVKSTLEKCEKVKTMEVTSVSIELEKNFSNFPRQYFALRK
        .: .:.. .: .:..:.:..:  .::. :. .  ..  .: :: ..  . :    .:.:
NP_003 QELISELDRRCHSSALELLQEVIIVLERSESWNLKDLDITSPEL-RSVCHVP----GLKK
         230       240       250       260        270           280

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pF1KB8 ILKQLIADVTLDPETAHPNLVLSEDRKSVKFVETRLRDLPDTPRRFTFYPCVLATEGFTS
       .:.   . .::::.::.: :.:::::..:.. .:. ...: . .::  :: ::... : :
NP_003 MLRTCAVHITLDPDTANPWLILSEDRRQVRLGDTQ-QSIPGNEERFDSYPMVLGAQHFHS
              290       300       310        320       330         

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pF1KB8 GRHYWEVEVGDKTHWAVGVCRDSVSRKGELTPLPETGYWRVRLWNGDKYAATTTPFTPLH
       :.:::::.:  :  : .::::::: :::..    ..:.: . ::: .:: : : : ::::
NP_003 GKHYWEVDVTGKEAWDLGVCRDSVRRKGHFLLSSKSGFWTIWLWNKQKYEAGTYPQTPLH
     340       350       360       370       380       390         

              430       440        450        460       470        
pF1KB8 IKVKPKRVGIFLDYEAGTLSFYNVTDR-SHIYTFTD-TFTEKLWPLFYPGIRAGRKNAAP
       ..: : .:::::::::: .::::.::. : ::.:.. .::  : :.: ::.  : ::.::
NP_003 LQVPPCQVGIFLDYEAGMVSFYNITDHGSLIYSFSECAFTGPLRPFFSPGFNDGGKNTAP
     400       410       420       430       440       450         

      480              
pF1KB8 LTIRPPTDWE      
       ::. :           
NP_003 LTLCPLNIGSQGSTDY
     460       470     

>>NP_660215 (OMIM: 607868) E3 ubiquitin-protein ligase T  (468 aa)
 initn: 1242 init1: 484 opt: 1156  Z-score: 681.1  bits: 135.4 E(85289): 3.4e-31
Smith-Waterman score: 1308; 45.1% identity (71.2% similar) in 466 aa overlap (22-483:9-457)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB8 MAETSLLEAGASAASTAAALENLQVEASCSVCLEYLKEPVIIECGHNFCKACITRWWEDL
                            ::: ::.:..::.:. .::. .::::::. :: : : . 
NP_660              MAAPDLSTNLQEEATCAICLDYFTDPVMTDCGHNFCRECIRRCWGQP
                            10        20        30        40       

               70        80        90       100       110       120
pF1KB8 ERDFPCPVCRKTSRYRSLRPNRQLGSMVEIAKQLQAVKRKIRDESLCPQHHEALSLFCYE
       :  . :: ::. :  :.::::: :..:.:.:..:.  .     ...:: :.: :. :: .
NP_660 EGPYACPECRELSPQRNLRPNRPLAKMAEMARRLHPPSP--VPQGVCPAHREPLAAFCGD
        50        60        70        80          90       100     

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pF1KB8 DQEAVCLICAISHTHRAHTVVPLDDATQEYKEKLQKCLEPLEQKLQEITRCKSSEEKKPG
       . . .:  :  :  : :: : ::.::... : ::.: :: :....:.    ... ..   
NP_660 ELRLLCAACERSGEHWAHRVRPLQDAAEDLKAKLEKSLEHLRKQMQDALLFQAQADETCV
         110       120       130       140       150       160     

              190       200       210       220       230       240
pF1KB8 ELKRLVESRRQQILREFEELHRRLDEEQQVLLSRLEEEEQDILQRLRENAAHLGDKRRDL
         ...:::.::..: :::.:.: : ::.: ::.:::::: ..: ::::.:::::..   :
NP_660 LWQKMVESQRQNVLGEFERLRRLLAEEEQQLLQRLEEEELEVLPRLREGAAHLGQQSAHL
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pF1KB8 AHLAAEVEGKCLQSGFEMLKDVKSTLEKCEKVKTMEVTSVSIELEKNFSNFPRQYFALRK
       :.: ::.::.:   .. .:.:.:..:.. . :: .    : .:: ..    :    .: .
NP_660 AELIAELEGRCQLPALGLLQDIKDALRRVQDVKLQPPEVVPMEL-RTVCRVP----GLVE
         230       240       250       260        270           280

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pF1KB8 ILKQLIADVTLDPETAHPNLVLSEDRKSVKFVETRLRDLPDTPRRFTFYPCVLATEGFTS
        :... .::::::.::.:.:.:::::.::.  . : . :::.:.::   ::::. : :::
NP_660 TLRRFRGDVTLDPDTANPELILSEDRRSVQRGDLR-QALPDSPERFDPGPCVLGQERFTS
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pF1KB8 GRHYWEVEVGDKTHWAVGVCRDSVSRK--GELTPLPETGYWRVRLWNGDKYAATTTPFTP
       :::::::::::.: ::.::::..:.::  :::.    .:.: . .. :. : ..   ..:
NP_660 GRHYWEVEVGDRTSWALGVCRENVNRKEKGELSA--GNGFW-ILVFLGSYYNSSERALAP
     340       350       360       370          380       390      

      420       430       440       450        460       470       
pF1KB8 LHIKVKPKRVGIFLDYEAGTLSFYNVTDRSHIYTFTDT-FTEKLWPLFYPGIRAGRKNAA
       :  .  :.::::::::::: ::::..:: : .. : .  :.  : ::: :      .. .
NP_660 L--RDPPRRVGIFLDYEAGHLSFYSATDGSLLFIFPEIPFSGTLRPLFSPL----SSSPT
          400       410       420       430       440           450

       480               
pF1KB8 PLTI-RPPTDWE      
       :.:: ::           
NP_660 PMTICRPKGGSGDTLAPQ
              460        

>>XP_016857901 (OMIM: 607868) PREDICTED: E3 ubiquitin-pr  (467 aa)
 initn: 1066 init1: 308 opt: 1149  Z-score: 677.2  bits: 134.7 E(85289): 5.6e-31
Smith-Waterman score: 1301; 45.3% identity (71.2% similar) in 466 aa overlap (22-483:9-456)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB8 MAETSLLEAGASAASTAAALENLQVEASCSVCLEYLKEPVIIECGHNFCKACITRWWEDL
                            ::: ::.:..::.:. .::. .::::::. :: : : . 
XP_016              MAAPDLSTNLQEEATCAICLDYFTDPVMTDCGHNFCRECIRRCWGQP
                            10        20        30        40       

               70        80        90       100       110       120
pF1KB8 ERDFPCPVCRKTSRYRSLRPNRQLGSMVEIAKQLQAVKRKIRDESLCPQHHEALSLFCYE
       :  . :: ::. :  :.::::: :..:.:.:..:.  .     ...:: :.: :. :: .
XP_016 EGPYACPECRELSPQRNLRPNRPLAKMAEMARRLHPPSP--VPQGVCPAHREPLAAFCGD
        50        60        70        80          90       100     

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pF1KB8 DQEAVCLICAISHTHRAHTVVPLDDATQEYKEKLQKCLEPLEQKLQEITRCKSSEEKKPG
       . . .:  :  :  : :: : ::.::... : ::.: :: :....:.    ... ..   
XP_016 ELRLLCAACERSGEHWAHRVRPLQDAAEDLKAKLEKSLEHLRKQMQDALLFQAQADET-C
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pF1KB8 ELKRLVESRRQQILREFEELHRRLDEEQQVLLSRLEEEEQDILQRLRENAAHLGDKRRDL
        : ..:::.::..: :::.:.: : ::.: ::.:::::: ..: ::::.:::::..   :
XP_016 VLWQMVESQRQNVLGEFERLRRLLAEEEQQLLQRLEEEELEVLPRLREGAAHLGQQSAHL
          170       180       190       200       210       220    

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pF1KB8 AHLAAEVEGKCLQSGFEMLKDVKSTLEKCEKVKTMEVTSVSIELEKNFSNFPRQYFALRK
       :.: ::.::.:   .. .:.:.:..:.. . :: .    : .:: ..    :    .: .
XP_016 AELIAELEGRCQLPALGLLQDIKDALRRVQDVKLQPPEVVPMEL-RTVCRVP----GLVE
          230       240       250       260        270             

              310       320       330       340       350       360
pF1KB8 ILKQLIADVTLDPETAHPNLVLSEDRKSVKFVETRLRDLPDTPRRFTFYPCVLATEGFTS
        :... .::::::.::.:.:.:::::.::.  . : . :::.:.::   ::::. : :::
XP_016 TLRRFRGDVTLDPDTANPELILSEDRRSVQRGDLR-QALPDSPERFDPGPCVLGQERFTS
     280       290       300       310        320       330        

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pF1KB8 GRHYWEVEVGDKTHWAVGVCRDSVSRK--GELTPLPETGYWRVRLWNGDKYAATTTPFTP
       :::::::::::.: ::.::::..:.::  :::.    .:.: . .. :. : ..   ..:
XP_016 GRHYWEVEVGDRTSWALGVCRENVNRKEKGELSA--GNGFW-ILVFLGSYYNSSERALAP
      340       350       360       370          380       390     

      420       430       440       450        460       470       
pF1KB8 LHIKVKPKRVGIFLDYEAGTLSFYNVTDRSHIYTFTDT-FTEKLWPLFYPGIRAGRKNAA
       :  .  :.::::::::::: ::::..:: : .. : .  :.  : ::: :      .. .
XP_016 L--RDPPRRVGIFLDYEAGHLSFYSATDGSLLFIFPEIPFSGTLRPLFSPL----SSSPT
           400       410       420       430       440             

       480               
pF1KB8 PLTI-RPPTDWE      
       :.:: ::           
XP_016 PMTICRPKGGSGDTLAPQ
     450       460       

>>NP_060543 (OMIM: 613184) E3 ubiquitin-protein ligase T  (485 aa)
 initn: 889 init1: 402 opt: 1133  Z-score: 667.9  bits: 133.0 E(85289): 1.8e-30
Smith-Waterman score: 1133; 38.1% identity (66.7% similar) in 480 aa overlap (18-481:5-478)

               10        20        30        40        50          
pF1KB8 MAETSLLEAGASAASTAAALENLQVEASCSVCLEYLKEPVIIECGHNFCKACITRWWE--
                        : .: .  :..: .:. .:.::. :.:::.::..:..  ::  
NP_060              MDPTALVEAIVEEVACPICMTFLREPMSIDCGHSFCHSCLSGLWEIP
                            10        20        30        40       

         60        70        80        90       100       110      
pF1KB8 --DLERDFPCPVCRKTSRYRSLRPNRQLGSMVEIAKQLQAVKRKIRDESLCPQHHEALSL
         . .  . ::.::   . :.:::: ::...:: .. :.         .:: .: : :..
NP_060 GESQNWGYTCPLCRAPVQPRNLRPNWQLANVVEKVRLLRLHPGMGLKGDLCERHGEKLKM
        50        60        70        80        90       100       

        120       130       140       150       160       170      
pF1KB8 FCYEDQEAVCLICAISHTHRAHTVVPLDDATQEYKEKLQKCLEPLEQKLQEITRCKSSEE
       :: ::   .:  :. :  :.::.:::..:.. ::: .:.. :: :... .:  . . .:.
NP_060 FCKEDVLIMCEACSQSPEHEAHSVVPMEDVAWEYKWELHEALEHLKKEQEEAWKLEVGER
       110       120       130       140       150       160       

        180       190       200                 210       220      
pF1KB8 KKPGELKRLVESRRQQILREFEEL----------HRRLDEEQQVLLSRLEEEEQDILQRL
       :. .  :  ::.:.:.:. :::.           ::.:  :  . :. :..:  . .:.:
NP_060 KRTATWKIQVETRKQSIVWEFEKYQRLLEKKQPPHRQLGAEVAAALASLQREAAETMQKL
       170       180       190       200       210       220       

        230       240       250       260       270       280      
pF1KB8 RENAAHLGDKRRDLAHLAAEVEGKCLQSGFEMLKDVKSTLEKCEKVKTMEVTSVSIELEK
       . : ..: .. . : .. ::.. .  .    ::.:.. .:.. .. . ..   .:.::. 
NP_060 ELNHSELIQQSQVLWRMIAELKERSQRPVRWMLQDIQEVLNRSKSWSLQQPEPISLELKT
       230       240       250       260       270       280       

        290       300       310       320       330       340      
pF1KB8 NFSNFPRQYFALRKILKQLIADVTLDPETAHPNLVLSEDRKSVKFVETRLRDLPDTPRRF
       .      . ..::.:::   ::: :::.::.  :..::::: :.. .:  . :::.:.::
NP_060 DC-----RVLGLREILKTYAADVRLDPDTAYSRLIVSEDRKRVHYGDTNQK-LPDNPERF
            290       300       310       320       330        340 

        350       360       370       380       390       400      
pF1KB8 TFYPCVLATEGFTSGRHYWEVEVGDKTHWAVGVCRDSVSRKGELTPLPETGYWRVRLWNG
         :  ::... ..::::::::::::...:..:::...:.::  .   :. :.: .:: .:
NP_060 YRYNIVLGSQCISSGRHYWEVEVGDRSEWGLGVCKQNVDRKEVVYLSPHYGFWVIRLRKG
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       : :    : .:.:::.:       
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pF1KB8 GI-RAGRKNAAPLTIRPPTDWE
       :  ..:.   . .:.       
XP_006 GAPKSGQMVISTVTMWVKG   
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NP_001              MEAVELARKLQEEATCSICLDYFTDPVMTTCGHNFCRACIQLSWEKA
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NP_001 PGQIEVLRGFLEDVVPDAT----SAYPYLLLYESRQRRYLGSSPEGSGFCSKDRFVAYPC
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NP_001 YLSTFSALTPVMLMEPPSHMGIFLDFEAGEVSFYSVSDGSHLHTYSQATFPGPLQPFFCL
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pF1KB8 GI-RAGRKNAAPLTIRPPTDWE
       :  ..:.   . .:.       
NP_001 GAPKSGQMVISTVTMWVKG   
      460       470          

>>NP_057186 (OMIM: 606123) E3 ubiquitin-protein ligase T  (477 aa)
 initn: 1113 init1: 417 opt: 1086  Z-score: 641.3  bits: 128.1 E(85289): 5.5e-29
Smith-Waterman score: 1086; 37.8% identity (66.6% similar) in 473 aa overlap (23-481:10-473)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB8 MAETSLLEAGASAASTAAALENLQVEASCSVCLEYLKEPVIIECGHNFCKACITRWWEDL
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NP_057              MEAVELARKLQEEATCSICLDYFTDPVMTTCGHNFCRACIQLSWEKA
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NP_057 RGKKGRRKRKGSFPCPECREMSPQRNLLPNRLLTKVAEMAQQHPGLQKQ----DLCQEHH
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