Result of FASTA (ccds) for
pFN21AB8733
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB8733, 488 aa
1>>>pF1KB8733 488 - 488 aa - 488 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.6741+/-0.00126; mu= -2.0123+/- 0.075
mean_var=270.6709+/-57.008, 0's: 0 Z-trim(109.9): 150 B-trim: 76 in 1/51
Lambda= 0.077957
statistics sampled from 11075 (11225) to 11075 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.708), E-opt: 0.2 (0.345), width: 16
Scan time: 3.480
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS34378.1 TRIM39 gene_id:56658|Hs108|chr6 ( 488) 3292 384.0 2e-106
CCDS78121.1 RPP21 gene_id:202658|Hs108|chr6 ( 503) 2448 289.1 7.7e-78
CCDS34377.1 TRIM39 gene_id:56658|Hs108|chr6 ( 518) 1786 214.6 2e-55
CCDS3808.1 TRIM60 gene_id:166655|Hs108|chr4 ( 471) 1325 162.7 7.7e-40
CCDS44525.1 TRIM21 gene_id:6737|Hs108|chr11 ( 475) 1225 151.5 1.9e-36
CCDS1636.1 TRIM58 gene_id:25893|Hs108|chr1 ( 486) 1165 144.7 2.1e-34
CCDS31048.1 TRIM11 gene_id:81559|Hs108|chr1 ( 468) 1156 143.7 4e-34
CCDS31356.1 TRIM68 gene_id:55128|Hs108|chr11 ( 485) 1133 141.1 2.5e-33
CCDS1571.1 TRIM17 gene_id:51127|Hs108|chr1 ( 477) 1086 135.9 9.6e-32
CCDS4568.1 TRIM38 gene_id:10475|Hs108|chr6 ( 465) 1021 128.5 1.5e-29
CCDS32220.1 TRIM69 gene_id:140691|Hs108|chr15 ( 500) 934 118.8 1.4e-26
CCDS4466.1 TRIM41 gene_id:90933|Hs108|chr5 ( 630) 869 111.5 2.6e-24
CCDS376.1 TRIM62 gene_id:55223|Hs108|chr1 ( 475) 862 110.7 3.7e-24
CCDS34654.1 TRIM50 gene_id:135892|Hs108|chr7 ( 487) 812 105.0 1.8e-22
CCDS4465.1 TRIM41 gene_id:90933|Hs108|chr5 ( 518) 788 102.4 1.3e-21
CCDS31389.1 TRIM6 gene_id:117854|Hs108|chr11 ( 516) 769 100.2 5.5e-21
CCDS3851.1 TRIML1 gene_id:339976|Hs108|chr4 ( 468) 768 100.1 5.5e-21
CCDS31390.1 TRIM6 gene_id:117854|Hs108|chr11 ( 488) 760 99.2 1.1e-20
CCDS55762.1 TRIM49B gene_id:283116|Hs108|chr11 ( 452) 706 93.1 6.8e-19
CCDS4676.1 TRIM10 gene_id:10107|Hs108|chr6 ( 395) 704 92.8 7.2e-19
CCDS34375.1 TRIM10 gene_id:10107|Hs108|chr6 ( 481) 704 92.9 8.3e-19
CCDS60930.1 TRIM49D1 gene_id:399939|Hs108|chr11 ( 452) 700 92.4 1.1e-18
CCDS53693.1 TRIM64B gene_id:642446|Hs108|chr11 ( 449) 694 91.7 1.7e-18
CCDS41612.1 TRIM22 gene_id:10346|Hs108|chr11 ( 498) 690 91.3 2.5e-18
CCDS8287.1 TRIM49 gene_id:57093|Hs108|chr11 ( 452) 689 91.2 2.6e-18
CCDS53694.1 TRIM49C gene_id:642612|Hs108|chr11 ( 452) 689 91.2 2.6e-18
CCDS73363.1 TRIM64 gene_id:120146|Hs108|chr11 ( 449) 685 90.7 3.5e-18
CCDS31391.1 TRIM34 gene_id:53840|Hs108|chr11 ( 488) 684 90.6 4e-18
CCDS6056.2 TRIM35 gene_id:23087|Hs108|chr8 ( 493) 670 89.1 1.2e-17
CCDS5678.1 TRIM4 gene_id:89122|Hs108|chr7 ( 474) 667 88.7 1.5e-17
CCDS10114.1 TRIM69 gene_id:140691|Hs108|chr15 ( 341) 663 88.2 1.6e-17
CCDS10498.1 MEFV gene_id:4210|Hs108|chr16 ( 781) 666 88.8 2.3e-17
CCDS44327.1 TRIM17 gene_id:51127|Hs108|chr1 ( 343) 658 87.6 2.3e-17
CCDS32437.1 TRIM72 gene_id:493829|Hs108|chr16 ( 477) 661 88.1 2.4e-17
CCDS31393.1 TRIM5 gene_id:85363|Hs108|chr11 ( 493) 656 87.5 3.6e-17
CCDS475.1 ERMAP gene_id:114625|Hs108|chr1 ( 475) 651 86.9 5.1e-17
CCDS73719.1 TRIM69 gene_id:140691|Hs108|chr15 ( 296) 645 86.1 5.7e-17
CCDS4654.1 TRIM27 gene_id:5987|Hs108|chr6 ( 513) 646 86.4 8e-17
CCDS73287.1 TRIM64C gene_id:646754|Hs108|chr11 ( 450) 643 86.0 9.2e-17
CCDS76746.1 TRIM69 gene_id:140691|Hs108|chr15 ( 279) 609 82.0 9.1e-16
CCDS4614.1 BTN1A1 gene_id:696|Hs108|chr6 ( 526) 615 82.9 9.2e-16
CCDS47388.1 BTN3A1 gene_id:11119|Hs108|chr6 ( 461) 596 80.7 3.6e-15
CCDS4608.1 BTN3A1 gene_id:11119|Hs108|chr6 ( 513) 596 80.8 4e-15
CCDS4612.2 BTN3A3 gene_id:10384|Hs108|chr6 ( 535) 596 80.8 4.1e-15
CCDS4611.1 BTN3A3 gene_id:10384|Hs108|chr6 ( 584) 596 80.8 4.4e-15
CCDS81297.1 TRIM62 gene_id:55223|Hs108|chr1 ( 354) 588 79.7 5.6e-15
CCDS60929.1 TRIM77 gene_id:390231|Hs108|chr11 ( 450) 580 78.9 1.2e-14
CCDS76745.1 TRIM69 gene_id:140691|Hs108|chr15 ( 263) 574 78.1 1.3e-14
CCDS34374.1 TRIM31 gene_id:11074|Hs108|chr6 ( 425) 577 78.6 1.5e-14
CCDS56403.1 BTN2A2 gene_id:10385|Hs108|chr6 ( 313) 570 77.7 2.1e-14
>>CCDS34378.1 TRIM39 gene_id:56658|Hs108|chr6 (488 aa)
initn: 3292 init1: 3292 opt: 3292 Z-score: 2024.1 bits: 384.0 E(32554): 2e-106
Smith-Waterman score: 3292; 100.0% identity (100.0% similar) in 488 aa overlap (1-488:1-488)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MAETSLLEAGASAASTAAALENLQVEASCSVCLEYLKEPVIIECGHNFCKACITRWWEDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 MAETSLLEAGASAASTAAALENLQVEASCSVCLEYLKEPVIIECGHNFCKACITRWWEDL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 ERDFPCPVCRKTSRYRSLRPNRQLGSMVEIAKQLQAVKRKIRDESLCPQHHEALSLFCYE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 ERDFPCPVCRKTSRYRSLRPNRQLGSMVEIAKQLQAVKRKIRDESLCPQHHEALSLFCYE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 DQEAVCLICAISHTHRAHTVVPLDDATQEYKEKLQKCLEPLEQKLQEITRCKSSEEKKPG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 DQEAVCLICAISHTHRAHTVVPLDDATQEYKEKLQKCLEPLEQKLQEITRCKSSEEKKPG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 ELKRLVESRRQQILREFEELHRRLDEEQQVLLSRLEEEEQDILQRLRENAAHLGDKRRDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 ELKRLVESRRQQILREFEELHRRLDEEQQVLLSRLEEEEQDILQRLRENAAHLGDKRRDL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 AHLAAEVEGKCLQSGFEMLKDVKSTLEKCEKVKTMEVTSVSIELEKNFSNFPRQYFALRK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 AHLAAEVEGKCLQSGFEMLKDVKSTLEKCEKVKTMEVTSVSIELEKNFSNFPRQYFALRK
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 ILKQLIADVTLDPETAHPNLVLSEDRKSVKFVETRLRDLPDTPRRFTFYPCVLATEGFTS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 ILKQLIADVTLDPETAHPNLVLSEDRKSVKFVETRLRDLPDTPRRFTFYPCVLATEGFTS
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB8 GRHYWEVEVGDKTHWAVGVCRDSVSRKGELTPLPETGYWRVRLWNGDKYAATTTPFTPLH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 GRHYWEVEVGDKTHWAVGVCRDSVSRKGELTPLPETGYWRVRLWNGDKYAATTTPFTPLH
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB8 IKVKPKRVGIFLDYEAGTLSFYNVTDRSHIYTFTDTFTEKLWPLFYPGIRAGRKNAAPLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 IKVKPKRVGIFLDYEAGTLSFYNVTDRSHIYTFTDTFTEKLWPLFYPGIRAGRKNAAPLT
430 440 450 460 470 480
pF1KB8 IRPPTDWE
::::::::
CCDS34 IRPPTDWE
>>CCDS78121.1 RPP21 gene_id:202658|Hs108|chr6 (503 aa)
initn: 2448 init1: 2448 opt: 2448 Z-score: 1510.9 bits: 289.1 E(32554): 7.7e-78
Smith-Waterman score: 2448; 100.0% identity (100.0% similar) in 368 aa overlap (1-368:1-368)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MAETSLLEAGASAASTAAALENLQVEASCSVCLEYLKEPVIIECGHNFCKACITRWWEDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 MAETSLLEAGASAASTAAALENLQVEASCSVCLEYLKEPVIIECGHNFCKACITRWWEDL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 ERDFPCPVCRKTSRYRSLRPNRQLGSMVEIAKQLQAVKRKIRDESLCPQHHEALSLFCYE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 ERDFPCPVCRKTSRYRSLRPNRQLGSMVEIAKQLQAVKRKIRDESLCPQHHEALSLFCYE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 DQEAVCLICAISHTHRAHTVVPLDDATQEYKEKLQKCLEPLEQKLQEITRCKSSEEKKPG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 DQEAVCLICAISHTHRAHTVVPLDDATQEYKEKLQKCLEPLEQKLQEITRCKSSEEKKPG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 ELKRLVESRRQQILREFEELHRRLDEEQQVLLSRLEEEEQDILQRLRENAAHLGDKRRDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 ELKRLVESRRQQILREFEELHRRLDEEQQVLLSRLEEEEQDILQRLRENAAHLGDKRRDL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 AHLAAEVEGKCLQSGFEMLKDVKSTLEKCEKVKTMEVTSVSIELEKNFSNFPRQYFALRK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 AHLAAEVEGKCLQSGFEMLKDVKSTLEKCEKVKTMEVTSVSIELEKNFSNFPRQYFALRK
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 ILKQLIADVTLDPETAHPNLVLSEDRKSVKFVETRLRDLPDTPRRFTFYPCVLATEGFTS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 ILKQLIADVTLDPETAHPNLVLSEDRKSVKFVETRLRDLPDTPRRFTFYPCVLATEGFTS
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB8 GRHYWEVEVGDKTHWAVGVCRDSVSRKGELTPLPETGYWRVRLWNGDKYAATTTPFTPLH
::::::::
CCDS78 GRHYWEVEAAHCVLAQDPENQALARFYCYTERTIAKRLVLRRDPSVKRTLCRGCSSLLVP
370 380 390 400 410 420
>>CCDS34377.1 TRIM39 gene_id:56658|Hs108|chr6 (518 aa)
initn: 1786 init1: 1786 opt: 1786 Z-score: 1108.4 bits: 214.6 E(32554): 2e-55
Smith-Waterman score: 3222; 94.2% identity (94.2% similar) in 518 aa overlap (1-488:1-518)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MAETSLLEAGASAASTAAALENLQVEASCSVCLEYLKEPVIIECGHNFCKACITRWWEDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 MAETSLLEAGASAASTAAALENLQVEASCSVCLEYLKEPVIIECGHNFCKACITRWWEDL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 ERDFPCPVCRKTSRYRSLRPNRQLGSMVEIAKQLQAVKRKIRDESLCPQHHEALSLFCYE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 ERDFPCPVCRKTSRYRSLRPNRQLGSMVEIAKQLQAVKRKIRDESLCPQHHEALSLFCYE
70 80 90 100 110 120
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pF1KB8 DQEAVCLICAISHTHRAHTVVPLDDATQEYKEKLQKCLEPLEQKLQEITRCKSSEEKKPG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 DQEAVCLICAISHTHRAHTVVPLDDATQEYKEKLQKCLEPLEQKLQEITRCKSSEEKKPG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 ELKRLVESRRQQILREFEELHRRLDEEQQVLLSRLEEEEQDILQRLRENAAHLGDKRRDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 ELKRLVESRRQQILREFEELHRRLDEEQQVLLSRLEEEEQDILQRLRENAAHLGDKRRDL
190 200 210 220 230 240
250 260 270
pF1KB8 AHLAAEVEGKCLQSGFEMLKDVKSTLEK------------------------------CE
:::::::::::::::::::::::::::: ::
CCDS34 AHLAAEVEGKCLQSGFEMLKDVKSTLEKNIPRKFGGSLSTICPRDHKALLGLVKEINRCE
250 260 270 280 290 300
280 290 300 310 320 330
pF1KB8 KVKTMEVTSVSIELEKNFSNFPRQYFALRKILKQLIADVTLDPETAHPNLVLSEDRKSVK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 KVKTMEVTSVSIELEKNFSNFPRQYFALRKILKQLIADVTLDPETAHPNLVLSEDRKSVK
310 320 330 340 350 360
340 350 360 370 380 390
pF1KB8 FVETRLRDLPDTPRRFTFYPCVLATEGFTSGRHYWEVEVGDKTHWAVGVCRDSVSRKGEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 FVETRLRDLPDTPRRFTFYPCVLATEGFTSGRHYWEVEVGDKTHWAVGVCRDSVSRKGEL
370 380 390 400 410 420
400 410 420 430 440 450
pF1KB8 TPLPETGYWRVRLWNGDKYAATTTPFTPLHIKVKPKRVGIFLDYEAGTLSFYNVTDRSHI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 TPLPETGYWRVRLWNGDKYAATTTPFTPLHIKVKPKRVGIFLDYEAGTLSFYNVTDRSHI
430 440 450 460 470 480
460 470 480
pF1KB8 YTFTDTFTEKLWPLFYPGIRAGRKNAAPLTIRPPTDWE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 YTFTDTFTEKLWPLFYPGIRAGRKNAAPLTIRPPTDWE
490 500 510
>>CCDS3808.1 TRIM60 gene_id:166655|Hs108|chr4 (471 aa)
initn: 1171 init1: 651 opt: 1325 Z-score: 828.7 bits: 162.7 E(32554): 7.7e-40
Smith-Waterman score: 1325; 43.1% identity (70.6% similar) in 473 aa overlap (19-488:6-470)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MAETSLLEAGASAASTAAALENLQVEASCSVCLEYLKEPVIIECGHNFCKACITRWWEDL
:: ::: :.:: .::::::.:: :.::::::..:.. :.::
CCDS38 MEFVTALVNLQEESSCPICLEYLKDPVTINCGHNFCRSCLSVSWKDL
10 20 30 40
70 80 90 100 110
pF1KB8 ERDFPCPVCRKTSRYRSLRPNRQLGSMVEIAKQLQ---AVKRKIRDESLCPQHHEALSLF
. ::::::: :.:.: : :: ...::::::: . ... .....: .:.. :.::
CCDS38 DDTFPCPVCRFCFPYKSFRRNPQLRNLTEIAKQLQIRRSKRKRQKENAMCEKHNQFLTLF
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KB8 CYEDQEAVCLICAISHTHRAHTVVPLDDATQEYKEKLQKCLEPLEQKLQEITRCKSSEEK
: .: : .: :..: :. : . :. :.. ..: :. ::::....... . . .
CCDS38 CVKDLEILCTQCSFSTKHQKHYICPIKKAASYHREILEGSLEPLRNNIERVEKVIILQGS
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KB8 KPGELKRLVESRRQQILREFEELHRRLDEEQQVLLSRLEEEEQDILQRLRENAAHLGDKR
: :::. :: .:..: :::... :..::...: ....::..:: .: :: ..:.:
CCDS38 KSVELKKKVEYKREEINSEFEQIRLFLQNEQEMILRQIQDEEMNILAKLNENLVELSDYV
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KB8 RDLAHLAAEVEGKCLQSGFEMLKDVKSTLEKCEKVKTMEVTSVSIELEKNFSNFPRQYFA
: :: ::::: .::..:.: ..:: .: ...: :. :..: : ..: :: .
CCDS38 STLKHLLREVEGKSVQSNLELLTQAKSMHHKYQNLKCPEL--FSFRLTKYGFSLPPQYSG
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KB8 LRKILKQLIADVTLDPETAHPNLVLSEDRKSVKFVETRLRDLPDTPRRFTFYPCVLATEG
: .:.: . .:: :: .::::.:..:::::.:.. : . :.. :::: : ::...
CCDS38 LDRIIKPFQVDVILDLNTAHPQLLVSEDRKAVRY-ERKKRNICYDPRRFYVCPAVLGSQR
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KB8 FTSGRHYWEVEVGDKTHWAVGVCRDSVSRKGELTPLPETGYWRVRLWNGDKYAATTTPFT
:.:::::::::::.: .: .:::.: . :. . : :.: . . . :.:. :
CCDS38 FSSGRHYWEVEVGNKPKWILGVCQDCLLRNWQDQPSVLGGFWAIGRYMKSGYVASGPKTT
350 360 370 380 390 400
420 430 440 450 460 470
pF1KB8 PLHIKVKPKRVGIFLDYEAGTLSFYNVTDRSHIYTFTDTFTEKLWPLFYPGIRAGRKNAA
: :::...::::::: : :::::..::: .:::.: ::: .:: :: : ..
CCDS38 QLLPVVKPSKIGIFLDYELGDLSFYNMNDRSILYTFNDCFTEAVWPYFYTG-----TDSE
410 420 430 440 450
480
pF1KB8 PLTIRPPTDWE
:: : .: :
CCDS38 PLKICSVSDSER
460 470
>>CCDS44525.1 TRIM21 gene_id:6737|Hs108|chr11 (475 aa)
initn: 1218 init1: 470 opt: 1225 Z-score: 767.9 bits: 151.5 E(32554): 1.9e-36
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10 20 30 40 50 60
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..:: : . :..: .::. . ::: :::::.::. ::.. .
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10 20 30 40
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:::::. ..:::::::..::. :... :. . : : : : ::: .
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: .:.: .:: :. :: :..:::..:.:::.:::: : :..: . . . : .
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. :. ::.....: :: . . : ::.: :..::..:.. :. : :. :.:... . :
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.: .:.. .: .:..:.:..: .::. :. . .. .: :: .. . : .:.:
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.:. . .::::.::.: :.:::::..:.. .:. ...: . .:: :: ::... : :
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..: : .:::::::::: .::::.::. : ::.:.. .:: : :.: ::. : ::.::
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480
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::. :
CCDS44 LTLCPLNIGSQGSTDY
460 470
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10 20 30 40 50 60
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CCDS16 FCEEDEAALCWVCDAGPEHRTHRTAPLQEAAGSYQVKLQMALELMRKELEDALTQEANVG
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CCDS16 KKTVIWKEKVEMQRQRFRLEFEKHRGFLAQEEQRQLRRLEAEERATLQRLRESKSRLVQQ
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. : .:: :.. .: . .. .:. :...: . . : .:. .. .:: :. .: .
CCDS16 SKALKELADELQERCQRPALGLLEGVRGVLSRSKAVTRLEAENIPMEL-KTACCIPGR--
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:..:... .:: ::: ::::.:.:. : .::. : ::.:..:.:: .::.:. .
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CCDS16 SFSSGRHYWEVLVGEGAEWGLGVCQDTLPRKGETTPSPENGVWALWLLKGNEYMVLASPS
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.:: .:. .::::::::: .::::::: :.::::.. :. : : :. .:
CCDS16 VPLLQLESPRCIGIFLDYEAGEISFYNVTDGSYIYTFNQLFSGLLRPYFFIC------DA
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480
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.:: : :::
CCDS16 TPL-ILPPTTIAGSGNWASRDHLDPASDVRDDHL
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>>CCDS31048.1 TRIM11 gene_id:81559|Hs108|chr1 (468 aa)
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CCDS31 MAAPDLSTNLQEEATCAICLDYFTDPVMTDCGHNFCRECIRRCWGQP
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CCDS31 EGPYACPECRELSPQRNLRPNRPLAKMAEMARRLHPPSP--VPQGVCPAHREPLAAFCGD
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CCDS31 ELRLLCAACERSGEHWAHRVRPLQDAAEDLKAKLEKSLEHLRKQMQDALLFQAQADETCV
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CCDS31 LWQKMVESQRQNVLGEFERLRRLLAEEEQQLLQRLEEEELEVLPRLREGAAHLGQQSAHL
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:.: ::.::.: .. .:.:.:..:.. . :: . : .:: .. : .: .
CCDS31 AELIAELEGRCQLPALGLLQDIKDALRRVQDVKLQPPEVVPMEL-RTVCRVP----GLVE
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:... .::::::.::.:.:.:::::.::. . : . :::.:.:: ::::. : :::
CCDS31 TLRRFRGDVTLDPDTANPELILSEDRRSVQRGDLR-QALPDSPERFDPGPCVLGQERFTS
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:::::::::::.: ::.::::..:.:: :::. .:.: . .. :. : .. ..:
CCDS31 GRHYWEVEVGDRTSWALGVCRENVNRKEKGELSA--GNGFW-ILVFLGSYYNSSERALAP
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: . :.::::::::::: ::::..:: : .. : . :. : ::: : .. .
CCDS31 L--RDPPRRVGIFLDYEAGHLSFYSATDGSLLFIFPEIPFSGTLRPLFSPL----SSSPT
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480
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CCDS31 PMTICRPKGGSGDTLAPQ
460
>>CCDS31356.1 TRIM68 gene_id:55128|Hs108|chr11 (485 aa)
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CCDS31 MDPTALVEAIVEEVACPICMTFLREPMSIDCGHSFCHSCLSGLWEIP
10 20 30 40
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CCDS31 GESQNWGYTCPLCRAPVQPRNLRPNWQLANVVEKVRLLRLHPGMGLKGDLCERHGEKLKM
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:: :: .: :. : :.::.:::..:.. ::: .:.. :: :... .: . . .:.
CCDS31 FCKEDVLIMCEACSQSPEHEAHSVVPMEDVAWEYKWELHEALEHLKKEQEEAWKLEVGER
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:. . : ::.:.:.:. :::. ::.: : . :. :..: . .:.:
CCDS31 KRTATWKIQVETRKQSIVWEFEKYQRLLEKKQPPHRQLGAEVAAALASLQREAAETMQKL
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pF1KB8 RENAAHLGDKRRDLAHLAAEVEGKCLQSGFEMLKDVKSTLEKCEKVKTMEVTSVSIELEK
. : ..: .. . : .. ::.. . . ::.:.. .:.. .. . .. .:.::.
CCDS31 ELNHSELIQQSQVLWRMIAELKERSQRPVRWMLQDIQEVLNRSKSWSLQQPEPISLELKT
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. . ..::.::: ::: :::.::. :..::::: :.. .: . :::.:.::
CCDS31 DC-----RVLGLREILKTYAADVRLDPDTAYSRLIVSEDRKRVHYGDTNQK-LPDNPERF
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pF1KB8 TFYPCVLATEGFTSGRHYWEVEVGDKTHWAVGVCRDSVSRKGELTPLPETGYWRVRLWNG
: ::... ..::::::::::::...:..:::...:.:: . :. :.: .:: .:
CCDS31 YRYNIVLGSQCISSGRHYWEVEVGDRSEWGLGVCKQNVDRKEVVYLSPHYGFWVIRLRKG
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pF1KB8 DKYAATTTPFTPLHIKVKPKRVGIFLDYEAGTLSFYNVTD-RSHIYTFTD-TFTEKLWPL
..: : : . : . : :.:::::.:::: .::::::: :::.:: : .: :
CCDS31 NEYRAGTDEYPILSLPVPPRRVGIFVDYEAHDISFYNVTDCGSHIFTFPRYPFPGRLLPY
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470 480
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: : : .:.:::.:
CCDS31 FSPCYSIGTNNTAPLAICSLDGED
470 480
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CCDS15 MEAVELARKLQEEATCSICLDYFTDPVMTTCGHNFCRACIQLSWEKA
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CCDS15 RGKKGRRKRKGSFPCPECREMSPQRNLLPNRLLTKVAEMAQQHPGLQKQ----DLCQEHH
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: :.::: .:: .:..: :. :: : :.: ..:.: :: ::.. .: :.... .
CCDS15 EPLKLFCQKDQSPICVVCRESREHRLHRVLPAEEAVQGYKLKLEEDMEYLREQITRTGNL
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CCDS15 QAREEQSLAEWQGKVKERRERIVLEFEKMNLYLVEEEQRLLQALETEEEETASRLRESVA
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: . ..: : ..: . :. ..::.:.: : . ..:... . ..
CCDS15 CLDRQGHSLELLLLQLEERSTQGPLQMLQDMKEPLSRKNNVSVQCPEVAPPTRPRTVCRV
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: : .:: .:.... :.: .:.: :.: :.:. . . . . ::. :::
CCDS15 PGQIEVLRGFLEDVVPDAT----SAYPYLLLYESRQRRYLGSSPEGSGFCSKDRFVAYPC
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... .:.:::::::: . :: ::.:::::.:::: .. ::.:.: :.: .: :
CCDS15 AVGQTAFSSGRHYWEVGMNITGDAL-WALGVCRDNVSRKDRVPKCPENGFWVVQLSKGTK
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pF1KB8 YAATTTPFTPLHIKVKPKRVGIFLDYEAGTLSFYNVTDRSHIYTFTD-TFTEKLWPLFYP
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CCDS15 YLSTFSALTPVMLMEPPSHMGIFLDFEAGEVSFYSVSDGSHLHTYSQATFPGPLQPFFCL
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pF1KB8 GI-RAGRKNAAPLTIRPPTDWE
: ..:. . .:.
CCDS15 GAPKSGQMVISTVTMWVKG
460 470
>>CCDS4568.1 TRIM38 gene_id:10475|Hs108|chr6 (465 aa)
initn: 1127 init1: 400 opt: 1021 Z-score: 644.0 bits: 128.5 E(32554): 1.5e-29
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::..:: .: ::.::.:: . .:: :.:::..:. ::: ....
CCDS45 MASTTSTKKMME----EATCSICLSLMTNPVSINCGHSYCHLCITDFFKNP
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pF1KB8 ----LERD-FPCPVCRKTSRYRSLRPNRQLGSMVEIAKQLQAVKRKIRDESLCPQHHEAL
:... : :: :: .. :::::.::::..: :. . .: : .: : .
CCDS45 SQKQLRQETFCCPQCRAPFHMDSLRPNKQLGSLIEALKETD-------QEMSCEEHGEQF
50 60 70 80 90 100
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pF1KB8 SLFCYEDQEAVCLICAISHTHRAHTVVPLDDATQEYKEKLQKCLEPLEQKLQEITRCKSS
::: .. . .: : . :..::.. ..:. : ::::::: . :.: .. :. : :
CCDS45 HLFCEDEGQLICWRCERAPQHKGHTTALVEDVCQGYKEKLQKAVTKLKQLEDRCTEQKLS
110 120 130 140 150 160
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pF1KB8 EEKKPGELKRLVESRRQQILREFEELHRRLDEEQQVLLSRLEEEEQDILQRLRENAAHLG
. . :. :. .::.: .:..:. : ::.. : :::.:::. :.:::. : ::
CCDS45 TAMRITKWKEKVQIQRQKIRSDFKNLQCFLHEEEKSYLWRLEKEEQQTLSRLRDYEAGLG
170 180 190 200 210 220
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pF1KB8 DKRRDLAHLAAEVEGKCLQSGFEMLKDVKSTLEKCEKVKTMEVTSVSIELEKNFSNFPRQ
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CCDS45 LKSNELKSHILELEEKCQGSAQKLLQNVNDTLSRSWAVKLETSEAVSLELH-TMCNVSKL
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pF1KB8 YFALRKILKQLIADVTLDPETAHPNLVLSEDRKSVKFVETRLRDLPDTPRRFTFYPCVLA
:: ..:.:.. ..:::::.::: .:.:::::..: :. .. . :::: .::::.
CCDS45 YFDVKKMLRSHQVSVTLDPDTAHHELILSEDRRQVTRGYTQ-ENQDTSSRRFTAFPCVLG
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:::::::.:.::.::. : : .::: ..:.: . :..:.: .:: . :.: :.
CCDS45 CEGFTSGRRYFEVDVGEGTGWDLGVCMENVQRGTGMKQEPQSGFWTLRLCKKKGYVALTS
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CCDS45 PPTSLHLHEQPLLVGIFLDYEAGVVSFYNGNTGCHIFTFPKASFSDTLRPYFQV------
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. .:: . :: :
CCDS45 YQYSPLFLPPPGD
460
488 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
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