FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB5246, 480 aa 1>>>pF1KB5246 480 - 480 aa - 480 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.5345+/-0.00104; mu= 19.2728+/- 0.063 mean_var=135.8506+/-25.276, 0's: 0 Z-trim(109.4): 56 B-trim: 0 in 0/50 Lambda= 0.110038 statistics sampled from 10837 (10889) to 10837 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.696), E-opt: 0.2 (0.334), width: 16 Scan time: 3.410 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS7630.1 HTRA1 gene_id:5654|Hs108|chr10 ( 480) 3174 515.6 4.5e-146 CCDS6110.1 HTRA4 gene_id:203100|Hs108|chr8 ( 476) 1613 267.8 1.8e-71 CCDS3400.1 HTRA3 gene_id:94031|Hs108|chr4 ( 453) 1547 257.3 2.5e-68 CCDS75105.1 HTRA3 gene_id:94031|Hs108|chr4 ( 357) 1256 211.0 1.7e-54 CCDS1951.1 HTRA2 gene_id:27429|Hs108|chr2 ( 458) 1107 187.5 2.7e-47 CCDS58900.1 IGFBP7 gene_id:3490|Hs108|chr4 ( 279) 377 71.3 1.5e-12 CCDS3512.1 IGFBP7 gene_id:3490|Hs108|chr4 ( 282) 377 71.3 1.5e-12 CCDS1952.1 HTRA2 gene_id:27429|Hs108|chr2 ( 361) 375 71.1 2.2e-12 >>CCDS7630.1 HTRA1 gene_id:5654|Hs108|chr10 (480 aa) initn: 3174 init1: 3174 opt: 3174 Z-score: 2735.9 bits: 515.6 E(32554): 4.5e-146 Smith-Waterman score: 3174; 100.0% identity (100.0% similar) in 480 aa overlap (1-480:1-480) 10 20 30 40 50 60 pF1KB5 MQIPRAALLPLLLLLLAAPASAQLSRAGRSAPLAAGCPDRCEPARCPPQPEHCEGGRARD :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS76 MQIPRAALLPLLLLLLAAPASAQLSRAGRSAPLAAGCPDRCEPARCPPQPEHCEGGRARD 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KB5 ACGCCEVCGAPEGAACGLQEGPCGEGLQCVVPFGVPASATVRRRAQAGLCVCASSEPVCG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS76 ACGCCEVCGAPEGAACGLQEGPCGEGLQCVVPFGVPASATVRRRAQAGLCVCASSEPVCG 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KB5 SDANTYANLCQLRAASRRSERLHRPPVIVLQRGACGQGQEDPNSLRHKYNFIADVVEKIA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS76 SDANTYANLCQLRAASRRSERLHRPPVIVLQRGACGQGQEDPNSLRHKYNFIADVVEKIA 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KB5 PAVVHIELFRKLPFSKREVPVASGSGFIVSEDGLIVTNAHVVTNKHRVKVELKNGATYEA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS76 PAVVHIELFRKLPFSKREVPVASGSGFIVSEDGLIVTNAHVVTNKHRVKVELKNGATYEA 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KB5 KIKDVDEKADIALIKIDHQGKLPVLLLGRSSELRPGEFVVAIGSPFSLQNTVTTGIVSTT :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS76 KIKDVDEKADIALIKIDHQGKLPVLLLGRSSELRPGEFVVAIGSPFSLQNTVTTGIVSTT 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KB5 QRGGKELGLRNSDMDYIQTDAIINYGNSGGPLVNLDGEVIGINTLKVTAGISFAIPSDKI :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS76 QRGGKELGLRNSDMDYIQTDAIINYGNSGGPLVNLDGEVIGINTLKVTAGISFAIPSDKI 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 pF1KB5 KKFLTESHDRQAKGKAITKKKYIGIRMMSLTSSKAKELKDRHRDFPDVISGAYIIEVIPD :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS76 KKFLTESHDRQAKGKAITKKKYIGIRMMSLTSSKAKELKDRHRDFPDVISGAYIIEVIPD 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 pF1KB5 TPAEAGGLKENDVIISINGQSVVSANDVSDVIKRESTLNMVVRRGNEDIMITVIPEEIDP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS76 TPAEAGGLKENDVIISINGQSVVSANDVSDVIKRESTLNMVVRRGNEDIMITVIPEEIDP 430 440 450 460 470 480 >>CCDS6110.1 HTRA4 gene_id:203100|Hs108|chr8 (476 aa) initn: 1618 init1: 1221 opt: 1613 Z-score: 1396.6 bits: 267.8 E(32554): 1.8e-71 Smith-Waterman score: 1628; 52.8% identity (77.5% similar) in 479 aa overlap (8-479:15-476) 10 20 30 40 50 pF1KB5 MQIPRAALLPLLLLLLAAPASAQLSRAGRSAPLAAGCPDRCEPARCPPQPEHC ::: :::::. :. .. .. : .:: :.:.::: : : CCDS61 MIRPQLRTAGLGRCLLPGLLLLLV-PVLWAGAEKLHTQP---SCPAVCQPTRCPALPT-C 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 pF1KB5 EGGRAR--DACGCCEVCGAPEGAACGLQEG-PCGEGLQCVVPF--GVPASATVRRRAQAG : . : : ::.:: : : .:: .: ::. ::::. :. : :.. CCDS61 ALGTTPVFDLCRCCRVCPAAEREVCGGAQGQPCAPGLQCLQPLRPGFPST---------- 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 pF1KB5 LCVCAS-SEPVCGSDANTYANLCQLRAASRRSERLHRPPVIVLQRGACGQ-GQEDPNSLR : : . . ::::: :: ..: ::: .: ..:: . :.. .: : ::. : .. . :: CCDS61 -CGCPTLGGAVCGSDRRTYPSMCALRAENRAARRLGKVPAVPVQWGNCGDTGTRSAGPLR 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 pF1KB5 HKYNFIADVVEKIAPAVVHIELFRKLPFSKREVPVASGSGFIVSEDGLIVTNAHVVTNKH ..::::: ::::.::.:::..:. .: ..: ::: :::::::::::::.:::::: :.. CCDS61 RNYNFIAAVVEKVAPSVVHVQLWGRLLHGSRLVPVYSGSGFIVSEDGLIITNAHVVRNQQ 170 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 pF1KB5 RVKVELKNGATYEAKIKDVDEKADIALIKIDHQGKLPVLLLGRSSELRPGEFVVAIGSPF ..: :.::: ::: .::.: : :.:.:::. ...::::.:::::.:: ::::::.:::: CCDS61 WIEVVLQNGARYEAVVKDIDLKLDLAVIKIESNAELPVLMLGRSSDLRAGEFVVALGSPF 230 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 pF1KB5 SLQNTVTTGIVSTTQRGGKELGLRNSDMDYIQTDAIINYGNSGGPLVNLDGEVIGINTLK :::::.:.::::: ::::::::...:::::.: :: :::::::::::::::.:::.:.:. CCDS61 SLQNTATAGIVSTKQRGGKELGMKDSDMDYVQIDATINYGNSGGPLVNLDGDVIGVNSLR 290 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 pF1KB5 VTAGISFAIPSDKIKKFLTESHDRQAKGKAITKKKYIGIRMMSLTSSKAKELKDRHRDFP :: :::::::::....::.: :..: ::::...:::.:..:.::: ..::: .. ::: CCDS61 VTDGISFAIPSDRVRQFLAEYHEHQMKGKAFSNKKYLGLQMLSLTVPLSEELKMHYPDFP 350 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 pF1KB5 DVISGAYIIEVIPDTPAEAGGLKENDVIISINGQSVVSANDVSDVIKRESTLNMVVRRGN :: ::.:. .:. : :...::...:::..:::. .....:: .. .: :.:.: ::. CCDS61 DVSSGVYVCKVVEGTAAQSSGLRDHDVIVNINGKPITTTTDVVKALDSDS-LSMAVLRGK 410 420 430 440 450 460 470 480 pF1KB5 EDIMITVIPEEIDP .....::::: :. CCDS61 DNLLLTVIPETIN 470 >>CCDS3400.1 HTRA3 gene_id:94031|Hs108|chr4 (453 aa) initn: 1739 init1: 753 opt: 1547 Z-score: 1340.2 bits: 257.3 E(32554): 2.5e-68 Smith-Waterman score: 1716; 57.4% identity (78.0% similar) in 472 aa overlap (14-478:6-452) 10 20 30 40 50 60 pF1KB5 MQIPRAALLPLLLLLLAAPASAQLSRAGRSAPLAAGCPDRCEPARCPPQPEHCEGGRARD ::::: :. :.: : :: :: ::. .::: .:. : :: . : CCDS34 MQARALLLAALAALALARE----PPAAPCPARCDVSRCP-SPR-CPGGYVPD 10 20 30 40 70 80 90 100 110 pF1KB5 ACGCCEVCGAPEGAACGLQ-EGPCGEGLQCVVPFGVPASATVRRRAQAGLCVCASSEPVC :.:: ::.: :: :: ..::::.:.:: ::: : :. :: CCDS34 LCNCCLVCAASEGEPCGGPLDSPCGESLECV----------------RGLCRCRWSHAVC 50 60 70 80 90 120 130 140 150 160 170 pF1KB5 GSDANTYANLCQLRAASRRSERLHRPPVIVLQRGACGQGQEDPNSLRHKYNFIADVVEKI :.:..::::.: :.:::::. .: :: ::.::: : .. .: :.:.:::::::::: CCDS34 GTDGHTYANVCALQAASRRALQLSGTPVRQLQKGACPLGLHQLSSPRYKFNFIADVVEKI 100 110 120 130 140 150 180 190 200 210 220 230 pF1KB5 APAVVHIELFRKLPFSKREVPVASGSGFIVSEDGLIVTNAHVVTN------KHRVKVELK :::::::::: . :. :.::..::::::.:: :::.::::::.. ....::.:. CCDS34 APAVVHIELFLRHPLFGRNVPLSSGSGFIMSEAGLIITNAHVVSSNSAAPGRQQLKVQLQ 160 170 180 190 200 210 240 250 260 270 280 290 pF1KB5 NGATYEAKIKDVDEKADIALIKIDHQGKLPVLLLGRSSELRPGEFVVAIGSPFSLQNTVT :: .::: :::.:.:.::: ::: . ::::::::.:..::::::::::::::.:::::: CCDS34 NGDSYEATIKDIDKKSDIATIKIHPKKKLPVLLLGHSADLRPGEFVVAIGSPFALQNTVT 220 230 240 250 260 270 300 310 320 330 340 350 pF1KB5 TGIVSTTQRGGKELGLRNSDMDYIQTDAIINYGNSGGPLVNLDGEVIGINTLKVTAGISF ::::::.:: :.:::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS34 TGIVSTAQREGRELGLRDSDMDYIQTDAIINYGNSGGPLVNLDGEVIGINTLKVTAGISF 280 290 300 310 320 330 360 370 380 390 400 410 pF1KB5 AIPSDKIKKFLTESHDRQAKGKAITKKKYIGIRMMSLTSSKAKELKDRHRDFPDVISGAY :::::.: .:::: .:.: : ::..::::: ..: : . ::: . :::.: :: : CCDS34 AIPSDRITRFLTEFQDKQIKDW---KKRFIGIRMRTITPSLVDELKASNPDFPEVSSGIY 340 350 360 370 380 420 430 440 450 460 470 pF1KB5 IIEVIPDTPAEAGGLKENDVIISINGQSVVSANDVSDVIKRESTLNMVVRRGNEDIMITV . :: :..:.. ::....:.:...::. .:......... :: : . :::::.:..... CCDS34 VQEVAPNSPSQRGGIQDGDIIVKVNGRPLVDSSELQEAVLTESPLLLEVRRGNDDLLFSI 390 400 410 420 430 440 480 pF1KB5 IPEEIDP :: . CCDS34 APEVVM 450 >>CCDS75105.1 HTRA3 gene_id:94031|Hs108|chr4 (357 aa) initn: 1442 init1: 755 opt: 1256 Z-score: 1091.7 bits: 211.0 E(32554): 1.7e-54 Smith-Waterman score: 1425; 62.0% identity (78.4% similar) in 371 aa overlap (14-377:6-354) 10 20 30 40 50 60 pF1KB5 MQIPRAALLPLLLLLLAAPASAQLSRAGRSAPLAAGCPDRCEPARCPPQPEHCEGGRARD ::::: :. :.: : :: :: ::. .::: .:. : :: . : CCDS75 MQARALLLAALAALALARE----PPAAPCPARCDVSRCP-SPR-CPGGYVPD 10 20 30 40 70 80 90 100 110 pF1KB5 ACGCCEVCGAPEGAACGLQ-EGPCGEGLQCVVPFGVPASATVRRRAQAGLCVCASSEPVC :.:: ::.: :: :: ..::::.:.:: ::: : :. :: CCDS75 LCNCCLVCAASEGEPCGGPLDSPCGESLECV----------------RGLCRCRWSHAVC 50 60 70 80 90 120 130 140 150 160 170 pF1KB5 GSDANTYANLCQLRAASRRSERLHRPPVIVLQRGACGQGQEDPNSLRHKYNFIADVVEKI :.:..::::.: :.:::::. .: :: ::.::: : .. .: :.:.:::::::::: CCDS75 GTDGHTYANVCALQAASRRALQLSGTPVRQLQKGACPLGLHQLSSPRYKFNFIADVVEKI 100 110 120 130 140 150 180 190 200 210 220 230 pF1KB5 APAVVHIELFRKLPFSKREVPVASGSGFIVSEDGLIVTNAHVVTN------KHRVKVELK :::::::::: . :. :.::..::::::.:: :::.::::::.. ....::.:. CCDS75 APAVVHIELFLRHPLFGRNVPLSSGSGFIMSEAGLIITNAHVVSSNSAAPGRQQLKVQLQ 160 170 180 190 200 210 240 250 260 270 280 290 pF1KB5 NGATYEAKIKDVDEKADIALIKIDHQGKLPVLLLGRSSELRPGEFVVAIGSPFSLQNTVT :: .::: :::.:.:.::: ::: . ::::::::.:..::::::::::::::.:::::: CCDS75 NGDSYEATIKDIDKKSDIATIKIHPKKKLPVLLLGHSADLRPGEFVVAIGSPFALQNTVT 220 230 240 250 260 270 300 310 320 330 340 350 pF1KB5 TGIVSTTQRGGKELGLRNSDMDYIQTDAIINYGNSGGPLVNLDGEVIGINTLKVTAGISF ::::::.:: :.:::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS75 TGIVSTAQREGRELGLRDSDMDYIQTDAIINYGNSGGPLVNLDGEVIGINTLKVTAGISF 280 290 300 310 320 330 360 370 380 390 400 410 pF1KB5 AIPSDKIKKFLTESHDRQAKGKAITKKKYIGIRMMSLTSSKAKELKDRHRDFPDVISGAY :::::.: .:::: .:.: :. .. CCDS75 AIPSDRITRFLTEFQDKQIKAPSLAVH 340 350 >>CCDS1951.1 HTRA2 gene_id:27429|Hs108|chr2 (458 aa) initn: 1103 init1: 869 opt: 1107 Z-score: 962.7 bits: 187.5 E(32554): 2.7e-47 Smith-Waterman score: 1107; 53.8% identity (81.6% similar) in 316 aa overlap (162-476:140-455) 140 150 160 170 180 190 pF1KB5 LRAASRRSERLHRPPVIVLQRGACGQGQEDPNSLRHKYNFIADVVEKIAPAVVHIELFRK : : : .:::::::::: :::::.::.. . CCDS19 ALGAGGAVLLLLWGGGRGPPAVLAAVPSPPPASPRSQYNFIADVVEKTAPAVVYIEILDR 110 120 130 140 150 160 200 210 220 230 240 250 pF1KB5 LPFSKREVPVASGSGFIVSEDGLIVTNAHVVTNKHRVKVELKNGATYEAKIKDVDEKADI :: ::::...::::.:. :::::::::::....::.:.: .: :::: . :: ::: CCDS19 HPFLGREVPISNGSGFVVAADGLIVTNAHVVADRRRVRVRLLSGDTYEAVVTAVDPVADI 170 180 190 200 210 220 260 270 280 290 300 310 pF1KB5 ALIKIDHQGKLPVLLLGRSSELRPGEFVVAIGSPFSLQNTVTTGIVSTTQRGGKELGLRN : ..:. . ::.: ::::...: ::::::.::::.::::.:.::::..:: ...::: . 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CCDS19 SSSGISGSQRRYIGVMMLTLSPSILAELQLREPSFPDVQHGVLIHKVILGSPAHRAGLRP 350 360 370 380 390 400 440 450 460 470 480 pF1KB5 NDVIISINGQSVVSANDVSDVIKRESTLNMVVRRGNEDIMITVIPEEIDP .:::..:. : : .:.:: .... .: : . .::: : . . : :: CCDS19 GDVILAIGEQMVQNAEDVYEAVRTQSQLAVQIRRGRETLTLYVTPEVTE 410 420 430 440 450 >>CCDS58900.1 IGFBP7 gene_id:3490|Hs108|chr4 (279 aa) initn: 376 init1: 191 opt: 377 Z-score: 338.7 bits: 71.3 E(32554): 1.5e-12 Smith-Waterman score: 377; 41.1% identity (58.9% similar) in 168 aa overlap (1-158:1-159) 10 20 30 40 50 pF1KB5 MQIP--RAALLPLL-LLLLAAPASAQLSRAGRSAPLAAGCPDRCEPARCPPQPE-HCEGG :. : :: :: :::: : :.. : . .: :::: ::: : : : CCDS58 MERPSLRALLLGAAGLLLLLLPLSSS-SSSDTCGP--------CEPASCPPLPPLGCLLG 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KB5 RARDACGCCEVCGAPEGAACG---LQEGPCGEGLQCVVPFGV---PASATVRRRAQAGLC ..::::::: .:. :: :: .: :. :..:: :.:.. . .:.: CCDS58 ETRDACGCCPMCARGEGEPCGGGGAGRGYCAPGMECVKSRKRRKGKAGAAAGGPGVSGVC 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KB5 VCASSEPVCGSDANTYANLCQLRAASRRSERLHRPPVIVLQRGACGQGQEDPNSLRHKYN :: : ::::::..:: . :::::::.:.: . . ...:.: :: CCDS58 VCKSRYPVCGSDGTTYPSGCQLRAASQRAESRGEKAITQVSKGTCEQGPSIVTPPKDIWN 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KB5 FIADVVEKIAPAVVHIELFRKLPFSKREVPVASGSGFIVSEDGLIVTNAHVVTNKHRVKV CCDS58 VTGAQVYLSCEVIGIPTPVLIWNKVKRGHYGVQRTELLPGDRDNLAIQTRGGPEKHEVTG 180 190 200 210 220 230 >>CCDS3512.1 IGFBP7 gene_id:3490|Hs108|chr4 (282 aa) initn: 376 init1: 191 opt: 377 Z-score: 338.7 bits: 71.3 E(32554): 1.5e-12 Smith-Waterman score: 377; 41.1% identity (58.9% similar) in 168 aa overlap (1-158:1-159) 10 20 30 40 50 pF1KB5 MQIP--RAALLPLL-LLLLAAPASAQLSRAGRSAPLAAGCPDRCEPARCPPQPE-HCEGG :. : :: :: :::: : :.. : . .: :::: ::: : : : CCDS35 MERPSLRALLLGAAGLLLLLLPLSSS-SSSDTCGP--------CEPASCPPLPPLGCLLG 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KB5 RARDACGCCEVCGAPEGAACG---LQEGPCGEGLQCVVPFGV---PASATVRRRAQAGLC ..::::::: .:. :: :: .: :. :..:: :.:.. . .:.: CCDS35 ETRDACGCCPMCARGEGEPCGGGGAGRGYCAPGMECVKSRKRRKGKAGAAAGGPGVSGVC 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KB5 VCASSEPVCGSDANTYANLCQLRAASRRSERLHRPPVIVLQRGACGQGQEDPNSLRHKYN :: : ::::::..:: . :::::::.:.: . . ...:.: :: CCDS35 VCKSRYPVCGSDGTTYPSGCQLRAASQRAESRGEKAITQVSKGTCEQGPSIVTPPKDIWN 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KB5 FIADVVEKIAPAVVHIELFRKLPFSKREVPVASGSGFIVSEDGLIVTNAHVVTNKHRVKV CCDS35 VTGAQVYLSCEVIGIPTPVLIWNKVKRGHYGVQRTELLPGDRDNLAIQTRGGPEKHEVTG 180 190 200 210 220 230 >>CCDS1952.1 HTRA2 gene_id:27429|Hs108|chr2 (361 aa) initn: 691 init1: 356 opt: 375 Z-score: 335.8 bits: 71.1 E(32554): 2.2e-12 Smith-Waterman score: 567; 38.3% identity (57.3% similar) in 316 aa overlap (162-476:140-358) 140 150 160 170 180 190 pF1KB5 LRAASRRSERLHRPPVIVLQRGACGQGQEDPNSLRHKYNFIADVVEKIAPAVVHIELFRK : : : .:::::::::: :::::.::.. . 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