FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB6196, 706 aa 1>>>pF1KB6196 706 - 706 aa - 706 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 11.0406+/-0.000391; mu= -1.9690+/- 0.025 mean_var=449.4223+/-93.370, 0's: 0 Z-trim(124.8): 65 B-trim: 0 in 0/59 Lambda= 0.060499 statistics sampled from 47104 (47199) to 47104 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.805), E-opt: 0.2 (0.553), width: 16 Scan time: 15.380 The best scores are: opt bits E(85289) NP_542937 (OMIM: 603803) dachshund homolog 1 isofo ( 706) 4597 415.7 3.1e-115 XP_011533242 (OMIM: 603803) PREDICTED: dachshund h ( 614) 2507 233.2 2.3e-60 XP_011533241 (OMIM: 603803) PREDICTED: dachshund h ( 758) 2507 233.3 2.7e-60 XP_011533243 (OMIM: 603803) PREDICTED: dachshund h ( 379) 2466 229.4 2e-59 NP_542938 (OMIM: 603803) dachshund homolog 1 isofo ( 558) 2462 229.2 3.3e-59 XP_011533244 (OMIM: 603803) PREDICTED: dachshund h ( 365) 2358 220.0 1.3e-56 XP_016875885 (OMIM: 603803) PREDICTED: dachshund h ( 417) 2139 200.9 8.3e-51 NP_004383 (OMIM: 603803) dachshund homolog 1 isofo ( 504) 2136 200.7 1.1e-50 XP_016884744 (OMIM: 300608) PREDICTED: dachshund h ( 586) 1439 140.0 2.6e-32 NP_001132986 (OMIM: 300608) dachshund homolog 2 is ( 571) 1430 139.2 4.4e-32 XP_016884745 (OMIM: 300608) PREDICTED: dachshund h ( 571) 1430 139.2 4.4e-32 XP_016884743 (OMIM: 300608) PREDICTED: dachshund h ( 596) 1409 137.4 1.6e-31 NP_001132987 (OMIM: 300608) dachshund homolog 2 is ( 432) 943 96.5 2.3e-19 NP_444511 (OMIM: 300608) dachshund homolog 2 isofo ( 599) 943 96.7 2.8e-19 XP_011529150 (OMIM: 300608) PREDICTED: dachshund h ( 584) 934 95.9 4.8e-19 XP_011529149 (OMIM: 300608) PREDICTED: dachshund h ( 594) 771 81.7 9.3e-15 XP_011529148 (OMIM: 300608) PREDICTED: dachshund h ( 609) 771 81.7 9.4e-15 >>NP_542937 (OMIM: 603803) dachshund homolog 1 isoform a (706 aa) initn: 4597 init1: 4597 opt: 4597 Z-score: 2189.8 bits: 415.7 E(85289): 3.1e-115 Smith-Waterman score: 4597; 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