Result of FASTA (omim) for pFN21AE1926
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KE1926, 464 aa
  1>>>pF1KE1926 464 - 464 aa - 464 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
  60827320 residues in 85289 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.2236+/-0.000471; mu= 18.4081+/- 0.029
 mean_var=67.6552+/-13.609, 0's: 0 Z-trim(109.0): 133  B-trim: 0 in 0/50
 Lambda= 0.155928
 statistics sampled from 16987 (17125) to 16987 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.563), E-opt: 0.2 (0.201), width:  16
 Scan time:  8.410

The best scores are:                                      opt bits E(85289)
NP_000479 (OMIM: 107300,613118) antithrombin-III p ( 464) 3037 692.7 5.5e-199
XP_005245255 (OMIM: 107300,613118) PREDICTED: anti ( 416) 2702 617.3 2.4e-176
XP_011512636 (OMIM: 130135) PREDICTED: leukocyte e ( 379)  881 207.6 4.7e-53
XP_011512635 (OMIM: 130135) PREDICTED: leukocyte e ( 379)  881 207.6 4.7e-53
NP_109591 (OMIM: 130135) leukocyte elastase inhibi ( 379)  881 207.6 4.7e-53
NP_001258751 (OMIM: 173321,613453) serpin B6 isofo ( 390)  836 197.5 5.3e-50
NP_004559 (OMIM: 173321,613453) serpin B6 isoform  ( 376)  827 195.5 2.1e-49
NP_001258754 (OMIM: 173321,613453) serpin B6 isofo ( 376)  827 195.5 2.1e-49
XP_011512976 (OMIM: 173321,613453) PREDICTED: serp ( 376)  827 195.5 2.1e-49
XP_011512975 (OMIM: 173321,613453) PREDICTED: serp ( 376)  827 195.5 2.1e-49
NP_001258753 (OMIM: 173321,613453) serpin B6 isofo ( 376)  827 195.5 2.1e-49
NP_001284629 (OMIM: 173321,613453) serpin B6 isofo ( 376)  827 195.5 2.1e-49
NP_001284628 (OMIM: 173321,613453) serpin B6 isofo ( 376)  827 195.5 2.1e-49
NP_001182220 (OMIM: 173321,613453) serpin B6 isofo ( 380)  827 195.5 2.1e-49
XP_016866429 (OMIM: 173321,613453) PREDICTED: serp ( 380)  827 195.5 2.1e-49
NP_001258752 (OMIM: 173321,613453) serpin B6 isofo ( 395)  827 195.5 2.2e-49
XP_011512974 (OMIM: 173321,613453) PREDICTED: serp ( 454)  827 195.5 2.5e-49
NP_002631 (OMIM: 601697,617115) serpin B8 isoform  ( 374)  811 191.9 2.5e-48
NP_942130 (OMIM: 601697,617115) serpin B8 isoform  ( 374)  811 191.9 2.5e-48
NP_536723 (OMIM: 615682) serpin B11 isoform a [Hom ( 392)  782 185.4 2.4e-46
XP_011524553 (OMIM: 615682) PREDICTED: serpin B11  ( 392)  782 185.4 2.4e-46
XP_005249241 (OMIM: 601799) PREDICTED: serpin B9 i ( 376)  781 185.1 2.7e-46
NP_004146 (OMIM: 601799) serpin B9 [Homo sapiens]  ( 376)  781 185.1 2.7e-46
NP_008850 (OMIM: 600517) serpin B3 [Homo sapiens]  ( 390)  774 183.6 8.4e-46
NP_002965 (OMIM: 600518) serpin B4 isoform 1 [Homo ( 390)  764 181.3   4e-45
XP_011524440 (OMIM: 600518) PREDICTED: serpin B4 i ( 390)  764 181.3   4e-45
XP_011512637 (OMIM: 130135) PREDICTED: leukocyte e ( 330)  744 176.8 7.9e-44
NP_003775 (OMIM: 603357,615598) serpin B7 isoform  ( 380)  736 175.0 3.1e-43
NP_001035237 (OMIM: 603357,615598) serpin B7 isofo ( 380)  736 175.0 3.1e-43
NP_001248759 (OMIM: 603357,615598) serpin B7 isofo ( 380)  736 175.0 3.1e-43
NP_005016 (OMIM: 602445,604218) neuroserpin precur ( 410)  731 173.9 7.2e-43
XP_016862107 (OMIM: 602445,604218) PREDICTED: neur ( 410)  731 173.9 7.2e-43
NP_001116224 (OMIM: 602445,604218) neuroserpin pre ( 410)  731 173.9 7.2e-43
XP_011524329 (OMIM: 602058) PREDICTED: serpin B10  ( 397)  720 171.4 3.9e-42
NP_005015 (OMIM: 602058) serpin B10 [Homo sapiens] ( 397)  720 171.4 3.9e-42
XP_016866430 (OMIM: 173321,613453) PREDICTED: serp ( 332)  714 170.0 8.5e-42
XP_011512978 (OMIM: 173321,613453) PREDICTED: serp ( 332)  714 170.0 8.5e-42
NP_006208 (OMIM: 605587) serpin I2 isoform 2 precu ( 405)  707 168.5   3e-41
NP_001012303 (OMIM: 605587) serpin I2 isoform 1 pr ( 415)  707 168.5 3.1e-41
XP_011524331 (OMIM: 604445) PREDICTED: serpin B13  ( 390)  703 167.6 5.4e-41
NP_036529 (OMIM: 604445) serpin B13 isoform 2 [Hom ( 391)  703 167.6 5.4e-41
NP_001294852 (OMIM: 604445) serpin B13 isoform 1 [ ( 400)  703 167.6 5.5e-41
XP_011512980 (OMIM: 601799) PREDICTED: serpin B9 i ( 325)  684 163.3   9e-40
XP_016866431 (OMIM: 601799) PREDICTED: serpin B9 i ( 325)  684 163.3   9e-40
XP_016866432 (OMIM: 601799) PREDICTED: serpin B9 i ( 325)  684 163.3   9e-40
NP_536722 (OMIM: 615662) serpin B12 isoform 2 [Hom ( 405)  670 160.2 9.6e-39
XP_016881556 (OMIM: 615662) PREDICTED: serpin B12  ( 425)  670 160.2   1e-38
XP_011524551 (OMIM: 615662) PREDICTED: serpin B12  ( 425)  670 160.2   1e-38
NP_001294857 (OMIM: 615662) serpin B12 isoform 1 [ ( 425)  670 160.2   1e-38
XP_011524550 (OMIM: 615662) PREDICTED: serpin B12  ( 425)  670 160.2   1e-38


>>NP_000479 (OMIM: 107300,613118) antithrombin-III precu  (464 aa)
 initn: 3037 init1: 3037 opt: 3037  Z-score: 3693.4  bits: 692.7 E(85289): 5.5e-199
Smith-Waterman score: 3037; 100.0% identity (100.0% similar) in 464 aa overlap (1-464:1-464)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE1 MYSNVIGTVTSGKRKVYLLSLLLIGFWDCVTCHGSPVDICTAKPRDIPMNPMCIYRSPEK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 MYSNVIGTVTSGKRKVYLLSLLLIGFWDCVTCHGSPVDICTAKPRDIPMNPMCIYRSPEK
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE1 KATEDEGSEQKIPEATNRRVWELSKANSRFATTFYQHLADSKNDNDNIFLSPLSISTAFA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 KATEDEGSEQKIPEATNRRVWELSKANSRFATTFYQHLADSKNDNDNIFLSPLSISTAFA
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE1 MTKLGACNDTLQQLMEVFKFDTISEKTSDQIHFFFAKLNCRLYRKANKSSKLVSANRLFG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 MTKLGACNDTLQQLMEVFKFDTISEKTSDQIHFFFAKLNCRLYRKANKSSKLVSANRLFG
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE1 DKSLTFNETYQDISELVYGAKLQPLDFKENAEQSRAAINKWVSNKTEGRITDVIPSEAIN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 DKSLTFNETYQDISELVYGAKLQPLDFKENAEQSRAAINKWVSNKTEGRITDVIPSEAIN
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE1 ELTVLVLVNTIYFKGLWKSKFSPENTRKELFYKADGESCSASMMYQEGKFRYRRVAEGTQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 ELTVLVLVNTIYFKGLWKSKFSPENTRKELFYKADGESCSASMMYQEGKFRYRRVAEGTQ
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE1 VLELPFKGDDITMVLILPKPEKSLAKVEKELTPEVLQEWLDELEEMMLVVHMPRFRIEDG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 VLELPFKGDDITMVLILPKPEKSLAKVEKELTPEVLQEWLDELEEMMLVVHMPRFRIEDG
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KE1 FSLKEQLQDMGLVDLFSPEKSKLPGIVAEGRDDLYVSDAFHKAFLEVNEEGSEAAASTAV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 FSLKEQLQDMGLVDLFSPEKSKLPGIVAEGRDDLYVSDAFHKAFLEVNEEGSEAAASTAV
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460    
pF1KE1 VIAGRSLNPNRVTFKANRPFLVFIREVPLNTIIFMGRVANPCVK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 VIAGRSLNPNRVTFKANRPFLVFIREVPLNTIIFMGRVANPCVK
              430       440       450       460    

>>XP_005245255 (OMIM: 107300,613118) PREDICTED: antithro  (416 aa)
 initn: 2702 init1: 2702 opt: 2702  Z-score: 3286.8  bits: 617.3 E(85289): 2.4e-176
Smith-Waterman score: 2702; 100.0% identity (100.0% similar) in 416 aa overlap (49-464:1-416)

       20        30        40        50        60        70        
pF1KE1 LSLLLIGFWDCVTCHGSPVDICTAKPRDIPMNPMCIYRSPEKKATEDEGSEQKIPEATNR
                                     ::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005                               MNPMCIYRSPEKKATEDEGSEQKIPEATNR
                                             10        20        30

       80        90       100       110       120       130        
pF1KE1 RVWELSKANSRFATTFYQHLADSKNDNDNIFLSPLSISTAFAMTKLGACNDTLQQLMEVF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 RVWELSKANSRFATTFYQHLADSKNDNDNIFLSPLSISTAFAMTKLGACNDTLQQLMEVF
               40        50        60        70        80        90

      140       150       160       170       180       190        
pF1KE1 KFDTISEKTSDQIHFFFAKLNCRLYRKANKSSKLVSANRLFGDKSLTFNETYQDISELVY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 KFDTISEKTSDQIHFFFAKLNCRLYRKANKSSKLVSANRLFGDKSLTFNETYQDISELVY
              100       110       120       130       140       150

      200       210       220       230       240       250        
pF1KE1 GAKLQPLDFKENAEQSRAAINKWVSNKTEGRITDVIPSEAINELTVLVLVNTIYFKGLWK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 GAKLQPLDFKENAEQSRAAINKWVSNKTEGRITDVIPSEAINELTVLVLVNTIYFKGLWK
              160       170       180       190       200       210

      260       270       280       290       300       310        
pF1KE1 SKFSPENTRKELFYKADGESCSASMMYQEGKFRYRRVAEGTQVLELPFKGDDITMVLILP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 SKFSPENTRKELFYKADGESCSASMMYQEGKFRYRRVAEGTQVLELPFKGDDITMVLILP
              220       230       240       250       260       270

      320       330       340       350       360       370        
pF1KE1 KPEKSLAKVEKELTPEVLQEWLDELEEMMLVVHMPRFRIEDGFSLKEQLQDMGLVDLFSP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 KPEKSLAKVEKELTPEVLQEWLDELEEMMLVVHMPRFRIEDGFSLKEQLQDMGLVDLFSP
              280       290       300       310       320       330

      380       390       400       410       420       430        
pF1KE1 EKSKLPGIVAEGRDDLYVSDAFHKAFLEVNEEGSEAAASTAVVIAGRSLNPNRVTFKANR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 EKSKLPGIVAEGRDDLYVSDAFHKAFLEVNEEGSEAAASTAVVIAGRSLNPNRVTFKANR
              340       350       360       370       380       390

      440       450       460    
pF1KE1 PFLVFIREVPLNTIIFMGRVANPCVK
       ::::::::::::::::::::::::::
XP_005 PFLVFIREVPLNTIIFMGRVANPCVK
              400       410      

>>XP_011512636 (OMIM: 130135) PREDICTED: leukocyte elast  (379 aa)
 initn: 821 init1: 319 opt: 881  Z-score: 1073.5  bits: 207.6 E(85289): 4.7e-53
Smith-Waterman score: 881; 39.3% identity (70.3% similar) in 387 aa overlap (82-461:3-379)

              60        70        80        90       100       110 
pF1KE1 MCIYRSPEKKATEDEGSEQKIPEATNRRVWELSKANSRFATTFYQHLADSKNDNDNIFLS
                                     .::.::.:::  ..  :... :   :::.:
XP_011                             MEQLSSANTRFALDLFLALSEN-NPAGNIFIS
                                           10        20         30 

             120       130       140       150       160       170 
pF1KE1 PLSISTAFAMTKLGACNDTLQQLMEVFKFDTISEKTSDQIHFFFAKLNCRLYRKANKSSK
       :.:::.:.::. ::. ..:  :: ..:.:.:. :     .:  : .::  . ...  :  
XP_011 PFSISSAMAMVFLGTRGNTAAQLSKTFHFNTVEE-----VHSRFQSLNADINKRGA-SYI
              40        50        60             70        80      

             180       190       200       210       220       230 
pF1KE1 LVSANRLFGDKSLTFNETYQDISELVYGAKLQPLDFKENAEQSRAAINKWVSNKTEGRIT
       :  ::::.:.:. .:   .   .. .::: :  .::.. .:..: .::.::...:::.: 
XP_011 LKLANRLYGEKTYNFLPEFLVSTQKTYGADLASVDFQHASEDARKTINQWVKGQTEGKIP
          90       100       110       120       130       140     

             240       250       260       270       280       290 
pF1KE1 DVIPSEAINELTVLVLVNTIYFKGLWKSKFSPENTRKELFYKADGESCSASMMYQEGKFR
       ... :  ....: :::::.::::: ::.::  : : .  :     .  ...::::. :: 
XP_011 ELLASGMVDNMTKLVLVNAIYFKGNWKDKFMKEATTNAPFRLNKKDRKTVKMMYQKKKFA
         150       160       170       180       190       200     

              300       310          320        330       340      
pF1KE1 YRRVAE-GTQVLELPFKGDDITMVLILP---KPEKS-LAKVEKELTPEVLQEWL--DELE
       :  . .   .:::::..:....::..::   . :.. : :.:..:: : :.::   ..:.
XP_011 YGYIEDLKCRVLELPYQGEELSMVILLPDDIEDESTGLKKIEEQLTLEKLHEWTKPENLD
         210       220       230       240       250       260     

          350       360       370       380       390       400    
pF1KE1 EMMLVVHMPRFRIEDGFSLKEQLQDMGLVDLFSPEKSKLPGIVAEGRDDLYVSDAFHKAF
        . . : .:::..:....:. .:  .:. :::.  :. : :.   :  :...:   ::.:
XP_011 FIEVNVSLPRFKLEESYTLNSDLARLGVQDLFNSSKADLSGM--SGARDIFISKIVHKSF
         270       280       290       300         310       320   

          410       420       430       440       450       460    
pF1KE1 LEVNEEGSEAAASTAVVIAGRSLNPNRVTFKANRPFLVFIREVPLNTIIFMGRVANPCVK
       .::::::.::::.:: . .   : :.. .: :..::: :::.   ..:.:.:: ..:   
XP_011 VEVNEEGTEAAAATAGIATFCMLMPEE-NFTADHPFLFFIRHNSSGSILFLGRFSSP   
           330       340       350        360       370            

>>XP_011512635 (OMIM: 130135) PREDICTED: leukocyte elast  (379 aa)
 initn: 821 init1: 319 opt: 881  Z-score: 1073.5  bits: 207.6 E(85289): 4.7e-53
Smith-Waterman score: 881; 39.3% identity (70.3% similar) in 387 aa overlap (82-461:3-379)

              60        70        80        90       100       110 
pF1KE1 MCIYRSPEKKATEDEGSEQKIPEATNRRVWELSKANSRFATTFYQHLADSKNDNDNIFLS
                                     .::.::.:::  ..  :... :   :::.:
XP_011                             MEQLSSANTRFALDLFLALSEN-NPAGNIFIS
                                           10        20         30 

             120       130       140       150       160       170 
pF1KE1 PLSISTAFAMTKLGACNDTLQQLMEVFKFDTISEKTSDQIHFFFAKLNCRLYRKANKSSK
       :.:::.:.::. ::. ..:  :: ..:.:.:. :     .:  : .::  . ...  :  
XP_011 PFSISSAMAMVFLGTRGNTAAQLSKTFHFNTVEE-----VHSRFQSLNADINKRGA-SYI
              40        50        60             70        80      

             180       190       200       210       220       230 
pF1KE1 LVSANRLFGDKSLTFNETYQDISELVYGAKLQPLDFKENAEQSRAAINKWVSNKTEGRIT
       :  ::::.:.:. .:   .   .. .::: :  .::.. .:..: .::.::...:::.: 
XP_011 LKLANRLYGEKTYNFLPEFLVSTQKTYGADLASVDFQHASEDARKTINQWVKGQTEGKIP
          90       100       110       120       130       140     

             240       250       260       270       280       290 
pF1KE1 DVIPSEAINELTVLVLVNTIYFKGLWKSKFSPENTRKELFYKADGESCSASMMYQEGKFR
       ... :  ....: :::::.::::: ::.::  : : .  :     .  ...::::. :: 
XP_011 ELLASGMVDNMTKLVLVNAIYFKGNWKDKFMKEATTNAPFRLNKKDRKTVKMMYQKKKFA
         150       160       170       180       190       200     

              300       310          320        330       340      
pF1KE1 YRRVAE-GTQVLELPFKGDDITMVLILP---KPEKS-LAKVEKELTPEVLQEWL--DELE
       :  . .   .:::::..:....::..::   . :.. : :.:..:: : :.::   ..:.
XP_011 YGYIEDLKCRVLELPYQGEELSMVILLPDDIEDESTGLKKIEEQLTLEKLHEWTKPENLD
         210       220       230       240       250       260     

          350       360       370       380       390       400    
pF1KE1 EMMLVVHMPRFRIEDGFSLKEQLQDMGLVDLFSPEKSKLPGIVAEGRDDLYVSDAFHKAF
        . . : .:::..:....:. .:  .:. :::.  :. : :.   :  :...:   ::.:
XP_011 FIEVNVSLPRFKLEESYTLNSDLARLGVQDLFNSSKADLSGM--SGARDIFISKIVHKSF
         270       280       290       300         310       320   

          410       420       430       440       450       460    
pF1KE1 LEVNEEGSEAAASTAVVIAGRSLNPNRVTFKANRPFLVFIREVPLNTIIFMGRVANPCVK
       .::::::.::::.:: . .   : :.. .: :..::: :::.   ..:.:.:: ..:   
XP_011 VEVNEEGTEAAAATAGIATFCMLMPEE-NFTADHPFLFFIRHNSSGSILFLGRFSSP   
           330       340       350        360       370            

>>NP_109591 (OMIM: 130135) leukocyte elastase inhibitor   (379 aa)
 initn: 821 init1: 319 opt: 881  Z-score: 1073.5  bits: 207.6 E(85289): 4.7e-53
Smith-Waterman score: 881; 39.3% identity (70.3% similar) in 387 aa overlap (82-461:3-379)

              60        70        80        90       100       110 
pF1KE1 MCIYRSPEKKATEDEGSEQKIPEATNRRVWELSKANSRFATTFYQHLADSKNDNDNIFLS
                                     .::.::.:::  ..  :... :   :::.:
NP_109                             MEQLSSANTRFALDLFLALSEN-NPAGNIFIS
                                           10        20         30 

             120       130       140       150       160       170 
pF1KE1 PLSISTAFAMTKLGACNDTLQQLMEVFKFDTISEKTSDQIHFFFAKLNCRLYRKANKSSK
       :.:::.:.::. ::. ..:  :: ..:.:.:. :     .:  : .::  . ...  :  
NP_109 PFSISSAMAMVFLGTRGNTAAQLSKTFHFNTVEE-----VHSRFQSLNADINKRGA-SYI
              40        50        60             70        80      

             180       190       200       210       220       230 
pF1KE1 LVSANRLFGDKSLTFNETYQDISELVYGAKLQPLDFKENAEQSRAAINKWVSNKTEGRIT
       :  ::::.:.:. .:   .   .. .::: :  .::.. .:..: .::.::...:::.: 
NP_109 LKLANRLYGEKTYNFLPEFLVSTQKTYGADLASVDFQHASEDARKTINQWVKGQTEGKIP
          90       100       110       120       130       140     

             240       250       260       270       280       290 
pF1KE1 DVIPSEAINELTVLVLVNTIYFKGLWKSKFSPENTRKELFYKADGESCSASMMYQEGKFR
       ... :  ....: :::::.::::: ::.::  : : .  :     .  ...::::. :: 
NP_109 ELLASGMVDNMTKLVLVNAIYFKGNWKDKFMKEATTNAPFRLNKKDRKTVKMMYQKKKFA
         150       160       170       180       190       200     

              300       310          320        330       340      
pF1KE1 YRRVAE-GTQVLELPFKGDDITMVLILP---KPEKS-LAKVEKELTPEVLQEWL--DELE
       :  . .   .:::::..:....::..::   . :.. : :.:..:: : :.::   ..:.
NP_109 YGYIEDLKCRVLELPYQGEELSMVILLPDDIEDESTGLKKIEEQLTLEKLHEWTKPENLD
         210       220       230       240       250       260     

          350       360       370       380       390       400    
pF1KE1 EMMLVVHMPRFRIEDGFSLKEQLQDMGLVDLFSPEKSKLPGIVAEGRDDLYVSDAFHKAF
        . . : .:::..:....:. .:  .:. :::.  :. : :.   :  :...:   ::.:
NP_109 FIEVNVSLPRFKLEESYTLNSDLARLGVQDLFNSSKADLSGM--SGARDIFISKIVHKSF
         270       280       290       300         310       320   

          410       420       430       440       450       460    
pF1KE1 LEVNEEGSEAAASTAVVIAGRSLNPNRVTFKANRPFLVFIREVPLNTIIFMGRVANPCVK
       .::::::.::::.:: . .   : :.. .: :..::: :::.   ..:.:.:: ..:   
NP_109 VEVNEEGTEAAAATAGIATFCMLMPEE-NFTADHPFLFFIRHNSSGSILFLGRFSSP   
           330       340       350        360       370            

>>NP_001258751 (OMIM: 173321,613453) serpin B6 isoform c  (390 aa)
 initn: 677 init1: 343 opt: 836  Z-score: 1018.6  bits: 197.5 E(85289): 5.3e-50
Smith-Waterman score: 836; 36.8% identity (68.0% similar) in 400 aa overlap (67-461:2-390)

         40        50        60        70        80        90      
pF1KE1 VDICTAKPRDIPMNPMCIYRSPEKKATEDEGSEQKIPEATNRRVWELSKANSRFATTFYQ
                                     :. :..:   .  .  :..::. :: .. .
NP_001                              MGAAQSLPGHRSAIMDVLAEANGTFALNLLK
                                            10        20        30 

        100       110       120       130       140       150      
pF1KE1 HLADSKNDNDNIFLSPLSISTAFAMTKLGACNDTLQQLMEVFKFDTISEKTSDQIHFFFA
        :.  :... :.:.::.:.: :.::. .:: ..:  :. ....:.  :   .: ::  : 
NP_001 TLG--KDNSKNVFFSPMSMSCALAMVYMGAKGNTAAQMAQILSFNK-SGGGGD-IHQGFQ
                40        50        60        70         80        

        160       170       180       190       200       210      
pF1KE1 KLNCRLYRKANKSSKLVSANRLFGDKSLTFNETYQDISELVYGAKLQPLDFKENAEQSRA
       .:  ..  :.. .  :  ::::::.::  :  ...:  .  : :... :::   .:.:: 
NP_001 SLLTEV-NKTGTQYLLRMANRLFGEKSCDFLSSFRDSCQKFYQAEMEELDFISAVEKSRK
        90        100       110       120       130       140      

        220       230       240       250       260       270      
pF1KE1 AINKWVSNKTEGRITDVIPSEAINELTVLVLVNTIYFKGLWKSKFSPENTRKELFYKADG
        :: ::..::::.:....   ... :: :::::..::.: :  .:. :::...::  . .
NP_001 HINTWVAEKTEGKIAELLSPGSVDPLTRLVLVNAVYFRGNWDEQFDKENTEERLFKVSKN
        150       160       170       180       190       200      

        280       290        300       310       320       330     
pF1KE1 ESCSASMMYQEGKFRYRRVAEG-TQVLELPFKGDDITMVLILPKPEKSLAKVEKELTPEV
       :   ..::.... :.   ..:  ::.: ::. : ...:...::    .:  :::::: : 
NP_001 EEKPVQMMFKQSTFKKTYIGEIFTQILVLPYVGKELNMIIMLPDETTDLRTVEKELTYEK
        210       220       230       240       250       260      

           340       350       360       370       380       390   
pF1KE1 LQEW--LDELEEMMLVVHMPRFRIEDGFSLKEQLQDMGLVDLFSPEKSKLPGIVAEGRDD
       . ::  :: ..:  . : .:::..:......  :...:..: :   :. . :.   .. :
NP_001 FVEWTRLDMMDEEEVEVSLPRFKLEESYDMESVLRNLGMTDAFELGKADFSGM---SQTD
        270       280       290       300       310          320   

           400       410       420         430       440       450 
pF1KE1 LYVSDAFHKAFLEVNEEGSEAAASTAVVIAGRS--LNPNRVTFKANRPFLVFIREVPLNT
       : .: . ::.:.::::::.::::.::...  :   . :    : :..::: ::..   : 
NP_001 LSLSKVVHKSFVEVNEEGTEAAAATAAIMMMRCARFVP---RFCADHPFLFFIQHSKTNG
           330       340       350       360          370       380

             460    
pF1KE1 IIFMGRVANPCVK
       :.: :: ..:   
NP_001 ILFCGRFSSP   
              390   

>>NP_004559 (OMIM: 173321,613453) serpin B6 isoform a [H  (376 aa)
 initn: 677 init1: 343 opt: 827  Z-score: 1007.9  bits: 195.5 E(85289): 2.1e-49
Smith-Waterman score: 827; 37.5% identity (68.8% similar) in 384 aa overlap (83-461:4-376)

             60        70        80        90       100       110  
pF1KE1 CIYRSPEKKATEDEGSEQKIPEATNRRVWELSKANSRFATTFYQHLADSKNDNDNIFLSP
                                     :..::. :: .. . :.  :... :.:.::
NP_004                            MDVLAEANGTFALNLLKTLG--KDNSKNVFFSP
                                          10        20          30 

            120       130       140       150       160       170  
pF1KE1 LSISTAFAMTKLGACNDTLQQLMEVFKFDTISEKTSDQIHFFFAKLNCRLYRKANKSSKL
       .:.: :.::. .:: ..:  :. ....:.  :   .: ::  : .:  ..  :.. .  :
NP_004 MSMSCALAMVYMGAKGNTAAQMAQILSFNK-SGGGGD-IHQGFQSLLTEV-NKTGTQYLL
              40        50        60          70         80        

            180       190       200       210       220       230  
pF1KE1 VSANRLFGDKSLTFNETYQDISELVYGAKLQPLDFKENAEQSRAAINKWVSNKTEGRITD
         ::::::.::  :  ...:  .  : :... :::   .:.::  :: ::..::::.:..
NP_004 RMANRLFGEKSCDFLSSFRDSCQKFYQAEMEELDFISAVEKSRKHINTWVAEKTEGKIAE
       90       100       110       120       130       140        

            240       250       260       270       280       290  
pF1KE1 VIPSEAINELTVLVLVNTIYFKGLWKSKFSPENTRKELFYKADGESCSASMMYQEGKFRY
       ..   ... :: :::::..::.: :  .:. :::...::  . .:   ..::.... :. 
NP_004 LLSPGSVDPLTRLVLVNAVYFRGNWDEQFDKENTEERLFKVSKNEEKPVQMMFKQSTFKK
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pF1KE1 RRVAEG-TQVLELPFKGDDITMVLILPKPEKSLAKVEKELTPEVLQEW--LDELEEMMLV
         ..:  ::.: ::. : ...:...::    .:  :::::: : . ::  :: ..:  . 
NP_004 TYIGEIFTQILVLPYVGKELNMIIMLPDETTDLRTVEKELTYEKFVEWTRLDMMDEEEVE
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pF1KE1 VHMPRFRIEDGFSLKEQLQDMGLVDLFSPEKSKLPGIVAEGRDDLYVSDAFHKAFLEVNE
       : .:::..:......  :...:..: :   :. . :.   .. :: .: . ::.:.::::
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pF1KE1 EGSEAAASTAVVIAGRS--LNPNRVTFKANRPFLVFIREVPLNTIIFMGRVANPCVK
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>>NP_001258754 (OMIM: 173321,613453) serpin B6 isoform a  (376 aa)
 initn: 677 init1: 343 opt: 827  Z-score: 1007.9  bits: 195.5 E(85289): 2.1e-49
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NP_001                            MDVLAEANGTFALNLLKTLG--KDNSKNVFFSP
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       .:.: :.::. .:: ..:  :. ....:.  :   .: ::  : .:  ..  :.. .  :
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pF1KE1 VIPSEAINELTVLVLVNTIYFKGLWKSKFSPENTRKELFYKADGESCSASMMYQEGKFRY
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pF1KE1 RRVAEG-TQVLELPFKGDDITMVLILPKPEKSLAKVEKELTPEVLQEW--LDELEEMMLV
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NP_001 TYIGEIFTQILVLPYVGKELNMIIMLPDETTDLRTVEKELTYEKFVEWTRLDMMDEEEVE
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pF1KE1 VHMPRFRIEDGFSLKEQLQDMGLVDLFSPEKSKLPGIVAEGRDDLYVSDAFHKAFLEVNE
       : .:::..:......  :...:..: :   :. . :.   .. :: .: . ::.:.::::
NP_001 VSLPRFKLEESYDMESVLRNLGMTDAFELGKADFSGM---SQTDLSLSKVVHKSFVEVNE
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pF1KE1 EGSEAAASTAVVIAGRS--LNPNRVTFKANRPFLVFIREVPLNTIIFMGRVANPCVK
       ::.::::.::...  :   . :    : :..::: ::..   : :.: :: ..:   
NP_001 EGTEAAAATAAIMMMRCARFVPR---FCADHPFLFFIQHSKTNGILFCGRFSSP   
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>>XP_011512976 (OMIM: 173321,613453) PREDICTED: serpin B  (376 aa)
 initn: 677 init1: 343 opt: 827  Z-score: 1007.9  bits: 195.5 E(85289): 2.1e-49
Smith-Waterman score: 827; 37.5% identity (68.8% similar) in 384 aa overlap (83-461:4-376)

             60        70        80        90       100       110  
pF1KE1 CIYRSPEKKATEDEGSEQKIPEATNRRVWELSKANSRFATTFYQHLADSKNDNDNIFLSP
                                     :..::. :: .. . :.  :... :.:.::
XP_011                            MDVLAEANGTFALNLLKTLG--KDNSKNVFFSP
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pF1KE1 LSISTAFAMTKLGACNDTLQQLMEVFKFDTISEKTSDQIHFFFAKLNCRLYRKANKSSKL
       .:.: :.::. .:: ..:  :. ....:.  :   .: ::  : .:  ..  :.. .  :
XP_011 MSMSCALAMVYMGAKGNTAAQMAQILSFNK-SGGGGD-IHQGFQSLLTEV-NKTGTQYLL
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pF1KE1 VSANRLFGDKSLTFNETYQDISELVYGAKLQPLDFKENAEQSRAAINKWVSNKTEGRITD
         ::::::.::  :  ...:  .  : :... :::   .:.::  :: ::..::::.:..
XP_011 RMANRLFGEKSCDFLSSFRDSCQKFYQAEMEELDFISAVEKSRKHINTWVAEKTEGKIAE
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pF1KE1 VIPSEAINELTVLVLVNTIYFKGLWKSKFSPENTRKELFYKADGESCSASMMYQEGKFRY
       ..   ... :: :::::..::.: :  .:. :::...::  . .:   ..::.... :. 
XP_011 LLSPGSVDPLTRLVLVNAVYFRGNWDEQFDKENTEERLFKVSKNEEKPVQMMFKQSTFKK
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pF1KE1 RRVAEG-TQVLELPFKGDDITMVLILPKPEKSLAKVEKELTPEVLQEW--LDELEEMMLV
         ..:  ::.: ::. : ...:...::    .:  :::::: : . ::  :: ..:  . 
XP_011 TYIGEIFTQILVLPYVGKELNMIIMLPDETTDLRTVEKELTYEKFVEWTRLDMMDEEEVE
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pF1KE1 VHMPRFRIEDGFSLKEQLQDMGLVDLFSPEKSKLPGIVAEGRDDLYVSDAFHKAFLEVNE
       : .:::..:......  :...:..: :   :. . :.   .. :: .: . ::.:.::::
XP_011 VSLPRFKLEESYDMESVLRNLGMTDAFELGKADFSGM---SQTDLSLSKVVHKSFVEVNE
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pF1KE1 EGSEAAASTAVVIAGRS--LNPNRVTFKANRPFLVFIREVPLNTIIFMGRVANPCVK
       ::.::::.::...  :   . :    : :..::: ::..   : :.: :: ..:   
XP_011 EGTEAAAATAAIMMMRCARFVPR---FCADHPFLFFIQHSKTNGILFCGRFSSP   
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>>XP_011512975 (OMIM: 173321,613453) PREDICTED: serpin B  (376 aa)
 initn: 677 init1: 343 opt: 827  Z-score: 1007.9  bits: 195.5 E(85289): 2.1e-49
Smith-Waterman score: 827; 37.5% identity (68.8% similar) in 384 aa overlap (83-461:4-376)

             60        70        80        90       100       110  
pF1KE1 CIYRSPEKKATEDEGSEQKIPEATNRRVWELSKANSRFATTFYQHLADSKNDNDNIFLSP
                                     :..::. :: .. . :.  :... :.:.::
XP_011                            MDVLAEANGTFALNLLKTLG--KDNSKNVFFSP
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pF1KE1 LSISTAFAMTKLGACNDTLQQLMEVFKFDTISEKTSDQIHFFFAKLNCRLYRKANKSSKL
       .:.: :.::. .:: ..:  :. ....:.  :   .: ::  : .:  ..  :.. .  :
XP_011 MSMSCALAMVYMGAKGNTAAQMAQILSFNK-SGGGGD-IHQGFQSLLTEV-NKTGTQYLL
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pF1KE1 VSANRLFGDKSLTFNETYQDISELVYGAKLQPLDFKENAEQSRAAINKWVSNKTEGRITD
         ::::::.::  :  ...:  .  : :... :::   .:.::  :: ::..::::.:..
XP_011 RMANRLFGEKSCDFLSSFRDSCQKFYQAEMEELDFISAVEKSRKHINTWVAEKTEGKIAE
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pF1KE1 VIPSEAINELTVLVLVNTIYFKGLWKSKFSPENTRKELFYKADGESCSASMMYQEGKFRY
       ..   ... :: :::::..::.: :  .:. :::...::  . .:   ..::.... :. 
XP_011 LLSPGSVDPLTRLVLVNAVYFRGNWDEQFDKENTEERLFKVSKNEEKPVQMMFKQSTFKK
      150       160       170       180       190       200        

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pF1KE1 RRVAEG-TQVLELPFKGDDITMVLILPKPEKSLAKVEKELTPEVLQEW--LDELEEMMLV
         ..:  ::.: ::. : ...:...::    .:  :::::: : . ::  :: ..:  . 
XP_011 TYIGEIFTQILVLPYVGKELNMIIMLPDETTDLRTVEKELTYEKFVEWTRLDMMDEEEVE
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pF1KE1 VHMPRFRIEDGFSLKEQLQDMGLVDLFSPEKSKLPGIVAEGRDDLYVSDAFHKAFLEVNE
       : .:::..:......  :...:..: :   :. . :.   .. :: .: . ::.:.::::
XP_011 VSLPRFKLEESYDMESVLRNLGMTDAFELGKADFSGM---SQTDLSLSKVVHKSFVEVNE
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pF1KE1 EGSEAAASTAVVIAGRS--LNPNRVTFKANRPFLVFIREVPLNTIIFMGRVANPCVK
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XP_011 EGTEAAAATAAIMMMRCARFVPR---FCADHPFLFFIQHSKTNGILFCGRFSSP   
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464 residues in 1 query   sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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