FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE3381, 1151 aa 1>>>pF1KE3381 1151 - 1151 aa - 1151 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.9344+/-0.000437; mu= 11.8535+/- 0.027 mean_var=288.0390+/-72.880, 0's: 0 Z-trim(116.9): 89 B-trim: 3227 in 2/52 Lambda= 0.075570 statistics sampled from 28347 (28476) to 28347 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.673), E-opt: 0.2 (0.334), width: 16 Scan time: 13.780 The best scores are: opt bits E(85289) NP_036214 (OMIM: 187500,603693,610187,616067) zinc (1151) 7862 872.5 0 XP_011515249 (OMIM: 187500,603693,610187,616067) P (1141) 7777 863.2 0 XP_011515250 (OMIM: 187500,603693,610187,616067) P (1098) 7407 822.9 0 NP_722520 (OMIM: 601950) zinc finger protein ZFPM1 (1006) 894 112.8 1.1e-23 XP_011521216 (OMIM: 601950) PREDICTED: zinc finger (1039) 894 112.8 1.2e-23 XP_011521214 (OMIM: 601950) PREDICTED: zinc finger (1052) 894 112.8 1.2e-23 XP_016878471 (OMIM: 601950) PREDICTED: zinc finger ( 919) 846 107.5 4e-22 XP_011521219 (OMIM: 601950) PREDICTED: zinc finger ( 946) 846 107.5 4.1e-22 >>NP_036214 (OMIM: 187500,603693,610187,616067) zinc fin (1151 aa) initn: 7862 init1: 7862 opt: 7862 Z-score: 4651.0 bits: 872.5 E(85289): 0 Smith-Waterman score: 7862; 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NP_722 ASILATAVINKDVFPCKDCGIWYRSERNLQAHLLYYCASRQGTGSPAAAATDEKPKETYP 230 240 250 260 270 280 300 310 320 330 340 350 pF1KE3 ISSLCPFPQCTKSFSNARALEMHLNSHSGVKMEEFLPPGASLKCTVCSYTADSVINFHQH .:::::: :: .: .::.:. :::: . : . : .: . . : ..: NP_722 NERVCPFPQCRKSCPSASSLEIHMRSHSGER------P---FVCLICLSAFTTKANCERH 290 300 310 320 330 360 370 380 390 pF1KE3 LFSHLTQAAFRCNHCHFGFQTQRELL------QHQ--------ELHVPSG-----KLPRE : : . :. : : ..: :..: .:. :.. :.. ::: . NP_722 LKVHTDTLSGVCHSCGF-ISTTRDILYSHLVTNHMVCQPGSKGEIYSPGAGHPATKLPPD 340 350 360 370 380 390 400 410 420 430 pF1KE3 S----DMEHS----PSATED-SLQP-------------ATDLLTRSE-LPQSQKAMQTKD : ...:. : :. : .: : ::. .:.: : :. . . NP_722 SLGSFQQQHTALQGPLASADLGLAPTPSPGLDRKALAEATNGEARAEPLAQNGGSSEPPA 400 410 420 430 440 450 440 450 460 470 480 pF1KE3 ASSDTELDKCEK-KTQLFLTNQRPEIQ-P--TTNKQSFSYTKIKSEPSSPRLASSPVQPN : . ... :. .. .: .: : : : . .: . ...:.: ::: .:::: . 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NP_722 GRGSEGSQSPGSSVDDAEDDPSRTLCEACNIRFSRHETYTVHKRYYCASRHDPPPRRPAA 660 670 680 690 700 710 730 740 750 760 770 pF1KE3 NK---------VPAMQRTMRTRKRRKMYEMCLPEQEQRPPLVQQRFLDVANLNNPCTSTQ .:. .:::.:::.::. :: . : . NP_722 PPGPPGPAAPPAPSPAAPVRTRRRRKLYELHAAGAPPPPP----------PGHAPAPESP 720 730 740 750 760 780 790 800 810 820 830 pF1KE3 EPTEGLGECYHPRCDIFPGIVSKHLETSLTINKCVPVSKCDTTHSSVSCLEMDVPIDLSK .: : : ::.. . :.. : :::::: NP_722 RPGSGSGSG--------PGLAPARSPG--------PAA--------------DGPIDLSK 770 780 790 840 850 860 870 880 890 pF1KE3 KCLSQSERTTTSPKRLLDYHECTVCKISFNKVENYLAHKQNFCPVTAHQRNDLGQLDGKV : . . : ::::::.:..::...: :::::. ::. : . :: : . . NP_722 K--PRRPLPGAPAPALADYHECTACRVSFHSLEAYLAHKKYSCPA-APPPGALG-LPAAA 800 810 820 830 840 850 900 910 920 930 940 950 pF1KE3 FPNPESERNSPDVSYERSIIKCEKNGNLKQPSPNGNLFSSHLATLQGLKVFSEAAQLIAT : : :: .. :.:. :. .:: . .: : . 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XP_011 CLICLSAFTTKANCERHLKVHTDTLSGVCHSCGF-ISTTRDILYSHLVTNHMVCQPGSKG 360 370 380 390 400 410 390 400 410 pF1KE3 ELHVPSG-----KLPRES----DMEHS----PSATED-SLQP-------------ATDLL :.. :.. ::: .: ...:. : :. : .: : ::. XP_011 EIYSPGAGHPATKLPPDSLGSFQQQHTALQGPLASADLGLAPTPSPGLDRKALAEATNGE 420 430 440 450 460 470 420 430 440 450 460 470 pF1KE3 TRSE-LPQSQKAMQTKDASSDTELDKCEK-KTQLFLTNQRPEIQ-P--TTNKQSFSYTKI .:.: : :. . . : . ... :. .. .: .: : : : . .: . ... XP_011 ARAEPLAQNGGSSEPPAAPRSIKVEAVEEPEAAPILGPGEPGPQAPSRTPSPRSPAPARV 480 490 500 510 520 530 480 490 500 510 520 530 pF1KE3 KSEPSSPRLASSPVQPNIGPSFPVGPFLSQFSFPQDITMVPQASEILAKMSELVHRRLRH :.: ::: .:::: ..: . . :: :. : : . : ::::::::::::: ::.. XP_011 KAELSSPTPGSSPVPGELGLAGAL--FLPQYVFGPDAA--PPASEILAKMSELVHSRLQQ 540 550 560 570 580 540 550 560 570 580 pF1KE3 GSSSYPPVIYS---PLMPKGATCFECNITFNNLDNYLVHKKHYCSSRWQQMAKSPEFPSV :... . : :::::::::.:::.:..:: :::. :::.: ..:: . XP_011 GAGAGAGGAQTGLFPGAPKGATCFECEITFSNVNNYYVHKRLYCSGR-----RAPE-DAP 590 600 610 620 630 640 590 600 610 620 630 640 pF1KE3 SEKMPEALSPNTGQTSINLLNPAAHSADPENPLLQTSCINSSTVLDLIGPNGKGHDKDFS . . :.: :. ... : .. :.:. : :: ::... XP_011 AARRPKA-PPGPARA------PPGQPAEPDAP-------RSSP-----GPGAR------- 650 660 670 650 660 670 680 690 700 pF1KE3 TQTKKLSTSSNNDDKINGKPVD-VKNPSVPLVDGESDPNKTTCEACNITFSRHETYMVHK . . ... .: .:. . ..:. . :.:.::..: :::::: ::::::: ::: XP_011 --EEGAGGAATPEDGAGGRGSEGSQSPGSSVDDAEDDPSRTLCEACNIRFSRHETYTVHK 680 690 700 710 720 730 710 720 730 740 750 pF1KE3 QYYCATRHDPPLKRSASNK---------VPAMQRTMRTRKRRKMYEMCLPEQEQRPPLVQ .::::.::::: .: :. .:. .:::.:::.::. :: XP_011 RYYCASRHDPPPRRPAAPPGPPGPAAPPAPSPAAPVRTRRRRKLYELHAAGAPPPPP--- 740 750 760 770 780 790 760 770 780 790 800 810 pF1KE3 QRFLDVANLNNPCTSTQEPTEGLGECYHPRCDIFPGIVSKHLETSLTINKCVPVSKCDTT . : . .: : : ::.. . :.. 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XP_011 EPVVQDGQRRIRARLSLATGLSWGPFHGSVQTRASSPRQAEPSPALTLLLVDEACWLRTL 140 150 160 170 180 190 170 180 190 200 210 pF1KE3 TWQGVEDNKNNCIVYSKGGQLWCTTTKAISEGEEL-IAFVVDFDSRLQAASQMTLTEGMY :.. . . : .. : ::: .:: . : : . .... : . .: XP_011 P-QALTEAEANTEIHRKDDALWCRVTKPVPAGGLLSVLLTAEPHSTPGHPVKKEPAEPTC 200 210 220 230 240 250 220 230 240 250 260 270 pF1KE3 PARLLDSIQLLPQQAAMASILPTAIVNKDIFPCKSCGIWYRSERNLQAHLMYYCSGRQRE :: : .:::::::.::::: ::..:::.::::.:::::::::::::::.:::..:: XP_011 PAPAHD-LQLLPQQAGMASILATAVINKDVFPCKDCGIWYRSERNLQAHLLYYCASRQGT 260 270 280 290 300 310 280 290 300 310 320 330 pF1KE3 AAPV---SEENEDSAHQISSLCPFPQCTKSFSNARALEMHLNSHSGVKMEEFLPPGASLK ..:. ..:. .. .:::::: :: .: .::.:. :::: . : . XP_011 GSPAAAATDEKPKETYPNERVCPFPQCRKSCPSASSLEIHMRSHSGER-----P----FV 320 330 340 350 360 340 350 360 370 380 pF1KE3 CTVCSYTADSVINFHQHLFSHLTQAAFRCNHCHFGFQTQRELL------QHQ-------- : .: . . : ..:: : . :. : : ..: :..: .:. XP_011 CLICLSAFTTKANCERHLKVHTDTLSGVCHSCGF-ISTTRDILYSHLVTNHMVCQPGSKG 370 380 390 400 410 420 390 400 410 pF1KE3 ELHVPSG-----KLPRES----DMEHS----PSATED-SLQP-------------ATDLL :.. :.. ::: .: ...:. : :. : .: : ::. XP_011 EIYSPGAGHPATKLPPDSLGSFQQQHTALQGPLASADLGLAPTPSPGLDRKALAEATNGE 430 440 450 460 470 480 420 430 440 450 460 470 pF1KE3 TRSE-LPQSQKAMQTKDASSDTELDKCEK-KTQLFLTNQRPEIQ-P--TTNKQSFSYTKI .:.: : :. . . : . ... :. .. .: .: : : : . .: . ... XP_011 ARAEPLAQNGGSSEPPAAPRSIKVEAVEEPEAAPILGPGEPGPQAPSRTPSPRSPAPARV 490 500 510 520 530 540 480 490 500 510 520 530 pF1KE3 KSEPSSPRLASSPVQPNIGPSFPVGPFLSQFSFPQDITMVPQASEILAKMSELVHRRLRH :.: ::: .:::: ..: . . :: :. : : . : ::::::::::::: ::.. XP_011 KAELSSPTPGSSPVPGELGLAGAL--FLPQYVFGPDAA--PPASEILAKMSELVHSRLQQ 550 560 570 580 590 600 540 550 560 570 580 pF1KE3 GSSSYPPVIYS---PLMPKGATCFECNITFNNLDNYLVHKKHYCSSRWQQMAKSPEFPSV :... . : :::::::::.:::.:..:: :::. :::.: ..:: . 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XP_016 CHSCGF-ISTTRDILYSHLVTNHMVCQPGSKGEIYSPGAGHPATKLPPDSLGSFQQQHTA 270 280 290 300 310 320 410 420 430 440 pF1KE3 ---PSATED-SLQP-------------ATDLLTRSE-LPQSQKAMQTKDASSDTELDKCE : :. : .: : ::. .:.: : :. . . : . ... : XP_016 LQGPLASADLGLAPTPSPGLDRKALAEATNGEARAEPLAQNGGSSEPPAAPRSIKVEAVE 330 340 350 360 370 380 450 460 470 480 490 pF1KE3 K-KTQLFLTNQRPEIQ-P--TTNKQSFSYTKIKSEPSSPRLASSPVQPNIGPSFPVGPFL . .. .: .: : : : . .: . ...:.: ::: .:::: ..: . . :: XP_016 EPEAAPILGPGEPGPQAPSRTPSPRSPAPARVKAELSSPTPGSSPVPGELGLAGAL--FL 390 400 410 420 430 500 510 520 530 540 550 pF1KE3 SQFSFPQDITMVPQASEILAKMSELVHRRLRHGSSSYPPVIYS---PLMPKGATCFECNI :. : : . : ::::::::::::: ::..:... . : :::::::::.: XP_016 PQYVFGPDAA--PPASEILAKMSELVHSRLQQGAGAGAGGAQTGLFPGAPKGATCFECEI 440 450 460 470 480 490 560 570 580 590 600 610 pF1KE3 TFNNLDNYLVHKKHYCSSRWQQMAKSPEFPSVSEKMPEALSPNTGQTSINLLNPAAHSAD ::.:..:: :::. :::.: ..:: . . . :.: :. ... : .. :. 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XP_011 CHSCGF-ISTTRDILYSHLVTNHMVCQPGSKGEIYSPGAGHPATKLPPDSLGSFQQQHTA 290 300 310 320 330 340 410 420 430 440 pF1KE3 ---PSATED-SLQP-------------ATDLLTRSE-LPQSQKAMQTKDASSDTELDKCE : :. : .: : ::. .:.: : :. . . : . ... : XP_011 LQGPLASADLGLAPTPSPGLDRKALAEATNGEARAEPLAQNGGSSEPPAAPRSIKVEAVE 350 360 370 380 390 400 450 460 470 480 490 pF1KE3 K-KTQLFLTNQRPEIQ-P--TTNKQSFSYTKIKSEPSSPRLASSPVQPNIGPSFPVGPFL . .. .: .: : : : . .: . ...:.: ::: .:::: ..: . . :: XP_011 EPEAAPILGPGEPGPQAPSRTPSPRSPAPARVKAELSSPTPGSSPVPGELGLAGAL--FL 410 420 430 440 450 460 500 510 520 530 540 550 pF1KE3 SQFSFPQDITMVPQASEILAKMSELVHRRLRHGSSSYPPVIYS---PLMPKGATCFECNI :. : : . : ::::::::::::: ::..:... . : :::::::::.: XP_011 PQYVFGPDAA--PPASEILAKMSELVHSRLQQGAGAGAGGAQTGLFPGAPKGATCFECEI 470 480 490 500 510 520 560 570 580 590 600 610 pF1KE3 TFNNLDNYLVHKKHYCSSRWQQMAKSPEFPSVSEKMPEALSPNTGQTSINLLNPAAHSAD ::.:..:: :::. :::.: ..:: . . . :.: :. ... : .. :. 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XP_011 ------PGLAPARSPG--------PAA--------------DGPIDLSKK--PRRPLPGA 720 730 740 850 860 870 880 890 900 pF1KE3 SPKRLLDYHECTVCKISFNKVENYLAHKQNFCPVTAHQRNDLGQLDGKVFPNPESERNSP : ::::::.:..::...: :::::. ::. : . :: : . . : XP_011 PAPALADYHECTACRVSFHSLEAYLAHKKYSCPA-APPPGALG-LPAAACPY-------- 750 760 770 780 790 910 920 930 940 950 960 pF1KE3 DVSYERSIIKCEKNGNLKQPSPNGNLFSSHLATLQGLKVFSEAAQLIATKEENRHLFLPQ : :: .. :.:. :. .:: . .: : . XP_011 ----------CPPNGPVR-----GDLLE-HFRLAHGLLL---GAPLAG------------ 800 810 820 970 980 990 1000 1010 1020 pF1KE3 CLYPGAIKKAKGADQLSPYYGIKPSDYISGSLVIHNTDIEQSRNAENESPKGQASSNGCA :: .. ::. : .:. : ::. 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