Result of FASTA (omim) for pFN21AB9669
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB9669, 489 aa
  1>>>pF1KB9669 489 - 489 aa - 489 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
  60827320 residues in 85289 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.1357+/-0.000613; mu= 11.9780+/- 0.038
 mean_var=283.2787+/-58.586, 0's: 0 Z-trim(115.5): 2044  B-trim: 199 in 2/48
 Lambda= 0.076202
 statistics sampled from 23591 (25935) to 23591 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.629), E-opt: 0.2 (0.304), width:  16
 Scan time:  8.460

The best scores are:                                      opt bits E(85289)
NP_067039 (OMIM: 194545) endothelial zinc finger p ( 489) 3514 400.6 5.4e-111
XP_016882569 (OMIM: 194545) PREDICTED: endothelial ( 489) 3514 400.6 5.4e-111
XP_016882568 (OMIM: 194545) PREDICTED: endothelial ( 549) 3514 400.6 5.7e-111
XP_016882567 (OMIM: 194545) PREDICTED: endothelial ( 549) 3514 400.6 5.7e-111
XP_011525495 (OMIM: 194545) PREDICTED: endothelial ( 549) 3514 400.6 5.7e-111
NP_001276331 (OMIM: 604077) zinc finger protein 13 ( 616) 1839 216.6 1.6e-55
XP_016882731 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 621) 1839 216.6 1.7e-55
XP_016882730 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 628) 1839 216.6 1.7e-55
NP_001276330 (OMIM: 604077) zinc finger protein 13 ( 658) 1839 216.6 1.7e-55
XP_016882729 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 658) 1839 216.6 1.7e-55
XP_005259268 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 670) 1839 216.6 1.7e-55
XP_006723426 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 670) 1839 216.6 1.7e-55
XP_006723425 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 670) 1839 216.6 1.7e-55
NP_003427 (OMIM: 604077) zinc finger protein 135 i ( 670) 1839 216.6 1.7e-55
NP_009065 (OMIM: 604077) zinc finger protein 135 i ( 682) 1839 216.6 1.7e-55
XP_005272399 (OMIM: 601262) PREDICTED: zinc finger ( 542) 1740 205.6 2.9e-52
XP_005272398 (OMIM: 601262) PREDICTED: zinc finger ( 682) 1740 205.8 3.3e-52
XP_011515600 (OMIM: 601262) PREDICTED: zinc finger ( 682) 1740 205.8 3.3e-52
NP_001025147 (OMIM: 601262) zinc finger protein 16 ( 682) 1740 205.8 3.3e-52
NP_008889 (OMIM: 601262) zinc finger protein 16 [H ( 682) 1740 205.8 3.3e-52
NP_001311078 (OMIM: 314995) zinc finger protein 41 ( 693) 1705 201.9 4.8e-51
NP_001311068 (OMIM: 314995) zinc finger protein 41 ( 693) 1705 201.9 4.8e-51
NP_001311081 (OMIM: 314995) zinc finger protein 41 ( 693) 1705 201.9 4.8e-51
NP_001311070 (OMIM: 314995) zinc finger protein 41 ( 693) 1705 201.9 4.8e-51
NP_001311072 (OMIM: 314995) zinc finger protein 41 ( 693) 1705 201.9 4.8e-51
NP_001311074 (OMIM: 314995) zinc finger protein 41 ( 693) 1705 201.9 4.8e-51
NP_001311086 (OMIM: 314995) zinc finger protein 41 ( 743) 1705 202.0   5e-51
NP_001311085 (OMIM: 314995) zinc finger protein 41 ( 745) 1705 202.0   5e-51
XP_016885306 (OMIM: 314995) PREDICTED: zinc finger ( 779) 1705 202.0 5.1e-51
NP_001311079 (OMIM: 314995) zinc finger protein 41 ( 779) 1705 202.0 5.1e-51
NP_001311073 (OMIM: 314995) zinc finger protein 41 ( 779) 1705 202.0 5.1e-51
NP_009061 (OMIM: 314995) zinc finger protein 41 is ( 779) 1705 202.0 5.1e-51
NP_001311076 (OMIM: 314995) zinc finger protein 41 ( 779) 1705 202.0 5.1e-51
NP_700359 (OMIM: 314995) zinc finger protein 41 is ( 779) 1705 202.0 5.1e-51
NP_001311069 (OMIM: 314995) zinc finger protein 41 ( 779) 1705 202.0 5.1e-51
NP_001311077 (OMIM: 314995) zinc finger protein 41 ( 781) 1705 202.0 5.1e-51
NP_001311071 (OMIM: 314995) zinc finger protein 41 ( 781) 1705 202.0 5.1e-51
XP_016885305 (OMIM: 314995) PREDICTED: zinc finger ( 789) 1705 202.0 5.1e-51
XP_006724618 (OMIM: 314995) PREDICTED: zinc finger ( 789) 1705 202.0 5.1e-51
NP_001311082 (OMIM: 314995) zinc finger protein 41 ( 789) 1705 202.0 5.1e-51
NP_001311080 (OMIM: 314995) zinc finger protein 41 ( 789) 1705 202.0 5.1e-51
XP_016885304 (OMIM: 314995) PREDICTED: zinc finger ( 813) 1705 202.0 5.2e-51
NP_001311083 (OMIM: 314995) zinc finger protein 41 ( 813) 1705 202.0 5.2e-51
XP_006724613 (OMIM: 314995) PREDICTED: zinc finger ( 813) 1705 202.0 5.2e-51
XP_016885302 (OMIM: 314995) PREDICTED: zinc finger ( 813) 1705 202.0 5.2e-51
XP_016885300 (OMIM: 314995) PREDICTED: zinc finger ( 813) 1705 202.0 5.2e-51
XP_016885299 (OMIM: 314995) PREDICTED: zinc finger ( 813) 1705 202.0 5.2e-51
XP_016885301 (OMIM: 314995) PREDICTED: zinc finger ( 813) 1705 202.0 5.2e-51
XP_016885303 (OMIM: 314995) PREDICTED: zinc finger ( 813) 1705 202.0 5.2e-51
NP_001311084 (OMIM: 314995) zinc finger protein 41 ( 821) 1705 202.0 5.2e-51


>>NP_067039 (OMIM: 194545) endothelial zinc finger prote  (489 aa)
 initn: 3514 init1: 3514 opt: 3514  Z-score: 2113.7  bits: 400.6 E(85289): 5.4e-111
Smith-Waterman score: 3514; 100.0% identity (100.0% similar) in 489 aa overlap (1-489:1-489)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB9 MKELDPKNDISEDKLSVVGEATGGPTRNGARGPGSEGVWEPGSWPERPRGDAGAEWEPLG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_067 MKELDPKNDISEDKLSVVGEATGGPTRNGARGPGSEGVWEPGSWPERPRGDAGAEWEPLG
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB9 IPQGNKLLGGSVPACHELKAFANQGCVLVPPRLDDPTEKGACPPVRRGKNFSSTSDLSKP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_067 IPQGNKLLGGSVPACHELKAFANQGCVLVPPRLDDPTEKGACPPVRRGKNFSSTSDLSKP
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB9 PMPCEEKKTYDCSECGKAFSRSSSLIKHQRIHTGEKPFECDTCGKHFIERSSLTIHQRVH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_067 PMPCEEKKTYDCSECGKAFSRSSSLIKHQRIHTGEKPFECDTCGKHFIERSSLTIHQRVH
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB9 TGEKPYACGDCGKAFSQRMNLTVHQRTHTGEKPYVCDVCGKAFRKTSSLTQHERIHTGEK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_067 TGEKPYACGDCGKAFSQRMNLTVHQRTHTGEKPYVCDVCGKAFRKTSSLTQHERIHTGEK
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB9 PYACGDCGKAFSQNMHLIVHQRTHTGEKPYVCPECGRAFSQNMHLTEHQRTHTGEKPYAC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_067 PYACGDCGKAFSQNMHLIVHQRTHTGEKPYVCPECGRAFSQNMHLTEHQRTHTGEKPYAC
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB9 KECGKAFNKSSSLTLHQRNHTGEKPYVCGECGKAFSQSSYLIQHQRFHIGVKPFECSECG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_067 KECGKAFNKSSSLTLHQRNHTGEKPYVCGECGKAFSQSSYLIQHQRFHIGVKPFECSECG
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB9 KAFSKNSSLTQHQRIHTGEKPYECYICKKHFTGRSSLIVHQIVHTGEKPYVCGECGKAFS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_067 KAFSKNSSLTQHQRIHTGEKPYECYICKKHFTGRSSLIVHQIVHTGEKPYVCGECGKAFS
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB9 QSAYLIEHQRIHTGEKPYRCGQCGKSFIKNSSLTVHQRIHTGEKPYRCGECGKTFSRNTN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_067 QSAYLIEHQRIHTGEKPYRCGQCGKSFIKNSSLTVHQRIHTGEKPYRCGECGKTFSRNTN
              430       440       450       460       470       480

                
pF1KB9 LTRHLRIHT
       :::::::::
NP_067 LTRHLRIHT
                

>>XP_016882569 (OMIM: 194545) PREDICTED: endothelial zin  (489 aa)
 initn: 3514 init1: 3514 opt: 3514  Z-score: 2113.7  bits: 400.6 E(85289): 5.4e-111
Smith-Waterman score: 3514; 100.0% identity (100.0% similar) in 489 aa overlap (1-489:1-489)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB9 MKELDPKNDISEDKLSVVGEATGGPTRNGARGPGSEGVWEPGSWPERPRGDAGAEWEPLG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MKELDPKNDISEDKLSVVGEATGGPTRNGARGPGSEGVWEPGSWPERPRGDAGAEWEPLG
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB9 IPQGNKLLGGSVPACHELKAFANQGCVLVPPRLDDPTEKGACPPVRRGKNFSSTSDLSKP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 IPQGNKLLGGSVPACHELKAFANQGCVLVPPRLDDPTEKGACPPVRRGKNFSSTSDLSKP
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB9 PMPCEEKKTYDCSECGKAFSRSSSLIKHQRIHTGEKPFECDTCGKHFIERSSLTIHQRVH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 PMPCEEKKTYDCSECGKAFSRSSSLIKHQRIHTGEKPFECDTCGKHFIERSSLTIHQRVH
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB9 TGEKPYACGDCGKAFSQRMNLTVHQRTHTGEKPYVCDVCGKAFRKTSSLTQHERIHTGEK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 TGEKPYACGDCGKAFSQRMNLTVHQRTHTGEKPYVCDVCGKAFRKTSSLTQHERIHTGEK
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB9 PYACGDCGKAFSQNMHLIVHQRTHTGEKPYVCPECGRAFSQNMHLTEHQRTHTGEKPYAC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 PYACGDCGKAFSQNMHLIVHQRTHTGEKPYVCPECGRAFSQNMHLTEHQRTHTGEKPYAC
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB9 KECGKAFNKSSSLTLHQRNHTGEKPYVCGECGKAFSQSSYLIQHQRFHIGVKPFECSECG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 KECGKAFNKSSSLTLHQRNHTGEKPYVCGECGKAFSQSSYLIQHQRFHIGVKPFECSECG
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB9 KAFSKNSSLTQHQRIHTGEKPYECYICKKHFTGRSSLIVHQIVHTGEKPYVCGECGKAFS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 KAFSKNSSLTQHQRIHTGEKPYECYICKKHFTGRSSLIVHQIVHTGEKPYVCGECGKAFS
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB9 QSAYLIEHQRIHTGEKPYRCGQCGKSFIKNSSLTVHQRIHTGEKPYRCGECGKTFSRNTN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 QSAYLIEHQRIHTGEKPYRCGQCGKSFIKNSSLTVHQRIHTGEKPYRCGECGKTFSRNTN
              430       440       450       460       470       480

                
pF1KB9 LTRHLRIHT
       :::::::::
XP_016 LTRHLRIHT
                

>>XP_016882568 (OMIM: 194545) PREDICTED: endothelial zin  (549 aa)
 initn: 3514 init1: 3514 opt: 3514  Z-score: 2113.2  bits: 400.6 E(85289): 5.7e-111
Smith-Waterman score: 3514; 100.0% identity (100.0% similar) in 489 aa overlap (1-489:61-549)

                                             10        20        30
pF1KB9                               MKELDPKNDISEDKLSVVGEATGGPTRNGA
                                     ::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LEPAQKDLYRDVMLENYRNLVSLDWETRPEMKELDPKNDISEDKLSVVGEATGGPTRNGA
               40        50        60        70        80        90

               40        50        60        70        80        90
pF1KB9 RGPGSEGVWEPGSWPERPRGDAGAEWEPLGIPQGNKLLGGSVPACHELKAFANQGCVLVP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 RGPGSEGVWEPGSWPERPRGDAGAEWEPLGIPQGNKLLGGSVPACHELKAFANQGCVLVP
              100       110       120       130       140       150

              100       110       120       130       140       150
pF1KB9 PRLDDPTEKGACPPVRRGKNFSSTSDLSKPPMPCEEKKTYDCSECGKAFSRSSSLIKHQR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 PRLDDPTEKGACPPVRRGKNFSSTSDLSKPPMPCEEKKTYDCSECGKAFSRSSSLIKHQR
              160       170       180       190       200       210

              160       170       180       190       200       210
pF1KB9 IHTGEKPFECDTCGKHFIERSSLTIHQRVHTGEKPYACGDCGKAFSQRMNLTVHQRTHTG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 IHTGEKPFECDTCGKHFIERSSLTIHQRVHTGEKPYACGDCGKAFSQRMNLTVHQRTHTG
              220       230       240       250       260       270

              220       230       240       250       260       270
pF1KB9 EKPYVCDVCGKAFRKTSSLTQHERIHTGEKPYACGDCGKAFSQNMHLIVHQRTHTGEKPY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 EKPYVCDVCGKAFRKTSSLTQHERIHTGEKPYACGDCGKAFSQNMHLIVHQRTHTGEKPY
              280       290       300       310       320       330

              280       290       300       310       320       330
pF1KB9 VCPECGRAFSQNMHLTEHQRTHTGEKPYACKECGKAFNKSSSLTLHQRNHTGEKPYVCGE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 VCPECGRAFSQNMHLTEHQRTHTGEKPYACKECGKAFNKSSSLTLHQRNHTGEKPYVCGE
              340       350       360       370       380       390

              340       350       360       370       380       390
pF1KB9 CGKAFSQSSYLIQHQRFHIGVKPFECSECGKAFSKNSSLTQHQRIHTGEKPYECYICKKH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 CGKAFSQSSYLIQHQRFHIGVKPFECSECGKAFSKNSSLTQHQRIHTGEKPYECYICKKH
              400       410       420       430       440       450

              400       410       420       430       440       450
pF1KB9 FTGRSSLIVHQIVHTGEKPYVCGECGKAFSQSAYLIEHQRIHTGEKPYRCGQCGKSFIKN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 FTGRSSLIVHQIVHTGEKPYVCGECGKAFSQSAYLIEHQRIHTGEKPYRCGQCGKSFIKN
              460       470       480       490       500       510

              460       470       480         
pF1KB9 SSLTVHQRIHTGEKPYRCGECGKTFSRNTNLTRHLRIHT
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SSLTVHQRIHTGEKPYRCGECGKTFSRNTNLTRHLRIHT
              520       530       540         

>>XP_016882567 (OMIM: 194545) PREDICTED: endothelial zin  (549 aa)
 initn: 3514 init1: 3514 opt: 3514  Z-score: 2113.2  bits: 400.6 E(85289): 5.7e-111
Smith-Waterman score: 3514; 100.0% identity (100.0% similar) in 489 aa overlap (1-489:61-549)

                                             10        20        30
pF1KB9                               MKELDPKNDISEDKLSVVGEATGGPTRNGA
                                     ::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LEPAQKDLYRDVMLENYRNLVSLDWETRPEMKELDPKNDISEDKLSVVGEATGGPTRNGA
               40        50        60        70        80        90

               40        50        60        70        80        90
pF1KB9 RGPGSEGVWEPGSWPERPRGDAGAEWEPLGIPQGNKLLGGSVPACHELKAFANQGCVLVP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 RGPGSEGVWEPGSWPERPRGDAGAEWEPLGIPQGNKLLGGSVPACHELKAFANQGCVLVP
              100       110       120       130       140       150

              100       110       120       130       140       150
pF1KB9 PRLDDPTEKGACPPVRRGKNFSSTSDLSKPPMPCEEKKTYDCSECGKAFSRSSSLIKHQR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 PRLDDPTEKGACPPVRRGKNFSSTSDLSKPPMPCEEKKTYDCSECGKAFSRSSSLIKHQR
              160       170       180       190       200       210

              160       170       180       190       200       210
pF1KB9 IHTGEKPFECDTCGKHFIERSSLTIHQRVHTGEKPYACGDCGKAFSQRMNLTVHQRTHTG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 IHTGEKPFECDTCGKHFIERSSLTIHQRVHTGEKPYACGDCGKAFSQRMNLTVHQRTHTG
              220       230       240       250       260       270

              220       230       240       250       260       270
pF1KB9 EKPYVCDVCGKAFRKTSSLTQHERIHTGEKPYACGDCGKAFSQNMHLIVHQRTHTGEKPY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 EKPYVCDVCGKAFRKTSSLTQHERIHTGEKPYACGDCGKAFSQNMHLIVHQRTHTGEKPY
              280       290       300       310       320       330

              280       290       300       310       320       330
pF1KB9 VCPECGRAFSQNMHLTEHQRTHTGEKPYACKECGKAFNKSSSLTLHQRNHTGEKPYVCGE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 VCPECGRAFSQNMHLTEHQRTHTGEKPYACKECGKAFNKSSSLTLHQRNHTGEKPYVCGE
              340       350       360       370       380       390

              340       350       360       370       380       390
pF1KB9 CGKAFSQSSYLIQHQRFHIGVKPFECSECGKAFSKNSSLTQHQRIHTGEKPYECYICKKH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 CGKAFSQSSYLIQHQRFHIGVKPFECSECGKAFSKNSSLTQHQRIHTGEKPYECYICKKH
              400       410       420       430       440       450

              400       410       420       430       440       450
pF1KB9 FTGRSSLIVHQIVHTGEKPYVCGECGKAFSQSAYLIEHQRIHTGEKPYRCGQCGKSFIKN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 FTGRSSLIVHQIVHTGEKPYVCGECGKAFSQSAYLIEHQRIHTGEKPYRCGQCGKSFIKN
              460       470       480       490       500       510

              460       470       480         
pF1KB9 SSLTVHQRIHTGEKPYRCGECGKTFSRNTNLTRHLRIHT
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SSLTVHQRIHTGEKPYRCGECGKTFSRNTNLTRHLRIHT
              520       530       540         

>>XP_011525495 (OMIM: 194545) PREDICTED: endothelial zin  (549 aa)
 initn: 3514 init1: 3514 opt: 3514  Z-score: 2113.2  bits: 400.6 E(85289): 5.7e-111
Smith-Waterman score: 3514; 100.0% identity (100.0% similar) in 489 aa overlap (1-489:61-549)

                                             10        20        30
pF1KB9                               MKELDPKNDISEDKLSVVGEATGGPTRNGA
                                     ::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LEPAQKDLYRDVMLENYRNLVSLDWETRPEMKELDPKNDISEDKLSVVGEATGGPTRNGA
               40        50        60        70        80        90

               40        50        60        70        80        90
pF1KB9 RGPGSEGVWEPGSWPERPRGDAGAEWEPLGIPQGNKLLGGSVPACHELKAFANQGCVLVP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 RGPGSEGVWEPGSWPERPRGDAGAEWEPLGIPQGNKLLGGSVPACHELKAFANQGCVLVP
              100       110       120       130       140       150

              100       110       120       130       140       150
pF1KB9 PRLDDPTEKGACPPVRRGKNFSSTSDLSKPPMPCEEKKTYDCSECGKAFSRSSSLIKHQR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 PRLDDPTEKGACPPVRRGKNFSSTSDLSKPPMPCEEKKTYDCSECGKAFSRSSSLIKHQR
              160       170       180       190       200       210

              160       170       180       190       200       210
pF1KB9 IHTGEKPFECDTCGKHFIERSSLTIHQRVHTGEKPYACGDCGKAFSQRMNLTVHQRTHTG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 IHTGEKPFECDTCGKHFIERSSLTIHQRVHTGEKPYACGDCGKAFSQRMNLTVHQRTHTG
              220       230       240       250       260       270

              220       230       240       250       260       270
pF1KB9 EKPYVCDVCGKAFRKTSSLTQHERIHTGEKPYACGDCGKAFSQNMHLIVHQRTHTGEKPY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 EKPYVCDVCGKAFRKTSSLTQHERIHTGEKPYACGDCGKAFSQNMHLIVHQRTHTGEKPY
              280       290       300       310       320       330

              280       290       300       310       320       330
pF1KB9 VCPECGRAFSQNMHLTEHQRTHTGEKPYACKECGKAFNKSSSLTLHQRNHTGEKPYVCGE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 VCPECGRAFSQNMHLTEHQRTHTGEKPYACKECGKAFNKSSSLTLHQRNHTGEKPYVCGE
              340       350       360       370       380       390

              340       350       360       370       380       390
pF1KB9 CGKAFSQSSYLIQHQRFHIGVKPFECSECGKAFSKNSSLTQHQRIHTGEKPYECYICKKH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 CGKAFSQSSYLIQHQRFHIGVKPFECSECGKAFSKNSSLTQHQRIHTGEKPYECYICKKH
              400       410       420       430       440       450

              400       410       420       430       440       450
pF1KB9 FTGRSSLIVHQIVHTGEKPYVCGECGKAFSQSAYLIEHQRIHTGEKPYRCGQCGKSFIKN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 FTGRSSLIVHQIVHTGEKPYVCGECGKAFSQSAYLIEHQRIHTGEKPYRCGQCGKSFIKN
              460       470       480       490       500       510

              460       470       480         
pF1KB9 SSLTVHQRIHTGEKPYRCGECGKTFSRNTNLTRHLRIHT
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SSLTVHQRIHTGEKPYRCGECGKTFSRNTNLTRHLRIHT
              520       530       540         

>>NP_001276331 (OMIM: 604077) zinc finger protein 135 is  (616 aa)
 initn: 1806 init1: 1806 opt: 1839  Z-score: 1117.6  bits: 216.6 E(85289): 1.6e-55
Smith-Waterman score: 1839; 57.5% identity (76.3% similar) in 452 aa overlap (41-489:145-587)

               20        30        40        50         60         
pF1KB9 SEDKLSVVGEATGGPTRNGARGPGSEGVWEPGSWPERPRGDAGAEWEP-LGIPQGNKLLG
                                     : .:     :  : . .: :.. :  :   
NP_001 LEQWQRNGFGENISLNPDLPHQPMTPERQSPHTW-----GTRGKREKPDLNVLQ--KTCV
          120       130       140            150       160         

      70          80        90       100       110       120       
pF1KB9 GSVP-ACHEL-KAFANQGCVLVPPRLDDPTEKGACPPVRRGKNFSSTSDLSKPPMPCEEK
          :  :.:  :::.... ..   :     .   :    .:  : ..: :.:       .
NP_001 KEKPYKCQECGKAFSHSSALIEHHRTHTGERPYECHECLKG--FRNSSALTKHQRIHTGE
       170       180       190       200         210       220     

       130       140       150       160       170       180       
pF1KB9 KTYDCSECGKAFSRSSSLIKHQRIHTGEKPFECDTCGKHFIERSSLTIHQRVHTGEKPYA
       : : :..::..:.. . ::.::: ::::::.::. ::: :  :::.. :.:.::::::: 
NP_001 KPYKCTQCGRTFNQIAPLIQHQRTHTGEKPYECSECGKSFSFRSSFSQHERTHTGEKPYE
         230       240       250       260       270       280     

       190       200       210       220       230       240       
pF1KB9 CGDCGKAFSQRMNLTVHQRTHTGEKPYVCDVCGKAFRKTSSLTQHERIHTGEKPYACGDC
       :..::::: : ..:: : : ::::::: :  ::::: ..::::.:.::::::::: : .:
NP_001 CSECGKAFRQSIHLTQHLRIHTGEKPYQCGECGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECHEC
         290       300       310       320       330       340     

       250       260       270       280       290       300       
pF1KB9 GKAFSQNMHLIVHQRTHTGEKPYVCPECGRAFSQNMHLTEHQRTHTGEKPYACKECGKAF
       ::::.:   :: ::::::::::: : :::.::::.  ::::.: :::::::.:.::::.:
NP_001 GKAFTQITPLIQHQRTHTGEKPYECGECGKAFSQSTLLTEHRRIHTGEKPYGCNECGKTF
         350       360       370       380       390       400     

       310       320       330       340       350       360       
pF1KB9 NKSSSLTLHQRNHTGEKPYVCGECGKAFSQSSYLIQHQRFHIGVKPFECSECGKAFSKNS
       ..::::. :.:.::::::: :..::::: ::..: ::::.: : ::.::..::::::..:
NP_001 SHSSSLSQHERTHTGEKPYECSQCGKAFRQSTHLTQHQRIHTGEKPYECNDCGKAFSHSS
         410       420       430       440       450       460     

       370       380       390       400       410       420       
pF1KB9 SLTQHQRIHTGEKPYECYICKKHFTGRSSLIVHQIVHTGEKPYVCGECGKAFSQSAYLIE
       :::.:::::::::::::  : . :.  . :: :: .::::::: :..::.:::::. :::
NP_001 SLTKHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQLAPLIQHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQSSLLIE
         470       480       490       500       510       520     

       430       440       450       460       470       480       
pF1KB9 HQRIHTGEKPYRCGQCGKSFIKNSSLTVHQRIHTGEKPYRCGECGKTFSRNTNLTRHLRI
       :::::: :::: :..::::: ..:::. :.: :::::::.: .:::.: ..:.::.: ::
NP_001 HQRIHTKEKPYGCNECGKSFSHSSSLSQHERTHTGEKPYECHDCGKSFRQSTHLTQHRRI
         530       540       550       560       570       580     

                                      
pF1KB9 HT                             
       ::                             
NP_001 HTGEKPYACRDCGKAFTHSSSLTKHQRTHTG
         590       600       610      

>>XP_016882731 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger pro  (621 aa)
 initn: 1806 init1: 1806 opt: 1839  Z-score: 1117.5  bits: 216.6 E(85289): 1.7e-55
Smith-Waterman score: 1839; 57.5% identity (76.3% similar) in 452 aa overlap (41-489:150-592)

               20        30        40        50         60         
pF1KB9 SEDKLSVVGEATGGPTRNGARGPGSEGVWEPGSWPERPRGDAGAEWEP-LGIPQGNKLLG
                                     : .:     :  : . .: :.. :  :   
XP_016 LEQWQRNGFGENISLNPDLPHQPMTPERQSPHTW-----GTRGKREKPDLNVLQ--KTCV
     120       130       140       150            160         170  

      70          80        90       100       110       120       
pF1KB9 GSVP-ACHEL-KAFANQGCVLVPPRLDDPTEKGACPPVRRGKNFSSTSDLSKPPMPCEEK
          :  :.:  :::.... ..   :     .   :    .:  : ..: :.:       .
XP_016 KEKPYKCQECGKAFSHSSALIEHHRTHTGERPYECHECLKG--FRNSSALTKHQRIHTGE
            180       190       200       210         220       230

       130       140       150       160       170       180       
pF1KB9 KTYDCSECGKAFSRSSSLIKHQRIHTGEKPFECDTCGKHFIERSSLTIHQRVHTGEKPYA
       : : :..::..:.. . ::.::: ::::::.::. ::: :  :::.. :.:.::::::: 
XP_016 KPYKCTQCGRTFNQIAPLIQHQRTHTGEKPYECSECGKSFSFRSSFSQHERTHTGEKPYE
              240       250       260       270       280       290

       190       200       210       220       230       240       
pF1KB9 CGDCGKAFSQRMNLTVHQRTHTGEKPYVCDVCGKAFRKTSSLTQHERIHTGEKPYACGDC
       :..::::: : ..:: : : ::::::: :  ::::: ..::::.:.::::::::: : .:
XP_016 CSECGKAFRQSIHLTQHLRIHTGEKPYQCGECGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECHEC
              300       310       320       330       340       350

       250       260       270       280       290       300       
pF1KB9 GKAFSQNMHLIVHQRTHTGEKPYVCPECGRAFSQNMHLTEHQRTHTGEKPYACKECGKAF
       ::::.:   :: ::::::::::: : :::.::::.  ::::.: :::::::.:.::::.:
XP_016 GKAFTQITPLIQHQRTHTGEKPYECGECGKAFSQSTLLTEHRRIHTGEKPYGCNECGKTF
              360       370       380       390       400       410

       310       320       330       340       350       360       
pF1KB9 NKSSSLTLHQRNHTGEKPYVCGECGKAFSQSSYLIQHQRFHIGVKPFECSECGKAFSKNS
       ..::::. :.:.::::::: :..::::: ::..: ::::.: : ::.::..::::::..:
XP_016 SHSSSLSQHERTHTGEKPYECSQCGKAFRQSTHLTQHQRIHTGEKPYECNDCGKAFSHSS
              420       430       440       450       460       470

       370       380       390       400       410       420       
pF1KB9 SLTQHQRIHTGEKPYECYICKKHFTGRSSLIVHQIVHTGEKPYVCGECGKAFSQSAYLIE
       :::.:::::::::::::  : . :.  . :: :: .::::::: :..::.:::::. :::
XP_016 SLTKHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQLAPLIQHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQSSLLIE
              480       490       500       510       520       530

       430       440       450       460       470       480       
pF1KB9 HQRIHTGEKPYRCGQCGKSFIKNSSLTVHQRIHTGEKPYRCGECGKTFSRNTNLTRHLRI
       :::::: :::: :..::::: ..:::. :.: :::::::.: .:::.: ..:.::.: ::
XP_016 HQRIHTKEKPYGCNECGKSFSHSSSLSQHERTHTGEKPYECHDCGKSFRQSTHLTQHRRI
              540       550       560       570       580       590

                                      
pF1KB9 HT                             
       ::                             
XP_016 HTGEKPYACRDCGKAFTHSSSLTKHQRTHTG
              600       610       620 

>>XP_016882730 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger pro  (628 aa)
 initn: 1806 init1: 1806 opt: 1839  Z-score: 1117.5  bits: 216.6 E(85289): 1.7e-55
Smith-Waterman score: 1839; 57.5% identity (76.3% similar) in 452 aa overlap (41-489:157-599)

               20        30        40        50         60         
pF1KB9 SEDKLSVVGEATGGPTRNGARGPGSEGVWEPGSWPERPRGDAGAEWEP-LGIPQGNKLLG
                                     : .:     :  : . .: :.. :  :   
XP_016 LEQWQRNGFGENISLNPDLPHQPMTPERQSPHTW-----GTRGKREKPDLNVLQ--KTCV
        130       140       150       160            170           

      70          80        90       100       110       120       
pF1KB9 GSVP-ACHEL-KAFANQGCVLVPPRLDDPTEKGACPPVRRGKNFSSTSDLSKPPMPCEEK
          :  :.:  :::.... ..   :     .   :    .:  : ..: :.:       .
XP_016 KEKPYKCQECGKAFSHSSALIEHHRTHTGERPYECHECLKG--FRNSSALTKHQRIHTGE
     180       190       200       210       220         230       

       130       140       150       160       170       180       
pF1KB9 KTYDCSECGKAFSRSSSLIKHQRIHTGEKPFECDTCGKHFIERSSLTIHQRVHTGEKPYA
       : : :..::..:.. . ::.::: ::::::.::. ::: :  :::.. :.:.::::::: 
XP_016 KPYKCTQCGRTFNQIAPLIQHQRTHTGEKPYECSECGKSFSFRSSFSQHERTHTGEKPYE
       240       250       260       270       280       290       

       190       200       210       220       230       240       
pF1KB9 CGDCGKAFSQRMNLTVHQRTHTGEKPYVCDVCGKAFRKTSSLTQHERIHTGEKPYACGDC
       :..::::: : ..:: : : ::::::: :  ::::: ..::::.:.::::::::: : .:
XP_016 CSECGKAFRQSIHLTQHLRIHTGEKPYQCGECGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECHEC
       300       310       320       330       340       350       

       250       260       270       280       290       300       
pF1KB9 GKAFSQNMHLIVHQRTHTGEKPYVCPECGRAFSQNMHLTEHQRTHTGEKPYACKECGKAF
       ::::.:   :: ::::::::::: : :::.::::.  ::::.: :::::::.:.::::.:
XP_016 GKAFTQITPLIQHQRTHTGEKPYECGECGKAFSQSTLLTEHRRIHTGEKPYGCNECGKTF
       360       370       380       390       400       410       

       310       320       330       340       350       360       
pF1KB9 NKSSSLTLHQRNHTGEKPYVCGECGKAFSQSSYLIQHQRFHIGVKPFECSECGKAFSKNS
       ..::::. :.:.::::::: :..::::: ::..: ::::.: : ::.::..::::::..:
XP_016 SHSSSLSQHERTHTGEKPYECSQCGKAFRQSTHLTQHQRIHTGEKPYECNDCGKAFSHSS
       420       430       440       450       460       470       

       370       380       390       400       410       420       
pF1KB9 SLTQHQRIHTGEKPYECYICKKHFTGRSSLIVHQIVHTGEKPYVCGECGKAFSQSAYLIE
       :::.:::::::::::::  : . :.  . :: :: .::::::: :..::.:::::. :::
XP_016 SLTKHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQLAPLIQHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQSSLLIE
       480       490       500       510       520       530       

       430       440       450       460       470       480       
pF1KB9 HQRIHTGEKPYRCGQCGKSFIKNSSLTVHQRIHTGEKPYRCGECGKTFSRNTNLTRHLRI
       :::::: :::: :..::::: ..:::. :.: :::::::.: .:::.: ..:.::.: ::
XP_016 HQRIHTKEKPYGCNECGKSFSHSSSLSQHERTHTGEKPYECHDCGKSFRQSTHLTQHRRI
       540       550       560       570       580       590       

                                      
pF1KB9 HT                             
       ::                             
XP_016 HTGEKPYACRDCGKAFTHSSSLTKHQRTHTG
       600       610       620        

>>NP_001276330 (OMIM: 604077) zinc finger protein 135 is  (658 aa)
 initn: 1806 init1: 1806 opt: 1839  Z-score: 1117.3  bits: 216.6 E(85289): 1.7e-55
Smith-Waterman score: 1839; 57.5% identity (76.3% similar) in 452 aa overlap (41-489:187-629)

               20        30        40        50         60         
pF1KB9 SEDKLSVVGEATGGPTRNGARGPGSEGVWEPGSWPERPRGDAGAEWEP-LGIPQGNKLLG
                                     : .:     :  : . .: :.. :  :   
NP_001 LEQWQRNGFGENISLNPDLPHQPMTPERQSPHTW-----GTRGKREKPDLNVLQ--KTCV
        160       170       180       190            200           

      70          80        90       100       110       120       
pF1KB9 GSVP-ACHEL-KAFANQGCVLVPPRLDDPTEKGACPPVRRGKNFSSTSDLSKPPMPCEEK
          :  :.:  :::.... ..   :     .   :    .:  : ..: :.:       .
NP_001 KEKPYKCQECGKAFSHSSALIEHHRTHTGERPYECHECLKG--FRNSSALTKHQRIHTGE
     210       220       230       240       250         260       

       130       140       150       160       170       180       
pF1KB9 KTYDCSECGKAFSRSSSLIKHQRIHTGEKPFECDTCGKHFIERSSLTIHQRVHTGEKPYA
       : : :..::..:.. . ::.::: ::::::.::. ::: :  :::.. :.:.::::::: 
NP_001 KPYKCTQCGRTFNQIAPLIQHQRTHTGEKPYECSECGKSFSFRSSFSQHERTHTGEKPYE
       270       280       290       300       310       320       

       190       200       210       220       230       240       
pF1KB9 CGDCGKAFSQRMNLTVHQRTHTGEKPYVCDVCGKAFRKTSSLTQHERIHTGEKPYACGDC
       :..::::: : ..:: : : ::::::: :  ::::: ..::::.:.::::::::: : .:
NP_001 CSECGKAFRQSIHLTQHLRIHTGEKPYQCGECGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECHEC
       330       340       350       360       370       380       

       250       260       270       280       290       300       
pF1KB9 GKAFSQNMHLIVHQRTHTGEKPYVCPECGRAFSQNMHLTEHQRTHTGEKPYACKECGKAF
       ::::.:   :: ::::::::::: : :::.::::.  ::::.: :::::::.:.::::.:
NP_001 GKAFTQITPLIQHQRTHTGEKPYECGECGKAFSQSTLLTEHRRIHTGEKPYGCNECGKTF
       390       400       410       420       430       440       

       310       320       330       340       350       360       
pF1KB9 NKSSSLTLHQRNHTGEKPYVCGECGKAFSQSSYLIQHQRFHIGVKPFECSECGKAFSKNS
       ..::::. :.:.::::::: :..::::: ::..: ::::.: : ::.::..::::::..:
NP_001 SHSSSLSQHERTHTGEKPYECSQCGKAFRQSTHLTQHQRIHTGEKPYECNDCGKAFSHSS
       450       460       470       480       490       500       

       370       380       390       400       410       420       
pF1KB9 SLTQHQRIHTGEKPYECYICKKHFTGRSSLIVHQIVHTGEKPYVCGECGKAFSQSAYLIE
       :::.:::::::::::::  : . :.  . :: :: .::::::: :..::.:::::. :::
NP_001 SLTKHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQLAPLIQHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQSSLLIE
       510       520       530       540       550       560       

       430       440       450       460       470       480       
pF1KB9 HQRIHTGEKPYRCGQCGKSFIKNSSLTVHQRIHTGEKPYRCGECGKTFSRNTNLTRHLRI
       :::::: :::: :..::::: ..:::. :.: :::::::.: .:::.: ..:.::.: ::
NP_001 HQRIHTKEKPYGCNECGKSFSHSSSLSQHERTHTGEKPYECHDCGKSFRQSTHLTQHRRI
       570       580       590       600       610       620       

                                      
pF1KB9 HT                             
       ::                             
NP_001 HTGEKPYACRDCGKAFTHSSSLTKHQRTHTG
       630       640       650        

>>XP_016882729 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger pro  (658 aa)
 initn: 1806 init1: 1806 opt: 1839  Z-score: 1117.3  bits: 216.6 E(85289): 1.7e-55
Smith-Waterman score: 1839; 57.5% identity (76.3% similar) in 452 aa overlap (41-489:187-629)

               20        30        40        50         60         
pF1KB9 SEDKLSVVGEATGGPTRNGARGPGSEGVWEPGSWPERPRGDAGAEWEP-LGIPQGNKLLG
                                     : .:     :  : . .: :.. :  :   
XP_016 LEQWQRNGFGENISLNPDLPHQPMTPERQSPHTW-----GTRGKREKPDLNVLQ--KTCV
        160       170       180       190            200           

      70          80        90       100       110       120       
pF1KB9 GSVP-ACHEL-KAFANQGCVLVPPRLDDPTEKGACPPVRRGKNFSSTSDLSKPPMPCEEK
          :  :.:  :::.... ..   :     .   :    .:  : ..: :.:       .
XP_016 KEKPYKCQECGKAFSHSSALIEHHRTHTGERPYECHECLKG--FRNSSALTKHQRIHTGE
     210       220       230       240       250         260       

       130       140       150       160       170       180       
pF1KB9 KTYDCSECGKAFSRSSSLIKHQRIHTGEKPFECDTCGKHFIERSSLTIHQRVHTGEKPYA
       : : :..::..:.. . ::.::: ::::::.::. ::: :  :::.. :.:.::::::: 
XP_016 KPYKCTQCGRTFNQIAPLIQHQRTHTGEKPYECSECGKSFSFRSSFSQHERTHTGEKPYE
       270       280       290       300       310       320       

       190       200       210       220       230       240       
pF1KB9 CGDCGKAFSQRMNLTVHQRTHTGEKPYVCDVCGKAFRKTSSLTQHERIHTGEKPYACGDC
       :..::::: : ..:: : : ::::::: :  ::::: ..::::.:.::::::::: : .:
XP_016 CSECGKAFRQSIHLTQHLRIHTGEKPYQCGECGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECHEC
       330       340       350       360       370       380       

       250       260       270       280       290       300       
pF1KB9 GKAFSQNMHLIVHQRTHTGEKPYVCPECGRAFSQNMHLTEHQRTHTGEKPYACKECGKAF
       ::::.:   :: ::::::::::: : :::.::::.  ::::.: :::::::.:.::::.:
XP_016 GKAFTQITPLIQHQRTHTGEKPYECGECGKAFSQSTLLTEHRRIHTGEKPYGCNECGKTF
       390       400       410       420       430       440       

       310       320       330       340       350       360       
pF1KB9 NKSSSLTLHQRNHTGEKPYVCGECGKAFSQSSYLIQHQRFHIGVKPFECSECGKAFSKNS
       ..::::. :.:.::::::: :..::::: ::..: ::::.: : ::.::..::::::..:
XP_016 SHSSSLSQHERTHTGEKPYECSQCGKAFRQSTHLTQHQRIHTGEKPYECNDCGKAFSHSS
       450       460       470       480       490       500       

       370       380       390       400       410       420       
pF1KB9 SLTQHQRIHTGEKPYECYICKKHFTGRSSLIVHQIVHTGEKPYVCGECGKAFSQSAYLIE
       :::.:::::::::::::  : . :.  . :: :: .::::::: :..::.:::::. :::
XP_016 SLTKHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQLAPLIQHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQSSLLIE
       510       520       530       540       550       560       

       430       440       450       460       470       480       
pF1KB9 HQRIHTGEKPYRCGQCGKSFIKNSSLTVHQRIHTGEKPYRCGECGKTFSRNTNLTRHLRI
       :::::: :::: :..::::: ..:::. :.: :::::::.: .:::.: ..:.::.: ::
XP_016 HQRIHTKEKPYGCNECGKSFSHSSSLSQHERTHTGEKPYECHDCGKSFRQSTHLTQHRRI
       570       580       590       600       610       620       

                                      
pF1KB9 HT                             
       ::                             
XP_016 HTGEKPYACRDCGKAFTHSSSLTKHQRTHTG
       630       640       650        




489 residues in 1 query   sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
 Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
 start: Sat Nov  5 08:26:52 2016 done: Sat Nov  5 08:26:53 2016
 Total Scan time:  8.460 Total Display time:  0.080

Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
Inquiries or Suggestions ?
Send a message to flexiclone AT kazusagt.com