FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE4085, 446 aa 1>>>pF1KE4085 446 - 446 aa - 446 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.9658+/-0.000697; mu= 12.0921+/- 0.042 mean_var=141.8152+/-28.958, 0's: 0 Z-trim(115.4): 72 B-trim: 410 in 1/53 Lambda= 0.107699 statistics sampled from 15865 (15942) to 15865 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.798), E-opt: 0.2 (0.49), width: 16 Scan time: 3.720 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS8162.1 TBC1D10C gene_id:374403|Hs108|chr11 ( 446) 3119 495.6 4.2e-140 CCDS13874.1 TBC1D10A gene_id:83874|Hs108|chr22 ( 508) 1384 226.1 6.5e-59 CCDS56227.1 TBC1D10A gene_id:83874|Hs108|chr22 ( 515) 1368 223.6 3.7e-58 CCDS10676.2 TBC1D10B gene_id:26000|Hs108|chr16 ( 808) 1368 223.8 5.2e-58 CCDS58150.1 TBC1D10C gene_id:374403|Hs108|chr11 ( 310) 1129 186.3 3.8e-47 CCDS1314.1 RABGAP1L gene_id:9910|Hs108|chr1 ( 815) 523 92.5 1.7e-18 CCDS30774.1 EVI5 gene_id:7813|Hs108|chr1 ( 810) 505 89.7 1.2e-17 CCDS76179.1 EVI5 gene_id:7813|Hs108|chr1 ( 821) 505 89.7 1.2e-17 CCDS9534.2 GRTP1 gene_id:79774|Hs108|chr13 ( 336) 497 88.1 1.5e-17 CCDS66591.1 GRTP1 gene_id:79774|Hs108|chr13 ( 344) 497 88.1 1.5e-17 CCDS12188.1 EVI5L gene_id:115704|Hs108|chr19 ( 794) 492 87.6 4.8e-17 CCDS54209.1 EVI5L gene_id:115704|Hs108|chr19 ( 805) 492 87.6 4.8e-17 CCDS47136.1 TBC1D9 gene_id:23158|Hs108|chr4 (1266) 479 85.8 2.8e-16 CCDS4450.1 TBC1D9B gene_id:23061|Hs108|chr5 (1233) 473 84.8 5.2e-16 CCDS43408.1 TBC1D9B gene_id:23061|Hs108|chr5 (1250) 473 84.8 5.2e-16 CCDS6848.2 RABGAP1 gene_id:23637|Hs108|chr9 (1069) 468 84.0 7.9e-16 CCDS59137.1 TBC1D2 gene_id:55357|Hs108|chr9 ( 468) 450 80.9 3e-15 CCDS75865.1 TBC1D2 gene_id:55357|Hs108|chr9 ( 928) 450 81.2 5e-15 CCDS32301.2 TBC1D2B gene_id:23102|Hs108|chr15 ( 914) 447 80.7 6.8e-15 CCDS53492.1 USP6NL gene_id:9712|Hs108|chr10 ( 828) 446 80.5 7e-15 CCDS45314.1 TBC1D2B gene_id:23102|Hs108|chr15 ( 963) 447 80.7 7e-15 CCDS44357.1 USP6NL gene_id:9712|Hs108|chr10 ( 845) 446 80.5 7.1e-15 CCDS14002.1 SGSM3 gene_id:27352|Hs108|chr22 ( 749) 431 78.1 3.3e-14 CCDS46375.1 TBC1D8 gene_id:11138|Hs108|chr2 (1140) 432 78.4 4e-14 CCDS82486.1 TBC1D8 gene_id:11138|Hs108|chr2 (1155) 432 78.4 4.1e-14 CCDS14522.1 TBC1D8B gene_id:54885|Hs108|chrX (1120) 430 78.1 4.9e-14 CCDS35080.1 TBC1D2 gene_id:55357|Hs108|chr9 ( 917) 421 76.7 1.1e-13 CCDS77009.1 TBC1D3E gene_id:102723859|Hs108|chr17 ( 549) 407 74.3 3.4e-13 CCDS45658.1 TBC1D3 gene_id:729873|Hs108|chr17 ( 549) 400 73.2 7.3e-13 CCDS74045.1 TBC1D3C gene_id:414060|Hs108|chr17 ( 549) 400 73.2 7.3e-13 CCDS74042.1 TBC1D3K gene_id:101060351|Hs108|chr17 ( 549) 400 73.2 7.3e-13 CCDS45653.1 TBC1D3H gene_id:729877|Hs108|chr17 ( 549) 399 73.1 8.1e-13 CCDS74043.1 TBC1D3L gene_id:101060376|Hs108|chr17 ( 549) 399 73.1 8.1e-13 CCDS74040.1 TBC1D3G gene_id:101060321|Hs108|chr17 ( 549) 398 72.9 9.1e-13 CCDS74039.1 TBC1D3I gene_id:102724862|Hs108|chr17 ( 549) 397 72.7 1e-12 CCDS42300.1 TBC1D3B gene_id:414059|Hs108|chr17 ( 549) 396 72.6 1.1e-12 CCDS74044.1 LOC101060389 gene_id:101060389|Hs108|c ( 549) 396 72.6 1.1e-12 CCDS33972.1 TBC1D1 gene_id:23216|Hs108|chr4 (1168) 394 72.5 2.5e-12 CCDS11069.2 USP6 gene_id:9098|Hs108|chr17 (1406) 375 69.7 2.2e-11 CCDS66563.1 TBC1D4 gene_id:9882|Hs108|chr13 (1235) 365 68.1 5.8e-11 CCDS66564.1 TBC1D4 gene_id:9882|Hs108|chr13 (1290) 365 68.1 6e-11 CCDS41901.1 TBC1D4 gene_id:9882|Hs108|chr13 (1298) 365 68.1 6e-11 >>CCDS8162.1 TBC1D10C gene_id:374403|Hs108|chr11 (446 aa) initn: 3119 init1: 3119 opt: 3119 Z-score: 2628.8 bits: 495.6 E(32554): 4.2e-140 Smith-Waterman score: 3119; 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CCDS13 PLPGSKAKPKPPKQAQKEQRKQMKG-----RGQ-LEKPPAPNQAMVVAAAGDACPPQHVP 420 430 440 450 460 470 CCDS13 PKDSAPKDSAPQDLAPQVSAHHRSQESLTSQESEDTYL 480 490 500 >>CCDS56227.1 TBC1D10A gene_id:83874|Hs108|chr22 (515 aa) initn: 1313 init1: 1228 opt: 1368 Z-score: 1157.6 bits: 223.6 E(32554): 3.7e-58 Smith-Waterman score: 1380; 46.1% identity (72.9% similar) in 447 aa overlap (7-436:24-460) 10 20 30 40 pF1KE4 MAQALGEDLVQPPE--LQDDSSSLGSDSELSGPGPYRQADRYG :.:.: :. :. :::::::: .: . :. :..: CCDS56 MAKSNGENGPRAPAAGESLSGTRESLAQGPDAATTDELSSLGSDSEANGFAE-RRIDKFG 10 20 30 40 50 50 60 70 80 90 pF1KE4 FIGGSSAEPGPGHP--------PADLIRQREMKWVEMTSHWEKTMSRRYKKVKMQCRKGI :: ::.. : : : ...:::: ::..: ..:.: :....::....:.::: CCDS56 FIVGSQGAEGAPCPLLHRLEEVPLEVLRQRESKWLDMLNNWDKWMAKKHKKIRLRCQKGI 60 70 80 90 100 110 100 110 120 130 140 150 pF1KE4 PSALRARCWPLLCGAHVCQKNSPGTYQELAEAPGDPQWMETIGRDLHRQFPLHEMFVSPQ : .::.: : : :..: ...:: ..:: .::::.:...: ::::::::.:::::: CCDS56 PPSLRGRAWQYLSGGKVKLQQNPGKFDELDMSPGDPKWLDVIERDLHRQFPFHEMFVSRG 120 130 140 150 160 170 160 170 180 190 200 210 pF1KE4 GHGQQGLLQVLKAYTLYRPEQGYCQAQGPVAAVLLMHLPPEEAFWCLVQICEVYLPGYYG ::::: :..:::::::::::.::::::.:.:::::::.: :.:::::::::: ::::::. 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CCDS56 IRLPLDAPLPGSKAKPKPPKQAQKEQRKQMKG-----RGQ-LEKPPAPNQAMVVAAAGDA 420 430 440 450 460 470 CCDS56 CPPQHVPPKDSAPKDSAPQDLAPQVSAHHRSQESLTSQESEDTYL 480 490 500 510 >>CCDS10676.2 TBC1D10B gene_id:26000|Hs108|chr16 (808 aa) initn: 1308 init1: 1308 opt: 1368 Z-score: 1155.0 bits: 223.8 E(32554): 5.2e-58 Smith-Waterman score: 1368; 47.1% identity (73.6% similar) in 420 aa overlap (15-431:283-694) 10 20 30 40 pF1KE4 MAQALGEDLVQPPELQDDSSSLGSDSELSGPGPYRQADRYGFIG : :: ::.:::::..: . :..:.:::.: CCDS10 GPGISGPRGQAPDTLSYLDSVSLMSGTLESLADDVSSMGSDSEINGLA-LRKTDKYGFLG 260 270 280 290 300 310 50 60 70 80 90 100 pF1KE4 GSSAEPG-PGHPPADLIRQREMKWVEMTSHWEKTMSRRYKKVKMQCRKGIPSALRARCWP ::. . . :.:. ::::.::..: :.:.: .:::..:::..:::::::.:::. : CCDS10 GSQYSGSLESSIPVDVARQRELKWLDMFSNWDKWLSRRFQKVKLRCRKGIPSSLRAKAWQ 320 330 340 350 360 370 110 120 130 140 150 160 pF1KE4 LLCGAHVCQKNSPGTYQELAEAPGDPQWMETIGRDLHRQFPLHEMFVSPQGHGQQGLLQV : ... ...:: ..:: .:::::.:...: .:::::::.::::.. ::::: : .. CCDS10 YLSNSKELLEQNPGKFEELERAPGDPKWLDVIEKDLHRQFPFHEMFAARGGHGQQDLYRI 380 390 400 410 420 430 170 180 190 200 210 220 pF1KE4 LKAYTLYRPEQGYCQAQGPVAAVLLMHLPPEEAFWCLVQICEVYLPGYYGPHMEAVRLDA :::::.:::..::::::.:::::::::.: :.:::::::::. ::::::. .::..::. CCDS10 LKAYTIYRPDEGYCQAQAPVAAVLLMHMPAEQAFWCLVQICDKYLPGYYSAGLEAIQLDG 440 450 460 470 480 490 230 240 250 260 270 280 pF1KE4 EVFMALLRRLLPHVHKHLQQVGVGPLLYLPEWFLCLFARSLPFPTVLRVWDAFLSEGARV :.:.::::: : .:.::.. . :.::. :::.:.:::.::. .:::::: :. ::... CCDS10 EIFFALLRRASPLAHRHLRRQRIDPVLYMTEWFMCIFARTLPWASVLRVWDMFFCEGVKI 500 510 520 530 540 550 290 300 310 320 330 340 pF1KE4 LFRVGLTLVRLALGTAEQRGACPGLLETLGALRAIPPAQLQEEAFMSQVHSVVLSERDLQ .:::.:.:.: .::..:. .: :. ::. :: .: .::. .. .: .. ..: .. CCDS10 IFRVALVLLRHTLGSVEKLRSCQGMYETMEQLRNLPQQCMQEDFLVHEVTNLPVTEALIE 560 570 580 590 600 610 350 360 370 380 390 400 pF1KE4 REIKAQLAQLPDSAPGPPPRPQVRLAGAQAIFEAQQLAGVRRGAKPEVPR--IVVQPPEE :: ::: . .. ::. :: :..:: : . :: : : .. : . CCDS10 RENAAQLKKWRETRGELQYRPSRRLHGSRAIHEER-----RRQQPPLGPSSSLLSLPGLK 620 630 640 650 660 410 420 430 440 pF1KE4 PRPPRRKPQTRGKTFHGLLTRARGPPIEGPPRPQRGSTSFLDTRF : : . . . :: . : :: CCDS10 SRGSRAAGGAPSPPPP--VRRASAGPAPGPVVTAEGLHPSLPSPTGNSTPLGSSKETRKQ 670 680 690 700 710 720 >>CCDS58150.1 TBC1D10C gene_id:374403|Hs108|chr11 (310 aa) initn: 1162 init1: 1129 opt: 1129 Z-score: 959.9 bits: 186.3 E(32554): 3.8e-47 Smith-Waterman score: 1129; 99.4% identity (100.0% similar) in 157 aa overlap (1-157:1-157) 10 20 30 40 50 60 pF1KE4 MAQALGEDLVQPPELQDDSSSLGSDSELSGPGPYRQADRYGFIGGSSAEPGPGHPPADLI :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS58 MAQALGEDLVQPPELQDDSSSLGSDSELSGPGPYRQADRYGFIGGSSAEPGPGHPPADLI 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE4 RQREMKWVEMTSHWEKTMSRRYKKVKMQCRKGIPSALRARCWPLLCGAHVCQKNSPGTYQ :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS58 RQREMKWVEMTSHWEKTMSRRYKKVKMQCRKGIPSALRARCWPLLCGAHVCQKNSPGTYQ 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE4 ELAEAPGDPQWMETIGRDLHRQFPLHEMFVSPQGHGQQGLLQVLKAYTLYRPEQGYCQAQ ::::::::::::::::::::::::::::::::::::. CCDS58 ELAEAPGDPQWMETIGRDLHRQFPLHEMFVSPQGHGRGSCRCSRPTPCIDRSRATARPRG 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE4 GPVAAVLLMHLPPEEAFWCLVQICEVYLPGYYGPHMEAVRLDAEVFMALLRRLLPHVHKH CCDS58 PWLLCCSCTCPQRRPSGAWCRSVRSTSLGTTGPTWCQSTVPCGADTGAPGAGHCRAARGL 190 200 210 220 230 240 >>CCDS1314.1 RABGAP1L gene_id:9910|Hs108|chr1 (815 aa) initn: 409 init1: 243 opt: 523 Z-score: 445.4 bits: 92.5 E(32554): 1.7e-18 Smith-Waterman score: 523; 30.6% identity (58.1% similar) in 356 aa overlap (6-352:451-803) 10 20 30 pF1KE4 MAQALGEDLVQPPELQDDSSSLGSDSELSGPGPYR :. . . :: .:.. . :: ::. CCDS13 ERFWYFSRKTFTETFFMRLKQSEGKGHTNAGDAIYEVVSLQRESDKEEPVTPTSGGGPMS 430 440 450 460 470 480 40 50 60 70 80 90 pF1KE4 -QADRYGFIGGSSAEPGPGHPPADLIRQREMKWVEMTSHWEKTMSRRYKKVKMQCRKGIP : :. . . : : : .. ..: :. ..:..... : : .. ..:.: CCDS13 PQDDEAEEESDNELSSGTGDVSKDCPEKILYSWGELLGKWHSNLGARPKGLSTLVKSGVP 490 500 510 520 530 540 100 110 120 130 140 150 pF1KE4 SALRARCWPLLCGAHVCQKNSPGTYQELAEAPGDPQWMETIGRDLHRQFPLHEMFVSPQG ::::. : :: : :. :. . : .: ::.:: :: :..: . : CCDS13 EALRAEVWQLLAG---CHDNQAMLDRYRILITKDSAQESVITRDIHRTFPAHDYFKDTGG 550 560 570 580 590 160 170 180 190 200 210 pF1KE4 HGQQGLLQVLKAYTLYRPEQGYCQAQGPVAAVLLMHLPPEEAFWCLVQICEVY-LPGYYG ::..: .. :::..: . ::::.:. .:::::.:.: :.:: ::.: : : : CCDS13 DGQESLYKICKAYSVYDEDIGYCQGQSFLAAVLLLHMPEEQAFCVLVKIMYDYGLRDLYR 600 610 620 630 640 650 220 230 240 250 260 270 pF1KE4 PHMEAVRLDAEVFMALLRRLLPHVHKHLQQVGVGPLLYLPEWFLCLFARSLPFPTVLRVW ..: .. . :... :: .:.:...... .: .::: ::. ..:. :... CCDS13 NNFEDLHCKFYQLERLMQEQLPDLHSHFSDLNLEAHMYASQWFLTLFTAKFPLCMVFHII 660 670 680 690 700 710 280 290 300 310 320 pF1KE4 DAFLSEGARVLFRVGLTLVRLA---LGTAEQRGACPGLLETLGA-LRAIPPAQ-LQEEAF : .: :: ..:.:.:.:.. . : :. .:: . : :: :. :.:.: CCDS13 DLLLCEGLNIIFHVALALLKTSKEDLLQADFEGALKFFRVQLPKRYRAEENARRLMEQAC 720 730 740 750 760 770 330 340 350 360 370 380 pF1KE4 MSQVHSVVLS--ERDLQREIKAQLAQLPDSAPGPPPRPQVRLAGAQAIFEAQQLAGVRRG .: . :. :.. : ..:: : CCDS13 NIKVPTKKLKKYEKEYQTMRESQLQQEDPMDRYKFVYL 780 790 800 810 >>CCDS30774.1 EVI5 gene_id:7813|Hs108|chr1 (810 aa) initn: 493 init1: 186 opt: 505 Z-score: 430.3 bits: 89.7 E(32554): 1.2e-17 Smith-Waterman score: 505; 29.3% identity (60.2% similar) in 352 aa overlap (2-345:76-414) 10 20 30 pF1KE4 MAQALGEDLVQPPELQDDSSSLGSDSE-LSG .: .:: .:.... : .::. : . CCDS30 ASQVASPSTSLHTTSSSTTLSTPALSPSSPSQLSPDDLELLAKLEEQNRLLETDSKSLRS 50 60 70 80 90 100 40 50 60 70 80 90 pF1KE4 PGPYRQADRYGFIGGSSAEPGPGHPPADLIRQREMKWVEMTSHWEKTMSRRYKKVKMQCR . :. . .....::: . .: : . : .....:: . ... :.:: . CCDS30 VNGSRRNSGSSLVSSSSASSNLSHLEED----SWILWGRIVNEWEDVRKKKEKQVKELVH 110 120 130 140 150 160 100 110 120 130 140 150 pF1KE4 KGIPSALRARCWPLLCGAHVCQKNSPGTYQELAEAPGDPQWMETIGRDLHRQFPLHEMFV :::: .:: : :::.:. .. :.:: . . . . : ::. : .: :..: CCDS30 KGIPHHFRAIVWQLLCSAQSMPIKDQ--YSELLKMTSPCEKL--IRRDIARTYPEHNFFK 170 180 190 200 210 160 170 180 190 200 pF1KE4 SPQGHGQQGLLQVLKAYTLYRPEQGYCQAQGPVAAVLLMHLPPEEAFWCLVQICEVY-LP .. ::. :..:.:::.: : ::::... ....:::..: :::: .:.. . : : CCDS30 EKDSLGQEVLFNVMKAYSLVDREVGYCQGSAFIVGLLLMQMPEEEAFCVFVKLMQDYRLR 220 230 240 250 260 270 210 220 230 240 250 260 pF1KE4 GYYGPHMEAVRLDAEVFMALLRRLLPHVHKHLQQVGVGPLLYLPEWFLCLFARSLPFPTV . : : . : : .... ::.. :.:. . .: ::: .: ..:.: . CCDS30 ELFKPSMAELGLCMYQFECMIQEHLPELFVHFQSQSFHTSMYASSWFLTIFLTTFPLPIA 280 290 300 310 320 330 270 280 290 300 310 320 pF1KE4 LRVWDAFLSEGARVLFRVGLTLVRLALGTAEQRGACPGLLETLGALRAIP------PAQL :..: :.::: ...:::::.:... . : :.:. . ..:: : .: CCDS30 TRIFDIFMSEGLEIVFRVGLALLQMNQAELMQLDM-EGMLQHF--QKVIPHQFDGVPDKL 340 350 360 370 380 390 330 340 350 360 370 380 pF1KE4 QEEAFMSQVHSVVLSERDLQREIKAQLAQLPDSAPGPPPRPQVRLAGAQAIFEAQQLAGV . :.. . .: . . :..: CCDS30 IQAAYQVKYNSKKM--KKLEKEYTTIKTKEMEEQVEIKRLRTENRLLKQRIETLEKHKCS 400 410 420 430 440 450 >>CCDS76179.1 EVI5 gene_id:7813|Hs108|chr1 (821 aa) initn: 493 init1: 186 opt: 505 Z-score: 430.2 bits: 89.7 E(32554): 1.2e-17 Smith-Waterman score: 505; 29.3% identity (60.2% similar) in 352 aa overlap (2-345:76-414) 10 20 30 pF1KE4 MAQALGEDLVQPPELQDDSSSLGSDSE-LSG .: .:: .:.... : .::. : . CCDS76 ASQVASPSTSLHTTSSSTTLSTPALSPSSPSQLSPDDLELLAKLEEQNRLLETDSKSLRS 50 60 70 80 90 100 40 50 60 70 80 90 pF1KE4 PGPYRQADRYGFIGGSSAEPGPGHPPADLIRQREMKWVEMTSHWEKTMSRRYKKVKMQCR . :. . .....::: . .: : . : .....:: . ... :.:: . CCDS76 VNGSRRNSGSSLVSSSSASSNLSHLEED----SWILWGRIVNEWEDVRKKKEKQVKELVH 110 120 130 140 150 160 100 110 120 130 140 150 pF1KE4 KGIPSALRARCWPLLCGAHVCQKNSPGTYQELAEAPGDPQWMETIGRDLHRQFPLHEMFV :::: .:: : :::.:. .. :.:: . . . . : ::. : .: :..: CCDS76 KGIPHHFRAIVWQLLCSAQSMPIKDQ--YSELLKMTSPCEKL--IRRDIARTYPEHNFFK 170 180 190 200 210 160 170 180 190 200 pF1KE4 SPQGHGQQGLLQVLKAYTLYRPEQGYCQAQGPVAAVLLMHLPPEEAFWCLVQICEVY-LP .. ::. :..:.:::.: : ::::... ....:::..: :::: .:.. . : : CCDS76 EKDSLGQEVLFNVMKAYSLVDREVGYCQGSAFIVGLLLMQMPEEEAFCVFVKLMQDYRLR 220 230 240 250 260 270 210 220 230 240 250 260 pF1KE4 GYYGPHMEAVRLDAEVFMALLRRLLPHVHKHLQQVGVGPLLYLPEWFLCLFARSLPFPTV . : : . : : .... ::.. :.:. . .: ::: .: ..:.: . CCDS76 ELFKPSMAELGLCMYQFECMIQEHLPELFVHFQSQSFHTSMYASSWFLTIFLTTFPLPIA 280 290 300 310 320 330 270 280 290 300 310 320 pF1KE4 LRVWDAFLSEGARVLFRVGLTLVRLALGTAEQRGACPGLLETLGALRAIP------PAQL :..: :.::: ...:::::.:... . : :.:. . ..:: : .: CCDS76 TRIFDIFMSEGLEIVFRVGLALLQMNQAELMQLDM-EGMLQHF--QKVIPHQFDGVPDKL 340 350 360 370 380 390 330 340 350 360 370 380 pF1KE4 QEEAFMSQVHSVVLSERDLQREIKAQLAQLPDSAPGPPPRPQVRLAGAQAIFEAQQLAGV . :.. . .: . . :..: CCDS76 IQAAYQVKYNSKKM--KKLEKEYTTIKTKEMEEQVEIKRLRTENRLLKQRIETLEKESAS 400 410 420 430 440 450 >>CCDS9534.2 GRTP1 gene_id:79774|Hs108|chr13 (336 aa) initn: 509 init1: 299 opt: 497 Z-score: 428.7 bits: 88.1 E(32554): 1.5e-17 Smith-Waterman score: 497; 36.4% identity (61.9% similar) in 236 aa overlap (60-293:39-271) 30 40 50 60 70 80 pF1KE4 GPGPYRQADRYGFIGGSSAEPGPGHPPADLIRQREMKWVEMTSHWEKTMSRRYKKVKMQC . .: .:: .. . :: :: CCDS95 VPRIDPYGFERPEDFDDAAYEKFFSSYLVTLTRRAIKWSRLLQGGGVPRSRT---VKRYV 10 20 30 40 50 60 90 100 110 120 130 140 pF1KE4 RKGIPSALRARCWPLLCGAHVCQKNSPGTYQELAEAPGDPQWMETIGRDLHRQFPLHEMF :::.: ::: : .: ::.. . ..:: :..: .. .:. ..: ::.: :: . : CCDS95 RKGVPLEHRARVWMVLSGAQAQMDQNPGYYHQLLQGERNPRLEDAIRTDLNRTFPDNVKF 70 80 90 100 110 120 150 160 170 180 190 200 pF1KE4 VSPQGHG-QQGLLQVLKAYTLYRPEQGYCQAQGPVAAVL-LMHLPPEEAFWCLVQICEVY . :. : .:: :: . ::::... .:. : :. ::.:: : . CCDS95 RKTTDPCLQRTLYNVLLAYGHHNQGVGYCQGMNFIAGYLILITNNEEESFWLLDALVGRI 130 140 150 160 170 180 210 220 230 240 250 260 pF1KE4 LPGYYGPHMEAVRLDAEVFMALLRRLLPHVHKHLQQVGVGPLLYLPEWFLCLFARSLPFP :: ::.: : ... : ::. :.: :: : ....:: : . .::.:::. :: CCDS95 LPDYYSPAMLGLKTDQEVLGELVRAKLPAVGALMERLGVLWTLLVSRWFICLFVDILPVE 190 200 210 220 230 240 270 280 290 300 310 320 pF1KE4 TVLRVWDAFLSEGARVLFRVGLTLVRLALGTAEQRGACPGLLETLGALRAIPPAQLQEEA ::::.:: ...::....:::.:::.. CCDS95 TVLRIWDCLFNEGSKIIFRVALTLIKQHQELILEATSVPDICDKFKQITKGSFVMECHTF 250 260 270 280 290 300 >>CCDS66591.1 GRTP1 gene_id:79774|Hs108|chr13 (344 aa) initn: 509 init1: 299 opt: 497 Z-score: 428.6 bits: 88.1 E(32554): 1.5e-17 Smith-Waterman score: 497; 36.4% identity (61.9% similar) in 236 aa overlap (60-293:39-271) 30 40 50 60 70 80 pF1KE4 GPGPYRQADRYGFIGGSSAEPGPGHPPADLIRQREMKWVEMTSHWEKTMSRRYKKVKMQC . .: .:: .. . :: :: CCDS66 VPRIDPYGFERPEDFDDAAYEKFFSSYLVTLTRRAIKWSRLLQGGGVPRSRT---VKRYV 10 20 30 40 50 60 90 100 110 120 130 140 pF1KE4 RKGIPSALRARCWPLLCGAHVCQKNSPGTYQELAEAPGDPQWMETIGRDLHRQFPLHEMF :::.: ::: : .: ::.. . ..:: :..: .. .:. ..: ::.: :: . : CCDS66 RKGVPLEHRARVWMVLSGAQAQMDQNPGYYHQLLQGERNPRLEDAIRTDLNRTFPDNVKF 70 80 90 100 110 120 150 160 170 180 190 200 pF1KE4 VSPQGHG-QQGLLQVLKAYTLYRPEQGYCQAQGPVAAVL-LMHLPPEEAFWCLVQICEVY . :. : .:: :: . ::::... .:. : :. ::.:: : . CCDS66 RKTTDPCLQRTLYNVLLAYGHHNQGVGYCQGMNFIAGYLILITNNEEESFWLLDALVGRI 130 140 150 160 170 180 210 220 230 240 250 260 pF1KE4 LPGYYGPHMEAVRLDAEVFMALLRRLLPHVHKHLQQVGVGPLLYLPEWFLCLFARSLPFP :: ::.: : ... : ::. :.: :: : ....:: : . .::.:::. :: CCDS66 LPDYYSPAMLGLKTDQEVLGELVRAKLPAVGALMERLGVLWTLLVSRWFICLFVDILPVE 190 200 210 220 230 240 270 280 290 300 310 320 pF1KE4 TVLRVWDAFLSEGARVLFRVGLTLVRLALGTAEQRGACPGLLETLGALRAIPPAQLQEEA ::::.:: ...::....:::.:::.. CCDS66 TVLRIWDCLFNEGSKIIFRVALTLIKQHQELILEATSVPDICDKFKQITKGSFVMECHTF 250 260 270 280 290 300 446 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Mon Nov 7 14:47:04 2016 done: Mon Nov 7 14:47:05 2016 Total Scan time: 3.720 Total Display time: 0.060 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]