Result of FASTA (ccds) for pFN21AE1151
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KE1151, 486 aa
  1>>>pF1KE1151 486 - 486 aa - 486 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.3887+/-0.00101; mu= 4.2485+/- 0.060
 mean_var=213.8938+/-45.245, 0's: 0 Z-trim(111.9): 131  B-trim: 506 in 1/51
 Lambda= 0.087695
 statistics sampled from 12630 (12772) to 12630 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.744), E-opt: 0.2 (0.392), width:  16
 Scan time:  3.630

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS1636.1 TRIM58 gene_id:25893|Hs108|chr1         ( 486) 3372 439.5 3.7e-123
CCDS44525.1 TRIM21 gene_id:6737|Hs108|chr11        ( 475) 1349 183.6 4.1e-46
CCDS31048.1 TRIM11 gene_id:81559|Hs108|chr1        ( 468) 1319 179.8 5.6e-45
CCDS4568.1 TRIM38 gene_id:10475|Hs108|chr6         ( 465) 1215 166.6 5.1e-41
CCDS34378.1 TRIM39 gene_id:56658|Hs108|chr6        ( 488) 1159 159.6 7.1e-39
CCDS1571.1 TRIM17 gene_id:51127|Hs108|chr1         ( 477) 1084 150.1   5e-36
CCDS3808.1 TRIM60 gene_id:166655|Hs108|chr4        ( 471)  948 132.9 7.6e-31
CCDS3851.1 TRIML1 gene_id:339976|Hs108|chr4        ( 468)  933 131.0 2.8e-30
CCDS31390.1 TRIM6 gene_id:117854|Hs108|chr11       ( 488)  851 120.6 3.8e-27
CCDS31389.1 TRIM6 gene_id:117854|Hs108|chr11       ( 516)  851 120.6   4e-27
CCDS78121.1 RPP21 gene_id:202658|Hs108|chr6        ( 503)  812 115.7 1.2e-25
CCDS73363.1 TRIM64 gene_id:120146|Hs108|chr11      ( 449)  791 113.0   7e-25
CCDS2015.1 TRIM43 gene_id:129868|Hs108|chr2        ( 446)  789 112.7 8.3e-25
CCDS53693.1 TRIM64B gene_id:642446|Hs108|chr11     ( 449)  789 112.7 8.3e-25
CCDS31391.1 TRIM34 gene_id:53840|Hs108|chr11       ( 488)  771 110.5 4.3e-24
CCDS31356.1 TRIM68 gene_id:55128|Hs108|chr11       ( 485)  759 109.0 1.2e-23
CCDS55762.1 TRIM49B gene_id:283116|Hs108|chr11     ( 452)  750 107.8 2.5e-23
CCDS73287.1 TRIM64C gene_id:646754|Hs108|chr11     ( 450)  746 107.3 3.6e-23
CCDS31393.1 TRIM5 gene_id:85363|Hs108|chr11        ( 493)  744 107.1 4.6e-23
CCDS5678.1 TRIM4 gene_id:89122|Hs108|chr7          ( 474)  741 106.7 5.8e-23
CCDS31392.1 TRIM5 gene_id:85363|Hs108|chr11        ( 326)  736 105.9 6.8e-23
CCDS31394.1 TRIM5 gene_id:85363|Hs108|chr11        ( 347)  736 105.9 7.2e-23
CCDS31388.1 TRIM34 gene_id:445372|Hs108|chr11      ( 842)  743 107.1 7.4e-23
CCDS53694.1 TRIM49C gene_id:642612|Hs108|chr11     ( 452)  727 104.9 1.9e-22
CCDS8287.1 TRIM49 gene_id:57093|Hs108|chr11        ( 452)  726 104.8 2.1e-22
CCDS41612.1 TRIM22 gene_id:10346|Hs108|chr11       ( 498)  717 103.7 4.9e-22
CCDS60930.1 TRIM49D1 gene_id:399939|Hs108|chr11    ( 452)  705 102.1 1.3e-21
CCDS34377.1 TRIM39 gene_id:56658|Hs108|chr6        ( 518)  665 97.1 4.9e-20
CCDS60929.1 TRIM77 gene_id:390231|Hs108|chr11      ( 450)  648 94.9 1.9e-19
CCDS44327.1 TRIM17 gene_id:51127|Hs108|chr1        ( 343)  630 92.5 7.7e-19
CCDS475.1 ERMAP gene_id:114625|Hs108|chr1          ( 475)  622 91.6   2e-18
CCDS34654.1 TRIM50 gene_id:135892|Hs108|chr7       ( 487)  613 90.5 4.4e-18
CCDS4654.1 TRIM27 gene_id:5987|Hs108|chr6          ( 513)  592 87.8 2.9e-17
CCDS56403.1 BTN2A2 gene_id:10385|Hs108|chr6        ( 313)  584 86.6 4.1e-17
CCDS4607.1 BTN2A2 gene_id:10385|Hs108|chr6         ( 407)  584 86.7   5e-17
CCDS4606.1 BTN2A2 gene_id:10385|Hs108|chr6         ( 523)  584 86.8   6e-17
CCDS56405.1 BTN2A1 gene_id:11120|Hs108|chr6        ( 466)  582 86.5 6.5e-17
CCDS4613.1 BTN2A1 gene_id:11120|Hs108|chr6         ( 527)  582 86.6 7.1e-17
CCDS4614.1 BTN1A1 gene_id:696|Hs108|chr6           ( 526)  581 86.5 7.8e-17
CCDS32437.1 TRIM72 gene_id:493829|Hs108|chr16      ( 477)  577 85.9   1e-16
CCDS4676.1 TRIM10 gene_id:10107|Hs108|chr6         ( 395)  572 85.2 1.4e-16
CCDS4611.1 BTN3A3 gene_id:10384|Hs108|chr6         ( 584)  574 85.6 1.6e-16
CCDS34375.1 TRIM10 gene_id:10107|Hs108|chr6        ( 481)  572 85.3 1.6e-16
CCDS4612.2 BTN3A3 gene_id:10384|Hs108|chr6         ( 535)  570 85.1 2.1e-16
CCDS4460.2 BTNL9 gene_id:153579|Hs108|chr5         ( 535)  567 84.7 2.7e-16
CCDS47388.1 BTN3A1 gene_id:11119|Hs108|chr6        ( 461)  559 83.6 4.9e-16
CCDS4608.1 BTN3A1 gene_id:11119|Hs108|chr6         ( 513)  559 83.7 5.3e-16
CCDS3850.2 TRIML2 gene_id:205860|Hs108|chr4        ( 437)  547 82.1 1.3e-15
CCDS34374.1 TRIM31 gene_id:11074|Hs108|chr6        ( 425)  540 81.2 2.4e-15
CCDS6056.2 TRIM35 gene_id:23087|Hs108|chr8         ( 493)  526 79.5 9.2e-15


>>CCDS1636.1 TRIM58 gene_id:25893|Hs108|chr1              (486 aa)
 initn: 3372 init1: 3372 opt: 3372  Z-score: 2324.5  bits: 439.5 E(32554): 3.7e-123
Smith-Waterman score: 3372; 99.8% identity (99.8% similar) in 486 aa overlap (1-486:1-486)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE1 MAWAPPGERLREDARCPVCLDFLQEPVSVDCGHSFCLRCISEFCEKSDGAQGGVYACPQC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS16 MAWAPPGERLREDARCPVCLDFLQEPVSVDCGHSFCLRCISEFCEKSDGAQGGVYACPQC
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE1 RGPFRPSGFRPNRQLAGLVESVRRLGLGAGPGARRCARHGEDLSRFCEEDEAALCWVCDA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS16 RGPFRPSGFRPNRQLAGLVESVRRLGLGAGPGARRCARHGEDLSRFCEEDEAALCWVCDA
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE1 GPEHRTHRTAPLQEAAGSYQVKLQMALELMRKELEDALTQEANVGKKTVIWKEKVEMQRQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS16 GPEHRTHRTAPLQEAAGSYQVKLQMALELMRKELEDALTQEANVGKKTVIWKEKVEMQRQ
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE1 RFRLEFEKHRGFLAQEEQRQLRRLEAEERATLQRLRESKSRLVQQSKALKELADELQERC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS16 RFRLEFEKHRGFLAQEEQRQLRRLEAEERATLQRLRESKSRLVQQSKALKELADELQERC
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE1 QRPALGLLEGVRGVLSRSKAVTRLEAENIPMELKTACCIPGRRELLRKFQVDVKLDPATA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS16 QRPALGLLEGVRGVLSRSKAVTRLEAENIPMELKTACCIPGRRELLRKFQVDVKLDPATA
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE1 HPSLLLTADLRSVQDGEPWRDVPNNPERFDTWPCILGLQSFSSGRHYWEVLVGEGAEWGL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS16 HPSLLLTADLRSVQDGEPWRDVPNNPERFDTWPCILGLQSFSSGRHYWEVLVGEGAEWGL
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KE1 GVCQDTLPRKGETMPSPENGVWALWLLKGNEYMVLASPSVPLLQLESPRCIGIFLDYEAG
       ::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS16 GVCQDTLPRKGETTPSPENGVWALWLLKGNEYMVLASPSVPLLQLESPRCIGIFLDYEAG
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KE1 EISFYNVTDGSYIYTFNQLFSGLLRPYFFICDATPLILPPTTIAGSGNWASRDHLDPASD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS16 EISFYNVTDGSYIYTFNQLFSGLLRPYFFICDATPLILPPTTIAGSGNWASRDHLDPASD
              430       440       450       460       470       480

             
pF1KE1 VRDDHL
       ::::::
CCDS16 VRDDHL
             

>>CCDS44525.1 TRIM21 gene_id:6737|Hs108|chr11             (475 aa)
 initn: 1300 init1: 1026 opt: 1349  Z-score: 941.4  bits: 183.6 E(32554): 4.1e-46
Smith-Waterman score: 1349; 44.5% identity (71.2% similar) in 479 aa overlap (1-468:1-472)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE1 MAWAPPGERLREDARCPVCLDFLQEPVSVDCGHSFCLRCISEFCEKSDGAQGGVYACPQC
       :: :     . :.. ::.::: . ::::..:::::: .:::.       ..::  .:: :
CCDS44 MASAARLTMMWEEVTCPICLDPFVEPVSIECGHSFCQECISQV------GKGGGSVCPVC
               10        20        30        40              50    

               70        80        90         100       110        
pF1KE1 RGPFRPSGFRPNRQLAGLVESVRRLGLGAGPGAR--RCARHGEDLSRFCEEDEAALCWVC
       :  :  ...:::::::..:.......  :  :..  ::: ::: :  :::.:  ::::::
CCDS44 RQRFLLKNLRPNRQLANMVNNLKEISQEAREGTQGERCAVHGERLHLFCEKDGKALCWVC
           60        70        80        90       100       110    

      120       130       140       150       160       170        
pF1KE1 DAGPEHRTHRTAPLQEAAGSYQVKLQMALELMRKELEDALTQEANVGKKTVIWKEKVEMQ
         . .:: :  .::.:::  :: :::.::  .:.. : :   :.... : . ::. :: :
CCDS44 AQSRKHRDHAMVPLEEAAQEYQEKLQVALGELRRKQELAEKLEVEIAIKRADWKKTVETQ
          120       130       140       150       160       170    

      180       190       200       210       220       230        
pF1KE1 RQRFRLEFEKHRGFLAQEEQRQLRRLEAEERATLQRLRESKSRLVQQSKALKELADELQE
       ..:.. :: ....::..::::::..:: .::  :. : :....:.:::.::.:: .::..
CCDS44 KSRIHAEFVQQKNFLVEEEQRQLQELEKDEREQLRILGEKEAKLAQQSQALQELISELDR
          180       190       200       210       220       230    

      240       250       260       270       280       290        
pF1KE1 RCQRPALGLLEGVRGVLSRSKAVTRLEAENIPMELKTACCIPGRRELLRKFQVDVKLDPA
       ::.  :: ::. :  :: ::.. .  . .    ::...: .:: ...::   : . ::: 
CCDS44 RCHSSALELLQEVIIVLERSESWNLKDLDITSPELRSVCHVPGLKKMLRTCAVHITLDPD
          240       250       260       270       280       290    

      300       310       320       330       340       350        
pF1KE1 TAHPSLLLTADLRSVQDGEPWRDVPNNPERFDTWPCILGLQSFSSGRHYWEVLVGEGAEW
       ::.: :.:. : :.:. :.  ...:.: ::::..: .:: : : ::.::::: :     :
CCDS44 TANPWLILSEDRRQVRLGDTQQSIPGNEERFDSYPMVLGAQHFHSGKHYWEVDVTGKEAW
          300       310       320       330       340       350    

      360       370       380       390       400       410        
pF1KE1 GLGVCQDTLPRKGETMPSPENGVWALWLLKGNEYMVLASPSVPLLQLESPRC-IGIFLDY
        ::::.:.. :::. . : ..: :..:: . ..: . . :..:: .:. : : .::::::
CCDS44 DLGVCRDSVRRKGHFLLSSKSGFWTIWLWNKQKYEAGTYPQTPL-HLQVPPCQVGIFLDY
          360       370       380       390        400       410   

       420        430        440          450          460         
pF1KE1 EAGEISFYNVTD-GSYIYTFNQL-FSGLLRPYF---FI---CDATPLILPPTTIAGSGNW
       ::: .::::.:: :: ::.:..  :.: :::.:   :     ...:: : : .:...:. 
CCDS44 EAGMVSFYNITDHGSLIYSFSECAFTGPLRPFFSPGFNDGGKNTAPLTLCPLNIGSQGST
           420       430       440       450       460       470   

     470       480      
pF1KE1 ASRDHLDPASDVRDDHL
                        
CCDS44 DY               
                        

>>CCDS31048.1 TRIM11 gene_id:81559|Hs108|chr1             (468 aa)
 initn: 1304 init1: 999 opt: 1319  Z-score: 921.0  bits: 179.8 E(32554): 5.6e-45
Smith-Waterman score: 1319; 45.5% identity (66.9% similar) in 475 aa overlap (1-468:1-463)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE1 MAWAPPGERLREDARCPVCLDFLQEPVSVDCGHSFCLRCISEFCEKSDGAQGGVYACPQC
       ::    .  :.:.: : .:::.. .:: .::::.:: .:: . :    :   : ::::.:
CCDS31 MAAPDLSTNLQEEATCAICLDYFTDPVMTDCGHNFCRECIRR-CW---GQPEGPYACPEC
               10        20        30        40            50      

                 70        80        90       100       110        
pF1KE1 R--GPFRPSGFRPNRQLAGLVESVRRLGLGAGPGARRCARHGEDLSRFCEEDEAALCWVC
       :  .: :  ..:::: :: ..: .:::   .      :  : : :. :: ..   :: .:
CCDS31 RELSPQR--NLRPNRPLAKMAEMARRLHPPSPVPQGVCPAHREPLAAFCGDELRLLCAAC
         60          70        80        90       100       110    

      120       130       140       150       160       170        
pF1KE1 DAGPEHRTHRTAPLQEAAGSYQVKLQMALELMRKELEDALTQEANVGKKTVIWKEKVEMQ
       . . :: .::. :::.:: . ..::. .:: .::...:::  .:.. .  :.:.. :: :
CCDS31 ERSGEHWAHRVRPLQDAAEDLKAKLEKSLEHLRKQMQDALLFQAQADETCVLWQKMVESQ
          120       130       140       150       160       170    

      180       190       200       210       220       230        
pF1KE1 RQRFRLEFEKHRGFLAQEEQRQLRRLEAEERATLQRLRESKSRLVQQSKALKELADELQE
       ::    :::. : .::.:::. :.::: ::  .: ::::. ..: :::  : ::  ::. 
CCDS31 RQNVLGEFERLRRLLAEEEQQLLQRLEEEELEVLPRLREGAAHLGQQSAHLAELIAELEG
          180       190       200       210       220       230    

      240       250       260       270       280       290        
pF1KE1 RCQRPALGLLEGVRGVLSRSKAVTRLEAENIPMELKTACCIPGRRELLRKFQVDVKLDPA
       ::: ::::::. .. .: : . :     : .::::.:.: .::  : ::.:. :: ::: 
CCDS31 RCQLPALGLLQDIKDALRRVQDVKLQPPEVVPMELRTVCRVPGLVETLRRFRGDVTLDPD
          240       250       260       270       280       290    

      300       310       320       330       340       350        
pF1KE1 TAHPSLLLTADLRSVQDGEPWRDVPNNPERFDTWPCILGLQSFSSGRHYWEVLVGEGAEW
       ::.: :.:. : :::: :.  . .:..:::::  ::.:: . :.:::::::: ::. . :
CCDS31 TANPELILSEDRRSVQRGDLRQALPDSPERFDPGPCVLGQERFTSGRHYWEVEVGDRTSW
          300       310       320       330       340       350    

      360       370       380       390       400       410        
pF1KE1 GLGVCQDTLPRKGETMPSPENGVWALWLLKGNEYMVLASPSVPLLQLESPRCIGIFLDYE
       .::::.... :: .   :  :: : : .: :. :       .::   . :: .:::::::
CCDS31 ALGVCRENVNRKEKGELSAGNGFWILVFL-GSYYNSSERALAPLR--DPPRRVGIFLDYE
          360       370       380        390         400       410 

      420       430        440       450       460           470   
pF1KE1 AGEISFYNVTDGSYIYTFNQL-FSGLLRPYFFICDATPLILPPTTI----AGSGNWASRD
       ::..:::..:::: .. : .. ::: ::: :   ...:    : ::    .:::.     
CCDS31 AGHLSFYSATDGSLLFIFPEIPFSGTLRPLFSPLSSSPT---PMTICRPKGGSGDTLAPQ
             420       430       440       450          460        

           480      
pF1KE1 HLDPASDVRDDHL

>>CCDS4568.1 TRIM38 gene_id:10475|Hs108|chr6              (465 aa)
 initn: 1250 init1: 464 opt: 1215  Z-score: 849.9  bits: 166.6 E(32554): 5.1e-41
Smith-Waterman score: 1215; 40.6% identity (68.4% similar) in 468 aa overlap (1-460:1-462)

               10        20        30        40        50          
pF1KE1 MAWAPPGERLREDARCPVCLDFLQEPVSVDCGHSFCLRCISEFCEKSDGAQ--GGVYACP
       :: .   ... :.: : .::... .:::..::::.:  ::..: .. .  :    .. ::
CCDS45 MASTTSTKKMMEEATCSICLSLMTNPVSINCGHSYCHLCITDFFKNPSQKQLRQETFCCP
               10        20        30        40        50        60

       60        70        80        90       100       110        
pF1KE1 QCRGPFRPSGFRPNRQLAGLVESVRRLGLGAGPGARRCARHGEDLSRFCEEDEAALCWVC
       :::.::. ...:::.::..:.:....           : .:::..  :::..   .:: :
CCDS45 QCRAPFHMDSLRPNKQLGSLIEALKETDQ-----EMSCEEHGEQFHLFCEDEGQLICWRC
               70        80             90       100       110     

      120       130       140       150        160       170       
pF1KE1 DAGPEHRTHRTAPLQEAAGSYQVKLQMALELMRKELEDALT-QEANVGKKTVIWKEKVEM
       . .:.:. : :: ....  .:. ::: :.  . :.:::  : :. ... . . :::::..
CCDS45 ERAPQHKGHTTALVEDVCQGYKEKLQKAVTKL-KQLEDRCTEQKLSTAMRITKWKEKVQI
         120       130       140        150       160       170    

       180       190       200       210       220       230       
pF1KE1 QRQRFRLEFEKHRGFLAQEEQRQLRRLEAEERATLQRLRESKSRLVQQSKALKELADELQ
       :::..: .:.. . :: .::.  : ::: ::. ::.:::. .. :  .:. ::    ::.
CCDS45 QRQKIRSDFKNLQCFLHEEEKSYLWRLEKEEQQTLSRLRDYEAGLGLKSNELKSHILELE
          180       190       200       210       220       230    

       240       250       260       270       280           290   
pF1KE1 ERCQRPALGLLEGVRGVLSRSKAVTRLEAENIPMELKTACCIP----GRRELLRKFQVDV
       :.::  :  ::..:  .:::: ::    .: . .::.: : .       ...::. ::.:
CCDS45 EKCQGSAQKLLQNVNDTLSRSWAVKLETSEAVSLELHTMCNVSKLYFDVKKMLRSHQVSV
          240       250       260       270       280       290    

           300       310       320       330       340       350   
pF1KE1 KLDPATAHPSLLLTADLRSVQDGEPWRDVPNNPERFDTWPCILGLQSFSSGRHYWEVLVG
        ::: :::  :.:. : :.:  :   ..  .. .:: ..::.:: ..:.:::.:.:: ::
CCDS45 TLDPDTAHHELILSEDRRQVTRGYTQENQDTSSRRFTAFPCVLGCEGFTSGRRYFEVDVG
          300       310       320       330       340       350    

           360       370       380       390       400       410   
pF1KE1 EGAEWGLGVCQDTLPRKGETMPSPENGVWALWLLKGNEYMVLASPSVPLLQLESPRCIGI
       ::. : ::::.... :       :..: :.: : : . :..:.:: . :   :.:  .::
CCDS45 EGTGWDLGVCMENVQRGTGMKQEPQSGFWTLRLCKKKGYVALTSPPTSLHLHEQPLLVGI
          360       370       380       390       400       410    

           420       430        440       450       460       470  
pF1KE1 FLDYEAGEISFYNVTDGSYIYTFNQL-FSGLLRPYFFICDATPLILPPTTIAGSGNWASR
       ::::::: .:::: . : .:.:: .  ::  ::::: . . .::.:::            
CCDS45 FLDYEAGVVSFYNGNTGCHIFTFPKASFSDTLRPYFQVYQYSPLFLPPPGD         
          420       430       440       450       460              

            480      
pF1KE1 DHLDPASDVRDDHL

>>CCDS34378.1 TRIM39 gene_id:56658|Hs108|chr6             (488 aa)
 initn: 1131 init1: 480 opt: 1159  Z-score: 811.4  bits: 159.6 E(32554): 7.1e-39
Smith-Waterman score: 1159; 40.4% identity (68.1% similar) in 470 aa overlap (8-461:21-485)

                            10        20        30        40       
pF1KE1              MAWAPPGERLREDARCPVCLDFLQEPVSVDCGHSFCLRCISEFCEKS
                           : :. .: : :::..:.::: ..:::.::  ::... :  
CCDS34 MAETSLLEAGASAASTAAALENLQVEASCSVCLEYLKEPVIIECGHNFCKACITRWWE--
               10        20        30        40        50          

        50        60        70        80        90          100    
pF1KE1 DGAQGGVYACPQCRGPFRPSGFRPNRQLAGLVESVRRLGLGAGPGARR---CARHGEDLS
       :  .   . :: ::   :  ..::::::...:: ...:  ..    :    : .: : ::
CCDS34 DLERD--FPCPVCRKTSRYRSLRPNRQLGSMVEIAKQLQ-AVKRKIRDESLCPQHHEALS
       60          70        80        90        100       110     

          110       120       130       140       150       160    
pF1KE1 RFCEEDEAALCWVCDAGPEHRTHRTAPLQEAAGSYQVKLQMALELMRKELEDALTQEANV
        :: ::. :.: .:  .  ::.: ..::..:.  :. :::  :: ....:..    ... 
CCDS34 LFCYEDQEAVCLICAISHTHRAHTVVPLDDATQEYKEKLQKCLEPLEQKLQEITRCKSSE
         120       130       140       150       160       170     

          170       180       190       200       210       220    
pF1KE1 GKKTVIWKEKVEMQRQRFRLEFEKHRGFLAQEEQRQLRRLEAEERATLQRLRESKSRLVQ
        ::    :. :: .::..  :::. .  : .:.:  : ::: ::.  ::::::. ..: .
CCDS34 EKKPGELKRLVESRRQQILREFEELHRRLDEEQQVLLSRLEEEEQDILQRLRENAAHLGD
         180       190       200       210       220       230     

          230       240       250       260       270        280   
pF1KE1 QSKALKELADELQERCQRPALGLLEGVRGVLSRSKAVTRLEAENIPMEL-KTACCIPGR-
       . . : .:: :.. .: . .. .:. :...: . . :  .:. .. .:: :.   .: . 
CCDS34 KRRDLAHLAAEVEGKCLQSGFEMLKDVKSTLEKCEKVKTMEVTSVSIELEKNFSNFPRQY
         240       250       260       270       280       290     

               290       300       310        320       330        
pF1KE1 ---RELLRKFQVDVKLDPATAHPSLLLTADLRSVQDGEP-WRDVPNNPERFDTWPCILGL
          :..:... .:: ::: ::::.:.:. : .::.  :   ::.:..:.::  .::.:. 
CCDS34 FALRKILKQLIADVTLDPETAHPNLVLSEDRKSVKFVETRLRDLPDTPRRFTFYPCVLAT
         300       310       320       330       340       350     

      340       350       360       370       380       390        
pF1KE1 QSFSSGRHYWEVLVGEGAEWGLGVCQDTLPRKGETMPSPENGVWALWLLKGNEYMVLASP
       ..:.:::::::: ::. ..:..:::.:.. ::::  : ::.: : . : .:..: . ..:
CCDS34 EGFTSGRHYWEVEVGDKTHWAVGVCRDSVSRKGELTPLPETGYWRVRLWNGDKYAATTTP
         360       370       380       390       400       410     

      400       410       420       430       440       450        
pF1KE1 SVPLLQLESPRCIGIFLDYEAGEISFYNVTDGSYIYTFNQLFSGLLRPYFFIC------D
        .::    .:. .::::::::: .::::::: :.::::.. :.  : : :.        .
CCDS34 FTPLHIKVKPKRVGIFLDYEAGTLSFYNVTDRSHIYTFTDTFTEKLWPLFYPGIRAGRKN
         420       430       440       450       460       470     

             460       470       480      
pF1KE1 ATPL-ILPPTTIAGSGNWASRDHLDPASDVRDDHL
       :.:: : :::                         
CCDS34 AAPLTIRPPTDWE                      
         480                              

>>CCDS1571.1 TRIM17 gene_id:51127|Hs108|chr1              (477 aa)
 initn: 982 init1: 392 opt: 1084  Z-score: 760.2  bits: 150.1 E(32554): 5e-36
Smith-Waterman score: 1084; 38.6% identity (66.4% similar) in 461 aa overlap (9-455:9-461)

               10        20        30        40        50          
pF1KE1 MAWAPPGERLREDARCPVCLDFLQEPVSVDCGHSFCLRCISEFCEKSDGAQG-----GVY
               .:.:.: : .:::.. .:: . :::.::  ::.   ::. : .:     : .
CCDS15 MEAVELARKLQEEATCSICLDYFTDPVMTTCGHNFCRACIQLSWEKARGKKGRRKRKGSF
               10        20        30        40        50        60

          60        70        80        90          100       110  
pF1KE1 ACPQCRGPFRPSGFRPNRQLAGLVESVRRLGLGAGPGARR---CARHGEDLSRFCEEDEA
        ::.::      .. ::: :. ..: ...      :: ..   : .: : :. ::..:..
CCDS15 PCPECREMSPQRNLLPNRLLTKVAEMAQQ-----HPGLQKQDLCQEHHEPLKLFCQKDQS
               70        80             90       100       110     

            120       130       140       150       160       170  
pF1KE1 ALCWVCDAGPEHRTHRTAPLQEAAGSYQVKLQMALELMRKELEDALTQEANVGKKTVIWK
        .: ::  . ::: ::. : .::. .:..::.  .: .:...  . . .:   .. . :.
CCDS15 PICVVCRESREHRLHRVLPAEEAVQGYKLKLEEDMEYLREQITRTGNLQAREEQSLAEWQ
         120       130       140       150       160       170     

            180       190       200       210       220       230  
pF1KE1 EKVEMQRQRFRLEFEKHRGFLAQEEQRQLRRLEAEERATLQRLRESKSRLVQQSKALKEL
        ::. .:.:. :::::   .:..:::: :. ::.::. : .::::: . : .:...:. :
CCDS15 GKVKERRERIVLEFEKMNLYLVEEEQRLLQALETEEEETASRLRESVACLDRQGHSLELL
         180       190       200       210       220       230     

            240       250       260       270        280       290 
pF1KE1 ADELQERCQRPALGLLEGVRGVLSRSKAVTRLEAENIP-MELKTACCIPGRRELLRKFQV
         .:.::  .  : .:. ..  :::.. :.    :  :  . .:.: .::. :.:: :  
CCDS15 LLQLEERSTQGPLQMLQDMKEPLSRKNNVSVQCPEVAPPTRPRTVCRVPGQIEVLRGFLE
         240       250       260       270       280       290     

             300        310       320       330       340       350
pF1KE1 DVKLDPATAHPSLLL-TADLRSVQDGEPWRDVPNNPERFDTWPCILGLQSFSSGRHYWEV
       ::  : ..:.: :::  .  :    . :  .   . .:: ..:: .:  .::::::::::
CCDS15 DVVPDATSAYPYLLLYESRQRRYLGSSPEGSGFCSKDRFVAYPCAVGQTAFSSGRHYWEV
         300       310       320       330       340       350     

                 360       370       380       390       400       
pF1KE1 ---LVGEGAEWGLGVCQDTLPRKGETMPSPENGVWALWLLKGNEYMVLASPSVPLLQLES
          ..:. : :.::::.:.. :: ..   :::: :.. : ::..:.   :  .:.. .: 
CCDS15 GMNITGD-ALWALGVCRDNVSRKDRVPKCPENGFWVVQLSKGTKYLSTFSALTPVMLMEP
         360        370       380       390       400       410    

       410       420       430        440       450       460      
pF1KE1 PRCIGIFLDYEAGEISFYNVTDGSYIYTFNQ-LFSGLLRPYFFICDATPLILPPTTIAGS
       :  .:::::.::::.:::.:.:::...:..:  : : :.:.:  : ..:           
CCDS15 PSHMGIFLDFEAGEVSFYSVSDGSHLHTYSQATFPGPLQPFF--CLGAPKSGQMVISTVT
          420       430       440       450         460       470  

        470       480      
pF1KE1 GNWASRDHLDPASDVRDDHL
                           
CCDS15 MWVKG               
                           

>>CCDS3808.1 TRIM60 gene_id:166655|Hs108|chr4             (471 aa)
 initn: 958 init1: 492 opt: 948  Z-score: 667.3  bits: 132.9 E(32554): 7.6e-31
Smith-Waterman score: 948; 35.7% identity (63.7% similar) in 457 aa overlap (10-456:10-461)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE1 MAWAPPGERLREDARCPVCLDFLQEPVSVDCGHSFCLRCISEFCEKSDGAQGGVYACPQC
                :.:.. ::.::..:..::...:::.::  :.:   .  : .    . :: :
CCDS38 MEFVTALVNLQEESSCPICLEYLKDPVTINCGHNFCRSCLSVSWKDLDDT----FPCPVC
               10        20        30        40        50          

               70        80        90            100       110     
pF1KE1 RGPFRPSGFRPNRQLAGLVESVRRLGLGAGPGARR-----CARHGEDLSRFCEEDEAALC
       :  :  ..:: : :: .:.: ...: .  .   :.     : .:.. :. :: .:   ::
CCDS38 RFCFPYKSFRRNPQLRNLTEIAKQLQIRRSKRKRQKENAMCEKHNQFLTLFCVKDLEILC
         60        70        80        90       100       110      

         120       130       140       150       160       170     
pF1KE1 WVCDAGPEHRTHRTAPLQEAAGSYQVKLQMALELMRKELEDALTQEANVGKKTVIWKEKV
         :. . .:. :   :...::. ..  :. .:: .:...: .       :.:.:  :.::
CCDS38 TQCSFSTKHQKHYICPIKKAASYHREILEGSLEPLRNNIERVEKVIILQGSKSVELKKKV
        120       130       140       150       160       170      

         180       190       200       210       220       230     
pF1KE1 EMQRQRFRLEFEKHRGFLAQEEQRQLRRLEAEERATLQRLRESKSRLVQQSKALKELADE
       :..:...  :::. : :: .:..  ::... ::   : .: :.  .: .  ..::.:  :
CCDS38 EYKREEINSEFEQIRLFLQNEQEMILRQIQDEEMNILAKLNENLVELSDYVSTLKHLLRE
        180       190       200       210       220       230      

         240       250       260       270       280           290 
pF1KE1 LQERCQRPALGLLEGVRGVLSRSKAVTRLEAENIPMELKTACCIP----GRRELLRKFQV
       .. .  .  : ::  ....  . . .   :  .. .  : .  .:    :  .... :::
CCDS38 VEGKSVQSNLELLTQAKSMHHKYQNLKCPELFSFRLT-KYGFSLPPQYSGLDRIIKPFQV
        240       250       260       270        280       290     

             300       310       320       330       340       350 
pF1KE1 DVKLDPATAHPSLLLTADLRSVQDGEPWRDVPNNPERFDTWPCILGLQSFSSGRHYWEVL
       :: ::  ::::.::.. : ..:.  .  :..  .:.:: . : .:: : :::::::::: 
CCDS38 DVILDLNTAHPQLLVSEDRKAVRYERKKRNICYDPRRFYVCPAVLGSQRFSSGRHYWEVE
         300       310       320       330       340       350     

             360       370       380       390       400       410 
pF1KE1 VGEGAEWGLGVCQDTLPRKGETMPSPENGVWALWLLKGNEYMVLASPSVPLLQLESPRCI
       ::.  .: :::::: : :. . .::  .: ::.     . :.. .  .. :: . .:  :
CCDS38 VGNKPKWILGVCQDCLLRNWQDQPSVLGGFWAIGRYMKSGYVASGPKTTQLLPVVKPSKI
         360       370       380       390       400       410     

             420       430       440       450        460       470
pF1KE1 GIFLDYEAGEISFYNVTDGSYIYTFNQLFSGLLRPYFFI-CDATPLILPPTTIAGSGNWA
       ::::::: :..::::..: : .::::. :.  . :::.   :. ::              
CCDS38 GIFLDYELGDLSFYNMNDRSILYTFNDCFTEAVWPYFYTGTDSEPLKICSVSDSER    
         420       430       440       450       460       470     

              480      
pF1KE1 SRDHLDPASDVRDDHL

>>CCDS3851.1 TRIML1 gene_id:339976|Hs108|chr4             (468 aa)
 initn: 737 init1: 368 opt: 933  Z-score: 657.1  bits: 131.0 E(32554): 2.8e-30
Smith-Waterman score: 933; 36.4% identity (64.6% similar) in 461 aa overlap (1-451:1-448)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE1 MAWAPPGERLREDARCPVCLDFLQEPVSVDCGHSFCLRCISEFCEKSDGAQGGVYACPQC
       :. :   : :::.  : .:::... ::...::::::: :. .  :. .       .::.:
CCDS38 MSTADLMENLREELTCFICLDYFSSPVTTECGHSFCLVCLLRSWEEHNTP----LSCPEC
               10        20        30        40        50          

                   70        80        90       100       110      
pF1KE1 ----RGPFRPSGFRPNRQLAGLVESVRRLGLGAGPGARRCARHGEDLSRFCEEDEAALCW
           .::   :. : .: ::......:   : .       .:     . . ......  .
CCDS38 WRTLEGPHFQSNERLGR-LASIARQLRSQVLQSEDEQGSYGRMPTTAKALSDDEQGGSAF
         60        70         80        90       100       110     

        120       130       140       150          160       170   
pF1KE1 VCDAGPEHRTHRTAPLQEAAGSYQVKLQMALELMR---KELEDALTQEANVGKKTVIWKE
       : ..   .:.: ..   ::   .. :::  :.:.:   :: . .::.:    ... . .:
CCDS38 VAQSHGANRVHLSS---EAEEHHREKLQEILNLLRVRRKEAQAVLTHEK---ERVKLCQE
         120          130       140       150       160            

           180       190       200       210       220       230   
pF1KE1 KVEMQRQRFRLEFEKHRGFLAQEEQRQLRRLEAEERATLQRLRESKSRLVQQSKALKELA
       ...  .:    :. : . :: .::: ::. :: ::. ....::... .:.:: ..:... 
CCDS38 ETKTCKQVVVSEYMKMHQFLKEEEQLQLQLLEQEEKENMRKLRNNEIKLTQQIRSLSKMI
     170       180       190       200       210       220         

           240       250       260       270       280       290   
pF1KE1 DELQERCQRPALGLLEGVRGVLSRSKAVTRLEAENIPMELKTACCIPGRRELLRKFQVDV
        ...   :  :.  :: :::.: ::. .     :    :: . : : : .:.::::....
CCDS38 AQIESSSQSSAFESLEEVRGALERSEPLLLQCPEATTTEL-SLCRITGMKEMLRKFSTEI
     230       240       250       260        270       280        

           300       310       320       330       340       350   
pF1KE1 KLDPATAHPSLLLTADLRSVQDGEPWRDVPNNPERFDTWPCILGLQSFSSGRHYWEVLVG
        ::::::.  :.:. ::.::. :   ...:.::::::    .:: : :.:::::::: ::
CCDS38 TLDPATANAYLVLSEDLKSVKYGGSRQQLPDNPERFDQSATVLGTQIFTSGRHYWEVEVG
      290       300       310       320       330       340        

           360       370       380        390       400       410  
pF1KE1 EGAEWGLGVCQDTLPRKGETMPSPENGVWALWLLK-GNEYMVLASPSVPLLQLESPRC-I
       . .:: .:.:.:.. :::. .:.: . ...:  :: :..: . .:  .   ... : : .
CCDS38 NKTEWEVGICKDSVSRKGN-LPKPPGDLFSLIGLKIGDDYSLWVSSPLKGQHVREPVCKV
      350       360        370       380       390       400       

             420       430        440       450       460       470
pF1KE1 GIFLDYEAGEISFYNVTDGSYIYTFNQL-FSGLLRPYFFICDATPLILPPTTIAGSGNWA
       :.:::::.:.:.::: :: : ::.: :  :.  ::: :  :                   
CCDS38 GVFLDYESGHIAFYNGTDESLIYSFPQASFQEALRPIFSPCLPNEGTNTDPLTICSLNSH
       410       420       430       440       450       460       

              480      
pF1KE1 SRDHLDPASDVRDDHL
                       
CCDS38 V               
                       

>>CCDS31390.1 TRIM6 gene_id:117854|Hs108|chr11            (488 aa)
 initn: 748 init1: 474 opt: 851  Z-score: 600.8  bits: 120.6 E(32554): 3.8e-27
Smith-Waterman score: 1083; 37.7% identity (67.1% similar) in 477 aa overlap (10-458:9-483)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE1 MAWAPPGERLREDARCPVCLDFLQEPVSVDCGHSFCLRCISEFCEKSDGAQGGVYACPQC
                .::.. ::.::..: ::.:.:::::::  ::.   ..:  .: :  .:: :
CCDS31  MTSPVLVDIREEVTCPICLELLTEPLSIDCGHSFCQACITPNGRESVIGQEGERSCPVC
                10        20        30        40        50         

               70        80        90         100       110        
pF1KE1 RGPFRPSGFRPNRQLAGLVESVRRLGLGAGPGARR--CARHGEDLSRFCEEDEAALCWVC
       .  ..:...::::.::..:. .:.. :: :   .   :: ::: :. ::.::  ..::.:
CCDS31 QTSYQPGNLRPNRHLANIVRRLREVVLGPGKQLKAVLCADHGEKLQLFCQEDGKVICWLC
      60        70        80        90       100       110         

      120       130       140       150       160       170        
pF1KE1 DAGPEHRTHRTAPLQEAAGSYQVKLQMALELMRKELEDALTQEANVGKKTVIWKEKVEMQ
       . . ::: :.:  ..:.:  :: :.: .:. ...: ..:    : . .: . ::...: .
CCDS31 ERSQEHRGHHTFLVEEVAQEYQEKFQESLKKLKNEEQEAEKLTAFIREKKTSWKNQMEPE
     120       130       140       150       160       170         

      180       190       200       210       220       230        
pF1KE1 RQRFRLEFEKHRGFLAQEEQRQLRRLEAEERATLQRLRESKSRLVQQSKALKELADELQE
       : :.. ::.. :..: . :::.:..:: ::.  :. ..:... ::.:...:.:: ..:..
CCDS31 RCRIQTEFNQLRNILDRVEQRELKKLEQEEKKGLRIIEEAENDLVHQTQSLRELISDLER
     180       190       200       210       220       230         

      240       250       260       270       280                  
pF1KE1 RCQRPALGLLEGVRGVLSRSKAVTRLEAENIPMELKTACCIPGRRELLR---------KF
       :::  .. ::. :  :  ::.  :  . : .: .:..    :  ...::         ..
CCDS31 RCQGSTMELLQDVSDVTERSEFWTLRKPEALPTKLRSMFRAPDLKRMLRVCRELTDVQSY
     240       250       260       270       280       290         

     290       300       310       320       330        340        
pF1KE1 QVDVKLDPATAHPSLLLTADLRSVQDGEPWRDVPNNPERFDTWPC-ILGLQSFSSGRHYW
        ::: :.: ::. .:.:. . :.:.      . :.  :.   . : .:: : ::::.:::
CCDS31 WVDVTLNPHTANLNLVLAKNRRQVRFVGAKVSGPSCLEKH--YDCSVLGSQHFSSGKHYW
     300       310       320       330         340       350       

      350       360                  370       380       390       
pF1KE1 EVLVGEGAEWGLGVCQDTL-P----------RKGETMPSPENGVWALWLLKGNEYMVL--
       :: :.. . : ::::...: :          ... .  .:..: :.. : ...:: .   
CCDS31 EVDVAKKTAWILGVCSNSLGPTFSFNHFAQNHSAYSRYQPQSGYWVIGLQHNHEYRAYED
       360       370       380       390       400       410       

         400       410       420       430         440       450   
pF1KE1 ASPSVPLLQLESPRCIGIFLDYEAGEISFYNVTDGSY-IYTFNQL-FSGLLRPYFFICDA
       .:::. : .   :: .:.::::::: .::::::. .. ::::..  :   : :::  :. 
CCDS31 SSPSLLLSMTVPPRRVGVFLDYEAGTVSFYNVTNHGFPIYTFSKYYFPTTLCPYFNPCNC
       420       430       440       450       460       470       

            460       470       480      
pF1KE1 T-PLILPPTTIAGSGNWASRDHLDPASDVRDDHL
       . :. :                            
CCDS31 VIPMTLRRPSS                       
       480                               

>>CCDS31389.1 TRIM6 gene_id:117854|Hs108|chr11            (516 aa)
 initn: 748 init1: 474 opt: 851  Z-score: 600.4  bits: 120.6 E(32554): 4e-27
Smith-Waterman score: 1083; 37.7% identity (67.1% similar) in 477 aa overlap (10-458:37-511)

                                    10        20        30         
pF1KE1                      MAWAPPGERLREDARCPVCLDFLQEPVSVDCGHSFCLRC
                                     .::.. ::.::..: ::.:.:::::::  :
CCDS31 ILQAGNILEIRVGQAGARRVATMTSPVLVDIREEVTCPICLELLTEPLSIDCGHSFCQAC
         10        20        30        40        50        60      

      40        50        60        70        80        90         
pF1KE1 ISEFCEKSDGAQGGVYACPQCRGPFRPSGFRPNRQLAGLVESVRRLGLGAGPGARR--CA
       :.   ..:  .: :  .:: :.  ..:...::::.::..:. .:.. :: :   .   ::
CCDS31 ITPNGRESVIGQEGERSCPVCQTSYQPGNLRPNRHLANIVRRLREVVLGPGKQLKAVLCA
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