FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE1151, 486 aa 1>>>pF1KE1151 486 - 486 aa - 486 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.3887+/-0.00101; mu= 4.2485+/- 0.060 mean_var=213.8938+/-45.245, 0's: 0 Z-trim(111.9): 131 B-trim: 506 in 1/51 Lambda= 0.087695 statistics sampled from 12630 (12772) to 12630 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.744), E-opt: 0.2 (0.392), width: 16 Scan time: 3.630 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS1636.1 TRIM58 gene_id:25893|Hs108|chr1 ( 486) 3372 439.5 3.7e-123 CCDS44525.1 TRIM21 gene_id:6737|Hs108|chr11 ( 475) 1349 183.6 4.1e-46 CCDS31048.1 TRIM11 gene_id:81559|Hs108|chr1 ( 468) 1319 179.8 5.6e-45 CCDS4568.1 TRIM38 gene_id:10475|Hs108|chr6 ( 465) 1215 166.6 5.1e-41 CCDS34378.1 TRIM39 gene_id:56658|Hs108|chr6 ( 488) 1159 159.6 7.1e-39 CCDS1571.1 TRIM17 gene_id:51127|Hs108|chr1 ( 477) 1084 150.1 5e-36 CCDS3808.1 TRIM60 gene_id:166655|Hs108|chr4 ( 471) 948 132.9 7.6e-31 CCDS3851.1 TRIML1 gene_id:339976|Hs108|chr4 ( 468) 933 131.0 2.8e-30 CCDS31390.1 TRIM6 gene_id:117854|Hs108|chr11 ( 488) 851 120.6 3.8e-27 CCDS31389.1 TRIM6 gene_id:117854|Hs108|chr11 ( 516) 851 120.6 4e-27 CCDS78121.1 RPP21 gene_id:202658|Hs108|chr6 ( 503) 812 115.7 1.2e-25 CCDS73363.1 TRIM64 gene_id:120146|Hs108|chr11 ( 449) 791 113.0 7e-25 CCDS2015.1 TRIM43 gene_id:129868|Hs108|chr2 ( 446) 789 112.7 8.3e-25 CCDS53693.1 TRIM64B gene_id:642446|Hs108|chr11 ( 449) 789 112.7 8.3e-25 CCDS31391.1 TRIM34 gene_id:53840|Hs108|chr11 ( 488) 771 110.5 4.3e-24 CCDS31356.1 TRIM68 gene_id:55128|Hs108|chr11 ( 485) 759 109.0 1.2e-23 CCDS55762.1 TRIM49B gene_id:283116|Hs108|chr11 ( 452) 750 107.8 2.5e-23 CCDS73287.1 TRIM64C gene_id:646754|Hs108|chr11 ( 450) 746 107.3 3.6e-23 CCDS31393.1 TRIM5 gene_id:85363|Hs108|chr11 ( 493) 744 107.1 4.6e-23 CCDS5678.1 TRIM4 gene_id:89122|Hs108|chr7 ( 474) 741 106.7 5.8e-23 CCDS31392.1 TRIM5 gene_id:85363|Hs108|chr11 ( 326) 736 105.9 6.8e-23 CCDS31394.1 TRIM5 gene_id:85363|Hs108|chr11 ( 347) 736 105.9 7.2e-23 CCDS31388.1 TRIM34 gene_id:445372|Hs108|chr11 ( 842) 743 107.1 7.4e-23 CCDS53694.1 TRIM49C gene_id:642612|Hs108|chr11 ( 452) 727 104.9 1.9e-22 CCDS8287.1 TRIM49 gene_id:57093|Hs108|chr11 ( 452) 726 104.8 2.1e-22 CCDS41612.1 TRIM22 gene_id:10346|Hs108|chr11 ( 498) 717 103.7 4.9e-22 CCDS60930.1 TRIM49D1 gene_id:399939|Hs108|chr11 ( 452) 705 102.1 1.3e-21 CCDS34377.1 TRIM39 gene_id:56658|Hs108|chr6 ( 518) 665 97.1 4.9e-20 CCDS60929.1 TRIM77 gene_id:390231|Hs108|chr11 ( 450) 648 94.9 1.9e-19 CCDS44327.1 TRIM17 gene_id:51127|Hs108|chr1 ( 343) 630 92.5 7.7e-19 CCDS475.1 ERMAP gene_id:114625|Hs108|chr1 ( 475) 622 91.6 2e-18 CCDS34654.1 TRIM50 gene_id:135892|Hs108|chr7 ( 487) 613 90.5 4.4e-18 CCDS4654.1 TRIM27 gene_id:5987|Hs108|chr6 ( 513) 592 87.8 2.9e-17 CCDS56403.1 BTN2A2 gene_id:10385|Hs108|chr6 ( 313) 584 86.6 4.1e-17 CCDS4607.1 BTN2A2 gene_id:10385|Hs108|chr6 ( 407) 584 86.7 5e-17 CCDS4606.1 BTN2A2 gene_id:10385|Hs108|chr6 ( 523) 584 86.8 6e-17 CCDS56405.1 BTN2A1 gene_id:11120|Hs108|chr6 ( 466) 582 86.5 6.5e-17 CCDS4613.1 BTN2A1 gene_id:11120|Hs108|chr6 ( 527) 582 86.6 7.1e-17 CCDS4614.1 BTN1A1 gene_id:696|Hs108|chr6 ( 526) 581 86.5 7.8e-17 CCDS32437.1 TRIM72 gene_id:493829|Hs108|chr16 ( 477) 577 85.9 1e-16 CCDS4676.1 TRIM10 gene_id:10107|Hs108|chr6 ( 395) 572 85.2 1.4e-16 CCDS4611.1 BTN3A3 gene_id:10384|Hs108|chr6 ( 584) 574 85.6 1.6e-16 CCDS34375.1 TRIM10 gene_id:10107|Hs108|chr6 ( 481) 572 85.3 1.6e-16 CCDS4612.2 BTN3A3 gene_id:10384|Hs108|chr6 ( 535) 570 85.1 2.1e-16 CCDS4460.2 BTNL9 gene_id:153579|Hs108|chr5 ( 535) 567 84.7 2.7e-16 CCDS47388.1 BTN3A1 gene_id:11119|Hs108|chr6 ( 461) 559 83.6 4.9e-16 CCDS4608.1 BTN3A1 gene_id:11119|Hs108|chr6 ( 513) 559 83.7 5.3e-16 CCDS3850.2 TRIML2 gene_id:205860|Hs108|chr4 ( 437) 547 82.1 1.3e-15 CCDS34374.1 TRIM31 gene_id:11074|Hs108|chr6 ( 425) 540 81.2 2.4e-15 CCDS6056.2 TRIM35 gene_id:23087|Hs108|chr8 ( 493) 526 79.5 9.2e-15 >>CCDS1636.1 TRIM58 gene_id:25893|Hs108|chr1 (486 aa) initn: 3372 init1: 3372 opt: 3372 Z-score: 2324.5 bits: 439.5 E(32554): 3.7e-123 Smith-Waterman score: 3372; 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CCDS44 KSRIHAEFVQQKNFLVEEEQRQLQELEKDEREQLRILGEKEAKLAQQSQALQELISELDR 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE1 RCQRPALGLLEGVRGVLSRSKAVTRLEAENIPMELKTACCIPGRRELLRKFQVDVKLDPA ::. :: ::. : :: ::.. . . . ::...: .:: ...:: : . ::: CCDS44 RCHSSALELLQEVIIVLERSESWNLKDLDITSPELRSVCHVPGLKKMLRTCAVHITLDPD 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KE1 TAHPSLLLTADLRSVQDGEPWRDVPNNPERFDTWPCILGLQSFSSGRHYWEVLVGEGAEW ::.: :.:. : :.:. :. ...:.: ::::..: .:: : : ::.::::: : : CCDS44 TANPWLILSEDRRQVRLGDTQQSIPGNEERFDSYPMVLGAQHFHSGKHYWEVDVTGKEAW 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KE1 GLGVCQDTLPRKGETMPSPENGVWALWLLKGNEYMVLASPSVPLLQLESPRC-IGIFLDY ::::.:.. :::. . : ..: :..:: . ..: . . :..:: .:. : : .:::::: CCDS44 DLGVCRDSVRRKGHFLLSSKSGFWTIWLWNKQKYEAGTYPQTPL-HLQVPPCQVGIFLDY 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 pF1KE1 EAGEISFYNVTD-GSYIYTFNQL-FSGLLRPYF---FI---CDATPLILPPTTIAGSGNW ::: .::::.:: :: ::.:.. :.: :::.: : ...:: : : .:...:. CCDS44 EAGMVSFYNITDHGSLIYSFSECAFTGPLRPFFSPGFNDGGKNTAPLTLCPLNIGSQGST 420 430 440 450 460 470 470 480 pF1KE1 ASRDHLDPASDVRDDHL CCDS44 DY >>CCDS31048.1 TRIM11 gene_id:81559|Hs108|chr1 (468 aa) initn: 1304 init1: 999 opt: 1319 Z-score: 921.0 bits: 179.8 E(32554): 5.6e-45 Smith-Waterman score: 1319; 45.5% identity (66.9% similar) in 475 aa overlap (1-468:1-463) 10 20 30 40 50 60 pF1KE1 MAWAPPGERLREDARCPVCLDFLQEPVSVDCGHSFCLRCISEFCEKSDGAQGGVYACPQC :: . :.:.: : .:::.. .:: .::::.:: .:: . : : : ::::.: CCDS31 MAAPDLSTNLQEEATCAICLDYFTDPVMTDCGHNFCRECIRR-CW---GQPEGPYACPEC 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 pF1KE1 R--GPFRPSGFRPNRQLAGLVESVRRLGLGAGPGARRCARHGEDLSRFCEEDEAALCWVC : .: : ..:::: :: ..: .::: . : : : :. :: .. :: .: CCDS31 RELSPQR--NLRPNRPLAKMAEMARRLHPPSPVPQGVCPAHREPLAAFCGDELRLLCAAC 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE1 DAGPEHRTHRTAPLQEAAGSYQVKLQMALELMRKELEDALTQEANVGKKTVIWKEKVEMQ . . :: .::. :::.:: . ..::. .:: .::...::: .:.. . :.:.. :: : CCDS31 ERSGEHWAHRVRPLQDAAEDLKAKLEKSLEHLRKQMQDALLFQAQADETCVLWQKMVESQ 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE1 RQRFRLEFEKHRGFLAQEEQRQLRRLEAEERATLQRLRESKSRLVQQSKALKELADELQE :: :::. : .::.:::. :.::: :: .: ::::. ..: ::: : :: ::. CCDS31 RQNVLGEFERLRRLLAEEEQQLLQRLEEEELEVLPRLREGAAHLGQQSAHLAELIAELEG 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE1 RCQRPALGLLEGVRGVLSRSKAVTRLEAENIPMELKTACCIPGRRELLRKFQVDVKLDPA ::: ::::::. .. .: : . : : .::::.:.: .:: : ::.:. :: ::: CCDS31 RCQLPALGLLQDIKDALRRVQDVKLQPPEVVPMELRTVCRVPGLVETLRRFRGDVTLDPD 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KE1 TAHPSLLLTADLRSVQDGEPWRDVPNNPERFDTWPCILGLQSFSSGRHYWEVLVGEGAEW ::.: :.:. : :::: :. . .:..::::: ::.:: . :.:::::::: ::. . : CCDS31 TANPELILSEDRRSVQRGDLRQALPDSPERFDPGPCVLGQERFTSGRHYWEVEVGDRTSW 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KE1 GLGVCQDTLPRKGETMPSPENGVWALWLLKGNEYMVLASPSVPLLQLESPRCIGIFLDYE .::::.... :: . : :: : : .: :. : .:: . :: .::::::: CCDS31 ALGVCRENVNRKEKGELSAGNGFWILVFL-GSYYNSSERALAPLR--DPPRRVGIFLDYE 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 pF1KE1 AGEISFYNVTDGSYIYTFNQL-FSGLLRPYFFICDATPLILPPTTI----AGSGNWASRD ::..:::..:::: .. : .. ::: ::: : ...: : :: .:::. CCDS31 AGHLSFYSATDGSLLFIFPEIPFSGTLRPLFSPLSSSPT---PMTICRPKGGSGDTLAPQ 420 430 440 450 460 480 pF1KE1 HLDPASDVRDDHL >>CCDS4568.1 TRIM38 gene_id:10475|Hs108|chr6 (465 aa) initn: 1250 init1: 464 opt: 1215 Z-score: 849.9 bits: 166.6 E(32554): 5.1e-41 Smith-Waterman score: 1215; 40.6% identity (68.4% similar) in 468 aa overlap (1-460:1-462) 10 20 30 40 50 pF1KE1 MAWAPPGERLREDARCPVCLDFLQEPVSVDCGHSFCLRCISEFCEKSDGAQ--GGVYACP :: . ... :.: : .::... .:::..::::.: ::..: .. . : .. :: CCDS45 MASTTSTKKMMEEATCSICLSLMTNPVSINCGHSYCHLCITDFFKNPSQKQLRQETFCCP 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE1 QCRGPFRPSGFRPNRQLAGLVESVRRLGLGAGPGARRCARHGEDLSRFCEEDEAALCWVC :::.::. ...:::.::..:.:.... : .:::.. :::.. .:: : CCDS45 QCRAPFHMDSLRPNKQLGSLIEALKETDQ-----EMSCEEHGEQFHLFCEDEGQLICWRC 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE1 DAGPEHRTHRTAPLQEAAGSYQVKLQMALELMRKELEDALT-QEANVGKKTVIWKEKVEM . .:.:. : :: .... .:. ::: :. . :.::: : :. ... . . :::::.. CCDS45 ERAPQHKGHTTALVEDVCQGYKEKLQKAVTKL-KQLEDRCTEQKLSTAMRITKWKEKVQI 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE1 QRQRFRLEFEKHRGFLAQEEQRQLRRLEAEERATLQRLRESKSRLVQQSKALKELADELQ :::..: .:.. . :: .::. : ::: ::. ::.:::. .. : .:. :: ::. CCDS45 QRQKIRSDFKNLQCFLHEEEKSYLWRLEKEEQQTLSRLRDYEAGLGLKSNELKSHILELE 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE1 ERCQRPALGLLEGVRGVLSRSKAVTRLEAENIPMELKTACCIP----GRRELLRKFQVDV :.:: : ::..: .:::: :: .: . .::.: : . ...::. ::.: CCDS45 EKCQGSAQKLLQNVNDTLSRSWAVKLETSEAVSLELHTMCNVSKLYFDVKKMLRSHQVSV 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KE1 KLDPATAHPSLLLTADLRSVQDGEPWRDVPNNPERFDTWPCILGLQSFSSGRHYWEVLVG ::: ::: :.:. : :.: : .. .. .:: ..::.:: ..:.:::.:.:: :: CCDS45 TLDPDTAHHELILSEDRRQVTRGYTQENQDTSSRRFTAFPCVLGCEGFTSGRRYFEVDVG 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KE1 EGAEWGLGVCQDTLPRKGETMPSPENGVWALWLLKGNEYMVLASPSVPLLQLESPRCIGI ::. : ::::.... : :..: :.: : : . :..:.:: . : :.: .:: CCDS45 EGTGWDLGVCMENVQRGTGMKQEPQSGFWTLRLCKKKGYVALTSPPTSLHLHEQPLLVGI 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 pF1KE1 FLDYEAGEISFYNVTDGSYIYTFNQL-FSGLLRPYFFICDATPLILPPTTIAGSGNWASR ::::::: .:::: . : .:.:: . :: ::::: . . .::.::: CCDS45 FLDYEAGVVSFYNGNTGCHIFTFPKASFSDTLRPYFQVYQYSPLFLPPPGD 420 430 440 450 460 480 pF1KE1 DHLDPASDVRDDHL >>CCDS34378.1 TRIM39 gene_id:56658|Hs108|chr6 (488 aa) initn: 1131 init1: 480 opt: 1159 Z-score: 811.4 bits: 159.6 E(32554): 7.1e-39 Smith-Waterman score: 1159; 40.4% identity (68.1% similar) in 470 aa overlap (8-461:21-485) 10 20 30 40 pF1KE1 MAWAPPGERLREDARCPVCLDFLQEPVSVDCGHSFCLRCISEFCEKS : :. .: : :::..:.::: ..:::.:: ::... : CCDS34 MAETSLLEAGASAASTAAALENLQVEASCSVCLEYLKEPVIIECGHNFCKACITRWWE-- 10 20 30 40 50 50 60 70 80 90 100 pF1KE1 DGAQGGVYACPQCRGPFRPSGFRPNRQLAGLVESVRRLGLGAGPGARR---CARHGEDLS : . . :: :: : ..::::::...:: ...: .. : : .: : :: CCDS34 DLERD--FPCPVCRKTSRYRSLRPNRQLGSMVEIAKQLQ-AVKRKIRDESLCPQHHEALS 60 70 80 90 100 110 110 120 130 140 150 160 pF1KE1 RFCEEDEAALCWVCDAGPEHRTHRTAPLQEAAGSYQVKLQMALELMRKELEDALTQEANV :: ::. :.: .: . ::.: ..::..:. :. ::: :: ....:.. ... CCDS34 LFCYEDQEAVCLICAISHTHRAHTVVPLDDATQEYKEKLQKCLEPLEQKLQEITRCKSSE 120 130 140 150 160 170 170 180 190 200 210 220 pF1KE1 GKKTVIWKEKVEMQRQRFRLEFEKHRGFLAQEEQRQLRRLEAEERATLQRLRESKSRLVQ :: :. :: .::.. :::. . : .:.: : ::: ::. ::::::. ..: . CCDS34 EKKPGELKRLVESRRQQILREFEELHRRLDEEQQVLLSRLEEEEQDILQRLRENAAHLGD 180 190 200 210 220 230 230 240 250 260 270 280 pF1KE1 QSKALKELADELQERCQRPALGLLEGVRGVLSRSKAVTRLEAENIPMEL-KTACCIPGR- . . : .:: :.. .: . .. .:. :...: . . : .:. .. .:: :. .: . CCDS34 KRRDLAHLAAEVEGKCLQSGFEMLKDVKSTLEKCEKVKTMEVTSVSIELEKNFSNFPRQY 240 250 260 270 280 290 290 300 310 320 330 pF1KE1 ---RELLRKFQVDVKLDPATAHPSLLLTADLRSVQDGEP-WRDVPNNPERFDTWPCILGL :..:... .:: ::: ::::.:.:. : .::. : ::.:..:.:: .::.:. CCDS34 FALRKILKQLIADVTLDPETAHPNLVLSEDRKSVKFVETRLRDLPDTPRRFTFYPCVLAT 300 310 320 330 340 350 340 350 360 370 380 390 pF1KE1 QSFSSGRHYWEVLVGEGAEWGLGVCQDTLPRKGETMPSPENGVWALWLLKGNEYMVLASP ..:.:::::::: ::. ..:..:::.:.. :::: : ::.: : . : .:..: . ..: CCDS34 EGFTSGRHYWEVEVGDKTHWAVGVCRDSVSRKGELTPLPETGYWRVRLWNGDKYAATTTP 360 370 380 390 400 410 400 410 420 430 440 450 pF1KE1 SVPLLQLESPRCIGIFLDYEAGEISFYNVTDGSYIYTFNQLFSGLLRPYFFIC------D .:: .:. .::::::::: .::::::: :.::::.. :. : : :. . CCDS34 FTPLHIKVKPKRVGIFLDYEAGTLSFYNVTDRSHIYTFTDTFTEKLWPLFYPGIRAGRKN 420 430 440 450 460 470 460 470 480 pF1KE1 ATPL-ILPPTTIAGSGNWASRDHLDPASDVRDDHL :.:: : ::: CCDS34 AAPLTIRPPTDWE 480 >>CCDS1571.1 TRIM17 gene_id:51127|Hs108|chr1 (477 aa) initn: 982 init1: 392 opt: 1084 Z-score: 760.2 bits: 150.1 E(32554): 5e-36 Smith-Waterman score: 1084; 38.6% identity (66.4% similar) in 461 aa overlap (9-455:9-461) 10 20 30 40 50 pF1KE1 MAWAPPGERLREDARCPVCLDFLQEPVSVDCGHSFCLRCISEFCEKSDGAQG-----GVY .:.:.: : .:::.. .:: . :::.:: ::. ::. : .: : . CCDS15 MEAVELARKLQEEATCSICLDYFTDPVMTTCGHNFCRACIQLSWEKARGKKGRRKRKGSF 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE1 ACPQCRGPFRPSGFRPNRQLAGLVESVRRLGLGAGPGARR---CARHGEDLSRFCEEDEA ::.:: .. ::: :. ..: ... :: .. : .: : :. ::..:.. CCDS15 PCPECREMSPQRNLLPNRLLTKVAEMAQQ-----HPGLQKQDLCQEHHEPLKLFCQKDQS 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE1 ALCWVCDAGPEHRTHRTAPLQEAAGSYQVKLQMALELMRKELEDALTQEANVGKKTVIWK .: :: . ::: ::. : .::. .:..::. .: .:... . . .: .. . :. CCDS15 PICVVCRESREHRLHRVLPAEEAVQGYKLKLEEDMEYLREQITRTGNLQAREEQSLAEWQ 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE1 EKVEMQRQRFRLEFEKHRGFLAQEEQRQLRRLEAEERATLQRLRESKSRLVQQSKALKEL ::. .:.:. ::::: .:..:::: :. ::.::. : .::::: . : .:...:. : CCDS15 GKVKERRERIVLEFEKMNLYLVEEEQRLLQALETEEEETASRLRESVACLDRQGHSLELL 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE1 ADELQERCQRPALGLLEGVRGVLSRSKAVTRLEAENIP-MELKTACCIPGRRELLRKFQV .:.:: . : .:. .. :::.. :. : : . .:.: .::. :.:: : CCDS15 LLQLEERSTQGPLQMLQDMKEPLSRKNNVSVQCPEVAPPTRPRTVCRVPGQIEVLRGFLE 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KE1 DVKLDPATAHPSLLL-TADLRSVQDGEPWRDVPNNPERFDTWPCILGLQSFSSGRHYWEV :: : ..:.: ::: . : . : . . .:: ..:: .: .:::::::::: CCDS15 DVVPDATSAYPYLLLYESRQRRYLGSSPEGSGFCSKDRFVAYPCAVGQTAFSSGRHYWEV 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 pF1KE1 ---LVGEGAEWGLGVCQDTLPRKGETMPSPENGVWALWLLKGNEYMVLASPSVPLLQLES ..:. : :.::::.:.. :: .. :::: :.. : ::..:. : .:.. .: CCDS15 GMNITGD-ALWALGVCRDNVSRKDRVPKCPENGFWVVQLSKGTKYLSTFSALTPVMLMEP 360 370 380 390 400 410 410 420 430 440 450 460 pF1KE1 PRCIGIFLDYEAGEISFYNVTDGSYIYTFNQ-LFSGLLRPYFFICDATPLILPPTTIAGS : .:::::.::::.:::.:.:::...:..: : : :.:.: : ..: CCDS15 PSHMGIFLDFEAGEVSFYSVSDGSHLHTYSQATFPGPLQPFF--CLGAPKSGQMVISTVT 420 430 440 450 460 470 470 480 pF1KE1 GNWASRDHLDPASDVRDDHL CCDS15 MWVKG >>CCDS3808.1 TRIM60 gene_id:166655|Hs108|chr4 (471 aa) initn: 958 init1: 492 opt: 948 Z-score: 667.3 bits: 132.9 E(32554): 7.6e-31 Smith-Waterman score: 948; 35.7% identity (63.7% similar) in 457 aa overlap (10-456:10-461) 10 20 30 40 50 60 pF1KE1 MAWAPPGERLREDARCPVCLDFLQEPVSVDCGHSFCLRCISEFCEKSDGAQGGVYACPQC :.:.. ::.::..:..::...:::.:: :.: . : . . :: : CCDS38 MEFVTALVNLQEESSCPICLEYLKDPVTINCGHNFCRSCLSVSWKDLDDT----FPCPVC 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 pF1KE1 RGPFRPSGFRPNRQLAGLVESVRRLGLGAGPGARR-----CARHGEDLSRFCEEDEAALC : : ..:: : :: .:.: ...: . . :. : .:.. :. :: .: :: CCDS38 RFCFPYKSFRRNPQLRNLTEIAKQLQIRRSKRKRQKENAMCEKHNQFLTLFCVKDLEILC 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE1 WVCDAGPEHRTHRTAPLQEAAGSYQVKLQMALELMRKELEDALTQEANVGKKTVIWKEKV :. . .:. : :...::. .. :. .:: .:...: . :.:.: :.:: CCDS38 TQCSFSTKHQKHYICPIKKAASYHREILEGSLEPLRNNIERVEKVIILQGSKSVELKKKV 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE1 EMQRQRFRLEFEKHRGFLAQEEQRQLRRLEAEERATLQRLRESKSRLVQQSKALKELADE :..:... :::. : :: .:.. ::... :: : .: :. .: . ..::.: : CCDS38 EYKREEINSEFEQIRLFLQNEQEMILRQIQDEEMNILAKLNENLVELSDYVSTLKHLLRE 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE1 LQERCQRPALGLLEGVRGVLSRSKAVTRLEAENIPMELKTACCIP----GRRELLRKFQV .. . . : :: .... . . . : .. . : . .: : .... ::: CCDS38 VEGKSVQSNLELLTQAKSMHHKYQNLKCPELFSFRLT-KYGFSLPPQYSGLDRIIKPFQV 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KE1 DVKLDPATAHPSLLLTADLRSVQDGEPWRDVPNNPERFDTWPCILGLQSFSSGRHYWEVL :: :: ::::.::.. : ..:. . :.. .:.:: . : .:: : :::::::::: CCDS38 DVILDLNTAHPQLLVSEDRKAVRYERKKRNICYDPRRFYVCPAVLGSQRFSSGRHYWEVE 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KE1 VGEGAEWGLGVCQDTLPRKGETMPSPENGVWALWLLKGNEYMVLASPSVPLLQLESPRCI ::. .: :::::: : :. . .:: .: ::. . :.. . .. :: . .: : CCDS38 VGNKPKWILGVCQDCLLRNWQDQPSVLGGFWAIGRYMKSGYVASGPKTTQLLPVVKPSKI 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 pF1KE1 GIFLDYEAGEISFYNVTDGSYIYTFNQLFSGLLRPYFFI-CDATPLILPPTTIAGSGNWA ::::::: :..::::..: : .::::. :. . :::. :. :: CCDS38 GIFLDYELGDLSFYNMNDRSILYTFNDCFTEAVWPYFYTGTDSEPLKICSVSDSER 420 430 440 450 460 470 480 pF1KE1 SRDHLDPASDVRDDHL >>CCDS3851.1 TRIML1 gene_id:339976|Hs108|chr4 (468 aa) initn: 737 init1: 368 opt: 933 Z-score: 657.1 bits: 131.0 E(32554): 2.8e-30 Smith-Waterman score: 933; 36.4% identity (64.6% similar) in 461 aa overlap (1-451:1-448) 10 20 30 40 50 60 pF1KE1 MAWAPPGERLREDARCPVCLDFLQEPVSVDCGHSFCLRCISEFCEKSDGAQGGVYACPQC :. : : :::. : .:::... ::...::::::: :. . :. . .::.: CCDS38 MSTADLMENLREELTCFICLDYFSSPVTTECGHSFCLVCLLRSWEEHNTP----LSCPEC 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 pF1KE1 ----RGPFRPSGFRPNRQLAGLVESVRRLGLGAGPGARRCARHGEDLSRFCEEDEAALCW .:: :. : .: ::......: : . .: . . ...... . CCDS38 WRTLEGPHFQSNERLGR-LASIARQLRSQVLQSEDEQGSYGRMPTTAKALSDDEQGGSAF 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE1 VCDAGPEHRTHRTAPLQEAAGSYQVKLQMALELMR---KELEDALTQEANVGKKTVIWKE : .. .:.: .. :: .. ::: :.:.: :: . .::.: ... . .: CCDS38 VAQSHGANRVHLSS---EAEEHHREKLQEILNLLRVRRKEAQAVLTHEK---ERVKLCQE 120 130 140 150 160 180 190 200 210 220 230 pF1KE1 KVEMQRQRFRLEFEKHRGFLAQEEQRQLRRLEAEERATLQRLRESKSRLVQQSKALKELA ... .: :. : . :: .::: ::. :: ::. ....::... .:.:: ..:... CCDS38 ETKTCKQVVVSEYMKMHQFLKEEEQLQLQLLEQEEKENMRKLRNNEIKLTQQIRSLSKMI 170 180 190 200 210 220 240 250 260 270 280 290 pF1KE1 DELQERCQRPALGLLEGVRGVLSRSKAVTRLEAENIPMELKTACCIPGRRELLRKFQVDV ... : :. :: :::.: ::. . : :: . : : : .:.::::.... CCDS38 AQIESSSQSSAFESLEEVRGALERSEPLLLQCPEATTTEL-SLCRITGMKEMLRKFSTEI 230 240 250 260 270 280 300 310 320 330 340 350 pF1KE1 KLDPATAHPSLLLTADLRSVQDGEPWRDVPNNPERFDTWPCILGLQSFSSGRHYWEVLVG ::::::. :.:. ::.::. : ...:.:::::: .:: : :.:::::::: :: CCDS38 TLDPATANAYLVLSEDLKSVKYGGSRQQLPDNPERFDQSATVLGTQIFTSGRHYWEVEVG 290 300 310 320 330 340 360 370 380 390 400 410 pF1KE1 EGAEWGLGVCQDTLPRKGETMPSPENGVWALWLLK-GNEYMVLASPSVPLLQLESPRC-I . .:: .:.:.:.. :::. .:.: . ...: :: :..: . .: . ... : : . CCDS38 NKTEWEVGICKDSVSRKGN-LPKPPGDLFSLIGLKIGDDYSLWVSSPLKGQHVREPVCKV 350 360 370 380 390 400 420 430 440 450 460 470 pF1KE1 GIFLDYEAGEISFYNVTDGSYIYTFNQL-FSGLLRPYFFICDATPLILPPTTIAGSGNWA :.:::::.:.:.::: :: : ::.: : :. ::: : : CCDS38 GVFLDYESGHIAFYNGTDESLIYSFPQASFQEALRPIFSPCLPNEGTNTDPLTICSLNSH 410 420 430 440 450 460 480 pF1KE1 SRDHLDPASDVRDDHL CCDS38 V >>CCDS31390.1 TRIM6 gene_id:117854|Hs108|chr11 (488 aa) initn: 748 init1: 474 opt: 851 Z-score: 600.8 bits: 120.6 E(32554): 3.8e-27 Smith-Waterman score: 1083; 37.7% identity (67.1% similar) in 477 aa overlap (10-458:9-483) 10 20 30 40 50 60 pF1KE1 MAWAPPGERLREDARCPVCLDFLQEPVSVDCGHSFCLRCISEFCEKSDGAQGGVYACPQC .::.. ::.::..: ::.:.::::::: ::. ..: .: : .:: : CCDS31 MTSPVLVDIREEVTCPICLELLTEPLSIDCGHSFCQACITPNGRESVIGQEGERSCPVC 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 pF1KE1 RGPFRPSGFRPNRQLAGLVESVRRLGLGAGPGARR--CARHGEDLSRFCEEDEAALCWVC . ..:...::::.::..:. .:.. :: : . :: ::: :. ::.:: ..::.: CCDS31 QTSYQPGNLRPNRHLANIVRRLREVVLGPGKQLKAVLCADHGEKLQLFCQEDGKVICWLC 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE1 DAGPEHRTHRTAPLQEAAGSYQVKLQMALELMRKELEDALTQEANVGKKTVIWKEKVEMQ . . ::: :.: ..:.: :: :.: .:. ...: ..: : . .: . ::...: . CCDS31 ERSQEHRGHHTFLVEEVAQEYQEKFQESLKKLKNEEQEAEKLTAFIREKKTSWKNQMEPE 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE1 RQRFRLEFEKHRGFLAQEEQRQLRRLEAEERATLQRLRESKSRLVQQSKALKELADELQE : :.. ::.. :..: . :::.:..:: ::. :. ..:... ::.:...:.:: ..:.. CCDS31 RCRIQTEFNQLRNILDRVEQRELKKLEQEEKKGLRIIEEAENDLVHQTQSLRELISDLER 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 pF1KE1 RCQRPALGLLEGVRGVLSRSKAVTRLEAENIPMELKTACCIPGRRELLR---------KF ::: .. ::. : : ::. : . : .: .:.. : ...:: .. CCDS31 RCQGSTMELLQDVSDVTERSEFWTLRKPEALPTKLRSMFRAPDLKRMLRVCRELTDVQSY 240 250 260 270 280 290 290 300 310 320 330 340 pF1KE1 QVDVKLDPATAHPSLLLTADLRSVQDGEPWRDVPNNPERFDTWPC-ILGLQSFSSGRHYW ::: :.: ::. .:.:. . :.:. . :. :. . : .:: : ::::.::: CCDS31 WVDVTLNPHTANLNLVLAKNRRQVRFVGAKVSGPSCLEKH--YDCSVLGSQHFSSGKHYW 300 310 320 330 340 350 350 360 370 380 390 pF1KE1 EVLVGEGAEWGLGVCQDTL-P----------RKGETMPSPENGVWALWLLKGNEYMVL-- :: :.. . : ::::...: : ... . .:..: :.. : ...:: . CCDS31 EVDVAKKTAWILGVCSNSLGPTFSFNHFAQNHSAYSRYQPQSGYWVIGLQHNHEYRAYED 360 370 380 390 400 410 400 410 420 430 440 450 pF1KE1 ASPSVPLLQLESPRCIGIFLDYEAGEISFYNVTDGSY-IYTFNQL-FSGLLRPYFFICDA .:::. : . :: .:.::::::: .::::::. .. ::::.. : : ::: :. 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