FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE4090, 456 aa 1>>>pF1KE4090 456 - 456 aa - 456 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.4551+/-0.000689; mu= 18.1215+/- 0.042 mean_var=90.6433+/-17.843, 0's: 0 Z-trim(112.4): 105 B-trim: 73 in 1/49 Lambda= 0.134712 statistics sampled from 12984 (13129) to 12984 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.744), E-opt: 0.2 (0.403), width: 16 Scan time: 3.440 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS12755.1 KCNA7 gene_id:3743|Hs108|chr19 ( 456) 3109 614.0 9.8e-176 CCDS828.2 KCNA3 gene_id:3738|Hs108|chr1 ( 575) 1958 390.4 2.5e-108 CCDS41629.1 KCNA4 gene_id:3739|Hs108|chr11 ( 653) 1910 381.1 1.8e-105 CCDS827.1 KCNA2 gene_id:3737|Hs108|chr1 ( 499) 1884 376.0 4.9e-104 CCDS8535.1 KCNA1 gene_id:3736|Hs108|chr12 ( 495) 1156 234.5 1.9e-61 CCDS55625.1 KCNA2 gene_id:3737|Hs108|chr1 ( 356) 1139 231.1 1.5e-60 CCDS8536.1 KCNA5 gene_id:3741|Hs108|chr12 ( 613) 1118 227.2 3.7e-59 CCDS826.1 KCNA10 gene_id:3744|Hs108|chr1 ( 511) 1081 219.9 4.7e-57 CCDS8534.1 KCNA6 gene_id:3742|Hs108|chr12 ( 529) 864 177.8 2.4e-44 CCDS13418.1 KCNB1 gene_id:3745|Hs108|chr20 ( 858) 755 156.8 8.2e-38 CCDS6209.1 KCNB2 gene_id:9312|Hs108|chr8 ( 911) 753 156.4 1.1e-37 CCDS5776.1 KCND2 gene_id:3751|Hs108|chr7 ( 630) 656 137.4 4e-32 CCDS14314.1 KCND1 gene_id:3750|Hs108|chrX ( 647) 653 136.8 6.2e-32 CCDS844.1 KCND3 gene_id:3752|Hs108|chr1 ( 636) 652 136.6 7e-32 CCDS843.1 KCND3 gene_id:3752|Hs108|chr1 ( 655) 652 136.6 7.1e-32 CCDS1692.1 KCNS3 gene_id:3790|Hs108|chr2 ( 491) 640 134.2 2.9e-31 CCDS6279.1 KCNS2 gene_id:3788|Hs108|chr8 ( 477) 633 132.8 7.3e-31 CCDS12793.1 KCNC3 gene_id:3748|Hs108|chr19 ( 757) 631 132.6 1.3e-30 CCDS13342.1 KCNS1 gene_id:3787|Hs108|chr20 ( 526) 628 131.9 1.5e-30 CCDS44193.1 KCNC4 gene_id:3749|Hs108|chr1 ( 626) 611 128.7 1.7e-29 CCDS821.1 KCNC4 gene_id:3749|Hs108|chr1 ( 635) 611 128.7 1.7e-29 CCDS9006.1 KCNC2 gene_id:3747|Hs108|chr12 ( 558) 606 127.6 3.1e-29 CCDS58255.1 KCNC2 gene_id:3747|Hs108|chr12 ( 583) 606 127.7 3.2e-29 CCDS9005.1 KCNC2 gene_id:3747|Hs108|chr12 ( 613) 606 127.7 3.3e-29 CCDS58257.1 KCNC2 gene_id:3747|Hs108|chr12 ( 618) 606 127.7 3.3e-29 CCDS58256.1 KCNC2 gene_id:3747|Hs108|chr12 ( 629) 606 127.7 3.4e-29 CCDS9007.1 KCNC2 gene_id:3747|Hs108|chr12 ( 638) 606 127.7 3.4e-29 CCDS7827.1 KCNC1 gene_id:3746|Hs108|chr11 ( 511) 602 126.8 5e-29 CCDS44547.1 KCNC1 gene_id:3746|Hs108|chr11 ( 585) 602 126.9 5.5e-29 CCDS13436.1 KCNG1 gene_id:3755|Hs108|chr20 ( 513) 599 126.3 7.5e-29 CCDS1676.1 KCNF1 gene_id:3754|Hs108|chr2 ( 494) 588 124.1 3.2e-28 CCDS42674.1 KCNG3 gene_id:170850|Hs108|chr2 ( 425) 585 123.5 4.3e-28 CCDS12019.1 KCNG2 gene_id:26251|Hs108|chr18 ( 466) 581 122.7 7.9e-28 CCDS10945.1 KCNG4 gene_id:93107|Hs108|chr16 ( 519) 573 121.2 2.5e-27 CCDS6447.1 KCNV2 gene_id:169522|Hs108|chr9 ( 545) 565 119.7 7.6e-27 CCDS6314.1 KCNV1 gene_id:27012|Hs108|chr8 ( 500) 553 117.3 3.6e-26 CCDS1809.1 KCNG3 gene_id:170850|Hs108|chr2 ( 436) 541 114.9 1.6e-25 CCDS7736.1 KCNQ1 gene_id:3784|Hs108|chr11 ( 676) 299 68.1 3.3e-11 >>CCDS12755.1 KCNA7 gene_id:3743|Hs108|chr19 (456 aa) initn: 3109 init1: 3109 opt: 3109 Z-score: 3268.5 bits: 614.0 E(32554): 9.8e-176 Smith-Waterman score: 3109; 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CCDS82 SDPFFVVETLCIIWFSFELLVRFFACPSKATFSRNIMNLIDIVAIIPYFITLGTELAERQ 300 310 320 330 340 350 270 280 290 300 310 320 pF1KE4 GVGQQAMSLAILRVIRLVRVFRIFKLSRHSKGLQILGQTLRASMRELGLLIFFLFIGVVL : ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::.: CCDS82 GNGQQAMSLAILRVIRLVRVFRIFKLSRHSKGLQILGQTLKASMRELGLLIFFLFIGVIL 360 370 380 390 400 410 330 340 350 360 370 380 pF1KE4 FSSAVYFAEVDRVDSHFTSIPESFWWAVVTMTTVGYGDMAPVTVGGKIVGSLCAIAGVLT :::::::::.: : :.:::..:::::::::::::::: :::.:::::::::::::::: CCDS82 FSSAVYFAEADDPTSGFSSIPDAFWWAVVTMTTVGYGDMHPVTIGGKIVGSLCAIAGVLT 420 430 440 450 460 470 390 400 410 420 430 440 pF1KE4 ISLPVPVIVSNFSYFYHRETEGEEAGMFSHVDMQPCGPLEGKANGGLVDGEVPELPPPLW :.::::::::::.::::::::::: ... :: : : ..: CCDS82 IALPVPVIVSNFNYFYHRETEGEEQSQYMHVG--SCQHLSSSAEELRKARSNSTLSKSEY 480 490 500 510 520 450 pF1KE4 APPGKHLVTEV CCDS82 MVIEEGGMNHSAFPQTPFKTGNSTATCTTNNNPNSCVNIKKIFTDV 530 540 550 560 570 >>CCDS41629.1 KCNA4 gene_id:3739|Hs108|chr11 (653 aa) initn: 1944 init1: 821 opt: 1910 Z-score: 2007.1 bits: 381.1 E(32554): 1.8e-105 Smith-Waterman score: 1910; 69.4% identity (86.4% similar) in 412 aa overlap (11-415:174-581) 10 20 30 40 pF1KE4 MEPRCPPPCGCCERLVLNVAGLRFETRARTLGRFPDTLLG ::::.:.::.::::::. .::..::.:::: CCDS41 EDDHGDECSYTDLLPQDEGGGGYSSVRYSDCCERVVINVSGLRFETQMKTLAQFPETLLG 150 160 170 180 190 200 50 60 70 80 90 100 pF1KE4 DPARRGRFYDDARREYFFDRHRPSFDAVLYYYQSGGRLRRPAHVPLDVFLEEVAFYGLGA :: .: ...: : ::::::.::::::.::::::::::.::..::.:.: ::: :: :: CCDS41 DPEKRTQYFDPLRNEYFFDRNRPSFDAILYYYQSGGRLKRPVNVPFDIFTEEVKFYQLGE 210 220 230 240 250 260 110 120 130 140 150 pF1KE4 AALARLREDEGCPVPPE-RPLPRRAFARQLWLLFEFPESSQAARVLAVVSVLVILVSIVV :: ..::::: : : ::. : .:.:::::.::::. :: .:.:::::::.:::. CCDS41 EALLKFREDEGFVREEEDRALPENEFKKQIWLLFEYPESSSPARGIAIVSVLVILISIVI 270 280 290 300 310 320 160 170 180 190 200 210 pF1KE4 FCLETLPDFRDDRDGTGLAAAAAAGPFPAPLNGSSQMPG--NPPRLPFNDPFFVVETLCI :::::::.:::::: :. : .:: . :: .: : : . ::::::.:::.:: CCDS41 FCLETLPEFRDDRD---LVMALSAGGHGGLLNDTSA-PHLENSGHTIFNDPFFIVETVCI 330 340 350 360 370 220 230 240 250 260 270 pF1KE4 CWFSFELLVRLLVCPSKAIFFKNVMNLIDFVAILPYFVALGTELARQRGVG----QQAMS :::::..:: ..:::.:.::::.::.::.:.:::::..:::.::.:.: : ::::: CCDS41 VWFSFEFVVRCFACPSQALFFKNIMNIIDIVSILPYFITLGTDLAQQQGGGNGQQQQAMS 380 390 400 410 420 430 280 290 300 310 320 330 pF1KE4 LAILRVIRLVRVFRIFKLSRHSKGLQILGQTLRASMRELGLLIFFLFIGVVLFSSAVYFA .::::.:::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::.::::::::: CCDS41 FAILRIIRLVRVFRIFKLSRHSKGLQILGHTLRASMRELGLLIFFLFIGVILFSSAVYFA 440 450 460 470 480 490 340 350 360 370 380 390 pF1KE4 EVDRVDSHFTSIPESFWWAVVTMTTVGYGDMAPVTVGGKIVGSLCAIAGVLTISLPVPVI :.:. .:: :::..:::::::::::::::: :.:::::::::::::::::::.:::::: CCDS41 EADEPTTHFQSIPDAFWWAVVTMTTVGYGDMKPITVGGKIVGSLCAIAGVLTIALPVPVI 500 510 520 530 540 550 400 410 420 430 440 450 pF1KE4 VSNFSYFYHRETEGEEAGMFSHVDMQPCGPLEGKANGGLVDGEVPELPPPLWAPPGKHLV ::::.::::::::.:: .... CCDS41 VSNFNYFYHRETENEEQTQLTQNAVSCPYLPSNLLKKFRSSTSSSLGDKSEYLEMEEGVK 560 570 580 590 600 610 >>CCDS827.1 KCNA2 gene_id:3737|Hs108|chr1 (499 aa) initn: 1928 init1: 839 opt: 1884 Z-score: 1981.3 bits: 376.0 E(32554): 4.9e-104 Smith-Waterman score: 1884; 68.0% identity (83.8% similar) in 419 aa overlap (11-423:31-439) 10 20 30 40 pF1KE4 MEPRCPPPCGCCERLVLNVAGLRFETRARTLGRFPDTLLG ::::.:.:..::::::. .::..::.:::: CCDS82 MTVATGDPADEAAALPGHPQDTYDPEADHECCERVVINISGLRFETQLKTLAQFPETLLG 10 20 30 40 50 60 50 60 70 80 90 100 pF1KE4 DPARRGRFYDDARREYFFDRHRPSFDAVLYYYQSGGRLRRPAHVPLDVFLEEVAFYGLGA :: .: :..: : ::::::.::::::.:::::::::::::..::::.: ::. :: :: CCDS82 DPKKRMRYFDPLRNEYFFDRNRPSFDAILYYYQSGGRLRRPVNVPLDIFSEEIRFYELGE 70 80 90 100 110 120 110 120 130 140 150 160 pF1KE4 AALARLREDEGCPVPPERPLPRRAFARQLWLLFEFPESSQAARVLAVVSVLVILVSIVVF :. .::::: :::::. : ::.:::::.:::: ::..:.:::.:::.::: : CCDS82 EAMEMFREDEGYIKEEERPLPENEFQRQVWLLFEYPESSGPARIIAIVSVMVILISIVSF 130 140 150 160 170 180 170 180 190 200 210 pF1KE4 CLETLPDFRD---DRDGTGLAAAAAAGPFPAPLNGSSQMPGNPPRLPFNDPFFVVETLCI :::::: ::: : :.:.. : . :.. : :.::::.:::::: CCDS82 CLETLPIFRDENEDMHGSGVT-------FHTYSNST---IGYQQSTSFTDPFFIVETLCI 190 200 210 220 230 220 230 240 250 260 270 pF1KE4 CWFSFELLVRLLVCPSKAIFFKNVMNLIDFVAILPYFVALGTELARQ---RGVGQQAMSL :::::.:::...::::: :: :.::.::.:::.:::..::::::.. ::::::: CCDS82 IWFSFEFLVRFFACPSKAGFFTNIMNIIDIVAIIPYFITLGTELAEKPEDAQQGQQAMSL 240 250 260 270 280 290 280 290 300 310 320 330 pF1KE4 AILRVIRLVRVFRIFKLSRHSKGLQILGQTLRASMRELGLLIFFLFIGVVLFSSAVYFAE :::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::.:::::::::: CCDS82 AILRVIRLVRVFRIFKLSRHSKGLQILGQTLKASMRELGLLIFFLFIGVILFSSAVYFAE 300 310 320 330 340 350 340 350 360 370 380 390 pF1KE4 VDRVDSHFTSIPESFWWAVVTMTTVGYGDMAPVTVGGKIVGSLCAIAGVLTISLPVPVIV .:. .:.: :::..::::::.:::::::::.:.:.:::::::::::::::::.::::::: CCDS82 ADERESQFPSIPDAFWWAVVSMTTVGYGDMVPTTIGGKIVGSLCAIAGVLTIALPVPVIV 360 370 380 390 400 410 400 410 420 430 440 450 pF1KE4 SNFSYFYHRETEGEEAGMFSHVDMQPCGPLEGKANGGLVDGEVPELPPPLWAPPGKHLVT :::.::::::::::: ... .: : : CCDS82 SNFNYFYHRETEGEEQAQYLQVTSCPKIPSSPDLKKSRSASTISKSDYMEIQEGVNNSNE 420 430 440 450 460 470 >>CCDS8535.1 KCNA1 gene_id:3736|Hs108|chr12 (495 aa) initn: 1941 init1: 844 opt: 1156 Z-score: 1216.7 bits: 234.5 E(32554): 1.9e-61 Smith-Waterman score: 1904; 68.9% identity (87.0% similar) in 408 aa overlap (11-416:35-430) 10 20 30 40 pF1KE4 MEPRCPPPCGCCERLVLNVAGLRFETRARTLGRFPDTLLG ::::.:.:..::::::. .::..::.:::: CCDS85 SGENVDEASAAPGHPQDGSYPRQADHDDHECCERVVINISGLRFETQLKTLAQFPNTLLG 10 20 30 40 50 60 50 60 70 80 90 100 pF1KE4 DPARRGRFYDDARREYFFDRHRPSFDAVLYYYQSGGRLRRPAHVPLDVFLEEVAFYGLGA .: .: :..: : ::::::.::::::.:::::::::::::..::::.: ::. :: :: CCDS85 NPKKRMRYFDPLRNEYFFDRNRPSFDAILYYYQSGGRLRRPVNVPLDMFSEEIKFYELGE 70 80 90 100 110 120 110 120 130 140 150 160 pF1KE4 AALARLREDEGCPVPPERPLPRRAFARQLWLLFEFPESSQAARVLAVVSVLVILVSIVVF :. ..::::: :::::.. . ::.:::::.:::: :::.:.:::.:::.:::.: CCDS85 EAMEKFREDEGFIKEEERPLPEKEYQRQVWLLFEYPESSGPARVIAIVSVMVILISIVIF 130 140 150 160 170 180 170 180 190 200 210 220 pF1KE4 CLETLPDFRDDRDGTGLAAAAAAGPFPAPLNGSSQMPGNPPRLPFNDPFFVVETLCICWF ::::::...::.: :: . : . . .: :.::::.:::::: :: CCDS85 CLETLPELKDDKDFTGTVHRID--------NTTVIYNSNI----FTDPFFIVETLCIIWF 190 200 210 220 230 230 240 250 260 270 pF1KE4 SFELLVRLLVCPSKAIFFKNVMNLIDFVAILPYFVALGTELARQRGV--GQQAMSLAILR ::::.::...::::. ::::.::.::.:::.:::..::::.:.:.: :.:: :::::: CCDS85 SFELVVRFFACPSKTDFFKNIMNFIDIVAIIPYFITLGTEIAEQEGNQKGEQATSLAILR 240 250 260 270 280 290 280 290 300 310 320 330 pF1KE4 VIRLVRVFRIFKLSRHSKGLQILGQTLRASMRELGLLIFFLFIGVVLFSSAVYFAEVDRV :::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::.::::::::::.... CCDS85 VIRLVRVFRIFKLSRHSKGLQILGQTLKASMRELGLLIFFLFIGVILFSSAVYFAEAEEA 300 310 320 330 340 350 340 350 360 370 380 390 pF1KE4 DSHFTSIPESFWWAVVTMTTVGYGDMAPVTVGGKIVGSLCAIAGVLTISLPVPVIVSNFS .:::.:::..::::::.::::::::: :::.:::::::::::::::::.::::::::::. CCDS85 ESHFSSIPDAFWWAVVSMTTVGYGDMYPVTIGGKIVGSLCAIAGVLTIALPVPVIVSNFN 360 370 380 390 400 410 400 410 420 430 440 450 pF1KE4 YFYHRETEGEEAGMFSHVDMQPCGPLEGKANGGLVDGEVPELPPPLWAPPGKHLVTEV ::::::::::: ... :: CCDS85 YFYHRETEGEEQAQLLHVSSPNLASDSDLSRRSSSTMSKSEYMEIEEDMNNSIAHYRQVN 420 430 440 450 460 470 >>CCDS55625.1 KCNA2 gene_id:3737|Hs108|chr1 (356 aa) initn: 1134 init1: 771 opt: 1139 Z-score: 1200.7 bits: 231.1 E(32554): 1.5e-60 Smith-Waterman score: 1139; 58.7% identity (77.3% similar) in 300 aa overlap (11-304:31-318) 10 20 30 40 pF1KE4 MEPRCPPPCGCCERLVLNVAGLRFETRARTLGRFPDTLLG ::::.:.:..::::::. .::..::.:::: CCDS55 MTVATGDPADEAAALPGHPQDTYDPEADHECCERVVINISGLRFETQLKTLAQFPETLLG 10 20 30 40 50 60 50 60 70 80 90 100 pF1KE4 DPARRGRFYDDARREYFFDRHRPSFDAVLYYYQSGGRLRRPAHVPLDVFLEEVAFYGLGA :: .: :..: : ::::::.::::::.:::::::::::::..::::.: ::. :: :: CCDS55 DPKKRMRYFDPLRNEYFFDRNRPSFDAILYYYQSGGRLRRPVNVPLDIFSEEIRFYELGE 70 80 90 100 110 120 110 120 130 140 150 160 pF1KE4 AALARLREDEGCPVPPERPLPRRAFARQLWLLFEFPESSQAARVLAVVSVLVILVSIVVF :. .::::: :::::. : ::.:::::.:::: ::..:.:::.:::.::: : CCDS55 EAMEMFREDEGYIKEEERPLPENEFQRQVWLLFEYPESSGPARIIAIVSVMVILISIVSF 130 140 150 160 170 180 170 180 190 200 210 pF1KE4 CLETLPDFRD---DRDGTGLAAAAAAGPFPAPLNGSSQMPGNPPRLPFNDPFFVVETLCI :::::: ::: : :.:.. : . :.. : :.::::.:::::: CCDS55 CLETLPIFRDENEDMHGSGVT-------FHTYSNSTI---GYQQSTSFTDPFFIVETLCI 190 200 210 220 230 220 230 240 250 260 270 pF1KE4 CWFSFELLVRLLVCPSKAIFFKNVMNLIDFVAILPYFVALGTELARQ---RGVGQQAMSL :::::.:::...::::: :: :.::.::.:::.:::..::::::.. ::::::: CCDS55 IWFSFEFLVRFFACPSKAGFFTNIMNIIDIVAIIPYFITLGTELAEKPEDAQQGQQAMSL 240 250 260 270 280 290 280 290 300 310 320 330 pF1KE4 AILRVIRLVRVFRIFKLSRHSKGLQILGQTLRASMRELGLLIFFLFIGVVLFSSAVYFAE :::::::: : : .. .. ..: : :. . CCDS55 AILRVIRLER--RPLQSQKSKRGRQHLNTSHDCTLGINLVAGMTVQWTRASGPDDRQTPA 300 310 320 330 340 >>CCDS8536.1 KCNA5 gene_id:3741|Hs108|chr12 (613 aa) initn: 1886 init1: 824 opt: 1118 Z-score: 1175.6 bits: 227.2 E(32554): 3.7e-59 Smith-Waterman score: 1865; 66.7% identity (83.4% similar) in 427 aa overlap (13-423:120-546) 10 20 30 40 pF1KE4 MEPRCPPPCGCCERLVLNVAGLRFETRARTLGRFPDTLLGDP .:. .:..::::::. ::..::.:::::: CCDS85 RPPPEDEEEEGDPGLGTVEDQALGTASLHHQRVHINISGLRFETQLGTLAQFPNTLLGDP 90 100 110 120 130 140 50 60 70 80 90 100 pF1KE4 ARRGRFYDDARREYFFDRHRPSFDAVLYYYQSGGRLRRPAHVPLDVFLEEVAFYGLGAAA :.: :..: : ::::::.:::::..:::::::::::::..: :::: .:. :: :: : CCDS85 AKRLRYFDPLRNEYFFDRNRPSFDGILYYYQSGGRLRRPVNVSLDVFADEIRFYQLGDEA 150 160 170 180 190 200 110 120 130 140 150 160 pF1KE4 LARLREDEGCPVPPERPLPRRAFARQLWLLFEFPESSQAARVLAVVSVLVILVSIVVFCL . :.::::: :.:::: : ::.::.::.:::: .::..:.:::::::.::..::: CCDS85 MERFREDEGFIKEEEKPLPRNEFQRQVWLIFEYPESSGSARAIAIVSVLVILISIITFCL 210 220 230 240 250 260 170 180 190 200 210 pF1KE4 ETLPDFRDDRDGTGLAAAAAAGPFPAP-LNGSSQM--PGNP---PRLP--FNDPFFVVET ::::.:::.:. : : ::: :::. : :..: : :: . ::::.::: CCDS85 ETLPEFRDERELLRHPPAPHQPPAPAPGANGSGVMAPPSGPTVAPLLPRTLADPFFIVET 270 280 290 300 310 320 220 230 240 250 260 pF1KE4 LCICWFSFELLVRLLVCPSKAIFFKNVMNLIDFVAILPYFVALGTELARQRG-------V :. ::.::::::...::::: : .:.::.:: :::.:::..::::::.:. CCDS85 TCVIWFTFELLVRFFACPSKAGFSRNIMNIIDVVAIFPYFITLGTELAEQQPGGGGGGQN 330 340 350 360 370 380 270 280 290 300 310 320 pF1KE4 GQQAMSLAILRVIRLVRVFRIFKLSRHSKGLQILGQTLRASMRELGLLIFFLFIGVVLFS :::::::::::::::::::::::::::::::::::.::.:::::::::::::::::.::: CCDS85 GQQAMSLAILRVIRLVRVFRIFKLSRHSKGLQILGKTLQASMRELGLLIFFLFIGVILFS 390 400 410 420 430 440 330 340 350 360 370 380 pF1KE4 SAVYFAEVDRVDSHFTSIPESFWWAVVTMTTVGYGDMAPVTVGGKIVGSLCAIAGVLTIS :::::::.: .::.:::..:::::::::::::::: :.:::::::::::::::::::. CCDS85 SAVYFAEADNQGTHFSSIPDAFWWAVVTMTTVGYGDMRPITVGGKIVGSLCAIAGVLTIA 450 460 470 480 490 500 390 400 410 420 430 440 pF1KE4 LPVPVIVSNFSYFYHRETEGEEAGMFSHVD-MQPCGPLEGKANGGLVDGEVPELPPPLWA ::::::::::.:::::::. :: ..... . : :: CCDS85 LPVPVIVSNFNYFYHRETDHEEPAVLKEEQGTQSQGPGLDRGVQRKVSGSRGSFCKAGGT 510 520 530 540 550 560 450 pF1KE4 PPGKHLVTEV CCDS85 LENADSARRGSCPLEKCNVKAKSNVDLRRSLYALCLDTSRETDL 570 580 590 600 610 >>CCDS826.1 KCNA10 gene_id:3744|Hs108|chr1 (511 aa) initn: 1785 init1: 818 opt: 1081 Z-score: 1137.7 bits: 219.9 E(32554): 4.7e-57 Smith-Waterman score: 1766; 64.6% identity (85.0% similar) in 412 aa overlap (2-409:72-472) 10 20 pF1KE4 MEPRCPPPCGCCE---RLVLNVAGLRFETRA .: : : : :...:.:::::::. CCDS82 GGSSFSNGKILISESTNHETAFSKLPGDYADPPGPEPVVLNEGNQRVIINIAGLRFETQL 50 60 70 80 90 100 30 40 50 60 70 80 pF1KE4 RTLGRFPDTLLGDPARRGRFYDDARREYFFDRHRPSFDAVLYYYQSGGRLRRPAHVPLDV :::..::.::::: .: .:.:. : ::::::.:::::..::::::::..::::.::.:. CCDS82 RTLSQFPETLLGDREKRMQFFDSMRNEYFFDRNRPSFDGILYYYQSGGKIRRPANVPIDI 110 120 130 140 150 160 90 100 110 120 130 140 pF1KE4 FLEEVAFYGLGAAALARLREDEGCPVPPERPLPRRAFARQLWLLFEFPESSQAARVLAVV : .:..:: ::. :. ..::::: :: :: . ::.:::::.::::.:::..::: CCDS82 FADEISFYELGSEAMDQFREDEGFIKDPETLLPTNDIHRQFWLLFEYPESSSAARAVAVV 170 180 190 200 210 220 150 160 170 180 190 200 pF1KE4 SVLVILVSIVVFCLETLPDFRDDRDGTGLAAAAAAGPFPAPLNGSSQMPGNPPRLPFNDP ::::...::..:::::::.::.::. .. : :: :. . . . :.:: CCDS82 SVLVVVISITIFCLETLPEFREDRE-----LKVVRDP---NLNMSKTVLS---QTMFTDP 230 240 250 260 270 210 220 230 240 250 260 pF1KE4 FFVVETLCICWFSFELLVRLLVCPSKAIFFKNVMNLIDFVAILPYFVALGTELARQ-RGV ::.::. :: ::.:::..:..:::::. ::.:.::.::...:.:::..: :::... . CCDS82 FFMVESTCIVWFTFELVLRFVVCPSKTDFFRNIMNIIDIISIIPYFATLITELVQETEPS 280 290 300 310 320 330 270 280 290 300 310 320 pF1KE4 GQQAMSLAILRVIRLVRVFRIFKLSRHSKGLQILGQTLRASMRELGLLIFFLFIGVVLFS .:: :::::::.::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::.::: CCDS82 AQQNMSLAILRIIRLVRVFRIFKLSRHSKGLQILGQTLKASMRELGLLIFFLFIGVILFS 340 350 360 370 380 390 330 340 350 360 370 380 pF1KE4 SAVYFAEVDRVDSHFTSIPESFWWAVVTMTTVGYGDMAPVTVGGKIVGSLCAIAGVLTIS :::::::::. .:::.:::..:::::::::::::::: :.: ::::::.::::::::::. CCDS82 SAVYFAEVDEPESHFSSIPDGFWWAVVTMTTVGYGDMCPTTPGGKIVGTLCAIAGVLTIA 400 410 420 430 440 450 390 400 410 420 430 440 pF1KE4 LPVPVIVSNFSYFYHRETEGEEAGMFSHVDMQPCGPLEGKANGGLVDGEVPELPPPLWAP ::::::::::.::::::::.:: CCDS82 LPVPVIVSNFNYFYHRETENEEKQNIPGEIERILNSVGSRMGSTDSLNKTNGGCSTEKSR 460 470 480 490 500 510 >>CCDS8534.1 KCNA6 gene_id:3742|Hs108|chr12 (529 aa) initn: 1931 init1: 860 opt: 864 Z-score: 909.6 bits: 177.8 E(32554): 2.4e-44 Smith-Waterman score: 1906; 63.4% identity (77.3% similar) in 497 aa overlap (10-456:36-529) 10 20 30 pF1KE4 MEPRCPPPCGCC--ERLVLNVAGLRFETRARTLGRFPDT ::: ::::.:..::::::. :::. :::: CCDS85 SLTLAAPGEVRGPEGEQQDAGDFPEAGGGGGCCSSERLVINISGLRFETQLRTLSLFPDT 10 20 30 40 50 60 40 50 60 70 80 90 pF1KE4 LLGDPARRGRFYDDARREYFFDRHRPSFDAVLYYYQSGGRLRRPAHVPLDVFLEEVAFYG :::::.:: ::.: : ::::::.::::::.:::::::::::::..::::.::::. :: CCDS85 LLGDPGRRVRFFDPLRNEYFFDRNRPSFDAILYYYQSGGRLRRPVNVPLDIFLEEIRFYQ 70 80 90 100 110 120 100 110 120 130 140 150 pF1KE4 LGAAALARLREDEGCPVPP----ERPLPRRAFARQLWLLFEFPESSQAARVLAVVSVLVI :: ::: .:::::: .: :.::: . : ::.:::::.:::: :: .:.:::::: CCDS85 LGDEALAAFREDEGC-LPEGGEDEKPLPSQPFQRQVWLLFEYPESSGPARGIAIVSVLVI 130 140 150 160 170 180 160 170 180 190 pF1KE4 LVSIVVFCLETLPDFR-DDRDGT--GLAAAAAA-------------------GPFPAPLN :.:::.:::::::.:: : : :. :.. .. . : :. .. 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