Result of FASTA (omim) for
pFN21AE4168
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE4168, 620 aa
1>>>pF1KE4168 620 - 620 aa - 620 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.0480+/-0.000463; mu= 20.9469+/- 0.029
mean_var=84.1783+/-17.885, 0's: 0 Z-trim(108.8): 424 B-trim: 18 in 1/58
Lambda= 0.139789
statistics sampled from 16502 (16972) to 16502 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.535), E-opt: 0.2 (0.199), width: 16
Scan time: 9.760
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_085127 (OMIM: 300980,300982) kelch-like protein ( 604) 736 159.4 3.4e-38
XP_006724581 (OMIM: 300980,300982) PREDICTED: kelc ( 604) 736 159.4 3.4e-38
NP_065856 (OMIM: 613772) kelch-like protein 14 [Ho ( 628) 668 145.7 4.7e-34
NP_001003760 (OMIM: 610749) kelch-like protein 31 ( 634) 657 143.5 2.2e-33
XP_016866347 (OMIM: 610749) PREDICTED: kelch-like ( 634) 657 143.5 2.2e-33
XP_005249164 (OMIM: 610749) PREDICTED: kelch-like ( 634) 657 143.5 2.2e-33
NP_569713 (OMIM: 614214) kelch-like protein 6 [Hom ( 621) 628 137.6 1.2e-31
NP_001138821 (OMIM: 147485) actin-binding protein ( 582) 618 135.6 4.8e-31
NP_005888 (OMIM: 147485) actin-binding protein IPP ( 584) 618 135.6 4.8e-31
XP_016856699 (OMIM: 147485) PREDICTED: actin-bindi ( 531) 600 131.9 5.6e-30
NP_061335 (OMIM: 611201) kelch-like protein 9 [Hom ( 617) 578 127.5 1.3e-28
NP_001161775 (OMIM: 300655) kelch-like protein 13 ( 613) 555 122.9 3.3e-27
XP_016885439 (OMIM: 300655) PREDICTED: kelch-like ( 639) 555 122.9 3.4e-27
NP_001161774 (OMIM: 300655) kelch-like protein 13 ( 639) 555 122.9 3.4e-27
NP_001161773 (OMIM: 300655) kelch-like protein 13 ( 639) 555 122.9 3.4e-27
NP_001161772 (OMIM: 300655) kelch-like protein 13 ( 649) 555 122.9 3.5e-27
XP_011529713 (OMIM: 300655) PREDICTED: kelch-like ( 655) 555 122.9 3.5e-27
NP_277030 (OMIM: 300655) kelch-like protein 13 iso ( 655) 555 122.9 3.5e-27
NP_001161771 (OMIM: 300655) kelch-like protein 13 ( 658) 555 122.9 3.5e-27
XP_011529712 (OMIM: 300655) PREDICTED: kelch-like ( 661) 555 122.9 3.5e-27
XP_011529711 (OMIM: 300655) PREDICTED: kelch-like ( 661) 555 122.9 3.5e-27
XP_016857484 (OMIM: 614522) PREDICTED: kelch-like ( 471) 505 112.7 3e-24
XP_011508138 (OMIM: 614522) PREDICTED: kelch-like ( 526) 505 112.7 3.3e-24
NP_067646 (OMIM: 614522) kelch-like protein 12 iso ( 568) 505 112.8 3.4e-24
NP_001289980 (OMIM: 614522) kelch-like protein 12 ( 606) 505 112.8 3.6e-24
XP_011508137 (OMIM: 614522) PREDICTED: kelch-like ( 623) 505 112.8 3.7e-24
XP_011539696 (OMIM: 147485) PREDICTED: actin-bindi ( 465) 491 109.8 2.1e-23
XP_005270896 (OMIM: 147485) PREDICTED: actin-bindi ( 465) 491 109.8 2.1e-23
XP_011541998 (OMIM: 605173) PREDICTED: ectoderm-ne ( 589) 492 110.1 2.2e-23
NP_001243504 (OMIM: 605173) ectoderm-neural cortex ( 589) 492 110.1 2.2e-23
XP_011541999 (OMIM: 605173) PREDICTED: ectoderm-ne ( 589) 492 110.1 2.2e-23
NP_001243503 (OMIM: 605173) ectoderm-neural cortex ( 589) 492 110.1 2.2e-23
NP_003624 (OMIM: 605173) ectoderm-neural cortex pr ( 589) 492 110.1 2.2e-23
XP_006710686 (OMIM: 147485) PREDICTED: actin-bindi ( 440) 489 109.4 2.7e-23
NP_059111 (OMIM: 605775,614495) kelch-like protein ( 587) 483 108.3 7.6e-23
NP_001290038 (OMIM: 614522) kelch-like protein 12 ( 467) 480 107.6 9.9e-23
XP_011508139 (OMIM: 614522) PREDICTED: kelch-like ( 522) 480 107.7 1.1e-22
NP_009177 (OMIM: 605774) kelch-like protein 2 isof ( 593) 477 107.1 1.8e-22
NP_001154993 (OMIM: 605774) kelch-like protein 2 i ( 597) 477 107.1 1.8e-22
NP_001244123 (OMIM: 605775,614495) kelch-like prot ( 555) 475 106.7 2.2e-22
XP_016863164 (OMIM: 605774) PREDICTED: kelch-like ( 415) 470 105.6 3.7e-22
XP_016862142 (OMIM: 611295) PREDICTED: kelch-like ( 625) 472 106.1 3.7e-22
XP_016862144 (OMIM: 611295) PREDICTED: kelch-like ( 625) 472 106.1 3.7e-22
XP_016862143 (OMIM: 611295) PREDICTED: kelch-like ( 625) 472 106.1 3.7e-22
XP_016862146 (OMIM: 611295) PREDICTED: kelch-like ( 625) 472 106.1 3.7e-22
XP_016862141 (OMIM: 611295) PREDICTED: kelch-like ( 625) 472 106.1 3.7e-22
XP_016862139 (OMIM: 611295) PREDICTED: kelch-like ( 625) 472 106.1 3.7e-22
XP_016862140 (OMIM: 611295) PREDICTED: kelch-like ( 625) 472 106.1 3.7e-22
XP_016862145 (OMIM: 611295) PREDICTED: kelch-like ( 625) 472 106.1 3.7e-22
XP_016862147 (OMIM: 611295) PREDICTED: kelch-like ( 625) 472 106.1 3.7e-22
>>NP_085127 (OMIM: 300980,300982) kelch-like protein 15 (604 aa)
initn: 761 init1: 330 opt: 736 Z-score: 806.7 bits: 159.4 E(85289): 3.4e-38
Smith-Waterman score: 865; 28.4% identity (59.8% similar) in 605 aa overlap (18-602:8-595)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MPSERCLSIQEMLTGQRLCHSESHNDSVLAALNQQRSDGILCDITLIAEEQKFHAHKAVL
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NP_085 MAGDVEGFCSS-IHDTSVSAGFRALYEEGLLLDVTLVIEDHQFQAHKALL
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 AACSDYFRAMFSLCMVESGADEVNLHGVTSLGLKQALEFAYTGQILLEPGVIQDVLAAGS
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NP_085 ATQSDYFRIMFTADMRERDQDKIHLKGLTATGFSHVLQFMYYGTIELSMNTVHEILQAAM
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170
pF1KE4 HLQLLELLNLCSHYLIQELNSFNYLDLYRLADLF--NLTLLEKAVIDFLVKHLSELLKSR
..::.:....: .:. .. : ...:: : : :. ... . ::. .. :. ::
NP_085 YVQLIEVVKFCCSFLLAKICLENCAEIMRLLDDFGVNIEGVREKLDTFLLDNFVPLM-SR
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pF1KE4 PEEVLTLPYCLLQEVLKSDRLTSLSEEQIWQLAVRWLEHNCH-YQYMDELLQYIRFGLMD
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NP_085 PDFLSYLSFEKLMSYLDNDHLSRFPEIELYEAVQSWLRHDRRRWRHTDTIIQNIRFCLMT
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KE4 VDTLHTVALSHPLVQASETATALVNEALEYHQSIYAQPVWQTRRTKPRFQSDTLYIIGGK
.. . . . . :. :..::.: :... ::. . . .. : . .. :
NP_085 PTSVFEKVKTSEFYRYSRQLRYEVDQALNYFQNVHQQPLLDMKSSRIRSAKPQTTVFRG-
230 240 250 260 270 280
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pF1KE4 KREVCKVKELRYFNPVDQENALIAAIANWSELAPMPVGRSHHCVAVMGDFLFVAGGEVEH
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NP_085 ---------MIGHSMVNSKILLLKKPRVWWELEGPQVPLRPDCLAIVNNFVFLLGGEELG
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pF1KE4 ASGRTCAVRTACRYDPRSNSWAEIAPMKNCREHFVLGAMEEYLYAVGGRNELRQVLPTVE
.:. : . :::::.::: ..: :. : .:..:.. ...:::.::.. ... ..:
NP_085 PDGEFHASSKVFRYDPRQNSWLQMADMSVPRSEFAVGVIGKFIYAVAGRTR-DETFYSTE
340 350 360 370 380 390
420 430 440 450 460 470
pF1KE4 RYCPKKNKWTFVQSFDRSLSCHAGYVADGLLWISGGVTNTAQYQNRLMVYEPNQ------
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NP_085 RYDITNDKWEFVDPYPVNKYGHEGTVLNNKLFITGGITSSSTSK-QVCVFDPSKEGTIEQ
400 410 420 430 440 450
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pF1KE4 ---------NKWISRSPMLQRRVYHSMAAVQRKLYVLGGND--LDYNNDRILVRHIDSYN
: : ..: : : .:.: . . ::::.:: : . . . ::
NP_085 RTRRTQVVTNCWENKSKMNYARCFHKMISYNGKLYVFGGVCVILRASFESQGCPSTEVYN
460 470 480 490 500 510
530 540 550 560 570 580
pF1KE4 IDTDQWTRCNFNLLTGQNESGVAVHNGRIYLVGGYSIWTNEPLACIQVLDVSREGKEEVF
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NP_085 PETDQWTILA-SMPIGRSGHGVTVLDKQIMVLGGLC-YNGHYSDSILTFDPDENKWKEDE
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590 600 610 620
pF1KE4 YGPTLPFASNGIAACFLPAPYFTCPNLQTLQVPHHRIGTI
: : .: .:. .: : : .
NP_085 Y-PRMPCKLDGLQVCNLHFPDYVLDEVRRCN
580 590 600
>>XP_006724581 (OMIM: 300980,300982) PREDICTED: kelch-li (604 aa)
initn: 761 init1: 330 opt: 736 Z-score: 806.7 bits: 159.4 E(85289): 3.4e-38
Smith-Waterman score: 865; 28.4% identity (59.8% similar) in 605 aa overlap (18-602:8-595)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MPSERCLSIQEMLTGQRLCHSESHNDSVLAALNQQRSDGILCDITLIAEEQKFHAHKAVL
.: : :. :: :.. .:.: :.::. :...:.::::.:
XP_006 MAGDVEGFCSS-IHDTSVSAGFRALYEEGLLLDVTLVIEDHQFQAHKALL
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pF1KE4 AACSDYFRAMFSLCMVESGADEVNLHGVTSLGLKQALEFAYTGQILLEPGVIQDVLAAGS
:. ::::: ::. : : :...:.:.:. :....:.: : : : : ......: :.
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pF1KE4 HLQLLELLNLCSHYLIQELNSFNYLDLYRLADLF--NLTLLEKAVIDFLVKHLSELLKSR
..::.:....: .:. .. : ...:: : : :. ... . ::. .. :. ::
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:. . : . :. : .:.:. . : .... . ::.:. . ... : ..: ::: ::
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pF1KE4 VDTLHTVALSHPLVQASETATALVNEALEYHQSIYAQPVWQTRRTKPRFQSDTLYIIGGK
.. . . . . :. :..::.: :... ::. . . .. : . .. :
XP_006 PTSVFEKVKTSEFYRYSRQLRYEVDQALNYFQNVHQQPLLDMKSSRIRSAKPQTTVFRG-
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pF1KE4 KREVCKVKELRYFNPVDQENALIAAIANWSELAPMPVGRSHHCVAVMGDFLFVAGGEVEH
. . :... :. : :: : :.:....:.:. :::
XP_006 ---------MIGHSMVNSKILLLKKPRVWWELEGPQVPLRPDCLAIVNNFVFLLGGEELG
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pF1KE4 ASGRTCAVRTACRYDPRSNSWAEIAPMKNCREHFVLGAMEEYLYAVGGRNELRQVLPTVE
.:. : . :::::.::: ..: :. : .:..:.. ...:::.::.. ... ..:
XP_006 PDGEFHASSKVFRYDPRQNSWLQMADMSVPRSEFAVGVIGKFIYAVAGRTR-DETFYSTE
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pF1KE4 RYCPKKNKWTFVQSFDRSLSCHAGYVADGLLWISGGVTNTAQYQNRLMVYEPNQ------
:: ..:: ::. . . : : : .. :.:.::.:... . .. :..:..
XP_006 RYDITNDKWEFVDPYPVNKYGHEGTVLNNKLFITGGITSSSTSK-QVCVFDPSKEGTIEQ
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pF1KE4 ---------NKWISRSPMLQRRVYHSMAAVQRKLYVLGGND--LDYNNDRILVRHIDSYN
: : ..: : : .:.: . . ::::.:: : . . . ::
XP_006 RTRRTQVVTNCWENKSKMNYARCFHKMISYNGKLYVFGGVCVILRASFESQGCPSTEVYN
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pF1KE4 IDTDQWTRCNFNLLTGQNESGVAVHNGRIYLVGGYSIWTNEPLACIQVLDVSREGKEEVF
.::::: .. :.. ::.: . .:...:: .... : ..: ... .:
XP_006 PETDQWTILA-SMPIGRSGHGVTVLDKQIMVLGGLC-YNGHYSDSILTFDPDENKWKEDE
520 530 540 550 560 570
590 600 610 620
pF1KE4 YGPTLPFASNGIAACFLPAPYFTCPNLQTLQVPHHRIGTI
: : .: .:. .: : : .
XP_006 Y-PRMPCKLDGLQVCNLHFPDYVLDEVRRCN
580 590 600
>>NP_065856 (OMIM: 613772) kelch-like protein 14 [Homo s (628 aa)
initn: 718 init1: 240 opt: 668 Z-score: 732.4 bits: 145.7 E(85289): 4.7e-34
Smith-Waterman score: 861; 29.1% identity (56.4% similar) in 647 aa overlap (14-601:4-626)
10 20 30 40 50
pF1KE4 MPSERCLSIQEMLTGQRLC-HSESHNDSVLAALNQQRSDGILCDITLIAEEQKFHAHKAV
.:.: . ::.:..: .:: ..::.:: :. :.:: ::::
NP_065 MSRSGDRTSTFDPSHSDNLLHGLNLLWRKQLFCDVTLTAQGQQFHCHKAV
10 20 30 40 50
60 70 80
pF1KE4 LAACSDYFRAMFS----LCMVESGAD----------------------------------
::.::.:::..:: : .: :
NP_065 LASCSQYFRSLFSSHPPLGGGVGGQDGLGAPKDQQQPPQQQPSQQQQPPPQEEPGTPSSS
60 70 80 90 100 110
90 100 110 120
pF1KE4 ----------EVN---LHGVTSLGLKQALEFAYTGQILLEPGVIQDVLAAGSHLQLLELL
.: :.: .:.::. .::. ::... : ....::.... :.. ..
NP_065 PDDKLLTSPRAINNLVLQGCSSIGLRLVLEYLYTANVTLSLDTVEEVLSVSKILHIPQVT
120 130 140 150 160 170
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pF1KE4 NLCSHYLIQELNSFNYLDLYRLADLFNLTLLEKAVIDFLVKHLSELLKSRPEEVLTLPYC
.:: ..: .... :: .. ..: : .: .: . .:: :.:: : .
NP_065 KLCVQFLNDQISVQNYKQVCKIAALHGLEETKKLANKYLV-----------EDVLLLNFE
180 190 200 210
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 LLQEVLKSDRLTSLSEEQIWQLAVRWLEHN--CHYQYMDELLQYIRFGLMDVDTLHTVAL
.. .: : :: ..:..: ::::. ..:: .:.. .::.:. . : .
NP_065 EMRALLDSLPPPVESELALFQMSVLWLEHDRETRMQYAPDLMKRLRFALIPAPELVERVQ
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pF1KE4 SHPLVQASETATALVNEALEYHQSIYAQPVWQTRRTKPRFQSDTLYIIGGKKREVCKVKE
: ..... . :. .:..:: . : :. .. : .. : ..:: ..
NP_065 SVDFMRTDPVCQKLLLDAMNYHLMPFRQHCRQSLASRIRSNKKMLLLVGGLPPGPDRLPS
280 290 300 310 320 330
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pF1KE4 --LRYFNPVDQENALIAAIANWSELAPMPVGRSHHCVAVMGDFLFVAGGEVEHASGRTCA
..:. :.:. .:. :. :: . .::::. . .:::: ::: . . .
NP_065 NLVQYY---DDEKK------TWKILTIMPYNSAHHCVVEVENFLFVLGGEDQWNPNGKHS
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pF1KE4 VRTACRYDPRSNSWAEIAPMKNCREHFVLGAMEEYLYAVGGRNELRQVLPTVERYCPKKN
. . ::::: ::: .. ::.. : : ....::..::::: : .:: : . :
NP_065 TNFVSRYDPRFNSWIQLPPMQERRASFYACRLDKHLYVIGGRNET-GYLSSVECYNLETN
400 410 420 430 440
430 440 450 460 470 480
pF1KE4 KWTFVQSFDRSLSCHAGYVADGLLWISGGVTNTAQYQNRLMVYEPNQNKWISRSPMLQRR
.: .:.:. . :. ::: : .: ..::::: : ..: :. :.: .. : .. : .:
NP_065 EWRYVSSLPQPLAAHAGAVHNGKIYISGGVHN-GEYVPWLYCYDPVMDVWARKQDMNTKR
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pF1KE4 VYHSMAAVQRKLYVLGGNDLDYNNDRILVRHIDSYNIDTDQWTRCNFNLLTGQNESGVAV
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NP_065 AIHTLAVMNDRLYAIGGNHLK-GFSHLDVMLVECYDPKGDQWNILQTPILEGRSGPGCAV
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610 620
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NP_065 NK
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XP_016 EATVGVSCCTLSMPNNVTRESRASSVSSVPVSI
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XP_005 NA-EGSLASLECYVPSTNQWQPKTPLEVARCCHASAVADGRVLVTGGYIANA-YSRSVCA
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XP_005 YDPASDSWQELPNLSTPRGWHCAVTLSDRVYVMGGSQLGPRGERVDVLTVECYSPATGQW
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XP_005 SYAA-PLQVGVSTAGVSALHGRAYLVGGWNEGEKKYKKCIQCF--SPELNEWT-EDDELP
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pF1KE4 FASNGIAACFLPAPYFTCPNLQTLQVPHHRIGTI
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XP_005 EATVGVSCCTLSMPNNVTRESRASSVSSVPVSI
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NP_569 IEYLNIGRWRHKMVVLGGKVYVIGGFDGL-QRINNVETYDPFHNCWSEAAPLLVHVSSFA
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NP_569 ATSHKKKLYVIGGGPNGKLATDKTQCYDPSTNKWSLKAAMPVEAKCINAVS-FRDRIYVV
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NP_569 GGA----------MRALYAYSPLEDSW--CLVTQLSHERASCGIAPCNNRLYITGGRD-E
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pF1KE4 TNEPLACIQVLDVSREGKEEVFYGPTLPFASNGIAACFLPAPYFTCPNLQTLQVPHHRIG
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NP_569 KNEVIATVLCWDPEAQKLTEECVLPRGVSHHGSVTIRKSYTHIRRIVPGAVSV
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>>NP_001138821 (OMIM: 147485) actin-binding protein IPP (582 aa)
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pF1KE4 MPSERCLSIQEMLTGQRLCHSESHNDSVLAALNQQRSDGILCDITLIAEEQKFHAHKAVL
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pF1KE4 AACSDYFRAMFSLCMVESGADEVNLHGVTSLGLKQALEFAYTGQILLEPGVIQDVLAAGS
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NP_001 AASSPYFAALFTGGMKESSKDVVPILGIEAGIFQILLDFIYTGIVNIGVNNVQELIIAAD
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pF1KE4 HLQLLELLNLCSHYLIQELNSFNYLDLYRLADLFNLTLLEKAVIDFLVKHLSELLKSRPE
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NP_001 MLQLTEVVHLCCEFLKGQIDPLNCIGIFQFSEQIACHDLLEFSENYIHVHFLEVHSG--E
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pF1KE4 EVLTLPYCLLQEVLKSDRLTSLSEEQIWQLAVRWLEHNC--HYQYMDELLQYIRFGLMDV
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NP_001 EFLALTKDQLIKILRSEELSIEDEYQVFLAAMQWILKDLGKRRKHVVEVLDPIRFPLLPP
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pF1KE4 DTLHTVALSHPLVQASETATALVNEALEYHQSIYAQPV---WQTRRTKPRFQSDT-LYII
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NP_001 QRLLKYIEGVSDFNLRVALQTLLKEYCEVCKSPKENKFCSFLQTSKVRPRKKARKYLYAV
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NP_001 GGYTRLQGGRWSDSRALSCVERFDTFSQY---WTTVSSLHQARSGLGVTVLGGMVYAIGG
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XP_016 LLSSLQTWPPRFK
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]