Result of FASTA (ccds) for pFN21AE4167
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KE4167, 619 aa
  1>>>pF1KE4167 619 - 619 aa - 619 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.1591+/-0.00102; mu= -1.0687+/- 0.061
 mean_var=367.5162+/-76.877, 0's: 0 Z-trim(116.5): 877  B-trim: 826 in 1/51
 Lambda= 0.066902
 statistics sampled from 16095 (17086) to 16095 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.805), E-opt: 0.2 (0.525), width:  16
 Scan time:  4.500

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS32830.1 ZBTB7C gene_id:201501|Hs108|chr18      ( 619) 4339 432.9  6e-121
CCDS12119.1 ZBTB7A gene_id:51341|Hs108|chr19       ( 584)  802 91.5 3.4e-18
CCDS1081.1 ZBTB7B gene_id:51043|Hs108|chr1         ( 539)  726 84.1 5.2e-16
CCDS58030.1 ZBTB7B gene_id:51043|Hs108|chr1        ( 573)  726 84.1 5.4e-16


>>CCDS32830.1 ZBTB7C gene_id:201501|Hs108|chr18           (619 aa)
 initn: 4339 init1: 4339 opt: 4339  Z-score: 2284.9  bits: 432.9 E(32554): 6e-121
Smith-Waterman score: 4339; 100.0% identity (100.0% similar) in 619 aa overlap (1-619:1-619)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE4 MANDIDELIGIPFPNHSSEVLCSLNEQRHDGLLCDVLLVVQEQEYRTHRSVLAACSKYFK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 MANDIDELIGIPFPNHSSEVLCSLNEQRHDGLLCDVLLVVQEQEYRTHRSVLAACSKYFK
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE4 KLFTAGTLASQPYVYEIDFVQPEALAAILEFAYTSTLTITAGNVKHILNAARMLEIQCIV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 KLFTAGTLASQPYVYEIDFVQPEALAAILEFAYTSTLTITAGNVKHILNAARMLEIQCIV
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE4 NVCLEIMEPGGDGGEEDDKEDDDDDEDDDDEEDEEEEEEEEEDDDDDTEDFADQENLPDP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 NVCLEIMEPGGDGGEEDDKEDDDDDEDDDDEEDEEEEEEEEEDDDDDTEDFADQENLPDP
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE4 QDISCHQSPSKTDHLTEKAYSDTPRDFPDSFQAGSPGHLGVIRDFSIESLLRENLYPKAN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 QDISCHQSPSKTDHLTEKAYSDTPRDFPDSFQAGSPGHLGVIRDFSIESLLRENLYPKAN
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE4 IPDRRPSLSPFAPDFFPHLWPGDFGAFAQLPEQPMDSGPLDLVIKNRKIKEEEKEELPPP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 IPDRRPSLSPFAPDFFPHLWPGDFGAFAQLPEQPMDSGPLDLVIKNRKIKEEEKEELPPP
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE4 PPPPFPNDFFKDMFPDLPGGPLGPIKAENDYGAYLNFLSATHLGGLFPPWPLVEERKLKP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 PPPPFPNDFFKDMFPDLPGGPLGPIKAENDYGAYLNFLSATHLGGLFPPWPLVEERKLKP
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KE4 KASQQCPICHKVIMGAGKLPRHMRTHTGEKPYMCTICEVRFTRQDKLKIHMRKHTGERPY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 KASQQCPICHKVIMGAGKLPRHMRTHTGEKPYMCTICEVRFTRQDKLKIHMRKHTGERPY
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KE4 LCIHCNAKFVHNYDLKNHMRIHTGVRPYQCEFCYKSFTRSDHLHRHIKRQSCRMARPRRG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 LCIHCNAKFVHNYDLKNHMRIHTGVRPYQCEFCYKSFTRSDHLHRHIKRQSCRMARPRRG
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KE4 RKPAAWRAASLLFGPGGPAPDKAAFVMPPALGEVGGHLGGAAVCLPGPSPAKHFLAAPKG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 RKPAAWRAASLLFGPGGPAPDKAAFVMPPALGEVGGHLGGAAVCLPGPSPAKHFLAAPKG
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KE4 ALSLQELERQFEETQMKLFGRAQLEAERNAGGLLAFALAENVAAARPYFPLPDPWAAGLA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 ALSLQELERQFEETQMKLFGRAQLEAERNAGGLLAFALAENVAAARPYFPLPDPWAAGLA
              550       560       570       580       590       600

              610         
pF1KE4 GLPGLAGLNHVASMSEANN
       :::::::::::::::::::
CCDS32 GLPGLAGLNHVASMSEANN
              610         

>>CCDS12119.1 ZBTB7A gene_id:51341|Hs108|chr19            (584 aa)
 initn: 1322 init1: 790 opt: 802  Z-score: 440.2  bits: 91.5 E(32554): 3.4e-18
Smith-Waterman score: 1249; 41.3% identity (64.3% similar) in 535 aa overlap (1-510:1-520)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE4 MANDIDELIGIPFPNHSSEVLCSLNEQRHDGLLCDVLLVVQEQEYRTHRSVLAACSKYFK
       ::. .:  ::::::.:::..: .::::: .::::::...:. .:. ::::::::::.:::
CCDS12 MAGGVDGPIGIPFPDHSSDILSGLNEQRTQGLLCDVVILVEGREFPTHRSVLAACSQYFK
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE4 KLFTAGTLASQPYVYEIDFVQPEALAAILEFAYTSTLTITAGNVKHILNAARMLEIQCIV
       ::::.:....:  :::::::. :::.:...::::.:::....::  ::.:::.:::  . 
CCDS12 KLFTSGAVVDQQNVYEIDFVSAEALTALMDFAYTATLTVSTANVGDILSAARLLEIPAVS
               70        80        90       100       110       120

                 130       140       150       160       170       
pF1KE4 NVCLEIMEP---GGDGGEEDDKEDDDDDEDDDDEEDEEEEEEEEEDDDDDTEDFADQENL
       .:: ....    ..:.: .  . :  :. :. .    .:  :  ...  ..   :     
CCDS12 HVCADLLDRQILAADAGADAGQLDLVDQIDQRNLLRAKEYLEFFQSNPMNSLPPAAAAAA
              130       140       150       160       170       180

       180       190             200       210       220       230 
pF1KE4 PDPQDISCHQSPSKTDHLTEK------AYSDTPRDFPDSFQAGSPGHLGVIRDFSIESLL
        .    .   : .  :   :       : .    .  : .  : :..     : . :.  
CCDS12 ASFPWSAFGASDDDLDATKEAVAAAVAAVAAGDCNGLDFYGPGPPAERPPTGD-GDEGDS
              190       200       210       220       230          

             240       250              260       270       280    
pF1KE4 RENLYPKANIPDRRPSLSPFAPDFFP-------HLWPGDFGAFAQLPEQPMDSGPLDLVI
         .:.:. .  .  :. . : :   :       :   :     :.: :   . :     .
CCDS12 NPGLWPERD--EDAPTGGLFPPPVAPPAATQNGHYGRGGEEEAASLSEAAPEPGDSPGFL
     240         250       260       270       280       290       

          290       300        310         320          330        
pF1KE4 KNRKIKEEEKEELPPPPPPPFP-NDFFKDMFPDL--PGGPLGPIKAE---NDYGA---YL
       ..      : :.   :    .  . ....:. ..   :.  :    :   .: :.   ::
CCDS12 SG----AAEGEDGDGPDVDGLAASTLLQQMMSSVGRAGAAAGDSDEESRADDKGVMDYYL
           300       310       320       330       340       350   

         340       350       360       370       380       390     
pF1KE4 NFLSATHLGGLFPPWPLVEERKLKPKASQQCPICHKVIMGAGKLPRHMRTHTGEKPYMCT
       ...:..: : ..: :    :.:.. :: :.::::.:::.::::::::.::::::::: :.
CCDS12 KYFSGAHDGDVYPAWSQKVEKKIRAKAFQKCPICEKVIQGAGKLPRHIRTHTGEKPYECN
           360       370       380       390       400       410   

         400       410       420       430       440       450     
pF1KE4 ICEVRFTRQDKLKIHMRKHTGERPYLCIHCNAKFVHNYDLKNHMRIHTGVRPYQCEFCYK
       ::.::::::::::.::::::::.:::: .:.: :.::::::::::.:::.:::::. : :
CCDS12 ICKVRFTRQDKLKVHMRKHTGEKPYLCQQCGAAFAHNYDLKNHMRVHTGLRPYQCDSCCK
           420       430       440       450       460       470   

         460       470       480       490       500       510     
pF1KE4 SFTRSDHLHRHIKRQSCRMARPRRGRKPAAWRAASLLFGPGGPAPDKAAFVMPPALGEVG
       .:.::::::::.:...:  .  :::::: . :.       :.: :. .: . : :     
CCDS12 TFVRSDHLHRHLKKDGCNGVPSRRGRKPRV-RG-------GAPDPSPGATATPGAPAQPS
           480       490       500               510       520     

         520       530       540       550       560       570     
pF1KE4 GHLGGAAVCLPGPSPAKHFLAAPKGALSLQELERQFEETQMKLFGRAQLEAERNAGGLLA
                                                                   
CCDS12 SPDARRNGQEKHFKDEDEDEDVASPDGLGRLNVAGAGGGGDSGGGPGAATDGNFTAGLA 
         530       540       550       560       570       580     

>>CCDS1081.1 ZBTB7B gene_id:51043|Hs108|chr1              (539 aa)
 initn: 1277 init1: 678 opt: 726  Z-score: 401.0  bits: 84.1 E(32554): 5.2e-16
Smith-Waterman score: 1182; 41.7% identity (61.0% similar) in 533 aa overlap (1-518:1-491)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE4 MANDIDELIGIPFPNHSSEVLCSLNEQRHDGLLCDVLLVVQEQEYRTHRSVLAACSKYFK
       :..  :.:::::::.::::.:  :::::. : :::. . .:  ::::::.::::::.:::
CCDS10 MGSPEDDLIGIPFPDHSSELLSCLNEQRQLGHLCDLTIRTQGLEYRTHRAVLAACSHYFK
               10        20        30        40        50        60

                             70        80        90       100      
pF1KE4 KLFTAG--------------TLASQPYVYEIDFVQPEALAAILEFAYTSTLTITAGNVKH
       :::: :              : ..   : :.::: ::::.:.::::::.::: ...:.  
CCDS10 KLFTEGGGGAVMGAGGSGTATGGAGAGVCELDFVGPEALGALLEFAYTATLTTSSANMPA
               70        80        90       100       110       120

        110       120       130       140       150       160      
pF1KE4 ILNAARMLEIQCIVNVCLEIMEPGGDGGEEDDKEDDDDDEDDDDEEDEEEEEEEEEDDDD
       .:.:::.::: :.. .:.::..  :.: :  . ..:: ..    ..  :       .   
CCDS10 VLQAARLLEIPCVIAACMEILQ--GSGLEAPSPDEDDCERA---RQYLEAFATATASGVP
              130       140         150          160       170     

        170       180       190       200       210       220      
pF1KE4 DTEDFADQENLPDPQDISCHQSPSKTDHLTEKAYSDTPRDFPDSFQAGSPGHLGVIRDFS
       . ::   :  :: :        :     ....  :  ::    . ...  .:: : .  .
CCDS10 NGEDSPPQVPLPPPP-------PPPPRPVARR--SRKPRKAFLQTKGARANHL-VPEVPT
         180       190              200         210        220     

        230       240       250       260       270       280      
pF1KE4 IESLLRENLYPKANIPDRRPSLSPFAPDFFPHLWPGDFGAFAQLPEQPMDSGPLDLVIKN
       . .  .   : . ..  :  : .  .:      .    :. :. :: :..  : .     
CCDS10 VPA--HPLTYEEEEVAGRVGSSGGSGPG---DSYSPPTGT-ASPPEGPQSYEPYE-----
           230       240       250          260        270         

        290       300       310       320       330       340      
pF1KE4 RKIKEEEKEELPPPPPPPFPNDFFKDMFPDLPGGPLGPIKAENDYGAYLNFLSATHLG-G
           :::.:::  ::   . .     . :.  :.    :  . :  :::. :   .:. :
CCDS10 ---GEEEEEELVYPPAYGLAQGGGPPLSPEELGSDEDAI--DPDLMAYLSSLHQDNLAPG
             280       290       300       310         320         

         350       360       370       380       390       400     
pF1KE4 LFPPWPLVEERKLKPKASQQCPICHKVIMGAGKLPRHMRTHTGEKPYMCTICEVRFTRQD
       :     ::  :: . .  :.::.:::.: :::::::::::::::::. : .: :::::.:
CCDS10 LDSQDKLV--RKRRSQMPQECPVCHKIIHGAGKLPRHMRTHTGEKPFACEVCGVRFTRND
     330         340       350       360       370       380       

         410       420       430       440       450       460     
pF1KE4 KLKIHMRKHTGERPYLCIHCNAKFVHNYDLKNHMRIHTGVRPYQCEFCYKSFTRSDHLHR
       ::::::::::::::: : :: :.:.:.:::::::..::: :::.:..:.:.:.. :::.:
CCDS10 KLKIHMRKHTGERPYSCPHCPARFLHSYDLKNHMHLHTGDRPYECHLCHKAFAKEDHLQR
       390       400       410       420       430       440       

         470       480       490       500       510       520     
pF1KE4 HIKRQSCRMARPRRGRKPAAWRAASLLFGPGGPAPDKAAFVMPPALGEVGGHLGGAAVCL
       :.: :.:  .: :: ::  :         :  : :. :: . : .:   .:::       
CCDS10 HLKGQNCLEVRTRRRRKDDA--------PPHYPPPSTAA-ASPAGLDLSNGHLDTFRLSL
       450       460               470        480       490        

         530       540       550       560       570       580     
pF1KE4 PGPSPAKHFLAAPKGALSLQELERQFEETQMKLFGRAQLEAERNAGGLLAFALAENVAAA
                                                                   
CCDS10 ARFWEQSAPTGPPVSTPGPPDDDEEEGAPTTPQAEGAMESS                   
      500       510       520       530                            

>>CCDS58030.1 ZBTB7B gene_id:51043|Hs108|chr1             (573 aa)
 initn: 1277 init1: 678 opt: 726  Z-score: 400.6  bits: 84.1 E(32554): 5.4e-16
Smith-Waterman score: 1182; 41.7% identity (61.0% similar) in 533 aa overlap (1-518:35-525)

                                             10        20        30
pF1KE4                               MANDIDELIGIPFPNHSSEVLCSLNEQRHD
                                     :..  :.:::::::.::::.:  :::::. 
CCDS58 GPHPPSPQAAAPGEAWPGPSQAPWQSLEEKMGSPEDDLIGIPFPDHSSELLSCLNEQRQL
           10        20        30        40        50        60    

               40        50        60                      70      
pF1KE4 GLLCDVLLVVQEQEYRTHRSVLAACSKYFKKLFTAG--------------TLASQPYVYE
       : :::. . .:  ::::::.::::::.::::::: :              : ..   : :
CCDS58 GHLCDLTIRTQGLEYRTHRAVLAACSHYFKKLFTEGGGGAVMGAGGSGTATGGAGAGVCE
           70        80        90       100       110       120    

         80        90       100       110       120       130      
pF1KE4 IDFVQPEALAAILEFAYTSTLTITAGNVKHILNAARMLEIQCIVNVCLEIMEPGGDGGEE
       .::: ::::.:.::::::.::: ...:.  .:.:::.::: :.. .:.::..  :.: : 
CCDS58 LDFVGPEALGALLEFAYTATLTTSSANMPAVLQAARLLEIPCVIAACMEILQ--GSGLEA
          130       140       150       160       170         180  

        140       150       160       170       180       190      
pF1KE4 DDKEDDDDDEDDDDEEDEEEEEEEEEDDDDDTEDFADQENLPDPQDISCHQSPSKTDHLT
        . ..:: ..    ..  :       .   . ::   :  :: :        :     ..
CCDS58 PSPDEDDCERA---RQYLEAFATATASGVPNGEDSPPQVPLPPPP-------PPPPRPVA
            190          200       210       220              230  

        200       210       220       230       240       250      
pF1KE4 EKAYSDTPRDFPDSFQAGSPGHLGVIRDFSIESLLRENLYPKANIPDRRPSLSPFAPDFF
       ..  :  ::    . ...  .:: : .  .. .  .   : . ..  :  : .  .:   
CCDS58 RR--SRKPRKAFLQTKGARANHL-VPEVPTVPA--HPLTYEEEEVAGRVGSSGGSGPG--
              240       250        260         270       280       

        260       270       280       290       300       310      
pF1KE4 PHLWPGDFGAFAQLPEQPMDSGPLDLVIKNRKIKEEEKEELPPPPPPPFPNDFFKDMFPD
          .    :. :. :: :..  : .         :::.:::  ::   . .     . :.
CCDS58 -DSYSPPTGT-ASPPEGPQSYEPYE--------GEEEEEELVYPPAYGLAQGGGPPLSPE
          290        300               310       320       330     

        320       330       340        350       360       370     
pF1KE4 LPGGPLGPIKAENDYGAYLNFLSATHLG-GLFPPWPLVEERKLKPKASQQCPICHKVIMG
         :.    :  . :  :::. :   .:. ::     ::  :: . .  :.::.:::.: :
CCDS58 ELGSDEDAI--DPDLMAYLSSLHQDNLAPGLDSQDKLV--RKRRSQMPQECPVCHKIIHG
         340         350       360       370         380       390 

         380       390       400       410       420       430     
pF1KE4 AGKLPRHMRTHTGEKPYMCTICEVRFTRQDKLKIHMRKHTGERPYLCIHCNAKFVHNYDL
       ::::::::::::::::. : .: :::::.:::::::::::::::: : :: :.:.:.:::
CCDS58 AGKLPRHMRTHTGEKPFACEVCGVRFTRNDKLKIHMRKHTGERPYSCPHCPARFLHSYDL
             400       410       420       430       440       450 

         440       450       460       470       480       490     
pF1KE4 KNHMRIHTGVRPYQCEFCYKSFTRSDHLHRHIKRQSCRMARPRRGRKPAAWRAASLLFGP
       ::::..::: :::.:..:.:.:.. :::.::.: :.:  .: :: ::  :         :
CCDS58 KNHMHLHTGDRPYECHLCHKAFAKEDHLQRHLKGQNCLEVRTRRRRKDDA--------PP
             460       470       480       490       500           

         500       510       520       530       540       550     
pF1KE4 GGPAPDKAAFVMPPALGEVGGHLGGAAVCLPGPSPAKHFLAAPKGALSLQELERQFEETQ
         : :. :: . : .:   .:::                                     
CCDS58 HYPPPSTAA-ASPAGLDLSNGHLDTFRLSLARFWEQSAPTGPPVSTPGPPDDDEEEGAPT
           510        520       530       540       550       560  




619 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
 Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
 start: Thu Nov  3 01:45:29 2016 done: Thu Nov  3 01:45:30 2016
 Total Scan time:  4.500 Total Display time:  0.050

Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
Inquiries or Suggestions ?
Send a message to flexiclone AT kazusagt.com