Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE1022
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE1022, 730 aa
1>>>pF1KE1022 730 - 730 aa - 730 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.3866+/-0.000904; mu= 3.4313+/- 0.055
mean_var=220.2393+/-44.501, 0's: 0 Z-trim(114.5): 15 B-trim: 736 in 1/52
Lambda= 0.086422
statistics sampled from 15087 (15100) to 15087 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.768), E-opt: 0.2 (0.464), width: 16
Scan time: 5.000
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS3397.1 AFAP1 gene_id:60312|Hs108|chr4 ( 730) 4815 613.2 4.6e-175
CCDS47010.1 AFAP1 gene_id:60312|Hs108|chr4 ( 814) 3425 439.9 7.4e-123
CCDS34274.1 AFAP1L1 gene_id:134265|Hs108|chr5 ( 768) 1460 194.9 4e-49
CCDS54932.1 AFAP1L1 gene_id:134265|Hs108|chr5 ( 725) 1459 194.7 4.1e-49
CCDS31287.1 AFAP1L2 gene_id:84632|Hs108|chr10 ( 814) 667 96.0 2.4e-19
CCDS31286.1 AFAP1L2 gene_id:84632|Hs108|chr10 ( 818) 667 96.0 2.4e-19
>>CCDS3397.1 AFAP1 gene_id:60312|Hs108|chr4 (730 aa)
initn: 4815 init1: 4815 opt: 4815 Z-score: 3256.5 bits: 613.2 E(32554): 4.6e-175
Smith-Waterman score: 4815; 99.9% identity (100.0% similar) in 730 aa overlap (1-730:1-730)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MEELIVELRLFLELLDHEYLTSTVREKKAVITNILLRIQSSKGFDVKDHAQKQETANSLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 MEELIVELRLFLELLDHEYLTSTVREKKAVITNILLRIQSSKGFDVKDHAQKQETANSLP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 APPQMPLPEIPQPWLPPDSGPPPLPTSSLPEGYYEEAVPLSPGKAPEYITSNYDSDAMSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 APPQMPLPEIPQPWLPPDSGPPPLPTSSLPEGYYEEAVPLSPGKAPEYITSNYDSDAMSS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 SYESYDEEEEDGKGKKTRHQWPSEEASMDLVKDAKICAFLLRKKRFGQWTKLLCVIKDTK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 SYESYDEEEEDGKGKKTRHQWPSEEASMDLVKDAKICAFLLRKKRFGQWTKLLCVIKDTK
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 LLCYKSSKDQQPQMELPLQGCNITYIPKDSKKKKHELKITQQGTDPLVLAVQSKEQAEQW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 LLCYKSSKDQQPQMELPLQGCNITYIPKDSKKKKHELKITQQGTDPLVLAVQSKEQAEQW
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 LKVIKEAYSGCSGPVDSECPPPPSSPVHKAELEKKLSSERPSSDGEGVVENGITTCNGKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 LKVIKEAYSGCSGPVDSECPPPPSSPVHKAELEKKLSSERPSSDGEGVVENGITTCNGKE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 QVKRKKSSKSEAKGTVSKVTGKKITKIISLGKKKPSTDEQTSSAEEDVPTCGYLNVLSNS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 QVKRKKSSKSEAKGTVSKVTGKKITKIISLGKKKPSTDEQTSSAEEDVPTCGYLNVLSNS
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 RWRERWCRVKDNKLIFHKDRTDLKTHIVSIPLRGCEVIPGLDSKHPLTFRLLRNGQEVAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 RWRERWCRVKDNKLIFHKDRTDLKTHIVSIPLRGCEVIPGLDSKHPLTFRLLRNGQEVAV
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE1 LEASSSEDMGRWIGILLAETGSSTDPEALHYDYIDVEMSASVIQTAKQTFCFMNRRVISA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 LEASSSEDMGRWIGILLAETGSSTDPEALHYDYIDVEMSASVIQTAKQTFCFMNRRVISA
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE1 NPYLGGTSNGYAHPSGTALHYDDVPCINGSLKGKKPPMASNGVTGKGKTLSSQPKKADPA
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::
CCDS33 NPYLGGTSNGYAHPSGTALHYDDVPCINGSLKGKKPPVASNGVTGKGKTLSSQPKKADPA
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE1 AVVKRTGSNAAQYKYGKNRVEADAKRLQTKEEELLKRKEALRNRLAQLRKERKDLRAAIE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 AVVKRTGSNAAQYKYGKNRVEADAKRLQTKEEELLKRKEALRNRLAQLRKERKDLRAAIE
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE1 VNAGRKPQAILEEKLKQLEEECRQKEAERVSLELELTEVKESLKKALAGGVTLGLAIEPK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 VNAGRKPQAILEEKLKQLEEECRQKEAERVSLELELTEVKESLKKALAGGVTLGLAIEPK
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE1 SGTSSPQSPVFRHRTLENSPISSCDTSDTEGPVPVNSAAVLKKSQAAPGSSPCRGHVLRK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 SGTSSPQSPVFRHRTLENSPISSCDTSDTEGPVPVNSAAVLKKSQAAPGSSPCRGHVLRK
670 680 690 700 710 720
730
pF1KE1 AKEWELKNGT
::::::::::
CCDS33 AKEWELKNGT
730
>>CCDS47010.1 AFAP1 gene_id:60312|Hs108|chr4 (814 aa)
initn: 3423 init1: 3423 opt: 3425 Z-score: 2319.2 bits: 439.9 E(32554): 7.4e-123
Smith-Waterman score: 4285; 88.8% identity (89.0% similar) in 762 aa overlap (1-678:1-762)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MEELIVELRLFLELLDHEYLTSTVREKKAVITNILLRIQSSKGFDVKDHAQKQETANSLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 MEELIVELRLFLELLDHEYLTSTVREKKAVITNILLRIQSSKGFDVKDHAQKQETANSLP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 APPQMPLPEIPQPWLPPDSGPPPLPTSSLPEGYYEEAVPLSPGKAPEYITSNYDSDAMSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 APPQMPLPEIPQPWLPPDSGPPPLPTSSLPEGYYEEAVPLSPGKAPEYITSNYDSDAMSS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 SYESYDEEEEDGKGKKTRHQWPSEEASMDLVKDAKICAFLLRKKRFGQWTKLLCVIKDTK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 SYESYDEEEEDGKGKKTRHQWPSEEASMDLVKDAKICAFLLRKKRFGQWTKLLCVIKDTK
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 LLCYKSSKDQQPQMELPLQGCNITYIPKDSKKKKHELKITQQGTDPLVLAVQSKEQAEQW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 LLCYKSSKDQQPQMELPLQGCNITYIPKDSKKKKHELKITQQGTDPLVLAVQSKEQAEQW
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 LKVIKEAYSGCSGPVDSECPPPPSSPVHKAELEKKLSSERPSSDGEGVVENGITTCNGKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 LKVIKEAYSGCSGPVDSECPPPPSSPVHKAELEKKLSSERPSSDGEGVVENGITTCNGKE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 QVKRKKSSKSEAKGTVSKVTGKKITKIISLGKKKPSTDEQTSSAEEDVPTCGYLNVLSNS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 QVKRKKSSKSEAKGTVSKVTGKKITKIISLGKKKPSTDEQTSSAEEDVPTCGYLNVLSNS
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 RWRERWCRVKDNKLIFHKDRTDLKTHIVSIPLRGCEVIPGLDSKHPLTFRLLRNGQEVAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 RWRERWCRVKDNKLIFHKDRTDLKTHIVSIPLRGCEVIPGLDSKHPLTFRLLRNGQEVAV
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE1 LEASSSEDMGRWIGILLAETGSSTDPEALHYDYIDVEMSASVIQTAKQTFCFMNRRVISA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 LEASSSEDMGRWIGILLAETGSSTDPEALHYDYIDVEMSASVIQTAKQTFCFMNRRVISA
430 440 450 460 470 480
490 500 510
pF1KE1 NPYLGGTSNGYAHPSGTALHYDDVPCINGS------------------------------
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 NPYLGGTSNGYAHPSGTALHYDDVPCINGSWEPEDGFPASCSRGLGEEVLYDNAGLYDNL
490 500 510 520 530 540
pF1KE1 ------------------------------------------------------LKGKKP
::::::
CCDS47 PPPHIFARYSPADRKASRLSADKLSSNHYKYPASAQSVTNTSSVGRASLGLNSQLKGKKP
550 560 570 580 590 600
520 530 540 550 560 570
pF1KE1 PMASNGVTGKGKTLSSQPKKADPAAVVKRTGSNAAQYKYGKNRVEADAKRLQTKEEELLK
:.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 PVASNGVTGKGKTLSSQPKKADPAAVVKRTGSNAAQYKYGKNRVEADAKRLQTKEEELLK
610 620 630 640 650 660
580 590 600 610 620 630
pF1KE1 RKEALRNRLAQLRKERKDLRAAIEVNAGRKPQAILEEKLKQLEEECRQKEAERVSLELEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 RKEALRNRLAQLRKERKDLRAAIEVNAGRKPQAILEEKLKQLEEECRQKEAERVSLELEL
670 680 690 700 710 720
640 650 660 670 680 690
pF1KE1 TEVKESLKKALAGGVTLGLAIEPKSGTSSPQSPVFRHRTLENSPISSCDTSDTEGPVPVN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 TEVKESLKKALAGGVTLGLAIEPKSGTSSPQSPVFRHRTLENSPISSCDTSDTEGPVPVN
730 740 750 760 770 780
700 710 720 730
pF1KE1 SAAVLKKSQAAPGSSPCRGHVLRKAKEWELKNGT
CCDS47 SAAVLKKSQAAPGSSPCRGHVLRKAKEWELKNGT
790 800 810
>>CCDS34274.1 AFAP1L1 gene_id:134265|Hs108|chr5 (768 aa)
initn: 1785 init1: 679 opt: 1460 Z-score: 995.5 bits: 194.9 E(32554): 4e-49
Smith-Waterman score: 1953; 46.9% identity (71.0% similar) in 710 aa overlap (62-727:93-766)
40 50 60 70 80
pF1KE1 TNILLRIQSSKGFDVKDHAQKQETANSLPAPPQMPLPEIPQ-PWLPPDSG-PPPLPTSSL
: . ::. . : : . :::::..
CCDS34 HSGPSFVESLFEEFDCDLSDLRDMPEDDGEPSKGASPELAKSPRLRNAADLPPPLPNKPP
70 80 90 100 110 120
90 100 110
pF1KE1 PEGYYEEAVPLSPGKAPEYITSNY----------------------------------DS
:: :::::.::.:::.::::.:. ::
CCDS34 PEDYYEEALPLGPGKSPEYISSHNGCSPSHSIVDGYYEDADSSYPATRVNGELKSSYNDS
130 140 150 160 170 180
120 130 140 150 160 170
pF1KE1 DAMSSSYESYDEEEEDGKGKKTRHQWPSEEASMDLVKDAKICAFLLRKKRFGQWTKLLCV
:::::::::::::::.::. . ::::::::::: ::.. .::::::::::::::.: : :
CCDS34 DAMSSSYESYDEEEEEGKSPQPRHQWPSEEASMHLVRECRICAFLLRKKRFGQWAKQLTV
190 200 210 220 230 240
180 190 200 210 220 230
pF1KE1 IKDTKLLCYKSSKDQQPQMELPLQGCNITYIPKDSKKKKHELKITQQGTDPLVLAVQSKE
:.. .:::::::::.::...: :. :.: :.::::..:.:::..:: .:. ::::.::.:
CCDS34 IREDQLLCYKSSKDRQPHLRLALDTCSIIYVPKDSRHKRHELRFTQGATEVLVLALQSRE
250 260 270 280 290 300
240 250 260 270 280 290
pF1KE1 QAEQWLKVIKEAYSGCSGPVDSECPPPPSSPVHKAELEKKLSSERPSSDGEGV-VENGIT
:::.:::::.:. . .: : : : . : .:.:.::.:. .::...: : .. .
CCDS34 QAEEWLKVIREVSKPVGGAEGVEVPRSPVL-LCKLDLDKRLSQEKQTSDSDSVGVGDNCS
310 320 330 340 350 360
300 310 320 330 340 350
pF1KE1 TCNGKEQV---KRKKSSKSEAKGTVSKVTGKKITKIISLGKKKPSTDE-QTSSAEEDVPT
: . .: : :::: .: ::..:...:.:::.::...::: .:. ::::.::.::
CCDS34 TLGRRETCDHGKGKKSSLAELKGSMSRAAGRKITRIIGFSKKKTLADDLQTSSTEEEVPC
370 380 390 400 410 420
360 370 380 390 400 410
pF1KE1 CGYLNVLSNSRWRERWCRVKDNKLIFHKDRTDLKTHIVSIPLRGCEVIPGLDSKHPLTFR
::::::: :. :.:::::.: : : ::::. ::.::. .: :.:::: ::. .::..::
CCDS34 CGYLNVLVNQGWKERWCRLKCNTLYFHKDHMDLRTHVNAIALQGCEVAPGFGPRHPFAFR
430 440 450 460 470 480
420 430 440 450 460 470
pF1KE1 LLRNGQEVAVLEASSSEDMGRWIGILLAETGSSTDPEALHYDYIDVEMSASVIQTAKQTF
.::: ::::.:::: :::::::.:.::.: :: . ::::::::.::: .:........:
CCDS34 ILRNRQEVAILEASCSEDMGRWLGLLLVEMGSRVTPEALHYDYVDVETLTSIVSAGRNSF
490 500 510 520 530 540
480 490 500 510 520
pF1KE1 CFMNRRVISANPYLGGTSNGYAHPSGTALHYDDVPCINGSLKGKKPPMASNG-VTGKGKT
: . .: . .: ::::: ... ..: ... : ....
CCDS34 L-----------YARSCQNQWPEPRV----YDDVP--YEKMQDEEPERPTGAQVKRHASS
550 560 570 580
530 540 550 560 570 580
pF1KE1 LSSQPKKADPAAVVKRTGSNAAQYKYGKNRVEADAKRLQTKEEELLKRKEALRNRLAQLR
: . ...:: . ::: .:.: ::::::::.: ::.: ...:.: :.::..:..: ::
CCDS34 CSEKSHRVDPQVKVKRHASSANQYKYGKNRAEEDARRYLVEKEKLEKEKETIRTELIALR
590 600 610 620 630 640
590 600 610 620 630 640
pF1KE1 KERKDLRAAIEVNAGRKPQAILEEKLKQLEEECRQKEAERVSLELELTEVKESLKKALAG
.:...:. ::. . : : .: ::: . :: .:: :: .:..:::.:. ::: :...:::
CCDS34 QEKRELKEAIRSSPGAKLKA-LEEAVATLEAQCRAKEERRIDLELKLVAVKERLQQSLAG
650 660 670 680 690 700
650 660 670 680 690 700
pF1KE1 GVTLGLAI--EPKSGTSSPQSPVFRHRTLENSPISSCDTSDTEGPVPVNSAAVLKKSQAA
: .:::.. .:::: .. :.: .: : :.::: .. :.: . .
CCDS34 GPALGLSVSSKPKSGETA------------NKPQNSVP----EQPLPVNCVSELRKRSPS
710 720 730 740
710 720 730
pF1KE1 PGSSPCRGHVLRKAKEWELKNGT
.: .:.::.::::::.:
CCDS34 IVASN-QGRVLQKAKEWEMKKT
750 760
>>CCDS54932.1 AFAP1L1 gene_id:134265|Hs108|chr5 (725 aa)
initn: 1735 init1: 679 opt: 1459 Z-score: 995.1 bits: 194.7 E(32554): 4.1e-49
Smith-Waterman score: 1880; 48.4% identity (72.6% similar) in 645 aa overlap (62-662:93-718)
40 50 60 70 80
pF1KE1 TNILLRIQSSKGFDVKDHAQKQETANSLPAPPQMPLPEIPQ-PWLPPDSG-PPPLPTSSL
: . ::. . : : . :::::..
CCDS54 HSGPSFVESLFEEFDCDLSDLRDMPEDDGEPSKGASPELAKSPRLRNAADLPPPLPNKPP
70 80 90 100 110 120
90 100 110
pF1KE1 PEGYYEEAVPLSPGKAPEYITSNY----------------------------------DS
:: :::::.::.:::.::::.:. ::
CCDS54 PEDYYEEALPLGPGKSPEYISSHNGCSPSHSIVDGYYEDADSSYPATRVNGELKSSYNDS
130 140 150 160 170 180
120 130 140 150 160 170
pF1KE1 DAMSSSYESYDEEEEDGKGKKTRHQWPSEEASMDLVKDAKICAFLLRKKRFGQWTKLLCV
:::::::::::::::.::. . ::::::::::: ::.. .::::::::::::::.: : :
CCDS54 DAMSSSYESYDEEEEEGKSPQPRHQWPSEEASMHLVRECRICAFLLRKKRFGQWAKQLTV
190 200 210 220 230 240
180 190 200 210 220 230
pF1KE1 IKDTKLLCYKSSKDQQPQMELPLQGCNITYIPKDSKKKKHELKITQQGTDPLVLAVQSKE
:.. .:::::::::.::...: :. :.: :.::::..:.:::..:: .:. ::::.::.:
CCDS54 IREDQLLCYKSSKDRQPHLRLALDTCSIIYVPKDSRHKRHELRFTQGATEVLVLALQSRE
250 260 270 280 290 300
240 250 260 270 280 290
pF1KE1 QAEQWLKVIKEAYSGCSGPVDSECPPPPSSPVHKAELEKKLSSERPSSDGEGV-VENGIT
:::.:::::.:. . .: : : : . : .:.:.::.:. .::...: : .. .
CCDS54 QAEEWLKVIREVSKPVGGAEGVEVPRSPVL-LCKLDLDKRLSQEKQTSDSDSVGVGDNCS
310 320 330 340 350 360
300 310 320 330 340 350
pF1KE1 TCNGKEQV---KRKKSSKSEAKGTVSKVTGKKITKIISLGKKKPSTDE-QTSSAEEDVPT
: . .: : :::: .: ::..:...:.:::.::...::: .:. ::::.::.::
CCDS54 TLGRRETCDHGKGKKSSLAELKGSMSRAAGRKITRIIGFSKKKTLADDLQTSSTEEEVPC
370 380 390 400 410 420
360 370 380 390 400 410
pF1KE1 CGYLNVLSNSRWRERWCRVKDNKLIFHKDRTDLKTHIVSIPLRGCEVIPGLDSKHPLTFR
::::::: :. :.:::::.: : : ::::. ::.::. .: :.:::: ::. .::..::
CCDS54 CGYLNVLVNQGWKERWCRLKCNTLYFHKDHMDLRTHVNAIALQGCEVAPGFGPRHPFAFR
430 440 450 460 470 480
420 430 440 450 460 470
pF1KE1 LLRNGQEVAVLEASSSEDMGRWIGILLAETGSSTDPEALHYDYIDVEMSASVIQTAKQTF
.::: ::::.:::: :::::::.:.::.: :: . ::::::::.::: .:........:
CCDS54 ILRNRQEVAILEASCSEDMGRWLGLLLVEMGSRVTPEALHYDYVDVETLTSIVSAGRNSF
490 500 510 520 530 540
480 490 500 510 520
pF1KE1 CFMNRRVISANPYLGGTSNGYAHPSGTALHYDDVPCINGSLKGKKPPMASNG-VTGKGKT
: . .: . .: ::::: ... ..: ... : ....
CCDS54 L-----------YARSCQNQWPEPRV----YDDVP--YEKMQDEEPERPTGAQVKRHASS
550 560 570 580
530 540 550 560 570 580
pF1KE1 LSSQPKKADPAAVVKRTGSNAAQYKYGKNRVEADAKRLQTKEEELLKRKEALRNRLAQLR
: . ...:: . ::: .:.: ::::::::.: ::.: ...:.: :.::..:..: ::
CCDS54 CSEKSHRVDPQVKVKRHASSANQYKYGKNRAEEDARRYLVEKEKLEKEKETIRTELIALR
590 600 610 620 630 640
590 600 610 620 630 640
pF1KE1 KERKDLRAAIEVNAGRKPQAILEEKLKQLEEECRQKEAERVSLELELTEVKESLKKALAG
.:...:. ::. . : : .: ::: . :: .:: :: .:..:::.:. ::: :...:::
CCDS54 QEKRELKEAIRSSPGAKLKA-LEEAVATLEAQCRAKEERRIDLELKLVAVKERLQQSLAG
650 660 670 680 690 700
650 660 670 680 690 700
pF1KE1 GVTLGLAI--EPKSGTSSPQSPVFRHRTLENSPISSCDTSDTEGPVPVNSAAVLKKSQAA
: .:::.. .::::
CCDS54 GPALGLSVSSKPKSGEWEMKKT
710 720
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]