Result of FASTA (ccds) for
pFN21AB5565
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB5565, 737 aa
1>>>pF1KB5565 737 - 737 aa - 737 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.1957+/-0.00105; mu= 19.8911+/- 0.063
mean_var=58.8864+/-11.996, 0's: 0 Z-trim(101.7): 26 B-trim: 0 in 0/51
Lambda= 0.167135
statistics sampled from 6624 (6639) to 6624 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.555), E-opt: 0.2 (0.204), width: 16
Scan time: 2.890
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS3131.1 PLOD2 gene_id:5352|Hs108|chr3 ( 737) 5083 1234.7 0
CCDS3132.1 PLOD2 gene_id:5352|Hs108|chr3 ( 758) 3408 830.9 0
CCDS5715.1 PLOD3 gene_id:8985|Hs108|chr7 ( 738) 3173 774.2 0
CCDS142.1 PLOD1 gene_id:5351|Hs108|chr1 ( 727) 3165 772.3 0
CCDS1360.1 COLGALT2 gene_id:23127|Hs108|chr1 ( 626) 304 82.4 2.4e-15
CCDS12363.1 COLGALT1 gene_id:79709|Hs108|chr19 ( 622) 242 67.4 7.5e-11
>>CCDS3131.1 PLOD2 gene_id:5352|Hs108|chr3 (737 aa)
initn: 5083 init1: 5083 opt: 5083 Z-score: 6615.7 bits: 1234.7 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5083; 100.0% identity (100.0% similar) in 737 aa overlap (1-737:1-737)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MGGCTVKPQLLLLALVLHPWNPCLGADSEKPSSIPTDKLLVITVATKESDGFHRFMQSAK
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CCDS31 MGGCTVKPQLLLLALVLHPWNPCLGADSEKPSSIPTDKLLVITVATKESDGFHRFMQSAK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 YFNYTVKVLGQGEEWRGGDGINSIGGGQKVRLMKEVMEHYADQDDLVVMFTECFDVIFAG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 YFNYTVKVLGQGEEWRGGDGINSIGGGQKVRLMKEVMEHYADQDDLVVMFTECFDVIFAG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 GPEEVLKKFQKANHKVVFAADGILWPDKRLADKYPVVHIGKRYLNSGGFIGYAPYVNRIV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 GPEEVLKKFQKANHKVVFAADGILWPDKRLADKYPVVHIGKRYLNSGGFIGYAPYVNRIV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 QQWNLQDNDDDQLFYTKVYIDPLKREAINITLDHKCKIFQTLNGAVDEVVLKFENGKARA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 QQWNLQDNDDDQLFYTKVYIDPLKREAINITLDHKCKIFQTLNGAVDEVVLKFENGKARA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 KNTFYETLPVAINGNGPTKILLNYFGNYVPNSWTQDNGCTLCEFDTVDLSAVDVHPNVSI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 KNTFYETLPVAINGNGPTKILLNYFGNYVPNSWTQDNGCTLCEFDTVDLSAVDVHPNVSI
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 GVFIEQPTPFLPRFLDILLTLDYPKEALKLFIHNKEVYHEKDIKVFFDKAKHEIKTIKIV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 GVFIEQPTPFLPRFLDILLTLDYPKEALKLFIHNKEVYHEKDIKVFFDKAKHEIKTIKIV
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 GPEENLSQAEARNMGMDFCRQDEKCDYYFSVDADVVLTNPRTLKILIEQNRKIIAPLVTR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 GPEENLSQAEARNMGMDFCRQDEKCDYYFSVDADVVLTNPRTLKILIEQNRKIIAPLVTR
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 HGKLWSNFWGALSPDGYYARSEDYVDIVQGNRVGVWNVPYMANVYLIKGKTLRSEMNERN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 HGKLWSNFWGALSPDGYYARSEDYVDIVQGNRVGVWNVPYMANVYLIKGKTLRSEMNERN
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB5 YFVRDKLDPDMALCRNAREMGVFMYISNRHEFGRLLSTANYNTSHYNNDLWQIFENPVDW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 YFVRDKLDPDMALCRNAREMGVFMYISNRHEFGRLLSTANYNTSHYNNDLWQIFENPVDW
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB5 KEKYINRDYSKIFTENIVEQPCPDVFWFPIFSEKACDELVEEMEHYGKWSGGKHHDSRIS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 KEKYINRDYSKIFTENIVEQPCPDVFWFPIFSEKACDELVEEMEHYGKWSGGKHHDSRIS
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB5 GGYENVPTDDIHMKQVDLENVWLHFIREFIAPVTLKVFAGYYTKGFALLNFVVKYSPERQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 GGYENVPTDDIHMKQVDLENVWLHFIREFIAPVTLKVFAGYYTKGFALLNFVVKYSPERQ
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB5 RSLRPHHDASTFTINIALNNVGEDFQGGGCKFLRYNCSIESPRKGWSFMHPGRLTHLHEG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 RSLRPHHDASTFTINIALNNVGEDFQGGGCKFLRYNCSIESPRKGWSFMHPGRLTHLHEG
670 680 690 700 710 720
730
pF1KB5 LPVKNGTRYIAVSFIDP
:::::::::::::::::
CCDS31 LPVKNGTRYIAVSFIDP
730
>>CCDS3132.1 PLOD2 gene_id:5352|Hs108|chr3 (758 aa)
initn: 5069 init1: 3408 opt: 3408 Z-score: 4432.7 bits: 830.9 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5031; 97.2% identity (97.2% similar) in 758 aa overlap (1-737:1-758)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MGGCTVKPQLLLLALVLHPWNPCLGADSEKPSSIPTDKLLVITVATKESDGFHRFMQSAK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MGGCTVKPQLLLLALVLHPWNPCLGADSEKPSSIPTDKLLVITVATKESDGFHRFMQSAK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 YFNYTVKVLGQGEEWRGGDGINSIGGGQKVRLMKEVMEHYADQDDLVVMFTECFDVIFAG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 YFNYTVKVLGQGEEWRGGDGINSIGGGQKVRLMKEVMEHYADQDDLVVMFTECFDVIFAG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 GPEEVLKKFQKANHKVVFAADGILWPDKRLADKYPVVHIGKRYLNSGGFIGYAPYVNRIV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 GPEEVLKKFQKANHKVVFAADGILWPDKRLADKYPVVHIGKRYLNSGGFIGYAPYVNRIV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 QQWNLQDNDDDQLFYTKVYIDPLKREAINITLDHKCKIFQTLNGAVDEVVLKFENGKARA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 QQWNLQDNDDDQLFYTKVYIDPLKREAINITLDHKCKIFQTLNGAVDEVVLKFENGKARA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 KNTFYETLPVAINGNGPTKILLNYFGNYVPNSWTQDNGCTLCEFDTVDLSAVDVHPNVSI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 KNTFYETLPVAINGNGPTKILLNYFGNYVPNSWTQDNGCTLCEFDTVDLSAVDVHPNVSI
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 GVFIEQPTPFLPRFLDILLTLDYPKEALKLFIHNKEVYHEKDIKVFFDKAKHEIKTIKIV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 GVFIEQPTPFLPRFLDILLTLDYPKEALKLFIHNKEVYHEKDIKVFFDKAKHEIKTIKIV
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 GPEENLSQAEARNMGMDFCRQDEKCDYYFSVDADVVLTNPRTLKILIEQNRKIIAPLVTR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 GPEENLSQAEARNMGMDFCRQDEKCDYYFSVDADVVLTNPRTLKILIEQNRKIIAPLVTR
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 HGKLWSNFWGALSPDGYYARSEDYVDIVQGNRVGVWNVPYMANVYLIKGKTLRSEMNERN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 HGKLWSNFWGALSPDGYYARSEDYVDIVQGNRVGVWNVPYMANVYLIKGKTLRSEMNERN
430 440 450 460 470 480
490 500 510
pF1KB5 YFVRDKLDPDMALCRNAREM---------------------GVFMYISNRHEFGRLLSTA
:::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::
CCDS31 YFVRDKLDPDMALCRNAREMTLQREKDSPTPETFQMLSPPKGVFMYISNRHEFGRLLSTA
490 500 510 520 530 540
520 530 540 550 560 570
pF1KB5 NYNTSHYNNDLWQIFENPVDWKEKYINRDYSKIFTENIVEQPCPDVFWFPIFSEKACDEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 NYNTSHYNNDLWQIFENPVDWKEKYINRDYSKIFTENIVEQPCPDVFWFPIFSEKACDEL
550 560 570 580 590 600
580 590 600 610 620 630
pF1KB5 VEEMEHYGKWSGGKHHDSRISGGYENVPTDDIHMKQVDLENVWLHFIREFIAPVTLKVFA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 VEEMEHYGKWSGGKHHDSRISGGYENVPTDDIHMKQVDLENVWLHFIREFIAPVTLKVFA
610 620 630 640 650 660
640 650 660 670 680 690
pF1KB5 GYYTKGFALLNFVVKYSPERQRSLRPHHDASTFTINIALNNVGEDFQGGGCKFLRYNCSI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 GYYTKGFALLNFVVKYSPERQRSLRPHHDASTFTINIALNNVGEDFQGGGCKFLRYNCSI
670 680 690 700 710 720
700 710 720 730
pF1KB5 ESPRKGWSFMHPGRLTHLHEGLPVKNGTRYIAVSFIDP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 ESPRKGWSFMHPGRLTHLHEGLPVKNGTRYIAVSFIDP
730 740 750
>>CCDS5715.1 PLOD3 gene_id:8985|Hs108|chr7 (738 aa)
initn: 3163 init1: 2219 opt: 3173 Z-score: 4126.6 bits: 774.2 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 3173; 58.6% identity (84.9% similar) in 734 aa overlap (8-737:8-738)
10 20 30 40 50
pF1KB5 MGGCTVKPQLLLLALVLHPWNPCLGADSEKPSS---IPTDKLLVITVATKESDGFHRFMQ
:..::: .: : : .: :..: . . .::::::::: :..:. ::..
CCDS57 MTSSGPGPRFLLLLPLLLP--PAASA-SDRPRGRDPVNPEKLLVITVATAETEGYLRFLR
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB5 SAKYFNYTVKVLGQGEEWRGGDGINSIGGGQKVRLMKEVMEHYADQDDLVVMFTECFDVI
::..:::::..:: :::::::: ..::::::: .:. ::.:::..:...::.. .:::
CCDS57 SAEFFNYTVRTLGLGEEWRGGDVARTVGGGQKVRWLKKEMEKYADREDMIIMFVDSYDVI
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB5 FAGGPEEVLKKFQKANHKVVFAADGILWPDKRLADKYPVVHIGKRYLNSGGFIGYAPYVN
.::.: :.:::: ... ...:.:... ::. ::..:: : :::.::::::::.: ..
CCDS57 LAGSPTELLKKFVQSGSRLLFSAESFCWPEWGLAEQYPEVGTGKRFLNSGGFIGFATTIH
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 RIVQQWNLQDNDDDQLFYTKVYIDPLKREAINITLDHKCKIFQTLNGAVDEVVLKFENGK
.::.::. .:.::::::::..:.:: :: ....:::: .:::.::::.:::::::. ..
CCDS57 QIVRQWKYKDDDDDQLFYTRLYLDPGLREKLSLNLDHKSRIFQNLNGALDEVVLKFDRNR
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 ARAKNTFYETLPVAINGNGPTKILLNYFGNYVPNSWTQDNGCTLCEFDTVDLSAVDVHPN
.: .:. :.:::....::::::. :::.::::::.:: ..:: .:. : : . . :
CCDS57 VRIRNVAYDTLPIVVHGNGPTKLQLNYLGNYVPNGWTPEGGCGFCNQDRRTLPGGQPPPR
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB5 VSIGVFIEQPTPFLPRFLDILLTLDYPKEALKLFIHNKEVYHEKDIKVFFDKAKHEIKTI
: ..::.:::::::::::. :: :::: . . ::.::.::.:: : . . . .....
CCDS57 VFLAVFVEQPTPFLPRFLQRLLLLDYPPDRVTLFLHNNEVFHEPHIADSWPQLQDHFSAV
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KB5 KIVGPEENLSQAEARNMGMDFCRQDEKCDYYFSVDADVVLTNPRTLKILIEQNRKIIAPL
:.::::: :: .:::.:.::.:::: .:..:::.:::.:::: .::.::::.:::.:::.
CCDS57 KLVGPEEALSPGEARDMAMDLCRQDPECEFYFSLDADAVLTNLQTLRILIEENRKVIAPM
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KB5 VTRHGKLWSNFWGALSPDGYYARSEDYVDIVQGNRVGVWNVPYMANVYLIKGKTLRSEMN
..:::::::::::::::: :::::::::..:: .:::::::::....:.:.: ::: :.
CCDS57 LSRHGKLWSNFWGALSPDEYYARSEDYVELVQRKRVGVWNVPYISQAYVIRGDTLRMELP
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KB5 ERNYFVRDKLDPDMALCRNAREMGVFMYISNRHEFGRLLSTANYNTSHYNNDLWQIFENP
.:. : . :::::.:.. :. :.:...::.:::::::.:. :.: : . ::::::.::
CCDS57 QRDVFSGSDTDPDMAFCKSFRDKGIFLHLSNQHEFGRLLATSRYDTEHLHPDLWQIFDNP
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580 590
pF1KB5 VDWKEKYINRDYSKIFT-ENIVEQPCPDVFWFPIFSEKACDELVEEMEHYGKWSGGKHHD
:::::.::...::. . :.:::::::::.:::..::. ::::: ::::::.::::.:.:
CCDS57 VDWKEQYIHENYSRALEGEGIVEQPCPDVYWFPLLSEQMCDELVAEMEHYGQWSGGRHED
540 550 560 570 580 590
600 610 620 630 640 650
pF1KB5 SRISGGYENVPTDDIHMKQVDLENVWLHFIREFIAPVTLKVFAGYYTKGFALLNFVVKYS
::..:::::::: ::::::: :. ::...: ...:.: ..: ::.::. :..::::.:
CCDS57 SRLAGGYENVPTVDIHMKQVGYEDQWLQLLRTYVGPMTESLFPGYHTKARAVMNFVVRYR
600 610 620 630 640 650
660 670 680 690 700 710
pF1KB5 PERQRSLRPHHDASTFTINIALNNVGEDFQGGGCKFLRYNCSIESPRKGWSFMHPGRLTH
:..: :::::::.::::.:.:::. : :..::::.::::.: : ::::::...:::::::
CCDS57 PDEQPSLRPHHDSSTFTLNVALNHKGLDYEGGGCRFLRYDCVISSPRKGWALLHPGRLTH
660 670 680 690 700 710
720 730
pF1KB5 LHEGLPVKNGTRYIAVSFIDP
:::::. ::::: :::.::
CCDS57 YHEGLPTTWGTRYIMVSFVDP
720 730
>>CCDS142.1 PLOD1 gene_id:5351|Hs108|chr1 (727 aa)
initn: 3159 init1: 2076 opt: 3165 Z-score: 4116.3 bits: 772.3 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 3165; 59.8% identity (85.1% similar) in 734 aa overlap (6-737:1-727)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MGGCTVKPQLLLLALVLHPWNPCLGADSEKPSSIPTDKLLVITVATKESDGFHRFMQSAK
..: ::::::. : : :.. : .. : :.:::.::::::..::.:: .::.
CCDS14 MRP-LLLLALL--GW--LLLAEA-KGDAKPEDNLLVLTVATKETEGFRRFKRSAQ
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 YFNYTVKVLGQGEEWRGGDGINSIGGGQKVRLMKEVMEHYADQDDLVVMFTECFDVIFAG
.::: ...:: ::.: : .: ::::::::.:...:..::..:::..:.. .::.::.
CCDS14 FFNYKIQALGLGEDWNVEKG-TSAGGGQKVRLLKKALEKHADKEDLVILFADSYDVLFAS
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 GPEEVLKKFQKANHKVVFAADGILWPDKRLADKYPVVHIGKRYLNSGGFIGYAPYVNRIV
::.:.::::..: .:::.:. ...::.:: ::::: :::.:.::::::::: ....:
CCDS14 GPRELLKKFRQARSQVVFSAEELIYPDRRLETKYPVVSDGKRFLGSGGFIGYAPNLSKLV
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 QQWNLQDNDDDQLFYTKVYIDPLKREAINITLDHKCKIFQTLNGAVDEVVLKFENGKARA
.:. ::.:.:::::::...:: ::: :::::::.:.:::.:.::.:::::::: :..::
CCDS14 AEWEGQDSDSDQLFYTKIFLDPEKREQINITLDHRCRIFQNLDGALDEVVLKFEMGHVRA
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290
pF1KB5 KNTFYETLPVAINGNGPTKILLNYFGNYVPNSWTQDNGCTLCEFDTVDLSAV--DVHPNV
.: :.:::: :.::::::. :::.:::.: :: ..:::.:. .:... .. :.:
CCDS14 RNLAYDTLPVLIHGNGPTKLQLNYLGNYIPRFWTFETGCTVCDEGLRSLKGIGDEALPTV
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KB5 SIGVFIEQPTPFLPRFLDILLTLDYPKEALKLFIHNKEVYHEKDIKVFFDKAKHEIKTIK
.::::::::::. :.. :: : ::.. ..:::::.: .:. ... :. . : ...:
CCDS14 LVGVFIEQPTPFVSLFFQRLLRLHYPQKHMRLFIHNHEQHHKAQVEEFLAQHGSEYQSVK
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KB5 IVGPEENLSQAEARNMGMDFCRQDEKCDYYFSVDADVVLTNPRTLKILIEQNRKIIAPLV
.:::: ...:.::::: :.::::..: :::::::::.::.: .:..::.::...::::.
CCDS14 LVGPEVRMANADARNMGADLCRQDRSCTYYFSVDADVALTEPNSLRLLIQQNKNVIAPLM
350 360 370 380 390 400
420 430 440 450 460 470
pF1KB5 TRHGKLWSNFWGALSPDGYYARSEDYVDIVQGNRVGVWNVPYMANVYLIKGKTLRSEMNE
::::.:::::::::: :::::::::::::::: :::::::::..:.:::::..::.:..
CCDS14 TRHGRLWSNFWGALSADGYYARSEDYVDIVQGRRVGVWNVPYISNIYLIKGSALRGELQS
410 420 430 440 450 460
480 490 500 510 520 530
pF1KB5 RNYFVRDKLDPDMALCRNAREMGVFMYISNRHEFGRLLSTANYNTSHYNNDLWQIFENPV
. : ..:::::::.: : :.. :::...::: .:.::: .: :.: .::::..: ::
CCDS14 SDLFHHSKLDPDMAFCANIRQQDVFMFLTNRHTLGHLLSLDSYRTTHLHNDLWEVFSNPE
470 480 490 500 510 520
540 550 560 570 580 590
pF1KB5 DWKEKYINRDYSKIFTENIVEQPCPDVFWFPIFSEKACDELVEEMEHYGKWSGGKHHDSR
:::::::...:.: .. ..:: :::::.:::::.: :::::::::::.:.:: :...:.:
CCDS14 DWKEKYIHQNYTKALAGKLVETPCPDVYWFPIFTEVACDELVEEMEHFGQWSLGNNKDNR
530 540 550 560 570 580
600 610 620 630 640 650
pF1KB5 ISGGYENVPTDDIHMKQVDLENVWLHFIREFIAPVTLKVFAGYYTKGFALLNFVVKYSPE
:.:::::::: ::::.:. .: : .:. :.:::.: :.. ::::.. : :::.:.:.
CCDS14 IQGGYENVPTIDIHMNQIGFEREWHKFLLEYIAPMTEKLYPGYYTRAQFDLAFVVRYKPD
590 600 610 620 630 640
660 670 680 690 700 710
pF1KB5 RQRSLRPHHDASTFTINIALNNVGEDFQGGGCKFLRYNCSIESPRKGWSFMHPGRLTHLH
.: :: ::::::::::::::: :: :..::::.::::::::..:::::..:::::::: :
CCDS14 EQPSLMPHHDASTFTINIALNRVGVDYEGGGCRFLRYNCSIRAPRKGWTLMHPGRLTHYH
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::::. :::::::::.::
CCDS14 EGLPTTRGTRYIAVSFVDP
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.: . ..:.: : :.. :.
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: ..:. .. . ::.:: : ::::: . .. :: :...: :... ..
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. : .. .::.. .. :. : . . :: :: . .:.: :::
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:.::..:: .:. :.::.. .: :.:::: ...: :.: :. :::.: . .:.: . ::
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.. ...:: ::.: ... : .: .: ... ..:. :. ::. ::...:
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:
CCDS13 YLPIPLKPHQTLQEDIENLIHVQIEAMIDRPPMEPSQYVSVVPKYPDKMGFDEIFMINLK
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: : :... .. . :: : : : .:.
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: :.. :: . : .: .: .. ... . :.:. . ...:
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]