Result of FASTA (ccds) for pFN21AB5551
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB5551, 680 aa
  1>>>pF1KB5551     680 - 680 aa - 680 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.3324+/-0.000992; mu= 19.1860+/- 0.060
 mean_var=62.1753+/-12.473, 0's: 0 Z-trim(103.3): 21  B-trim: 0 in 0/50
 Lambda= 0.162654
 statistics sampled from 7336 (7353) to 7336 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.594), E-opt: 0.2 (0.226), width:  16
 Scan time:  3.560

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS5579.1 POR gene_id:5447|Hs108|chr7             ( 680) 4524 1070.7       0
CCDS48061.1 NDOR1 gene_id:27158|Hs108|chr9         ( 606) 1012 246.6 7.9e-65
CCDS7036.1 NDOR1 gene_id:27158|Hs108|chr9          ( 597)  946 231.1 3.6e-60
CCDS11223.1 NOS2 gene_id:4843|Hs108|chr17          (1153)  925 226.3 1.9e-58
CCDS5912.1 NOS3 gene_id:4846|Hs108|chr7            (1203)  747 184.5 7.5e-46
CCDS41842.1 NOS1 gene_id:4842|Hs108|chr12          (1434)  661 164.4   1e-39
CCDS55890.1 NOS1 gene_id:4842|Hs108|chr12          (1468)  661 164.4 1.1e-39
CCDS48062.1 NDOR1 gene_id:27158|Hs108|chr9         ( 590)  615 153.4 8.5e-37
CCDS48063.1 NDOR1 gene_id:27158|Hs108|chr9         ( 521)  607 151.5 2.8e-36
CCDS5538.1 TYW1 gene_id:55253|Hs108|chr7           ( 732)  312 82.4 2.6e-15
CCDS3874.1 MTRR gene_id:4552|Hs108|chr5            ( 725)  281 75.1   4e-13
CCDS47190.1 MTRR gene_id:4552|Hs108|chr5           ( 698)  279 74.6 5.4e-13


>>CCDS5579.1 POR gene_id:5447|Hs108|chr7                  (680 aa)
 initn: 4524 init1: 4524 opt: 4524  Z-score: 5730.5  bits: 1070.7 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 4524; 100.0% identity (100.0% similar) in 680 aa overlap (1-680:1-680)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB5 MINMGDSHVDTSSTVSEAVAEEVSLFSMTDMILFSLIVGLLTYWFLFRKKKEEVPEFTKI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 MINMGDSHVDTSSTVSEAVAEEVSLFSMTDMILFSLIVGLLTYWFLFRKKKEEVPEFTKI
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB5 QTLTSSVRESSFVEKMKKTGRNIIVFYGSQTGTAEEFANRLSKDAHRYGMRGMSADPEEY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 QTLTSSVRESSFVEKMKKTGRNIIVFYGSQTGTAEEFANRLSKDAHRYGMRGMSADPEEY
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB5 DLADLSSLPEIDNALVVFCMATYGEGDPTDNAQDFYDWLQETDVDLSGVKFAVFGLGNKT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 DLADLSSLPEIDNALVVFCMATYGEGDPTDNAQDFYDWLQETDVDLSGVKFAVFGLGNKT
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB5 YEHFNAMGKYVDKRLEQLGAQRIFELGLGDDDGNLEEDFITWREQFWPAVCEHFGVEATG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 YEHFNAMGKYVDKRLEQLGAQRIFELGLGDDDGNLEEDFITWREQFWPAVCEHFGVEATG
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB5 EESSIRQYELVVHTDIDAAKVYMGEMGRLKSYENQKPPFDAKNPFLAAVTTNRKLNQGTE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 EESSIRQYELVVHTDIDAAKVYMGEMGRLKSYENQKPPFDAKNPFLAAVTTNRKLNQGTE
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB5 RHLMHLELDISDSKIRYESGDHVAVYPANDSALVNQLGKILGADLDVVMSLNNLDEESNK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 RHLMHLELDISDSKIRYESGDHVAVYPANDSALVNQLGKILGADLDVVMSLNNLDEESNK
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB5 KHPFPCPTSYRTALTYYLDITNPPRTNVLYELAQYASEPSEQELLRKMASSSGEGKELYL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 KHPFPCPTSYRTALTYYLDITNPPRTNVLYELAQYASEPSEQELLRKMASSSGEGKELYL
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB5 SWVVEARRHILAILQDCPSLRPPIDHLCELLPRLQARYYSIASSSKVHPNSVHICAVVVE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 SWVVEARRHILAILQDCPSLRPPIDHLCELLPRLQARYYSIASSSKVHPNSVHICAVVVE
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB5 YETKAGRINKGVATNWLRAKEPAGENGGRALVPMFVRKSQFRLPFKATTPVIMVGPGTGV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 YETKAGRINKGVATNWLRAKEPAGENGGRALVPMFVRKSQFRLPFKATTPVIMVGPGTGV
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KB5 APFIGFIQERAWLRQQGKEVGETLLYYGCRRSDEDYLYREELAQFHRDGALTQLNVAFSR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 APFIGFIQERAWLRQQGKEVGETLLYYGCRRSDEDYLYREELAQFHRDGALTQLNVAFSR
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KB5 EQSHKVYVQHLLKQDREHLWKLIEGGAHIYVCGDARNMARDVQNTFYDIVAELGAMEHAQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 EQSHKVYVQHLLKQDREHLWKLIEGGAHIYVCGDARNMARDVQNTFYDIVAELGAMEHAQ
              610       620       630       640       650       660

              670       680
pF1KB5 AVDYIKKLMTKGRYSLDVWS
       ::::::::::::::::::::
CCDS55 AVDYIKKLMTKGRYSLDVWS
              670       680

>>CCDS48061.1 NDOR1 gene_id:27158|Hs108|chr9              (606 aa)
 initn: 718 init1: 311 opt: 1012  Z-score: 1277.4  bits: 246.6 E(32554): 7.9e-65
Smith-Waterman score: 1021; 32.6% identity (63.1% similar) in 623 aa overlap (83-680:6-606)

             60        70        80        90       100         110
pF1KB5 EVPEFTKIQTLTSSVRESSFVEKMKKTGRNIIVFYGSQTGTAEEFANRLSKDAHRY--GM
                                     ..:..:::::::.. ..::...:.:   : 
CCDS48                          MPSPQLLVLFGSQTGTAQDVSERLGREARRRRLGC
                                        10        20        30     

              120       130       140       150       160          
pF1KB5 RGMSADPEEYDLADLSSLPEIDNALVVFCMATYGEGDPTDNAQDFYDWLQETDVD---LS
       : .. :   : ...:     :.. ::.:  :: :.::: :: ..:. .. . ..    : 
CCDS48 RVQALDS--YPVVNL-----INEPLVIFVCATTGQGDPPDNMKNFWRFIFRKNLPSTALC
          40               50        60        70        80        

       170       180       190       200       210       220       
pF1KB5 GVKFAVFGLGNKTYEHFNAMGKYVDKRLEQLGAQRIFELGLGDDDGNLEEDFIT--WREQ
        . :::.:::...: .:: ..: . .:: :::.. .. . ::::. .:  :  .  : ..
CCDS48 QMDFAVLGLGDSSYAKFNFVAKKLHRRLLQLGGSALLPVCLGDDQHELGPDAAVDPWLRD
       90       100       110       120       130       140        

         230           240        250       260       270       280
pF1KB5 FWPAVCEHF----GVEATGEESSI-RQYELVVHTDIDAAKVYMGEMGRLKSYENQKPPFD
       .:  :   .    :.        .  .. :.    .. :    .:  :.    .:.:: .
CCDS48 LWDRVLGLYPPPPGLTEIPPGVPLPSKFTLLF---LQEAPSTGSEGQRVAHPGSQEPPSE
      150       160       170       180          190       200     

              290       300        310       320       330         
pF1KB5 AKNPFLAAVTTNRKLNQGTERHLMHL-ELDISDSKIRYESGDHVAVYPANDSALVNQLGK
       .: :::: . .:....  .. . ..: :.::  : : . .:: : . :.:..: :... .
CCDS48 SK-PFLAPMISNQRVTGPSHFQDVRLIEFDILGSGISFAAGDVVLIQPSNSAAHVQRFCQ
          210       220       230       240       250       260    

     340       350       360       370       380       390         
pF1KB5 ILGADLDVVMSLNNLDEESNKKHPFPCPTSYRTALTYYLDITNPPRTNVLYELAQYASEP
       .:: : : .. :.  . . ..   .: : :.:  ...::::.. :: . .  ::  . . 
CCDS48 VLGLDPDQLFMLQPREPDVSSPTRLPQPCSMRHLVSHYLDIASVPRRSFFELLACLSLHE
          270       280       290       300       310       320    

     400       410       420       430       440         450       
pF1KB5 SEQELLRKMASSSGEGKELYLSWVVEARRHILAILQDCPSLRP--PIDHLCELLPRLQAR
        :.: :  .  ::..:.:  . .  . :: :: .: : :      : :.: .:.: .. :
CCDS48 LEREKL--LEFSSAQGQEELFEYCNRPRRTILEVLCDFPHTAAAIPPDYLLDLIPVIRPR
          330         340       350       360       370       380  

       460       470       480       490       500       510       
pF1KB5 YYSIASSSKVHPNSVHICAVVVEYETKAGRINKGVATNWLRAKEPAGENGGRALVPMFVR
        .:::::  .::. ..: ..::...:.  .  .:. ..:: . .: :.  : . ::..::
CCDS48 AFSIASSLLTHPSRLQILVAVVQFQTRLKEPRRGLCSSWLASLDP-GQ--GPVRVPLWVR
            390       400       410       420          430         

       520       530       540       550       560       570       
pF1KB5 KSQFRLPFKATTPVIMVGPGTGVAPFIGFIQERAWLRQQGKEVGETLLYYGCRRSDEDYL
        ... .:    ::::::::::::::: . ::::.   : :     ..:..:::  :.:. 
CCDS48 PGSLAFPETPDTPVIMVGPGTGVAPFRAAIQERVAQGQTG-----NFLFFGCRWRDQDFY
     440       450       460       470            480       490    

       580       590       600                610       620        
pF1KB5 YREELAQFHRDGALTQLNVAFSREQS---------HKVYVQHLLKQDREHLWKLIE-GGA
       .. :  ....   :: :  ::::::          .:::::: :..    .:.:..  ::
CCDS48 WEAEWQELEKRDCLT-LIPAFSREQPPALFSALQEQKVYVQHRLRELGSLVWELLDRQGA
          500        510       520       530       540       550   

       630       640       650       660       670       680
pF1KB5 HIYVCGDARNMARDVQNTFYDIVAELGAMEHAQAVDYIKKLMTKGRYSLDVWS
       ..:. :.:..:  ::......:  : :..   .:. :. .:.   :.. ..:.
CCDS48 YFYLAGNAKSMPADVSEALMSIFQEEGGLCSPDAAAYLARLQQTRRFQTETWA
           560       570       580       590       600      

>>CCDS7036.1 NDOR1 gene_id:27158|Hs108|chr9               (597 aa)
 initn: 784 init1: 311 opt: 946  Z-score: 1193.8  bits: 231.1 E(32554): 3.6e-60
Smith-Waterman score: 1049; 33.1% identity (64.0% similar) in 614 aa overlap (83-680:6-597)

             60        70        80        90       100         110
pF1KB5 EVPEFTKIQTLTSSVRESSFVEKMKKTGRNIIVFYGSQTGTAEEFANRLSKDAHRY--GM
                                     ..:..:::::::.. ..::...:.:   : 
CCDS70                          MPSPQLLVLFGSQTGTAQDVSERLGREARRRRLGC
                                        10        20        30     

              120       130       140       150       160          
pF1KB5 RGMSADPEEYDLADLSSLPEIDNALVVFCMATYGEGDPTDNAQDFYDWLQETDVD---LS
       : .. :   : ...:     :.. ::.:  :: :.::: :: ..:. .. . ..    : 
CCDS70 RVQALDS--YPVVNL-----INEPLVIFVCATTGQGDPPDNMKNFWRFIFRKNLPSTALC
          40               50        60        70        80        

       170       180       190       200       210       220       
pF1KB5 GVKFAVFGLGNKTYEHFNAMGKYVDKRLEQLGAQRIFELGLGDDDGNLEEDFIT--WREQ
        . :::.:::...: .:: ..: . .:: :::.. .. . ::::. .:  :  .  : ..
CCDS70 QMDFAVLGLGDSSYAKFNFVAKKLHRRLLQLGGSALLPVCLGDDQHELGPDAAVDPWLRD
       90       100       110       120       130       140        

         230           240        250       260       270       280
pF1KB5 FWPAVCEHF----GVEATGEESSI-RQYELVVHTDIDAAKVYMGEMGRLKSYENQKPPFD
       .:  :   .    :.        .  .. :.    .. :    .:  :.    .:.:: .
CCDS70 LWDRVLGLYPPPPGLTEIPPGVPLPSKFTLLF---LQEAPSTGSEGQRVAHPGSQEPPSE
      150       160       170       180          190       200     

              290       300        310       320       330         
pF1KB5 AKNPFLAAVTTNRKLNQGTERHLMHL-ELDISDSKIRYESGDHVAVYPANDSALVNQLGK
       .: :::: . .:....  .. . ..: :.::  : : . .:: : . :.:..: :... .
CCDS70 SK-PFLAPMISNQRVTGPSHFQDVRLIEFDILGSGISFAAGDVVLIQPSNSAAHVQRFCQ
          210       220       230       240       250       260    

     340       350       360       370       380       390         
pF1KB5 ILGADLDVVMSLNNLDEESNKKHPFPCPTSYRTALTYYLDITNPPRTNVLYELAQYASEP
       .:: : : .. :.  . . ..   .: : :.:  ...::::.. :: . .  ::  . . 
CCDS70 VLGLDPDQLFMLQPREPDVSSPTRLPQPCSMRHLVSHYLDIASVPRRSFFELLACLSLHE
          270       280       290       300       310       320    

     400       410       420       430       440         450       
pF1KB5 SEQELLRKMASSSGEGKELYLSWVVEARRHILAILQDCPSLRP--PIDHLCELLPRLQAR
        :.: :  .  ::..:.:  . .  . :: :: .: : :      : :.: .:.: .. :
CCDS70 LEREKL--LEFSSAQGQEELFEYCNRPRRTILEVLCDFPHTAAAIPPDYLLDLIPVIRPR
          330         340       350       360       370       380  

       460       470       480       490       500       510       
pF1KB5 YYSIASSSKVHPNSVHICAVVVEYETKAGRINKGVATNWLRAKEPAGENGGRALVPMFVR
        .:::::  .::. ..: ..::...:.  .  .:. ..:: . .: :.  : . ::..::
CCDS70 AFSIASSLLTHPSRLQILVAVVQFQTRLKEPRRGLCSSWLASLDP-GQ--GPVRVPLWVR
            390       400       410       420          430         

       520       530       540       550       560       570       
pF1KB5 KSQFRLPFKATTPVIMVGPGTGVAPFIGFIQERAWLRQQGKEVGETLLYYGCRRSDEDYL
        ... .:    ::::::::::::::: . ::::.   : :     ..:..:::  :.:. 
CCDS70 PGSLAFPETPDTPVIMVGPGTGVAPFRAAIQERVAQGQTG-----NFLFFGCRWRDQDFY
     440       450       460       470            480       490    

       580       590       600       610       620        630      
pF1KB5 YREELAQFHRDGALTQLNVAFSREQSHKVYVQHLLKQDREHLWKLIE-GGAHIYVCGDAR
       .. :  ....   :: :  :::::: .:::::: :..    .:.:..  ::..:. :.:.
CCDS70 WEAEWQELEKRDCLT-LIPAFSREQEQKVYVQHRLRELGSLVWELLDRQGAYFYLAGNAK
          500        510       520       530       540       550   

        640       650       660       670       680
pF1KB5 NMARDVQNTFYDIVAELGAMEHAQAVDYIKKLMTKGRYSLDVWS
       .:  ::......:  : :..   .:. :. .:.   :.. ..:.
CCDS70 SMPADVSEALMSIFQEEGGLCSPDAAAYLARLQQTRRFQTETWA
           560       570       580       590       

>>CCDS11223.1 NOS2 gene_id:4843|Hs108|chr17               (1153 aa)
 initn: 716 init1: 182 opt: 925  Z-score: 1162.7  bits: 226.3 E(32554): 1.9e-58
Smith-Waterman score: 941; 31.8% identity (60.1% similar) in 651 aa overlap (48-679:507-1128)

        20        30        40        50        60        70       
pF1KB5 AVAEEVSLFSMTDMILFSLIVGLLTYWFLFRKKKEEVPEFTKIQTLTSSVRESSFVEKMK
                                     : :..:.:    ...:...:  . .. .  
CCDS11 HQEMLNYVLSPFYYYQVEAWKTHVWQDEKRRPKRREIP----LKVLVKAVLFACMLMRKT
        480       490       500       510           520       530  

        80         90       100       110         120       130    
pF1KB5 KTGR-NIIVFYGSQTGTAEEFANRLSKDAHRYGMRGMSADPEE--YDLADLSSLPEIDNA
        ..:  . ......:: .: .:  :.      .. . . .:.   .:   :: : :  . 
CCDS11 MASRVRVTILFATETGKSEALAWDLG------ALFSCAFNPKVVCMDKYRLSCLEE--ER
            540       550             560       570       580      

          140       150       160       170       180       190    
pF1KB5 LVVFCMATYGEGDPTDNAQDFYDWLQETDVDLSGVKFAVFGLGNKTYEHFNAMGKYVDKR
       :..   .:.:.::   :.. .   :       .  ..::::::.. : .: :... .:..
CCDS11 LLLVVTSTFGNGDCPGNGEKLKKSLFMLKELNNKFRYAVFGLGSSMYPRFCAFAHDIDQK
          590       600       610       620       630       640    

          200       210       220       230       240       250    
pF1KB5 LEQLGAQRIFELGLGDDDGNLEEDFITWREQFWPAVCEHFGVEATGEESSIRQYELVVHT
       : .:::...  .: ::. .. :. : .:  : . :.:: : :..  . .  . :   :  
CCDS11 LSHLGASQLTPMGEGDELSGQEDAFRSWAVQTFKAACETFDVRGKQHIQIPKLYTSNVTW
          650       660       670       680       690       700    

          260       270       280       290       300        310   
pF1KB5 DIDAAKVYMGEMGRLKSYENQKPPFDAKNPFLAAVTTNRKLNQGTE-RHLMHLELDISDS
       :    .. .   ..  .  .    . ::: :   . . ..:.. :  :  . .::.  :.
CCDS11 DPHHYRLVQD--SQPLDLSKALSSMHAKNVFTMRLKSRQNLQSPTSSRATILVELSCEDG
          710         720       730       740       750       760  

            320       330        340        350            360     
pF1KB5 K-IRYESGDHVAVYPANDSALVNQ-LGKIL-GADLDVVMSLNNLDEE-----SNKKHPFP
       . . :  :.:..: :.:. :::.  : ... :     .. :. :::      :.:. : :
CCDS11 QGLNYLPGEHLGVCPGNQPALVQGILERVVDGPTPHQTVRLEALDESGSYWVSDKRLP-P
            770       780       790       800       810       820  

         370       380       390       400       410       420     
pF1KB5 CPTSYRTALTYYLDITNPPRTNVLYELAQYASEPSEQELLRKMASSSGEGKELYLSWVVE
       :  :   ::::.::::.::   .: .::: :.:  :.. :. . . :      : .:   
CCDS11 CSLSQ--ALTYFLDITTPPTQLLLQKLAQVATEEPERQRLEALCQPS-----EYSKWKFT
               830       840       850       860            870    

         430       440       450       460       470       480     
pF1KB5 ARRHILAILQDCPSLRPPIDHLCELLPRLQARYYSIASSSKVHPNSVHICAVVVEYETKA
           .: .:.. ::::     :   :: :. :.:::.::    :. .:. ..:: :.:. 
CCDS11 NSPTFLEVLEEFPSLRVSAGFLLSQLPILKPRFYSISSSRDHTPTEIHLTVAVVTYHTRD
          880       890       900       910       920       930    

           490       500       510        520       530       540  
pF1KB5 GR--INKGVATNWLRAKEPAGENGGRALVPMFVRK-SQFRLPFKATTPVIMVGPGTGVAP
       :.  ...:: ..:: . .:         :: :::. : :.::   . : :..:::::.::
CCDS11 GQGPLHHGVCSTWLNSLKPQDP------VPCFVRNASGFHLPEDPSHPCILIGPGTGIAP
          940       950             960       970       980        

            550        560       570       580       590       600 
pF1KB5 FIGFIQERAWLRQ-QGKEVGETLLYYGCRRSDEDYLYREELAQFHRDGALTQLNVAFSRE
       : .: :.:    : .: . :.  : .:::: :::..:.::. .. . :.:  ...:.:: 
CCDS11 FRSFWQQRLHDSQHKGVRGGRMTLVFGCRRPDEDHIYQEEMLEMAQKGVLHAVHTAYSRL
      990      1000      1010      1020      1030      1040        

              610         620       630       640       650        
pF1KB5 QSH-KVYVQHLLKQD--REHLWKLIEGGAHIYVCGDARNMARDVQNTFYDIVAELGAMEH
        .. ::::: .:.:.   : :  : .  .:.:::::.: ::::: .:. ..::    ...
CCDS11 PGKPKVYVQDILRQQLASEVLRVLHKEPGHLYVCGDVR-MARDVAHTLKQLVAAKLKLNE
     1050      1060      1070      1080       1090      1100       

      660       670       680                        
pF1KB5 AQAVDYIKKLMTKGRYSLDVWS                        
        :. ::. .: .. ::  :..                         
CCDS11 EQVEDYFFQLKSQKRYHEDIFGAVFPYEAKKDRVAVQPSSLEMSAL
      1110      1120      1130      1140      1150   

>>CCDS5912.1 NOS3 gene_id:4846|Hs108|chr7                 (1203 aa)
 initn: 771 init1: 215 opt: 747  Z-score: 936.7  bits: 184.5 E(32554): 7.5e-46
Smith-Waterman score: 877; 29.6% identity (57.1% similar) in 702 aa overlap (50-679:492-1160)

      20        30        40        50        60        70         
pF1KB5 AEEVSLFSMTDMILFSLIVGLLTYWFLFRKKKEEVPEFTKIQTLTSSVRESSFVEKMKKT
                                     .:.   : ..   ...:.  . .....: :
CCDS59 QEMVNYFLSPAFRYQPDPWKGSAAKGTGITRKKTFKEVANAVKISASLMGTVMAKRVKAT
             470       480       490       500       510       520 

      80        90       100        110       120       130        
pF1KB5 GRNIIVFYGSQTGTAEEFANRLSKDAHR-YGMRGMSADPEEYDLADLSSLPEIDNALVVF
            ..:::.:: :. .:..:..  .. .  : .  :  :::...:       ..::. 
CCDS59 -----ILYGSETGRAQSYAQQLGRLFRKAFDPRVLCMD--EYDVVSLEH-----ETLVLV
                  530       540       550         560              

      140       150       160                                      
pF1KB5 CMATYGEGDPTDNAQDFYDWLQE-------------------------------------
         .:.:.::: .:...:   :.:                                     
CCDS59 VTSTFGNGDPPENGESFAAALMEMSGPYNSSPRPEQHKSYKIRFNSISCSDPLVSSWRRK
     570       580       590       600       610       620         

                     170       180       190       200       210   
pF1KB5 ----TDVDLSG----VKFAVFGLGNKTYEHFNAMGKYVDKRLEQLGAQRIFELGLGDDDG
           ...: .:    ..: :::::...: :: :... :: :::.::..:...:: ::.  
CCDS59 RKESSNTDSAGALGTLRFCVFGLGSRAYPHFCAFARAVDTRLEELGGERLLQLGQGDELC
     630       640       650       660       670       680         

           220       230       240       250       260       270   
pF1KB5 NLEEDFITWREQFWPAVCEHFGVEATGEESSIRQYELVVHTDIDAAKVYMGEMGRLKSYE
       . :: :  : .  . :.:: : :   ::...    ..     ..  . .  .  ::..  
CCDS59 GQEEAFRGWAQAAFQAACETFCV---GEDAKAAARDI-----FSPKRSWKRQRYRLSAQA
     690       700       710          720            730       740 

                 280       290        300       310        320     
pF1KB5 N--QKPP----FDAKNPFLAAVTTNRKLNQG-TERHLMHLELDISDSK-IRYESGDHVAV
       .  :  :       .. : :.. . ..:... . :  . ..:: . .. ..:. :::..:
CCDS59 EGLQLLPGLIHVHRRKMFQATIRSVENLQSSKSTRATILVRLDTGGQEGLQYQPGDHIGV
             750       760       770       780       790       800 

         330        340        350       360               370     
pF1KB5 YPANDSALVNQL-GKILGADLDVV-MSLNNLDEESNKKHP--------FPCPTSYRTALT
        : :  .::. : ...      .  .....:.. :    :        .: : . : :::
CCDS59 CPPNRPGLVEALLSRVEDPPAPTEPVAVEQLEKGSPGGPPPGWVRDPRLP-PCTLRQALT
             810       820       830       840       850        860

         380       390       400       410       420       430     
pF1KB5 YYLDITNPPRTNVLYELAQYASEPSEQELLRKMASSSGEGKELYLSWVVEARRHILAILQ
       ..::::.::  ..:  :.  : :: ::. :. ..    .  . :  :       .: .:.
CCDS59 FFLDITSPPSPQLLRLLSTLAEEPREQQELEALS----QDPRRYEEWKWFRCPTLLEVLE
              870       880       890           900       910      

         440       450       460       470       480         490   
pF1KB5 DCPSLRPPIDHLCELLPRLQARYYSIASSSKVHPNSVHICAVVVEYETKAGR--INKGVA
       . ::.  :   :   :: :: ::::..:. ..::. .:. ..:. :.:. :   .. :: 
CCDS59 QFPSVALPAPLLLTQLPLLQPRYYSVSSAPSTHPGEIHLTVAVLAYRTQDGLGPLHYGVC
        920       930       940       950       960       970      

           500       510        520       530       540       550  
pF1KB5 TNWLRAKEPAGENGGRALVPMFVRKS-QFRLPFKATTPVIMVGPGTGVAPFIGFIQERAW
       ..::   .: :.      :: :.: . .::::   . : :.::::::.::: :: :::  
CCDS59 STWLSQLKP-GDP-----VPCFIRGAPSFRLPPDPSLPCILVGPGTGIAPFRGFWQERLH
        980             990      1000      1010      1020      1030

             560       570       580       590       600        610
pF1KB5 -LRQQGKEVGETLLYYGCRRSDEDYLYREELAQFHRDGALTQLNVAFSREQSH-KVYVQH
        ....: .     : .::: :. :.:::.:. . .. :.. .. .::::: .. :.::: 
CCDS59 DIESKGLQPTPMTLVFGCRCSQLDHLYRDEVQNAQQRGVFGRVLTAFSREPDNPKTYVQD
             1040      1050      1060      1070      1080      1090

                 620       630       640       650       660       
pF1KB5 LLKQD---REHLWKLIEGGAHIYVCGDARNMARDVQNTFYDIVAELGAMEHAQAVDYIKK
       .:. .   . :    .: : :..::::. .:: .: .:   :.:  : ::  .: : :  
CCDS59 ILRTELAAEVHRVLCLERG-HMFVCGDV-TMATNVLQTVQRILATEGDMELDEAGDVIGV
             1100       1110       1120      1130      1140        

       670       680                                          
pF1KB5 LMTKGRYSLDVWS                                          
       :  . ::  :..                                           
CCDS59 LRDQQRYHEDIFGLTLRTQEVTSRIRTQSFSLQERQLRGAVPWAFDPPGSDTNSP
     1150      1160      1170      1180      1190      1200   

>>CCDS41842.1 NOS1 gene_id:4842|Hs108|chr12               (1434 aa)
 initn: 707 init1: 212 opt: 661  Z-score: 826.4  bits: 164.4 E(32554): 1e-39
Smith-Waterman score: 867; 31.5% identity (58.3% similar) in 666 aa overlap (85-679:762-1400)

           60        70        80        90       100        110   
pF1KB5 PEFTKIQTLTSSVRESSFVEKMKKTGRNIIVFYGSQTGTAEEFANRLSKD-AHRYGMRGM
                                     ..:...:: .. .:. : .   : .  . :
CCDS41 RAIGFKKLAEAVKFSAKLMGQAMAKRVKATILYATETGKSQAYAKTLCEIFKHAFDAKVM
             740       750       760       770       780       790 

           120       130       140       150                       
pF1KB5 SADPEEYDLADLSSLPEIDNALVVFCMATYGEGDPTDNAQDF------------------
       :   ::::.. :       ..::.   .:.:.::: .:.. :                  
CCDS41 SM--EEYDIVHLEH-----ETLVLVVTSTFGNGDPPENGEKFGCALMEMRHPNSVQEERK
               800            810       820       830       840    

                    160                    170       180       190 
pF1KB5 -----------YDWLQETDVD-------------LSGVKFAVFGLGNKTYEHFNAMGKYV
                  :.  :... :             :..:.:.:::::...: :: :.:. :
CCDS41 SYKVRFNSVSSYSDSQKSSGDGPDLRDNFESAGPLANVRFSVFGLGSRAYPHFCAFGHAV
          850       860       870       880       890       900    

             200       210       220       230       240       250 
pF1KB5 DKRLEQLGAQRIFELGLGDDDGNLEEDFITWREQFWPAVCEHFGVEATGEESSIRQYELV
       :  ::.::..::...  ::.  . :: : :: .. . :.:. : :   :.. .:   : .
CCDS41 DTLLEELGGERILKMREGDELCGQEEAFRTWAKKVFKAACDVFCV---GDDVNI---EKA
          910       920       930       940          950           

             260       270       280             290         300   
pF1KB5 VHTDIDAAKVYMGEMGRLKSYENQKPPFDA------KNPFLAAVTTNRKLNQG--TERHL
        .. :.  . .  .  :: ..  . : .        :.   ::   .:.  :.  . :  
CCDS41 NNSLISNDRSWKRNKFRL-TFVAEAPELTQGLSNVHKKRVSAARLLSRQNLQSPKSSRST
      960       970        980       990      1000      1010       

           310        320       330       340         350          
pF1KB5 MHLELDISDSK-IRYESGDHVAVYPANDSALVNQLGKIL--GADLDVVMSLNNLDEE---
       . ..:  . :. ..:. :::..:.:.:   ::: : . :  .  .. ..... :.:.   
CCDS41 IFVRLHTNGSQELQYQPGDHLGVFPGNHEDLVNALIERLEDAPPVNQMVKVELLEERNTA
      1020      1030      1040      1050      1060      1070       

           360          370       380       390       400       410
pF1KB5 ----SNKKHPF---PCPTSYRTALTYYLDITNPPRTNVLYELAQYASEPSEQELLRKMAS
           ::    .   :: : .. :. ::::::.::    : ..:. :.  ::.:  : .. 
CCDS41 LGVISNWTDELRLPPC-TIFQ-AFKYYLDITTPPTPLQLQQFASLAT--SEKEKQRLLVL
      1080      1090        1100      1110      1120        1130   

              420       430       440       450       460       470
pF1KB5 SSGEGKELYLSWVVEARRHILAILQDCPSLRPPIDHLCELLPRLQARYYSIASSSKVHPN
       :  .: . :  :       :. .:.. ::.. :   :   :  :: :::::.::  ..:.
CCDS41 S--KGLQEYEEWKWGKNPTIVEVLEEFPSIQMPATLLLTQLSLLQPRYYSISSSPDMYPD
            1140      1150      1160      1170      1180      1190 

              480         490       500       510        520       
pF1KB5 SVHICAVVVEYETKAGR--INKGVATNWLRAKEPAGENGGRALVPMFVRKS-QFRLPFKA
        ::. ...: :.:. :.  :..:: ..::  .  : :     ::: ::: . .:.:: . 
CCDS41 EVHLTVAIVSYRTRDGEGPIHHGVCSSWLN-RIQADE-----LVPCFVRGAPSFHLPRNP
            1200      1210      1220            1230      1240     

       530       540       550        560       570       580      
pF1KB5 TTPVIMVGPGTGVAPFIGFIQERAW-LRQQGKEVGETLLYYGCRRSDEDYLYREELAQFH
        .: :.::::::.::: .: :.: . ....: .    .: .:::.:  :..::::  : .
CCDS41 QVPCILVGPGTGIAPFRSFWQQRQFDIQHKGMNPCPMVLVFGCRQSKIDHIYREETLQAK
        1250      1260      1270      1280      1290      1300     

        590       600        610        620        630       640   
pF1KB5 RDGALTQLNVAFSREQSH-KVYVQHLLK-QDREHLWK-LIEGGAHIYVCGDARNMARDVQ
         :.. .: .:.::: .. : ::: .:. :  : ... : : :.:::::::. .:: :: 
CCDS41 NKGVFRELYTAYSREPDKPKKYVQDILQEQLAESVYRALKEQGGHIYVCGDV-TMAADVL
        1310      1320      1330      1340      1350       1360    

           650       660       670       680                       
pF1KB5 NTFYDIVAELGAMEHAQAVDYIKKLMTKGRYSLDVWS                       
       ...  :... : .   .:  .:...   .::  :..                        
CCDS41 KAIQRIMTQQGKLSAEDAGVFISRMRDDNRYHEDIFGVTLRTYEVTNRLRSESIAFIEES
         1370      1380      1390      1400      1410      1420    

CCDS41 KKDTDEVFSS
         1430    

>>CCDS55890.1 NOS1 gene_id:4842|Hs108|chr12               (1468 aa)
 initn: 707 init1: 212 opt: 661  Z-score: 826.2  bits: 164.4 E(32554): 1.1e-39
Smith-Waterman score: 850; 33.1% identity (60.6% similar) in 574 aa overlap (133-679:885-1434)

            110       120       130       140       150       160  
pF1KB5 KDAHRYGMRGMSADPEEYDLADLSSLPEIDNALVVFCMATYGEGDPTDNAQDFYDWLQET
                                     :..  .  .  . ::  :  ..:     :.
CCDS55 KGPPLPNGDTEVHGLAAARDSQHRSYKVRFNSVSSYSDSQKSSGDGPDLRDNF-----ES
          860       870       880       890       900              

            170       180       190       200       210       220  
pF1KB5 DVDLSGVKFAVFGLGNKTYEHFNAMGKYVDKRLEQLGAQRIFELGLGDDDGNLEEDFITW
          :..:.:.:::::...: :: :.:. ::  ::.::..::...  ::.  . :: : ::
CCDS55 AGPLANVRFSVFGLGSRAYPHFCAFGHAVDTLLEELGGERILKMREGDELCGQEEAFRTW
     910       920       930       940       950       960         

            230       240       250       260       270       280  
pF1KB5 REQFWPAVCEHFGVEATGEESSIRQYELVVHTDIDAAKVYMGEMGRLKSYENQKPPFDA-
        .. . :.:. : :   :.. .:   : . .. :.  . .  .  :: ..  . : .   
CCDS55 AKKVFKAACDVFCV---GDDVNI---EKANNSLISNDRSWKRNKFRL-TFVAEAPELTQG
     970       980             990      1000      1010       1020  

                  290         300       310        320       330   
pF1KB5 -----KNPFLAAVTTNRKLNQG--TERHLMHLELDISDSK-IRYESGDHVAVYPANDSAL
            :.   ::   .:.  :.  . :  . ..:  . :. ..:. :::..:.:.:   :
CCDS55 LSNVHKKRVSAARLLSRQNLQSPKSSRSTIFVRLHTNGSQELQYQPGDHLGVFPGNHEDL
           1030      1040      1050      1060      1070      1080  

           340         350              360         370       380  
pF1KB5 VNQLGKIL--GADLDVVMSLNNLDEE-------SNKKHPF--PCPTSYRTALTYYLDITN
       :: : . :  .  .. ..... :.:.       ::    .  : : .   :. ::::::.
CCDS55 VNALIERLEDAPPVNQMVKVELLEERNTALGVISNWTDELRLP-PCTIFQAFKYYLDITT
           1090      1100      1110      1120       1130      1140 

            390       400       410       420       430       440  
pF1KB5 PPRTNVLYELAQYASEPSEQELLRKMASSSGEGKELYLSWVVEARRHILAILQDCPSLRP
       ::    : ..:. :.  ::.:  : .. :  .: . :  :       :. .:.. ::.. 
CCDS55 PPTPLQLQQFASLAT--SEKEKQRLLVLS--KGLQEYEEWKWGKNPTIVEVLEEFPSIQM
            1150        1160        1170      1180      1190       

            450       460       470       480         490       500
pF1KB5 PIDHLCELLPRLQARYYSIASSSKVHPNSVHICAVVVEYETKAGR--INKGVATNWLRAK
       :   :   :  :: :::::.::  ..:. ::. ...: :.:. :.  :..:: ..::  .
CCDS55 PATLLLTQLSLLQPRYYSISSSPDMYPDEVHLTVAIVSYRTRDGEGPIHHGVCSSWLN-R
      1200      1210      1220      1230      1240      1250       

              510        520       530       540       550         
pF1KB5 EPAGENGGRALVPMFVRKS-QFRLPFKATTPVIMVGPGTGVAPFIGFIQERAW-LRQQGK
         : :     ::: ::: . .:.:: .  .: :.::::::.::: .: :.: . ....: 
CCDS55 IQADE-----LVPCFVRGAPSFHLPRNPQVPCILVGPGTGIAPFRSFWQQRQFDIQHKGM
       1260           1270      1280      1290      1300      1310 

      560       570       580       590       600        610       
pF1KB5 EVGETLLYYGCRRSDEDYLYREELAQFHRDGALTQLNVAFSREQSH-KVYVQHLLK-QDR
       .    .: .:::.:  :..::::  : .  :.. .: .:.::: .. : ::: .:. :  
CCDS55 NPCPMVLVFGCRQSKIDHIYREETLQAKNKGVFRELYTAYSREPDKPKKYVQDILQEQLA
            1320      1330      1340      1350      1360      1370 

        620        630       640       650       660       670     
pF1KB5 EHLWK-LIEGGAHIYVCGDARNMARDVQNTFYDIVAELGAMEHAQAVDYIKKLMTKGRYS
       : ... : : :.:::::::. .:: :: ...  :... : .   .:  .:...   .:: 
CCDS55 ESVYRALKEQGGHIYVCGDV-TMAADVLKAIQRIMTQQGKLSAEDAGVFISRMRDDNRYH
            1380      1390       1400      1410      1420      1430

         680                                 
pF1KB5 LDVWS                                 
        :..                                  
CCDS55 EDIFGVTLRTYEVTNRLRSESIAFIEESKKDTDEVFSS
             1440      1450      1460        

>>CCDS48062.1 NDOR1 gene_id:27158|Hs108|chr9              (590 aa)
 initn: 705 init1: 232 opt: 615  Z-score: 774.1  bits: 153.4 E(32554): 8.5e-37
Smith-Waterman score: 1007; 32.7% identity (63.2% similar) in 614 aa overlap (83-680:6-590)

             60        70        80        90       100         110
pF1KB5 EVPEFTKIQTLTSSVRESSFVEKMKKTGRNIIVFYGSQTGTAEEFANRLSKDAHRY--GM
                                     ..:..:::::::.. ..::...:.:   : 
CCDS48                          MPSPQLLVLFGSQTGTAQDVSERLGREARRRRLGC
                                        10        20        30     

              120       130       140       150       160          
pF1KB5 RGMSADPEEYDLADLSSLPEIDNALVVFCMATYGEGDPTDNAQDFYDWLQETDVD---LS
       : .. :   : ...:     :.. ::.:  :: :.::: :: ..:. .. . ..    : 
CCDS48 RVQALDS--YPVVNL-----INEPLVIFVCATTGQGDPPDNMKNFWRFIFRKNLPSTALC
          40               50        60        70        80        

       170       180       190       200       210       220       
pF1KB5 GVKFAVFGLGNKTYEHFNAMGKYVDKRLEQLGAQRIFELGLGDDDGNLEEDFIT--WREQ
        . :::.:::...: .:: ..: . .:: :::.. .. . ::::. .:  :  .  : ..
CCDS48 QMDFAVLGLGDSSYAKFNFVAKKLHRRLLQLGGSALLPVCLGDDQHELGPDAAVDPWLRD
       90       100       110       120       130       140        

         230           240        250       260       270       280
pF1KB5 FWPAVCEHF----GVEATGEESSI-RQYELVVHTDIDAAKVYMGEMGRLKSYENQKPPFD
       .:  :   .    :.        .  .. :.    .. :    .:  :.    .:.:: .
CCDS48 LWDRVLGLYPPPPGLTEIPPGVPLPSKFTLLF---LQEAPSTGSEGQRVAHPGSQEPPSE
      150       160       170       180          190       200     

              290       300        310       320       330         
pF1KB5 AKNPFLAAVTTNRKLNQGTERHLMHL-ELDISDSKIRYESGDHVAVYPANDSALVNQLGK
       .: :::: . .:....  .. . ..: :.::  : : . .:: : . :.:..: :... .
CCDS48 SK-PFLAPMISNQRVTGPSHFQDVRLIEFDILGSGISFAAGDVVLIQPSNSAAHVQRFCQ
          210       220       230       240       250       260    

     340       350       360       370       380       390         
pF1KB5 ILGADLDVVMSLNNLDEESNKKHPFPCPTSYRTALTYYLDITNPPRTNVLYELAQYASEP
       .:: : : .. :.  . . ..   .: : :.:  ...::::.. :: . .  ::  . . 
CCDS48 VLGLDPDQLFMLQPREPDVSSPTRLPQPCSMRHLVSHYLDIASVPRRSFFELLACLSLHE
          270       280       290       300       310       320    

     400       410       420       430       440         450       
pF1KB5 SEQELLRKMASSSGEGKELYLSWVVEARRHILAILQDCPSLRP--PIDHLCELLPRLQAR
        :.: :  .  ::..:.:  . .  . :: :: .: : :      : :.: .:.: .. :
CCDS48 LEREKL--LEFSSAQGQEELFEYCNRPRRTILEVLCDFPHTAAAIPPDYLLDLIPVIRPR
          330         340       350       360       370       380  

       460       470       480       490       500       510       
pF1KB5 YYSIASSSKVHPNSVHICAVVVEYETKAGRINKGVATNWLRAKEPAGENGGRALVPMFVR
        .:::::       . : ..::...:.  .  .:. ..:: . .: :.  : . ::..::
CCDS48 AFSIASS-------LLILVAVVQFQTRLKEPRRGLCSSWLASLDP-GQ--GPVRVPLWVR
                   390       400       410       420          430  

       520       530       540       550       560       570       
pF1KB5 KSQFRLPFKATTPVIMVGPGTGVAPFIGFIQERAWLRQQGKEVGETLLYYGCRRSDEDYL
        ... .:    ::::::::::::::: . ::::.   : :     ..:..:::  :.:. 
CCDS48 PGSLAFPETPDTPVIMVGPGTGVAPFRAAIQERVAQGQTG-----NFLFFGCRWRDQDFY
            440       450       460       470            480       

       580       590       600       610       620        630      
pF1KB5 YREELAQFHRDGALTQLNVAFSREQSHKVYVQHLLKQDREHLWKLIE-GGAHIYVCGDAR
       .. :  ....   :: :  :::::: .:::::: :..    .:.:..  ::..:. :.:.
CCDS48 WEAEWQELEKRDCLT-LIPAFSREQEQKVYVQHRLRELGSLVWELLDRQGAYFYLAGNAK
       490       500        510       520       530       540      

        640       650       660       670       680
pF1KB5 NMARDVQNTFYDIVAELGAMEHAQAVDYIKKLMTKGRYSLDVWS
       .:  ::......:  : :..   .:. :. .:.   :.. ..:.
CCDS48 SMPADVSEALMSIFQEEGGLCSPDAAAYLARLQQTRRFQTETWA
        550       560       570       580       590

>>CCDS48063.1 NDOR1 gene_id:27158|Hs108|chr9              (521 aa)
 initn: 780 init1: 311 opt: 607  Z-score: 764.8  bits: 151.5 E(32554): 2.8e-36
Smith-Waterman score: 907; 33.6% identity (61.4% similar) in 560 aa overlap (83-632:6-514)

             60        70        80        90       100         110
pF1KB5 EVPEFTKIQTLTSSVRESSFVEKMKKTGRNIIVFYGSQTGTAEEFANRLSKDAHRY--GM
                                     ..:..:::::::.. ..::...:.:   : 
CCDS48                          MPSPQLLVLFGSQTGTAQDVSERLGREARRRRLGC
                                        10        20        30     

              120       130       140       150       160          
pF1KB5 RGMSADPEEYDLADLSSLPEIDNALVVFCMATYGEGDPTDNAQDFYDWLQETDVD---LS
       : .. :   : ...:     :.. ::.:  :: :.::: :: ..:. .. . ..    : 
CCDS48 RVQALD--SYPVVNL-----INEPLVIFVCATTGQGDPPDNMKNFWRFIFRKNLPSTALC
          40               50        60        70        80        

       170       180       190       200       210         220     
pF1KB5 GVKFAVFGLGNKTYEHFNAMGKYVDKRLEQLGAQRIFELGLGDDDGNL--EEDFITWREQ
        . :::.:::...: .:: ..: . .:: :::.. .. . ::::. .:     :     :
CCDS48 QMDFAVLGLGDSSYAKFNFVAKKLHRRLLQLGGSALLPVCLGDDQHELGLPSKFTLLFLQ
       90       100       110       120       130       140        

         230       240       250       260       270       280     
pF1KB5 FWPAVCEHFGVEATGEESSIRQYELVVHTDIDAAKVYMGEMGRLKSYENQKPPFDAKNPF
         :.         :: :.     . :.:                    .:.:: ..: ::
CCDS48 EAPS---------TGSEG-----QRVAHPG------------------SQEPPSESK-PF
      150                     160                         170      

         290       300        310       320       330       340    
pF1KB5 LAAVTTNRKLNQGTERHLMHL-ELDISDSKIRYESGDHVAVYPANDSALVNQLGKILGAD
       :: . .:....  .. . ..: :.::  : : . .:: : . :.:..: :... ..:: :
CCDS48 LAPMISNQRVTGPSHFQDVRLIEFDILGSGISFAAGDVVLIQPSNSAAHVQRFCQVLGLD
         180       190       200       210       220       230     

          350       360       370       380       390       400    
pF1KB5 LDVVMSLNNLDEESNKKHPFPCPTSYRTALTYYLDITNPPRTNVLYELAQYASEPSEQEL
        : .. :.  . . ..   .: : :.:  ...::::.. :: . .  ::  . .  :.: 
CCDS48 PDQLFMLQPREPDVSSPTRLPQPCSMRHLVSHYLDIASVPRRSFFELLACLSLHELEREK
         240       250       260       270       280       290     

          410       420       430       440         450       460  
pF1KB5 LRKMASSSGEGKELYLSWVVEARRHILAILQDCPSLRP--PIDHLCELLPRLQARYYSIA
       :  .  ::..:.:  . .  . :: :: .: : :      : :.: .:.: .. : .:::
CCDS48 L--LEFSSAQGQEELFEYCNRPRRTILEVLCDFPHTAAAIPPDYLLDLIPVIRPRAFSIA
           300       310       320       330       340       350   

            470       480       490       500       510       520  
pF1KB5 SSSKVHPNSVHICAVVVEYETKAGRINKGVATNWLRAKEPAGENGGRALVPMFVRKSQFR
       ::  .::. ..: ..::...:.  .  .:. ..:: . .: :.  : . ::..:: ... 
CCDS48 SSLLTHPSRLQILVAVVQFQTRLKEPRRGLCSSWLASLDP-GQ--GPVRVPLWVRPGSLA
           360       370       380       390          400       410

            530       540       550       560       570       580  
pF1KB5 LPFKATTPVIMVGPGTGVAPFIGFIQERAWLRQQGKEVGETLLYYGCRRSDEDYLYREEL
       .:    ::::::::::::::: . ::::.   : :.     .:..:::  :.:. .. : 
CCDS48 FPETPDTPVIMVGPGTGVAPFRAAIQERVAQGQTGN-----FLFFGCRWRDQDFYWEAEW
              420       430       440            450       460     

            590       600       610       620       630       640  
pF1KB5 AQFHRDGALTQLNVAFSREQSHKVYVQHLLKQDREHLWKLIEGGAHIYVCGDARNMARDV
        ....   :: :  :::::: .:::::: :..    .:.:..  :    :          
CCDS48 QELEKRDCLT-LIPAFSREQEQKVYVQHRLRELGSLVWELLDRQATPSPCQRTSRKP   
         470        480       490       500       510       520    

            650       660       670       680
pF1KB5 QNTFYDIVAELGAMEHAQAVDYIKKLMTKGRYSLDVWS

>>CCDS5538.1 TYW1 gene_id:55253|Hs108|chr7                (732 aa)
 initn: 300 init1: 168 opt: 312  Z-score: 388.3  bits: 82.4 E(32554): 2.6e-15
Smith-Waterman score: 345; 40.9% identity (64.8% similar) in 159 aa overlap (83-226:79-236)

             60        70        80        90       100       110  
pF1KB5 EVPEFTKIQTLTSSVRESSFVEKMKKTGRNIIVFYGSQTGTAEEFANRLSKDAHRYGMRG
                                     . .:::::::::. ::. :.. .    .  
CCDS55 LQEKSVPKAAQDLMTNGYVSLQEKDIFVSGVKIFYGSQTGTAKGFATVLAEAVTSLDLPV
       50        60        70        80        90       100        

            120       130        140       150       160           
pF1KB5 MSADPEEYDLADLSSLPEIDNALV-VFCMATYGEGDPTDNAQDFYDWLQETDVD------
          . .:::  :   . :. .  : :: .::: .: ::..:. :  ::.:...:      
CCDS55 AIINLKEYD-PDDHLIEEVTSKNVCVFLVATYTDGLPTESAEWFCKWLEEASIDFRFGKT
      110        120       130       140       150       160       

          170       180        190       200       210             
pF1KB5 -LSGVKFAVFGLGNKTYE-HFNAMGKYVDKRLEQLGAQRIFELGLGDDD------GNLEE
        :.:...:::::::..:  ::: .:: ::: : .:::.:..  : :: :      :..: 
CCDS55 YLKGMRYAVFGLGNSAYASHFNKVGKNVDKWLWMLGAHRVMSRGEGDCDVVKSKHGSIEA
       170       180       190       200       210       220       

       220       230       240       250       260       270       
pF1KB5 DFITWREQFWPAVCEHFGVEATGEESSIRQYELVVHTDIDAAKVYMGEMGRLKSYENQKP
       :: .:. .:                                                   
CCDS55 DFRAWKTKFISQLQALQKGERKKSCGGHCKKGKCESHQHGSEEREEGSHEQDELHHRDTE
       230       240       250       260       270       280       




680 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
 Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
 start: Mon May 22 10:35:41 2017 done: Mon May 22 10:35:42 2017
 Total Scan time:  3.560 Total Display time:  0.180

Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
Inquiries or Suggestions ?
Send a message to flexiclone AT kazusagt.com