Result of FASTA (omim) for
pFN21AA1849
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA1849, 1073 aa
1>>>pF1KA1849 1073 - 1073 aa - 1073 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 11.8391+/-0.000464; mu= -9.1193+/- 0.029
mean_var=388.1211+/-82.176, 0's: 0 Z-trim(121.5): 78 B-trim: 1560 in 2/54
Lambda= 0.065101
statistics sampled from 38090 (38219) to 38090 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.76), E-opt: 0.2 (0.448), width: 16
Scan time: 18.170
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_060529 (OMIM: 611491) ras-associating and dilut (1075) 7115 683.5 1.8e-195
NP_060275 (OMIM: 609623) ras-interacting protein 1 ( 963) 1266 134.1 3.8e-30
XP_016882403 (OMIM: 609623) PREDICTED: ras-interac (1064) 1266 134.1 4.1e-30
XP_011525355 (OMIM: 609623) PREDICTED: ras-interac (1074) 1151 123.3 7.4e-27
XP_011525356 (OMIM: 609623) PREDICTED: ras-interac (1059) 1148 123.0 8.9e-27
XP_016882404 (OMIM: 609623) PREDICTED: ras-interac ( 966) 645 75.8 1.4e-12
XP_011525357 (OMIM: 609623) PREDICTED: ras-interac ( 976) 530 65.0 2.5e-09
XP_016879383 (OMIM: 606553) PREDICTED: Na(+)/H(+) ( 372) 286 41.7 0.0093
>>NP_060529 (OMIM: 611491) ras-associating and dilute do (1075 aa)
initn: 7126 init1: 5430 opt: 7115 Z-score: 3630.5 bits: 683.5 E(85289): 1.8e-195
Smith-Waterman score: 7115; 98.3% identity (98.7% similar) in 1075 aa overlap (1-1073:1-1075)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MFYGTHFIMSPPTKSKLKRQSQLLSSMLSRTLSYKYRDLDSTFSSLGASDDPAELSTQLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_060 MFYGTHFIMSPPTKSKLKRQSQLLSSMLSRTLSYKYRDLDSTFSSLGASDDPAELSTQLS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 APGVLKVFGDSVCTGTHYKSVLATGTSSARELVKEALERYALDPRQAGQYVLCDVVGQAG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_060 APGVLKVFGDSVCTGTHYKSVLATGTSSARELVKEALERYALDPRQAGQYVLCDVVGQAG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 DAGQRWQARCFRVFGDSEKPLLIQELWKPREGLSRRFELRKRSDVEELAAKEVDTITAGI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_060 DAGQRWQARCFRVFGDSEKPLLIQELWKPREGLSRRFELRKRSDVEELAAKEVDTITAGI
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 NAQARRLQRSRAKGTPTPALGDARSSPPPRLRRTVSETSLSPVNALPAAAQGPEEPGPNA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:
NP_060 NAQARRLQRSRAKGTPTPALGDARSSPPPRLRRTVSETSLSPVNALPAAAQGPEEPGPDA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290
pF1KA1 MRYSLYQSPHLLLLQGYSQQHPG-VCAQPGPAHG-GPADPSSKPSISLSAPDILPLHCTI
::::::::::::::::::::: . : . : : :::::::::::::::::::::
NP_060 MRYSLYQSPHLLLLQGYSQQHDSLVYVLNRDRHTVGQRTPSSKPSISLSAPDILPLHCTI
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KA1 RRQPLPDSGQAAGRLVLEPIPGAHISVNFSEVGHRTVVLHHGDLLSLGLYYLLLFKDPAQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_060 RRQPLPDSGQAAGRLVLEPIPGAHISVNFSEVGHRTVVLHHGDLLSLGLYYLLLFKDPAQ
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KA1 AQPLPARALARLRAVPQSCRLCGAALGARGAASPTQAALPRRQQLLLEFEPDLEDTLLQR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::
NP_060 AQPLPARALARLRAVPQSCRLCGAALGARGAASPTQAALPRRQQLLLEFEPHLEDTLLQR
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450 460 470
pF1KA1 IMTLIEPGGDDHKLTPAFLLCLCIQHSATHFQPGTFGQLLLKIARLIRETVWEKTKELAE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_060 IMTLIEPGGDDHKLTPAFLLCLCIQHSATHFQPGTFGQLLLKIARLIRETVWEKTKELAE
430 440 450 460 470 480
480 490 500 510 520 530
pF1KA1 KQAQLQEPISLASCAMADLVPDLQPILFWMSNSIELLYFIQQKCPLYMQSMEEQLDITGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_060 KQAQLQEPISLASCAMADLVPDLQPILFWMSNSIELLYFIQQKCPLYMQSMEEQLDITGS
490 500 510 520 530 540
540 550 560 570 580 590
pF1KA1 KESLFSCTLTASEEAMAVLEEVVLYAFQQCVYYVSKSLYICLPALLECPPFQTERRESWS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_060 KESLFSCTLTASEEAMAVLEEVVLYAFQQCVYYVSKSLYICLPALLECPPFQTERRESWS
550 560 570 580 590 600
600 610 620 630 640 650
pF1KA1 SAPELPEELRRVVSVYQAALDLLRQLQVHPEVASQMLAYLFFFSGTLLLNQLLDRGPSLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_060 SAPELPEELRRVVSVYQAALDLLRQLQVHPEVASQMLAYLFFFSGTLLLNQLLDRGPSLS
610 620 630 640 650 660
660 670 680 690 700 710
pF1KA1 CFHWPRGVQACARLQQLLEWMRSAGFGAAGEHFFQKLSCTLNLLATPRAQLIQMSWTALR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_060 CFHWPRGVQACARLQQLLEWMRSAGFGAAGEHFFQKLSCTLNLLATPRAQLIQMSWTALR
670 680 690 700 710 720
720 730 740 750 760 770
pF1KA1 AAFPALSPAQLHRLLTHYQLASAMGPMSTWEPGAQDSPEAFRSEDVLESYENPPPIVLPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_060 AAFPALSPAQLHRLLTHYQLASAMGPMSTWEPGAQDSPEAFRSEDVLESYENPPPIVLPS
730 740 750 760 770 780
780 790 800 810 820 830
pF1KA1 DGFQVDLEANCLDDSIYQHLLYVRHFLWGLRSRASPGSPGRPGSGASQPVCPEGMHHVVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_060 DGFQVDLEANCLDDSIYQHLLYVRHFLWGLRSRASPGSPGRPGSGASQPVCPEGMHHVVL
790 800 810 820 830 840
840 850 860 870 880 890
pF1KA1 DGHLEAPSCPLAPRDPGPAAREVAPERTLPLRGAPWAQAPPGRQPGRGGSQAGPPHTDSS
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::
NP_060 DGHLEAPSCPLAPRDPGPAAREVAPERTLPLRGAPWAQAPPGRQPSRGGSQAGPPHTDSS
850 860 870 880 890 900
900 910 920 930 940 950
pF1KA1 CLLTPPSTPLGPEPGDPDWPESGGPCGKALPERQRNGLSGLRGAAPEGDSAALAEESPPA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_060 CLLTPPSTPLGPEPGDPDWPESGGPCGKALPERQRNGLSGLRGAAPEGDSAALAEESPPA
910 920 930 940 950 960
960 970 980 990 1000 1010
pF1KA1 PSSRSSSTEDFCYVFTVELERGPSGLGMGLIDGMHTHLGAPGLYIQTLLPGSPAAADGRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_060 PSSRSSSTEDFCYVFTVELERGPSGLGMGLIDGMHTHLGAPGLYIQTLLPGSPAAADGRL
970 980 990 1000 1010 1020
1020 1030 1040 1050 1060 1070
pF1KA1 SLGDRILEVNGSSLLGLGYLRAVDLIRHGGKKMRFLVAKSDVETAKKIHFRTPPL
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_060 SLGDRILEVNGSSLLGLGYLRAVDLIRHGGKKMRFLVAKSDVETAKKIHFRTPPL
1030 1040 1050 1060 1070
>>NP_060275 (OMIM: 609623) ras-interacting protein 1 [Ho (963 aa)
initn: 1497 init1: 493 opt: 1266 Z-score: 662.2 bits: 134.1 E(85289): 3.8e-30
Smith-Waterman score: 1651; 37.1% identity (63.3% similar) in 856 aa overlap (47-827:130-963)
20 30 40 50 60 70
pF1KA1 LKRQSQLLSSMLSRTLSYKYRDLDSTFSSLGASDDPAELSTQLSAPGVLKVFGDSVCTGT
:.. .: . . :::::.:: .. .:.
NP_060 TTGSSGAGGPGTPGGAQRWASEKKLPELAAGVAPEPPLATRATAPPGVLKIFGAGLASGA
100 110 120 130 140 150
80 90 100 110 120
pF1KA1 HYKSVLATGTSSARELVKEALERYALDPRQAG---------QYVLCDVVGQAGDAG---Q
.:::::::. :.::::: ::::::.: .: ..:::..:. . ::
NP_060 NYKSVLATARSTARELVAEALERYGLAGSPGGGPGESSCVDAFALCDALGRPAAAGVGSG
160 170 180 190 200 210
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 RWQARCFRVFGDSEKPLLIQELWKPREGLSRRFELRKRSDVEELAAKEVDTI-TAGINAQ
.:.:. .::.::::.:::.::::. : : .:::::: : ....: . . . : .:
NP_060 EWRAEHLRVLGDSERPLLVQELWRARPGWARRFELRGREEARRLEQEAFGAADSEGTGAP
220 230 240 250 260 270
190 200 210 220
pF1KA1 ARRLQRSRAKG--------TPTPALGD---ARSSPPPR-----LRRTVSETSLS------
. : :..:... .: :. :. : :. : :::.::: ::.
NP_060 SWRPQKNRSRAASGGAALASPGPGTGSGAPAGSGGKERSENLSLRRSVSELSLQGRRRRQ
280 290 300 310 320 330
230 240 250
pF1KA1 ------PVNALPAAAQ---GPEEPGP-NAMRYSLYQSP----HLLLLQGYS---------
.. :.::. : .:: . . : :.: ..::::::.
NP_060 QERRQQALSMAPGAADAQIGTADPGDFDQLTQCLIQAPSNRPYFLLLQGYQDAQDFVVYV
340 350 360 370 380 390
260 270 280 290 300 310
pF1KA1 ---QQHPGVCAQPGPAHGGPADPSSKPSISLSAPDILPLHCTIRRQPLPDSGQAAGRLVL
.:: : .. : . : ..:. . :.:::::: :::.: : . ..
NP_060 MTREQH--VFGRGGNSSGRGGSPAPYVDTFLNAPDILPRHCTVRAGPEHPA-------MV
400 410 420 430 440 450
320 330 340 350 360 370
pF1KA1 EPIPGAHISVNFSEVGHRTVVLHHGDLLSLGLYYLLLFKDPAQAQPLPARAL---ARLRA
.: :: .. : . . : . :: ::::.:: ..:...::: . ::: :: :
NP_060 RPSRGAPVTHN-GCLLLREAELHPGDLLGLGEHFLFMYKDPRTGGSGPARPPWLPARPGA
460 470 480 490 500
380 390 400 410 420
pF1KA1 VPQ------SCRLCGAALGARGAASPTQAALPRRQQLLLEFEPDLEDTLLQRIMTLIEPG
.: :::::: .: :: : : : :. .: .:.: :..:: .:. :
NP_060 TPPGPGWAFSCRLCGRGLQERGEA--LAAYLDGREPVL-RFRPREEEALLGEIVRAAAAG
510 520 530 540 550 560
430 440 450 460 470 480
pF1KA1 -GDDHKLTPAFLLCLCIQHSATHFQPGTFGQLLLKIARLIRETVWEKTKELAEKQAQLQ-
:: : :: :: ::.:::: ... : . .:: ..::::.:.:::: ::....: . .
NP_060 SGDLPPLGPATLLALCVQHSARELELGHLPRLLGRLARLIKEAVWEKIKEIGDRQPENHP
570 580 590 600 610 620
490 500 510 520 530 540
pF1KA1 EPISLASCAMADLVPDLQPILFWMSNSIELLYFIQQKCPLYMQSMEEQLDITGSKESLFS
: . . . . .:.:...::.:. ::: :.:.: . ::.. : ... .
NP_060 EGVPEVPLTPEAVSVELRPLMLWMANTTELLSFVQEK----VLEMEKEAD---QEDPQLC
630 640 650 660 670
550 560 570 580 590 600
pF1KA1 CTLTASEEAMAVLEEVVLYAFQQCVYYVSKSLYICLPALLECPPFQTERRESWSSAPEL-
: .::::.:.::.. .::: :::..:.:: :::::. :: : : . . ::
NP_060 NDLELCDEAMALLDEVIMCTFQQSVYYLTKTLYSTLPALLDSNPF-TAGAELPGPGAELG
680 690 700 710 720 730
610 620 630 640 650 660
pF1KA1 --PEELRRVVSVYQAALDLLRQLQVHPEVASQMLAYLFFFSGTLLLNQLLDRGPSLSCFH
: :: ...:.::::.: : ..::...:: ..::::::.. :::.:..:: . ..
NP_060 AMPPGLRPTLGVFQAALELTSQCELHPDLVSQTFGYLFFFSNASLLNSLMERGQGRPFYQ
740 750 760 770 780 790
670 680 690 700 710 720
pF1KA1 WPRGVQACARLQQLLEWMRSAGFGAAGEHFFQKLSCTLNLLATPRAQLIQMSWTALRAAF
: :.:: . :. .:.:...::.: . .::.::: ..::: .::..:.. ::..::.
NP_060 WSRAVQIRTNLDLVLDWLQGAGLGDIATEFFRKLSMAVNLLCVPRTSLLKASWSSLRTDH
800 810 820 830 840 850
730 740 750 760 770 780
pF1KA1 PALSPAQLHRLLTHYQLASAMGPMSTWEPGAQDSPEAFRSEDVLESYENPPPIVLPSDGF
:.:.:::::.::.::::. . :: ..:.: . :: . :..::. . ::..:: .
NP_060 PTLTPAQLHHLLSHYQLGPGRGPPAAWDPPPAER-EAVDTGDIFESFSSHPPLILPLGSS
860 870 880 890 900 910
790 800 810 820 830 840
pF1KA1 QVDLEANCLDDSIYQHLLYVRHFLWGLRSRASPGSPGRPGSGASQPVCPEGMHHVVLDGH
.. : . ::.....: .:..:: :... :.. . :..:
NP_060 RLRLTGPVTDDALHRELRRLRRLLWDLEQQELPANYRHGPPVATSP
920 930 940 950 960
850 860 870 880 890 900
pF1KA1 LEAPSCPLAPRDPGPAAREVAPERTLPLRGAPWAQAPPGRQPGRGGSQAGPPHTDSSCLL
>>XP_016882403 (OMIM: 609623) PREDICTED: ras-interacting (1064 aa)
initn: 1497 init1: 493 opt: 1266 Z-score: 661.6 bits: 134.1 E(85289): 4.1e-30
Smith-Waterman score: 1651; 37.1% identity (63.3% similar) in 856 aa overlap (47-827:231-1064)
20 30 40 50 60 70
pF1KA1 LKRQSQLLSSMLSRTLSYKYRDLDSTFSSLGASDDPAELSTQLSAPGVLKVFGDSVCTGT
:.. .: . . :::::.:: .. .:.
XP_016 TTGSSGAGGPGTPGGAQRWASEKKLPELAAGVAPEPPLATRATAPPGVLKIFGAGLASGA
210 220 230 240 250 260
80 90 100 110 120
pF1KA1 HYKSVLATGTSSARELVKEALERYALDPRQAG---------QYVLCDVVGQAGDAG---Q
.:::::::. :.::::: ::::::.: .: ..:::..:. . ::
XP_016 NYKSVLATARSTARELVAEALERYGLAGSPGGGPGESSCVDAFALCDALGRPAAAGVGSG
270 280 290 300 310 320
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 RWQARCFRVFGDSEKPLLIQELWKPREGLSRRFELRKRSDVEELAAKEVDTI-TAGINAQ
.:.:. .::.::::.:::.::::. : : .:::::: : ....: . . . : .:
XP_016 EWRAEHLRVLGDSERPLLVQELWRARPGWARRFELRGREEARRLEQEAFGAADSEGTGAP
330 340 350 360 370 380
190 200 210 220
pF1KA1 ARRLQRSRAKG--------TPTPALGD---ARSSPPPR-----LRRTVSETSLS------
. : :..:... .: :. :. : :. : :::.::: ::.
XP_016 SWRPQKNRSRAASGGAALASPGPGTGSGAPAGSGGKERSENLSLRRSVSELSLQGRRRRQ
390 400 410 420 430 440
230 240 250
pF1KA1 ------PVNALPAAAQ---GPEEPGP-NAMRYSLYQSP----HLLLLQGYS---------
.. :.::. : .:: . . : :.: ..::::::.
XP_016 QERRQQALSMAPGAADAQIGTADPGDFDQLTQCLIQAPSNRPYFLLLQGYQDAQDFVVYV
450 460 470 480 490 500
260 270 280 290 300 310
pF1KA1 ---QQHPGVCAQPGPAHGGPADPSSKPSISLSAPDILPLHCTIRRQPLPDSGQAAGRLVL
.:: : .. : . : ..:. . :.:::::: :::.: : . ..
XP_016 MTREQH--VFGRGGNSSGRGGSPAPYVDTFLNAPDILPRHCTVRAGPEHPA-------MV
510 520 530 540 550
320 330 340 350 360 370
pF1KA1 EPIPGAHISVNFSEVGHRTVVLHHGDLLSLGLYYLLLFKDPAQAQPLPARAL---ARLRA
.: :: .. : . . : . :: ::::.:: ..:...::: . ::: :: :
XP_016 RPSRGAPVTHN-GCLLLREAELHPGDLLGLGEHFLFMYKDPRTGGSGPARPPWLPARPGA
560 570 580 590 600 610
380 390 400 410 420
pF1KA1 VPQ------SCRLCGAALGARGAASPTQAALPRRQQLLLEFEPDLEDTLLQRIMTLIEPG
.: :::::: .: :: : : : :. .: .:.: :..:: .:. :
XP_016 TPPGPGWAFSCRLCGRGLQERGEA--LAAYLDGREPVL-RFRPREEEALLGEIVRAAAAG
620 630 640 650 660
430 440 450 460 470 480
pF1KA1 -GDDHKLTPAFLLCLCIQHSATHFQPGTFGQLLLKIARLIRETVWEKTKELAEKQAQLQ-
:: : :: :: ::.:::: ... : . .:: ..::::.:.:::: ::....: . .
XP_016 SGDLPPLGPATLLALCVQHSARELELGHLPRLLGRLARLIKEAVWEKIKEIGDRQPENHP
670 680 690 700 710 720
490 500 510 520 530 540
pF1KA1 EPISLASCAMADLVPDLQPILFWMSNSIELLYFIQQKCPLYMQSMEEQLDITGSKESLFS
: . . . . .:.:...::.:. ::: :.:.: . ::.. : ... .
XP_016 EGVPEVPLTPEAVSVELRPLMLWMANTTELLSFVQEK----VLEMEKEAD---QEDPQLC
730 740 750 760 770 780
550 560 570 580 590 600
pF1KA1 CTLTASEEAMAVLEEVVLYAFQQCVYYVSKSLYICLPALLECPPFQTERRESWSSAPEL-
: .::::.:.::.. .::: :::..:.:: :::::. :: : : . . ::
XP_016 NDLELCDEAMALLDEVIMCTFQQSVYYLTKTLYSTLPALLDSNPF-TAGAELPGPGAELG
790 800 810 820 830
610 620 630 640 650 660
pF1KA1 --PEELRRVVSVYQAALDLLRQLQVHPEVASQMLAYLFFFSGTLLLNQLLDRGPSLSCFH
: :: ...:.::::.: : ..::...:: ..::::::.. :::.:..:: . ..
XP_016 AMPPGLRPTLGVFQAALELTSQCELHPDLVSQTFGYLFFFSNASLLNSLMERGQGRPFYQ
840 850 860 870 880 890
670 680 690 700 710 720
pF1KA1 WPRGVQACARLQQLLEWMRSAGFGAAGEHFFQKLSCTLNLLATPRAQLIQMSWTALRAAF
: :.:: . :. .:.:...::.: . .::.::: ..::: .::..:.. ::..::.
XP_016 WSRAVQIRTNLDLVLDWLQGAGLGDIATEFFRKLSMAVNLLCVPRTSLLKASWSSLRTDH
900 910 920 930 940 950
730 740 750 760 770 780
pF1KA1 PALSPAQLHRLLTHYQLASAMGPMSTWEPGAQDSPEAFRSEDVLESYENPPPIVLPSDGF
:.:.:::::.::.::::. . :: ..:.: . :: . :..::. . ::..:: .
XP_016 PTLTPAQLHHLLSHYQLGPGRGPPAAWDPPPAER-EAVDTGDIFESFSSHPPLILPLGSS
960 970 980 990 1000 1010
790 800 810 820 830 840
pF1KA1 QVDLEANCLDDSIYQHLLYVRHFLWGLRSRASPGSPGRPGSGASQPVCPEGMHHVVLDGH
.. : . ::.....: .:..:: :... :.. . :..:
XP_016 RLRLTGPVTDDALHRELRRLRRLLWDLEQQELPANYRHGPPVATSP
1020 1030 1040 1050 1060
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pF1KA1 LEAPSCPLAPRDPGPAAREVAPERTLPLRGAPWAQAPPGRQPGRGGSQAGPPHTDSSCLL
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