FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE4286, 1631 aa 1>>>pF1KE4286 1631 - 1631 aa - 1631 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.4830+/-0.00051; mu= 18.4308+/- 0.032 mean_var=107.7539+/-21.783, 0's: 0 Z-trim(110.3): 95 B-trim: 196 in 1/58 Lambda= 0.123554 statistics sampled from 18517 (18612) to 18517 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.555), E-opt: 0.2 (0.218), width: 16 Scan time: 18.470 The best scores are: opt bits E(85289) NP_003861 (OMIM: 603379) ras GTPase-activating-lik (1657) 5923 1068.3 0 NP_001272389 (OMIM: 605401) ras GTPase-activating- (1525) 3728 677.0 3.3e-193 XP_005248467 (OMIM: 605401) PREDICTED: ras GTPase- (1548) 3728 677.0 3.3e-193 NP_006624 (OMIM: 605401) ras GTPase-activating-lik (1575) 3728 677.0 3.4e-193 XP_005248471 (OMIM: 605401) PREDICTED: ras GTPase- (1128) 3273 595.8 6.7e-169 XP_011541410 (OMIM: 605401) PREDICTED: ras GTPase- (1128) 3273 595.8 6.7e-169 NP_001272391 (OMIM: 605401) ras GTPase-activating- (1071) 2828 516.5 4.9e-145 NP_001272390 (OMIM: 605401) ras GTPase-activating- (1071) 2828 516.5 4.9e-145 XP_016864449 (OMIM: 605401) PREDICTED: ras GTPase- (1518) 2828 516.6 6.4e-145 NP_001317706 (OMIM: 611714) GTPase-activating prot (1412) 179 44.4 0.0084 XP_005251961 (OMIM: 611714) PREDICTED: GTPase-acti (1433) 179 44.4 0.0085 NP_001317707 (OMIM: 611714) GTPase-activating prot (1433) 179 44.4 0.0085 XP_016870098 (OMIM: 611714) PREDICTED: GTPase-acti (1433) 179 44.4 0.0085 NP_001269610 (OMIM: 611714) GTPase-activating prot (1439) 179 44.4 0.0086 XP_016870097 (OMIM: 611714) PREDICTED: GTPase-acti (1439) 179 44.4 0.0086 XP_006717107 (OMIM: 611714) PREDICTED: GTPase-acti (1439) 179 44.4 0.0086 XP_016870095 (OMIM: 611714) PREDICTED: GTPase-acti (1439) 179 44.4 0.0086 XP_016870096 (OMIM: 611714) PREDICTED: GTPase-acti (1439) 179 44.4 0.0086 XP_016870094 (OMIM: 611714) PREDICTED: GTPase-acti (1460) 179 44.4 0.0087 XP_016870092 (OMIM: 611714) PREDICTED: GTPase-acti (1460) 179 44.4 0.0087 XP_005251958 (OMIM: 611714) PREDICTED: GTPase-acti (1460) 179 44.4 0.0087 XP_011516809 (OMIM: 611714) PREDICTED: GTPase-acti (1460) 179 44.4 0.0087 XP_016870090 (OMIM: 611714) PREDICTED: GTPase-acti (1460) 179 44.4 0.0087 NP_001269609 (OMIM: 611714) GTPase-activating prot (1460) 179 44.4 0.0087 XP_016870093 (OMIM: 611714) PREDICTED: GTPase-acti (1460) 179 44.4 0.0087 XP_016870091 (OMIM: 611714) PREDICTED: GTPase-acti (1460) 179 44.4 0.0087 XP_011516808 (OMIM: 611714) PREDICTED: GTPase-acti (1466) 179 44.4 0.0087 NP_001269608 (OMIM: 611714) GTPase-activating prot (1478) 179 44.4 0.0088 NP_056450 (OMIM: 611714) GTPase-activating protein (1487) 179 44.4 0.0088 XP_011516801 (OMIM: 611714) PREDICTED: GTPase-acti (1487) 179 44.4 0.0088 XP_011516802 (OMIM: 611714) PREDICTED: GTPase-acti (1487) 179 44.4 0.0088 XP_011516804 (OMIM: 611714) PREDICTED: GTPase-acti (1487) 179 44.4 0.0088 XP_016870089 (OMIM: 611714) PREDICTED: GTPase-acti (1487) 179 44.4 0.0088 >>NP_003861 (OMIM: 603379) ras GTPase-activating-like pr (1657 aa) initn: 4879 init1: 1813 opt: 5923 Z-score: 5703.7 bits: 1068.3 E(85289): 0 Smith-Waterman score: 6380; 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NP_003 ECGETYHSDLAEAKKKKLAVGDNNSKWVKHWVKGGYYYYHNLETQEGGWDEPPNFVQNSM 660 670 680 690 700 710 710 720 730 740 750 760 pF1KE4 HLTREEIQSAVTKVTAAYDRQQLWKANVGFVIQLQARLRGFLVRQKFAEHSHFLRTWLPA .:.::::::... :::::.:.::: :: :.. .:::: ::.::::.: . .::. .:: NP_003 QLSREEIQSSISGVTAAYNREQLWLANEGLITRLQARCRGYLVRQEFRSRMNFLKKQIPA 720 730 740 750 760 770 770 780 790 800 810 820 pF1KE4 VIKIQAHWRGYRQRKIYLEWLQYFKANLDAIIKIQAWARMWAARRQYLRRLHYFQKNVNS . ::..::::.:.: : . : :.... : ..:::. ::: ::..: ::.::. ..:. NP_003 ITCIQSQWRGYKQKKAYQDRLAYLRSHKDEVVKIQSLARMHQARKRYRDRLQYFRDHIND 780 790 800 810 820 830 830 840 850 860 870 880 pF1KE4 IVKIQAFFRARKAQDDYRILVHAPHPPLSVVRRFAHLLNQSQQDFLAEAELLKLQEEVVR :.:::::.:: ::.:::. :..: ::. :::.:.:::.::.::: : .:.:..:::. NP_003 IIKIQAFIRANKARDDYKTLINAEDPPMVVVRKFVHLLDQSDQDFQEELDLMKMREEVIT 840 850 860 870 880 890 890 900 910 920 930 940 pF1KE4 KIRSNQQLEQDLNIMDIKIGLLVKNRITLQEVVSHCKKLTKRNKEQLSDMMVLDKQKG-L ::::::::.:::.:::::::::::.::::.:::: :::::.:::::::::...:::: : NP_003 LIRSNQQLENDLNLMDIKIGLLVKNKITLQDVVSHSKKLTKKNKEQLSDMMMINKQKGGL 900 910 920 930 940 950 950 960 970 980 990 1000 pF1KE4 KSLSKEKRQKLEAYQHLFYLLQTQPIYLAKLIFQMPQNKTTKFMEAVIFSLYNYASSRRE :.::::::.::::::::::::::.: :::::::::::::.::::..:::.::::::..:: NP_003 KALSKEKREKLEAYQHLFYLLQTNPTYLAKLIFQMPQNKSTKFMDSVIFTLYNYASNQRE 960 970 980 990 1000 1010 1010 1020 1030 1040 1050 1060 pF1KE4 AYLLLQLFKTALQEEIKSKVEQPQDVVTGNPTVVRLVVRFYRNGRGQSALQEILGKVIQD ::::.::::::::::::::.: :..:::::::...:: : :..:::.::..::. :... NP_003 EYLLLRLFKTALQEEIKSKVDQIQEIVTGNPTVIKMVVSFNRGARGQNALRQILAPVVKE 1020 1030 1040 1050 1060 1070 1070 1080 1090 1100 1110 1120 pF1KE4 VLEDKVLSVHTDPVHLYKNWINQTEAQTGQRSHLPYDVTPEQALSHPEVQRRLDIALRNL ...:: :...:::: .::.:.:: :.:::. :.:::::::::::.: ::. ::: ..::. NP_003 IMDDKSLNIKTDPVDIYKSWVNQMESQTGEASKLPYDVTPEQALAHEEVKTRLDSSIRNM 1080 1090 1100 1110 1120 1130 1130 1140 1150 1160 1170 1180 pF1KE4 LAMTDKFLLAITSSVDQIPYGMRYVAKVLKATLAEKFPDATDSEVYKVVGNLLYYRFLNP :.::::: ::.::::.::::::..::::: .: :::::: ..:. :..:::::::..:: NP_003 RAVTDKFLSAIVSSVDKIPYGMRFIAKVLKDSLHEKFPDAGEDELLKIIGNLLYYRYMNP 1140 1150 1160 1170 1180 1190 1190 1200 1210 1220 1230 1240 pF1KE4 AVVAPDAFDIVAMAAGGALAAPQRHALGAVAQLLQHAAAGKAFSGQSQHLRVLNDYLEET :.::::::::. ..::: :.. ::. ::..:..:::::..: : :.. :: ..:.:: .. NP_003 AIVAPDAFDIIDLSAGGQLTTDQRRNLGSIAKMLQHAASNKMFLGDNAHLSIINEYLSQS 1200 1210 1220 1230 1240 1250 1250 1260 1270 1280 1290 1300 pF1KE4 HLKFRKFIHRACQVPEPEERFAVDEYSDMVAVAKPMVYITVGELVNTHRLLLEHQDCIAP . :::.:.. ::.::: ...: ::::::.:...::..::..::..::: :::.::: ::: NP_003 YQKFRRFFQTACDVPELQDKFNVDEYSDLVTLTKPVIYISIGEIINTHTLLLDHQDAIAP 1260 1270 1280 1290 1300 1310 1310 1320 1330 1340 1350 pF1KE4 DHQDPLHELLEDLGELPTIPDLIGES---IAADGHTDLSKLEVSLTLTNKFEGLEADADD .:.::.::::.::::.::: .::::: . .. :.: ::::::::::. . . NP_003 EHNDPIHELLDDLGEVPTIESLIGESSGNLNDPNKEALAKTEVSLTLTNKFDVPGDENAE 1320 1330 1340 1350 1360 1370 1360 1370 1380 1390 1400 1410 pF1KE4 SNTRSLLLSTKQLLADIIQFHPGDTLKEILSLSASREQEAAHKQLMSRRQACTAQTPEPL ..:..::.::.:..:.:.:.::.:: ::: :. :::: :.. :.:: :.::. . NP_003 MDARTILLNTKRLIVDVIRFQPGETLTEILETPATSEQEAEHQRAMQRRAIRDAKTPDKM 1380 1390 1400 1410 1420 1430 1420 1430 1440 1450 1460 1470 pF1KE4 RRHRSLTAHSLLPLAEKQRRVLRNLRRLEALGLVSARNGYQGLVDELAKDIRNQHRHRHR .. .:. : : : ::.... .:..: :: :. .: :: :....:.:::::.:.:.: NP_003 KKSKSVKEDSNLTLQEKKEKIQTGLKKLTELGTVDPKNKYQELINDIARDIRNQRRYRQR 1440 1450 1460 1470 1480 1490 1480 1490 1500 1510 1520 1530 pF1KE4 RKAELVKLQATLQGLSTKTTFYEEQGDYYSQYIRACLDHLAPDSKSS-------GKGKKQ ::::::::: : .:..:.::: :: :::..::..:::.:: .: : :: .:. NP_003 RKAELVKLQQTYAALNSKATFYGEQVDYYKSYIKTCLDNLASKGKVSKKPREMKGKKSKK 1500 1510 1520 1530 1540 1550 1540 1550 1560 1570 1580 1590 pF1KE4 PSLHYTAAQLLEKGVLVEIEDLPASHFRNVIFDITPGDEAGKFEVNAKFLGVDMERFQLH ::.::::.: :::::.::::: ...:.::::.:.: .:.: :::.:::.::.:: :.:: NP_003 ISLKYTAARLHEKGVLLEIEDLQVNQFKNVIFEISPTEEVGDFEVKAKFMGVQMETFMLH 1560 1570 1580 1590 1600 1610 1600 1610 1620 1630 pF1KE4 YQDLLQLQYEGVAVMKLFNKAKVNVNLLIFLLNKKFLRK ::::::::::::::::::..:::::::::::::::: : NP_003 YQDLLQLQYEGVAVMKLFDRAKVNVNLLIFLLNKKFYGK 1620 1630 1640 1650 >>NP_001272389 (OMIM: 605401) ras GTPase-activating-like (1525 aa) initn: 3786 init1: 1801 opt: 3728 Z-score: 3589.7 bits: 677.0 E(85289): 3.3e-193 Smith-Waterman score: 4932; 49.4% identity (75.7% similar) in 1613 aa overlap (44-1631:1-1525) 20 30 40 50 60 70 pF1KE4 ERLTAEEMDEQRRQNVAYQYLCRLEEAKRWMEACLKEELPSPVELEESLRNGVLLAKLGH ::.:: :::: .::::.::::: ::::.. NP_001 MEVCLVEELPPTTELEEGLRNGVYLAKLAK 10 20 30 80 90 100 110 120 130 pF1KE4 CFAPSVVPLKKIYDVEQLRYQATGLHFRHTDNINFWLSAIAHIGLPSTFFPETTDIYDKK :::..: :::::::: ::. .::::::::: :: :. ::::. :.:::::.::.: NP_001 FFAPKMVSEKKIYDVEQTRYKKSGLHFRHTDNTVQWLRAMESIGLPKIFYPETTDVYDRK 40 50 60 70 80 90 140 150 160 170 180 190 pF1KE4 NMPRVVYCIHALSLFLFRLGLAPQIHDLYGKVKFTAEELSNMASELAKYGLQLPAFSKIG :.::..::::::::.::.::.::::.:: ::: :: ::.::: .:: :::.:.:.::::: NP_001 NIPRMIYCIHALSLYLFKLGIAPQIQDLLGKVDFTEEEISNMRKELEKYGIQMPSFSKIG 100 110 120 130 140 150 200 210 220 230 240 250 pF1KE4 GILANELSVDEAAVHAAVLAINEAVERGVVEDTLAALQNPSALLENLREPLAAVYQEMLA :::::::::::::.::::.:::::::.:..:.:...:.::.:.: . . :: ::. : NP_001 GILANELSVDEAALHAAVIAINEAVEKGIAEQTVVTLRNPNAVLTLVDDNLAPEYQKELW 160 170 180 190 200 210 260 270 280 290 300 310 pF1KE4 QAKMEKAANARNHDD---RESQDIYDHYLTQAEIQGNINHVNAHGALEVVDDALERQSPE .:: .: ::: ... .: .: :.. :::::::::::.:: ..:.. .. .. :: NP_001 DAKKKKEENARLKNSCISEEERDAYEELLTQAEIQGNINKVNRQAAVDHINAVI----PE 220 230 240 250 260 320 330 340 350 360 370 pF1KE4 ALLKALQDPALALRGVRRDFADWYLEQLNSDREQKAQELGLVELLEKEEVQAGVAAANTK NP_001 ------------------------------------------------------------ 380 390 400 410 420 pF1KE4 GDQEQAMLHAVQRINKAIRRGVAADTVKELMCPEAQLPPVYPVASSMYQLELAVLQQQQ- :: :...: :... :::::: ::: :..::: :: ::.:. NP_001 GDPENTLL--------ALKK------------PEAQLPAVYPFAAAMYQNELFNLQKQNT 270 280 290 300 430 440 450 460 470 480 pF1KE4 -GELGQEELFVAVEMLSAVVLINRALEARDASGFWSSLVNPATGLAEVEGENAQRYFDAL . :..:::..::::::::.:.:.:::. : . ..: .:: :: ... ..:: ..: NP_001 MNYLAHEELLIAVEMLSAVALLNQALESNDLVSVQNQLRSPAIGLNNLDKAYVERYANTL 310 320 330 340 350 360 490 500 510 520 530 540 pF1KE4 LKLRQER-GMGEDFLSWNDLQATVSQVNAQTQEETDRVLAVSLINEALDKGSPEKTLSAL :... : ..:.: ::::..: ...:::: :::.:::.::. ::::.:.:.: .:: .: NP_001 LSVKLEVLSQGQDNLSWNEIQNCIDMVNAQIQEENDRVVAVGYINEAIDEGNPLRTLETL 370 380 390 400 410 420 550 560 570 580 590 600 pF1KE4 LLPAAGLDDVSLPVAPRYHLLLVAAKRQKAQVTGDPGAVLWLEEIRQGVVRANQDTNTAQ :::.:...::. : .:. .: :: :: . . . ::::.::.:.: :: : . :. NP_001 LLPTANISDVDPAHAQHYQDVLYHAKSQKLGDSESVSKVLWLDEIQQAVDDANVDEDRAK 430 440 450 460 470 480 610 620 630 640 650 660 pF1KE4 RMALGVAAINQAIKEGKAAQTERVLRNPAVALRGVVPDCANGYQRALESA--MAKKQCPA . . :. .:: .. :... ::.. . ..:.::. : :: .: . ... . NP_001 QWVTLVVDVNQCLEGKKSSDILSVLKSSTSNANDIIPECADKYYDALVKAKELKSERVSS 490 500 510 520 530 540 670 680 690 700 710 720 pF1KE4 DTAFWVQHDMKDGTAYYFHLQTFQGIWEQPPGCPLNTSHLTREEIQSAVTKVTAAYDRQQ : . :.. ... ::.. .. .. : : .: . : :: .::.. . .::..: :.. NP_001 DGS-WLKLNLHKKYDYYYNTDSKESSWVTPESCLYKESWLTGKEIEDIIEEVTVGYIREN 550 560 570 580 590 600 730 740 750 760 770 780 pF1KE4 LWKANVGFVIQLQARLRGFLVRQKFAEHSHFLRTWLPAVIKIQAHWRGYRQRKIYLEWLQ .:.:. .....:: : ..:..: .. ::. :.:::: :.::.::: :.. : NP_001 IWSASEELLLRFQATSSGPILREEFEARKSFLHEQEENVVKIQAFWKGYKQRKEYMHRRQ 610 620 630 640 650 660 790 800 810 820 830 840 pF1KE4 YFKANLDAIIKIQAWARMWAARRQYLRRLHYFQKNVNSIVKIQAFFRARKAQDDYRILVH : : :.:.:::.: :: .::..:: ::.::. . : :::::...:: ::.:::. :: NP_001 TFIDNTDSIVKIQSWFRMATARKSYLSRLQYFRDHNNEIVKIQSLLRANKARDDYKTLVG 670 680 690 700 710 720 850 860 870 880 890 900 pF1KE4 APHPPLSVVRRFAHLLNQSQQDFLAEAELLKLQEEVVRKIRSNQQLEQDLNIMDIKIGLL . .:::.:.:.:..::.::. :: : :. .:.:::: :::.:::::.:::.:::::::: NP_001 SENPPLTVIRKFVYLLDQSDLDFQEELEVARLREEVVTKIRANQQLEKDLNLMDIKIGLL 730 740 750 760 770 780 910 920 930 940 950 960 pF1KE4 VKNRITLQEVVSHCKKLTKRNKEQLSDMMVLDKQKGLKSLSKEKRQKLEAYQHLFYLLQT :::::::..:.:: :::.:.. .. . :.: :.::::::.:. ::.::.::::::: NP_001 VKNRITLEDVISHSKKLNKKKGGEMEILNNTDNQ-GIKSLSKERRKTLETYQQLFYLLQT 790 800 810 820 830 840 970 980 990 1000 1010 1020 pF1KE4 QPIYLAKLIFQMPQNKTTKFMEAVIFSLYNYASSRREAYLLLQLFKTALQEEIKSKVEQP .:.:::::::::::::.::::..:::.::::::..:: ::::.::::::.:::::::.: NP_001 NPLYLAKLIFQMPQNKSTKFMDTVIFTLYNYASNQREEYLLLKLFKTALEEEIKSKVDQV 850 860 870 880 890 900 1030 1040 1050 1060 1070 1080 pF1KE4 QDVVTGNPTVVRLVVRFYRNGRGQSALQEILGKVIQDVLEDKVLSVHTDPVHLYKNWINQ ::.:::::::...:: : :..:::..:...:. :......:: : ..:.::..:: :.:: NP_001 QDIVTGNPTVIKMVVSFNRGARGQNTLRQLLAPVVKEIIDDKSLIINTNPVEVYKAWVNQ 910 920 930 940 950 960 1090 1100 1110 1120 1130 1140 pF1KE4 TEAQTGQRSHLPYDVTPEQALSHPEVQRRLDIALRNLLAMTDKFLLAITSSVDQIPYGMR :.:::. :.:::::: ::::..:::. .:. ...:: .::: : .: ::.: .:::.: NP_001 LETQTGEASKLPYDVTTEQALTYPEVKNKLEASIENLRRVTDKVLNSIISSLDLLPYGLR 970 980 990 1000 1010 1020 1150 1160 1170 1180 1190 1200 pF1KE4 YVAKVLKATLAEKFPDATDSEVYKVVGNLLYYRFLNPAVVAPDAFDIVAMAAGGALAAPQ :.::::: .. :::::::..:. :.::::::::..:::.::::.:::. :.::: . . : NP_001 YIAKVLKNSIHEKFPDATEDELLKIVGNLLYYRYMNPAIVAPDGFDIIDMTAGGQINSDQ 1030 1040 1050 1060 1070 1080 1210 1220 1230 1240 1250 1260 pF1KE4 RHALGAVAQLLQHAAAGKAFSGQSQHLRVLNDYLEETHLKFRKFIHRACQVPEPEERFAV :. ::.::..:::::..: : :...:: .:.:: ::. .:::....::.::::::.: . NP_001 RRNLGSVAKVLQHAASNKLFEGENEHLSSMNNYLSETYQEFRKYFKEACNVPEPEEKFNM 1090 1100 1110 1120 1130 1140 1270 1280 1290 1300 1310 1320 pF1KE4 DEYSDMVAVAKPMVYITVGELVNTHRLLLEHQDCIAPDHQDPLHELLEDLGELPTIPDLI :.:.:.:.:.::..::.. :...:: ::::::: :::...: : ::: .:::.::. ... NP_001 DKYTDLVTVSKPVIYISIEEIISTHSLLLEHQDAIAPEKNDLLSELLGSLGEVPTVESFL 1150 1160 1170 1180 1190 1200 1330 1340 1350 1360 1370 pF1KE4 GESIA-------ADGHTDLSKLEVSLTLTNKFEGLEADADDSNTRSLLLSTKQLLADIIQ ::. . :. ..::: :.::.::.:.. ...: :: :::...::.:. :.:. NP_001 GEGAVDPNDPNKANTLSQLSKTEISLVLTSKYDIEDGEAIDS--RSLMIKTKKLIIDVIR 1210 1220 1230 1240 1250 1260 1380 1390 1400 1410 1420 1430 pF1KE4 FHPGDTLKEILSLSASREQEAAHKQLMSRRQACTAQTPEPLRRHRSLTAHSLLPLAEKQR .::.:: ::: :. .::. : : : ..::: ... .:. . ::: .:.: NP_001 NQPGNTLTEILETPATAQQEVDHATDMVSRAMIDSRTPEEMKHSQSMIEDAQLPLEQKKR 1270 1280 1290 1300 1310 1320 1440 1450 1460 1470 1480 1490 pF1KE4 RVLRNLRRLEALGLVSARNGYQGLVDELAKDIRNQHRHRHRRKAELVKLQATLQGLSTKT .. :::: :: : ::..: :: ...:.:::::::. .:. :::::.::: ::..:. :. NP_001 KIQRNLRTLEQTGHVSSENKYQDILNEIAKDIRNQRIYRKLRKAELAKLQQTLNALNKKA 1330 1340 1350 1360 1370 1380 1500 1510 1520 1530 1540 pF1KE4 TFYEEQGDYYSQYIRACLDHLA-PDSKSS----GKG-----KKQPSLHYTAAQLLEKGVL .::::: .::. ::..:::.: ... : ::: :. ..::::.: ::::: NP_001 AFYEEQINYYDTYIKTCLDNLKRKNTRRSIKLDGKGEPKGAKRAKPVKYTAAKLHEKGVL 1390 1400 1410 1420 1430 1440 1550 1560 1570 1580 1590 1600 pF1KE4 VEIEDLPASHFRNVIFDITPGDEAGKFEVNAKFLGVDMERFQLHYQDLLQLQYEGVAVMK ..:.:: ...:.:: ::: ...: :.: .:::::.::. ::. :::::.::::::::: NP_001 LDIDDLQTNQFKNVTFDIIATEDVGIFDVRSKFLGVEMEKVQLNIQDLLQMQYEGVAVMK 1450 1460 1470 1480 1490 1500 1610 1620 1630 pF1KE4 LFNKAKVNVNLLIFLLNKKFLRK .:.:.::::::::.:::::: : NP_001 MFDKVKVNVNLLIYLLNKKFYGK 1510 1520 >>XP_005248467 (OMIM: 605401) PREDICTED: ras GTPase-acti (1548 aa) initn: 3931 init1: 1801 opt: 3728 Z-score: 3589.6 bits: 677.0 E(85289): 3.3e-193 Smith-Waterman score: 5077; 49.9% identity (76.0% similar) in 1636 aa overlap (21-1631:1-1548) 10 20 30 40 50 60 pF1KE4 MERRAAGPGWAAYERLTAEEMDEQRRQNVAYQYLCRLEEAKRWMEACLKEELPSPVELEE :::.::::.::.:::.:::::::::.:: :::: .:::: XP_005 MDERRRQNIAYEYLCHLEEAKRWMEVCLVEELPPTTELEE 10 20 30 40 70 80 90 100 110 120 pF1KE4 SLRNGVLLAKLGHCFAPSVVPLKKIYDVEQLRYQATGLHFRHTDNINFWLSAIAHIGLPS .::::: ::::.. :::..: :::::::: ::. .::::::::: :: :. ::::. XP_005 GLRNGVYLAKLAKFFAPKMVSEKKIYDVEQTRYKKSGLHFRHTDNTVQWLRAMESIGLPK 50 60 70 80 90 100 130 140 150 160 170 180 pF1KE4 TFFPETTDIYDKKNMPRVVYCIHALSLFLFRLGLAPQIHDLYGKVKFTAEELSNMASELA :.:::::.::.::.::..::::::::.::.::.::::.:: ::: :: ::.::: .:: XP_005 IFYPETTDVYDRKNIPRMIYCIHALSLYLFKLGIAPQIQDLLGKVDFTEEEISNMRKELE 110 120 130 140 150 160 190 200 210 220 230 240 pF1KE4 KYGLQLPAFSKIGGILANELSVDEAAVHAAVLAINEAVERGVVEDTLAALQNPSALLENL :::.:.:.::::::::::::::::::.::::.:::::::.:..:.:...:.::.:.: . XP_005 KYGIQMPSFSKIGGILANELSVDEAALHAAVIAINEAVEKGIAEQTVVTLRNPNAVLTLV 170 180 190 200 210 220 250 260 270 280 290 pF1KE4 REPLAAVYQEMLAQAKMEKAANARNHDD---RESQDIYDHYLTQAEIQGNINHVNAHGAL . :: ::. : .:: .: ::: ... .: .: :.. :::::::::::.:: ..:. XP_005 DDNLAPEYQKELWDAKKKKEENARLKNSCISEEERDAYEELLTQAEIQGNINKVNRQAAV 230 240 250 260 270 280 300 310 320 330 340 350 pF1KE4 EVVDDALERQSPEALLKALQDPALALRGVRRDFADWYLEQLNSDREQKAQELGLVELLEK . .. .. :: XP_005 DHINAVI----PE----------------------------------------------- 360 370 380 390 400 410 pF1KE4 EEVQAGVAAANTKGDQEQAMLHAVQRINKAIRRGVAADTVKELMCPEAQLPPVYPVASSM :: :...: :... :::::: ::: :..: XP_005 -------------GDPENTLL--------ALKK------------PEAQLPAVYPFAAAM 290 300 310 420 430 440 450 460 470 pF1KE4 YQLELAVLQQQQ--GELGQEELFVAVEMLSAVVLINRALEARDASGFWSSLVNPATGLAE :: :: ::.:. . :..:::..::::::::.:.:.:::. : . ..: .:: :: . XP_005 YQNELFNLQKQNTMNYLAHEELLIAVEMLSAVALLNQALESNDLVSVQNQLRSPAIGLNN 320 330 340 350 360 370 480 490 500 510 520 530 pF1KE4 VEGENAQRYFDALLKLRQER-GMGEDFLSWNDLQATVSQVNAQTQEETDRVLAVSLINEA .. ..:: ..::... : ..:.: ::::..: ...:::: :::.:::.::. :::: XP_005 LDKAYVERYANTLLSVKLEVLSQGQDNLSWNEIQNCIDMVNAQIQEENDRVVAVGYINEA 380 390 400 410 420 430 540 550 560 570 580 590 pF1KE4 LDKGSPEKTLSALLLPAAGLDDVSLPVAPRYHLLLVAAKRQKAQVTGDPGAVLWLEEIRQ .:.:.: .:: .::::.:...::. : .:. .: :: :: . . . ::::.::.: XP_005 IDEGNPLRTLETLLLPTANISDVDPAHAQHYQDVLYHAKSQKLGDSESVSKVLWLDEIQQ 440 450 460 470 480 490 600 610 620 630 640 650 pF1KE4 GVVRANQDTNTAQRMALGVAAINQAIKEGKAAQTERVLRNPAVALRGVVPDCANGYQRAL .: :: : . :.. . :. .:: .. :... ::.. . ..:.::. : :: XP_005 AVDDANVDKDRAKQWVTLVVDVNQCLEGKKSSDILSVLKSSTSNANDIIPECADKYYDAL 500 510 520 530 540 550 660 670 680 690 700 710 pF1KE4 ESA--MAKKQCPADTAFWVQHDMKDGTAYYFHLQTFQGIWEQPPGCPLNTSHLTREEIQS .: . ... .: . :.. ... ::.. .. .. : : .: . : :: .::.. XP_005 VKAKELKSERVSSDGS-WLKLNLHKKYDYYYNTDSKESSWVTPESCLYKESWLTGKEIED 560 570 580 590 600 610 720 730 740 750 760 770 pF1KE4 AVTKVTAAYDRQQLWKANVGFVIQLQARLRGFLVRQKFAEHSHFLRTWLPAVIKIQAHWR . .::..: :...:.:. .....:: : ..:..: .. ::. :.:::: :. XP_005 IIEEVTVGYIRENIWSASEELLLRFQATSSGPILREEFEARKSFLHEQEENVVKIQAFWK 620 630 640 650 660 670 780 790 800 810 820 830 pF1KE4 GYRQRKIYLEWLQYFKANLDAIIKIQAWARMWAARRQYLRRLHYFQKNVNSIVKIQAFFR ::.::: :.. : : : :.:.:::.: :: .::..:: ::.::. . : :::::...: XP_005 GYKQRKEYMHRRQTFIDNTDSIVKIQSWFRMATARKSYLSRLQYFRDHNNEIVKIQSLLR 680 690 700 710 720 730 840 850 860 870 880 890 pF1KE4 ARKAQDDYRILVHAPHPPLSVVRRFAHLLNQSQQDFLAEAELLKLQEEVVRKIRSNQQLE : ::.:::. :: . .:::.:.:.:..::.::. :: : :. .:.:::: :::.::::: XP_005 ANKARDDYKTLVGSENPPLTVIRKFVYLLDQSDLDFQEELEVARLREEVVTKIRANQQLE 740 750 760 770 780 790 900 910 920 930 940 950 pF1KE4 QDLNIMDIKIGLLVKNRITLQEVVSHCKKLTKRNKEQLSDMMVLDKQKGLKSLSKEKRQK .:::.:::::::::::::::..:.:: :::.:.. .. . :.: :.::::::.:. XP_005 KDLNLMDIKIGLLVKNRITLEDVISHSKKLNKKKGGEMEILNNTDNQ-GIKSLSKERRKT 800 810 820 830 840 850 960 970 980 990 1000 1010 pF1KE4 LEAYQHLFYLLQTQPIYLAKLIFQMPQNKTTKFMEAVIFSLYNYASSRREAYLLLQLFKT ::.::.:::::::.:.:::::::::::::.::::..:::.::::::..:: ::::.:::: XP_005 LETYQQLFYLLQTNPLYLAKLIFQMPQNKSTKFMDTVIFTLYNYASNQREEYLLLKLFKT 860 870 880 890 900 910 1020 1030 1040 1050 1060 1070 pF1KE4 ALQEEIKSKVEQPQDVVTGNPTVVRLVVRFYRNGRGQSALQEILGKVIQDVLEDKVLSVH ::.:::::::.: ::.:::::::...:: : :..:::..:...:. :......:: : .. XP_005 ALEEEIKSKVDQVQDIVTGNPTVIKMVVSFNRGARGQNTLRQLLAPVVKEIIDDKSLIIN 920 930 940 950 960 970 1080 1090 1100 1110 1120 1130 pF1KE4 TDPVHLYKNWINQTEAQTGQRSHLPYDVTPEQALSHPEVQRRLDIALRNLLAMTDKFLLA :.::..:: :.:: :.:::. :.:::::: ::::..:::. .:. ...:: .::: : . XP_005 TNPVEVYKAWVNQLETQTGEASKLPYDVTTEQALTYPEVKNKLEASIENLRRVTDKVLNS 980 990 1000 1010 1020 1030 1140 1150 1160 1170 1180 1190 pF1KE4 ITSSVDQIPYGMRYVAKVLKATLAEKFPDATDSEVYKVVGNLLYYRFLNPAVVAPDAFDI : ::.: .:::.::.::::: .. :::::::..:. :.::::::::..:::.::::.::: XP_005 IISSLDLLPYGLRYIAKVLKNSIHEKFPDATEDELLKIVGNLLYYRYMNPAIVAPDGFDI 1040 1050 1060 1070 1080 1090 1200 1210 1220 1230 1240 1250 pF1KE4 VAMAAGGALAAPQRHALGAVAQLLQHAAAGKAFSGQSQHLRVLNDYLEETHLKFRKFIHR . :.::: . . ::. ::.::..:::::..: : :...:: .:.:: ::. .:::.... XP_005 IDMTAGGQINSDQRRNLGSVAKVLQHAASNKLFEGENEHLSSMNNYLSETYQEFRKYFKE 1100 1110 1120 1130 1140 1150 1260 1270 1280 1290 1300 1310 pF1KE4 ACQVPEPEERFAVDEYSDMVAVAKPMVYITVGELVNTHRLLLEHQDCIAPDHQDPLHELL ::.::::::.: .:.:.:.:.:.::..::.. :...:: ::::::: :::...: : ::: XP_005 ACNVPEPEEKFNMDKYTDLVTVSKPVIYISIEEIISTHSLLLEHQDAIAPEKNDLLSELL 1160 1170 1180 1190 1200 1210 1320 1330 1340 1350 1360 pF1KE4 EDLGELPTIPDLIGESIA-------ADGHTDLSKLEVSLTLTNKFEGLEADADDSNTRSL .:::.::. ...::. . :. ..::: :.::.::.:.. ...: :: ::: XP_005 GSLGEVPTVESFLGEGAVDPNDPNKANTLSQLSKTEISLVLTSKYDIEDGEAIDS--RSL 1220 1230 1240 1250 1260 1270 1370 1380 1390 1400 1410 1420 pF1KE4 LLSTKQLLADIIQFHPGDTLKEILSLSASREQEAAHKQLMSRRQACTAQTPEPLRRHRSL ...::.:. :.:. .::.:: ::: :. .::. : : : ..::: ... .:. XP_005 MIKTKKLIIDVIRNQPGNTLTEILETPATAQQEVDHATDMVSRAMIDSRTPEEMKHSQSM 1280 1290 1300 1310 1320 1330 1430 1440 1450 1460 1470 1480 pF1KE4 TAHSLLPLAEKQRRVLRNLRRLEALGLVSARNGYQGLVDELAKDIRNQHRHRHRRKAELV . ::: .:.:.. :::: :: : ::..: :: ...:.:::::::. .:. :::::. XP_005 IEDAQLPLEQKKRKIQRNLRTLEQTGHVSSENKYQDILNEIAKDIRNQRIYRKLRKAELA 1340 1350 1360 1370 1380 1390 1490 1500 1510 1520 1530 pF1KE4 KLQATLQGLSTKTTFYEEQGDYYSQYIRACLDHLAPDS-----KSSGKG-----KKQPSL ::: ::..:. :..::::: .::. ::..:::.: . : .::: :. . 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NP_006 PTTELEEGLRNGVYLAKLAKFFAPKMVSEKKIYDVEQTRYKKSGLHFRHTDNTVQWLRAM 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KE4 AHIGLPSTFFPETTDIYDKKNMPRVVYCIHALSLFLFRLGLAPQIHDLYGKVKFTAEELS ::::. :.:::::.::.::.::..::::::::.::.::.::::.:: ::: :: ::.: NP_006 ESIGLPKIFYPETTDVYDRKNIPRMIYCIHALSLYLFKLGIAPQIQDLLGKVDFTEEEIS 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 pF1KE4 NMASELAKYGLQLPAFSKIGGILANELSVDEAAVHAAVLAINEAVERGVVEDTLAALQNP :: .:: :::.:.:.::::::::::::::::::.::::.:::::::.:..:.:...:.:: NP_006 NMRKELEKYGIQMPSFSKIGGILANELSVDEAALHAAVIAINEAVEKGIAEQTVVTLRNP 190 200 210 220 230 240 240 250 260 270 280 290 pF1KE4 SALLENLREPLAAVYQEMLAQAKMEKAANARNHDD---RESQDIYDHYLTQAEIQGNINH .:.: . . :: ::. : .:: .: ::: ... .: .: :.. :::::::::::. 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