Result of FASTA (omim) for
pFN21AE4227
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE4227, 802 aa
1>>>pF1KE4227 802 - 802 aa - 802 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
64092750 residues in 91774 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.0464+/-0.000339; mu= 9.6519+/- 0.021
mean_var=211.0267+/-43.567, 0's: 0 Z-trim(121.1): 195 B-trim: 0 in 0/57
Lambda= 0.088289
statistics sampled from 38319 (38532) to 38319 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.747), E-opt: 0.2 (0.42), width: 16
Scan time: 6.870
The best scores are: opt bits E(91774)
NP_694945 (OMIM: 612496) rho guanine nucleotide ex ( 802) 5388 699.6 1.5e-200
XP_011539008 (OMIM: 612496) rho guanine nucleotide ( 802) 5388 699.6 1.5e-200
NP_005426 (OMIM: 600888) rho guanine nucleotide ex (1597) 1684 228.1 2.6e-58
NP_001107562 (OMIM: 605991) ephexin-1 isoform 2 [H ( 618) 1216 168.1 1.2e-40
NP_062824 (OMIM: 605991) ephexin-1 isoform 1 [Homo ( 710) 1216 168.1 1.3e-40
XP_011509225 (OMIM: 605991) ephexin-1 isoform X1 [ ( 710) 1216 168.1 1.3e-40
XP_011509227 (OMIM: 605991) ephexin-1 isoform X2 [ ( 433) 1070 149.3 3.6e-35
XP_011509226 (OMIM: 605991) ephexin-1 isoform X2 [ ( 433) 1070 149.3 3.6e-35
NP_776089 (OMIM: 608504) rho guanine nucleotide ex ( 841) 897 127.6 2.4e-28
NP_079290 (OMIM: 608504) rho guanine nucleotide ex ( 841) 897 127.6 2.4e-28
XP_016861649 (OMIM: 617552) rho guanine nucleotide ( 507) 659 97.0 2.3e-19
NP_001238892 (OMIM: 617552) rho guanine nucleotide ( 791) 659 97.2 3.1e-19
NP_001238891 (OMIM: 617552) rho guanine nucleotide ( 871) 659 97.3 3.4e-19
NP_056410 (OMIM: 617552) rho guanine nucleotide ex ( 871) 659 97.3 3.4e-19
XP_011522038 (OMIM: 608504) rho guanine nucleotide ( 792) 527 80.4 3.6e-14
XP_011522036 (OMIM: 608504) rho guanine nucleotide ( 856) 527 80.4 3.8e-14
XP_011522037 (OMIM: 608504) rho guanine nucleotide ( 856) 527 80.4 3.8e-14
XP_011510974 (OMIM: 617552) rho guanine nucleotide ( 841) 464 72.4 9.8e-12
XP_011522039 (OMIM: 608504) rho guanine nucleotide ( 439) 427 67.4 1.6e-10
XP_016883926 (OMIM: 602442) intersectin-1 isoform (1185) 314 53.5 7.1e-06
XP_016883925 (OMIM: 602442) intersectin-1 isoform (1608) 314 53.6 8.8e-06
XP_016883924 (OMIM: 602442) intersectin-1 isoform (1613) 314 53.6 8.8e-06
XP_016883923 (OMIM: 602442) intersectin-1 isoform (1645) 314 53.6 8.9e-06
XP_016883922 (OMIM: 602442) intersectin-1 isoform (1650) 314 53.6 8.9e-06
XP_016883919 (OMIM: 602442) intersectin-1 isoform (1679) 314 53.6 9e-06
XP_016883918 (OMIM: 602442) intersectin-1 isoform (1684) 314 53.6 9.1e-06
NP_001317939 (OMIM: 602442) intersectin-1 isoform (1716) 314 53.6 9.2e-06
XP_016883917 (OMIM: 602442) intersectin-1 isoform (1721) 314 53.6 9.2e-06
NP_003015 (OMIM: 602442) intersectin-1 isoform ITS (1721) 314 53.6 9.2e-06
XP_024308705 (OMIM: 604464) intersectin-2 isoform ( 929) 271 47.9 0.00026
XP_024308703 (OMIM: 604464) intersectin-2 isoform (1656) 271 48.1 0.0004
NP_001335111 (OMIM: 604464) intersectin-2 isoform (1657) 271 48.1 0.0004
NP_062541 (OMIM: 604464) intersectin-2 isoform 3 [ (1670) 271 48.1 0.0004
XP_024308702 (OMIM: 604464) intersectin-2 isoform (1670) 271 48.1 0.0004
NP_001335110 (OMIM: 604464) intersectin-2 isoform (1683) 271 48.1 0.0004
XP_024308700 (OMIM: 604464) intersectin-2 isoform (1683) 271 48.1 0.0004
XP_024308701 (OMIM: 604464) intersectin-2 isoform (1684) 271 48.1 0.0004
XP_024308699 (OMIM: 604464) intersectin-2 isoform (1697) 271 48.1 0.00041
NP_006268 (OMIM: 604464) intersectin-2 isoform 1 [ (1697) 271 48.1 0.00041
XP_024308698 (OMIM: 604464) intersectin-2 isoform (1697) 271 48.1 0.00041
NP_945328 (OMIM: 601855,618459) rho guanine nucleo ( 879) 265 47.1 0.00043
NP_004697 (OMIM: 601855,618459) rho guanine nucleo ( 912) 265 47.1 0.00044
NP_945353 (OMIM: 601855,618459) rho guanine nucleo ( 927) 265 47.1 0.00045
XP_011508491 (OMIM: 605708) rho guanine nucleotide ( 945) 249 45.1 0.0019
XP_005245690 (OMIM: 605708) rho guanine nucleotide (1141) 249 45.2 0.0021
XP_011508489 (OMIM: 605708) rho guanine nucleotide (1485) 249 45.3 0.0026
NP_055599 (OMIM: 605708) rho guanine nucleotide ex (1522) 249 45.3 0.0026
XP_016858412 (OMIM: 605708) rho guanine nucleotide (1523) 249 45.3 0.0026
XP_016858413 (OMIM: 605708) rho guanine nucleotide (1523) 249 45.3 0.0026
XP_016858411 (OMIM: 605708) rho guanine nucleotide (1528) 249 45.3 0.0026
>>NP_694945 (OMIM: 612496) rho guanine nucleotide exchan (802 aa)
initn: 5388 init1: 5388 opt: 5388 Z-score: 3722.1 bits: 699.6 E(91774): 1.5e-200
Smith-Waterman score: 5388; 100.0% identity (100.0% similar) in 802 aa overlap (1-802:1-802)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MDCGPPATLQPHLTGPPGTAHHPVAVCQQESLSFAELPALKPPSPVCLDLFPVAPEELRA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_694 MDCGPPATLQPHLTGPPGTAHHPVAVCQQESLSFAELPALKPPSPVCLDLFPVAPEELRA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 PGSRWSLGTPAPLQGLLWPLSPGGSDTEITSGGMRPSRAGSWPHCPGAQPPALEGPWSPR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_694 PGSRWSLGTPAPLQGLLWPLSPGGSDTEITSGGMRPSRAGSWPHCPGAQPPALEGPWSPR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 HTQPQRRASHGSEKKSAWRKMRVYQREEVPGCPEAHAVFLEPGQVVQEQALSTEEPRVEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_694 HTQPQRRASHGSEKKSAWRKMRVYQREEVPGCPEAHAVFLEPGQVVQEQALSTEEPRVEL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 SGSTRVSLEGPERRRFSASELMTRLHSSLRLGRNSAARALISGSGTGAAREGKASGMEAR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_694 SGSTRVSLEGPERRRFSASELMTRLHSSLRLGRNSAARALISGSGTGAAREGKASGMEAR
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 SVEMSGDRVSRPAPGDSREGDWSEPRLDTQEEPPLGSRSTNERRQSRFLLNSVLYQEYSD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_694 SVEMSGDRVSRPAPGDSREGDWSEPRLDTQEEPPLGSRSTNERRQSRFLLNSVLYQEYSD
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 VASARELRRQQREEEGPGDEAEGAEEGPGPPRANLSPSSSFRAQRSARGSTFSLWQDIPD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_694 VASARELRRQQREEEGPGDEAEGAEEGPGPPRANLSPSSSFRAQRSARGSTFSLWQDIPD
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE4 VRGSGVLATLSLRDCKLQEAKFELITSEASYIHSLSVAVGHFLGSAELSECLGAQDKQWL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_694 VRGSGVLATLSLRDCKLQEAKFELITSEASYIHSLSVAVGHFLGSAELSECLGAQDKQWL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE4 FSKLPEVKSTSERFLQDLEQRLEADVLRFSVCDVVLDHCPAFRRVYLPYVTNQAYQERTY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_694 FSKLPEVKSTSERFLQDLEQRLEADVLRFSVCDVVLDHCPAFRRVYLPYVTNQAYQERTY
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE4 QRLLLENPRFPGILARLEESPVCQRLPLTSFLILPFQRITRLKMLVENILKRTAQGSEDE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_694 QRLLLENPRFPGILARLEESPVCQRLPLTSFLILPFQRITRLKMLVENILKRTAQGSEDE
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE4 DMATKAFNALKELVQECNASVQSMKRTEELIHLSKKIHFEGKIFPLISQARWLVRHGELV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_694 DMATKAFNALKELVQECNASVQSMKRTEELIHLSKKIHFEGKIFPLISQARWLVRHGELV
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE4 ELAPLPAAPPAKLKLSSKAVYLHLFNDCLLLSRRKELGKFAVFVHAKMAELQVRDLSLKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_694 ELAPLPAAPPAKLKLSSKAVYLHLFNDCLLLSRRKELGKFAVFVHAKMAELQVRDLSLKL
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE4 QGIPGHVFLLQLLHGQHMKHQFLLRARTESEKQRWISALCPSSPQEDKEVISEGEDCPQV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_694 QGIPGHVFLLQLLHGQHMKHQFLLRARTESEKQRWISALCPSSPQEDKEVISEGEDCPQV
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE4 QCVRTYKALHPDELTLEKTDILSVRTWTSDGWLEGVRLADGEKGWVPQAYVEEISSLSAR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_694 QCVRTYKALHPDELTLEKTDILSVRTWTSDGWLEGVRLADGEKGWVPQAYVEEISSLSAR
730 740 750 760 770 780
790 800
pF1KE4 LRNLRENKRVTSATSKLGEAPV
::::::::::::::::::::::
NP_694 LRNLRENKRVTSATSKLGEAPV
790 800
>>XP_011539008 (OMIM: 612496) rho guanine nucleotide exc (802 aa)
initn: 5388 init1: 5388 opt: 5388 Z-score: 3722.1 bits: 699.6 E(91774): 1.5e-200
Smith-Waterman score: 5388; 100.0% identity (100.0% similar) in 802 aa overlap (1-802:1-802)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MDCGPPATLQPHLTGPPGTAHHPVAVCQQESLSFAELPALKPPSPVCLDLFPVAPEELRA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MDCGPPATLQPHLTGPPGTAHHPVAVCQQESLSFAELPALKPPSPVCLDLFPVAPEELRA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 PGSRWSLGTPAPLQGLLWPLSPGGSDTEITSGGMRPSRAGSWPHCPGAQPPALEGPWSPR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 PGSRWSLGTPAPLQGLLWPLSPGGSDTEITSGGMRPSRAGSWPHCPGAQPPALEGPWSPR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 HTQPQRRASHGSEKKSAWRKMRVYQREEVPGCPEAHAVFLEPGQVVQEQALSTEEPRVEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 HTQPQRRASHGSEKKSAWRKMRVYQREEVPGCPEAHAVFLEPGQVVQEQALSTEEPRVEL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 SGSTRVSLEGPERRRFSASELMTRLHSSLRLGRNSAARALISGSGTGAAREGKASGMEAR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SGSTRVSLEGPERRRFSASELMTRLHSSLRLGRNSAARALISGSGTGAAREGKASGMEAR
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 SVEMSGDRVSRPAPGDSREGDWSEPRLDTQEEPPLGSRSTNERRQSRFLLNSVLYQEYSD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SVEMSGDRVSRPAPGDSREGDWSEPRLDTQEEPPLGSRSTNERRQSRFLLNSVLYQEYSD
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 VASARELRRQQREEEGPGDEAEGAEEGPGPPRANLSPSSSFRAQRSARGSTFSLWQDIPD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 VASARELRRQQREEEGPGDEAEGAEEGPGPPRANLSPSSSFRAQRSARGSTFSLWQDIPD
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE4 VRGSGVLATLSLRDCKLQEAKFELITSEASYIHSLSVAVGHFLGSAELSECLGAQDKQWL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 VRGSGVLATLSLRDCKLQEAKFELITSEASYIHSLSVAVGHFLGSAELSECLGAQDKQWL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE4 FSKLPEVKSTSERFLQDLEQRLEADVLRFSVCDVVLDHCPAFRRVYLPYVTNQAYQERTY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 FSKLPEVKSTSERFLQDLEQRLEADVLRFSVCDVVLDHCPAFRRVYLPYVTNQAYQERTY
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE4 QRLLLENPRFPGILARLEESPVCQRLPLTSFLILPFQRITRLKMLVENILKRTAQGSEDE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 QRLLLENPRFPGILARLEESPVCQRLPLTSFLILPFQRITRLKMLVENILKRTAQGSEDE
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE4 DMATKAFNALKELVQECNASVQSMKRTEELIHLSKKIHFEGKIFPLISQARWLVRHGELV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 DMATKAFNALKELVQECNASVQSMKRTEELIHLSKKIHFEGKIFPLISQARWLVRHGELV
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE4 ELAPLPAAPPAKLKLSSKAVYLHLFNDCLLLSRRKELGKFAVFVHAKMAELQVRDLSLKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 ELAPLPAAPPAKLKLSSKAVYLHLFNDCLLLSRRKELGKFAVFVHAKMAELQVRDLSLKL
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE4 QGIPGHVFLLQLLHGQHMKHQFLLRARTESEKQRWISALCPSSPQEDKEVISEGEDCPQV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 QGIPGHVFLLQLLHGQHMKHQFLLRARTESEKQRWISALCPSSPQEDKEVISEGEDCPQV
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE4 QCVRTYKALHPDELTLEKTDILSVRTWTSDGWLEGVRLADGEKGWVPQAYVEEISSLSAR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 QCVRTYKALHPDELTLEKTDILSVRTWTSDGWLEGVRLADGEKGWVPQAYVEEISSLSAR
730 740 750 760 770 780
790 800
pF1KE4 LRNLRENKRVTSATSKLGEAPV
::::::::::::::::::::::
XP_011 LRNLRENKRVTSATSKLGEAPV
790 800
>>NP_005426 (OMIM: 600888) rho guanine nucleotide exchan (1597 aa)
initn: 1528 init1: 1032 opt: 1684 Z-score: 1168.5 bits: 228.1 E(91774): 2.6e-58
Smith-Waterman score: 1734; 41.5% identity (63.9% similar) in 840 aa overlap (6-799:782-1594)
10 20 30
pF1KE4 MDCGPPATLQPH--LTGPPGTAHHPVAVCQQESLS
::. . : : . : ..:: :. . .
NP_005 TLKQHSHPPPLALGSGLHAPHKGPLPQASDPAVARQHRPLPSTPDSSHHAQATPRWRY--
760 770 780 790 800
40 50 60 70 80
pF1KE4 FAELPALKPPSPVCLDLF-PVAPEELRAPGSRWSLGTPAPLQGLL------WPLSPGGSD
. : ::.: :: : : . :::: . : : .. :: : .
NP_005 --NKPL--PPTP---DLPQPHLPP-ISAPGSS-RIYRPLPPLPIIDPPTEPPPLPPKSRG
810 820 830 840 850 860
90 100 110 120 130
pF1KE4 -TEITSGGMRPS--RAGSWPHCPG-AQP-PALEG--PWSPRHTQPQRRASHGSEKKSAWR
.. : :: : .: . : : . : :: : : : .. . . :..::
NP_005 RSRSTRGGHMNSGGHAKTRPACQDWTVPLPASAGRTSWPPATARSTESFTSTSRSKSEVS
870 880 890 900 910 920
140 150 160 170 180 190
pF1KE4 KMRVYQREEVPGCPEAHAVFLEP---GQVVQEQALSTEEP----RVELSGST-RVSLEGP
... :: . .. : : . ...: .:.: : : .: . . ::
NP_005 PGMAFSNMTNFLCPSSPTTPWTPELQGPTSKDEAGVSEHPEAPAREPLRRTTPQQGASGP
930 940 950 960 970 980
200 210 220 230
pF1KE4 ERRRFSAS---ELMTRLH-----------SSLRLGRNSAARALISGSGTGAAREGKASGM
: . . : ..:: .: : .:...:. . :.. . . .:.
NP_005 GRSPVGQARQPEKPSHLHLEKASSWPHRRDSGRPPGDSSGQAVAPSEGANKHKGWSRQGL
990 1000 1010 1020 1030 1040
240 250 260 270 280 290
pF1KE4 EARSVEMSGDRVSRPAPGDSREGDWSEPRLDTQEEPP--LGSRSTNERRQSRFLLNS--V
. :. :. :: .:. .. :. . ...: .:. : :: :. :.:: .
NP_005 RRPSILPEGSSDSR-GPAVEKHPGPSDTVVFREKKPKEVMGGFS---RRCSK-LINSSQL
1050 1060 1070 1080 1090
300 310 320 330 340 350
pF1KE4 LYQEYSDVASARELRRQQREE---EGPGDEAEGAEEGPGPPRANLSPSSSFRAQRSARGS
::::::::. .:.. ::: : : :: . : :: : : :. :: . .:
NP_005 LYQEYSDVVLNKEIQSQQRLESLSETPGPSS------PRQPRKALVSSESY-LQRLSMAS
1100 1110 1120 1130 1140
360 370 380 390 400 410
pF1KE4 TFSLWQDIPDVRGSGVLATLSLRDCKLQEAKFELITSEASYIHSLSVAVGHFLGSAELSE
. ::::.:: ::.: :: ... .: ::::.:::::.:::::..::..:: :: :. :
NP_005 SGSLWQEIPVVRNSTVLLSMTHEDQKLQEVKFELIVSEASYLRSLNIAVDHFQLSTSLRA
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pF1KE4 CLGAQDKQWLFSKLPEVKSTSERFLQDLEQRLEADVLRFSVCDVVLDHCPAFRRVYLPYV
:. :..:::::.: .:...: ::.:::. .: ... :.::::::.: : :::::::::
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pF1KE4 TNQAYQERTYQRLLLENPRFPGILARLEESPVCQRLPLTSFLILPFQRITRLKMLVENIL
:::.:::::.: :. : : .: .:: .:::::: : ::::::::::::::.:..:::
NP_005 TNQTYQERTFQSLMNSNSNFREVLEKLESDPVCQRLSLKSFLILPFQRITRLKLLLQNIL
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pF1KE4 KRTAQGSEDEDMATKAFNALKELVQECNASVQSMKRTEELIHLSKKIHFEGKIFPLISQA
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NP_005 KRTQPGSSEEAEATKAHHALEQLIRDCNNNVQSMRRTEELIYLSQKIEFECKIFPLISQS
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pF1KE4 RWLVRHGELVELAPLPAAPPAKLKLSSKAVYLHLFNDCLLLSRRKELGKFAVFVHAKMAE
::::. :::. : . :.: . ::... :.:::::::::::: .: ..: :: :: ..
NP_005 RWLVKSGELTALE-FSASPGLRRKLNTRPVHLHLFNDCLLLSRPREGSRFLVFDHAPFSS
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pF1KE4 LQVRDLSLKLQGIPGHVFLLQLLHG-QHMKHQFLLRARTESEKQRWISALCPSSPQEDKE
.. . .::.: ..: : : .. : . .::.:..:.::: :::::: . :.:. .
NP_005 IRGEKCEMKLHGPHKNLFRLFLRQNTQGAQAEFLFRTETQSEKLRWISAL--AMPREELD
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pF1KE4 VISEGEDCPQVQCVRTYKALHPDELTLEKTDILSVRTWTSDGWLEGVRLADGEKGWVPQA
.. : . :::::.:.:: . :::.:::.:.. : .::::::::::.:::.:: :
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pF1KE4 YVEEISSLSARLRNLRENKRVTSATSKLGEAPV
:: ::. .: .::.: .:: .: .: :
NP_005 QVEFISNPEVRAQNLKEAHRVKTAKLQLVEQQA
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NP_001 LEILQPEEIKLQEAMFELVTSEASYYKSLNLLVSHFMENERIRKILHPSEAHILFSNVLD
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: ..::::: .::.:.: ... .:::.: . ::. ::.::.::::::..:: :
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pF1KE4 NPRFPGILARLEESPVCQRLPLTSFLILPFQRITRLKMLVENILKRTAQGSEDEDMATKA
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. :. .:. :: .:..:.:::..: ..::..:. : :.::..:::...::: ...
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pF1KE4 AAPPAKLKLSSKAVYLHLFNDCLLLSRRKELGKFAVFVHAKMAELQVRDLSLKLQGIPGH
.. . : . .:: :::: :.. :. :. :: : . :.:..: . : . ..
NP_001 TSRTLRTKKLFHEIYLFLFNDLLVICRQIPGDKYQVFDSAPRGLLRVEELEDQGQTL-AN
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pF1KE4 VFLLQLLHGQHMKHQ-FLLRARTESEKQRWISALCPSSPQEDKEVISEGEDCPQVQCVRT
::.:.::.. .. ..:.: ..:: .::...: :. . :. ::::::::.
NP_001 VFILRLLENADDREATYMLKASSQSEMKRWMTSLAPNRRTKFVSFTSRLLDCPQVQCVHP
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pF1KE4 YKALHPDELTLEKTDILSVRTWTSDGWLEGVRLADGEKGWVPQAYVEEISSLSARLRNLR
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pF1KE4 ENKRVTSATSKLGEAPV
: ::
NP_001 ECFRVHKMDDPQRSQNKDRRKLGSRNRQ
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pF1KE4 ATSKLGEAPV
NP_062 MDDPQRSQNKDRRKLGSRNRQ
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pF1KE4 LLWPLSPGGSDTEITSGGMRPSRAGSWPHCPGAQPPALEGPWSPRHTQPQRRASHGSEKK
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XP_011 ETRESEDLEKTRRKSASDQWNTDNEPAKVKPELLPEKEETSQADQDIQDKEPHCHIPIKR
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140 150 160 170 180 190
pF1KE4 SAW--RKMRVYQREEVPGCPEAHAVFLEPGQVVQEQALSTEEPRVELSGSTRVSLEGPER
.. :..: .. .. :: .: : .: ... :..:: ..:. :
XP_011 NSIFNRSIRRKSKAKARDNPERNASCLADSQ---DNGKSVNEP---------LTLNIPWS
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pF1KE4 RRFSASELMTRLHSSLRLGRNSAARALISGSGTGAAREGKASGMEARSVEMSGDRVSRPA
: : .. .....: : :.::. : . .. .. . :. .:
XP_011 RMPPCRTAMQTDPGAQEMSESS------STPGNGATPEEWPALADSPTTLTEALRMIHPI
110 120 130 140 150 160
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pF1KE4 PGDSREGDWSEPRLDTQEEPPLGSRSTNERRQSRFLLNSVLYQEYSDVASARELRRQQRE
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XP_011 PADSWRNLIEQIGLLYQE---YRDKSTLQEIETRRQQDA----EIEDNTNGSPASEDTPE
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pF1KE4 EEGPGDEAEGAEEGPGPPRANLSPSSSFRAQRSARGSTFSLWQDIPDVRGSGVLATLSLR
:: .: : :: .::. . :. . .. .: :.::::.:..:.:::: :. .
XP_011 EE---EEEEEEEEPASPPERKTLPQICLLSNPHSR---FNLWQDLPEIRSSGVLEILQPE
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XP_011 VKACNEGVRKMSRTEQMISIQKKMEFKIKSVPIISHSRWLLKQGELQQMSGPKTSRTLRT
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XP_011 ENADDREATYMLKASSQSEMKRWMTSLAPNRRTKFVSFTSRLLDCPQVQCVHPYVAQQPD
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pF1KE4 ELTLEKTDILSVRTWTSDGWLEGVRLADGEKGWVPQAYVEEISSLSARLRNLRENKRVTS
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XP_011 ELTLELADILNILDKTDDGWIFGERLHDQERGWFPSSMTEEILNPKIRSQNLKECFRVHK
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pF1KE4 ATSKLGEAPV
XP_011 MDDPQRSQNKDRRKLGSRNRQ
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XP_011 NQTYQERTYKQLLQEKAAFRELIAQLELDPKCRGLPFSSFLILPFQRITRLKLLVQNILK
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pF1KE4 RTAQGSEDEDMATKAFNALKELVQECNASVQSMKRTEELIHLSKKIHFEGKIFPLISQAR
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XP_011 RVEERSERECTALDAHKELEMVVKACNEGVRKMSRTEQMISIQKKMEFKIKSVPIISHSR
160 170 180 190 200 210
600 610 620 630 640 650
pF1KE4 WLVRHGELVELAPLPAAPPAKLKLSSKAVYLHLFNDCLLLSRRKELGKFAVFVHAKMAEL
::...::: ... .. . : . .:: :::: :.. :. :. :: : . :
XP_011 WLLKQGELQQMSGPKTSRTLRTKKLFHEIYLFLFNDLLVICRQIPGDKYQVFDSAPRGLL
220 230 240 250 260 270
660 670 680 690 700 710
pF1KE4 QVRDLSLKLQGIPGHVFLLQLLHGQHMKHQ-FLLRARTESEKQRWISALCPSSPQEDKEV
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XP_011 RVEELEDQGQTL-ANVFILRLLENADDREATYMLKASSQSEMKRWMTSLAPNRRTKFVSF
280 290 300 310 320 330
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pF1KE4 ISEGEDCPQVQCVRTYKALHPDELTLEKTDILSVRTWTSDGWLEGVRLADGEKGWVPQAY
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XP_011 TSRLLDCPQVQCVHPYVAQQPDELTLELADILNILDKTDDGWIFGERLHDQERGWFPSSM
340 350 360 370 380 390
780 790 800
pF1KE4 VEEISSLSARLRNLRENKRVTSATSKLGEAPV
.::: . . : .::.: ::
XP_011 TEEILNPKIRSQNLKECFRVHKMDDPQRSQNKDRRKLGSRNRQ
400 410 420 430
>>XP_011509226 (OMIM: 605991) ephexin-1 isoform X2 [Homo (433 aa)
initn: 1058 init1: 1058 opt: 1070 Z-score: 753.1 bits: 149.3 E(91774): 3.6e-35
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360 370 380 390 400 410
pF1KE4 FSLWQDIPDVRGSGVLATLSLRDCKLQEAKFELITSEASYIHSLSVAVGHFLGSAELSEC
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XP_011 MFELVTSEASYYKSLNLLVSHFMENERIRKI
10 20 30
420 430 440 450 460 470
pF1KE4 LGAQDKQWLFSKLPEVKSTSERFLQDLEQRLEADVLRFSVCDVVLDHCPAFRRVYLPYVT
: .. . :::.. .: ..::::: .::.:.: ... .:::.: . ::. ::.
XP_011 LHPSEAHILFSNVLDVLAVSERFLLELEHRMEENIVISDVCDIVYRYAADHFSVYITYVS
40 50 60 70 80 90
480 490 500 510 520 530
pF1KE4 NQAYQERTYQRLLLENPRFPGILARLEESPVCQRLPLTSFLILPFQRITRLKMLVENILK
::.::::::..:: :. : ..:.:: .: :. ::..::::::::::::::.::.::::
XP_011 NQTYQERTYKQLLQEKAAFRELIAQLELDPKCRGLPFSSFLILPFQRITRLKLLVQNILK
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540 550 560 570 580 590
pF1KE4 RTAQGSEDEDMATKAFNALKELVQECNASVQSMKRTEELIHLSKKIHFEGKIFPLISQAR
:. . :: : : : . :. .:. :: .:..:.:::..: ..::..:. : :.::..:
XP_011 RVEERSERECTALDAHKELEMVVKACNEGVRKMSRTEQMISIQKKMEFKIKSVPIISHSR
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pF1KE4 WLVRHGELVELAPLPAAPPAKLKLSSKAVYLHLFNDCLLLSRRKELGKFAVFVHAKMAEL
::...::: ... .. . : . .:: :::: :.. :. :. :: : . :
XP_011 WLLKQGELQQMSGPKTSRTLRTKKLFHEIYLFLFNDLLVICRQIPGDKYQVFDSAPRGLL
220 230 240 250 260 270
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pF1KE4 QVRDLSLKLQGIPGHVFLLQLLHGQHMKHQ-FLLRARTESEKQRWISALCPSSPQEDKEV
.:..: . : . ..::.:.::.. .. ..:.: ..:: .::...: :. .
XP_011 RVEELEDQGQTL-ANVFILRLLENADDREATYMLKASSQSEMKRWMTSLAPNRRTKFVSF
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pF1KE4 ISEGEDCPQVQCVRTYKALHPDELTLEKTDILSVRTWTSDGWLEGVRLADGEKGWVPQAY
:. ::::::::. : : .::::::: .:::.. :.:::. : :: : :.:: :...
XP_011 TSRLLDCPQVQCVHPYVAQQPDELTLELADILNILDKTDDGWIFGERLHDQERGWFPSSM
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pF1KE4 VEEISSLSARLRNLRENKRVTSATSKLGEAPV
.::: . . : .::.: ::
XP_011 TEEILNPKIRSQNLKECFRVHKMDDPQRSQNKDRRKLGSRNRQ
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>>NP_776089 (OMIM: 608504) rho guanine nucleotide exchan (841 aa)
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10 20 30 40
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:: ..:. ::. .:. : ... : ::: . :.
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. : . :: : : .: . :..:: . . . :. : : . .:. : :
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:: .: .: . : .. :.:: .:. :.. :.: :
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220 230 240 250
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. . :. .: :. .: : : : : . ...: .. : : :.
NP_776 YEEVPRVPRRASPLRTSRSRPHPPSIGHPAVVLTSYRSTAERKLLPLLKPPKPTRVRQDA
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260 270 280 290 300
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: : . ..: :. : .: :: . . .: . :. .:::..: :..:
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350 360 370 380 390 400
370 380 390 400 410 420
pF1KE4 GVLATLSLRDCKLQEAKFELITSEASYIHSLSVAVGHFLGSAELSECLGAQDKQWLFSKL
:.: ::: .. ..::. ::..::::::..:: . . :. : : . : .:.. :::..
NP_776 GLLDTLSPQERRMQESLFEVVTSEASYLRSLRLLTDTFVLSQALRDTLTPRDHHTLFSNV
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pF1KE4 PEVKSTSERFLQDLEQRLEADVLRFSVCDVVLDHCPAFRRVYLPYVTNQAYQERTYQRLL
.:...::::: : .:.... ..:::: : . ::. :: :: :::.::.::.
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pF1KE4 LENPRFPGILARLEESPVCQRLPLTSFLILPFQRITRLKMLVENILKRTAQGSEDEDMAT
: :: . : ::. : :.:::: :::.:::::::::.::..:::..: .:: .. :
NP_776 DTNVRFSAELRRLQSLPKCERLPLPSFLLLPFQRITRLRMLLQNILRQTEEGSSRQENAQ
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550 560 570 580 590 600
pF1KE4 KAFNALKELVQECNASVQSMKRTEELIHLSKKIHFEG-KIFPLISQARWLVRHGELVELA
::..:.......:.: : ::.:::::.:.....:. : .::.: .: : .:::.::.
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pF1KE4 PLPAAPPAKLKLSSKAVYLHLFNDCLLLSRRKELGKFAVFVHAKMAELQVRDLSLKLQGI
.. . . : ::.: ::... : .. :. .:. . .:.... .:
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670 680 690 700 710 720
pF1KE4 PGHVFLLQLL--HGQHMKHQFLLRARTESEKQRWISALCPSSPQE-DKEVISEGEDCPQV
: .: :.:: : . :. ::.: . :. :::..:. .: . ..: : :: :
NP_776 P--TFRLSLLSNHQGRPTHR-LLQASSLSDMQRWLGAFPTPGPLPCSPDTIYEDCDCSQE
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730 740 750 760 770 780
pF1KE4 QCVRTYKALHPDELTLEKTDILSVRTWTSDGWLEGVRLADGEKGWVPQAYVEEISSLSAR
: .. . . .::. . : .:::.:. : : : :... :
NP_776 LCSESSAPAKTEGRSLESRAAPKHLHKTPEGWLKGL------PGAFPAQLVCEVTGEHER
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790 800
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10 20 30 40
pF1KE4 MDCGPPATLQPHLTGPPG---TAHHPVAVCQQESLSFAELP--ALKPPS
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pF1KE4 PVCLDLFPVAPEE-LRAPGSRWSLGTPAPLQGLLWPLSPGGSDTEITSGGMRPSRAGSWP
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NP_079 PMCTPIFWEPPAASLKPPALLPPSASRASLDSQTSPDSPSSTPTP-SPVSRRSASPEPAP
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KE4 HCPGAQPPALEG-PWSPRHTQPQRRASHGSEKKSAWRKMRVYQREEVPGCPEAH-AVFLE
. : . :: : : .: . :..:: . . . :. : : . .:. : :
NP_079 RSP-VPPPKPSGSPCTPLLPMAGVLAQNGSASAPGTVR-RLAGRFEGGAEGRAQDADAPE
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210
pF1KE4 PGQVVQEQALSTEEPRVELSGSTRVSLEGPERRRFSASELMTRLHSS---LRL------G
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NP_079 PG--LQARADVNGEREAPLTGSGSQENGAPDAGLACPPCCPCVCHTTRPGLELRWVPVGG
180 190 200 210 220 230
220 230 240 250
pF1KE4 RNSAARALISGSG--TGAAREGKAS-GMEA---RSVEMSGDR-----VSRPAPGDSRE--
. . :. .: :. .: : : : : . ...: .. : : :.
NP_079 YEEVPRVPRRASPLRTSRSRPHPPSIGHPAVVLTSYRSTAERKLLPLLKPPKPTRVRQDA
240 250 260 270 280 290
260 270 280 290 300
pF1KE4 ---GDWSEPRLD-----------TQEEPPLGSR-STNERRQSRFLLNSVLYQEYSDVASA
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NP_079 TIFGDPPQPDLDLLSEDGIQTGDSPDEAPQNTPPATVEGREEEGL--EVLKEQNWELPLQ
300 310 320 330 340
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 RELRRQQREEEGPGDEAEGAEEGPGPPRANLSPSSSFRAQRSARGSTFSLWQDIPDVRGS
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NP_079 DEPLYQTYRAAVLSEELWGVGEDGSPSPANAGDAPTFPRPPGPRN---TLWQELPAVQAS
350 360 370 380 390 400
370 380 390 400 410 420
pF1KE4 GVLATLSLRDCKLQEAKFELITSEASYIHSLSVAVGHFLGSAELSECLGAQDKQWLFSKL
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NP_079 GLLDTLSPQERRMQESLFEVVTSEASYLRSLRLLTDTFVLSQALRDTLTPRDHHTLFSNV
410 420 430 440 450 460
430 440 450 460 470 480
pF1KE4 PEVKSTSERFLQDLEQRLEADVLRFSVCDVVLDHCPAFRRVYLPYVTNQAYQERTYQRLL
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NP_079 QRVQGVSERFLATLLSRVRSSPHISDLCDVVHAHAVGPFSVYVDYVRNQQYQEETYSRLM
470 480 490 500 510 520
490 500 510 520 530 540
pF1KE4 LENPRFPGILARLEESPVCQRLPLTSFLILPFQRITRLKMLVENILKRTAQGSEDEDMAT
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NP_079 DTNVRFSAELRRLQSLPKCERLPLPSFLLLPFQRITRLRMLLQNILRQTEEGSSRQENAQ
530 540 550 560 570 580
550 560 570 580 590 600
pF1KE4 KAFNALKELVQECNASVQSMKRTEELIHLSKKIHFEG-KIFPLISQARWLVRHGELVELA
::..:.......:.: : ::.:::::.:.....:. : .::.: .: : .:::.::.
NP_079 KALGAVSKIIERCSAEVGRMKQTEELIRLTQRLRFHKVKALPLVSWSRRLEFQGELTELG
590 600 610 620 630 640
610 620 630 640 650 660
pF1KE4 PLPAAPPAKLKLSSKAVYLHLFNDCLLLSRRKELGKFAVFVHAKMAELQVRDLSLKLQGI
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NP_079 CRRGGVLFASRPRFTPLCLLLFSDLLLITQPKSGQRLQVLDYAHRSLVQAQQVP-DPSGP
650 660 670 680 690 700
670 680 690 700 710 720
pF1KE4 PGHVFLLQLL--HGQHMKHQFLLRARTESEKQRWISALCPSSPQE-DKEVISEGEDCPQV
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NP_079 P--TFRLSLLSNHQGRPTHR-LLQASSLSDMQRWLGAFPTPGPLPCSPDTIYEDCDCSQE
710 720 730 740 750 760
730 740 750 760 770 780
pF1KE4 QCVRTYKALHPDELTLEKTDILSVRTWTSDGWLEGVRLADGEKGWVPQAYVEEISSLSAR
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NP_079 LCSESSAPAKTEGRSLESRAAPKHLHKTPEGWLKGL------PGAFPAQLVCEVTGEHER
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pF1KE4 LRNLRENKRVTSATSKLGEAPV
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]