Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE9543
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE9543, 496 aa
1>>>pF1KE9543 496 - 496 aa - 496 aa
Library: human.CCDS.faa
18921897 residues in 33420 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.0531+/-0.000998; mu= 19.3305+/- 0.060
mean_var=70.8027+/-14.401, 0's: 0 Z-trim(104.2): 78 B-trim: 0 in 0/50
Lambda= 0.152423
statistics sampled from 7796 (7878) to 7796 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.601), E-opt: 0.2 (0.236), width: 16
Scan time: 1.340
The best scores are: opt bits E(33420)
CCDS56480.1 ADCYAP1R1 gene_id:117|Hs109|chr7 ( 496) 3427 763.3 0
CCDS5433.1 ADCYAP1R1 gene_id:117|Hs109|chr7 ( 468) 2443 546.9 1.8e-155
CCDS56481.1 ADCYAP1R1 gene_id:117|Hs109|chr7 ( 447) 1676 378.2 1.1e-104
CCDS5950.1 VIPR2 gene_id:7434|Hs109|chr7 ( 438) 987 226.7 4.2e-59
CCDS58827.1 VIPR1 gene_id:7433|Hs109|chr3 ( 409) 927 213.5 3.7e-55
CCDS58828.1 VIPR1 gene_id:7433|Hs109|chr3 ( 416) 916 211.0 2e-54
CCDS2698.1 VIPR1 gene_id:7433|Hs109|chr3 ( 457) 916 211.1 2.2e-54
CCDS2127.1 SCTR gene_id:6344|Hs109|chr2 ( 440) 915 210.8 2.5e-54
CCDS78295.1 VIPR2 gene_id:7434|Hs109|chr7 ( 422) 849 196.3 5.6e-50
CCDS5432.1 GHRHR gene_id:2692|Hs109|chr7 ( 423) 756 175.9 8e-44
CCDS82367.1 GIPR gene_id:2696|Hs109|chr19 ( 430) 611 144.0 3.2e-34
CCDS12671.1 GIPR gene_id:2696|Hs109|chr19 ( 466) 611 144.0 3.4e-34
CCDS58829.1 VIPR1 gene_id:7433|Hs109|chr3 ( 247) 454 109.3 5.2e-24
CCDS5631.1 CALCR gene_id:799|Hs109|chr7 ( 474) 445 107.5 3.4e-23
CCDS2293.1 CALCRL gene_id:10203|Hs109|chr2 ( 461) 431 104.4 2.8e-22
CCDS11150.1 GLP2R gene_id:9340|Hs109|chr17 ( 553) 431 104.5 3.2e-22
CCDS75576.1 CRHR2 gene_id:1395|Hs109|chr7 ( 387) 423 102.6 8.3e-22
CCDS56477.1 CRHR2 gene_id:1395|Hs109|chr7 ( 397) 423 102.6 8.4e-22
CCDS5429.1 CRHR2 gene_id:1395|Hs109|chr7 ( 411) 423 102.6 8.7e-22
CCDS56478.1 CRHR2 gene_id:1395|Hs109|chr7 ( 438) 423 102.7 9.1e-22
CCDS45714.1 CRHR1 gene_id:1394|Hs109|chr17 ( 375) 410 99.7 5.9e-21
CCDS45713.1 CRHR1 gene_id:1394|Hs109|chr17 ( 401) 410 99.8 6.2e-21
CCDS42350.1 CRHR1 gene_id:1394|Hs109|chr17 ( 415) 410 99.8 6.3e-21
CCDS2747.1 PTH1R gene_id:5745|Hs109|chr3 ( 593) 410 99.9 8.3e-21
CCDS4839.1 GLP1R gene_id:2740|Hs109|chr6 ( 463) 405 98.7 1.5e-20
CCDS77049.1 CRHR1 gene_id:1394|Hs109|chr17 ( 314) 400 97.5 2.3e-20
CCDS55125.1 CALCR gene_id:799|Hs109|chr7 ( 508) 386 94.6 2.9e-19
CCDS2383.1 PTH2R gene_id:5746|Hs109|chr2 ( 550) 386 94.6 3e-19
CCDS54177.1 GCGR gene_id:2642|Hs109|chr17 ( 477) 383 93.9 4.3e-19
CCDS45712.1 CRHR1 gene_id:1394|Hs109|chr17 ( 444) 346 85.7 1.1e-16
CCDS82565.1 PTH2R gene_id:5746|Hs109|chr2 ( 439) 332 82.6 9.6e-16
CCDS58556.1 CRHR1 gene_id:1394|Hs109|chr17 ( 240) 280 71.0 1.7e-12
CCDS32931.1 ADGRE5 gene_id:976|Hs109|chr19 ( 742) 262 67.4 6.2e-11
CCDS32930.1 ADGRE5 gene_id:976|Hs109|chr19 ( 786) 262 67.4 6.5e-11
CCDS32929.1 ADGRE5 gene_id:976|Hs109|chr19 ( 835) 262 67.5 6.8e-11
>>CCDS56480.1 ADCYAP1R1 gene_id:117|Hs109|chr7 (496 aa)
initn: 3427 init1: 3427 opt: 3427 Z-score: 4073.8 bits: 763.3 E(33420): 0
Smith-Waterman score: 3427; 100.0% identity (100.0% similar) in 496 aa overlap (1-496:1-496)
10 20 30 40 50 60
pF1KE9 MAGVVHVSLAALLLLPMAPAMHSDCIFKKEQAMCLEKIQRANELMGFNDSSPGCPGMWDN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 MAGVVHVSLAALLLLPMAPAMHSDCIFKKEQAMCLEKIQRANELMGFNDSSPGCPGMWDN
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE9 ITCWKPAHVGEMVLVSCPELFRIFNPDQVWETETIGESDFGDSNSLDLSDMGVVSRNCTE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 ITCWKPAHVGEMVLVSCPELFRIFNPDQVWETETIGESDFGDSNSLDLSDMGVVSRNCTE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE9 DGWSEPFPHYFDACGFDEYESETGDQDYYYLSVKALYTVGYSTSLVTLTTAMVILCRFRK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 DGWSEPFPHYFDACGFDEYESETGDQDYYYLSVKALYTVGYSTSLVTLTTAMVILCRFRK
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE9 LHCTRNFIHMNLFVSFMLRAISVFIKDWILYAEQDSNHCFISTVECKAVMVFFHYCVVSN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 LHCTRNFIHMNLFVSFMLRAISVFIKDWILYAEQDSNHCFISTVECKAVMVFFHYCVVSN
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE9 YFWLFIEGLYLFTLLVETFFPERRYFYWYTIIGWGTPTVCVTVWATLRLYFDDTGCWDMN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 YFWLFIEGLYLFTLLVETFFPERRYFYWYTIIGWGTPTVCVTVWATLRLYFDDTGCWDMN
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE9 DSTALWWVIKGPVVGSIMVNFVLFIGIIVILVQKLQSPDMGGNESSIYFSCVQKCYCKPQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 DSTALWWVIKGPVVGSIMVNFVLFIGIIVILVQKLQSPDMGGNESSIYFSCVQKCYCKPQ
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE9 RAQQHSCKMSELSTITLRLARSTLLLIPLFGIHYTVFAFSPENVSKRERLVFELGLGSFQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 RAQQHSCKMSELSTITLRLARSTLLLIPLFGIHYTVFAFSPENVSKRERLVFELGLGSFQ
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE9 GFVVAVLYCFLNGEVQAEIKRKWRSWKVNRYFAVDFKHRHPSLASSGVNGGTQLSILSKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 GFVVAVLYCFLNGEVQAEIKRKWRSWKVNRYFAVDFKHRHPSLASSGVNGGTQLSILSKS
430 440 450 460 470 480
490
pF1KE9 SSQIRMSGLPADNLAT
::::::::::::::::
CCDS56 SSQIRMSGLPADNLAT
490
>>CCDS5433.1 ADCYAP1R1 gene_id:117|Hs109|chr7 (468 aa)
initn: 2443 init1: 2443 opt: 2443 Z-score: 2904.7 bits: 546.9 E(33420): 1.8e-155
Smith-Waterman score: 3157; 94.4% identity (94.4% similar) in 496 aa overlap (1-496:1-468)
10 20 30 40 50 60
pF1KE9 MAGVVHVSLAALLLLPMAPAMHSDCIFKKEQAMCLEKIQRANELMGFNDSSPGCPGMWDN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 MAGVVHVSLAALLLLPMAPAMHSDCIFKKEQAMCLEKIQRANELMGFNDSSPGCPGMWDN
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE9 ITCWKPAHVGEMVLVSCPELFRIFNPDQVWETETIGESDFGDSNSLDLSDMGVVSRNCTE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 ITCWKPAHVGEMVLVSCPELFRIFNPDQVWETETIGESDFGDSNSLDLSDMGVVSRNCTE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE9 DGWSEPFPHYFDACGFDEYESETGDQDYYYLSVKALYTVGYSTSLVTLTTAMVILCRFRK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 DGWSEPFPHYFDACGFDEYESETGDQDYYYLSVKALYTVGYSTSLVTLTTAMVILCRFRK
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE9 LHCTRNFIHMNLFVSFMLRAISVFIKDWILYAEQDSNHCFISTVECKAVMVFFHYCVVSN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 LHCTRNFIHMNLFVSFMLRAISVFIKDWILYAEQDSNHCFISTVECKAVMVFFHYCVVSN
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE9 YFWLFIEGLYLFTLLVETFFPERRYFYWYTIIGWGTPTVCVTVWATLRLYFDDTGCWDMN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 YFWLFIEGLYLFTLLVETFFPERRYFYWYTIIGWGTPTVCVTVWATLRLYFDDTGCWDMN
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE9 DSTALWWVIKGPVVGSIMVNFVLFIGIIVILVQKLQSPDMGGNESSIYFSCVQKCYCKPQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 DSTALWWVIKGPVVGSIMVNFVLFIGIIVILVQKLQSPDMGGNESSIY------------
310 320 330 340
370 380 390 400 410 420
pF1KE9 RAQQHSCKMSELSTITLRLARSTLLLIPLFGIHYTVFAFSPENVSKRERLVFELGLGSFQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 ----------------LRLARSTLLLIPLFGIHYTVFAFSPENVSKRERLVFELGLGSFQ
350 360 370 380 390
430 440 450 460 470 480
pF1KE9 GFVVAVLYCFLNGEVQAEIKRKWRSWKVNRYFAVDFKHRHPSLASSGVNGGTQLSILSKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 GFVVAVLYCFLNGEVQAEIKRKWRSWKVNRYFAVDFKHRHPSLASSGVNGGTQLSILSKS
400 410 420 430 440 450
490
pF1KE9 SSQIRMSGLPADNLAT
::::::::::::::::
CCDS54 SSQIRMSGLPADNLAT
460
>>CCDS56481.1 ADCYAP1R1 gene_id:117|Hs109|chr7 (447 aa)
initn: 2291 init1: 1675 opt: 1676 Z-score: 1993.5 bits: 378.2 E(33420): 1.1e-104
Smith-Waterman score: 2967; 90.1% identity (90.1% similar) in 496 aa overlap (1-496:1-447)
10 20 30 40 50 60
pF1KE9 MAGVVHVSLAALLLLPMAPAMHSDCIFKKEQAMCLEKIQRANELMGFNDSSPGCPGMWDN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 MAGVVHVSLAALLLLPMAPAMHSDCIFKKEQAMCLEKIQRANELMGFNDSSPGCPGMWDN
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE9 ITCWKPAHVGEMVLVSCPELFRIFNPDQVWETETIGESDFGDSNSLDLSDMGVVSRNCTE
:::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::
CCDS56 ITCWKPAHVGEMVLVSCPELFRIFNPDQ---------------------DMGVVSRNCTE
70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KE9 DGWSEPFPHYFDACGFDEYESETGDQDYYYLSVKALYTVGYSTSLVTLTTAMVILCRFRK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 DGWSEPFPHYFDACGFDEYESETGDQDYYYLSVKALYTVGYSTSLVTLTTAMVILCRFRK
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KE9 LHCTRNFIHMNLFVSFMLRAISVFIKDWILYAEQDSNHCFISTVECKAVMVFFHYCVVSN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 LHCTRNFIHMNLFVSFMLRAISVFIKDWILYAEQDSNHCFISTVECKAVMVFFHYCVVSN
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KE9 YFWLFIEGLYLFTLLVETFFPERRYFYWYTIIGWGTPTVCVTVWATLRLYFDDTGCWDMN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 YFWLFIEGLYLFTLLVETFFPERRYFYWYTIIGWGTPTVCVTVWATLRLYFDDTGCWDMN
220 230 240 250 260 270
310 320 330 340 350 360
pF1KE9 DSTALWWVIKGPVVGSIMVNFVLFIGIIVILVQKLQSPDMGGNESSIYFSCVQKCYCKPQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 DSTALWWVIKGPVVGSIMVNFVLFIGIIVILVQKLQSPDMGGNESSIY------------
280 290 300 310 320
370 380 390 400 410 420
pF1KE9 RAQQHSCKMSELSTITLRLARSTLLLIPLFGIHYTVFAFSPENVSKRERLVFELGLGSFQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 ----------------LRLARSTLLLIPLFGIHYTVFAFSPENVSKRERLVFELGLGSFQ
330 340 350 360 370
430 440 450 460 470 480
pF1KE9 GFVVAVLYCFLNGEVQAEIKRKWRSWKVNRYFAVDFKHRHPSLASSGVNGGTQLSILSKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 GFVVAVLYCFLNGEVQAEIKRKWRSWKVNRYFAVDFKHRHPSLASSGVNGGTQLSILSKS
380 390 400 410 420 430
490
pF1KE9 SSQIRMSGLPADNLAT
::::::::::::::::
CCDS56 SSQIRMSGLPADNLAT
440
>>CCDS5950.1 VIPR2 gene_id:7434|Hs109|chr7 (438 aa)
initn: 1387 init1: 463 opt: 987 Z-score: 1174.8 bits: 226.7 E(33420): 4.2e-59
Smith-Waterman score: 1412; 47.4% identity (69.4% similar) in 477 aa overlap (9-482:10-429)
10 20 30 40 50
pF1KE9 MAGVVHVSLAALLLLPMAPAMHSDCIFKKEQAMCLEKIQRANELMGFNDSSPGCPGMWD
:. :: :. ..: .: :. : . :. . :. : . ... .: :.::
CCDS59 MRTLLPPALLTCWLLAPVN-SIHPECRFHLE--IQEEETKCAELLRSQTEKHKACSGVWD
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE9 NITCWKPAHVGEMVLVSCPELFRIFNPDQVWETETIGESDFGDSNSLDLSDMGVVSRNCT
:::::.::.::: : : ::..: :.: : : .:.:::
CCDS59 NITCWRPANVGETVTVPCPKVF----------------SNF-------YSKAGNISKNCT
60 70 80 90
120 130 140 150 160 170
pF1KE9 EDGWSEPFPHYFDACGFDEYESETGDQDYYYLSVKALYTVGYSTSLVTLTTAMVILCRFR
::::: :: . ::::... :.:. . .:. :::.::.:::.::..:.:. .::: ::
CCDS59 SDGWSETFPDFVDACGYSDPEDES--KITFYILVKAIYTLGYSVSLMSLATGSIILCLFR
100 110 120 130 140 150
180 190 200 210 220 230
pF1KE9 KLHCTRNFIHMNLFVSFMLRAISVFIKDWILYAEQDSNHCF---ISTVECKAVMVFFHYC
:::::::.::.:::.::.::::::..:: .::. . . :: : : :: .::..::
CCDS59 KLHCTRNYIHLNLFLSFILRAISVLVKDDVLYSSSGTLHCPDQPSSWVGCKLSLVFLQYC
160 170 180 190 200 210
240 250 260 270 280 290
pF1KE9 VVSNYFWLFIEGLYLFTLLVETFFPERRYFYWYTIIGWGTPTVCVTVWATLRLYFDDTGC
...:.:::..::::: :::: ...: :: : : .:::: ::::. .:.. :::..::::
CCDS59 IMANFFWLLVEGLYLHTLLV-AMLPPRRCFLAYLLIGWGLPTVCIGAWTAARLYLEDTGC
220 230 240 250 260 270
300 310 320 330 340 350
pF1KE9 WDMNDSTALWWVIKGPVVGSIMVNFVLFIGIIVILVQKLQSPDMGGNESSIYFSCVQKCY
:: :: .. ::::. :.. ::.:::::::.:: ::.::: :::.:::..: :
CCDS59 WDTNDHSVPWWVIRIPILISIIVNFVLFISIIRILLQKLTSPDVGGNDQSQY--------
280 290 300 310 320
360 370 380 390 400 410
pF1KE9 CKPQRAQQHSCKMSELSTITLRLARSTLLLIPLFGIHYTVFAFSPENVSKRERLVFELGL
:::.::::::::::.:: ::: : ..:.. ...::: :
CCDS59 --------------------KRLAKSTLLLIPLFGVHYMVFAVFPISISSKYQILFELCL
330 340 350 360
420 430 440 450 460 470
pF1KE9 GSFQGFVVAVLYCFLNGEVQAEIKRKWRSWKVNRYFAVDFKHRHPSLASSGVNGGTQLSI
:::::.::::::::::.::: :.:::::: . . :.. :.. .: .:. :.
CCDS59 GSFQGLVVAVLYCFLNSEVQCELKRKWRSRCPTPSASRDYRVCGSSFSRNGSEGALQFHR
370 380 390 400 410 420
480 490
pF1KE9 LSKSSSQIRMSGLPADNLAT
:...:
CCDS59 GSRAQSFLQTETSVI
430
>>CCDS58827.1 VIPR1 gene_id:7433|Hs109|chr3 (409 aa)
initn: 1492 init1: 698 opt: 927 Z-score: 1103.9 bits: 213.5 E(33420): 3.7e-55
Smith-Waterman score: 1396; 48.5% identity (71.4% similar) in 437 aa overlap (53-487:15-399)
30 40 50 60 70 80
pF1KE9 SDCIFKKEQAMCLEKIQRANELMGFNDSSPGCPGMWDNITCWKPAHVGEMVLVSCPELFR
:: ::::.::: . :..:...:: .:.
CCDS58 MRAGRRPRLGPWAGGCSKMWDNLTCWPATPRGQVVVLACPLIFK
10 20 30 40
90 100 110 120 130 140
pF1KE9 IFNPDQVWETETIGESDFGDSNSLDLSDMGVVSRNCTEDGWS--EPFPHYFDACGFDEYE
.:. : :.. :::.::..::. :: : : :::.:.
CCDS58 LFSSIQ-------GRN---------------VSRSCTDEGWTHLEPGP-YPIACGLDDKA
50 60 70 80
150 160 170 180 190 200
pF1KE9 SETGDQDYYYLSVKALYTVGYSTSLVTLTTAMVILCRFRKLHCTRNFIHMNLFVSFMLRA
. .: ..: :::. ::.::. ::.:: .: .:: :::::::::.:::.::.::.:::
CCDS58 ASLDEQTMFYGSVKTGYTIGYGLSLATLLVATAILSLFRKLHCTRNYIHMHLFISFILRA
90 100 110 120 130 140
210 220 230 240 250 260
pF1KE9 ISVFIKDWILYAEQDSNHCFISTVECKAVMVFFHYCVVSNYFWLFIEGLYLFTLLVETFF
.::::: :. .:..: ..: :::.::::.:::..:.:::..:::::.:::. .::
CCDS58 AAVFIKDLALFDSGESDQCSEGSVGCKAAMVFFQYCVMANFFWLLVEGLYLYTLLAVSFF
150 160 170 180 190 200
270 280 290 300 310 320
pF1KE9 PERRYFYWYTIIGWGTPTVCVTVWATLRLYFDDTGCWDMNDSTALWWVIKGPVVGSIMVN
::.::. : .::::.:.. . ::. :..:.: :::: .:. :::.::::.. ::.::
CCDS58 SERKYFWGYILIGWGVPSTFTMVWTIARIHFEDYGCWDTINSS-LWWIIKGPILTSILVN
210 220 230 240 250 260
330 340 350 360 370 380
pF1KE9 FVLFIGIIVILVQKLQSPDMGGNESSIYFSCVQKCYCKPQRAQQHSCKMSELSTITLRLA
:.::: :: ::.:::. ::. ..:: : :::
CCDS58 FILFICIIRILLQKLRPPDIRKSDSSPYS----------------------------RLA
270 280 290
390 400 410 420 430 440
pF1KE9 RSTLLLIPLFGIHYTVFAFSPENVSKRERLVFELGLGSFQGFVVAVLYCFLNGEVQAEIK
:::::::::::.:: .::: :.: . . ..:::: .:::::::::.::::::::::::..
CCDS58 RSTLLLIPLFGVHYIMFAFFPDNFKPEVKMVFELVVGSFQGFVVAILYCFLNGEVQAELR
300 310 320 330 340 350
450 460 470 480 490
pF1KE9 RKWRSWKVNRYFAVDFKHRHPSLASSGVNGGTQLSILSKSSSQIRMSGLPADNLAT
:::: :... .. . :.:::: .:.:.. .::.:.:.. : : :
CCDS58 RKWRRWHLQGVLGWNPKYRHPSGGSNGATCSTQVSMLTRVSPGARRSSSFQAEVSLV
360 370 380 390 400
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10 20 30 40 50 60
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.. .:::. : :: .: : ::::
CCDS58 MIEVQHKQCLEEAQLENETIG-------CSKMWDN
10 20
70 80 90 100 110 120
pF1KE9 ITCWKPAHVGEMVLVSCPELFRIFNPDQVWETETIGESDFGDSNSLDLSDMGVVSRNCTE
.::: . :..:...:: .:..:. : :.. :::.::.
CCDS58 LTCWPATPRGQVVVLACPLIFKLFSSIQ-------GRN---------------VSRSCTD
30 40 50 60
130 140 150 160 170
pF1KE9 DGWS--EPFPHYFDACGFDEYESETGDQD-YYYLSVKALYTVGYSTSLVTLTTAMVILCR
.::. :: : : :::.:. . .:. ..: :::. ::.::. ::.:: .: .::
CCDS58 EGWTHLEPGP-YPIACGLDDKAASLDEQQTMFYGSVKTGYTIGYGLSLATLLVATAILSL
70 80 90 100 110 120
180 190 200 210 220 230
pF1KE9 FRKLHCTRNFIHMNLFVSFMLRAISVFIKDWILYAEQDSNHCFISTVECKAVMVFFHYCV
:::::::::.:::.::.::.::: .::::: :. .:..: ..: :::.::::.:::
CCDS58 FRKLHCTRNYIHMHLFISFILRAAAVFIKDLALFDSGESDQCSEGSVGCKAAMVFFQYCV
130 140 150 160 170 180
240 250 260 270 280 290
pF1KE9 VSNYFWLFIEGLYLFTLLVETFFPERRYFYWYTIIGWGTPTVCVTVWATLRLYFDDTGCW
..:.:::..:::::.:::. .:: ::.::. : .::::.:.. . ::. :..:.: :::
CCDS58 MANFFWLLVEGLYLYTLLAVSFFSERKYFWGYILIGWGVPSTFTMVWTIARIHFEDYGCW
190 200 210 220 230 240
300 310 320 330 340 350
pF1KE9 DMNDSTALWWVIKGPVVGSIMVNFVLFIGIIVILVQKLQSPDMGGNESSIYFSCVQKCYC
: .:. :::.::::.. ::.:::.::: :: ::.:::. ::. ..:: :
CCDS58 DTINSS-LWWIIKGPILTSILVNFILFICIIRILLQKLRPPDIRKSDSSPYS--------
250 260 270 280 290
360 370 380 390 400 410
pF1KE9 KPQRAQQHSCKMSELSTITLRLARSTLLLIPLFGIHYTVFAFSPENVSKRERLVFELGLG
::::::::::::::.:: .::: :.: . . ..:::: .:
CCDS58 --------------------RLARSTLLLIPLFGVHYIMFAFFPDNFKPEVKMVFELVVG
300 310 320 330
420 430 440 450 460 470
pF1KE9 SFQGFVVAVLYCFLNGEVQAEIKRKWRSWKVNRYFAVDFKHRHPSLASSGVNGGTQLSIL
::::::::.::::::::::::..:::: :... .. . :.:::: .:.:.. .::.:.:
CCDS58 SFQGFVVAILYCFLNGEVQAELRRKWRRWHLQGVLGWNPKYRHPSGGSNGATCSTQVSML
340 350 360 370 380 390
480 490
pF1KE9 SKSSSQIRMSGLPADNLAT
.. : : :
CCDS58 TRVSPGARRSSSFQAEVSLV
400 410
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10 20 30 40
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::. : ..:: .. .: ... .. .:::. : ::
CCDS26 MRPPSPLPARWLCVLAGALAWALGPAGGQAARLQEECDYVQMIEVQHKQCLEEAQLENET
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KE9 MGFNDSSPGCPGMWDNITCWKPAHVGEMVLVSCPELFRIFNPDQVWETETIGESDFGDSN
. :: ::::.::: . :..:...:: .:..:. : :..
CCDS26 I-------GCSKMWDNLTCWPATPRGQVVVLACPLIFKLFSSIQ-------GRN------
70 80 90 100
110 120 130 140 150 160
pF1KE9 SLDLSDMGVVSRNCTEDGWS--EPFPHYFDACGFDEYESETGDQD-YYYLSVKALYTVGY
:::.::..::. :: : : :::.:. . .:. ..: :::. ::.::
CCDS26 ---------VSRSCTDEGWTHLEPGP-YPIACGLDDKAASLDEQQTMFYGSVKTGYTIGY
110 120 130 140 150
170 180 190 200 210 220
pF1KE9 STSLVTLTTAMVILCRFRKLHCTRNFIHMNLFVSFMLRAISVFIKDWILYAEQDSNHCFI
. ::.:: .: .:: :::::::::.:::.::.::.::: .::::: :. .:..:
CCDS26 GLSLATLLVATAILSLFRKLHCTRNYIHMHLFISFILRAAAVFIKDLALFDSGESDQCSE
160 170 180 190 200 210
230 240 250 260 270 280
pF1KE9 STVECKAVMVFFHYCVVSNYFWLFIEGLYLFTLLVETFFPERRYFYWYTIIGWGTPTVCV
..: :::.::::.:::..:.:::..:::::.:::. .:: ::.::. : .::::.:.. .
CCDS26 GSVGCKAAMVFFQYCVMANFFWLLVEGLYLYTLLAVSFFSERKYFWGYILIGWGVPSTFT
220 230 240 250 260 270
290 300 310 320 330 340
pF1KE9 TVWATLRLYFDDTGCWDMNDSTALWWVIKGPVVGSIMVNFVLFIGIIVILVQKLQSPDMG
::. :..:.: :::: .:. :::.::::.. ::.:::.::: :: ::.:::. ::.
CCDS26 MVWTIARIHFEDYGCWDTINSS-LWWIIKGPILTSILVNFILFICIIRILLQKLRPPDIR
280 290 300 310 320
350 360 370 380 390 400
pF1KE9 GNESSIYFSCVQKCYCKPQRAQQHSCKMSELSTITLRLARSTLLLIPLFGIHYTVFAFSP
..:: : ::::::::::::::.:: .::: :
CCDS26 KSDSSPYS----------------------------RLARSTLLLIPLFGVHYIMFAFFP
330 340 350 360
410 420 430 440 450 460
pF1KE9 ENVSKRERLVFELGLGSFQGFVVAVLYCFLNGEVQAEIKRKWRSWKVNRYFAVDFKHRHP
.: . . ..:::: .:::::::::.::::::::::::..:::: :... .. . :.:::
CCDS26 DNFKPEVKMVFELVVGSFQGFVVAILYCFLNGEVQAELRRKWRRWHLQGVLGWNPKYRHP
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470 480 490
pF1KE9 SLASSGVNGGTQLSILSKSSSQIRMSGLPADNLAT
: .:.:.. .::.:.:.. : : :
CCDS26 SGGSNGATCSTQVSMLTRVSPGARRSSSFQAEVSLV
430 440 450
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10 20 30 40
pF1KE9 MAGVVHVSLAALLLLP--MAPAMHSD------C----IFKKEQAMCLEKIQRANEL-MGF
:::: .: : :: : .. .:: .::....: . .:
CCDS21 MRPHLSPPLQQLLLPVLLACAAHSTGALPRLCDVLQVLWEEQDQCLQELSREQTGDLGT
10 20 30 40 50
50 60 70 80 90 100
pF1KE9 NDSSPGCPGMWDNITCWKPAHVGEMVLVSCPELFRIFNPDQVWETETIGESDFGDSNSLD
.. ::: ::::::.:: . :.:: : ::...:...
CCDS21 EQPVPGCEGMWDNISCWPSSVPGRMVEVECPRFLRMLT----------------------
60 70 80 90
110 120 130 140 150 160
pF1KE9 LSDMGVVSRNCTEDGWSEPFPHYFDACGFDEYESETGDQDYYYLSVKALYTVGYSTSLVT
: : . ::::.::::: ::. ::: . .: . . : :..:..::::::.:::
CCDS21 -SRNGSLFRNCTQDGWSETFPRPNLACGVNVNDSSNEKRHSYLLKLKVMYTVGYSSSLVM
100 110 120 130 140 150
170 180 190 200 210 220
pF1KE9 LTTAMVILCRFRKLHCTRNFIHMNLFVSFMLRAISVFIKDWILYAEQDSNHCFISTVECK
: .:. ::: ::.::::::.:::.:::::.:::.: :::: .:.. .: ..: . ::
CCDS21 LLVALGILCAFRRLHCTRNYIHMHLFVSFILRALSNFIKDAVLFSSDDVTYCDAHRAGCK
160 170 180 190 200 210
230 240 250 260 270 280
pF1KE9 AVMVFFHYCVVSNYFWLFIEGLYLFTLLVETFFPERRYFYWYTIIGWGTPTVCVTVWATL
:::.:.::...:: ::..::::: :::. .:: ::.:. .. .:::.:.. :..::
CCDS21 LVMVLFQYCIMANYSWLLVEGLYLHTLLAISFFSERKYLQGFVAFGWGSPAIFVALWAIA
220 230 240 250 260 270
290 300 310 320 330 340
pF1KE9 RLYFDDTGCWDMNDSTALWWVIKGPVVGSIMVNFVLFIGIIVILVQKLQSPDMGGNESSI
: ...:.::::.: ....::.:.:::. ::..::.:::.:. ::..::.. . ::: :
CCDS21 RHFLEDVGCWDINANASIWWIIRGPVILSILINFILFINILRILMRKLRTQETRGNEVSH
280 290 300 310 320 330
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pF1KE9 YFSCVQKCYCKPQRAQQHSCKMSELSTITLRLARSTLLLIPLFGIHYTVFAFSPENVSKR
: ::::::::::::::::: :::::::.. .
CCDS21 Y----------------------------KRLARSTLLLIPLFGIHYIVFAFSPEDAMEI
340 350 360
410 420 430 440 450 460
pF1KE9 ERLVFELGLGSFQGFVVAVLYCFLNGEVQAEIKRKWRSWKVNRYFAVDFKHRHPSLASSG
. : :::.::::::.:::::::::::::: :...::..:.. : : . :: .::
CCDS21 Q-LFFELALGSFQGLVVAVLYCFLNGEVQLEVQKKWQQWHL-REFPL-----HP-VAS--
370 380 390 400 410
470 480 490
pF1KE9 VNGGTQLSILSKSSSQIRMSGLPADNLAT
...:. : : .:.. : :
CCDS21 FSNSTKASHLEQSQGTCRTSII
420 430 440
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.:. :::.::.:::.::..:.:. .::: :
CCDS78 SSDGNGDSKAATERVVSAMDTVRRKHPEITFYILVKAIYTLGYSVSLMSLATGSIILCLF
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pF1KE9 RKLHCTRNFIHMNLFVSFMLRAISVFIKDWILYAEQDSNHCF---ISTVECKAVMVFFHY
::::::::.::.:::.::.::::::..:: .::. . . :: : : :: .::..:
CCDS78 RKLHCTRNYIHLNLFLSFILRAISVLVKDDVLYSSSGTLHCPDQPSSWVGCKLSLVFLQY
140 150 160 170 180 190
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pF1KE9 CVVSNYFWLFIEGLYLFTLLVETFFPERRYFYWYTIIGWGTPTVCVTVWATLRLYFDDTG
:...:.:::..::::: :::: ...: :: : : .:::: ::::. .:.. :::..:::
CCDS78 CIMANFFWLLVEGLYLHTLLV-AMLPPRRCFLAYLLIGWGLPTVCIGAWTAARLYLEDTG
200 210 220 230 240 250
300 310 320 330 340 350
pF1KE9 CWDMNDSTALWWVIKGPVVGSIMVNFVLFIGIIVILVQKLQSPDMGGNESSIYFSCVQKC
::: :: .. ::::. :.. ::.:::::::.:: ::.::: :::.:::..: :
CCDS78 CWDTNDHSVPWWVIRIPILISIIVNFVLFISIIRILLQKLTSPDVGGNDQSQY-------
260 270 280 290 300
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pF1KE9 YCKPQRAQQHSCKMSELSTITLRLARSTLLLIPLFGIHYTVFAFSPENVSKRERLVFELG
:::.::::::::::.:: ::: : ..:.. ...:::
CCDS78 ---------------------KRLAKSTLLLIPLFGVHYMVFAVFPISISSKYQILFELC
310 320 330 340
420 430 440 450 460 470
pF1KE9 LGSFQGFVVAVLYCFLNGEVQAEIKRKWRSWKVNRYFAVDFKHRHPSLASSGVNGGTQLS
::::::.::::::::::.::: :.:::::: . . :.. :.. .: .:. :.
CCDS78 LGSFQGLVVAVLYCFLNSEVQCELKRKWRSRCPTPSASRDYRVCGSSFSRNGSEGALQFH
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pF1KE9 ILSKSSSQIRMSGLPADNLAT
:...:
CCDS78 RGSRAQSFLQTETSVI
410 420
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10 20 30 40 50
pF1KE9 MAGVVHVSLAALLLLPMAPAMHSDCIF----KKEQAMCLEKIQRANELMGFNDSSPG
:: .: : ..... :: : :.:. ... :
CCDS54 MDRRMWGAHVFCVLSPLPTVLGHMHPECDFITQLREDESACL---QAAEEM---PNTTLG
10 20 30 40 50
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pF1KE9 CPGMWDNITCWKPAHVGEMVLVSCPELFRIFNPDQVWETETIGESDFGDSNSLDLSDMGV
::. ::.. :: : :: : . ::..: :. :. :.
CCDS54 CPATWDGLLCWPTAGSGEWVTLPCPDFFSHFS-----------------------SESGA
60 70 80 90
120 130 140 150 160 170
pF1KE9 VSRNCTEDGWSEPFPHYFDACGFD-EYESETGDQDYYYLSVKALYTVGYSTSLVTLTTAM
:.:.:: ::::::: : :: : .: .. :. .:: .::::.: :.:.: .:.
CCDS54 VKRDCTITGWSEPFPPYPVACPVPLELLAE---EESYFSTVKIIYTVGHSISIVALFVAI
100 110 120 130 140
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pF1KE9 VILCRFRKLHCTRNFIHMNLFVSFMLRAISVFIKDWILYAEQDSNHCFISTVECKAVMVF
.:: .:.::: ::..: .::..:.:.: .::.:: :. .:..:: .::: ::. ..
CCDS54 TILVALRRLHCPRNYVHTQLFTTFILKAGAVFLKDAALFHSDDTDHCSFSTVLCKVSVAA
150 160 170 180 190 200
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pF1KE9 FHYCVVSNYFWLFIEGLYLFTLLVETFFPERRYFYWYTIIGWGTPTVCVTVWATLRLYFD
:. ...:. ::. :..:: ::. : :: :.: .. ::: :.. . .:.. .: :.
CCDS54 SHFATMTNFSWLLAEAVYLNCLLASTSPSSRRAFWWLVLAGWGLPVLFTGTWVSCKLAFE
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CCDS54 DIACWDLDDTSPYWWIIKGPIVLSVGVNFGLFLNIIRILVRKLE-PAQG----SLH---T
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CCDS54 QSQY--------------------WRLSKSTLFLIPLFGIHYIIFNFLPDNAGLGIRLPL
330 340 350 360
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CCDS54 ELGLGSFQGFIVAILYCFLNQEVRTEISRKWHGHDPELLPAWRTRAKWTTPSRSAAKVLT
370 380 390 400 410 420
480 490
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CCDS54 SMC
496 residues in 1 query sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]