Result of FASTA (omim) for
pFN21AB4957
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB4957, 534 aa
1>>>pF1KB4957 534 - 534 aa - 534 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.8665+/-0.000434; mu= 15.8208+/- 0.027
mean_var=79.8739+/-16.544, 0's: 0 Z-trim(110.3): 30 B-trim: 0 in 0/56
Lambda= 0.143507
statistics sampled from 18661 (18686) to 18661 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.574), E-opt: 0.2 (0.219), width: 16
Scan time: 9.680
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_001136067 (OMIM: 176710) prolyl 4-hydroxylase s ( 534) 3574 750.2 3.6e-216
NP_001017962 (OMIM: 176710) prolyl 4-hydroxylase s ( 534) 3574 750.2 3.6e-216
NP_000908 (OMIM: 176710) prolyl 4-hydroxylase subu ( 534) 3514 737.8 2e-212
NP_001136068 (OMIM: 176710) prolyl 4-hydroxylase s ( 516) 2677 564.5 2.8e-160
XP_005272177 (OMIM: 600608) PREDICTED: prolyl 4-hy ( 535) 2332 493.0 9.2e-139
XP_005272174 (OMIM: 600608) PREDICTED: prolyl 4-hy ( 535) 2332 493.0 9.2e-139
XP_005272176 (OMIM: 600608) PREDICTED: prolyl 4-hy ( 535) 2332 493.0 9.2e-139
XP_005272175 (OMIM: 600608) PREDICTED: prolyl 4-hy ( 535) 2332 493.0 9.2e-139
NP_001136071 (OMIM: 600608) prolyl 4-hydroxylase s ( 535) 2332 493.0 9.2e-139
NP_004190 (OMIM: 600608) prolyl 4-hydroxylase subu ( 535) 2332 493.0 9.2e-139
XP_005272173 (OMIM: 600608) PREDICTED: prolyl 4-hy ( 535) 2332 493.0 9.2e-139
XP_006714791 (OMIM: 600608) PREDICTED: prolyl 4-hy ( 535) 2332 493.0 9.2e-139
XP_006714793 (OMIM: 600608) PREDICTED: prolyl 4-hy ( 533) 2268 479.8 8.9e-135
NP_001017974 (OMIM: 600608) prolyl 4-hydroxylase s ( 533) 2268 479.8 8.9e-135
NP_001136070 (OMIM: 600608) prolyl 4-hydroxylase s ( 533) 2268 479.8 8.9e-135
XP_016865500 (OMIM: 600608) PREDICTED: prolyl 4-hy ( 533) 2268 479.8 8.9e-135
NP_001017973 (OMIM: 600608) prolyl 4-hydroxylase s ( 533) 2268 479.8 8.9e-135
XP_006714792 (OMIM: 600608) PREDICTED: prolyl 4-hy ( 533) 2268 479.8 8.9e-135
XP_016865501 (OMIM: 600608) PREDICTED: prolyl 4-hy ( 474) 1149 248.1 4.5e-65
XP_011542007 (OMIM: 600608) PREDICTED: prolyl 4-hy ( 476) 1146 247.5 6.9e-65
NP_878907 (OMIM: 608987) prolyl 4-hydroxylase subu ( 544) 987 214.6 6.3e-55
NP_001275677 (OMIM: 608987) prolyl 4-hydroxylase s ( 604) 755 166.6 2e-40
NP_808808 (OMIM: 614584) transmembrane prolyl 4-hy ( 502) 159 43.1 0.0023
NP_808807 (OMIM: 614584) transmembrane prolyl 4-hy ( 563) 159 43.2 0.0026
>>NP_001136067 (OMIM: 176710) prolyl 4-hydroxylase subun (534 aa)
initn: 3574 init1: 3574 opt: 3574 Z-score: 4001.9 bits: 750.2 E(85289): 3.6e-216
Smith-Waterman score: 3574; 100.0% identity (100.0% similar) in 534 aa overlap (1-534:1-534)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MIWYILIIGILLPQSLAHPGFFTSIGQMTDLIHTEKDLVTSLKDYIKAEEDKLEQIKKWA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MIWYILIIGILLPQSLAHPGFFTSIGQMTDLIHTEKDLVTSLKDYIKAEEDKLEQIKKWA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 EKLDRLTSTATKDPEGFVGHPVNAFKLMKRLNTEWSELENLVLKDMSDGFISNLTIQRQY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EKLDRLTSTATKDPEGFVGHPVNAFKLMKRLNTEWSELENLVLKDMSDGFISNLTIQRQY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 FPNDEDQVGAAKALLRLQDTYNLDTDTISKGNLPGVKHKSFLTAEDCFELGKVAYTEADY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 FPNDEDQVGAAKALLRLQDTYNLDTDTISKGNLPGVKHKSFLTAEDCFELGKVAYTEADY
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 YHTELWMEQALRQLDEGEISTIDKVSVLDYLSYAVYQQGDLDKALLLTKKLLELDPEHQR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 YHTELWMEQALRQLDEGEISTIDKVSVLDYLSYAVYQQGDLDKALLLTKKLLELDPEHQR
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 ANGNLKYFEYIMAKEKDVNKSASDDQSDQKTTPKKKGVAVDYLPERQKYEMLCRGEGIKM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ANGNLKYFEYIMAKEKDVNKSASDDQSDQKTTPKKKGVAVDYLPERQKYEMLCRGEGIKM
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB4 TPRRQKKLFCRYHDGNRNPKFILAPAKQEDEWDKPRIIRFHDIISDAEIEIVKDLAKPRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TPRRQKKLFCRYHDGNRNPKFILAPAKQEDEWDKPRIIRFHDIISDAEIEIVKDLAKPRL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB4 RRATISNPITGDLETVHYRISKSAWLSGYENPVVSRINMRIQDLTGLDVSTAEELQVANY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RRATISNPITGDLETVHYRISKSAWLSGYENPVVSRINMRIQDLTGLDVSTAEELQVANY
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB4 GVGGQYEPHFDFARKDEPDAFKELGTGNRIATWLFYMSDVSAGGATVFPEVGASVWPKKG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GVGGQYEPHFDFARKDEPDAFKELGTGNRIATWLFYMSDVSAGGATVFPEVGASVWPKKG
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530
pF1KB4 TAVFWYNLFASGEGDYSTRHAACPVLVGNKWVSNKWLHERGQEFRRPCTLSELE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TAVFWYNLFASGEGDYSTRHAACPVLVGNKWVSNKWLHERGQEFRRPCTLSELE
490 500 510 520 530
>>NP_001017962 (OMIM: 176710) prolyl 4-hydroxylase subun (534 aa)
initn: 3574 init1: 3574 opt: 3574 Z-score: 4001.9 bits: 750.2 E(85289): 3.6e-216
Smith-Waterman score: 3574; 100.0% identity (100.0% similar) in 534 aa overlap (1-534:1-534)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MIWYILIIGILLPQSLAHPGFFTSIGQMTDLIHTEKDLVTSLKDYIKAEEDKLEQIKKWA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MIWYILIIGILLPQSLAHPGFFTSIGQMTDLIHTEKDLVTSLKDYIKAEEDKLEQIKKWA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 EKLDRLTSTATKDPEGFVGHPVNAFKLMKRLNTEWSELENLVLKDMSDGFISNLTIQRQY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EKLDRLTSTATKDPEGFVGHPVNAFKLMKRLNTEWSELENLVLKDMSDGFISNLTIQRQY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 FPNDEDQVGAAKALLRLQDTYNLDTDTISKGNLPGVKHKSFLTAEDCFELGKVAYTEADY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 FPNDEDQVGAAKALLRLQDTYNLDTDTISKGNLPGVKHKSFLTAEDCFELGKVAYTEADY
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 YHTELWMEQALRQLDEGEISTIDKVSVLDYLSYAVYQQGDLDKALLLTKKLLELDPEHQR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 YHTELWMEQALRQLDEGEISTIDKVSVLDYLSYAVYQQGDLDKALLLTKKLLELDPEHQR
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 ANGNLKYFEYIMAKEKDVNKSASDDQSDQKTTPKKKGVAVDYLPERQKYEMLCRGEGIKM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ANGNLKYFEYIMAKEKDVNKSASDDQSDQKTTPKKKGVAVDYLPERQKYEMLCRGEGIKM
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB4 TPRRQKKLFCRYHDGNRNPKFILAPAKQEDEWDKPRIIRFHDIISDAEIEIVKDLAKPRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TPRRQKKLFCRYHDGNRNPKFILAPAKQEDEWDKPRIIRFHDIISDAEIEIVKDLAKPRL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB4 RRATISNPITGDLETVHYRISKSAWLSGYENPVVSRINMRIQDLTGLDVSTAEELQVANY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RRATISNPITGDLETVHYRISKSAWLSGYENPVVSRINMRIQDLTGLDVSTAEELQVANY
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB4 GVGGQYEPHFDFARKDEPDAFKELGTGNRIATWLFYMSDVSAGGATVFPEVGASVWPKKG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GVGGQYEPHFDFARKDEPDAFKELGTGNRIATWLFYMSDVSAGGATVFPEVGASVWPKKG
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530
pF1KB4 TAVFWYNLFASGEGDYSTRHAACPVLVGNKWVSNKWLHERGQEFRRPCTLSELE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TAVFWYNLFASGEGDYSTRHAACPVLVGNKWVSNKWLHERGQEFRRPCTLSELE
490 500 510 520 530
>>NP_000908 (OMIM: 176710) prolyl 4-hydroxylase subunit (534 aa)
initn: 3514 init1: 3514 opt: 3514 Z-score: 3934.8 bits: 737.8 E(85289): 2e-212
Smith-Waterman score: 3514; 98.1% identity (99.1% similar) in 534 aa overlap (1-534:1-534)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MIWYILIIGILLPQSLAHPGFFTSIGQMTDLIHTEKDLVTSLKDYIKAEEDKLEQIKKWA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 MIWYILIIGILLPQSLAHPGFFTSIGQMTDLIHTEKDLVTSLKDYIKAEEDKLEQIKKWA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 EKLDRLTSTATKDPEGFVGHPVNAFKLMKRLNTEWSELENLVLKDMSDGFISNLTIQRQY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 EKLDRLTSTATKDPEGFVGHPVNAFKLMKRLNTEWSELENLVLKDMSDGFISNLTIQRQY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 FPNDEDQVGAAKALLRLQDTYNLDTDTISKGNLPGVKHKSFLTAEDCFELGKVAYTEADY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 FPNDEDQVGAAKALLRLQDTYNLDTDTISKGNLPGVKHKSFLTAEDCFELGKVAYTEADY
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 YHTELWMEQALRQLDEGEISTIDKVSVLDYLSYAVYQQGDLDKALLLTKKLLELDPEHQR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 YHTELWMEQALRQLDEGEISTIDKVSVLDYLSYAVYQQGDLDKALLLTKKLLELDPEHQR
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 ANGNLKYFEYIMAKEKDVNKSASDDQSDQKTTPKKKGVAVDYLPERQKYEMLCRGEGIKM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 ANGNLKYFEYIMAKEKDVNKSASDDQSDQKTTPKKKGVAVDYLPERQKYEMLCRGEGIKM
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB4 TPRRQKKLFCRYHDGNRNPKFILAPAKQEDEWDKPRIIRFHDIISDAEIEIVKDLAKPRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 TPRRQKKLFCRYHDGNRNPKFILAPAKQEDEWDKPRIIRFHDIISDAEIEIVKDLAKPRL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB4 RRATISNPITGDLETVHYRISKSAWLSGYENPVVSRINMRIQDLTGLDVSTAEELQVANY
:::. .: :: : :..::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 SRATVHDPETGKLTTAQYRVSKSAWLSGYENPVVSRINMRIQDLTGLDVSTAEELQVANY
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB4 GVGGQYEPHFDFARKDEPDAFKELGTGNRIATWLFYMSDVSAGGATVFPEVGASVWPKKG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 GVGGQYEPHFDFARKDEPDAFKELGTGNRIATWLFYMSDVSAGGATVFPEVGASVWPKKG
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530
pF1KB4 TAVFWYNLFASGEGDYSTRHAACPVLVGNKWVSNKWLHERGQEFRRPCTLSELE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 TAVFWYNLFASGEGDYSTRHAACPVLVGNKWVSNKWLHERGQEFRRPCTLSELE
490 500 510 520 530
>>NP_001136068 (OMIM: 176710) prolyl 4-hydroxylase subun (516 aa)
initn: 2677 init1: 2677 opt: 2677 Z-score: 2998.5 bits: 564.5 E(85289): 2.8e-160
Smith-Waterman score: 3337; 94.8% identity (95.7% similar) in 534 aa overlap (1-534:1-516)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MIWYILIIGILLPQSLAHPGFFTSIGQMTDLIHTEKDLVTSLKDYIKAEEDKLEQIKKWA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MIWYILIIGILLPQSLAHPGFFTSIGQMTDLIHTEKDLVTSLKDYIKAEEDKLEQIKKWA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 EKLDRLTSTATKDPEGFVGHPVNAFKLMKRLNTEWSELENLVLKDMSDGFISNLTIQRQY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EKLDRLTSTATKDPEGFVGHPVNAFKLMKRLNTEWSELENLVLKDMSDGFISNLTIQRQY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 FPNDEDQVGAAKALLRLQDTYNLDTDTISKGNLPGVKHKSFLTAEDCFELGKVAYTEADY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 FPNDEDQVGAAKALLRLQDTYNLDTDTISKGNLPGVKHKSFLTAEDCFELGKVAYTEADY
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 YHTELWMEQALRQLDEGEISTIDKVSVLDYLSYAVYQQGDLDKALLLTKKLLELDPEHQR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 YHTELWMEQALRQLDEGEISTIDKVSVLDYLSYAVYQQGDLDKALLLTKKLLELDPEHQR
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 ANGNLKYFEYIMAKEKDVNKSASDDQSDQKTTPKKKGVAVDYLPERQKYEMLCRGEGIKM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ANGNLKYFEYIMAKEKDVNKSASDDQSDQKTTPKKKGVAVDYLPERQKYEMLCRGEGIKM
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB4 TPRRQKKLFCRYHDGNRNPKFILAPAKQEDEWDKPRIIRFHDIISDAEIEIVKDLAKPRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TPRRQKKLFCRYHDGNRNPKFILAPAKQEDEWDKPRIIRFHDIISDAEIEIVKDLAKPRL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB4 RRATISNPITGDLETVHYRISKSAWLSGYENPVVSRINMRIQDLTGLDVSTAEELQVANY
:::. .: :: : :..::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SRATVHDPETGKLTTAQYRVSKSAWLSGYENPVVSRINMRIQDLTGLDVSTAEELQ----
370 380 390 400 410
430 440 450 460 470 480
pF1KB4 GVGGQYEPHFDFARKDEPDAFKELGTGNRIATWLFYMSDVSAGGATVFPEVGASVWPKKG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 --------------KDEPDAFKELGTGNRIATWLFYMSDVSAGGATVFPEVGASVWPKKG
420 430 440 450 460
490 500 510 520 530
pF1KB4 TAVFWYNLFASGEGDYSTRHAACPVLVGNKWVSNKWLHERGQEFRRPCTLSELE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TAVFWYNLFASGEGDYSTRHAACPVLVGNKWVSNKWLHERGQEFRRPCTLSELE
470 480 490 500 510
>>XP_005272177 (OMIM: 600608) PREDICTED: prolyl 4-hydrox (535 aa)
initn: 2316 init1: 1303 opt: 2332 Z-score: 2612.2 bits: 493.0 E(85289): 9.2e-139
Smith-Waterman score: 2332; 62.2% identity (84.5% similar) in 537 aa overlap (1-534:10-535)
10 20 30 40 50
pF1KB4 MIWYILIIGILLPQSLAHPGFFTSIGQMTDLIHTEKDLVTSLKDYIKAEED
: :. :.: : .. ::::::.:::::..::.:: :::.:: .::
XP_005 MKLWVSALLMAWF----GVL---SCVQAEFFTSIGHMTDLIYAEKELVQSLKEYILVEEA
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB4 KLEQIKKWAEKLDRLTSTATKDPEGFVGHPVNAFKLMKRLNTEWSELENLVLKDMSDGFI
:: .::.::.:.. ::: .. : ::...:::::.::.:::::.: ::.:::.: . :::
XP_005 KLSKIKSWANKMEALTSKSAADAEGYLAHPVNAYKLVKRLNTDWPALEDLVLQDSAAGFI
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB4 SNLTIQRQYFPNDEDQVGAAKALLRLQDTYNLDTDTISKGNLPGVKHKSFLTAEDCFELG
.::..:::.::.:::..::::::.:::::: :: :::.:.:::.:....:...::: .:
XP_005 ANLSVQRQFFPTDEDEIGAAKALMRLQDTYRLDPGTISRGELPGTKYQAMLSVDDCFGMG
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB4 KVAYTEADYYHTELWMEQALRQLDEGEISTIDKVSVLDYLSYAVYQQGDLDKALLLTKKL
. ::.:.::::: :::::.:.::: :: .: : .:::::::::.: ::: .:: ::..:
XP_005 RSAYNEGDYYHTVLWMEQVLKQLDAGEEATTTKSQVLDYLSYAVFQLGDLHRALELTRRL
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280
pF1KB4 LELDPEHQRANGNLKYFEYIMAKEKDVNKSASDDQSDQKTTPKKKGV---AVDYLPERQK
: ::: :.::.:::.::: .. .:.. :. ... . .:: .:. :::::::.
XP_005 LSLDPSHERAGGNLRYFEQLLEEERE--KTLTNQTEAELATP--EGIYERPVDYLPERDV
240 250 260 270 280
290 300 310 320 330 340
pF1KB4 YEMLCRGEGIKMTPRRQKKLFCRYHDGNRNPKFILAPAKQEDEWDKPRIIRFHDIISDAE
:: ::::::.:.::::::.:::::: ::: :....:: :.:::::.:.:.:..:..:: :
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pF1KB4 TLSELE
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NP_004 GSTEVD
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Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
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