Result of FASTA (ccds) for
pFN21AB4120
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB4120, 451 aa
1>>>pF1KB4120 451 - 451 aa - 451 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 12.4760+/-0.00112; mu= -12.2748+/- 0.068
mean_var=453.9034+/-94.471, 0's: 0 Z-trim(115.6): 39 B-trim: 463 in 1/54
Lambda= 0.060199
statistics sampled from 16179 (16213) to 16179 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.769), E-opt: 0.2 (0.498), width: 16
Scan time: 3.120
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS53499.1 ABI1 gene_id:10006|Hs108|chr10 ( 451) 3053 279.1 6.5e-75
CCDS31170.1 ABI1 gene_id:10006|Hs108|chr10 ( 452) 3041 278.0 1.3e-74
CCDS53498.1 ABI1 gene_id:10006|Hs108|chr10 ( 446) 2996 274.1 2e-73
CCDS53500.1 ABI1 gene_id:10006|Hs108|chr10 ( 480) 2255 209.8 5e-54
CCDS31171.1 ABI1 gene_id:10006|Hs108|chr10 ( 481) 2232 207.8 2e-53
CCDS31169.1 ABI1 gene_id:10006|Hs108|chr10 ( 476) 2220 206.7 4.1e-53
CCDS73078.1 ABI1 gene_id:10006|Hs108|chr10 ( 422) 1831 172.9 5.5e-43
CCDS7150.1 ABI1 gene_id:10006|Hs108|chr10 ( 508) 1819 171.9 1.3e-42
CCDS73077.1 ABI1 gene_id:10006|Hs108|chr10 ( 393) 1793 169.6 5.1e-42
CCDS2358.1 ABI2 gene_id:10152|Hs108|chr2 ( 475) 1616 154.3 2.5e-37
CCDS53501.1 ABI1 gene_id:10006|Hs108|chr10 ( 496) 1598 152.7 7.7e-37
CCDS74634.1 ABI2 gene_id:10152|Hs108|chr2 ( 390) 1590 152.0 1e-36
CCDS63094.1 ABI2 gene_id:10152|Hs108|chr2 ( 507) 1428 138.0 2.2e-32
CCDS63093.1 ABI2 gene_id:10152|Hs108|chr2 ( 513) 1370 132.9 7.2e-31
CCDS53497.1 ABI1 gene_id:10006|Hs108|chr10 ( 329) 943 95.7 7.5e-20
CCDS11546.1 ABI3 gene_id:51225|Hs108|chr17 ( 366) 602 66.1 6.7e-11
>>CCDS53499.1 ABI1 gene_id:10006|Hs108|chr10 (451 aa)
initn: 3053 init1: 3053 opt: 3053 Z-score: 1458.4 bits: 279.1 E(32554): 6.5e-75
Smith-Waterman score: 3053; 100.0% identity (100.0% similar) in 451 aa overlap (1-451:1-451)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MAELQMLLEEEIPSGKRALIESYQNLTRVADYCENNYIQATDKRKALEETKAYTTQSLAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 MAELQMLLEEEIPSGKRALIESYQNLTRVADYCENNYIQATDKRKALEETKAYTTQSLAS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 VAYQINALANNVLQLLDIQASQLRRMESSINHISQTVDIHKEKVARREIGILTTNKNTSR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 VAYQINALANNVLQLLDIQASQLRRMESSINHISQTVDIHKEKVARREIGILTTNKNTSR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 THKIIAPANMERPVRYIRKPIDYTVLDDVGHGVKWLKAKHGNNQPARTGTLSRTNPPTQK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 THKIIAPANMERPVRYIRKPIDYTVLDDVGHGVKWLKAKHGNNQPARTGTLSRTNPPTQK
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 PPSPPMSGRGTLGRNTPYKTLEPVKPPTVPNDYMTSPARLGSQHSPGRTASLNQRPRTHS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 PPSPPMSGRGTLGRNTPYKTLEPVKPPTVPNDYMTSPARLGSQHSPGRTASLNQRPRTHS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 GSSGGSGSRENSGSSSIGIPIAVPTPSPPTIGPAPGSAPGSQYGTMTRQISRHNSTTSST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 GSSGGSGSRENSGSSSIGIPIAVPTPSPPTIGPAPGSAPGSQYGTMTRQISRHNSTTSST
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB4 SSGGYRRTPSVTAQFSAQPHVNGGPLYSQNSIADSPTPPPPPPPDDIPMFDDSPPPPPPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 SSGGYRRTPSVTAQFSAQPHVNGGPLYSQNSIADSPTPPPPPPPDDIPMFDDSPPPPPPP
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB4 PVDYEDEEAAVVQYNDPYADGDPAWAPKNYIEKVVAIYDYTKDKDDELSFMEGAIIYVIK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 PVDYEDEEAAVVQYNDPYADGDPAWAPKNYIEKVVAIYDYTKDKDDELSFMEGAIIYVIK
370 380 390 400 410 420
430 440 450
pF1KB4 KNDDGWYEGVCNRVTGLFPGNYVESIMHYTD
:::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 KNDDGWYEGVCNRVTGLFPGNYVESIMHYTD
430 440 450
>>CCDS31170.1 ABI1 gene_id:10006|Hs108|chr10 (452 aa)
initn: 1907 init1: 1907 opt: 3041 Z-score: 1452.8 bits: 278.0 E(32554): 1.3e-74
Smith-Waterman score: 3041; 99.8% identity (99.8% similar) in 452 aa overlap (1-451:1-452)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MAELQMLLEEEIPSGKRALIESYQNLTRVADYCENNYIQATDKRKALEETKAYTTQSLAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MAELQMLLEEEIPSGKRALIESYQNLTRVADYCENNYIQATDKRKALEETKAYTTQSLAS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 VAYQINALANNVLQLLDIQASQLRRMESSINHISQTVDIHKEKVARREIGILTTNKNTSR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 VAYQINALANNVLQLLDIQASQLRRMESSINHISQTVDIHKEKVARREIGILTTNKNTSR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 THKIIAPANMERPVRYIRKPIDYTVLDDVGHGVKWLKAKHGNNQPARTGTLSRTNPPTQK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 THKIIAPANMERPVRYIRKPIDYTVLDDVGHGVKWLKAKHGNNQPARTGTLSRTNPPTQK
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 PPSPPMSGRGTLGRNTPYKTLEPVKPPTVPNDYMTSPARLGSQHSPGRTASLNQRPRTHS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 PPSPPMSGRGTLGRNTPYKTLEPVKPPTVPNDYMTSPARLGSQHSPGRTASLNQRPRTHS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290
pF1KB4 GSSGGSGSRENSGSSSIGIPIAVPTPSPPTIGPA-PGSAPGSQYGTMTRQISRHNSTTSS
:::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::
CCDS31 GSSGGSGSRENSGSSSIGIPIAVPTPSPPTIGPAAPGSAPGSQYGTMTRQISRHNSTTSS
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KB4 TSSGGYRRTPSVTAQFSAQPHVNGGPLYSQNSIADSPTPPPPPPPDDIPMFDDSPPPPPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 TSSGGYRRTPSVTAQFSAQPHVNGGPLYSQNSIADSPTPPPPPPPDDIPMFDDSPPPPPP
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KB4 PPVDYEDEEAAVVQYNDPYADGDPAWAPKNYIEKVVAIYDYTKDKDDELSFMEGAIIYVI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 PPVDYEDEEAAVVQYNDPYADGDPAWAPKNYIEKVVAIYDYTKDKDDELSFMEGAIIYVI
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450
pF1KB4 KKNDDGWYEGVCNRVTGLFPGNYVESIMHYTD
::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 KKNDDGWYEGVCNRVTGLFPGNYVESIMHYTD
430 440 450
>>CCDS53498.1 ABI1 gene_id:10006|Hs108|chr10 (446 aa)
initn: 2060 init1: 2060 opt: 2996 Z-score: 1431.7 bits: 274.1 E(32554): 2e-73
Smith-Waterman score: 2996; 98.9% identity (98.9% similar) in 451 aa overlap (1-451:1-446)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MAELQMLLEEEIPSGKRALIESYQNLTRVADYCENNYIQATDKRKALEETKAYTTQSLAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 MAELQMLLEEEIPSGKRALIESYQNLTRVADYCENNYIQATDKRKALEETKAYTTQSLAS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 VAYQINALANNVLQLLDIQASQLRRMESSINHISQTVDIHKEKVARREIGILTTNKNTSR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 VAYQINALANNVLQLLDIQASQLRRMESSINHISQTVDIHKEKVARREIGILTTNKNTSR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 THKIIAPANMERPVRYIRKPIDYTVLDDVGHGVKWLKAKHGNNQPARTGTLSRTNPPTQK
:::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::
CCDS53 THKIIAPANMERPVRYIRKPIDYTVLDDVGHGVK-----HGNNQPARTGTLSRTNPPTQK
130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 PPSPPMSGRGTLGRNTPYKTLEPVKPPTVPNDYMTSPARLGSQHSPGRTASLNQRPRTHS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 PPSPPMSGRGTLGRNTPYKTLEPVKPPTVPNDYMTSPARLGSQHSPGRTASLNQRPRTHS
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 GSSGGSGSRENSGSSSIGIPIAVPTPSPPTIGPAPGSAPGSQYGTMTRQISRHNSTTSST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 GSSGGSGSRENSGSSSIGIPIAVPTPSPPTIGPAPGSAPGSQYGTMTRQISRHNSTTSST
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KB4 SSGGYRRTPSVTAQFSAQPHVNGGPLYSQNSIADSPTPPPPPPPDDIPMFDDSPPPPPPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 SSGGYRRTPSVTAQFSAQPHVNGGPLYSQNSIADSPTPPPPPPPDDIPMFDDSPPPPPPP
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KB4 PVDYEDEEAAVVQYNDPYADGDPAWAPKNYIEKVVAIYDYTKDKDDELSFMEGAIIYVIK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 PVDYEDEEAAVVQYNDPYADGDPAWAPKNYIEKVVAIYDYTKDKDDELSFMEGAIIYVIK
360 370 380 390 400 410
430 440 450
pF1KB4 KNDDGWYEGVCNRVTGLFPGNYVESIMHYTD
:::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 KNDDGWYEGVCNRVTGLFPGNYVESIMHYTD
420 430 440
>>CCDS53500.1 ABI1 gene_id:10006|Hs108|chr10 (480 aa)
initn: 2295 init1: 2222 opt: 2255 Z-score: 1083.5 bits: 209.8 E(32554): 5e-54
Smith-Waterman score: 2985; 94.0% identity (94.0% similar) in 480 aa overlap (1-451:1-480)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MAELQMLLEEEIPSGKRALIESYQNLTRVADYCENNYIQATDKRKALEETKAYTTQSLAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 MAELQMLLEEEIPSGKRALIESYQNLTRVADYCENNYIQATDKRKALEETKAYTTQSLAS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 VAYQINALANNVLQLLDIQASQLRRMESSINHISQTVDIHKEKVARREIGILTTNKNTSR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 VAYQINALANNVLQLLDIQASQLRRMESSINHISQTVDIHKEKVARREIGILTTNKNTSR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 THKIIAPANMERPVRYIRKPIDYTVLDDVGHGVKWLKAKHGNNQPARTGTLSRTNPPTQK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 THKIIAPANMERPVRYIRKPIDYTVLDDVGHGVKWLKAKHGNNQPARTGTLSRTNPPTQK
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 PPSPPMSGRGTLGRNTPYKTLEPVKPPTVPNDYMTSPARLGSQHSPGRTASLNQRPRTHS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 PPSPPMSGRGTLGRNTPYKTLEPVKPPTVPNDYMTSPARLGSQHSPGRTASLNQRPRTHS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 GSSGGSGSRENSGSSSIGIPIAVPTPSPPTIGPAPGSAPGSQYGTMTRQISRHNSTTSST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 GSSGGSGSRENSGSSSIGIPIAVPTPSPPTIGPAPGSAPGSQYGTMTRQISRHNSTTSST
250 260 270 280 290 300
310 320 330
pF1KB4 SSGGYRRTPSVTAQFSAQPHVNGGPLYSQNSI----------------------------
::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 SSGGYRRTPSVTAQFSAQPHVNGGPLYSQNSISIAPPPPPMPQLTPQIPLTGFVARVQEN
310 320 330 340 350 360
340 350 360 370 380 390
pF1KB4 -ADSPTPPPPPPPDDIPMFDDSPPPPPPPPVDYEDEEAAVVQYNDPYADGDPAWAPKNYI
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 IADSPTPPPPPPPDDIPMFDDSPPPPPPPPVDYEDEEAAVVQYNDPYADGDPAWAPKNYI
370 380 390 400 410 420
400 410 420 430 440 450
pF1KB4 EKVVAIYDYTKDKDDELSFMEGAIIYVIKKNDDGWYEGVCNRVTGLFPGNYVESIMHYTD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 EKVVAIYDYTKDKDDELSFMEGAIIYVIKKNDDGWYEGVCNRVTGLFPGNYVESIMHYTD
430 440 450 460 470 480
>>CCDS31171.1 ABI1 gene_id:10006|Hs108|chr10 (481 aa)
initn: 2245 init1: 1825 opt: 2232 Z-score: 1072.7 bits: 207.8 E(32554): 2e-53
Smith-Waterman score: 2973; 93.8% identity (93.8% similar) in 481 aa overlap (1-451:1-481)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MAELQMLLEEEIPSGKRALIESYQNLTRVADYCENNYIQATDKRKALEETKAYTTQSLAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MAELQMLLEEEIPSGKRALIESYQNLTRVADYCENNYIQATDKRKALEETKAYTTQSLAS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 VAYQINALANNVLQLLDIQASQLRRMESSINHISQTVDIHKEKVARREIGILTTNKNTSR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 VAYQINALANNVLQLLDIQASQLRRMESSINHISQTVDIHKEKVARREIGILTTNKNTSR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 THKIIAPANMERPVRYIRKPIDYTVLDDVGHGVKWLKAKHGNNQPARTGTLSRTNPPTQK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 THKIIAPANMERPVRYIRKPIDYTVLDDVGHGVKWLKAKHGNNQPARTGTLSRTNPPTQK
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 PPSPPMSGRGTLGRNTPYKTLEPVKPPTVPNDYMTSPARLGSQHSPGRTASLNQRPRTHS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 PPSPPMSGRGTLGRNTPYKTLEPVKPPTVPNDYMTSPARLGSQHSPGRTASLNQRPRTHS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290
pF1KB4 GSSGGSGSRENSGSSSIGIPIAVPTPSPPTIGPA-PGSAPGSQYGTMTRQISRHNSTTSS
:::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::
CCDS31 GSSGGSGSRENSGSSSIGIPIAVPTPSPPTIGPAAPGSAPGSQYGTMTRQISRHNSTTSS
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330
pF1KB4 TSSGGYRRTPSVTAQFSAQPHVNGGPLYSQNSI---------------------------
:::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 TSSGGYRRTPSVTAQFSAQPHVNGGPLYSQNSISIAPPPPPMPQLTPQIPLTGFVARVQE
310 320 330 340 350 360
340 350 360 370 380 390
pF1KB4 --ADSPTPPPPPPPDDIPMFDDSPPPPPPPPVDYEDEEAAVVQYNDPYADGDPAWAPKNY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 NIADSPTPPPPPPPDDIPMFDDSPPPPPPPPVDYEDEEAAVVQYNDPYADGDPAWAPKNY
370 380 390 400 410 420
400 410 420 430 440 450
pF1KB4 IEKVVAIYDYTKDKDDELSFMEGAIIYVIKKNDDGWYEGVCNRVTGLFPGNYVESIMHYT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 IEKVVAIYDYTKDKDDELSFMEGAIIYVIKKNDDGWYEGVCNRVTGLFPGNYVESIMHYT
430 440 450 460 470 480
pF1KB4 D
:
CCDS31 D
>>CCDS31169.1 ABI1 gene_id:10006|Hs108|chr10 (476 aa)
initn: 2219 init1: 981 opt: 2220 Z-score: 1067.1 bits: 206.7 E(32554): 4.1e-53
Smith-Waterman score: 2916; 92.7% identity (92.7% similar) in 481 aa overlap (1-451:1-476)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MAELQMLLEEEIPSGKRALIESYQNLTRVADYCENNYIQATDKRKALEETKAYTTQSLAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MAELQMLLEEEIPSGKRALIESYQNLTRVADYCENNYIQATDKRKALEETKAYTTQSLAS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 VAYQINALANNVLQLLDIQASQLRRMESSINHISQTVDIHKEKVARREIGILTTNKNTSR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 VAYQINALANNVLQLLDIQASQLRRMESSINHISQTVDIHKEKVARREIGILTTNKNTSR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 THKIIAPANMERPVRYIRKPIDYTVLDDVGHGVKWLKAKHGNNQPARTGTLSRTNPPTQK
:::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::
CCDS31 THKIIAPANMERPVRYIRKPIDYTVLDDVGHGVK-----HGNNQPARTGTLSRTNPPTQK
130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 PPSPPMSGRGTLGRNTPYKTLEPVKPPTVPNDYMTSPARLGSQHSPGRTASLNQRPRTHS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 PPSPPMSGRGTLGRNTPYKTLEPVKPPTVPNDYMTSPARLGSQHSPGRTASLNQRPRTHS
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290
pF1KB4 GSSGGSGSRENSGSSSIGIPIAVPTPSPPTIGPA-PGSAPGSQYGTMTRQISRHNSTTSS
:::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::
CCDS31 GSSGGSGSRENSGSSSIGIPIAVPTPSPPTIGPAAPGSAPGSQYGTMTRQISRHNSTTSS
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330
pF1KB4 TSSGGYRRTPSVTAQFSAQPHVNGGPLYSQNSI---------------------------
:::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 TSSGGYRRTPSVTAQFSAQPHVNGGPLYSQNSISIAPPPPPMPQLTPQIPLTGFVARVQE
300 310 320 330 340 350
340 350 360 370 380 390
pF1KB4 --ADSPTPPPPPPPDDIPMFDDSPPPPPPPPVDYEDEEAAVVQYNDPYADGDPAWAPKNY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 NIADSPTPPPPPPPDDIPMFDDSPPPPPPPPVDYEDEEAAVVQYNDPYADGDPAWAPKNY
360 370 380 390 400 410
400 410 420 430 440 450
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 IEKVVAIYDYTKDKDDELSFMEGAIIYVIKKNDDGWYEGVCNRVTGLFPGNYVESIMHYT
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:
CCDS31 D
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 VAYQINALANNVLQLLDIQASQLRRMESSINHISQTVDIHKEKVARREIGILTTNKNTSR
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 THKIIAPANMERPVRYIRKPIDYTVLDDVGHGVKWLKAKHGNNQPARTGTLSRTNPPTQK
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 PPSPPMSGRGTLGRNTPYKTLEPVKPPTVPNDYMTSPARLGSQHSPGRTASLNQRPRTHS
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:::::::::::::::::::::::::::::::::. . :
CCDS73 GSSGGSGSRENSGSSSIGIPIAVPTPSPPTIGPVSIAPP---------------------
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: :.. : ..: :..:::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 --------PPPMPQLTPQIPLTGFVARVQENIADSPTPPPPPPPDDIPMFDDSPPPPPPP
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 PVDYEDEEAAVVQYNDPYADGDPAWAPKNYIEKVVAIYDYTKDKDDELSFMEGAIIYVIK
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:::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 KNDDGWYEGVCNRVTGLFPGNYVESIMHYTD
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10 20 30 40 50 60
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS71 MAELQMLLEEEIPSGKRALIESYQNLTRVADYCENNYIQATDKRKALEETKAYTTQSLAS
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS71 VAYQINALANNVLQLLDIQASQLRRMESSINHISQTVDIHKEKVARREIGILTTNKNTSR
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS71 THKIIAPANMERPVRYIRKPIDYTVLDDVGHGVKWLKAKHGNNQPARTGTLSRTNPPTQK
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS71 PPSPPMSGRGTLGRNTPYKTLEPVKPPTVPNDYMTSPARLGSQHSPGRTASLNQRPRTHS
190 200 210 220 230 240
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:::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS71 GSSGGSGSRENSGSSSIGIPIAVPTPSPPTIGPENISVPPPSGAPPAPPLAPLLPVSTVI
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280 290 300 310 320 330
pF1KB4 -APGSAPGSQYGTMTRQISRHNSTTSSTSSGGYRRTPSVTAQFSAQPHVNGGPLYSQNSI
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS71 AAPGSAPGSQYGTMTRQISRHNSTTSSTSSGGYRRTPSVTAQFSAQPHVNGGPLYSQNSI
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340 350 360
pF1KB4 -----------------------------ADSPTPPPPPPPDDIPMFDDSPPPPPPPPVD
:::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS71 SIAPPPPPMPQLTPQIPLTGFVARVQENIADSPTPPPPPPPDDIPMFDDSPPPPPPPPVD
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370 380 390 400 410 420
pF1KB4 YEDEEAAVVQYNDPYADGDPAWAPKNYIEKVVAIYDYTKDKDDELSFMEGAIIYVIKKND
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS71 YEDEEAAVVQYNDPYADGDPAWAPKNYIEKVVAIYDYTKDKDDELSFMEGAIIYVIKKND
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430 440 450
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:::
CCDS71 DGWYEGVCNRVTGLFPGNYVESIMHYTD
490 500
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 VAYQINALANNVLQLLDIQASQLRRMESSINHISQTVDIHKEKVARREIGILTTNKNTSR
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 THKIIAPANMERPVRYIRKPIDYTVLDDVGHGVKWLKAKHGNNQPARTGTLSRTNPPTQK
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190 200 210 220 230 240
pF1KB4 PPSPPMSGRGTLGRNTPYKTLEPVKPPTVPNDYMTSPARLGSQHSPGRTASLNQRPRTHS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 PPSPPMSGRGTLGRNTPYKTLEPVKPPTVPNDYMTSPARLGSQHSPGRTASLNQRPRTHS
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:::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 GSSGGSGSRENSGSSSIGIPIAVPTPSPPTIGP---------------------------
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.::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 -------------------------------VADSPTPPPPPPPDDIPMFDDSPPPPPPP
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pF1KB4 PVDYEDEEAAVVQYNDPYADGDPAWAPKNYIEKVVAIYDYTKDKDDELSFMEGAIIYVIK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 PVDYEDEEAAVVQYNDPYADGDPAWAPKNYIEKVVAIYDYTKDKDDELSFMEGAIIYVIK
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430 440 450
pF1KB4 KNDDGWYEGVCNRVTGLFPGNYVESIMHYTD
:::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 KNDDGWYEGVCNRVTGLFPGNYVESIMHYTD
370 380 390
>>CCDS2358.1 ABI2 gene_id:10152|Hs108|chr2 (475 aa)
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10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MAELQMLLEEEIPSGKRALIESYQNLTRVADYCENNYIQATDKRKALEETKAYTTQSLAS
:::::::::::::.:.:::..:: :: ::::::::::::..::..:::::::::::::::
CCDS23 MAELQMLLEEEIPGGRRALFDSYTNLERVADYCENNYIQSADKQRALEETKAYTTQSLAS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 VAYQINALANNVLQLLDIQASQLRRMESSINHISQTVDIHKEKVARREIGILTTNKNTSR
::: ::.:::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS23 VAYLINTLANNVLQMLDIQASQLRRMESSINHISQTVDIHKEKVARREIGILTTNKNTSR
70 80 90 100 110 120
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pF1KB4 THKIIAPANMERPVRYIRKPIDYTVLDDVGHGVKWLKAKHGNNQPARTGTLSRTNPPTQK
:::::::::.::::::::::::::.:::.::::: ..: . : : ::.:::::
CCDS23 THKIIAPANLERPVRYIRKPIDYTILDDIGHGVKV------STQNMKMGGLPRTTPPTQK
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190 200 210 220 230
pF1KB4 PPSPPMSGRGTLGRNTPYKTLEPVKPPTVPNDYMTSPAR--LGSQHSPGRTASLNQRPRT
::::::::.:::::..::.:::::.::.:::::. ::.: ::.:: ::::.::: ::
CCDS23 PPSPPMSGKGTLGRHSPYRTLEPVRPPVVPNDYVPSPTRNMAPSQQSPVRTASVNQRNRT
180 190 200 210 220 230
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pF1KB4 HS--GSSGGS------GSRENSGSSSIGIPIAVPTPSPPTIGPAPGSAPGSQYGTMTRQI
.: :::::: .:::::::.:.:.::::::::::.. :. : :. .:.:
CCDS23 YSSSGSSGGSHPSSRSSSRENSGSGSVGVPIAVPTPSPPSVFPG---HP-VQFYSMNRPA
240 250 260 270 280 290
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pF1KB4 SRHNSTTSSTSSGGYRRTPSVTAQFSAQPHVNGGPLYSQNSIADSPTPP-----------
:::. : . .: ::: ::.:.: : : ..::::.:::: .. .: ::
CCDS23 SRHTPPTIG-GSLPYRRPPSITSQTSLQNQMNGGPFYSQNPVSLAPPPPSILQVTPQLPL
300 310 320 330 340
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pF1KB4 ---------------PPPPPDDIPMFDDSPPPPPPPPVDYEDEEAAVVQYNDPYADGDPA
::::: . :.::.:::::::: :::.::::::.:.::::. ::
CCDS23 MGFVARVQENISDTPPPPPPVEEPVFDESPPPPPPPE-DYEEEEAAVVEYSDPYAEEDPP
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pF1KB4 WAPKNYIEKVVAIYDYTKDKDDELSFMEGAIIYVIKKNDDGWYEGVCNRVTGLFPGNYVE
:::..:.:::::::::::::.:::::.::::::::::::::::::: : :::::::::::
CCDS23 WAPRSYLEKVVAIYDYTKDKEDELSFQEGAIIYVIKKNDDGWYEGVMNGVTGLFPGNYVE
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:::::..
CCDS23 SIMHYSE
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]