FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE4319, 325 aa 1>>>pF1KE4319 325 - 325 aa - 325 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.4755+/-0.000805; mu= 14.9305+/- 0.048 mean_var=65.4871+/-13.184, 0's: 0 Z-trim(107.1): 28 B-trim: 0 in 0/50 Lambda= 0.158488 statistics sampled from 9382 (9403) to 9382 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.666), E-opt: 0.2 (0.289), width: 16 Scan time: 2.650 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS523.1 AKR1A1 gene_id:10327|Hs108|chr1 ( 325) 2218 515.8 1.8e-146 CCDS5831.1 AKR1B1 gene_id:231|Hs108|chr7 ( 316) 1080 255.6 3.8e-68 CCDS5832.1 AKR1B10 gene_id:57016|Hs108|chr7 ( 316) 1055 249.9 2e-66 CCDS47715.2 AKR1B15 gene_id:441282|Hs108|chr7 ( 344) 932 221.8 6.3e-58 CCDS7061.1 AKR1C1 gene_id:1645|Hs108|chr10 ( 323) 922 219.5 2.9e-57 CCDS7062.1 AKR1C2 gene_id:1646|Hs108|chr10 ( 323) 918 218.6 5.5e-57 CCDS5846.1 AKR1D1 gene_id:6718|Hs108|chr7 ( 326) 914 217.6 1e-56 CCDS7064.1 AKR1C4 gene_id:1109|Hs108|chr10 ( 323) 900 214.4 9.6e-56 CCDS7063.1 AKR1C3 gene_id:8644|Hs108|chr10 ( 323) 870 207.6 1.1e-53 CCDS73062.1 AKR1C3 gene_id:8644|Hs108|chr10 ( 323) 866 206.7 2.1e-53 CCDS55169.1 AKR1D1 gene_id:6718|Hs108|chr7 ( 290) 786 188.4 6.1e-48 CCDS31134.1 AKR1E2 gene_id:83592|Hs108|chr10 ( 320) 508 124.8 9.1e-29 CCDS81438.1 AKR1C2 gene_id:1646|Hs108|chr10 ( 297) 485 119.5 3.3e-27 CCDS55170.1 AKR1D1 gene_id:6718|Hs108|chr7 ( 285) 418 104.2 1.3e-22 CCDS59210.1 AKR1E2 gene_id:83592|Hs108|chr10 ( 222) 382 95.9 3.1e-20 CCDS59209.1 AKR1E2 gene_id:83592|Hs108|chr10 ( 263) 382 96.0 3.6e-20 CCDS44350.1 AKR1C2 gene_id:1646|Hs108|chr10 ( 139) 356 89.9 1.3e-18 >>CCDS523.1 AKR1A1 gene_id:10327|Hs108|chr1 (325 aa) initn: 2218 init1: 2218 opt: 2218 Z-score: 2742.9 bits: 515.8 E(32554): 1.8e-146 Smith-Waterman score: 2218; 100.0% identity (100.0% similar) in 325 aa overlap (1-325:1-325) 10 20 30 40 50 60 pF1KE4 MAASCVLLHTGQKMPLIGLGTWKSEPGQVKAAVKYALSVGYRHIDCAAIYGNEPEIGEAL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS52 MAASCVLLHTGQKMPLIGLGTWKSEPGQVKAAVKYALSVGYRHIDCAAIYGNEPEIGEAL 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE4 KEDVGPGKAVPREELFVTSKLWNTKHHPEDVEPALRKTLADLQLEYLDLYLMHWPYAFER :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS52 KEDVGPGKAVPREELFVTSKLWNTKHHPEDVEPALRKTLADLQLEYLDLYLMHWPYAFER 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE4 GDNPFPKNADGTICYDSTHYKETWKALEALVAKGLVQALGLSNFNSRQIDDILSVASVRP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS52 GDNPFPKNADGTICYDSTHYKETWKALEALVAKGLVQALGLSNFNSRQIDDILSVASVRP 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE4 AVLQVECHPYLAQNELIAHCQARGLEVTAYSPLGSSDRAWRDPDEPVLLEEPVVLALAEK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS52 AVLQVECHPYLAQNELIAHCQARGLEVTAYSPLGSSDRAWRDPDEPVLLEEPVVLALAEK 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE4 YGRSPAQILLRWQVQRKVICIPKSITPSRILQNIKVFDFTFSPEEMKQLNALNKNWRYIV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS52 YGRSPAQILLRWQVQRKVICIPKSITPSRILQNIKVFDFTFSPEEMKQLNALNKNWRYIV 250 260 270 280 290 300 310 320 pF1KE4 PMLTVDGKRVPRDAGHPLYPFNDPY ::::::::::::::::::::::::: CCDS52 PMLTVDGKRVPRDAGHPLYPFNDPY 310 320 >>CCDS5831.1 AKR1B1 gene_id:231|Hs108|chr7 (316 aa) initn: 1076 init1: 484 opt: 1080 Z-score: 1336.9 bits: 255.6 E(32554): 3.8e-68 Smith-Waterman score: 1087; 49.5% identity (75.7% similar) in 325 aa overlap (3-325:2-316) 10 20 30 40 50 60 pF1KE4 MAASCVLLHTGQKMPLIGLGTWKSEPGQVKAAVKYALSVGYRHIDCAAIYGNEPEIGEAL :: .::..: :::..::::::: :::: ::: :..::::::::: .: :: :.: :. 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CCDS58 GKEFFPLDESGNVVPSDTNILDTWAAMEELVDEGLVKAIGISNFNHLQVEMILNKPGLKY 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE4 -PAVLQVECHPYLAQNELIAHCQARGLEVTAYSPLGSSDRAWRDPDEPVLLEEPVVLALA ::: :.::::::.:..:: .::..:. ::::::::: :: : :..: :::.: . :.: CCDS58 KPAVNQIECHPYLTQEKLIQYCQSKGIVVTAYSPLGSPDRPWAKPEDPSLLEDPRIKAIA 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE4 EKYGRSPAQILLRWQVQRKVICIPKSITPSRILQNIKVFDFTFSPEEMKQLNALNKNWRY :.... ::.:.:. .::... ::::.:: :: .:.::::: .: ..: : . :.::: CCDS58 AKHNKTTAQVLIRFPMQRNLVVIPKSVTPERIAENFKVFDFELSSQDMTTLLSYNRNWR- 240 250 260 270 280 290 300 310 320 pF1KE4 IVPMLTVDGKRVPRDAGHPLYPFNDPY . .:. ..: :::.. . 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CCDS47 VGPLTGLKSSLLKDTTSAGPLLRPYPASLLGKVKEAVKVAIDAEYRHIDCAYFYENQHEV 30 40 50 60 70 80 60 70 80 90 100 110 pF1KE4 GEALKEDVGPGKAVPREELFVTSKLWNTKHHPEDVEPALRKTLADLQLEYLDLYLMHWPY :::..: . ::: ::.::..::.: : . :. :..::: ::.: :::.::.::: CCDS47 GEAIQEKIQE-KAVMREDLFIVSKVWPTFFERPLVRKAFEKTLKDLKLSYLDVYLIHWPQ 90 100 110 120 130 140 120 130 140 150 160 170 pF1KE4 AFERGDNPFPKNADGTICYDSTHYKETWKALEALVAKGLVQALGLSNFNSRQIDDILSVA .:. ::. :::. :.. . . ..:.:.: :: .:::.:::.:::: ::. .:. CCDS47 GFKTGDDFFPKDDKGNMISGKGTFLDAWEAMEELVDEGLVKALGVSNFNHFQIERLLNKP 150 160 170 180 190 200 180 190 200 210 220 230 pF1KE4 SVR--PAVLQVECHPYLAQNELIAHCQARGLEVTAYSPLGSSDRAWRDPDEPVLLEEPVV ... :.. ::::::::.:..:: .:...:. ::::::::: :: : :..: :::.: . CCDS47 GLKYKPVTNQVECHPYLTQEKLIQYCHSKGITVTAYSPLGSPDRPWAKPEDPSLLEDPKI 210 220 230 240 250 260 240 250 260 270 280 290 pF1KE4 LALAEKYGRSPAQILLRWQVQRKVICIPKSITPSRILQNIKVFDFTFSPEEMKQLNALNK .: :. .. ::.:.:...::.: ::::.::..:..::.:::: .: ::: . ..:. CCDS47 KEIAAKHKKTTAQVLIRFHIQRNVTVIPKSMTPAHIVENIQVFDFKLSDEEMATILSFNR 270 280 290 300 310 320 300 310 320 pF1KE4 NWRYIVPMLTVDGKRVPRDAGHPLYPFNDPY ::: CCDS47 NWRAFDFKEFSHLEDFPFDAEY 330 340 >>CCDS7061.1 AKR1C1 gene_id:1645|Hs108|chr10 (323 aa) initn: 883 init1: 336 opt: 922 Z-score: 1141.5 bits: 219.5 E(32554): 2.9e-57 Smith-Waterman score: 922; 44.3% identity (72.8% similar) in 327 aa overlap (5-325:7-323) 10 20 30 40 50 pF1KE4 MAASCVLLHTGQKMPLIGLGTWK-SEPGQVKA--AVKYALSVGYRHIDCAAIYGNEPE :: :. :. ::..:.::. .: . :: :.: :. .:.:::: : .:.:: . CCDS70 MDSKYQCVKLNDGHFMPVLGFGTYAPAEVPKSKALEATKLAIEAGFRHIDSAHLYNNEEQ 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE4 IGEALKEDVGPGKAVPREELFVTSKLWNTKHHPEDVEPALRKTLADLQLEYLDLYLMHWP .: :.. .. : .: ::..: ::::: ..:.:: :.:::...: .:::.:.::::.:.: CCDS70 VGLAIRSKIADG-SVKREDIFYTSKLWCNSHRPELVRPALERSLKNLQLDYVDLYLIHFP 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE4 YAFERGDNPFPKNADGTICYDSTHYKETWKALEALVAKGLVQALGLSNFNSRQIDDILSV . . :.. .::. .: : .:.. ::.:.: ::....:.:::: ::.. ::. 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CCDS70 MDSKYQCVKLNDGHFMPVLGFGTYAPAEVPKSKALEAVKLAIEAGFHHIDSAHVYNNEEQ 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE4 IGEALKEDVGPGKAVPREELFVTSKLWNTKHHPEDVEPALRKTLADLQLEYLDLYLMHWP .: :.. .. : .: ::..: :::::...:.:: :.:::...: .:::.:.::::.:.: CCDS70 VGLAIRSKIADG-SVKREDIFYTSKLWSNSHRPELVRPALERSLKNLQLDYVDLYLIHFP 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE4 YAFERGDNPFPKNADGTICYDSTHYKETWKALEALVAKGLVQALGLSNFNSRQIDDILSV . . :.. .::. .: : .:.. ::.:.: ::....:.:::: : .. ::. CCDS70 VSVKPGEEVIPKDENGKILFDTVDLCATWEAMEKCKDAGLAKSIGVSNFNHRLLEMILNK 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE4 ASVR--PAVLQVECHPYLAQNELIAHCQARGLEVTAYSPLGSS-DRAWRDPDEPVLLEEP ... :. :::::::. : .:. :... . ..::: ::: .. : ::. :::::.: CCDS70 PGLKYKPVCNQVECHPYFNQRKLLDFCKSKDIVLVAYSALGSHREEPWVDPNSPVLLEDP 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE4 VVLALAEKYGRSPAQILLRWQVQRKVICIPKSITPSRILQNIKVFDFTFSPEEMKQLNAL :. :::.:. :.:: : ::.:.:: :. . :: . .:: ::..::.: .. :::: ...: CCDS70 VLCALAKKHKRTPALIALRYQLQRGVVVLAKSYNEQRIRQNVQVFEFQLTSEEMKAIDGL 240 250 260 270 280 290 300 310 320 pF1KE4 NKNWRYIVPMLTVDGKRVPRDAGHPLYPFNDPY :.: :: ::.: :: : :::.: : CCDS70 NRNVRY----LTLDIF-----AGPPNYPFSDEY 300 310 320 >>CCDS5846.1 AKR1D1 gene_id:6718|Hs108|chr7 (326 aa) initn: 870 init1: 327 opt: 914 Z-score: 1131.5 bits: 217.6 E(32554): 1e-56 Smith-Waterman score: 914; 43.8% identity (72.8% similar) in 331 aa overlap (2-325:6-326) 10 20 30 40 50 pF1KE4 MAASCVLLHTGQKMPLIGLGTW---KSEP-GQVKAAVKYALSVGYRHIDCAAIYGN :. . : :...:.:::::. :: : : ..:: :...:::::: : :: : CCDS58 MDLSAASHRIPLSDGNSIPIIGLGTYSEPKSTPKGACATSVKVAIDTGYRHIDGAYIYQN 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE4 EPEIGEALKEDVGPGKAVPREELFVTSKLWNTKHHPEDVEPALRKTLADLQLEYLDLYLM : :.:::..: .. :: : ::..: .::: :.: :: :.:.:..:: :::.:.:::.. CCDS58 EHEVGEAIREKIAEGK-VRREDIFYCGKLWATNHVPEMVRPTLERTLRVLQLDYVDLYII 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE4 HWPYAFERGDNPFPKNADGTICYDSTHYKETWKALEALVAKGLVQALGLSNFNSRQIDDI . :.::. ::. .:.. .: : ... ::.:.:: :::..::.:::: ::.. : CCDS58 EVPMAFKPGDEIYPRDENGKWLYHKSNLCATWEAMEACKDAGLVKSLGVSNFNRRQLELI 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 pF1KE4 LSVASVR--PAVLQVECHPYLAQNELIAHCQARGLEVTAYSPLGSS-DRAWRDPDEPVLL :. ... :. :::::::..: .:. :: . . .:::::::.: . : . . : :: CCDS58 LNKPGLKHKPVSNQVECHPYFTQPKLLKFCQQHDIVITAYSPLGTSRNPIWVNVSSPPLL 180 190 200 210 220 230 230 240 250 260 270 280 pF1KE4 EEPVVLALAEKYGRSPAQILLRWQVQRKVICIPKSITPSRILQNIKVFDFTFSPEEMKQL .. .. .:...:... :::.::...:: :. ::::.. :: .:...:::... ::::.. 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