FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB7845, 544 aa 1>>>pF1KB7845 544 - 544 aa - 544 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.7406+/-0.00038; mu= 9.9093+/- 0.024 mean_var=261.4867+/-52.252, 0's: 0 Z-trim(122.2): 1989 B-trim: 152 in 1/54 Lambda= 0.079314 statistics sampled from 37581 (39847) to 37581 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.779), E-opt: 0.2 (0.467), width: 16 Scan time: 10.860 The best scores are: opt bits E(85289) NP_005732 (OMIM: 604191) zinc finger protein 263 [ ( 683) 1077 136.8 2.2e-31 XP_011520646 (OMIM: 604191) PREDICTED: zinc finger ( 683) 1077 136.8 2.2e-31 XP_006720895 (OMIM: 604191) PREDICTED: zinc finger ( 644) 1063 135.1 6.3e-31 XP_006722621 (OMIM: 609601) PREDICTED: zinc finger ( 553) 1052 133.8 1.4e-30 XP_011524531 (OMIM: 609601) PREDICTED: zinc finger ( 553) 1052 133.8 1.4e-30 XP_011524532 (OMIM: 609601) PREDICTED: zinc finger ( 553) 1052 133.8 1.4e-30 XP_006720896 (OMIM: 604191) PREDICTED: zinc finger ( 598) 1052 133.8 1.4e-30 NP_085137 (OMIM: 611703) zinc finger protein 436 [ ( 470) 928 119.5 2.3e-26 NP_001070663 (OMIM: 611703) zinc finger protein 43 ( 470) 928 119.5 2.3e-26 XP_011540503 (OMIM: 611703) PREDICTED: zinc finger ( 452) 879 113.9 1.1e-24 NP_001092753 (OMIM: 601069) zinc finger protein 23 ( 458) 847 110.2 1.4e-23 XP_005271889 (OMIM: 601069) PREDICTED: zinc finger ( 458) 847 110.2 1.4e-23 XP_011538540 (OMIM: 601069) PREDICTED: zinc finger ( 458) 847 110.2 1.4e-23 NP_001311279 (OMIM: 601069) zinc finger protein 23 ( 458) 847 110.2 1.4e-23 NP_001311277 (OMIM: 601069) zinc finger protein 23 ( 458) 847 110.2 1.4e-23 NP_001311278 (OMIM: 601069) zinc finger protein 23 ( 458) 847 110.2 1.4e-23 XP_006718066 (OMIM: 601069) PREDICTED: zinc finger ( 458) 847 110.2 1.4e-23 NP_005665 (OMIM: 601069) zinc finger protein 239 i ( 458) 847 110.2 1.4e-23 NP_001092752 (OMIM: 601069) zinc finger protein 23 ( 458) 847 110.2 1.4e-23 NP_001311276 (OMIM: 601069) zinc finger protein 23 ( 458) 847 110.2 1.4e-23 NP_001311280 (OMIM: 601069) zinc finger protein 23 ( 458) 847 110.2 1.4e-23 NP_001092754 (OMIM: 601069) zinc finger protein 23 ( 458) 847 110.2 1.4e-23 XP_006718064 (OMIM: 601069) PREDICTED: zinc finger ( 500) 847 110.3 1.5e-23 XP_011538537 (OMIM: 601069) PREDICTED: zinc finger ( 500) 847 110.3 1.5e-23 XP_011538538 (OMIM: 601069) PREDICTED: zinc finger ( 500) 847 110.3 1.5e-23 XP_016872229 (OMIM: 601069) PREDICTED: zinc finger ( 500) 847 110.3 1.5e-23 XP_011538536 (OMIM: 601069) PREDICTED: zinc finger ( 500) 847 110.3 1.5e-23 NP_001311281 (OMIM: 601069) zinc finger protein 23 ( 500) 847 110.3 1.5e-23 XP_011538539 (OMIM: 601069) PREDICTED: zinc finger ( 500) 847 110.3 1.5e-23 NP_001311282 (OMIM: 601069) zinc finger protein 23 ( 571) 847 110.3 1.6e-23 XP_011538534 (OMIM: 601069) PREDICTED: zinc finger ( 602) 847 110.4 1.7e-23 XP_016880498 (OMIM: 194524) PREDICTED: zinc finger ( 548) 845 110.1 1.8e-23 XP_016880499 (OMIM: 194524) PREDICTED: zinc finger ( 548) 845 110.1 1.8e-23 XP_016880500 (OMIM: 194524) PREDICTED: zinc finger ( 548) 845 110.1 1.8e-23 NP_001290211 (OMIM: 194524) zinc finger protein 18 ( 548) 845 110.1 1.8e-23 XP_016880497 (OMIM: 194524) PREDICTED: zinc finger ( 548) 845 110.1 1.8e-23 XP_016880495 (OMIM: 194524) PREDICTED: zinc finger ( 549) 843 109.9 2.2e-23 XP_011522304 (OMIM: 194524) PREDICTED: zinc finger ( 549) 843 109.9 2.2e-23 XP_016880496 (OMIM: 194524) PREDICTED: zinc finger ( 549) 843 109.9 2.2e-23 NP_001290210 (OMIM: 194524) zinc finger protein 18 ( 549) 843 109.9 2.2e-23 NP_653281 (OMIM: 194524) zinc finger protein 18 is ( 549) 843 109.9 2.2e-23 XP_005272399 (OMIM: 601262) PREDICTED: zinc finger ( 542) 838 109.3 3.2e-23 XP_005272398 (OMIM: 601262) PREDICTED: zinc finger ( 682) 838 109.4 3.7e-23 XP_011515600 (OMIM: 601262) PREDICTED: zinc finger ( 682) 838 109.4 3.7e-23 NP_008889 (OMIM: 601262) zinc finger protein 16 [H ( 682) 838 109.4 3.7e-23 NP_001025147 (OMIM: 601262) zinc finger protein 16 ( 682) 838 109.4 3.7e-23 NP_037512 (OMIM: 603994) zinc finger protein 112 i ( 907) 840 109.8 3.7e-23 NP_001076804 (OMIM: 603994) zinc finger protein 11 ( 913) 840 109.8 3.8e-23 NP_001311074 (OMIM: 314995) zinc finger protein 41 ( 693) 837 109.3 4e-23 NP_001311068 (OMIM: 314995) zinc finger protein 41 ( 693) 837 109.3 4e-23 >>NP_005732 (OMIM: 604191) zinc finger protein 263 [Homo (683 aa) initn: 1863 init1: 384 opt: 1077 Z-score: 684.6 bits: 136.8 E(85289): 2.2e-31 Smith-Waterman score: 1125; 37.9% identity (60.1% similar) in 567 aa overlap (8-539:1-543) 10 20 30 40 50 pF1KB7 MLKEHPEMAEAP--QQQLGIPVVKLEKELPWGR----GREDPSPETFRLRFRQFRYQEAA :: .: :.. :. .::::.. :.. ::::. .::::.::.:::: NP_005 MASGPGSQEREGLLIVKLEEDCAWSQELPPPDPGPSPEASHLRFRRFRFQEAA 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KB7 GPQEALRELQELCRRWLRPELHTKEQILELLVLEQFLTILPREFYAWIREHGPESGKALA ::.::: .:::::. :::::..:::::::::::::::::::.:. . ..: ::::. . 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XP_011 IFTNKSLGKRDLYDEAERCLILTTDSIMCQKVPPEERPYRCDVCGHSFKQHSSLTQHQRI 270 280 290 300 310 320 340 350 360 370 380 390 pF1KB7 KTHSSFWKPFQCPECGKGFSRSSNLVRHQRTHE-EKSYGCVECGKGFTLREYLMKHQRTH .: ::..: .:::.:: : :. ::: : ::.: : ::::.:. :..:.. : XP_011 HTGE---KPYKCNQCGKAFSLRSYLIIHQRIHSGEKAYECSECGKAFNQSSALIRHRKIH 330 340 350 360 370 380 400 410 420 430 440 450 pF1KB7 LGKRPYVCSECWKTFSQRHHLEVHQRSHTGEKPYKCGDCWKSFSRRQHLQVHRRTHTGEK :.. :.:: :.::: .: .::: :::::::.:..: :.::. ..: :.: ::::. XP_011 TGEKACKCNECGKAFSQSSYLIIHQRIHTGEKPYECNECGKTFSQSSKLIRHQRIHTGER 390 400 410 420 430 440 460 470 480 490 500 510 pF1KB7 PYTC-ECGKSFSRNANLAVHRRAHTGEKPYGCQVCGKRFSKGERLVRHQRIHTGEKPYHC :: : ::::.: ....: .:.: :.::::: :. ::: :: . :.::::::.::.::.: XP_011 PYECNECGKAFRQSSELITHQRIHSGEKPYECSECGKAFSLSSNLIRHQRIHSGEEPYQC 450 460 470 480 490 500 520 530 540 pF1KB7 PACGRSFNQRSILNRHQKTQHRQEPLVQ ::..:.. : : .::. . .: . 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