FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE4406, 421 aa 1>>>pF1KE4406 421 - 421 aa - 421 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.5415+/-0.000957; mu= 15.2657+/- 0.057 mean_var=54.2007+/-10.805, 0's: 0 Z-trim(102.9): 34 B-trim: 2 in 1/47 Lambda= 0.174210 statistics sampled from 7149 (7173) to 7149 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.585), E-opt: 0.2 (0.22), width: 16 Scan time: 1.380 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS668.1 ACADM gene_id:34|Hs108|chr1 ( 421) 2801 712.2 2.4e-205 CCDS44165.1 ACADM gene_id:34|Hs108|chr1 ( 425) 2783 707.7 5.5e-204 CCDS65562.1 ACADM gene_id:34|Hs108|chr1 ( 385) 2517 640.8 6.7e-184 CCDS72807.1 ACADM gene_id:34|Hs108|chr1 ( 454) 2150 548.6 4.6e-156 CCDS9207.1 ACADS gene_id:35|Hs108|chr12 ( 412) 895 233.1 3.7e-61 CCDS7634.1 ACADSB gene_id:36|Hs108|chr10 ( 432) 832 217.3 2.3e-56 CCDS8498.1 ACAD8 gene_id:27034|Hs108|chr11 ( 415) 793 207.5 2e-53 CCDS10057.2 IVD gene_id:3712|Hs108|chr15 ( 426) 780 204.2 1.9e-52 CCDS81518.1 ACADSB gene_id:36|Hs108|chr10 ( 330) 744 195.2 8e-50 CCDS76610.1 ACADS gene_id:35|Hs108|chr12 ( 408) 734 192.7 5.6e-49 CCDS3053.1 ACAD9 gene_id:28976|Hs108|chr3 ( 621) 731 191.9 1.4e-48 CCDS2389.1 ACADL gene_id:33|Hs108|chr2 ( 430) 720 189.2 6.7e-48 CCDS53930.1 IVD gene_id:3712|Hs108|chr15 ( 396) 709 186.4 4.2e-47 CCDS42249.1 ACADVL gene_id:37|Hs108|chr17 ( 633) 636 168.1 2.2e-41 CCDS11090.1 ACADVL gene_id:37|Hs108|chr17 ( 655) 636 168.1 2.3e-41 CCDS58509.1 ACADVL gene_id:37|Hs108|chr17 ( 678) 636 168.1 2.4e-41 CCDS12286.1 GCDH gene_id:2639|Hs108|chr19 ( 438) 489 131.1 2.1e-30 CCDS31903.1 ACAD10 gene_id:80724|Hs108|chr12 (1059) 446 120.3 8.6e-27 CCDS44973.1 ACAD10 gene_id:80724|Hs108|chr12 (1090) 446 120.3 8.9e-27 CCDS3074.1 ACAD11 gene_id:84129|Hs108|chr3 ( 780) 444 119.8 9.1e-27 >>CCDS668.1 ACADM gene_id:34|Hs108|chr1 (421 aa) initn: 2801 init1: 2801 opt: 2801 Z-score: 3800.2 bits: 712.2 E(32554): 2.4e-205 Smith-Waterman score: 2801; 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CCDS92 MAAALLARASGPARRALCPRAWRQLHTIYQ---------SVELPETHQMLLQTCRDFAEK 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE4 EIIPVAAEYDKTGEYPVPLIRRAWELGLMNTHIPENCGGLGLGTFDACLISEELAYGC-- :..:.::. :: .:. ... :::. .::. :: :: . . ::.. :: CCDS92 ELFPIAAQVDKEHLFPAAQVKKMGGLGLLAMDVPEELGGAGLDYLAYAIAMEEISRGCAS 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE4 TGVQTAIEGNSLGQMPIIIAGNDQQKKKYLGRMTEEPLMCAYCVTEPGAGSDVAGIKTKA ::: ... ::: ::. :. .::. .. .: . . ..::: :::... .: : CCDS92 TGVIMSVN-NSLYLGPILKFGSKEQKQAWVTPFTSGDKIGCFALSEPGNGSDAGAASTTA 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE4 EKKGDEYIINGQKMWITNGGKANWYFLLARSDPDPKAPANKAFTGFIVEADTPGIQIGRK . .:: ...:: : ::::. .:. ..: .: .: ::....:.: :::. .:.: CCDS92 RAEGDSWVLNGTKAWITNAWEASAAVVFASTD---RALQNKGISAFLVPMPTPGLTLGKK 180 190 200 210 220 240 250 260 270 280 290 pF1KE4 ELNMGQRCSDTRGIVFEDVKVPKENVLIGDGAGFKVAMGAFDKTRPVVAAGVVGLAQRAL : ..: : :.: ...::: ..::...: : :::.:: ..: : .:. ..:.:: :: CCDS92 EDKLGIRGSSTANLIFEDCRIPKDSILGEPGMGFKIAMQTLDMGRIGIASQALGIAQTAL 230 240 250 260 270 280 300 310 320 330 340 350 pF1KE4 DEATKYALERKTFGKLLVEHQAISFMLAEMAMKVELARMSYQRAAWEVDSGRRNTYYASI : :..:: .: .:: :.. :.:.: ::.::. .: ::. ::: :. . :.. CCDS92 DCAVNYAENRMAFGAPLTKLQVIQFKLADMALALESARLLTWRAAMLKDNKKPFIKEAAM 290 300 310 320 330 340 360 370 380 390 400 410 pF1KE4 AKAFAGDIANQLATDAVQILGGNGFNTEYPVEKLMRDAKIYQIYEGTSQIQRLIVAREHI :: :.. :. .. .:.::::: :. ::.:.:. .:::.: .::::::.::::..: . . CCDS92 AKLAASEAATAISHQAIQILGGMGYVTEMPAERHYRDARITEIYEGTSEIQRLVIAGHLL 350 360 370 380 390 400 420 pF1KE4 DKYKN .:.. CCDS92 RSYRS 410 >>CCDS7634.1 ACADSB gene_id:36|Hs108|chr10 (432 aa) initn: 780 init1: 490 opt: 832 Z-score: 1125.5 bits: 217.3 E(32554): 2.3e-56 Smith-Waterman score: 832; 36.2% identity (68.5% similar) in 409 aa overlap (20-417:26-429) 10 20 30 40 pF1KE4 MAAGFGRCCRVLRSISRFHWR-SQHTKANRQREPGL-----GFSFE----FTEQ :. :.. . : : : :. : ::.. CCDS76 MEGLAVRLLRGSRLLRRNFLTCLSSWKIPPHVSKSSQSEALLNITNNGIHFAPLQTFTDE 10 20 30 40 50 60 50 60 70 80 90 100 pF1KE4 QKEFQATARKFAREEIIPVAAEYDKTGEYPVPLIRRAWELGLMNTHIPENCGGLGLGTFD . ......:::.:.: :... .:..... .:. .. :::. .. . :: : . .. CCDS76 EMMIKSSVKKFAQEQIAPLVSTMDENSKMEKSVIQGLFQQGLMGIEVDPEYGGTGASFLS 70 80 90 100 110 120 110 120 130 140 150 160 pF1KE4 ACLISEELAYGCTGVQTAIE-GNSLGQMPIIIAGNDQQKKKYLGRMTEEPLMCAYCVTEP . :. :::: ..: . : :.: . : :...:: :: ..: : . ..:..: CCDS76 TVLVIEELAKVDASVAVFCEIQNTLINTLIRKHGTEEQKATYLPQLTTEKVG-SFCLSEA 130 140 150 160 170 170 180 190 200 210 220 pF1KE4 GAGSDVAGIKTKAEKKGDEYIINGQKMWITNGGKANWYFLLARSDPDPKAPANKAFTGFI ::::: ..::.:.:.:: :..::.::::... .:. ....: :: . . :..:.:. CCDS76 GAGSDSFALKTRADKEGDYYVLNGSKMWISSAEHAGLFLVMANVDP---TIGYKGITSFL 180 190 200 210 220 230 230 240 250 260 270 280 pF1KE4 VEADTPGIQIGRKELNMGQRCSDTRGIVFEDVKVPKENVLIGDGAGFKVAMGAFDKTRPV :. ::::..::. : ..: : :.: ..::.::::. :.: : :.: :.:.... : CCDS76 VDRDTPGLHIGKPENKLGLRASSTCPLTFENVKVPEANILGQIGHGYKYAIGSLNEGRIG 240 250 260 270 280 290 290 300 310 320 330 340 pF1KE4 VAAGVVGLAQRALDEATKYALERKTFGKLLVEHQAISFMLAEMAMKVELARMSYQRAAWE .:: ..:::: .: . : :: ::: : . :... ..:..: ..: ::. :: CCDS76 IAAQMLGLAQGCFDYTIPYIKERIQFGKRLFDFQGLQHQVAHVATQLEAARLLTYNAARL 300 310 320 330 340 350 350 360 370 380 390 400 pF1KE4 VDSGRRNTYYASIAKAFAGDIANQLATDAVQILGGNGFNTEYPVEKLMRDAKIYQIYEGT ...:. ::.:: .:..::.: .. .. .:: :.. .::::: .::::: ::::. CCDS76 LEAGKPFIKEASMAKYYASEIAGQTTSKCIEWMGGVGYTKDYPVEKYFRDAKIGTIYEGA 360 370 380 390 400 410 410 420 pF1KE4 SQIQRLIVAREHIDKYKN :.:: .:. ::: CCDS76 SNIQLNTIAK-HIDAEY 420 430 >>CCDS8498.1 ACAD8 gene_id:27034|Hs108|chr11 (415 aa) initn: 772 init1: 400 opt: 793 Z-score: 1072.8 bits: 207.5 E(32554): 2e-53 Smith-Waterman score: 793; 33.7% identity (68.1% similar) in 383 aa overlap (32-413:36-410) 10 20 30 40 50 60 pF1KE4 AAGFGRCCRVLRSISRFHWRSQHTKANRQREPGLGFSFEFTEQQKEFQATARKFAREEII .:..:.. :.::::: .: :: .:. CCDS84 CRRFGARLGCLPGGLRVLVQTGHRSLTSCIDPSMGLN----EEQKEFQKVAFDFAAREMA 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE4 PVAAEYDKTGEYPVPLIRRAWELGLMNTHIPENCGGLGLGTFDACLISEELAYGCTGVQT : ::.:. .:: ..:.: .::. ...: . :: ::. .:. .: : :: :::.. . CCDS84 PNMAEWDQKELFPVDVMRKAAQLGFGGVYIQTDVGGSGLSRLDTSVIFEALATGCTSTTA 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE4 AIEGNSLGQMPIIIAGNDQQKKKYLGRMTEEPLMCAYCVTEPGAGSDVAGIKTKAEKKGD : ... : ::..:..:. . . .::.::::.:::.:.. :.:.:.:: CCDS84 YISIHNMCAWMIDSFGNEEQRHKFCPPLCTMEKFASYCLTEPGSGSDAASLLTSAKKQGD 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE4 EYIINGQKMWITNGGKANWYFLLARSDPDPKAPANKAFTGFIVEADTPGIQIGRKELNMG .::.::.: .:...:... : .. :. .:. :... ..:: :::...:.:: ..: CCDS84 HYILNGSKAFISGAGESDIYVVMCRTG----GPGPKGISCIVVEKGTPGLSFGKKEKKVG 190 200 210 220 230 250 260 270 280 290 300 pF1KE4 QRCSDTRGIVFEDVKVPKENVLIGDGAGFKVAMGAFDKTRPVVAAGVVGLAQRALDEATK . ::...::: :: : . ..: :: .:. ... : .:. .: :. .. . CCDS84 WNSQPTRAVIFEDCAVPVANRIGSEGQGFLIAVRGLNGGRINIASCSLGAAHASVILTRD 240 250 260 270 280 290 310 320 330 340 350 360 pF1KE4 YALERKTFGKLLVEHQAISFMLAEMAMKVELARMSYQRAAWEVDSGRRNTY-YASIAKAF . :: ::. :. .: ..: ::.:: .. ::. . :: .. :... :.:: : CCDS84 HLNVRKQFGEPLASNQYLQFTLADMATRLVAARLMVRNAAVALQEERKDAVALCSMAKLF 300 310 320 330 340 350 370 380 390 400 410 420 pF1KE4 AGDIANQLATDAVQILGGNGFNTEYPVEKLMRDAKIYQIYEGTSQIQRLIVAREHIDKYK : : . ..:.:. :: :. .: :.. .::....:: ::.....:....: CCDS84 ATDECFAICNQALQMHGGYGYLKDYAVQQYVRDSRVHQILEGSNEVMRILISRSLLQE 360 370 380 390 400 410 pF1KE4 N >>CCDS10057.2 IVD gene_id:3712|Hs108|chr15 (426 aa) initn: 658 init1: 434 opt: 780 Z-score: 1055.0 bits: 204.2 E(32554): 1.9e-52 Smith-Waterman score: 780; 34.6% identity (67.8% similar) in 379 aa overlap (41-413:45-419) 20 30 40 50 60 70 pF1KE4 VLRSISRFHWRSQHTKANRQREPGLGFSFEFTEQQKEFQATARKFAREEIIPVAAEYDKT ..:.:.... : :: .:.. : : : :.. 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CCDS10 VREAFGQKIGHFQLMQGKMADMYTRLMACRQYVYNVAKACDEGHCTAKDCAGVILYSAEC 320 330 340 350 360 370 370 380 390 400 410 420 pF1KE4 ANQLATDAVQILGGNGFNTEYPVEKLMRDAKIYQIYEGTSQIQRLIVAREHIDKYKN :.:.: :..: .::::. ...:. ...::::.:.: :::...::...: CCDS10 ATQVALDGIQCFGGNGYINDFPMGRFLRDAKLYEIGAGTSEVRRLVIGRAFNADFH 380 390 400 410 420 >>CCDS81518.1 ACADSB gene_id:36|Hs108|chr10 (330 aa) initn: 688 init1: 490 opt: 744 Z-score: 1008.0 bits: 195.2 E(32554): 8e-50 Smith-Waterman score: 744; 38.9% identity (69.9% similar) in 332 aa overlap (87-417:1-327) 60 70 80 90 100 110 pF1KE4 REEIIPVAAEYDKTGEYPVPLIRRAWELGLMNTHIPENCGGLGLGTFDACLISEELAYGC :. .. . :: : . ... :. :::: CCDS81 MGIEVDPEYGGTGASFLSTVLVIEELAKVD 10 20 30 120 130 140 150 160 170 pF1KE4 TGVQTAIE-GNSLGQMPIIIAGNDQQKKKYLGRMTEEPLMCAYCVTEPGAGSDVAGIKTK ..: . : :.: . : :...:: :: ..: : . ..:..: ::::: ..::. 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CCDS81 ADKEGDYYVLNGSKMWISSAEHAGLFLVMANVDP---TIGYKGITSFLVDRDTPGLHIGK 90 100 110 120 130 140 240 250 260 270 280 290 pF1KE4 KELNMGQRCSDTRGIVFEDVKVPKENVLIGDGAGFKVAMGAFDKTRPVVAAGVVGLAQRA : ..: : :.: ..::.::::. :.: : :.: :.:.... : .:: ..:::: CCDS81 PENKLGLRASSTCPLTFENVKVPEANILGQIGHGYKYAIGSLNEGRIGIAAQMLGLAQGC 150 160 170 180 190 200 300 310 320 330 340 350 pF1KE4 LDEATKYALERKTFGKLLVEHQAISFMLAEMAMKVELARMSYQRAAWEVDSGRRNTYYAS .: . : :: ::: : . :... ..:..: ..: ::. :: ...:. :: CCDS81 FDYTIPYIKERIQFGKRLFDFQGLQHQVAHVATQLEAARLLTYNAARLLEAGKPFIKEAS 210 220 230 240 250 260 360 370 380 390 400 410 pF1KE4 IAKAFAGDIANQLATDAVQILGGNGFNTEYPVEKLMRDAKIYQIYEGTSQIQRLIVAREH .:: .:..::.: .. .. .:: :.. .::::: .::::: ::::.:.:: .:. : CCDS81 MAKYYASEIAGQTTSKCIEWMGGVGYTKDYPVEKYFRDAKIGTIYEGASNIQLNTIAK-H 270 280 290 300 310 320 420 pF1KE4 IDKYKN :: CCDS81 IDAEY 330 >>CCDS76610.1 ACADS gene_id:35|Hs108|chr12 (408 aa) initn: 738 init1: 516 opt: 734 Z-score: 992.8 bits: 192.7 E(32554): 5.6e-49 Smith-Waterman score: 737; 34.1% identity (62.0% similar) in 413 aa overlap (13-421:15-408) 10 20 30 40 50 pF1KE4 MAAGFGRCCRVLRSISRFHWRSQHTKANRQREPGLGFSFEFTEQQKEFQATARKFARE :.. ::. :: . : :. : .. . : : ::.. CCDS76 MAAALLARASGPARRALCPRAWRQLHTIYQ---------SVELPETHQMLLQTCRDFAEK 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE4 EIIPVAAEYDKTGEYPVPLIRRAWELGLMNTHIPENCGGLGLGTFDACLISEELAYGC-- :..:.::. :: .:. ... :::. .::. :: :: . . ::.. :: CCDS76 ELFPIAAQVDKEHLFPAAQVKKMGGLGLLAMDVPEELGGAGLDYLAYAIAMEEISRGCAS 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE4 TGVQTAIEGNSLGQMPIIIAGNDQQKKKYLGRMTEEPLMCAYCVTEPGAGSDVAGIKTKA ::: ... ::: ::. :. .::. .. .: . . ..::: . . : CCDS76 TGVIMSVN-NSLYLGPILKFGSKEQKQAWVTPFTSGDKIGCFALSEPGPS--LLG----- 120 130 140 150 160 180 190 200 210 220 230 pF1KE4 EKKGDEYIINGQKMWITNGGKANWYFLLARSDPDPKAPA--NKAFTGFIVEADTPGIQIG : . . :: .. :. . :: . : .....:.: :::. .: CCDS76 -PTGPIFAL-GQVGCPCPSSAATEACTFPRSRQRVSRPELLREGISAFLVPMPTPGLTLG 170 180 190 200 210 220 240 250 260 270 280 290 pF1KE4 RKELNMGQRCSDTRGIVFEDVKVPKENVLIGDGAGFKVAMGAFDKTRPVVAAGVVGLAQR .:: ..: : :.: ...::: ..::...: : :::.:: ..: : .:. ..:.:: CCDS76 KKEDKLGIRGSSTANLIFEDCRIPKDSILGEPGMGFKIAMQTLDMGRIGIASQALGIAQT 230 240 250 260 270 280 300 310 320 330 340 350 pF1KE4 ALDEATKYALERKTFGKLLVEHQAISFMLAEMAMKVELARMSYQRAAWEVDSGRRNTYYA ::: :..:: .: .:: :.. :.:.: ::.::. .: ::. ::: :. . : CCDS76 ALDCAVNYAENRMAFGAPLTKLQVIQFKLADMALALESARLLTWRAAMLKDNKKPFIKEA 290 300 310 320 330 340 360 370 380 390 400 410 pF1KE4 SIAKAFAGDIANQLATDAVQILGGNGFNTEYPVEKLMRDAKIYQIYEGTSQIQRLIVARE ..:: :.. :. .. .:.::::: :. ::.:.:. .:::.: .::::::.::::..: . CCDS76 AMAKLAASEAATAISHQAIQILGGMGYVTEMPAERHYRDARITEIYEGTSEIQRLVIAGH 350 360 370 380 390 400 420 pF1KE4 HIDKYKN . .:.. CCDS76 LLRSYRS 421 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Sun Nov 6 01:19:13 2016 done: Sun Nov 6 01:19:14 2016 Total Scan time: 1.380 Total Display time: 0.030 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]