Result of FASTA (ccds) for pFN21AE4406
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KE4406, 421 aa
  1>>>pF1KE4406 421 - 421 aa - 421 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.5415+/-0.000957; mu= 15.2657+/- 0.057
 mean_var=54.2007+/-10.805, 0's: 0 Z-trim(102.9): 34  B-trim: 2 in 1/47
 Lambda= 0.174210
 statistics sampled from 7149 (7173) to 7149 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.585), E-opt: 0.2 (0.22), width:  16
 Scan time:  1.380

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS668.1 ACADM gene_id:34|Hs108|chr1              ( 421) 2801 712.2 2.4e-205
CCDS44165.1 ACADM gene_id:34|Hs108|chr1            ( 425) 2783 707.7 5.5e-204
CCDS65562.1 ACADM gene_id:34|Hs108|chr1            ( 385) 2517 640.8 6.7e-184
CCDS72807.1 ACADM gene_id:34|Hs108|chr1            ( 454) 2150 548.6 4.6e-156
CCDS9207.1 ACADS gene_id:35|Hs108|chr12            ( 412)  895 233.1 3.7e-61
CCDS7634.1 ACADSB gene_id:36|Hs108|chr10           ( 432)  832 217.3 2.3e-56
CCDS8498.1 ACAD8 gene_id:27034|Hs108|chr11         ( 415)  793 207.5   2e-53
CCDS10057.2 IVD gene_id:3712|Hs108|chr15           ( 426)  780 204.2 1.9e-52
CCDS81518.1 ACADSB gene_id:36|Hs108|chr10          ( 330)  744 195.2   8e-50
CCDS76610.1 ACADS gene_id:35|Hs108|chr12           ( 408)  734 192.7 5.6e-49
CCDS3053.1 ACAD9 gene_id:28976|Hs108|chr3          ( 621)  731 191.9 1.4e-48
CCDS2389.1 ACADL gene_id:33|Hs108|chr2             ( 430)  720 189.2 6.7e-48
CCDS53930.1 IVD gene_id:3712|Hs108|chr15           ( 396)  709 186.4 4.2e-47
CCDS42249.1 ACADVL gene_id:37|Hs108|chr17          ( 633)  636 168.1 2.2e-41
CCDS11090.1 ACADVL gene_id:37|Hs108|chr17          ( 655)  636 168.1 2.3e-41
CCDS58509.1 ACADVL gene_id:37|Hs108|chr17          ( 678)  636 168.1 2.4e-41
CCDS12286.1 GCDH gene_id:2639|Hs108|chr19          ( 438)  489 131.1 2.1e-30
CCDS31903.1 ACAD10 gene_id:80724|Hs108|chr12       (1059)  446 120.3 8.6e-27
CCDS44973.1 ACAD10 gene_id:80724|Hs108|chr12       (1090)  446 120.3 8.9e-27
CCDS3074.1 ACAD11 gene_id:84129|Hs108|chr3         ( 780)  444 119.8 9.1e-27


>>CCDS668.1 ACADM gene_id:34|Hs108|chr1                   (421 aa)
 initn: 2801 init1: 2801 opt: 2801  Z-score: 3800.2  bits: 712.2 E(32554): 2.4e-205
Smith-Waterman score: 2801; 99.8% identity (100.0% similar) in 421 aa overlap (1-421:1-421)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE4 MAAGFGRCCRVLRSISRFHWRSQHTKANRQREPGLGFSFEFTEQQKEFQATARKFAREEI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 MAAGFGRCCRVLRSISRFHWRSQHTKANRQREPGLGFSFEFTEQQKEFQATARKFAREEI
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE4 IPVAAEYDKTGEYPVPLIRRAWELGLMNTHIPENCGGLGLGTFDACLISEELAYGCTGVQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 IPVAAEYDKTGEYPVPLIRRAWELGLMNTHIPENCGGLGLGTFDACLISEELAYGCTGVQ
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE4 TAIEGNSLGQMPIIIAGNDQQKKKYLGRMTEEPLMCAYCVTEPGAGSDVAGIKTKAEKKG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 TAIEGNSLGQMPIIIAGNDQQKKKYLGRMTEEPLMCAYCVTEPGAGSDVAGIKTKAEKKG
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE4 DEYIINGQKMWITNGGKANWYFLLARSDPDPKAPANKAFTGFIVEADTPGIQIGRKELNM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 DEYIINGQKMWITNGGKANWYFLLARSDPDPKAPANKAFTGFIVEADTPGIQIGRKELNM
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE4 GQRCSDTRGIVFEDVKVPKENVLIGDGAGFKVAMGAFDKTRPVVAAGVVGLAQRALDEAT
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::
CCDS66 GQRCSDTRGIVFEDVKVPKENVLIGDGAGFKVAMGAFDKTRPVVAAGAVGLAQRALDEAT
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE4 KYALERKTFGKLLVEHQAISFMLAEMAMKVELARMSYQRAAWEVDSGRRNTYYASIAKAF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 KYALERKTFGKLLVEHQAISFMLAEMAMKVELARMSYQRAAWEVDSGRRNTYYASIAKAF
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KE4 AGDIANQLATDAVQILGGNGFNTEYPVEKLMRDAKIYQIYEGTSQIQRLIVAREHIDKYK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 AGDIANQLATDAVQILGGNGFNTEYPVEKLMRDAKIYQIYEGTSQIQRLIVAREHIDKYK
              370       380       390       400       410       420

        
pF1KE4 N
       :
CCDS66 N
        

>>CCDS44165.1 ACADM gene_id:34|Hs108|chr1                 (425 aa)
 initn: 2721 init1: 2721 opt: 2783  Z-score: 3775.7  bits: 707.7 E(32554): 5.5e-204
Smith-Waterman score: 2783; 98.8% identity (99.1% similar) in 425 aa overlap (1-421:1-425)

               10            20        30        40        50      
pF1KE4 MAAGFGRCCR----VLRSISRFHWRSQHTKANRQREPGLGFSFEFTEQQKEFQATARKFA
       ::::::::::    ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 MAAGFGRCCRCSLQVLRSISRFHWRSQHTKANRQREPGLGFSFEFTEQQKEFQATARKFA
               10        20        30        40        50        60

         60        70        80        90       100       110      
pF1KE4 REEIIPVAAEYDKTGEYPVPLIRRAWELGLMNTHIPENCGGLGLGTFDACLISEELAYGC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 REEIIPVAAEYDKTGEYPVPLIRRAWELGLMNTHIPENCGGLGLGTFDACLISEELAYGC
               70        80        90       100       110       120

        120       130       140       150       160       170      
pF1KE4 TGVQTAIEGNSLGQMPIIIAGNDQQKKKYLGRMTEEPLMCAYCVTEPGAGSDVAGIKTKA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 TGVQTAIEGNSLGQMPIIIAGNDQQKKKYLGRMTEEPLMCAYCVTEPGAGSDVAGIKTKA
              130       140       150       160       170       180

        180       190       200       210       220       230      
pF1KE4 EKKGDEYIINGQKMWITNGGKANWYFLLARSDPDPKAPANKAFTGFIVEADTPGIQIGRK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 EKKGDEYIINGQKMWITNGGKANWYFLLARSDPDPKAPANKAFTGFIVEADTPGIQIGRK
              190       200       210       220       230       240

        240       250       260       270       280       290      
pF1KE4 ELNMGQRCSDTRGIVFEDVKVPKENVLIGDGAGFKVAMGAFDKTRPVVAAGVVGLAQRAL
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::
CCDS44 ELNMGQRCSDTRGIVFEDVKVPKENVLIGDGAGFKVAMGAFDKTRPVVAAGAVGLAQRAL
              250       260       270       280       290       300

        300       310       320       330       340       350      
pF1KE4 DEATKYALERKTFGKLLVEHQAISFMLAEMAMKVELARMSYQRAAWEVDSGRRNTYYASI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 DEATKYALERKTFGKLLVEHQAISFMLAEMAMKVELARMSYQRAAWEVDSGRRNTYYASI
              310       320       330       340       350       360

        360       370       380       390       400       410      
pF1KE4 AKAFAGDIANQLATDAVQILGGNGFNTEYPVEKLMRDAKIYQIYEGTSQIQRLIVAREHI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 AKAFAGDIANQLATDAVQILGGNGFNTEYPVEKLMRDAKIYQIYEGTSQIQRLIVAREHI
              370       380       390       400       410       420

        420 
pF1KE4 DKYKN
       :::::
CCDS44 DKYKN
            

>>CCDS65562.1 ACADM gene_id:34|Hs108|chr1                 (385 aa)
 initn: 2517 init1: 2517 opt: 2517  Z-score: 3415.1  bits: 640.8 E(32554): 6.7e-184
Smith-Waterman score: 2517; 99.7% identity (100.0% similar) in 382 aa overlap (40-421:4-385)

      10        20        30        40        50        60         
pF1KE4 RVLRSISRFHWRSQHTKANRQREPGLGFSFEFTEQQKEFQATARKFAREEIIPVAAEYDK
                                     ::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65                            MLQEFTEQQKEFQATARKFAREEIIPVAAEYDK
                                          10        20        30   

      70        80        90       100       110       120         
pF1KE4 TGEYPVPLIRRAWELGLMNTHIPENCGGLGLGTFDACLISEELAYGCTGVQTAIEGNSLG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 TGEYPVPLIRRAWELGLMNTHIPENCGGLGLGTFDACLISEELAYGCTGVQTAIEGNSLG
            40        50        60        70        80        90   

     130       140       150       160       170       180         
pF1KE4 QMPIIIAGNDQQKKKYLGRMTEEPLMCAYCVTEPGAGSDVAGIKTKAEKKGDEYIINGQK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 QMPIIIAGNDQQKKKYLGRMTEEPLMCAYCVTEPGAGSDVAGIKTKAEKKGDEYIINGQK
           100       110       120       130       140       150   

     190       200       210       220       230       240         
pF1KE4 MWITNGGKANWYFLLARSDPDPKAPANKAFTGFIVEADTPGIQIGRKELNMGQRCSDTRG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 MWITNGGKANWYFLLARSDPDPKAPANKAFTGFIVEADTPGIQIGRKELNMGQRCSDTRG
           160       170       180       190       200       210   

     250       260       270       280       290       300         
pF1KE4 IVFEDVKVPKENVLIGDGAGFKVAMGAFDKTRPVVAAGVVGLAQRALDEATKYALERKTF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::
CCDS65 IVFEDVKVPKENVLIGDGAGFKVAMGAFDKTRPVVAAGAVGLAQRALDEATKYALERKTF
           220       230       240       250       260       270   

     310       320       330       340       350       360         
pF1KE4 GKLLVEHQAISFMLAEMAMKVELARMSYQRAAWEVDSGRRNTYYASIAKAFAGDIANQLA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 GKLLVEHQAISFMLAEMAMKVELARMSYQRAAWEVDSGRRNTYYASIAKAFAGDIANQLA
           280       290       300       310       320       330   

     370       380       390       400       410       420 
pF1KE4 TDAVQILGGNGFNTEYPVEKLMRDAKIYQIYEGTSQIQRLIVAREHIDKYKN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 TDAVQILGGNGFNTEYPVEKLMRDAKIYQIYEGTSQIQRLIVAREHIDKYKN
           340       350       360       370       380     

>>CCDS72807.1 ACADM gene_id:34|Hs108|chr1                 (454 aa)
 initn: 2143 init1: 2143 opt: 2150  Z-score: 2915.4  bits: 548.6 E(32554): 4.6e-156
Smith-Waterman score: 2718; 92.5% identity (92.7% similar) in 453 aa overlap (2-421:2-454)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE4 MAAGFGRCCRVLRSISRFHWRSQHTKANRQREPGLGFSFEFTEQQKEFQATARKFAREEI
        :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 MAAGFGRCCRVLRSISRFHWRSQHTKANRQREPGLGFSFEFTEQQKEFQATARKFAREEI
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90                              
pF1KE4 IPVAAEYDKTGEYPVPLIRRAWELGLMNTHIPENC-------------------------
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::                         
CCDS72 IPVAAEYDKTGEYPVPLIRRAWELGLMNTHIPENCDYSVCPLLEACTLYLDAFFLLLTGS
               70        80        90       100       110       120

                 100       110       120       130       140       
pF1KE4 --------GGLGLGTFDACLISEELAYGCTGVQTAIEGNSLGQMPIIIAGNDQQKKKYLG
               ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 NLNLHLNLGGLGLGTFDACLISEELAYGCTGVQTAIEGNSLGQMPIIIAGNDQQKKKYLG
              130       140       150       160       170       180

       150       160       170       180       190       200       
pF1KE4 RMTEEPLMCAYCVTEPGAGSDVAGIKTKAEKKGDEYIINGQKMWITNGGKANWYFLLARS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 RMTEEPLMCAYCVTEPGAGSDVAGIKTKAEKKGDEYIINGQKMWITNGGKANWYFLLARS
              190       200       210       220       230       240

       210       220       230       240       250       260       
pF1KE4 DPDPKAPANKAFTGFIVEADTPGIQIGRKELNMGQRCSDTRGIVFEDVKVPKENVLIGDG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 DPDPKAPANKAFTGFIVEADTPGIQIGRKELNMGQRCSDTRGIVFEDVKVPKENVLIGDG
              250       260       270       280       290       300

       270       280       290       300       310       320       
pF1KE4 AGFKVAMGAFDKTRPVVAAGVVGLAQRALDEATKYALERKTFGKLLVEHQAISFMLAEMA
       ::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 AGFKVAMGAFDKTRPVVAAGAVGLAQRALDEATKYALERKTFGKLLVEHQAISFMLAEMA
              310       320       330       340       350       360

       330       340       350       360       370       380       
pF1KE4 MKVELARMSYQRAAWEVDSGRRNTYYASIAKAFAGDIANQLATDAVQILGGNGFNTEYPV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 MKVELARMSYQRAAWEVDSGRRNTYYASIAKAFAGDIANQLATDAVQILGGNGFNTEYPV
              370       380       390       400       410       420

       390       400       410       420 
pF1KE4 EKLMRDAKIYQIYEGTSQIQRLIVAREHIDKYKN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 EKLMRDAKIYQIYEGTSQIQRLIVAREHIDKYKN
              430       440       450    

>>CCDS9207.1 ACADS gene_id:35|Hs108|chr12                 (412 aa)
 initn: 720 init1: 543 opt: 895  Z-score: 1211.4  bits: 233.1 E(32554): 3.7e-61
Smith-Waterman score: 898; 37.2% identity (66.7% similar) in 411 aa overlap (13-421:15-412)

                 10        20        30        40        50        
pF1KE4   MAAGFGRCCRVLRSISRFHWRSQHTKANRQREPGLGFSFEFTEQQKEFQATARKFARE
                     :..    ::. ::  .         : :. : .. .  : : ::..
CCDS92 MAAALLARASGPARRALCPRAWRQLHTIYQ---------SVELPETHQMLLQTCRDFAEK
               10        20        30                 40        50 

       60        70        80        90       100       110        
pF1KE4 EIIPVAAEYDKTGEYPVPLIRRAWELGLMNTHIPENCGGLGLGTFDACLISEELAYGC--
       :..:.::. ::   .:.  ...   :::.   .::. :: ::  .   .  ::.. ::  
CCDS92 ELFPIAAQVDKEHLFPAAQVKKMGGLGLLAMDVPEELGGAGLDYLAYAIAMEEISRGCAS
              60        70        80        90       100       110 

        120       130       140       150       160       170      
pF1KE4 TGVQTAIEGNSLGQMPIIIAGNDQQKKKYLGRMTEEPLMCAYCVTEPGAGSDVAGIKTKA
       :::  ... :::   ::.  :. .::. ..  .:    .  . ..::: :::... .: :
CCDS92 TGVIMSVN-NSLYLGPILKFGSKEQKQAWVTPFTSGDKIGCFALSEPGNGSDAGAASTTA
              120       130       140       150       160       170

        180       190       200       210       220       230      
pF1KE4 EKKGDEYIINGQKMWITNGGKANWYFLLARSDPDPKAPANKAFTGFIVEADTPGIQIGRK
       . .:: ...:: : ::::. .:.   ..: .:   .:  ::....:.:   :::. .:.:
CCDS92 RAEGDSWVLNGTKAWITNAWEASAAVVFASTD---RALQNKGISAFLVPMPTPGLTLGKK
              180       190       200          210       220       

        240       250       260       270       280       290      
pF1KE4 ELNMGQRCSDTRGIVFEDVKVPKENVLIGDGAGFKVAMGAFDKTRPVVAAGVVGLAQRAL
       : ..: : :.: ...::: ..::...:   : :::.:: ..:  :  .:. ..:.:: ::
CCDS92 EDKLGIRGSSTANLIFEDCRIPKDSILGEPGMGFKIAMQTLDMGRIGIASQALGIAQTAL
       230       240       250       260       270       280       

        300       310       320       330       340       350      
pF1KE4 DEATKYALERKTFGKLLVEHQAISFMLAEMAMKVELARMSYQRAAWEVDSGRRNTYYASI
       : :..:: .: .::  :.. :.:.: ::.::. .: ::.   :::   :. .     :..
CCDS92 DCAVNYAENRMAFGAPLTKLQVIQFKLADMALALESARLLTWRAAMLKDNKKPFIKEAAM
       290       300       310       320       330       340       

        360       370       380       390       400       410      
pF1KE4 AKAFAGDIANQLATDAVQILGGNGFNTEYPVEKLMRDAKIYQIYEGTSQIQRLIVAREHI
       ::  :.. :. .. .:.::::: :. ::.:.:. .:::.: .::::::.::::..: . .
CCDS92 AKLAASEAATAISHQAIQILGGMGYVTEMPAERHYRDARITEIYEGTSEIQRLVIAGHLL
       350       360       370       380       390       400       

        420 
pF1KE4 DKYKN
        .:..
CCDS92 RSYRS
       410  

>>CCDS7634.1 ACADSB gene_id:36|Hs108|chr10                (432 aa)
 initn: 780 init1: 490 opt: 832  Z-score: 1125.5  bits: 217.3 E(32554): 2.3e-56
Smith-Waterman score: 832; 36.2% identity (68.5% similar) in 409 aa overlap (20-417:26-429)

                     10        20         30             40        
pF1KE4       MAAGFGRCCRVLRSISRFHWR-SQHTKANRQREPGL-----GFSFE----FTEQ
                                :.   :.. . : :  :     :. :     ::..
CCDS76 MEGLAVRLLRGSRLLRRNFLTCLSSWKIPPHVSKSSQSEALLNITNNGIHFAPLQTFTDE
               10        20        30        40        50        60

           50        60        70        80        90       100    
pF1KE4 QKEFQATARKFAREEIIPVAAEYDKTGEYPVPLIRRAWELGLMNTHIPENCGGLGLGTFD
       .  ......:::.:.: :... .:.....   .:.  .. :::. ..  . :: : . ..
CCDS76 EMMIKSSVKKFAQEQIAPLVSTMDENSKMEKSVIQGLFQQGLMGIEVDPEYGGTGASFLS
               70        80        90       100       110       120

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pF1KE4 ACLISEELAYGCTGVQTAIE-GNSLGQMPIIIAGNDQQKKKYLGRMTEEPLMCAYCVTEP
       . :. ::::   ..: .  :  :.: .  :   :...::  :: ..: : .  ..:..: 
CCDS76 TVLVIEELAKVDASVAVFCEIQNTLINTLIRKHGTEEQKATYLPQLTTEKVG-SFCLSEA
              130       140       150       160       170          

           170       180       190       200       210       220   
pF1KE4 GAGSDVAGIKTKAEKKGDEYIINGQKMWITNGGKANWYFLLARSDPDPKAPANKAFTGFI
       :::::  ..::.:.:.:: :..::.::::... .:. ....:  ::   . . :..:.:.
CCDS76 GAGSDSFALKTRADKEGDYYVLNGSKMWISSAEHAGLFLVMANVDP---TIGYKGITSFL
     180       190       200       210       220          230      

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pF1KE4 VEADTPGIQIGRKELNMGQRCSDTRGIVFEDVKVPKENVLIGDGAGFKVAMGAFDKTRPV
       :. ::::..::. : ..: : :.:  ..::.::::. :.:   : :.: :.:.... :  
CCDS76 VDRDTPGLHIGKPENKLGLRASSTCPLTFENVKVPEANILGQIGHGYKYAIGSLNEGRIG
        240       250       260       270       280       290      

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pF1KE4 VAAGVVGLAQRALDEATKYALERKTFGKLLVEHQAISFMLAEMAMKVELARMSYQRAAWE
       .:: ..::::  .: .  :  ::  ::: : . :... ..:..: ..: ::.    ::  
CCDS76 IAAQMLGLAQGCFDYTIPYIKERIQFGKRLFDFQGLQHQVAHVATQLEAARLLTYNAARL
        300       310       320       330       340       350      

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pF1KE4 VDSGRRNTYYASIAKAFAGDIANQLATDAVQILGGNGFNTEYPVEKLMRDAKIYQIYEGT
       ...:.     ::.:: .:..::.: ..  .. .:: :.. .::::: .:::::  ::::.
CCDS76 LEAGKPFIKEASMAKYYASEIAGQTTSKCIEWMGGVGYTKDYPVEKYFRDAKIGTIYEGA
        360       370       380       390       400       410      

           410       420 
pF1KE4 SQIQRLIVAREHIDKYKN
       :.::   .:. :::    
CCDS76 SNIQLNTIAK-HIDAEY 
        420        430   

>>CCDS8498.1 ACAD8 gene_id:27034|Hs108|chr11              (415 aa)
 initn: 772 init1: 400 opt: 793  Z-score: 1072.8  bits: 207.5 E(32554): 2e-53
Smith-Waterman score: 793; 33.7% identity (68.1% similar) in 383 aa overlap (32-413:36-410)

              10        20        30        40        50        60 
pF1KE4 AAGFGRCCRVLRSISRFHWRSQHTKANRQREPGLGFSFEFTEQQKEFQATARKFAREEII
                                     .:..:..    :.::::: .:  :: .:. 
CCDS84 CRRFGARLGCLPGGLRVLVQTGHRSLTSCIDPSMGLN----EEQKEFQKVAFDFAAREMA
          10        20        30        40            50        60 

              70        80        90       100       110       120 
pF1KE4 PVAAEYDKTGEYPVPLIRRAWELGLMNTHIPENCGGLGLGTFDACLISEELAYGCTGVQT
       :  ::.:.   .:: ..:.: .::. ...:  . :: ::. .:. .: : :: :::.. .
CCDS84 PNMAEWDQKELFPVDVMRKAAQLGFGGVYIQTDVGGSGLSRLDTSVIFEALATGCTSTTA
              70        80        90       100       110       120 

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pF1KE4 AIEGNSLGQMPIIIAGNDQQKKKYLGRMTEEPLMCAYCVTEPGAGSDVAGIKTKAEKKGD
        :  ...    :   ::..:..:.   .     . .::.::::.:::.:.. :.:.:.::
CCDS84 YISIHNMCAWMIDSFGNEEQRHKFCPPLCTMEKFASYCLTEPGSGSDAASLLTSAKKQGD
             130       140       150       160       170       180 

             190       200       210       220       230       240 
pF1KE4 EYIINGQKMWITNGGKANWYFLLARSDPDPKAPANKAFTGFIVEADTPGIQIGRKELNMG
       .::.::.: .:...:... : .. :.     .:. :... ..::  :::...:.:: ..:
CCDS84 HYILNGSKAFISGAGESDIYVVMCRTG----GPGPKGISCIVVEKGTPGLSFGKKEKKVG
             190       200           210       220       230       

             250       260       270       280       290       300 
pF1KE4 QRCSDTRGIVFEDVKVPKENVLIGDGAGFKVAMGAFDKTRPVVAAGVVGLAQRALDEATK
          . ::...:::  ::  : . ..: :: .:. ...  :  .:.  .: :. ..  .  
CCDS84 WNSQPTRAVIFEDCAVPVANRIGSEGQGFLIAVRGLNGGRINIASCSLGAAHASVILTRD
       240       250       260       270       280       290       

             310       320       330       340       350        360
pF1KE4 YALERKTFGKLLVEHQAISFMLAEMAMKVELARMSYQRAAWEVDSGRRNTY-YASIAKAF
       .   :: ::. :. .: ..: ::.:: ..  ::.  . ::  ..  :...    :.:: :
CCDS84 HLNVRKQFGEPLASNQYLQFTLADMATRLVAARLMVRNAAVALQEERKDAVALCSMAKLF
       300       310       320       330       340       350       

              370       380       390       400       410       420
pF1KE4 AGDIANQLATDAVQILGGNGFNTEYPVEKLMRDAKIYQIYEGTSQIQRLIVAREHIDKYK
       : :    . ..:.:. :: :.  .: :.. .::....:: ::.....:....:       
CCDS84 ATDECFAICNQALQMHGGYGYLKDYAVQQYVRDSRVHQILEGSNEVMRILISRSLLQE  
       360       370       380       390       400       410       

        
pF1KE4 N

>>CCDS10057.2 IVD gene_id:3712|Hs108|chr15                (426 aa)
 initn: 658 init1: 434 opt: 780  Z-score: 1055.0  bits: 204.2 E(32554): 1.9e-52
Smith-Waterman score: 780; 34.6% identity (67.8% similar) in 379 aa overlap (41-413:45-419)

               20        30        40        50        60        70
pF1KE4 VLRSISRFHWRSQHTKANRQREPGLGFSFEFTEQQKEFQATARKFAREEIIPVAAEYDKT
                                     ..:.:.... :  :: .:.. : : : :..
CCDS10 VASWRLRPPLAGFVSQRAHSLLPVDDAINGLSEEQRQLRQTMAKFLQEHLAPKAQEIDRS
           20        30        40        50        60        70    

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pF1KE4 GEYPVPLIRRAWE----LGLMNTHIPENCGGLGLGTFDACLISEEL--AYGCTGVQTAIE
       .:.    .:. :.    ::...   : . :: ::: ..  :. ::.  : : .:.. . .
CCDS10 NEFKN--LREFWKQLGNLGVLGITAPVQYGGSGLGYLEHVLVMEEISRASGAVGLSYGAH
             80        90       100       110       120       130  

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pF1KE4 GNSLGQMPIIIAGNDQQKKKYLGRMTEEPLMCAYCVTEPGAGSDVAGIKTKAEKKGDEYI
       .: :    ..  ::. ::.::: ..     . :  ..::.:::::...: ::::::..::
CCDS10 SN-LCINQLVRNGNEAQKEKYLPKLISGEYIGALAMSEPNAGSDVVSMKLKAEKKGNHYI
             140       150       160       170       180       190 

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pF1KE4 INGQKMWITNGGKANWYFLLARSDPDPKAPANKAFTGFIVEADTPGIQIGRKELNMGQRC
       .::.:.:::::  :.  .. :..:    .::....:.::::   ::.. ..:  ..:.: 
CCDS10 LNGNKFWITNGPDADVLIVYAKTDL-AAVPASRGITAFIVEKGMPGFSTSKKLDKLGMRG
             200       210        220       230       240       250

          250       260       270       280       290       300    
pF1KE4 SDTRGIVFEDVKVPKENVLIGDGAGFKVAMGAFDKTRPVVAAGVVGLAQRALDEATKYAL
       :.:  ..::: :.:  :.:  .. :  : :...:  : :.:.: .:: : .::..  :  
CCDS10 SNTCELIFEDCKIPAANILGHENKGVYVLMSGLDLERLVLAGGPLGLMQAVLDHTIPYLH
              260       270       280       290       300       310

          310       320       330       340       350       360    
pF1KE4 ERKTFGKLLVEHQAISFMLAEMAMKVELARMSYQRAAWEVDSGRRNTYYASIAKAFAGDI
        :..::. . . : ..  .:.:  ..   :.    .:   : :. ..   . .  .... 
CCDS10 VREAFGQKIGHFQLMQGKMADMYTRLMACRQYVYNVAKACDEGHCTAKDCAGVILYSAEC
              320       330       340       350       360       370

          370       380       390       400       410       420 
pF1KE4 ANQLATDAVQILGGNGFNTEYPVEKLMRDAKIYQIYEGTSQIQRLIVAREHIDKYKN
       :.:.: :..: .::::. ...:. ...::::.:.:  :::...::...:        
CCDS10 ATQVALDGIQCFGGNGYINDFPMGRFLRDAKLYEIGAGTSEVRRLVIGRAFNADFH 
              380       390       400       410       420       

>>CCDS81518.1 ACADSB gene_id:36|Hs108|chr10               (330 aa)
 initn: 688 init1: 490 opt: 744  Z-score: 1008.0  bits: 195.2 E(32554): 8e-50
Smith-Waterman score: 744; 38.9% identity (69.9% similar) in 332 aa overlap (87-417:1-327)

         60        70        80        90       100       110      
pF1KE4 REEIIPVAAEYDKTGEYPVPLIRRAWELGLMNTHIPENCGGLGLGTFDACLISEELAYGC
                                     :. ..  . :: : . ... :. ::::   
CCDS81                               MGIEVDPEYGGTGASFLSTVLVIEELAKVD
                                             10        20        30

        120        130       140       150       160       170     
pF1KE4 TGVQTAIE-GNSLGQMPIIIAGNDQQKKKYLGRMTEEPLMCAYCVTEPGAGSDVAGIKTK
       ..: .  :  :.: .  :   :...::  :: ..: : .  ..:..: :::::  ..::.
CCDS81 ASVAVFCEIQNTLINTLIRKHGTEEQKATYLPQLTTEKVG-SFCLSEAGAGSDSFALKTR
               40        50        60        70         80         

         180       190       200       210       220       230     
pF1KE4 AEKKGDEYIINGQKMWITNGGKANWYFLLARSDPDPKAPANKAFTGFIVEADTPGIQIGR
       :.:.:: :..::.::::... .:. ....:  ::   . . :..:.:.:. ::::..::.
CCDS81 ADKEGDYYVLNGSKMWISSAEHAGLFLVMANVDP---TIGYKGITSFLVDRDTPGLHIGK
      90       100       110       120          130       140      

         240       250       260       270       280       290     
pF1KE4 KELNMGQRCSDTRGIVFEDVKVPKENVLIGDGAGFKVAMGAFDKTRPVVAAGVVGLAQRA
        : ..: : :.:  ..::.::::. :.:   : :.: :.:.... :  .:: ..::::  
CCDS81 PENKLGLRASSTCPLTFENVKVPEANILGQIGHGYKYAIGSLNEGRIGIAAQMLGLAQGC
        150       160       170       180       190       200      

         300       310       320       330       340       350     
pF1KE4 LDEATKYALERKTFGKLLVEHQAISFMLAEMAMKVELARMSYQRAAWEVDSGRRNTYYAS
       .: .  :  ::  ::: : . :... ..:..: ..: ::.    ::  ...:.     ::
CCDS81 FDYTIPYIKERIQFGKRLFDFQGLQHQVAHVATQLEAARLLTYNAARLLEAGKPFIKEAS
        210       220       230       240       250       260      

         360       370       380       390       400       410     
pF1KE4 IAKAFAGDIANQLATDAVQILGGNGFNTEYPVEKLMRDAKIYQIYEGTSQIQRLIVAREH
       .:: .:..::.: ..  .. .:: :.. .::::: .:::::  ::::.:.::   .:. :
CCDS81 MAKYYASEIAGQTTSKCIEWMGGVGYTKDYPVEKYFRDAKIGTIYEGASNIQLNTIAK-H
        270       280       290       300       310       320      

         420 
pF1KE4 IDKYKN
       ::    
CCDS81 IDAEY 
         330 

>>CCDS76610.1 ACADS gene_id:35|Hs108|chr12                (408 aa)
 initn: 738 init1: 516 opt: 734  Z-score: 992.8  bits: 192.7 E(32554): 5.6e-49
Smith-Waterman score: 737; 34.1% identity (62.0% similar) in 413 aa overlap (13-421:15-408)

                 10        20        30        40        50        
pF1KE4   MAAGFGRCCRVLRSISRFHWRSQHTKANRQREPGLGFSFEFTEQQKEFQATARKFARE
                     :..    ::. ::  .         : :. : .. .  : : ::..
CCDS76 MAAALLARASGPARRALCPRAWRQLHTIYQ---------SVELPETHQMLLQTCRDFAEK
               10        20        30                 40        50 

       60        70        80        90       100       110        
pF1KE4 EIIPVAAEYDKTGEYPVPLIRRAWELGLMNTHIPENCGGLGLGTFDACLISEELAYGC--
       :..:.::. ::   .:.  ...   :::.   .::. :: ::  .   .  ::.. ::  
CCDS76 ELFPIAAQVDKEHLFPAAQVKKMGGLGLLAMDVPEELGGAGLDYLAYAIAMEEISRGCAS
              60        70        80        90       100       110 

        120       130       140       150       160       170      
pF1KE4 TGVQTAIEGNSLGQMPIIIAGNDQQKKKYLGRMTEEPLMCAYCVTEPGAGSDVAGIKTKA
       :::  ... :::   ::.  :. .::. ..  .:    .  . ..::: .  . :     
CCDS76 TGVIMSVN-NSLYLGPILKFGSKEQKQAWVTPFTSGDKIGCFALSEPGPS--LLG-----
              120       130       140       150       160          

        180       190       200       210         220       230    
pF1KE4 EKKGDEYIINGQKMWITNGGKANWYFLLARSDPDPKAPA--NKAFTGFIVEADTPGIQIG
          :  . . ::      .. :.    . ::    . :    .....:.:   :::. .:
CCDS76 -PTGPIFAL-GQVGCPCPSSAATEACTFPRSRQRVSRPELLREGISAFLVPMPTPGLTLG
            170        180       190       200       210       220 

          240       250       260       270       280       290    
pF1KE4 RKELNMGQRCSDTRGIVFEDVKVPKENVLIGDGAGFKVAMGAFDKTRPVVAAGVVGLAQR
       .:: ..: : :.: ...::: ..::...:   : :::.:: ..:  :  .:. ..:.:: 
CCDS76 KKEDKLGIRGSSTANLIFEDCRIPKDSILGEPGMGFKIAMQTLDMGRIGIASQALGIAQT
             230       240       250       260       270       280 

          300       310       320       330       340       350    
pF1KE4 ALDEATKYALERKTFGKLLVEHQAISFMLAEMAMKVELARMSYQRAAWEVDSGRRNTYYA
       ::: :..:: .: .::  :.. :.:.: ::.::. .: ::.   :::   :. .     :
CCDS76 ALDCAVNYAENRMAFGAPLTKLQVIQFKLADMALALESARLLTWRAAMLKDNKKPFIKEA
             290       300       310       320       330       340 

          360       370       380       390       400       410    
pF1KE4 SIAKAFAGDIANQLATDAVQILGGNGFNTEYPVEKLMRDAKIYQIYEGTSQIQRLIVARE
       ..::  :.. :. .. .:.::::: :. ::.:.:. .:::.: .::::::.::::..: .
CCDS76 AMAKLAASEAATAISHQAIQILGGMGYVTEMPAERHYRDARITEIYEGTSEIQRLVIAGH
             350       360       370       380       390       400 

          420 
pF1KE4 HIDKYKN
        . .:..
CCDS76 LLRSYRS
              




421 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
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 start: Sun Nov  6 01:19:13 2016 done: Sun Nov  6 01:19:14 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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