FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE4260, 1053 aa 1>>>pF1KE4260 1053 - 1053 aa - 1053 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.9607+/-0.00126; mu= 9.8966+/- 0.073 mean_var=285.8197+/-62.839, 0's: 0 Z-trim(108.3): 889 B-trim: 407 in 1/50 Lambda= 0.075863 statistics sampled from 9106 (10103) to 9106 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.644), E-opt: 0.2 (0.31), width: 16 Scan time: 4.130 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS2943.1 ZBTB11 gene_id:27107|Hs108|chr3 (1053) 7062 788.4 0 CCDS61813.1 ZSCAN10 gene_id:84891|Hs108|chr16 ( 386) 783 100.6 7e-21 CCDS61814.1 ZSCAN10 gene_id:84891|Hs108|chr16 ( 643) 783 100.9 9.5e-21 CCDS10493.2 ZSCAN10 gene_id:84891|Hs108|chr16 ( 780) 783 101.0 1.1e-20 CCDS56092.1 ZNF568 gene_id:374900|Hs108|chr19 ( 580) 707 92.5 2.9e-18 CCDS42558.1 ZNF568 gene_id:374900|Hs108|chr19 ( 644) 707 92.6 3e-18 CCDS6437.1 ZNF16 gene_id:7564|Hs108|chr8 ( 682) 699 91.7 5.8e-18 CCDS46162.1 ZNF836 gene_id:162962|Hs108|chr19 ( 936) 692 91.1 1.2e-17 CCDS47357.2 ZFP62 gene_id:643836|Hs108|chr5 ( 867) 689 90.8 1.4e-17 CCDS54955.1 ZFP62 gene_id:643836|Hs108|chr5 ( 900) 689 90.8 1.5e-17 CCDS73997.1 ZNF286A gene_id:57335|Hs108|chr17 ( 511) 683 89.8 1.6e-17 CCDS11172.1 ZNF286A gene_id:57335|Hs108|chr17 ( 521) 683 89.8 1.7e-17 CCDS82274.1 ZNF57 gene_id:126295|Hs108|chr19 ( 523) 683 89.8 1.7e-17 CCDS12098.1 ZNF57 gene_id:126295|Hs108|chr19 ( 555) 683 89.8 1.7e-17 CCDS75846.1 ZNF658 gene_id:26149|Hs108|chr9 (1059) 687 90.6 1.9e-17 CCDS73089.1 ZNF33A gene_id:7581|Hs108|chr10 ( 699) 683 90.0 2e-17 CCDS31182.1 ZNF33A gene_id:7581|Hs108|chr10 ( 810) 683 90.1 2.2e-17 CCDS44372.1 ZNF33A gene_id:7581|Hs108|chr10 ( 811) 683 90.1 2.2e-17 CCDS60514.1 ZNF33A gene_id:7581|Hs108|chr10 ( 817) 683 90.1 2.2e-17 CCDS73088.1 ZNF33A gene_id:7581|Hs108|chr10 ( 829) 683 90.1 2.2e-17 CCDS74388.1 ZNF227 gene_id:7770|Hs108|chr19 ( 748) 682 89.9 2.2e-17 CCDS12636.1 ZNF227 gene_id:7770|Hs108|chr19 ( 799) 682 89.9 2.3e-17 CCDS12409.1 ZNF14 gene_id:7561|Hs108|chr19 ( 642) 679 89.5 2.5e-17 CCDS10329.2 ZSCAN2 gene_id:54993|Hs108|chr15 ( 614) 677 89.2 2.9e-17 CCDS35235.1 ZNF182 gene_id:7569|Hs108|chrX ( 620) 674 88.9 3.6e-17 CCDS35236.1 ZNF182 gene_id:7569|Hs108|chrX ( 639) 674 88.9 3.7e-17 CCDS59369.1 ZNF99 gene_id:7652|Hs108|chr19 ( 864) 675 89.2 4.1e-17 CCDS2719.1 ZNF502 gene_id:91392|Hs108|chr3 ( 544) 670 88.4 4.5e-17 CCDS59329.1 ZNF555 gene_id:148254|Hs108|chr19 ( 627) 670 88.5 5e-17 CCDS12096.1 ZNF555 gene_id:148254|Hs108|chr19 ( 628) 670 88.5 5e-17 CCDS4624.1 ZNF184 gene_id:7738|Hs108|chr6 ( 751) 667 88.3 6.9e-17 CCDS33096.1 ZNF816 gene_id:125893|Hs108|chr19 ( 651) 664 87.9 8e-17 CCDS32977.1 ZNF85 gene_id:7639|Hs108|chr19 ( 595) 661 87.5 9.5e-17 CCDS12273.1 ZNF791 gene_id:163049|Hs108|chr19 ( 576) 660 87.3 1e-16 CCDS12854.1 ZNF83 gene_id:55769|Hs108|chr19 ( 516) 659 87.2 1e-16 CCDS12495.1 ZNF567 gene_id:163081|Hs108|chr19 ( 616) 660 87.4 1e-16 CCDS74349.1 ZNF567 gene_id:163081|Hs108|chr19 ( 647) 660 87.4 1.1e-16 CCDS33102.1 ZNF331 gene_id:55422|Hs108|chr19 ( 463) 655 86.7 1.3e-16 CCDS75077.1 ZNF595 gene_id:152687|Hs108|chr4 ( 465) 655 86.7 1.3e-16 CCDS7195.1 ZNF25 gene_id:219749|Hs108|chr10 ( 456) 654 86.6 1.4e-16 CCDS46170.1 ZNF845 gene_id:91664|Hs108|chr19 ( 970) 660 87.6 1.4e-16 CCDS7198.1 ZNF33B gene_id:7582|Hs108|chr10 ( 778) 657 87.2 1.5e-16 CCDS75076.1 ZNF595 gene_id:152687|Hs108|chr4 ( 616) 655 86.8 1.5e-16 CCDS75075.1 ZNF595 gene_id:152687|Hs108|chr4 ( 648) 655 86.9 1.6e-16 CCDS32978.1 ZNF430 gene_id:80264|Hs108|chr19 ( 570) 651 86.4 2e-16 CCDS12501.1 ZNF383 gene_id:163087|Hs108|chr19 ( 475) 647 85.8 2.4e-16 CCDS62707.1 ZNF180 gene_id:7733|Hs108|chr19 ( 665) 645 85.8 3.4e-16 CCDS62708.1 ZNF180 gene_id:7733|Hs108|chr19 ( 667) 645 85.8 3.4e-16 CCDS77773.1 ZNF717 gene_id:100131827|Hs108|chr3 ( 864) 647 86.2 3.4e-16 CCDS12639.1 ZNF180 gene_id:7733|Hs108|chr19 ( 692) 645 85.8 3.5e-16 >>CCDS2943.1 ZBTB11 gene_id:27107|Hs108|chr3 (1053 aa) initn: 7062 init1: 7062 opt: 7062 Z-score: 4197.7 bits: 788.4 E(32554): 0 Smith-Waterman score: 7062; 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CCDS56 QKIHTGEKPYKCNECGKAFIQMSNLIRHHRIHTGEKPYACKDCWKAFSQKSNLIEHERIH 210 220 230 240 250 260 650 660 670 680 690 700 pF1KE4 T-KREFICSICGRTLPKLYSLRIHMLKHTGVKPHACQVCGKTFIYKHGLKLHQSLHQSQK : .. . :. ::... . .: : ::: ::.::. ::..: .. ::. : ..: CCDS56 TGEKPYECKECGKSFSQKQNLIEHEKIHTGEKPYACNECGRAFSRMSSVTLHMRSHTGEK 270 280 290 300 310 320 710 720 730 740 750 760 pF1KE4 QFQCELCVKSFVTKRSLQEHMSIHTGESKYLCSVCGKSFHRGSGLSKHFKKHQPKPEVRG ..:. : :.: . :: ::::. :.:: :::.: ..:.:. :...: . . CCDS56 PYKCNKCGKAFSQCSVFIIHMRSHTGEKPYVCSECGKAFSQSSSLTVHMRNHTAE---KP 330 340 350 360 370 380 770 780 790 800 810 820 pF1KE4 YHCTQCEKSFFEARDLRQHMNKHLGVKPFQCQFCDKCYSWKKDWYSHVKSHSVTEPYRCN :.: .: :.: . ..: :.. : : ::..:. : : . .. : . :. .:: :. CCDS56 YECKECGKAFSRKENLITHQKIHTGEKPYECSECGKAFIQMSNLIRHQRIHTGEKPYACT 390 400 410 420 430 440 830 840 850 860 870 880 pF1KE4 ICGKEFYEKALFRRHVKKATHGKKGRAKQNLERVCEKCGRKFTQLREYRRHMNNHEGVKP .::: : .:. . .: : : :.: :..::. :.: .. .: . : : :: CCDS56 VCGKAFSQKSNLTEHEKIHT-GEKPYH-------CNQCGKAFSQRQNLLEHEKIHTGEKP 450 460 470 480 490 890 900 910 920 930 940 pF1KE4 FECLTCGVAWADARSLKRHVRTHTGERPYVCPVCSEAYIDARTLRKHMTKFHRDYVP--C :.: :: :.. :: :::.::::.:: : :..:. . : :: . : : : CCDS56 FKCNECGKAFSRISSLTLHVRSHTGEKPYECNKCGKAFSQCSLLIIHM-RSHTGEKPFEC 500 510 520 530 540 550 950 960 970 980 990 pF1KE4 ----KIMLEKDTLQFHNQGTQVAHAVSILTAGMQEQESSGPQELETVVVTGETMEALEAV : . .. .:..:..: CCDS56 NECGKAFSQRASLSIHKRGHTGERHQVY 560 570 580 >>CCDS42558.1 ZNF568 gene_id:374900|Hs108|chr19 (644 aa) initn: 2057 init1: 353 opt: 707 Z-score: 441.0 bits: 92.6 E(32554): 3e-18 Smith-Waterman score: 851; 33.0% identity (59.7% similar) in 409 aa overlap (558-958:239-635) 530 540 550 560 570 580 pF1KE4 LQKRKAVPKSAVQQVAQKLVQRGKKMKQPKRDAKENTEEASHKCGECGMVFQRRYALIMH : . .. : ..: ::: .:.:. :: : CCDS42 KPFYHCASYVVTPFKCNQCGQDFSHKFDLIRHERIHAGEKPYECKECGKAFSRKENLITH 210 220 230 240 250 260 590 600 610 620 630 640 pF1KE4 KLKHERARDYKCPLCKKQF-QYSASLRAHLIRHTRKDAPSSSSSNSTSNEASGTSSEKGR . : . ::: : : : :.: .: : :. .: .. .. :.... :. . CCDS42 QKIHTGEKPYKCNECGKAFIQMSNLIRHHRIHTGEKPYACKDCWKAFSQKSNLIEHERIH 270 280 290 300 310 320 650 660 670 680 690 700 pF1KE4 T-KREFICSICGRTLPKLYSLRIHMLKHTGVKPHACQVCGKTFIYKHGLKLHQSLHQSQK : .. . :. ::... . .: : ::: ::.::. ::..: .. ::. : ..: CCDS42 TGEKPYECKECGKSFSQKQNLIEHEKIHTGEKPYACNECGRAFSRMSSVTLHMRSHTGEK 330 340 350 360 370 380 710 720 730 740 750 760 pF1KE4 QFQCELCVKSFVTKRSLQEHMSIHTGESKYLCSVCGKSFHRGSGLSKHFKKHQPKPEVRG ..:. : :.: . :: ::::. :.:: :::.: ..:.:. :...: . . CCDS42 PYKCNKCGKAFSQCSVFIIHMRSHTGEKPYVCSECGKAFSQSSSLTVHMRNHTAE---KP 390 400 410 420 430 440 770 780 790 800 810 820 pF1KE4 YHCTQCEKSFFEARDLRQHMNKHLGVKPFQCQFCDKCYSWKKDWYSHVKSHSVTEPYRCN :.: .: :.: . ..: :.. : : ::..:. : : . .. : . :. .:: :. CCDS42 YECKECGKAFSRKENLITHQKIHTGEKPYECSECGKAFIQMSNLIRHQRIHTGEKPYACT 450 460 470 480 490 500 830 840 850 860 870 880 pF1KE4 ICGKEFYEKALFRRHVKKATHGKKGRAKQNLERVCEKCGRKFTQLREYRRHMNNHEGVKP .::: : .:. . .: : : :.: :..::. :.: .. .: . : : :: CCDS42 VCGKAFSQKSNLTEHEKIHT-GEKPYH-------CNQCGKAFSQRQNLLEHEKIHTGEKP 510 520 530 540 550 890 900 910 920 930 940 pF1KE4 FECLTCGVAWADARSLKRHVRTHTGERPYVCPVCSEAYIDARTLRKHMTKFHRDYVP--C :.: :: :.. :: :::.::::.:: : :..:. . : :: . : : : CCDS42 FKCNECGKAFSRISSLTLHVRSHTGEKPYECNKCGKAFSQCSLLIIHM-RSHTGEKPFEC 560 570 580 590 600 610 950 960 970 980 990 pF1KE4 ----KIMLEKDTLQFHNQGTQVAHAVSILTAGMQEQESSGPQELETVVVTGETMEALEAV : . .. .:..:..: CCDS42 NECGKAFSQRASLSIHKRGHTGERHQVY 620 630 640 >>CCDS6437.1 ZNF16 gene_id:7564|Hs108|chr8 (682 aa) initn: 340 init1: 340 opt: 699 Z-score: 436.0 bits: 91.7 E(32554): 5.8e-18 Smith-Waterman score: 819; 28.4% identity (55.2% similar) in 630 aa overlap (305-911:80-682) 280 290 300 310 320 pF1KE4 TSVLSFDFCSMADVAILARHLFMSEVLEICESVHKLMEEK-QLTVYKKGEVQTV------ :..:. .: . ... :.:. : CCDS64 CSDTELEAICPHYQQPDCDTRTEDKEFLHKEDIHEDLESQAEISENYAGDVSQVPELGDL 50 60 70 80 90 100 330 340 350 360 370 380 pF1KE4 ---ASTQDLRVQNGGTAPPVASSEGTTTSLPTELGDCEIVLLVNGELPEAEQ--NGEVGR .: .: : .: : :.:: : :. .: :. : : : . :: .: CCDS64 CDDVSERDWGVPEGRRLPQSLSQEGDFT--PAAMG------LLRGPLGEKDLDCNGFDSR 110 120 130 140 150 160 390 400 410 420 430 pF1KE4 ---QPEPQVSSEAESALSSVGCIADSHPEMESVDLITKNNQTELETS--NNRENNTVSNI .:. .. .: . .. ..:::: ... :. :. ..: .. 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CCDS64 DFS-RHQSHHSSERPYMCNECGKAFSQNSSLKKHQKSHMSEKPYECNECGKAFRRSSNLI 280 290 300 310 320 330 560 570 580 590 600 610 pF1KE4 QPKRDAKENTEEASHKCGECGMVFQRRYALIMHKLKHERARDYKCPLCKKQFQYSASLRA : .: .. : . :.::: .:.: :: :. : . ..: : : :. :: :: CCDS64 QHQRI---HSGEKPYVCSECGKAFRRSSNLIKHHRTHTGEKPFECGECGKAFSQSAHLRK 340 350 360 370 380 390 620 630 640 650 660 670 pF1KE4 HLIRHT-RKDAPSSSSSNSTSNEASGTSSEKGRT-KREFICSICGRTLPKLYSLRIHMLK : :: .: .. .. : .. . .. .: .. . :: ::... . :: : CCDS64 HQRVHTGEKPYECNDCGKPFSRVSNLIKHHRVHTGEKPYKCSDCGKAFSQSSSLIQHRRI 400 410 420 430 440 450 680 690 700 710 720 730 pF1KE4 HTGVKPHACQVCGKTFIYKHGLKLHQSLHQSQKQFQCELCVKSFVTKRSLQEHMSIHTGE ::: :::.:.::::.: :. :. :: .: ..: ..: .: :.: . .: .:...:::. CCDS64 HTGEKPHVCNVCGKAFSYSSVLRKHQIIHTGEKPYRCSVCGKAFSHSSALIQHQGVHTGD 460 470 480 490 500 510 740 750 760 770 780 790 pF1KE4 SKYLCSVCGKSFHRGSGLSKHFKKHQ-PKPEVRGYHCTQCEKSFFEARDLRQHMNKHLGV . : : :::.: :.:.: : . : :: :.::.: :.: .. : ::. : :. 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CCDS46 GQHSQEDVENKCIENQLTLSFQSRLTELQKFQTEGKIYECNQSEKTVNNSSLV------- 130 140 150 160 170 530 540 550 560 570 580 pF1KE4 KKLQKRKAVPKSAVQQVAQKLVQRGKKMKQPKRDAKENTEEASHKCGECGMVFQRRYALI . ::. .: :. ....: .. ... : . : . .: . : :: .:. .:: CCDS46 SPLQR--ILP-SVQTNISKKYENEFLQLSLPTQLEKTHIREKPYMCKGCGKAFRVSSSLI 180 190 200 210 220 230 590 600 610 620 630 640 pF1KE4 MHKLKHERARDYKCPLCKKQFQYSASLRAHLIRHTRKDAPSSSSSNSTSNEASG-TSSEK :.. : . ::: : : :. .. : : : ::: . . .. . : .. .. CCDS46 NHQMVHTTEKPYKCNECGKAFHRGSLLTIHQIVHTRGKPYQCGVCGKIFRQNSDLVNHRR 240 250 260 270 280 290 650 660 670 680 690 700 pF1KE4 GRT-KREFICSICGRTLPKLYSLRIHMLKHTGVKPHACQVCGKTFIYKHGLKLHQSLHQS ..: .. . :. ::... . :.: ::. ::: ::. :. ::::: : :: .: . 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CCDS47 MPESKVGDTCVWDSKVENQQ-KKPVENRMKEDKSSIR 10 20 30 500 510 520 530 540 550 pF1KE4 TDFGPDDDTYRSRLRQRSVNEGAYIRLHKGMEKKLQKRKAVPKSAVQQVAQKLVQRGKKM .. .: . .:.. :.. :: . .. .. . . . .: : :. . 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