Result of FASTA (ccds) for pFN21AB3292
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB3292, 559 aa
  1>>>pF1KB3292 559 - 559 aa - 559 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7321+/-0.000984; mu= 16.2042+/- 0.059
 mean_var=71.2009+/-14.117, 0's: 0 Z-trim(104.5): 26  B-trim: 0 in 0/48
 Lambda= 0.151996
 statistics sampled from 7931 (7957) to 7931 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.61), E-opt: 0.2 (0.244), width:  16
 Scan time:  2.330

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS11915.1 GALNT1 gene_id:2589|Hs108|chr18        ( 559) 3856 855.2       0
CCDS2199.1 GALNT13 gene_id:114805|Hs108|chr2       ( 556) 3334 740.7 1.1e-213
CCDS77472.1 GALNT13 gene_id:114805|Hs108|chr2      ( 561) 3102 689.8 2.2e-198
CCDS1582.1 GALNT2 gene_id:2590|Hs108|chr1          ( 571) 1554 350.4 3.5e-96
CCDS8813.1 GALNT6 gene_id:11226|Hs108|chr12        ( 622) 1501 338.8 1.2e-92
CCDS55860.1 GALNT4 gene_id:100528030|Hs108|chr12   ( 575) 1491 336.6   5e-92
CCDS53817.1 GALNT4 gene_id:8693|Hs108|chr12        ( 578) 1491 336.6 5.1e-92
CCDS6737.1 GALNT12 gene_id:79695|Hs108|chr9        ( 581) 1446 326.7 4.7e-89
CCDS2226.1 GALNT3 gene_id:2591|Hs108|chr2          ( 633) 1440 325.4 1.3e-88
CCDS2203.1 GALNT5 gene_id:11227|Hs108|chr2         ( 940) 1397 316.0 1.2e-85
CCDS58705.1 GALNT14 gene_id:79623|Hs108|chr2       ( 532) 1361 308.0 1.8e-83
CCDS1773.2 GALNT14 gene_id:79623|Hs108|chr2        ( 552) 1361 308.1 1.9e-83
CCDS5930.1 GALNT11 gene_id:63917|Hs108|chr7        ( 608) 1345 304.6 2.3e-82
CCDS4325.1 GALNT10 gene_id:55568|Hs108|chr5        ( 603) 1323 299.7 6.5e-81
CCDS58706.1 GALNT14 gene_id:79623|Hs108|chr2       ( 557) 1297 294.0 3.1e-79
CCDS34104.1 GALNTL6 gene_id:442117|Hs108|chr4      ( 601) 1289 292.3 1.1e-78
CCDS32107.1 GALNT16 gene_id:57452|Hs108|chr14      ( 558) 1273 288.8 1.2e-77
CCDS81755.1 GALNT9 gene_id:50614|Hs108|chr12       ( 603) 1161 264.2 3.2e-70
CCDS33711.1 GALNT15 gene_id:117248|Hs108|chr3      ( 639) 1156 263.1 7.2e-70
CCDS5540.1 WBSCR17 gene_id:64409|Hs108|chr7        ( 598) 1152 262.2 1.2e-69
CCDS3815.1 GALNT7 gene_id:51809|Hs108|chr4         ( 657) 1121 255.5 1.5e-67
CCDS5929.1 GALNTL5 gene_id:168391|Hs108|chr7       ( 443) 1106 252.1   1e-66
CCDS7807.1 GALNT18 gene_id:374378|Hs108|chr11      ( 607) 1079 246.2 8.3e-65
CCDS82742.1 GALNT15 gene_id:117248|Hs108|chr3      ( 617) 1077 245.8 1.1e-64
CCDS8533.1 GALNT8 gene_id:26290|Hs108|chr12        ( 637) 1031 235.7 1.3e-61
CCDS41866.1 GALNT9 gene_id:50614|Hs108|chr12       ( 237)  363 89.1 6.7e-18


>>CCDS11915.1 GALNT1 gene_id:2589|Hs108|chr18             (559 aa)
 initn: 3856 init1: 3856 opt: 3856  Z-score: 4568.6  bits: 855.2 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 3856; 100.0% identity (100.0% similar) in 559 aa overlap (1-559:1-559)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB3 MRKFAYCKVVLATSLIWVLLDMFLLLYFSECNKCDEKKERGLPAGDVLEPVQKPHEGPGE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 MRKFAYCKVVLATSLIWVLLDMFLLLYFSECNKCDEKKERGLPAGDVLEPVQKPHEGPGE
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB3 MGKPVVIPKEDQEKMKEMFKINQFNLMASEMIALNRSLPDVRLEGCKTKVYPDNLPTTSV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 MGKPVVIPKEDQEKMKEMFKINQFNLMASEMIALNRSLPDVRLEGCKTKVYPDNLPTTSV
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB3 VIVFHNEAWSTLLRTVHSVINRSPRHMIEEIVLVDDASERDFLKRPLESYVKKLKVPVHV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 VIVFHNEAWSTLLRTVHSVINRSPRHMIEEIVLVDDASERDFLKRPLESYVKKLKVPVHV
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB3 IRMEQRSGLIRARLKGAAVSKGQVITFLDAHCECTVGWLEPLLARIKHDRRTVVCPIIDV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 IRMEQRSGLIRARLKGAAVSKGQVITFLDAHCECTVGWLEPLLARIKHDRRTVVCPIIDV
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB3 ISDDTFEYMAGSDMTYGGFNWKLNFRWYPVPQREMDRRKGDRTLPVRTPTMAGGLFSIDR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 ISDDTFEYMAGSDMTYGGFNWKLNFRWYPVPQREMDRRKGDRTLPVRTPTMAGGLFSIDR
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB3 DYFQEIGTYDAGMDIWGGENLEISFRIWQCGGTLEIVTCSHVGHVFRKATPYTFPGGTGQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 DYFQEIGTYDAGMDIWGGENLEISFRIWQCGGTLEIVTCSHVGHVFRKATPYTFPGGTGQ
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB3 IINKNNRRLAEVWMDEFKNFFYIISPGVTKVDYGDISSRVGLRHKLQCKPFSWYLENIYP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 IINKNNRRLAEVWMDEFKNFFYIISPGVTKVDYGDISSRVGLRHKLQCKPFSWYLENIYP
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB3 DSQIPRHYFSLGEIRNVETNQCLDNMARKENEKVGIFNCHGMGGNQVFSYTANKEIRTDD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 DSQIPRHYFSLGEIRNVETNQCLDNMARKENEKVGIFNCHGMGGNQVFSYTANKEIRTDD
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB3 LCLDVSKLNGPVTMLKCHHLKGNQLWEYDPVKLTLQHVNSNQCLDKATEEDSQVPSIRDC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 LCLDVSKLNGPVTMLKCHHLKGNQLWEYDPVKLTLQHVNSNQCLDKATEEDSQVPSIRDC
              490       500       510       520       530       540

              550         
pF1KB3 NGSRSQQWLLRNVTLPEIF
       :::::::::::::::::::
CCDS11 NGSRSQQWLLRNVTLPEIF
              550         

>>CCDS2199.1 GALNT13 gene_id:114805|Hs108|chr2            (556 aa)
 initn: 3336 init1: 3097 opt: 3334  Z-score: 3950.0  bits: 740.7 E(32554): 1.1e-213
Smith-Waterman score: 3334; 84.7% identity (96.9% similar) in 556 aa overlap (1-555:1-554)

               10        20        30        40         50         
pF1KB3 MRKFAYCKVVLATSLIWVLLDMFLLLYFSECNKCDEKKERGL-PAGDVLEPVQKPHEGPG
       ::.:.::::::::::.:::.:.:::::::::::::.::::.: ::  ..  ... .::::
CCDS21 MRRFVYCKVVLATSLMWVLVDVFLLLYFSECNKCDDKKERSLLPALRAV--ISRNQEGPG
               10        20        30        40          50        

      60        70        80        90       100       110         
pF1KB3 EMGKPVVIPKEDQEKMKEMFKINQFNLMASEMIALNRSLPDVRLEGCKTKVYPDNLPTTS
       :::: :.:::.:::::::.:::::::::::..::::::::::::::::::::::.::.::
CCDS21 EMGKAVLIPKDDQEKMKELFKINQFNLMASDLIALNRSLPDVRLEGCKTKVYPDELPNTS
       60        70        80        90       100       110        

     120       130       140       150       160       170         
pF1KB3 VVIVFHNEAWSTLLRTVHSVINRSPRHMIEEIVLVDDASERDFLKRPLESYVKKLKVPVH
       :::::::::::::::::.:::::::.... :..::::::::::::  ::.:::.:.:::.
CCDS21 VVIVFHNEAWSTLLRTVYSVINRSPHYLLSEVILVDDASERDFLKLTLENYVKNLEVPVK
      120       130       140       150       160       170        

     180       190       200       210       220       230         
pF1KB3 VIRMEQRSGLIRARLKGAAVSKGQVITFLDAHCECTVGWLEPLLARIKHDRRTVVCPIID
       .::::.:::::::::.:::.::::::::::::::::.:::::::::::.::.::::::::
CCDS21 IIRMEERSGLIRARLRGAAASKGQVITFLDAHCECTLGWLEPLLARIKEDRKTVVCPIID
      180       190       200       210       220       230        

     240       250       260       270       280       290         
pF1KB3 VISDDTFEYMAGSDMTYGGFNWKLNFRWYPVPQREMDRRKGDRTLPVRTPTMAGGLFSID
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS21 VISDDTFEYMAGSDMTYGGFNWKLNFRWYPVPQREMDRRKGDRTLPVRTPTMAGGLFSID
      240       250       260       270       280       290        

     300       310       320       330       340       350         
pF1KB3 RDYFQEIGTYDAGMDIWGGENLEISFRIWQCGGTLEIVTCSHVGHVFRKATPYTFPGGTG
       :.::.::::::::::::::::::.:::::::::.::::::::::::::::::::::::::
CCDS21 RNYFEEIGTYDAGMDIWGGENLEMSFRIWQCGGSLEIVTCSHVGHVFRKATPYTFPGGTG
      300       310       320       330       340       350        

     360       370       380       390       400       410         
pF1KB3 QIINKNNRRLAEVWMDEFKNFFYIISPGVTKVDYGDISSRVGLRHKLQCKPFSWYLENIY
       ..:::::::::::::::::.:::::::::.::::::.: :  ::..:.::::::::::::
CCDS21 HVINKNNRRLAEVWMDEFKDFFYIISPGVVKVDYGDVSVRKTLRENLKCKPFSWYLENIY
      360       370       380       390       400       410        

     420       430       440       450       460       470         
pF1KB3 PDSQIPRHYFSLGEIRNVETNQCLDNMARKENEKVGIFNCHGMGGNQVFSYTANKEIRTD
       :::::::.:.:::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::.::::::
CCDS21 PDSQIPRRYYSLGEIRNVETNQCLDNMGRKENEKVGIFNCHGMGGNQVFSYTADKEIRTD
      420       430       440       450       460       470        

     480       490       500       510       520       530         
pF1KB3 DLCLDVSKLNGPVTMLKCHHLKGNQLWEYDPVKLTLQHVNSNQCLDKATEEDSQVPSIRD
       :::::::.::::: ::::::..::::::::  .:::.:::::::::. .:::..::...:
CCDS21 DLCLDVSRLNGPVIMLKCHHMRGNQLWEYDAERLTLRHVNSNQCLDEPSEEDKMVPTMQD
      480       490       500       510       520       530        

     540       550         
pF1KB3 CNGSRSQQWLLRNVTLPEIF
       :.:::::::::::.::    
CCDS21 CSGSRSQQWLLRNMTLGT  
      540       550        

>>CCDS77472.1 GALNT13 gene_id:114805|Hs108|chr2           (561 aa)
 initn: 3196 init1: 2862 opt: 3102  Z-score: 3675.0  bits: 689.8 E(32554): 2.2e-198
Smith-Waterman score: 3183; 81.6% identity (93.2% similar) in 561 aa overlap (1-559:1-549)

               10        20        30        40         50         
pF1KB3 MRKFAYCKVVLATSLIWVLLDMFLLLYFSECNKCDEKKERGL-PAGDVLEPVQKPHEGPG
       ::.:.::::::::::.:::.:.:::::::::::::.::::.: ::  ..  ... .::::
CCDS77 MRRFVYCKVVLATSLMWVLVDVFLLLYFSECNKCDDKKERSLLPALRAV--ISRNQEGPG
               10        20        30        40          50        

      60        70        80        90       100       110         
pF1KB3 EMGKPVVIPKEDQEKMKEMFKINQFNLMASEMIALNRSLPDVRLEGCKTKVYPDNLPTTS
       :::: :.:::.:::::::.:::::::::::..::::::::::::::::::::::.::.::
CCDS77 EMGKAVLIPKDDQEKMKELFKINQFNLMASDLIALNRSLPDVRLEGCKTKVYPDELPNTS
       60        70        80        90       100       110        

     120       130       140       150       160       170         
pF1KB3 VVIVFHNEAWSTLLRTVHSVINRSPRHMIEEIVLVDDASERDFLKRPLESYVKKLKVPVH
       :::::::::::::::::.:::::::.... :..::::::::::::  ::.:::.:.:::.
CCDS77 VVIVFHNEAWSTLLRTVYSVINRSPHYLLSEVILVDDASERDFLKLTLENYVKNLEVPVK
      120       130       140       150       160       170        

     180       190       200       210       220       230         
pF1KB3 VIRMEQRSGLIRARLKGAAVSKGQVITFLDAHCECTVGWLEPLLARIKHDRRTVVCPIID
       .::::.:::::::::.:::.::::::::::::::::.:::::::::::.::.::::::::
CCDS77 IIRMEERSGLIRARLRGAAASKGQVITFLDAHCECTLGWLEPLLARIKEDRKTVVCPIID
      180       190       200       210       220       230        

     240       250       260       270       280       290         
pF1KB3 VISDDTFEYMAGSDMTYGGFNWKLNFRWYPVPQREMDRRKGDRTLPVRTPTMAGGLFSID
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 VISDDTFEYMAGSDMTYGGFNWKLNFRWYPVPQREMDRRKGDRTLPVRTPTMAGGLFSID
      240       250       260       270       280       290        

     300       310       320       330       340       350         
pF1KB3 RDYFQEIGTYDAGMDIWGGENLEISFRIWQCGGTLEIVTCSHVGHVFRKATPYTFPGGTG
       :.::.::::::::::::::::::.:::::::::.::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 RNYFEEIGTYDAGMDIWGGENLEMSFRIWQCGGSLEIVTCSHVGHVFRKATPYTFPGGTG
      300       310       320       330       340       350        

     360       370       380       390       400       410         
pF1KB3 QIINKNNRRLAEVWMDEFKNFFYIISPGVTKVDYGDISSRVGLRHKLQCKPFSWYLENIY
       ..:::::::::::::::::.:::::::::.::::::.: :  ::..:.::::::::::::
CCDS77 HVINKNNRRLAEVWMDEFKDFFYIISPGVVKVDYGDVSVRKTLRENLKCKPFSWYLENIY
      360       370       380       390       400       410        

     420       430       440       450       460       470         
pF1KB3 PDSQIPRHYFSLGEIRNVETNQCLDNMARKENEKVGIFNCHGMGGNQVFSYTANKEIRTD
       :::::::.:.:::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::.::::::
CCDS77 PDSQIPRRYYSLGEIRNVETNQCLDNMGRKENEKVGIFNCHGMGGNQVFSYTADKEIRTD
      420       430       440       450       460       470        

     480       490       500       510       520       530         
pF1KB3 DLCLDVSKLNGPVTMLKCHHLKGNQLWEYDPVKLTLQHVNSNQCLDKATEED-SQVPSIR
       :::::::.::::: ::::::..::::::::          ...::.     : :: :...
CCDS77 DLCLDVSRLNGPVIMLKCHHMRGNQLWEYD----------AESCLSVNKVADGSQHPTVE
      480       490       500                 510       520        

      540       550                     
pF1KB3 DCNGSRSQQWLLRNVTLPEIF            
        :: :  :.::::: :  :::            
CCDS77 TCNDSTLQKWLLRNYTRMEIFRNIFGNSTDYIL
      530       540       550       560 

>>CCDS1582.1 GALNT2 gene_id:2590|Hs108|chr1               (571 aa)
 initn: 1509 init1: 1079 opt: 1554  Z-score: 1840.3  bits: 350.4 E(32554): 3.5e-96
Smith-Waterman score: 1554; 45.0% identity (72.7% similar) in 531 aa overlap (32-548:46-563)

              10        20        30        40        50        60 
pF1KB3 RKFAYCKVVLATSLIWVLLDMFLLLYFSECNKCDEKKERGLPAGDVLEPVQKPHEGPGEM
                                     :. :  :.. :  ..  : .:. .  :   
CCDS15 VLGIAYYMYSGGGSALAGGAGGGAGRKEDWNEIDPIKKKDLHHSNGEEKAQSMETLPP--
          20        30        40        50        60        70     

              70                 80        90       100       110  
pF1KB3 GKPVVIPKEDQEKM---------KEMFKINQFNLMASEMIALNRSLPDVRLEGCKTKVYP
       :: :  :  .:: .         .. .  :.:: . :. . ..:..::.: . :. : . 
CCDS15 GK-VRWPDFNQEAYVGGTMVRSGQDPYARNKFNQVESDKLRMDRAIPDTRHDQCQRKQWR
             80        90       100       110       120       130  

            120       130       140       150       160       170  
pF1KB3 DNLPTTSVVIVFHNEAWSTLLRTVHSVINRSPRHMIEEIVLVDDASERDFLKRPLESYVK
        .::.:::::.::::: :.::::: ::...:: :.:.::.:::: :. :     : . ..
CCDS15 VDLPATSVVITFHNEARSALLRTVVSVLKKSPPHLIKEIILVDDYSN-DPEDGALLGKIE
            140       150       160       170        180       190 

            180       190       200       210       220       230  
pF1KB3 KLKVPVHVIRMEQRSGLIRARLKGAAVSKGQVITFLDAHCECTVGWLEPLLARIKHDRRT
       :    :.:.: ..: ::.:.:..:: .....:.::::.::::.  :::::: :. .::  
CCDS15 K----VRVLRNDRREGLMRSRVRGADAAQAKVLTFLDSHCECNEHWLEPLLERVAEDRTR
                 200       210       220       230       240       

            240       250       260        270       280       290 
pF1KB3 VVCPIIDVISDDTFEYMAGSDMTYGGFNWKLNFRW-YPVPQREMDRRKGDRTLPVRTPTM
       :: ::::::. :.:.:...:    :::.:.: :.: : .:... .: .:. . :..:: .
CCDS15 VVSPIIDVINMDNFQYVGASADLKGGFDWNLVFKWDYMTPEQRRSR-QGNPVAPIKTPMI
       250       260       270       280       290        300      

             300       310       320       330       340       350 
pF1KB3 AGGLFSIDRDYFQEIGTYDAGMDIWGGENLEISFRIWQCGGTLEIVTCSHVGHVFRKATP
       ::::: .:. ::.:.: ::  ::.:::::::::::.:::::.:::. ::.:::::::  :
CCDS15 AGGLFVMDKFYFEELGKYDMMMDVWGGENLEISFRVWQCGGSLEIIPCSRVGHVFRKQHP
        310       320       330       340       350       360      

             360       370       380       390       400       410 
pF1KB3 YTFPGGTGQIINKNNRRLAEVWMDEFKNFFYIISPGVTKVDYGDISSRVGLRHKLQCKPF
       ::::::.: .. .:.:: :::::::.:::.:   :.. .: ::.:.::. ::.::.::::
CCDS15 YTFPGGSGTVFARNTRRAAEVWMDEYKNFYYAAVPSARNVPYGNIQSRLELRKKLSCKPF
        370       380       390       400       410       420      

             420        430       440       450       460       470
pF1KB3 SWYLENIYPDSQIPRHY-FSLGEIRNVETNQCLDNMARKENEKVGIFNCHGMGGNQVFSY
       .:::::.::. ..: :  ...: ..  . ..:::....  .  ::...::. :::: .. 
CCDS15 KWYLENVYPELRVPDHQDIAFGALQ--QGTNCLDTLGHFADGVVGVYECHNAGGNQEWAL
        430       440       450         460       470       480    

              480       490          500       510       520       
pF1KB3 TANKEIRTDDLCLDVSKLNGPVTMLK---CHHLKGNQLWEYDPVKLTLQHVNSNQCLDKA
       : .: ..  :::: :    .: ...:   :..  . : ::    .  :.::.:: :::. 
CCDS15 TKEKSVKHMDLCLTVVD-RAPGSLIKLQGCRENDSRQKWEQIEGNSKLRHVGSNLCLDSR
          490       500        510       520       530       540   

       530       540       550         
pF1KB3 TEEDSQVPSIRDCNGSRSQQWLLRNVTLPEIF
       : ... . :.. :. . ::::           
CCDS15 TAKSGGL-SVEVCGPALSQQWKFTLNLQQ   
           550        560       570    

>>CCDS8813.1 GALNT6 gene_id:11226|Hs108|chr12             (622 aa)
 initn: 1191 init1: 418 opt: 1501  Z-score: 1776.9  bits: 338.8 E(32554): 1.2e-92
Smith-Waterman score: 1513; 48.3% identity (72.2% similar) in 532 aa overlap (50-550:106-621)

      20        30        40        50        60            70     
pF1KB3 LDMFLLLYFSECNKCDEKKERGLPAGDVLEPVQKPHEGPGEMGKPVV----IPKEDQEKM
                                     : : :. .::  ::        : : ::: 
CCDS88 PEAQQTLFSINQSCLPGFYTPAELKPFWERPPQDPN-APGADGKAFQKSKWTPLETQEK-
          80        90       100       110        120       130    

          80        90        100          110       120       130 
pF1KB3 KEMFKINQFNLMASEMIALNRSL-PDVRLEGC---KTKVYPDNLPTTSVVIVFHNEAWST
       .: .: . :: .::. :.:.::: ::.:   :   : .  :  : ::::.::::::::::
CCDS88 EEGYKKHCFNAFASDRISLQRSLGPDTRPPECVDQKFRRCPP-LATTSVIIVFHNEAWST
           140       150       160       170        180       190  

             140       150       160       170       180       190 
pF1KB3 LLRTVHSVINRSPRHMIEEIVLVDDASERDFLKRPLESYVKKLKVPVHVIRMEQRSGLIR
       :::::.::.. .:  ...::.:::::: .. ::. ::.:::.:.: :.:.:.:.:.::: 
CCDS88 LLRTVYSVLHTTPAILLKEIILVDDASTEEHLKEKLEQYVKQLQV-VRVVRQEERKGLIT
            200       210       220       230        240       250 

             200       210       220       230       240       250 
pF1KB3 ARLKGAAVSKGQVITFLDAHCECTVGWLEPLLARIKHDRRTVVCPIIDVISDDTFEYMA-
       ::: ::.:....:.:::::::::  :::::::::: .:. .:: : : .:. .:::.   
CCDS88 ARLLGASVAQAEVLTFLDAHCECFHGWLEPLLARIAEDKTVVVSPDIVTIDLNTFEFAKP
             260       270       280       290       300       310 

                 260       270       280       290       300       
pF1KB3 ---GSDMTYGGFNWKLNFRWYPVPQREMDRRKGDRTLPVRTPTMAGGLFSIDRDYFQEIG
          :   . :.:.:.:.: :  .: .: .::: :.: :...::.:::::::...::..::
CCDS88 VQRGRVHSRGNFDWSLTFGWETLPPHEKQRRK-DETYPIKSPTFAGGLFSISKSYFEHIG
             320       330       340        350       360       370

       310       320       330       340       350       360       
pF1KB3 TYDAGMDIWGGENLEISFRIWQCGGTLEIVTCSHVGHVFRKATPYTFPGGTGQIINKNNR
       :::  :.::::::.:.:::.::::: :::. :: ::::::  .:.::: ::. .: .:. 
CCDS88 TYDNQMEIWGGENVEMSFRVWQCGGQLEIIPCSVVGHVFRTKSPHTFPKGTS-VIARNQV
              380       390       400       410       420          

       370       380       390           400       410       420   
pF1KB3 RLAEVWMDEFKNFFYIISPGVTKV----DYGDISSRVGLRHKLQCKPFSWYLENIYPDSQ
       :::::::: .:..::  .  ..:.    ..:::: :. ::..:.:. :::::.:.::.  
CCDS88 RLAEVWMDSYKKIFYRRNLQAAKMAQEKSFGDISERLQLREQLHCHNFSWYLHNVYPEMF
     430       440       450       460       470       480         

           430        440       450           460       470        
pF1KB3 IPRHYFSL-GEIRNVETNQCLDNMARKENEKVG----IFNCHGMGGNQVFSYTANKEIRT
       .:    .. : :.:. ::::::     ::.. :    ...:::.:::: : ::.....: 
CCDS88 VPDLTPTFYGAIKNLGTNQCLD---VGENNRGGKPLIMYSCHGLGGNQYFEYTTQRDLRH
     490       500       510          520       530       540      

         480       490       500             510       520         
pF1KB3 D---DLCLDVSKLNGPVTMLKCHHL-KGNQL-----WEYDPVKLTLQHVNSNQCLDKATE
       .   .::: :::  : . . .::   :..:.     ::    .: ... .:. ::   : 
CCDS88 NIAKQLCLHVSK--GALGLGSCHFTGKNSQVPKDEEWELAQDQL-IRNSGSGTCL---TS
        550         560       570       580        590          600

     530       540        550         
pF1KB3 EDSQVPSIRDCNGSRSQQ-WLLRNVTLPEIF
       .:.. :..  :: :  .: ::.         
CCDS88 QDKK-PAMAPCNPSDPHQLWLFV        
               610       620          

>>CCDS55860.1 GALNT4 gene_id:100528030|Hs108|chr12        (575 aa)
 initn: 1152 init1: 670 opt: 1491  Z-score: 1765.6  bits: 336.6 E(32554): 5e-92
Smith-Waterman score: 1491; 45.5% identity (71.8% similar) in 525 aa overlap (46-548:55-571)

          20        30        40        50            60         70
pF1KB3 IWVLLDMFLLLYFSECNKCDEKKERGLPAGDVLEPV-QKPHEGP---GEMGKPVVIP-KE
                                     :. .:. .::       :: ::   .  .:
CCDS55 DLSPNGKQLGAGRARELGSRRLSDLQKNTEDLSRPLYKKPPADSRALGEWGKASKLQLNE
           30        40        50        60        70        80    

                80        90       100       110        120        
pF1KB3 DQEKMKE-MFKINQFNLMASEMIALNRSLPDVRLEGCKTKVYP-DNLPTTSVVIVFHNEA
       :. :..: ...   .:.. :. :.:.: . : :.  ::.. .   .::::::.:.:.:::
CCDS55 DELKQQEELIERYAINIYLSDRISLHRHIEDKRMYECKSQKFNYRTLPTTSVIIAFYNEA
           90       100       110       120       130       140    

      130       140       150       160       170       180        
pF1KB3 WSTLLRTVHSVINRSPRHMIEEIVLVDDASERDFLKRPLESYVKKLKVPVHVIRMEQRSG
       :::::::.:::.. ::  ...::.:::: :.: .::  ::.:...:   :..:: ..: :
CCDS55 WSTLLRTIHSVLETSPAVLLKEIILVDDLSDRVYLKTQLETYISNLDR-VRLIRTNKREG
          150       160       170       180       190        200   

      190       200       210       220       230       240        
pF1KB3 LIRARLKGAAVSKGQVITFLDAHCECTVGWLEPLLARIKHDRRTVVCPIIDVISDDTFE-
       :.:::: ::. . :.:.:::: ::::. ::::::: :: .:. .::::.::.:. .::: 
CCDS55 LVRARLIGATFATGDVLTFLDCHCECNSGWLEPLLERIGRDETAVVCPVIDTIDWNTFEF
           210       220       230       240       250       260   

       250       260       270       280       290       300       
pF1KB3 YMAGSDMTYGGFNWKLNFRWYPVPQREMDRRKGDRTLPVRTPTMAGGLFSIDRDYFQEIG
       ::  ..   :::.:.:.:.:. ::..: ::: . :  :.:.::::::::.... ::: .:
CCDS55 YMQIGEPMIGGFDWRLTFQWHSVPKQERDRRIS-RIDPIRSPTMAGGLFAVSKKYFQYLG
           270       280       290        300       310       320  

       310       320       330       340       350       360       
pF1KB3 TYDAGMDIWGGENLEISFRIWQCGGTLEIVTCSHVGHVFRKATPYTFPGGTGQIINKNNR
       :::.::..:::::::.:::.::::: :::  :::::::: : .::. :.     . .:. 
CCDS55 TYDTGMEVWGGENLELSFRVWQCGGKLEIHPCSHVGHVFPKRAPYARPN-----FLQNTA
            330       340       350       360       370            

       370       380       390       400       410       420       
pF1KB3 RLAEVWMDEFKNFFYIISPGVTKVDYGDISSRVGLRHKLQCKPFSWYLENIYPDSQIPRH
       : :::::::.:. ::  .: . :  ::::: :  ::..:.:: :.:::.:..:. ..:. 
CCDS55 RAAEVWMDEYKEHFYNRNPPARKEAYGDISERKLLRERLRCKSFDWYLKNVFPNLHVPED
       380       390       400       410       420       430       

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pF1KB3 YFSL-GEIRNVE-TNQCLDNMARKENE---KVGIFNCHGMGGNQVFSYTANKEIRTD---
         .  : ::.   ...:::  .  .:    ....:.:::.:::: : ::.::::: .   
CCDS55 RPGWHGAIRSRGISSECLDYNSPDNNPTGANLSLFGCHGQGGNQFFEYTSNKEIRFNSVT
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pF1KB3 DLCLDVSKLNGPVTMLKCHH----LKGNQLWEYDPVKLTLQHVNSNQCLDKA-TEEDSQV
       .:: .: . .. : : .: .    . .: .:..     :. : .:. ::.   : :    
CCDS55 ELCAEVPEQKNYVGMQNCPKDGFPVPANIIWHFKE-DGTIFHPHSGLCLSAYRTPEGRPD
       500       510       520       530        540       550      

          540        550         
pF1KB3 PSIRDCNG-SRSQQWLLRNVTLPEIF
        ..: :.. ...: :           
CCDS55 VQMRTCDALDKNQIWSFEK       
        560       570            

>>CCDS53817.1 GALNT4 gene_id:8693|Hs108|chr12             (578 aa)
 initn: 1152 init1: 670 opt: 1491  Z-score: 1765.6  bits: 336.6 E(32554): 5.1e-92
Smith-Waterman score: 1491; 45.5% identity (71.8% similar) in 525 aa overlap (46-548:58-574)

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pF1KB3 IWVLLDMFLLLYFSECNKCDEKKERGLPAGDVLEPV-QKPHEGP---GEMGKPVVIP-KE
                                     :. .:. .::       :: ::   .  .:
CCDS53 LVSTFHASAGAGRARELGSRRLSDLQKNTEDLSRPLYKKPPADSRALGEWGKASKLQLNE
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pF1KB3 DQEKMKE-MFKINQFNLMASEMIALNRSLPDVRLEGCKTKVYP-DNLPTTSVVIVFHNEA
       :. :..: ...   .:.. :. :.:.: . : :.  ::.. .   .::::::.:.:.:::
CCDS53 DELKQQEELIERYAINIYLSDRISLHRHIEDKRMYECKSQKFNYRTLPTTSVIIAFYNEA
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pF1KB3 WSTLLRTVHSVINRSPRHMIEEIVLVDDASERDFLKRPLESYVKKLKVPVHVIRMEQRSG
       :::::::.:::.. ::  ...::.:::: :.: .::  ::.:...:   :..:: ..: :
CCDS53 WSTLLRTIHSVLETSPAVLLKEIILVDDLSDRVYLKTQLETYISNLDR-VRLIRTNKREG
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pF1KB3 LIRARLKGAAVSKGQVITFLDAHCECTVGWLEPLLARIKHDRRTVVCPIIDVISDDTFE-
       :.:::: ::. . :.:.:::: ::::. ::::::: :: .:. .::::.::.:. .::: 
CCDS53 LVRARLIGATFATGDVLTFLDCHCECNSGWLEPLLERIGRDETAVVCPVIDTIDWNTFEF
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pF1KB3 YMAGSDMTYGGFNWKLNFRWYPVPQREMDRRKGDRTLPVRTPTMAGGLFSIDRDYFQEIG
       ::  ..   :::.:.:.:.:. ::..: ::: . :  :.:.::::::::.... ::: .:
CCDS53 YMQIGEPMIGGFDWRLTFQWHSVPKQERDRRIS-RIDPIRSPTMAGGLFAVSKKYFQYLG
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pF1KB3 TYDAGMDIWGGENLEISFRIWQCGGTLEIVTCSHVGHVFRKATPYTFPGGTGQIINKNNR
       :::.::..:::::::.:::.::::: :::  :::::::: : .::. :.     . .:. 
CCDS53 TYDTGMEVWGGENLELSFRVWQCGGKLEIHPCSHVGHVFPKRAPYARPN-----FLQNTA
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pF1KB3 RLAEVWMDEFKNFFYIISPGVTKVDYGDISSRVGLRHKLQCKPFSWYLENIYPDSQIPRH
       : :::::::.:. ::  .: . :  ::::: :  ::..:.:: :.:::.:..:. ..:. 
CCDS53 RAAEVWMDEYKEHFYNRNPPARKEAYGDISERKLLRERLRCKSFDWYLKNVFPNLHVPED
              390       400       410       420       430       440

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pF1KB3 YFSL-GEIRNVE-TNQCLDNMARKENE---KVGIFNCHGMGGNQVFSYTANKEIRTD---
         .  : ::.   ...:::  .  .:    ....:.:::.:::: : ::.::::: .   
CCDS53 RPGWHGAIRSRGISSECLDYNSPDNNPTGANLSLFGCHGQGGNQFFEYTSNKEIRFNSVT
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pF1KB3 DLCLDVSKLNGPVTMLKCHH----LKGNQLWEYDPVKLTLQHVNSNQCLDKA-TEEDSQV
       .:: .: . .. : : .: .    . .: .:..     :. : .:. ::.   : :    
CCDS53 ELCAEVPEQKNYVGMQNCPKDGFPVPANIIWHFKE-DGTIFHPHSGLCLSAYRTPEGRPD
              510       520       530        540       550         

          540        550         
pF1KB3 PSIRDCNG-SRSQQWLLRNVTLPEIF
        ..: :.. ...: :           
CCDS53 VQMRTCDALDKNQIWSFEK       
     560       570               

>>CCDS6737.1 GALNT12 gene_id:79695|Hs108|chr9             (581 aa)
 initn: 1163 init1: 629 opt: 1446  Z-score: 1712.2  bits: 326.7 E(32554): 4.7e-89
Smith-Waterman score: 1446; 43.8% identity (69.9% similar) in 528 aa overlap (49-555:62-581)

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pF1KB3 LLDMFLLLYFSECNKCDEKKERGLPAGDVLEPVQK----PHEGPGEMGKPVVIPKEDQE-
                                     :::.     : .. :  :. : .  . .: 
CCDS67 GLGSVLRAQRGAGAGAAEPGPPRTPRPGRREPVMPRPPVPANALGARGEAVRLQLQGEEL
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pF1KB3 KMKEM-FKINQFNLMASEMIALNRSLPDVRLEGCKTKVYP-DNLPTTSVVIVFHNEAWST
       ...:   ...:.:.. :. :.:.: ::.     :: : :  :::: :::.:.:.::::::
CCDS67 RLQEESVRLHQINIYLSDRISLHRRLPERWNPLCKEKKYDYDNLPRTSVIIAFYNEAWST
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pF1KB3 LLRTVHSVINRSPRHMIEEIVLVDDASERDFLKRPLESYVKKLKVPVHVIRMEQRSGLIR
       :::::.::.. ::  ..::..:::: :.:. ::. : . .. :   :..:: ..: ::.:
CCDS67 LLRTVYSVLETSPDILLEEVILVDDYSDREHLKERLANELSGLP-KVRLIRANKREGLVR
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pF1KB3 ARLKGAAVSKGQVITFLDAHCECTVGWLEPLLARIKHDRRTVVCPIIDVISDDTFEYMAG
       ::: ::....:.:.:::: ::::  ::::::: ::.... .::::.::::. .::::...
CCDS67 ARLLGASAARGDVLTFLDCHCECHEGWLEPLLQRIHEEESAVVCPVIDVIDWNTFEYLGN
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pF1KB3 S-DMTYGGFNWKLNFRWYPVPQREMDRRKGDRTLPVRTPTMAGGLFSIDRDYFQEIGTYD
       : .   :::.:.: : :. ::.::  : ..   . .:.::::::::.... ::. .:.::
CCDS67 SGEPQIGGFDWRLVFTWHTVPERERIRMQSPVDV-IRSPTMAGGLFAVSKKYFEYLGSYD
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              320       330       340       350       360       370
pF1KB3 AGMDIWGGENLEISFRIWQCGGTLEIVTCSHVGHVFRKATPYTFPGGTGQIINKNNRRLA
       .::..:::::::.:::::::::.::   :::::::: : .::.   . .     :. : :
CCDS67 TGMEVWGGENLEFSFRIWQCGGVLETHPCSHVGHVFPKQAPYSRNKALA-----NSVRAA
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pF1KB3 EVWMDEFKNFFYIISPGVTKVDYGDISSRVGLRHKLQCKPFSWYLENIYPDSQIPRH---
       ::::::::...:  .: .    .::.. :  :: ::::: :.:.::..::. ..:.    
CCDS67 EVWMDEFKELYYHRNPRARLEPFGDVTERKQLRDKLQCKDFKWFLETVYPELHVPEDRPG
          390       400       410       420       430       440    

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pF1KB3 YFSLGEIRNVETNQCLDNMARKENEKVG----IFNCHGMGGNQVFSYTANKEIRTD----
       .:.. . ... :. :.:     ::. ::    .. ::::: :: : ::..:::: .    
CCDS67 FFGMLQNKGL-TDYCFDYNPPDENQIVGHQVILYLCHGMGQNQFFEYTSQKEIRYNTHQP
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pF1KB3 DLCLDVSKLNGPVTMLKCHHLKGNQLWEYDPVKLTLQHVNSNQCLDKATEE--DSQVPSI
       . :. :      . :  :..   ..         .: : .:..:.. : .:  :: :: .
CCDS67 EGCIAVEAGMDTLIMHLCEETAPENQKFILQEDGSLFHEQSKKCVQAARKESSDSFVPLL
           510       520       530       540       550       560   

       540       550         
pF1KB3 RDCNGSRSQQWLLRNVTLPEIF
       :::..:  :.:....  :    
CCDS67 RDCTNSDHQKWFFKERML    
           570       580     

>>CCDS2226.1 GALNT3 gene_id:2591|Hs108|chr2               (633 aa)
 initn: 1225 init1: 411 opt: 1440  Z-score: 1704.5  bits: 325.4 E(32554): 1.3e-88
Smith-Waterman score: 1465; 45.9% identity (70.8% similar) in 534 aa overlap (48-550:107-629)

        20        30        40        50            60        70   
pF1KB3 VLLDMFLLLYFSECNKCDEKKERGLPAGDVLEPV-QKPHE---GPGEMGKPVVIPKEDQE
                                     :.:: ..: .   .::  ::     . . :
CCDS22 MPKMQIGAPVRQNIDAGERPCLQGYYTAAELKPVLDRPPQDSNAPGASGKAFKTTNLSVE
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pF1KB3 KMKEMFKINQ---FNLMASEMIALNRSL-PDVRLEGC---KTKVYPDNLPTTSVVIVFHN
       ..::  . .    :: .::. :.:.:.: ::.:   :   : :  :  ::::::.:::::
CCDS22 EQKEKERGEAKHCFNAFASDRISLHRDLGPDTRPPECIEQKFKRCPP-LPTTSVIIVFHN
        140       150       160       170       180        190     

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pF1KB3 EAWSTLLRTVHSVINRSPRHMIEEIVLVDDASERDFLKRPLESYVKKLKVPVHVIRMEQR
       :::::::::::::.  ::  ...::.::::::  ..:.  :. :::.... :...:...:
CCDS22 EAWSTLLRTVHSVLYSSPAILLKEIILVDDASVDEYLHDKLDEYVKQFSI-VKIVRQRER
         200       210       220       230       240        250    

        190       200       210       220       230       240      
pF1KB3 SGLIRARLKGAAVSKGQVITFLDAHCECTVGWLEPLLARIKHDRRTVVCPIIDVISDDTF
       .::: ::: ::.:. ....:::::::::  :::::::::: ..  .:: : :  :. .::
CCDS22 KGLITARLLGATVATAETLTFLDAHCECFYGWLEPLLARIAENYTAVVSPDIASIDLNTF
          260       270       280       290       300       310    

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pF1KB3 EYMA----GSDMTYGGFNWKLNFRWYPVPQREMDRRKGDRTLPVRTPTMAGGLFSIDRDY
       :.      ::. . :.:.:.:.: :  .:..: .::: :.: :..:::.:::::::...:
CCDS22 EFNKPSPYGSNHNRGNFDWSLSFGWESLPDHEKQRRK-DETYPIKTPTFAGGLFSISKEY
          320       330       340       350        360       370   

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pF1KB3 FQEIGTYDAGMDIWGGENLEISFRIWQCGGTLEIVTCSHVGHVFRKATPYTFPGGTGQII
       :. ::.::  :.::::::.:.:::.::::: :::. :: ::::::. .:..:: :: :.:
CCDS22 FEYIGSYDEEMEIWGGENIEMSFRVWQCGGQLEIMPCSVVGHVFRSKSPHSFPKGT-QVI
           380       390       400       410       420        430  

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pF1KB3 NKNNRRLAEVWMDEFKNFFYIISPGVTKV----DYGDISSRVGLRHKLQCKPFSWYLENI
        .:. :::::::::.:..::  .  ..:.     .::.:.:  ..:.:::: :.:::.::
CCDS22 ARNQVRLAEVWMDEYKEIFYRRNTDAAKIVKQKAFGDLSKRFEIKHRLQCKNFTWYLNNI
            440       450       460       470       480       490  

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pF1KB3 YPDSQIPRHYFSL-GEIRNVETNQCLDNMARKENEK-VGIFNCHGMGGNQVFSYTANKEI
       ::.  .:     . : :..:    :::    ... : . ...:::.:::: : :.:..::
CCDS22 YPEVYVPDLNPVISGYIKSVGQPLCLDVGENNQGGKPLIMYTCHGLGGNQYFEYSAQHEI
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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