FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE4228, 803 aa 1>>>pF1KE4228 803 - 803 aa - 803 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.9574+/-0.00041; mu= 16.9912+/- 0.025 mean_var=102.8995+/-20.547, 0's: 0 Z-trim(113.6): 401 B-trim: 225 in 1/52 Lambda= 0.126435 statistics sampled from 22535 (22988) to 22535 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.633), E-opt: 0.2 (0.27), width: 16 Scan time: 10.830 The best scores are: opt bits E(85289) NP_008920 (OMIM: 607943) ras GTPase-activating pro ( 803) 5357 988.8 0 XP_016867150 (OMIM: 607943) PREDICTED: ras GTPase- ( 840) 5094 940.9 0 XP_011514025 (OMIM: 607943) PREDICTED: ras GTPase- ( 682) 4055 751.3 3.3e-216 NP_001073346 (OMIM: 607943) ras GTPase-activating ( 757) 4051 750.6 5.9e-216 XP_016867151 (OMIM: 607943) PREDICTED: ras GTPase- ( 794) 4051 750.6 6.1e-216 XP_016875517 (OMIM: 604118) PREDICTED: rasGAP-acti ( 805) 2490 465.9 3.2e-130 NP_001288131 (OMIM: 604118) rasGAP-activating-like ( 805) 2490 465.9 3.2e-130 XP_011537155 (OMIM: 604118) PREDICTED: rasGAP-acti ( 804) 2486 465.1 5.3e-130 NP_004649 (OMIM: 604118) rasGAP-activating-like pr ( 804) 2486 465.1 5.3e-130 XP_005254007 (OMIM: 604118) PREDICTED: rasGAP-acti ( 806) 2478 463.7 1.5e-129 XP_006719704 (OMIM: 604118) PREDICTED: rasGAP-acti ( 806) 2478 463.7 1.5e-129 NP_001180449 (OMIM: 604118) rasGAP-activating-like ( 806) 2478 463.7 1.5e-129 XP_011537154 (OMIM: 604118) PREDICTED: rasGAP-acti ( 806) 2478 463.7 1.5e-129 XP_006719705 (OMIM: 604118) PREDICTED: rasGAP-acti ( 805) 2474 462.9 2.4e-129 XP_016875520 (OMIM: 604118) PREDICTED: rasGAP-acti ( 779) 2315 433.9 1.3e-120 XP_016875518 (OMIM: 604118) PREDICTED: rasGAP-acti ( 780) 2303 431.7 5.8e-120 XP_016875519 (OMIM: 604118) PREDICTED: rasGAP-acti ( 780) 2303 431.7 5.8e-120 NP_001180450 (OMIM: 604118) rasGAP-activating-like ( 776) 1987 374.1 1.3e-102 XP_011537156 (OMIM: 604118) PREDICTED: rasGAP-acti ( 447) 1196 229.6 2.3e-59 NP_001290174 (OMIM: 601589) ras GTPase-activating ( 850) 830 163.1 4.7e-39 NP_006497 (OMIM: 601589) ras GTPase-activating pro ( 849) 825 162.2 8.9e-39 NP_001290175 (OMIM: 601589) ras GTPase-activating ( 853) 819 161.1 1.9e-38 XP_011511361 (OMIM: 601589) PREDICTED: ras GTPase- ( 853) 818 160.9 2.2e-38 XP_016862457 (OMIM: 601589) PREDICTED: ras GTPase- ( 872) 818 160.9 2.2e-38 XP_016862458 (OMIM: 601589) PREDICTED: ras GTPase- ( 871) 813 160.0 4.1e-38 NP_031394 (OMIM: 605182) ras GTPase-activating pro ( 834) 812 159.8 4.5e-38 NP_001307751 (OMIM: 605182) ras GTPase-activating ( 802) 784 154.7 1.5e-36 XP_011533143 (OMIM: 605182) PREDICTED: ras GTPase- ( 802) 784 154.7 1.5e-36 XP_011533144 (OMIM: 605182) PREDICTED: ras GTPase- ( 802) 784 154.7 1.5e-36 XP_016862459 (OMIM: 601589) PREDICTED: ras GTPase- ( 707) 595 120.1 3.3e-26 XP_016862461 (OMIM: 601589) PREDICTED: ras GTPase- ( 442) 581 117.4 1.4e-25 XP_016875928 (OMIM: 605182) PREDICTED: ras GTPase- ( 451) 509 104.3 1.2e-21 XP_016875927 (OMIM: 605182) PREDICTED: ras GTPase- ( 451) 509 104.3 1.2e-21 NP_001307750 (OMIM: 605182) ras GTPase-activating ( 451) 509 104.3 1.2e-21 XP_016862460 (OMIM: 601589) PREDICTED: ras GTPase- ( 573) 448 93.3 3.3e-18 XP_006719639 (OMIM: 185605) PREDICTED: synaptotagm ( 419) 313 68.5 6.8e-11 XP_005269170 (OMIM: 185605) PREDICTED: synaptotagm ( 419) 313 68.5 6.8e-11 NP_001278830 (OMIM: 185605) synaptotagmin-1 isofor ( 419) 313 68.5 6.8e-11 XP_011537012 (OMIM: 185605) PREDICTED: synaptotagm ( 422) 313 68.5 6.8e-11 NP_001129278 (OMIM: 185605) synaptotagmin-1 isofor ( 422) 313 68.5 6.8e-11 NP_005630 (OMIM: 185605) synaptotagmin-1 isoform 1 ( 422) 313 68.5 6.8e-11 NP_001129277 (OMIM: 185605) synaptotagmin-1 isofor ( 422) 313 68.5 6.8e-11 XP_016875398 (OMIM: 185605) PREDICTED: synaptotagm ( 422) 313 68.5 6.8e-11 XP_006723404 (OMIM: 600782) PREDICTED: synaptotagm ( 383) 305 67.0 1.7e-10 NP_003171 (OMIM: 600782) synaptotagmin-5 isoform 1 ( 386) 305 67.0 1.8e-10 XP_016882664 (OMIM: 600782) PREDICTED: synaptotagm ( 386) 305 67.0 1.8e-10 XP_016882665 (OMIM: 600782) PREDICTED: synaptotagm ( 386) 305 67.0 1.8e-10 XP_006723402 (OMIM: 600782) PREDICTED: synaptotagm ( 386) 305 67.0 1.8e-10 NP_783860 (OMIM: 613528) synaptotagmin-9 [Homo sap ( 491) 304 66.9 2.4e-10 XP_011518206 (OMIM: 613528) PREDICTED: synaptotagm ( 492) 304 66.9 2.4e-10 >>NP_008920 (OMIM: 607943) ras GTPase-activating protein (803 aa) initn: 5357 init1: 5357 opt: 5357 Z-score: 5285.2 bits: 988.8 E(85289): 0 Smith-Waterman score: 5357; 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XP_011 LSFAKTPSSKEFPFVSGSRATGKSSDIRATKYIWRVLEYLRAWPRGQRRLKSSPHQPPGL 610 620 630 640 650 660 660 670 680 690 700 710 pF1KE4 QCKCVNELNQWLSALRKVSINNTGLLGSYHPGVFRGDKWSCCHQKEKTGQGCDKTRSRVT XP_011 LPSRCLPWGQVELLPPKRRDSV 670 680 >>NP_001073346 (OMIM: 607943) ras GTPase-activating prot (757 aa) initn: 4051 init1: 4051 opt: 4051 Z-score: 3998.1 bits: 750.6 E(85289): 5.9e-216 Smith-Waterman score: 4961; 94.0% identity (94.3% similar) in 803 aa overlap (1-803:1-757) 10 20 30 40 50 60 pF1KE4 MAKRSSLYIRIVEGKNLPAKDITGSSDPYCIVKVDNEPIIRTATVWKTLCPFWGEEYQVH :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_001 MAKRSSLYIRIVEGKNLPAKDITGSSDPYCIVKVDNEPIIRTATVWKTLCPFWGEEYQVH 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE4 LPPTFHAVAFYVMDEDALSRDDVIGKVCLTRDTIASHPKGFSGWAHLTEVDPDEEVQGEI :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_001 LPPTFHAVAFYVMDEDALSRDDVIGKVCLTRDTIASHPKGFSGWAHLTEVDPDEEVQGEI 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE4 HLRLEVWPGARACRLRCSVLEARDLAPKDRNGTSDPFVRVRYKGRTRETSIVKKSCYPRW :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_001 HLRLEVWPGARACRLRCSVLEARDLAPKDRNGTSDPFVRVRYKGRTRETSIVKKSCYPRW 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE4 NETFEFELQEGAMEALCVEAWDWDLVSRNDFLGKVVIDVQRLRVVQQEEGWFRLQPDQSK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_001 NETFEFELQEGAMEALCVEAWDWDLVSRNDFLGKVVIDVQRLRVVQQEEGWFRLQPDQSK 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE4 SRRHDEGNLGSLQLEVRLRDETVLPSSYYQPLVHLLCHEVKLGMQGPGQLIPLIEETTST :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_001 SRRHDEGNLGSLQLEVRLRDETVLPSSYYQPLVHLLCHEVKLGMQGPGQLIPLIEETTST 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KE4 ECRQDVATNLLKLFLGQGLAKDFLDLLFQLELSRTSETNTLFRSNSLASKSVESFLKVAG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::: NP_001 ECRQDVATNLLKLFLGQGLAKDFLDLLFQLELSRTSETNTLFRSNSLASKSMESFLKVAG 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 pF1KE4 MQYLHGVLGPIINKVFEEKKYVELDPSKVEVKDVGCSGLHRPQTEAEVLEQSAQTLRAHL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_001 MQYLHGVLGPIINKVFEEKKYVELDPSKVEVKDVGCSGLHRPQTEAEVLEQSAQTLRAHL 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 pF1KE4 GALLSALSRSVRACPAVVRATFRQLFRRVRERFPGAQHENVPFIAVTSFLCLRFFSPAIM :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_001 GALLSALSRSVRACPAVVRATFRQLFRRVRERFPGAQHENVPFIAVTSFLCLRFFSPAIM 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 pF1KE4 SPKLFHLRERHADARTSRTLLLLAKAVQNVGNMDTPASRAKEAWMEPLQPTVRQGVAQLK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_001 SPKLFHLRERHADARTSRTLLLLAKAVQNVGNMDTPASRAKEAWMEPLQPTVRQGVAQLK 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 590 600 pF1KE4 DFITKLVDIEEKDELDLQRTLSLQAPPVKEGPLFIHRTKGKGPLMSSSFKKLYFSLTTEA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_001 DFITKLVDIEEKDELDLQRTLSLQAPPVKEGPLFIHRTKGKGPLMSSSFKKLYFSLTTEA 550 560 570 580 590 600 610 620 630 640 650 660 pF1KE4 LSFAKTPSSKKSALIKLANIRAAEKVEEKSFGGSHVMQVIYTDDAGRPQTAYLQCKCVNE :::::::::: :::: NP_001 LSFAKTPSSK----------------------------------------------CVNE 610 670 680 690 700 710 720 pF1KE4 LNQWLSALRKVSINNTGLLGSYHPGVFRGDKWSCCHQKEKTGQGCDKTRSRVTLQEWNDP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_001 LNQWLSALRKVSINNTGLLGSYHPGVFRGDKWSCCHQKEKTGQGCDKTRSRVTLQEWNDP 620 630 640 650 660 670 730 740 750 760 770 780 pF1KE4 LDRDLEAQLIYRHLLGVEAMLWERHRELSGGAEAGTVPTSPGKVPEDSLARLLRVLQDLR ::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_001 LDHDLEAQLIYRHLLGVEAMLWERHRELSGGAEAGTVPTSPGKVPEDSLARLLRVLQDLR 680 690 700 710 720 730 790 800 pF1KE4 EAHSSSPAGSPPSEPNCLLELQT ::::::::::::::::::::::: NP_001 EAHSSSPAGSPPSEPNCLLELQT 740 750 >>XP_016867151 (OMIM: 607943) PREDICTED: ras GTPase-acti (794 aa) initn: 4300 init1: 4051 opt: 4051 Z-score: 3997.8 bits: 750.6 E(85289): 6.1e-216 Smith-Waterman score: 4877; 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XP_016 DEVLELREMPGAPSPLRVELWDWDMVGKNDFLGMVEFSPKTLQQ-KPPKGWFRLLP-FPR 190 200 210 220 230 250 260 270 280 290 pF1KE4 SRRHDEGNLGSLQLEVRLRDETVLPSSYYQPLVHLLCHEVKLGMQGPGQL-----IPLIE ... . ::::.:...::: .. ::::. ::::..:: . : :::.. . :.: XP_016 AEEDSGGNLGALRVKVRLIEDRVLPSQCYQPLMELLMESV----QGPAEEDTASPLALLE 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KE4 ETTSTECRQDVATNLLKLFLGQGLAKDFLDLLFQLELSRTSETNTLFRSNSLASKSVESF : : .::::.::.:.:::::.::: ::: : . :..:: . :::::::::::::.:.: XP_016 ELTLGDCRQDLATKLVKLFLGRGLAGRFLDYLTRREVARTMDPNTLFRSNSLASKSMEQF 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KE4 LKVAGMQYLHGVLGPIINKVFEEKKYVELDPSKVEVKDVGCSGLHRPQTEAEVLEQSAQT .:..:: ::: :: :.:..:::::::.:::: :... . ... .: .. : : XP_016 MKLVGMPYLHEVLKPVISRVFEEKKYMELDPCKMDLGRTRRISFKGALSEEQMRETSLGL 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 pF1KE4 LRAHLGALLSALSRSVRACPAVVRATFRQLFRRVRERFPGAQHENVPFIAVTSFLCLRFF : ..:: ...:. :: :: ..: .:.:: :::.:::: :.:..: ..:...:: :::: XP_016 LTGYLGPIVDAIVGSVGRCPPAMRLAFKQLHRRVEERFPQAEHQDVKYLAISGFLFLRFF 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 pF1KE4 SPAIMSPKLFHLRERHADARTSRTLLLLAKAVQNVGNMDTPASRAKEAWMEPLQPTVRQG .:::..:::: ::..::: .:::.:::::::::..::. ...:: :: ::.: . : XP_016 APAILTPKLFDLRDQHADPQTSRSLLLLAKAVQSIGNLGQQLGQGKELWMAPLHPFLLQC 480 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 590 pF1KE4 VAQLKDFITKLVDIEEKDELDLQ-RTLSLQAPPVKEGPLFIHRTKGKGPLMSSSFKKLYF :....::. .:::.. .: . :.: . :.:: :. .. . : .::: : XP_016 VSRVRDFLDRLVDVDGDEEAGVPARALFPPSAIVREGYLLKRKEEPAGLATRFAFKKRYV 540 550 560 570 580 590 600 610 620 630 640 650 pF1KE4 SLTTEALSFAKTPSSKKSALIKLANIRAAEKVEEKSFGGSHVMQVIYTDDAGRPQTAYLQ :. :.:::.:.: . : ...:::.:.:.: .: :::::. : .: .:.::: XP_016 WLSGETLSFSKSPEWQMCHSIPVSHIRAVERVDEGAFQLPHVMQVVTQDGTGALHTTYLQ 600 610 620 630 640 650 660 670 680 690 700 710 pF1KE4 CKCVNELNQWLSALRKVSINNTGLLGSYHPGVFRGDKWSCCHQKEKTGQGCDKTRSRVTL :: :::::::::::::.: : . :.. :::.::. .:.:: : :... ::..:.: ::: XP_016 CKNVNELNQWLSALRKASAPNPNKLAACHPGAFRSARWTCCLQAERSAAGCSRTHSAVTL 660 670 680 690 700 710 720 730 740 750 760 pF1KE4 QEWNDPLDRDLEAQLIYRHLL-GVEAMLWERHRELSGGAEAGTVPTSPGKVPE------D .:.:::: : ::: .::.:: : . . : . : . :. .. : :: XP_016 GDWSDPLDPDAEAQTVYRQLLLGRDQL---RLKLLEDSNMDTTLEADTGACPEVLARQRA 720 730 740 750 760 770 770 780 790 800 pF1KE4 SLARLLRVLQDLREAHSSSPAGSPPSEPNCLLELQT . ::::.:: :: .:: XP_016 ATARLLEVLADLDRAHEEFQQQERGKAALGPLGP 780 790 800 >>NP_001288131 (OMIM: 604118) rasGAP-activating-like pro (805 aa) initn: 1110 init1: 1067 opt: 2490 Z-score: 2458.8 bits: 465.9 E(85289): 3.2e-130 Smith-Waterman score: 2490; 48.9% identity (74.7% similar) in 796 aa overlap (1-783:1-787) 10 20 30 40 50 60 pF1KE4 MAKRSSLYIRIVEGKNLPAKDITGSSDPYCIVKVDNEPIIRTATVWKTLCPFWGEEYQVH ::: ::: .:.:::. :::::..:::::::.::::.: . ::::::..: ::::::: :: NP_001 MAKSSSLNVRVVEGRALPAKDVSGSSDPYCLVKVDDEVVARTATVWRSLGPFWGEEYTVH 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE4 LPPTFHAVAFYVMDEDALSRDDVIGKVCLTRDTIASHPKGFSGWAHLTEVDPDEEVQGEI :: :: .::::.:::....::.:::. :.:..:.. :.:...: .:..:::: :::::: NP_001 LPLDFHQLAFYVLDEDTVGHDDIIGKISLSREAITADPRGIDSWINLSRVDPDAEVQGEI 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE4 HLRLEVWPGARACRLRCSVLEARDLAPKDRNGTSDPFVRVRYKGRTRETSIVKKSCYPRW : ... ... ::: ::.::::::.: .::::::.:: . ... ::: .::. .:.: NP_001 CLSVQMLEDGQGRCLRCHVLQARDLAPRDISGTSDPFARVFWGSQSLETSTIKKTRFPHW 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE4 NETFEFELQEGAMEALCVEAWDWDLVSRNDFLGKVVIDVQRLRVVQQEEGWFRLQPDQSK .:..:.. . :: : :: ::::.:..::::: : .. . :. . .::::: : . NP_001 DEVLELREMPGAPSPLRVELWDWDMVGKNDFLGMVEFSPKTLQQ-KPPKGWFRLLP-FPR 190 200 210 220 230 250 260 270 280 290 pF1KE4 SRRHDEGNLGSLQLEVRLRDETVLPSSYYQPLVHLLCHEVKLGMQGPGQL-----IPLIE ... . ::::.:...::: .. ::::. ::::..:: . : :::.. . :.: NP_001 AEEDSGGNLGALRVKVRLIEDRVLPSQCYQPLMELLMESV----QGPAEEDTASPLALLE 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KE4 ETTSTECRQDVATNLLKLFLGQGLAKDFLDLLFQLELSRTSETNTLFRSNSLASKSVESF : : .::::.::.:.:::::.::: ::: : . :..:: . :::::::::::::.:.: NP_001 ELTLGDCRQDLATKLVKLFLGRGLAGRFLDYLTRREVARTMDPNTLFRSNSLASKSMEQF 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KE4 LKVAGMQYLHGVLGPIINKVFEEKKYVELDPSKVEVKDVGCSGLHRPQTEAEVLEQSAQT .:..:: ::: :: :.:..:::::::.:::: :... . ... .: .. : : NP_001 MKLVGMPYLHEVLKPVISRVFEEKKYMELDPCKMDLGRTRRISFKGALSEEQMRETSLGL 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 pF1KE4 LRAHLGALLSALSRSVRACPAVVRATFRQLFRRVRERFPGAQHENVPFIAVTSFLCLRFF : ..:: ...:. :: :: ..: .:.:: :::.:::: :.:..: ..:...:: :::: NP_001 LTGYLGPIVDAIVGSVGRCPPAMRLAFKQLHRRVEERFPQAEHQDVKYLAISGFLFLRFF 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 pF1KE4 SPAIMSPKLFHLRERHADARTSRTLLLLAKAVQNVGNMDTPASRAKEAWMEPLQPTVRQG .:::..:::: ::..::: .:::.:::::::::..::. ...:: :: ::.: . : NP_001 APAILTPKLFDLRDQHADPQTSRSLLLLAKAVQSIGNLGQQLGQGKELWMAPLHPFLLQC 480 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 590 pF1KE4 VAQLKDFITKLVDIEEKDELDLQ-RTLSLQAPPVKEGPLFIHRTKGKGPLMSSSFKKLYF :....::. .:::.. .: . :.: . :.:: :. .. . : .::: : NP_001 VSRVRDFLDRLVDVDGDEEAGVPARALFPPSAIVREGYLLKRKEEPAGLATRFAFKKRYV 540 550 560 570 580 590 600 610 620 630 640 650 pF1KE4 SLTTEALSFAKTPSSKKSALIKLANIRAAEKVEEKSFGGSHVMQVIYTDDAGRPQTAYLQ :. :.:::.:.: . : ...:::.:.:.: .: :::::. : .: .:.::: NP_001 WLSGETLSFSKSPEWQMCHSIPVSHIRAVERVDEGAFQLPHVMQVVTQDGTGALHTTYLQ 600 610 620 630 640 650 660 670 680 690 700 710 pF1KE4 CKCVNELNQWLSALRKVSINNTGLLGSYHPGVFRGDKWSCCHQKEKTGQGCDKTRSRVTL :: :::::::::::::.: : . :.. :::.::. .:.:: : :... ::..:.: ::: NP_001 CKNVNELNQWLSALRKASAPNPNKLAACHPGAFRSARWTCCLQAERSAAGCSRTHSAVTL 660 670 680 690 700 710 720 730 740 750 760 pF1KE4 QEWNDPLDRDLEAQLIYRHLL-GVEAMLWERHRELSGGAEAGTVPTSPGKVPE------D .:.:::: : ::: .::.:: : . . : . : . :. .. : :: NP_001 GDWSDPLDPDAEAQTVYRQLLLGRDQL---RLKLLEDSNMDTTLEADTGACPEVLARQRA 720 730 740 750 760 770 770 780 790 800 pF1KE4 SLARLLRVLQDLREAHSSSPAGSPPSEPNCLLELQT . ::::.:: :: .:: NP_001 ATARLLEVLADLDRAHEEFQQQERGKAALGPLGP 780 790 800 >>XP_011537155 (OMIM: 604118) PREDICTED: rasGAP-activati (804 aa) initn: 2456 init1: 1431 opt: 2486 Z-score: 2454.9 bits: 465.1 E(85289): 5.3e-130 Smith-Waterman score: 2486; 49.0% identity (74.7% similar) in 796 aa overlap (1-783:1-786) 10 20 30 40 50 60 pF1KE4 MAKRSSLYIRIVEGKNLPAKDITGSSDPYCIVKVDNEPIIRTATVWKTLCPFWGEEYQVH ::: ::: .:.:::. :::::..:::::::.::::.: . ::::::..: ::::::: :: XP_011 MAKSSSLNVRVVEGRALPAKDVSGSSDPYCLVKVDDEVVARTATVWRSLGPFWGEEYTVH 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE4 LPPTFHAVAFYVMDEDALSRDDVIGKVCLTRDTIASHPKGFSGWAHLTEVDPDEEVQGEI :: :: .::::.:::....::.:::. :.:..:.. :.:...: .:..:::: :::::: XP_011 LPLDFHQLAFYVLDEDTVGHDDIIGKISLSREAITADPRGIDSWINLSRVDPDAEVQGEI 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE4 HLRLEVWPGARACRLRCSVLEARDLAPKDRNGTSDPFVRVRYKGRTRETSIVKKSCYPRW : ... ... ::: ::.::::::.: .::::::.:: . ... ::: .::. .:.: XP_011 CLSVQMLEDGQGRCLRCHVLQARDLAPRDISGTSDPFARVFWGSQSLETSTIKKTRFPHW 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE4 NETFEFELQEGAMEALCVEAWDWDLVSRNDFLGKVVIDVQRLRVVQQEEGWFRLQPDQSK .:..:.. . :: : :: ::::.:..::::: : .. . :. . .::::: : . XP_011 DEVLELREMPGAPSPLRVELWDWDMVGKNDFLGMVEFSPKTLQQ-KPPKGWFRLLP-FPR 190 200 210 220 230 250 260 270 280 290 pF1KE4 SRRHDEGNLGSLQLEVRLRDETVLPSSYYQPLVHLLCHEVKLGMQGPGQL-----IPLIE ... . ::::.:...::: .. ::::. ::::..:: . : :::.. . :.: XP_011 AEEDSGGNLGALRVKVRLIEDRVLPSQCYQPLMELLMESV----QGPAEEDTASPLALLE 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KE4 ETTSTECRQDVATNLLKLFLGQGLAKDFLDLLFQLELSRTSETNTLFRSNSLASKSVESF : : .::::.::.:.:::::.::: ::: : . :..:: . :::::::::::::.:.: XP_011 ELTLGDCRQDLATKLVKLFLGRGLAGRFLDYLTRREVARTMDPNTLFRSNSLASKSMEQF 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KE4 LKVAGMQYLHGVLGPIINKVFEEKKYVELDPSKVEVKDVGCSGLHRPQTEAEVLEQSAQT .:..:: ::: :: :.:..:::::::.:::: :... . ... .: .. : : XP_011 MKLVGMPYLHEVLKPVISRVFEEKKYMELDPCKMDLGRTRRISFKGALSEEQMRETSLGL 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 pF1KE4 LRAHLGALLSALSRSVRACPAVVRATFRQLFRRVRERFPGAQHENVPFIAVTSFLCLRFF : ..:: ...:. :: :: ..: .:.:: :::.:::: :.:..: ..:...:: :::: XP_011 LTGYLGPIVDAIVGSVGRCPPAMRLAFKQLHRRVEERFPQAEHQDVKYLAISGFLFLRFF 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 pF1KE4 SPAIMSPKLFHLRERHADARTSRTLLLLAKAVQNVGNMDTPASRAKEAWMEPLQPTVRQG .:::..:::: ::..::: .:::.:::::::::..::. ...:: :: ::.: . : XP_011 APAILTPKLFDLRDQHADPQTSRSLLLLAKAVQSIGNLGQQLGQGKELWMAPLHPFLLQC 480 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 590 pF1KE4 VAQLKDFITKLVDIEEKDELDLQ-RTLSLQAPPVKEGPLFIHRTKGKGPLMSSSFKKLYF :....::. .:::.. :: . :.: . :.:: :. .. . : .::: : XP_011 VSRVRDFLDRLVDVD-GDEAGVPARALFPPSAIVREGYLLKRKEEPAGLATRFAFKKRYV 540 550 560 570 580 590 600 610 620 630 640 650 pF1KE4 SLTTEALSFAKTPSSKKSALIKLANIRAAEKVEEKSFGGSHVMQVIYTDDAGRPQTAYLQ :. :.:::.:.: . : ...:::.:.:.: .: :::::. : .: .:.::: XP_011 WLSGETLSFSKSPEWQMCHSIPVSHIRAVERVDEGAFQLPHVMQVVTQDGTGALHTTYLQ 600 610 620 630 640 650 660 670 680 690 700 710 pF1KE4 CKCVNELNQWLSALRKVSINNTGLLGSYHPGVFRGDKWSCCHQKEKTGQGCDKTRSRVTL :: :::::::::::::.: : . :.. :::.::. .:.:: : :... ::..:.: ::: XP_011 CKNVNELNQWLSALRKASAPNPNKLAACHPGAFRSARWTCCLQAERSAAGCSRTHSAVTL 660 670 680 690 700 710 720 730 740 750 760 pF1KE4 QEWNDPLDRDLEAQLIYRHLL-GVEAMLWERHRELSGGAEAGTVPTSPGKVPE------D .:.:::: : ::: .::.:: : . . : . : . :. .. : :: XP_011 GDWSDPLDPDAEAQTVYRQLLLGRDQL---RLKLLEDSNMDTTLEADTGACPEVLARQRA 720 730 740 750 760 770 770 780 790 800 pF1KE4 SLARLLRVLQDLREAHSSSPAGSPPSEPNCLLELQT . ::::.:: :: .:: XP_011 ATARLLEVLADLDRAHEEFQQQERGKAALGPLGP 780 790 800 >>NP_004649 (OMIM: 604118) rasGAP-activating-like protei (804 aa) initn: 2456 init1: 1431 opt: 2486 Z-score: 2454.9 bits: 465.1 E(85289): 5.3e-130 Smith-Waterman score: 2486; 49.0% identity (74.7% similar) in 796 aa overlap (1-783:1-786) 10 20 30 40 50 60 pF1KE4 MAKRSSLYIRIVEGKNLPAKDITGSSDPYCIVKVDNEPIIRTATVWKTLCPFWGEEYQVH ::: ::: .:.:::. :::::..:::::::.::::.: . ::::::..: ::::::: :: NP_004 MAKSSSLNVRVVEGRALPAKDVSGSSDPYCLVKVDDEVVARTATVWRSLGPFWGEEYTVH 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE4 LPPTFHAVAFYVMDEDALSRDDVIGKVCLTRDTIASHPKGFSGWAHLTEVDPDEEVQGEI :: :: .::::.:::....::.:::. :.:..:.. :.:...: .:..:::: :::::: NP_004 LPLDFHQLAFYVLDEDTVGHDDIIGKISLSREAITADPRGIDSWINLSRVDPDAEVQGEI 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE4 HLRLEVWPGARACRLRCSVLEARDLAPKDRNGTSDPFVRVRYKGRTRETSIVKKSCYPRW : ... ... ::: ::.::::::.: .::::::.:: . ... ::: .::. .:.: NP_004 CLSVQMLEDGQGRCLRCHVLQARDLAPRDISGTSDPFARVFWGSQSLETSTIKKTRFPHW 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE4 NETFEFELQEGAMEALCVEAWDWDLVSRNDFLGKVVIDVQRLRVVQQEEGWFRLQPDQSK .:..:.. . :: : :: ::::.:..::::: : .. . :. . .::::: : . NP_004 DEVLELREMPGAPSPLRVELWDWDMVGKNDFLGMVEFSPKTLQQ-KPPKGWFRLLP-FPR 190 200 210 220 230 250 260 270 280 290 pF1KE4 SRRHDEGNLGSLQLEVRLRDETVLPSSYYQPLVHLLCHEVKLGMQGPGQL-----IPLIE ... . ::::.:...::: .. ::::. ::::..:: . : :::.. . :.: NP_004 AEEDSGGNLGALRVKVRLIEDRVLPSQCYQPLMELLMESV----QGPAEEDTASPLALLE 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KE4 ETTSTECRQDVATNLLKLFLGQGLAKDFLDLLFQLELSRTSETNTLFRSNSLASKSVESF : : .::::.::.:.:::::.::: ::: : . :..:: . :::::::::::::.:.: NP_004 ELTLGDCRQDLATKLVKLFLGRGLAGRFLDYLTRREVARTMDPNTLFRSNSLASKSMEQF 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KE4 LKVAGMQYLHGVLGPIINKVFEEKKYVELDPSKVEVKDVGCSGLHRPQTEAEVLEQSAQT .:..:: ::: :: :.:..:::::::.:::: :... . ... .: .. : : NP_004 MKLVGMPYLHEVLKPVISRVFEEKKYMELDPCKMDLGRTRRISFKGALSEEQMRETSLGL 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 pF1KE4 LRAHLGALLSALSRSVRACPAVVRATFRQLFRRVRERFPGAQHENVPFIAVTSFLCLRFF : ..:: ...:. :: :: ..: .:.:: :::.:::: :.:..: ..:...:: :::: NP_004 LTGYLGPIVDAIVGSVGRCPPAMRLAFKQLHRRVEERFPQAEHQDVKYLAISGFLFLRFF 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 pF1KE4 SPAIMSPKLFHLRERHADARTSRTLLLLAKAVQNVGNMDTPASRAKEAWMEPLQPTVRQG .:::..:::: ::..::: .:::.:::::::::..::. ...:: :: ::.: . : NP_004 APAILTPKLFDLRDQHADPQTSRSLLLLAKAVQSIGNLGQQLGQGKELWMAPLHPFLLQC 480 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 590 pF1KE4 VAQLKDFITKLVDIEEKDELDLQ-RTLSLQAPPVKEGPLFIHRTKGKGPLMSSSFKKLYF :....::. .:::.. :: . :.: . :.:: :. .. . : .::: : NP_004 VSRVRDFLDRLVDVD-GDEAGVPARALFPPSAIVREGYLLKRKEEPAGLATRFAFKKRYV 540 550 560 570 580 590 600 610 620 630 640 650 pF1KE4 SLTTEALSFAKTPSSKKSALIKLANIRAAEKVEEKSFGGSHVMQVIYTDDAGRPQTAYLQ :. :.:::.:.: . : ...:::.:.:.: .: :::::. : .: .:.::: NP_004 WLSGETLSFSKSPEWQMCHSIPVSHIRAVERVDEGAFQLPHVMQVVTQDGTGALHTTYLQ 600 610 620 630 640 650 660 670 680 690 700 710 pF1KE4 CKCVNELNQWLSALRKVSINNTGLLGSYHPGVFRGDKWSCCHQKEKTGQGCDKTRSRVTL :: :::::::::::::.: : . :.. :::.::. .:.:: : :... ::..:.: ::: NP_004 CKNVNELNQWLSALRKASAPNPNKLAACHPGAFRSARWTCCLQAERSAAGCSRTHSAVTL 660 670 680 690 700 710 720 730 740 750 760 pF1KE4 QEWNDPLDRDLEAQLIYRHLL-GVEAMLWERHRELSGGAEAGTVPTSPGKVPE------D .:.:::: : ::: .::.:: : . . : . : . :. .. : :: NP_004 GDWSDPLDPDAEAQTVYRQLLLGRDQL---RLKLLEDSNMDTTLEADTGACPEVLARQRA 720 730 740 750 760 770 770 780 790 800 pF1KE4 SLARLLRVLQDLREAHSSSPAGSPPSEPNCLLELQT . ::::.:: :: .:: NP_004 ATARLLEVLADLDRAHEEFQQQERGKAALGPLGP 780 790 800 >>XP_005254007 (OMIM: 604118) PREDICTED: rasGAP-activati (806 aa) initn: 2288 init1: 1005 opt: 2478 Z-score: 2447.0 bits: 463.7 E(85289): 1.5e-129 Smith-Waterman score: 2478; 48.8% identity (74.7% similar) in 797 aa overlap (1-783:1-788) 10 20 30 40 50 60 pF1KE4 MAKRSSLYIRIVEGKNLPAKDITGSSDPYCIVKVDNEPIIRTATVWKTLCPFWGEEYQVH ::: ::: .:.:::. :::::..:::::::.::::.: . ::::::..: ::::::: :: XP_005 MAKSSSLNVRVVEGRALPAKDVSGSSDPYCLVKVDDEVVARTATVWRSLGPFWGEEYTVH 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE4 LPPTFHAVAFYVMDEDALSRDDVIGKVCLTRDTIASHPKGFSGWAHLTEVDPDEEVQGEI :: :: .::::.:::....::.:::. :.:..:.. :.:...: .:..:::: :::::: XP_005 LPLDFHQLAFYVLDEDTVGHDDIIGKISLSREAITADPRGIDSWINLSRVDPDAEVQGEI 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE4 HLRLEVWPGARACRLRCSVLEARDLAPKDRNGTSDPFVRVRYKGRTRETSIVKKSCYPRW : ... ... ::: ::.::::::.: .::::::.:: . ... ::: .::. .:.: XP_005 CLSVQMLEDGQGRCLRCHVLQARDLAPRDISGTSDPFARVFWGSQSLETSTIKKTRFPHW 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE4 NETFEFELQEGAMEALCVEAWDWDLVSRNDFLGKVVIDVQRLRVVQQEEGWFRLQPDQSK .:..:.. . :: : :: ::::.:..::::: : .. . :. . .::::: : . XP_005 DEVLELREMPGAPSPLRVELWDWDMVGKNDFLGMVEFSPKTLQQ-KPPKGWFRLLP-FPR 190 200 210 220 230 250 260 270 280 290 pF1KE4 SRRHDEGNLGSLQLEVRLRDETVLPSSYYQPLVHLLCHEVKLGMQGPGQL-----IPLIE ... . ::::.:...::: .. ::::. ::::..:: . : :::.. . :.: XP_005 AEEDSGGNLGALRVKVRLIEDRVLPSQCYQPLMELLMESV----QGPAEEDTASPLALLE 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KE4 ETTSTECRQDVATNLLKLFLGQGLAKDFLDLLFQLELSRTSETNTLFRSNSLASKSVESF : : .::::.::.:.:::::.::: ::: : . :..:: . :::::::::::::.:.: XP_005 ELTLGDCRQDLATKLVKLFLGRGLAGRFLDYLTRREVARTMDPNTLFRSNSLASKSMEQF 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KE4 LKVAGMQYLHGVLGPIINKVFEEKKYVELDPSKVEVKDVGCSGLHRPQTEAEVLEQSAQT .:..:: ::: :: :.:..:::::::.:::: :... . ... .: .. : : XP_005 MKLVGMPYLHEVLKPVISRVFEEKKYMELDPCKMDLGRTRRISFKGALSEEQMRETSLGL 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 pF1KE4 LRAHLGALLSALSRSVRACPAVVRATFRQLFRRVRERFPGAQHE-NVPFIAVTSFLCLRF : ..:: ...:. :: :: ..: .:.:: :::.:::: :.:. .: ..:...:: ::: XP_005 LTGYLGPIVDAIVGSVGRCPPAMRLAFKQLHRRVEERFPQAEHQQDVKYLAISGFLFLRF 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 pF1KE4 FSPAIMSPKLFHLRERHADARTSRTLLLLAKAVQNVGNMDTPASRAKEAWMEPLQPTVRQ :.:::..:::: ::..::: .:::.:::::::::..::. ...:: :: ::.: . : XP_005 FAPAILTPKLFDLRDQHADPQTSRSLLLLAKAVQSIGNLGQQLGQGKELWMAPLHPFLLQ 480 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 590 pF1KE4 GVAQLKDFITKLVDIEEKDELDLQ-RTLSLQAPPVKEGPLFIHRTKGKGPLMSSSFKKLY :....::. .:::.. .: . :.: . :.:: :. .. . : .::: : XP_005 CVSRVRDFLDRLVDVDGDEEAGVPARALFPPSAIVREGYLLKRKEEPAGLATRFAFKKRY 540 550 560 570 580 590 600 610 620 630 640 650 pF1KE4 FSLTTEALSFAKTPSSKKSALIKLANIRAAEKVEEKSFGGSHVMQVIYTDDAGRPQTAYL :. :.:::.:.: . : ...:::.:.:.: .: :::::. : .: .:.:: XP_005 VWLSGETLSFSKSPEWQMCHSIPVSHIRAVERVDEGAFQLPHVMQVVTQDGTGALHTTYL 600 610 620 630 640 650 660 670 680 690 700 710 pF1KE4 QCKCVNELNQWLSALRKVSINNTGLLGSYHPGVFRGDKWSCCHQKEKTGQGCDKTRSRVT ::: :::::::::::::.: : . :.. :::.::. .:.:: : :... ::..:.: :: XP_005 QCKNVNELNQWLSALRKASAPNPNKLAACHPGAFRSARWTCCLQAERSAAGCSRTHSAVT 660 670 680 690 700 710 720 730 740 750 760 pF1KE4 LQEWNDPLDRDLEAQLIYRHLL-GVEAMLWERHRELSGGAEAGTVPTSPGKVPE------ : .:.:::: : ::: .::.:: : . . : . : . :. .. : :: XP_005 LGDWSDPLDPDAEAQTVYRQLLLGRDQL---RLKLLEDSNMDTTLEADTGACPEVLARQR 720 730 740 750 760 770 770 780 790 800 pF1KE4 DSLARLLRVLQDLREAHSSSPAGSPPSEPNCLLELQT . ::::.:: :: .:: XP_005 AATARLLEVLADLDRAHEEFQQQERGKAALGPLGP 780 790 800 803 residues in 1 query sequences 60827320 residues in 85289 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Sat Nov 5 18:09:25 2016 done: Sat Nov 5 18:09:27 2016 Total Scan time: 10.830 Total Display time: 0.290 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]