Result of FASTA (omim) for
pFN21AB3205
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB3205, 545 aa
1>>>pF1KB3205 545 - 545 aa - 545 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.5642+/-0.000496; mu= 17.6188+/- 0.031
mean_var=81.2294+/-16.350, 0's: 0 Z-trim(108.8): 57 B-trim: 56 in 1/49
Lambda= 0.142304
statistics sampled from 16861 (16915) to 16861 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.556), E-opt: 0.2 (0.198), width: 16
Scan time: 7.750
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_005989 (OMIM: 600114) T-complex protein 1 subun ( 545) 3512 731.6 1.5e-210
NP_001008800 (OMIM: 600114) T-complex protein 1 su ( 507) 3072 641.2 2.3e-183
NP_036205 (OMIM: 256840,610150) T-complex protein ( 541) 1046 225.3 3.9e-58
NP_006421 (OMIM: 605142) T-complex protein 1 subun ( 539) 1039 223.8 1e-57
NP_001293082 (OMIM: 256840,610150) T-complex prote ( 520) 1028 221.6 4.8e-57
NP_001293085 (OMIM: 256840,610150) T-complex prote ( 503) 1019 219.7 1.7e-56
NP_006420 (OMIM: 605140) T-complex protein 1 subun ( 543) 987 213.2 1.7e-54
NP_001753 (OMIM: 104613) T-complex protein 1 subun ( 531) 920 199.4 2.3e-50
NP_006575 (OMIM: 610730) T-complex protein 1 subun ( 530) 894 194.1 9.4e-49
XP_011530780 (OMIM: 605140) PREDICTED: T-complex p ( 499) 892 193.6 1.2e-48
XP_011530781 (OMIM: 605140) PREDICTED: T-complex p ( 499) 892 193.6 1.2e-48
NP_001159757 (OMIM: 605140) T-complex protein 1 su ( 499) 892 193.6 1.2e-48
NP_110379 (OMIM: 186980) T-complex protein 1 subun ( 556) 848 184.6 6.8e-46
NP_001243650 (OMIM: 605142) T-complex protein 1 su ( 509) 826 180.1 1.4e-44
NP_006422 (OMIM: 605139) T-complex protein 1 subun ( 535) 795 173.7 1.2e-42
NP_001293084 (OMIM: 256840,610150) T-complex prote ( 448) 770 168.6 3.8e-41
NP_001293083 (OMIM: 256840,610150) T-complex prote ( 486) 770 168.6 4e-41
NP_001159756 (OMIM: 605140) T-complex protein 1 su ( 456) 750 164.5 6.6e-40
XP_016879512 (OMIM: 610730) PREDICTED: T-complex p ( 464) 741 162.6 2.4e-39
NP_001185771 (OMIM: 605139) T-complex protein 1 su ( 488) 729 160.2 1.4e-38
NP_001009186 (OMIM: 104613) T-complex protein 1 su ( 486) 644 142.7 2.5e-33
NP_001180459 (OMIM: 610730) T-complex protein 1 su ( 485) 620 137.8 7.5e-32
XP_011522505 (OMIM: 610730) PREDICTED: T-complex p ( 388) 579 129.3 2.2e-29
NP_001008897 (OMIM: 186980) T-complex protein 1 su ( 401) 577 128.9 2.9e-29
NP_001009570 (OMIM: 605140) T-complex protein 1 su ( 339) 556 124.5 5.1e-28
XP_016879513 (OMIM: 610730) PREDICTED: T-complex p ( 351) 468 106.5 1.4e-22
NP_001180458 (OMIM: 610730) T-complex protein 1 su ( 493) 363 85.0 5.8e-16
XP_011509094 (OMIM: 121850,609414) PREDICTED: 1-ph (1340) 357 84.1 3e-15
XP_011509092 (OMIM: 121850,609414) PREDICTED: 1-ph (1779) 357 84.2 3.8e-15
XP_016859061 (OMIM: 121850,609414) PREDICTED: 1-ph (1779) 357 84.2 3.8e-15
XP_016859062 (OMIM: 121850,609414) PREDICTED: 1-ph (1779) 357 84.2 3.8e-15
XP_016859063 (OMIM: 121850,609414) PREDICTED: 1-ph (1779) 357 84.2 3.8e-15
XP_016859060 (OMIM: 121850,609414) PREDICTED: 1-ph (1895) 357 84.2 4e-15
XP_016859059 (OMIM: 121850,609414) PREDICTED: 1-ph (1945) 357 84.2 4e-15
XP_011509091 (OMIM: 121850,609414) PREDICTED: 1-ph (1951) 357 84.2 4.1e-15
XP_011509090 (OMIM: 121850,609414) PREDICTED: 1-ph (2001) 357 84.2 4.1e-15
XP_011509089 (OMIM: 121850,609414) PREDICTED: 1-ph (2012) 357 84.2 4.2e-15
XP_011509088 (OMIM: 121850,609414) PREDICTED: 1-ph (2013) 357 84.2 4.2e-15
XP_016859058 (OMIM: 121850,609414) PREDICTED: 1-ph (2036) 357 84.2 4.2e-15
XP_011509087 (OMIM: 121850,609414) PREDICTED: 1-ph (2048) 357 84.2 4.2e-15
XP_011509086 (OMIM: 121850,609414) PREDICTED: 1-ph (2053) 357 84.2 4.2e-15
XP_011509085 (OMIM: 121850,609414) PREDICTED: 1-ph (2054) 357 84.2 4.2e-15
XP_011509084 (OMIM: 121850,609414) PREDICTED: 1-ph (2055) 357 84.2 4.2e-15
XP_016859057 (OMIM: 121850,609414) PREDICTED: 1-ph (2092) 357 84.2 4.3e-15
NP_055855 (OMIM: 121850,609414) 1-phosphatidylinos (2098) 357 84.2 4.3e-15
XP_011509083 (OMIM: 121850,609414) PREDICTED: 1-ph (2104) 357 84.2 4.3e-15
XP_011509082 (OMIM: 121850,609414) PREDICTED: 1-ph (2109) 357 84.2 4.3e-15
XP_011509081 (OMIM: 121850,609414) PREDICTED: 1-ph (2110) 357 84.2 4.3e-15
XP_011509080 (OMIM: 121850,609414) PREDICTED: 1-ph (2110) 357 84.2 4.3e-15
NP_061336 (OMIM: 209900,236700,604896,605231) McKu ( 570) 287 69.5 3.2e-11
>>NP_005989 (OMIM: 600114) T-complex protein 1 subunit g (545 aa)
initn: 3512 init1: 3512 opt: 3512 Z-score: 3900.9 bits: 731.6 E(85289): 1.5e-210
Smith-Waterman score: 3512; 100.0% identity (100.0% similar) in 545 aa overlap (1-545:1-545)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MMGHRPVLVLSQNTKRESGRKVQSGNINAAKTIADIIRTCLGPKSMMKMLLDPMGGIVMT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 MMGHRPVLVLSQNTKRESGRKVQSGNINAAKTIADIIRTCLGPKSMMKMLLDPMGGIVMT
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 NDGNAILREIQVQHPAAKSMIEISRTQDEEVGDGTTSVIILAGEMLSVAEHFLEQQMHPT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 NDGNAILREIQVQHPAAKSMIEISRTQDEEVGDGTTSVIILAGEMLSVAEHFLEQQMHPT
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB3 VVISAYRKALDDMISTLKKISIPVDISDSDMMLNIINSSITTKAISRWSSLACNIALDAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 VVISAYRKALDDMISTLKKISIPVDISDSDMMLNIINSSITTKAISRWSSLACNIALDAV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB3 KMVQFEENGRKEIDIKKYARVEKIPGGIIEDSCVLRGVMINKDVTHPRMRRYIKNPRIVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 KMVQFEENGRKEIDIKKYARVEKIPGGIIEDSCVLRGVMINKDVTHPRMRRYIKNPRIVL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB3 LDSSLEYKKGESQTDIEITREEDFTRILQMEEEYIQQLCEDIIQLKPDVVITEKGISDLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 LDSSLEYKKGESQTDIEITREEDFTRILQMEEEYIQQLCEDIIQLKPDVVITEKGISDLA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB3 QHYLMRANITAIRRVRKTDNNRIARACGARIVSRPEELREDDVGTGAGLLEIKKIGDEYF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 QHYLMRANITAIRRVRKTDNNRIARACGARIVSRPEELREDDVGTGAGLLEIKKIGDEYF
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB3 TFITDCKDPKACTILLRGASKEILSEVERNLQDAMQVCRNVLLDPQLVPGGGASEMAVAH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 TFITDCKDPKACTILLRGASKEILSEVERNLQDAMQVCRNVLLDPQLVPGGGASEMAVAH
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB3 ALTEKSKAMTGVEQWPYRAVAQALEVIPRTLIQNCGASTIRLLTSLRAKHTQENCETWGV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 ALTEKSKAMTGVEQWPYRAVAQALEVIPRTLIQNCGASTIRLLTSLRAKHTQENCETWGV
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB3 NGETGTLVDMKELGIWEPLAVKLQTYKTAVETAVLLLRIDDIVSGHKKKGDDQSRQGGAP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 NGETGTLVDMKELGIWEPLAVKLQTYKTAVETAVLLLRIDDIVSGHKKKGDDQSRQGGAP
490 500 510 520 530 540
pF1KB3 DAGQE
:::::
NP_005 DAGQE
>>NP_001008800 (OMIM: 600114) T-complex protein 1 subuni (507 aa)
initn: 3072 init1: 3072 opt: 3072 Z-score: 3413.1 bits: 641.2 E(85289): 2.3e-183
Smith-Waterman score: 3176; 93.0% identity (93.0% similar) in 545 aa overlap (1-545:1-507)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MMGHRPVLVLSQNTKRESGRKVQSGNINAAKTIADIIRTCLGPKSMMKMLLDPMGGIVMT
:::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MMGHRPVLVLSQNTKRESGRKVQSGNINAAK-----------------------------
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 NDGNAILREIQVQHPAAKSMIEISRTQDEEVGDGTTSVIILAGEMLSVAEHFLEQQMHPT
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ---------IQVQHPAAKSMIEISRTQDEEVGDGTTSVIILAGEMLSVAEHFLEQQMHPT
40 50 60 70 80
130 140 150 160 170 180
pF1KB3 VVISAYRKALDDMISTLKKISIPVDISDSDMMLNIINSSITTKAISRWSSLACNIALDAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VVISAYRKALDDMISTLKKISIPVDISDSDMMLNIINSSITTKAISRWSSLACNIALDAV
90 100 110 120 130 140
190 200 210 220 230 240
pF1KB3 KMVQFEENGRKEIDIKKYARVEKIPGGIIEDSCVLRGVMINKDVTHPRMRRYIKNPRIVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KMVQFEENGRKEIDIKKYARVEKIPGGIIEDSCVLRGVMINKDVTHPRMRRYIKNPRIVL
150 160 170 180 190 200
250 260 270 280 290 300
pF1KB3 LDSSLEYKKGESQTDIEITREEDFTRILQMEEEYIQQLCEDIIQLKPDVVITEKGISDLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LDSSLEYKKGESQTDIEITREEDFTRILQMEEEYIQQLCEDIIQLKPDVVITEKGISDLA
210 220 230 240 250 260
310 320 330 340 350 360
pF1KB3 QHYLMRANITAIRRVRKTDNNRIARACGARIVSRPEELREDDVGTGAGLLEIKKIGDEYF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QHYLMRANITAIRRVRKTDNNRIARACGARIVSRPEELREDDVGTGAGLLEIKKIGDEYF
270 280 290 300 310 320
370 380 390 400 410 420
pF1KB3 TFITDCKDPKACTILLRGASKEILSEVERNLQDAMQVCRNVLLDPQLVPGGGASEMAVAH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TFITDCKDPKACTILLRGASKEILSEVERNLQDAMQVCRNVLLDPQLVPGGGASEMAVAH
330 340 350 360 370 380
430 440 450 460 470 480
pF1KB3 ALTEKSKAMTGVEQWPYRAVAQALEVIPRTLIQNCGASTIRLLTSLRAKHTQENCETWGV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ALTEKSKAMTGVEQWPYRAVAQALEVIPRTLIQNCGASTIRLLTSLRAKHTQENCETWGV
390 400 410 420 430 440
490 500 510 520 530 540
pF1KB3 NGETGTLVDMKELGIWEPLAVKLQTYKTAVETAVLLLRIDDIVSGHKKKGDDQSRQGGAP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 NGETGTLVDMKELGIWEPLAVKLQTYKTAVETAVLLLRIDDIVSGHKKKGDDQSRQGGAP
450 460 470 480 490 500
pF1KB3 DAGQE
:::::
NP_001 DAGQE
>>NP_036205 (OMIM: 256840,610150) T-complex protein 1 su (541 aa)
initn: 541 init1: 541 opt: 1046 Z-score: 1164.8 bits: 225.3 E(85289): 3.9e-58
Smith-Waterman score: 1046; 34.0% identity (68.0% similar) in 535 aa overlap (5-533:14-540)
10 20 30 40
pF1KB3 MMGHRPVLVLS-QNTK-RESGRKVQSGNINAAKTIADIIRTCLGPKSMMKM
:: :... :. : : : .. ...: :::..:. .:: :::... ::
NP_036 MASMGTLAFDEYGRPFLIIKDQDRKSRLMGLEALKSHIMAAKAVANTMRTSLGPNGLDKM
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KB3 LLDPMGGIVMTNDGNAILREIQVQHPAAKSMIEISRTQDEEVGDGTTSVIILAGEMLSVA
..: : ...:::: .:: ..:.: :: :.:.:..::.:.:::::.:..::: .: :
NP_036 MVDKDGDVTVTNDGATILSMMDVDHQIAKLMVELSKSQDDEIGDGTTGVVVLAGALLEEA
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KB3 EHFLEQQMHPTVVISAYRKALDDMISTLKKIS--IPVDISDSDMMLNIINSSITTKAISR
:..:.. .:: . ..:..: : : ::: . :::.:.. ... .... .:...
NP_036 EQLLDRGIHPIRIADGYEQAARVAIEHLDKISDSVLVDIKDTEPLIQTAKTTLGSKVVNS
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KB3 WSSLACNIALDAVKMVQFEENGRKEIDIKKYARVEKIPGGIIEDSCVLRGVMINKDVTHP
.::..:: : : :...:.. .:: :: .::. ...::...:: .::
NP_036 CHRQMAEIAVNAVLTVADME--RRDVDFE-LIKVEGKVGGRLEDTKLIKGVIVDKDFSHP
190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KB3 RMRRYIKNPRIVLLDSSLEYKKGESQTDIEITREEDFTRILQMEEEYIQQLCEDIIQLKP
.: . ... .:..: .: : ... ...: ::. . ..:.: .... ..: .
NP_036 QMPKKVEDAKIAILTCPFEPPKPKTKHKLDVTSVEDYKALQKYEKEKFEEMIQQIKETGA
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KB3 DVVITEKGISDLAQHYLMRANITAIRRVRKTDNNRIARACGARIVSRPEELREDDVGTGA
...: . :..: :.: :.. :. :.: : . . :: : :.::: : :: . .: :
NP_036 NLAICQWGFDDEANHLLLQNNLPAVRWVGGPEIELIAIATGGRIVPRFSELTAEKLGF-A
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KB3 GLLEIKKIGD--EYFTFITDCKDPKACTILLRGASKEILSEVERNLQDAMQVCRNVLLDP
::.. ..: . . : .::. .: ::..::..: :. :..:.:.::. : ::.. :
NP_036 GLVQEISFGTTKDKMLVIEQCKNSRAVTIFIRGGNKMIIEEAKRSLHDALCVIRNLIRDN
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450 460
pF1KB3 QLVPGGGASEMAVAHALTEKSKAMTGVEQWPYRAVAQALEVIPRTLIQNCGASTIRLLTS
..: ::::.:.. : :..... .::. .:: :.:::::: .: .: : . :. .:
NP_036 RVVYGGGAAEISCALAVSQEADKCPTLEQYAMRAFADALEVIPMALSENSGMNPIQTMTE
420 430 440 450 460 470
470 480 490 500 510 520
pF1KB3 LRAKHTQENCETWGVNGETGTLVDMKELGIWEPLAVKLQTYKTAVETAVLLLRIDDIVSG
.::....: . :.. :::. . : : : : . :.. . ..:.::::
NP_036 VRARQVKEMNPALGIDCLHKGTNDMKQQHVIETLIGKKQQISLATQMVRMILKIDDI---
480 490 500 510 520 530
530 540
pF1KB3 HKKKGDDQSRQGGAPDAGQE
.: :...
NP_036 -RKPGESEE
540
>>NP_006421 (OMIM: 605142) T-complex protein 1 subunit d (539 aa)
initn: 799 init1: 486 opt: 1039 Z-score: 1157.0 bits: 223.8 E(85289): 1e-57
Smith-Waterman score: 1039; 34.6% identity (69.3% similar) in 515 aa overlap (16-524:27-537)
10 20 30 40
pF1KB3 MMGHRPVLVLSQNTKRESGRKVQSGNINAAKTIADIIRTCLGPKSMMKM
:.. ... .::.:::..:: ::: ::::.: ::
NP_006 MPENVAPRSGATAGAAGGRGKGAYQDRDKPAQIRFSNISAAKAVADAIRTSLGPKGMDKM
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KB3 LLDPMGGIVMTNDGNAILREIQVQHPAAKSMIEISRTQDEEVGDGTTSVIILAGEMLSVA
. : : ...:::: .::...:: ::::. ..:.:..:: :.:::::::.:.:: .:.
NP_006 IQDGKGDVTITNDGATILKQMQVLHPAARMLVELSKAQDIEAGDGTTSVVIIAGSLLDSC
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KB3 EHFLEQQMHPTVVISAYRKALDDMISTLKKISIPVDISDSDMMLNIINSSITTKAISRWS
..:.. .:::.. ...:::. : : .: ::..:: . .:: ..:...:..:..:
NP_006 TKLLQKGIHPTIISESFQKALEKGIEILTDMSRPVELSDRETLLNSATTSLNSKVVSQYS
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KB3 SLACNIALDAVKMVQFEENGRKEIDIKKYARVEKIPGGIIEDSCVLRGVMINKDVTHPRM
:: ....:: : .. .:.. :.:. :: :.: ...:..... :.. .
NP_006 SLLSPMSVNAV-MKVIDPATATSVDLRDIKIVKKL-GGTIDDCELVEGLVLTQKVSNSGI
190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KB3 RRYIKNPRIVLLDSSLEYKKGESQTDIEITREEDFTRILQMEEEYIQQLCEDIIQLKPDV
: ... .: :.. : : . ...: .. .. :.:. :. :: .: ..: . .:
NP_006 TR-VEKAKIGLIQFCLSAPKTDMDNQIVVSDYAQMDRVLREERAYILNLVKQIKKTGCNV
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KB3 VITEKGI-----SDLAQHYLMRANITAIRRVRKTDNNRIARACGARIVSRPEELREDDVG
.. .:.: :::: :.: . .: .:. ... : . : .. :.. :.. ... : .:
NP_006 LLIQKSILRDALSDLALHFLNKMKIMVIKDIEREDIEFICKTIGTKPVAHIDQFTADMLG
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KB3 TGAGLLEIKKIGDEYFTFITDCKDP-KACTILLRGASKEILSEVERNLQDAMQVCRNVLL
.. :.. :. . :: : .: :. ::..::..: .. :.::...::. : : ..
NP_006 SAELAEEVNLNGSGKLLKITGCASPGKTVTIVVRGSNKLVIEEAERSIHDALCVIRCLVK
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450 460
pF1KB3 DPQLVPGGGASEMAVAHALTEKSKAMTGVEQWPYRAVAQALEVIPRTLIQNCGASTIRLL
:. :::: :. .: ::: :....:.:.. :: :.:.:::: :: .: : . : .
NP_006 KRALIAGGGAPEIELALRLTEYSRTLSGMESYCVRAFADAMEVIPSTLAENAGLNPISTV
420 430 440 450 460 470
470 480 490 500 510 520
pF1KB3 TSLRAKHTQENCETWGVNGETGTLVDMKELGIWEPLAVKLQTYKTAVETAVLLLRIDDIV
: :: .:.: . .: :.: . : . .. : . .:: :.... :.::. .:.:::.:
NP_006 TELRNRHAQGE-KTAGINVRKGGISNILEELVVQPLLVSVSALTLATETVRSILKIDDVV
480 490 500 510 520 530
530 540
pF1KB3 SGHKKKGDDQSRQGGAPDAGQE
.
NP_006 NTR
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Smith-Waterman score: 1028; 34.0% identity (68.3% similar) in 517 aa overlap (21-533:11-519)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MMGHRPVLVLSQNTKRESGRKVQSGNINAAKTIADIIRTCLGPKSMMKMLLDPMGGIVMT
:.. ..: :::..:. .:: :::... ::..: : ...:
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::: .:: ..:.: :: :.:.:..::.:.:::::.:..::: .: ::..:.. .::
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pF1KB3 VVISAYRKALDDMISTLKKIS--IPVDISDSDMMLNIINSSITTKAISRWSSLACNIALD
. ..:..: : : ::: . :::.:.. ... .... .:... .::..
NP_001 RIADGYEQAARVAIEHLDKISDSVLVDIKDTEPLIQTAKTTLGSKVVNSCHRQMAEIAVN
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pF1KB3 AVKMVQFEENGRKEIDIKKYARVEKIPGGIIEDSCVLRGVMINKDVTHPRMRRYIKNPRI
:: : : :...:.. .:: :: .::. ...::...:: .::.: . ... .:
NP_001 AVLTVADME--RRDVDFE-LIKVEGKVGGRLEDTKLIKGVIVDKDFSHPQMPKKVEDAKI
180 190 200 210 220
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pF1KB3 VLLDSSLEYKKGESQTDIEITREEDFTRILQMEEEYIQQLCEDIIQLKPDVVITEKGISD
..: .: : ... ...: ::. . ..:.: .... ..: . ...: . :..:
NP_001 AILTCPFEPPKPKTKHKLDVTSVEDYKALQKYEKEKFEEMIQQIKETGANLAICQWGFDD
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pF1KB3 LAQHYLMRANITAIRRVRKTDNNRIARACGARIVSRPEELREDDVGTGAGLLEIKKIGD-
:.: :.. :. :.: : . . :: : :.::: : :: . .: :::.. ..:
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pF1KB3 -EYFTFITDCKDPKACTILLRGASKEILSEVERNLQDAMQVCRNVLLDPQLVPGGGASEM
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. : :..... .::. .:: :.:::::: .: .: : . :. .: .::....:
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pF1KB3 TWGVNGETGTLVDMKELGIWEPLAVKLQTYKTAVETAVLLLRIDDIVSGHKKKGDDQSRQ
. :.. :::. . : : : : . :.. . ..:.:::: .: :...
NP_001 ALGIDCLHKGTNDMKQQHVIETLIGKKQQISLATQMVRMILKIDDI----RKPGESEE
470 480 490 500 510 520
540
pF1KB3 GGAPDAGQE
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Smith-Waterman score: 1019; 34.2% identity (68.2% similar) in 509 aa overlap (29-533:2-502)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MMGHRPVLVLSQNTKRESGRKVQSGNINAAKTIADIIRTCLGPKSMMKMLLDPMGGIVMT
:::..:. .:: :::... ::..: : ...:
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pF1KB3 NDGNAILREIQVQHPAAKSMIEISRTQDEEVGDGTTSVIILAGEMLSVAEHFLEQQMHPT
::: .:: ..:.: :: :.:.:..::.:.:::::.:..::: .: ::..:.. .::
NP_001 NDGATILSMMDVDHQIAKLMVELSKSQDDEIGDGTTGVVVLAGALLEEAEQLLDRGIHPI
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pF1KB3 VVISAYRKALDDMISTLKKIS--IPVDISDSDMMLNIINSSITTKAISRWSSLACNIALD
. ..:..: : : ::: . :::.:.. ... .... .:... .::..
NP_001 RIADGYEQAARVAIEHLDKISDSVLVDIKDTEPLIQTAKTTLGSKVVNSCHRQMAEIAVN
100 110 120 130 140 150
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pF1KB3 AVKMVQFEENGRKEIDIKKYARVEKIPGGIIEDSCVLRGVMINKDVTHPRMRRYIKNPRI
:: : : :...:.. .:: :: .::. ...::...:: .::.: . ... .:
NP_001 AVLTVADME--RRDVDFE-LIKVEGKVGGRLEDTKLIKGVIVDKDFSHPQMPKKVEDAKI
160 170 180 190 200 210
240 250 260 270 280 290
pF1KB3 VLLDSSLEYKKGESQTDIEITREEDFTRILQMEEEYIQQLCEDIIQLKPDVVITEKGISD
..: .: : ... ...: ::. . ..:.: .... ..: . ...: . :..:
NP_001 AILTCPFEPPKPKTKHKLDVTSVEDYKALQKYEKEKFEEMIQQIKETGANLAICQWGFDD
220 230 240 250 260 270
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pF1KB3 LAQHYLMRANITAIRRVRKTDNNRIARACGARIVSRPEELREDDVGTGAGLLEIKKIGD-
:.: :.. :. :.: : . . :: : :.::: : :: . .: :::.. ..:
NP_001 EANHLLLQNNLPAVRWVGGPEIELIAIATGGRIVPRFSELTAEKLGF-AGLVQEISFGTT
280 290 300 310 320
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pF1KB3 -EYFTFITDCKDPKACTILLRGASKEILSEVERNLQDAMQVCRNVLLDPQLVPGGGASEM
. . : .::. .: ::..::..: :. :..:.:.::. : ::.. : ..: ::::.:.
NP_001 KDKMLVIEQCKNSRAVTIFIRGGNKMIIEEAKRSLHDALCVIRNLIRDNRVVYGGGAAEI
330 340 350 360 370 380
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pF1KB3 AVAHALTEKSKAMTGVEQWPYRAVAQALEVIPRTLIQNCGASTIRLLTSLRAKHTQENCE
. : :..... .::. .:: :.:::::: .: .: : . :. .: .::....:
NP_001 SCALAVSQEADKCPTLEQYAMRAFADALEVIPMALSENSGMNPIQTMTEVRARQVKEMNP
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pF1KB3 TWGVNGETGTLVDMKELGIWEPLAVKLQTYKTAVETAVLLLRIDDIVSGHKKKGDDQSRQ
. :.. :::. . : : : : . :.. . ..:.:::: .: :...
NP_001 ALGIDCLHKGTNDMKQQHVIETLIGKKQQISLATQMVRMILKIDDI----RKPGESEE
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540
pF1KB3 GGAPDAGQE
>>NP_006420 (OMIM: 605140) T-complex protein 1 subunit e (543 aa)
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Smith-Waterman score: 987; 31.8% identity (66.2% similar) in 544 aa overlap (2-537:1-534)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MMGHRPVLVLSQNTKRESGRKVQSGNINAAKTIADIIRTCLGPKSMMKMLLDPMGGIVMT
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NP_006 MMPTPVILLKEGTDSSQGIPQLVSNISACQVIAEAVRTTLGPRGMDKLIVDGRGKATIS
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pF1KB3 NDGNAILREIQVQHPAAKSMIEISRTQDEEVGDGTTSVIILAGEMLSVAEHFLEQQMHPT
::: .::. ..: :::::....:...:: ::::::::: .::.:.:. .. ..:. .::
NP_006 NDGATILKLLDVVHPAAKTLVDIAKSQDAEVGDGTTSVTLLAAEFLKQVKPYVEEGLHPQ
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pF1KB3 VVISAYRKALDDMISTLKKISIPVDISDS----DMMLNIINSSITTKAISRWSSLACNIA
..: :.: : . .. .:.:.. : .:. .. . .....: ::. ... ...
NP_006 IIIRAFRTATQLAVNKIKEIAVTVKKADKVEQRKLLEKCAMTALSSKLISQQKAFFAKMV
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pF1KB3 LDAVKMVQFEENGRKEIDIKKYARVEKIPGGIIEDSCVLRGVMINKDVTHP--RMR-RYI
.::: :.. .. :. ..:. :: .::: .. :: ..: .. .:. .
NP_006 VDAVMMLD-------DLLQLKMIGIKKVQGGALEDSQLVAGVAFKKTFSYAGFEMQPKKY
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pF1KB3 KNPRIVLLDSSLEYKKGESQTDIEITREEDFTRILQMEEEYIQQLCEDIIQLKPDVVITE
.::.:.::. :: : .....:.. ::. :.. : . . . : : . ::...
NP_006 HNPKIALLNVELELKAEKDNAEIRVHTVEDYQAIVDAEWNILYDKLEKIHHSGAKVVLSK
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pF1KB3 KGISDLAQHYLMRANITAIRRVRKTDNNRIARACGARIVSRPEELREDDVGTGAGLLEIK
:.:.: .:. .. :: . : .: :::. : . . : : .: ..:
NP_006 LPIGDVATQYFADRDMFCAGRVPEEDLKRTMMACGGSIQTSVNALSADVLGR-CQVFEET
300 310 320 330 340 350
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pF1KB3 KIGDEYFTFITDCKDPKACTILLRGASKEILSEVERNLQDAMQVCRNVLLDPQLVPGGGA
.:: : ..:.: : :.::..:::...... :.::.:.::... : .. . ..: ::::
NP_006 QIGGERYNFFTGCPKAKTCTFILRGGAEQFMEETERSLHDAIMIVRRAIKNDSVVAGGGA
360 370 380 390 400 410
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pF1KB3 SEMAVAHALTEKSKAMTGVEQWPYRAVAQALEVIPRTLIQNCGASTIRLLTSLRAKHTQE
:: ... : . :... : .: : :.:::.::: : .: : .. .:..:::.:.:
NP_006 IEMELSKYLRDYSRTIPGKQQLLIGAYAKALEIIPRQLCDNAGFDATNILNKLRARHAQG
420 430 440 450 460 470
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pF1KB3 NCETW-GVNGETGTLVDMKELGIWEPLAVKLQTYKTAVETAVLLLRIDDIVSGHKKKGDD
. :: ::. .. ..: : .::: :.... .: :.: :.. .:. ... .. :
NP_006 G--TWYGVDINNEDIADNFEAFVWEPAMVRINALTAASEAACLIVSVDETIKNPRSTVDA
480 490 500 510 520
540
pF1KB3 QSRQGGAPDAGQE
. :
NP_006 PTAAGRGRGRGRPH
530 540
>>NP_001753 (OMIM: 104613) T-complex protein 1 subunit z (531 aa)
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Smith-Waterman score: 920; 29.4% identity (67.6% similar) in 527 aa overlap (9-523:4-522)
10 20 30 40 50
pF1KB3 MMGHRPVLVLSQNTKRESGRKVQSG---NINAAKTIADIIRTCLGPKSMMKMLLDPMGGI
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NP_001 MAAVKTLNPKAEVAR-AQAALAVNISAARGLQDVLRTNLGPKGTMKMLVSGAGDI
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pF1KB3 VMTNDGNAILREIQVQHPAAKSMIEISRTQDEEVGDGTTSVIILAGEMLSVAEHFLEQQM
.:.:::..:.:.:.:::.:. . ... .::. .:::::: ... ::.:. :. .. . .
NP_001 KLTKDGNVLLHEMQIQHPTASLIAKVATAQDDITGDGTTSNVLIIGELLKQADLYISEGL
60 70 80 90 100 110
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pF1KB3 HPTVVISAYRKALDDMISTLKKISIPVDISDSDMMLNIINSSITTKAISRWSSLACNIAL
:: .. ... : . .. :..... .. : . .... .:. ::. .. ... . ..
NP_001 HPRIITEGFEAAKEKALQFLEEVKVSREM-DRETLIDVARTSLRTKVHAELADVLTEAVV
120 130 140 150 160 170
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pF1KB3 DAVKMVQFEENGRKEIDIKKYARVEKIPGGIIEDSCVLRGVMINKDVTHPRMRRYIKNPR
:.. .. .. . ::. . .. .. :. ..::..... . :: :.. ...
NP_001 DSILAIKKQD---EPIDLF-MIEIMEMKHKSETDTSLIRGLVLDHGARHPDMKKRVEDAY
180 190 200 210 220
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pF1KB3 IVLLDSSLEYKKGESQTDIEITREEDFTRILQMEEEYIQQLCEDIIQLK------PD---
:. . ::::.: : .. . :. .... :...:.. . ::.:: :
NP_001 ILTCNVSLEYEKTEVNSGFFYKSAEEREKLVKAERKFIEDRVKKIIELKRKVCGDSDKGF
230 240 250 260 270 280
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pF1KB3 VVITEKGISDLAQHYLMRANITAIRRVRKTDNNRIARACGARIVSRPEELREDDVGTGAG
:::..:::. .. : . .:.:.::... . .:.. :::. .. ..: : .: ::
NP_001 VVINQKGIDPFSLDALSKEGIVALRRAKRRNMERLTLACGGVALNSFDDLSPDCLGH-AG
290 300 310 320 330 340
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pF1KB3 LLEIKKIGDEYFTFITDCKDPKACTILLRGASKEILSEVERNLQDAMQVCRNVLLDPQLV
:. .:.: :::: :..:.. :.:..: .:. :.... ..:.... .:.. : .:
NP_001 LVYEYTLGEEKFTFIEKCNNPRSVTLLIKGPNKHTLTQIKDAVRDGLRAVKNAIDDGCVV
350 360 370 380 390 400
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pF1KB3 PGGGASEMAVAHALTEKSKAMTGVEQWPYRAVAQALEVIPRTLIQNCGASTIRLLTSLRA
::.:: :.:.:.:: ... .. : : .: :.:: .::..: :: : . . :....:
NP_001 PGAGAVEVAMAEALIKHKPSVKGRAQLGVQAFADALLIIPKVLAQNSGFDLQETLVKIQA
410 420 430 440 450 460
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pF1KB3 KHTQENCETWGVNGETGTLVDMKELGIWEPLAVKLQTYKTAVETAVLLLRIDDIVSGHKK
.:. :. . ::. .:: . :.:.:. :: : .. . :. .: .:.:.
NP_001 EHS-ESGQLVGVDLNTGEPMVAAEVGVWDNYCVKKQLLHSCTVIATNILLVDEIMRAGMS
470 480 490 500 510 520
530 540
pF1KB3 KGDDQSRQGGAPDAGQE
NP_001 SLKG
530
>>NP_006575 (OMIM: 610730) T-complex protein 1 subunit z (530 aa)
initn: 784 init1: 324 opt: 894 Z-score: 996.3 bits: 194.1 E(85289): 9.4e-49
Smith-Waterman score: 894; 29.7% identity (67.2% similar) in 522 aa overlap (13-523:8-522)
10 20 30 40 50
pF1KB3 MMGHRPVLVLSQNTKRE--SGRKVQSGNINAAKTIADIIRTCLGPKSMMKMLLDPMGGIV
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NP_006 MAAIKAVNSKAEVARARAALAVNICAARGLQDVLRTNLGPKGTMKMLVSGAGDIK
10 20 30 40 50
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pF1KB3 MTNDGNAILREIQVQHPAAKSMIEISRTQDEEVGDGTTSVIILAGEMLSVAEHFLEQQMH
.:.:::..: :.:.:::.:. . ... .::. .:::::: ... ::.:. :. .. . .:
NP_006 LTKDGNVLLDEMQIQHPTASLIAKVATAQDDVTGDGTTSNVLIIGELLKQADLYISEGLH
60 70 80 90 100 110
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pF1KB3 PTVVISAYRKALDDMISTLKKISIPVDISDSDMMLNIINSSITTKAISRWSSLACNIALD
: .. ... : . .:..... ... . ..:.. .:. ::. .. ... ....:
NP_006 PRIIAEGFEAAKIKALEVLEEVKVTKEMKRK-ILLDVARTSLQTKVHAELADVLTEVVVD
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB3 AVKMVQFEENGRKEIDIKKYARVEKIPGGIIEDSCVLRGVMINKDVTHPRMRRYIKNPRI
.: :. . : ::. .... .. . :. ...:..... . :: :.. ... :
NP_006 SVLAVR--RPGYP-IDLF-MVEIMEMKHKLGTDTKLIQGLVLDHGARHPDMKKRVEDAFI
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280
pF1KB3 VLLDSSLEYKKGESQTDIEITREEDFTRILQMEEEYIQQLCEDIIQLKPDV---------
.. . ::::.: : .. . :. .... :...:.. . ::.:: :
NP_006 LICNVSLEYEKTEVNSGFFYKTAEEKEKLVKAERKFIEDRVQKIIDLKDKVCAQSNKGFV
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KB3 VITEKGISDLAQHYLMRANITAIRRVRKTDNNRIARACGARIVSRPEELREDDVGTGAGL
::..:::. .. : . .:.:.::... . .:.. :::. :. :.: : .: :::
NP_006 VINQKGIDPFSLDSLAKHGIVALRRAKRRNMERLSLACGGMAVNSFEDLTVDCLGH-AGL
300 310 320 330 340
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pF1KB3 LEIKKIGDEYFTFITDCKDPKACTILLRGASKEILSEVERNLQDAMQVCRNVLLDPQLVP
. .:.: :::: .: .: . :.:..: .:. :..:. ..:.... .:.. : .::
NP_006 VYEYTLGEEKFTFIEECVNPCSVTLLVKGPNKHTLTQVKDAIRDGLRAIKNAIEDGCMVP
350 360 370 380 390 400
410 420 430 440 450 460
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