Result of FASTA (ccds) for
pFN21AB3205
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB3205, 545 aa
1>>>pF1KB3205 545 - 545 aa - 545 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.0418+/-0.00119; mu= 14.6001+/- 0.071
mean_var=73.8351+/-14.682, 0's: 0 Z-trim(101.5): 38 B-trim: 29 in 1/49
Lambda= 0.149260
statistics sampled from 6523 (6553) to 6523 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.564), E-opt: 0.2 (0.201), width: 16
Scan time: 2.390
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS1140.2 CCT3 gene_id:7203|Hs108|chr1 ( 545) 3512 766.2 0
CCDS30888.1 CCT3 gene_id:7203|Hs108|chr1 ( 507) 3072 671.5 6.5e-193
CCDS3877.1 CCT5 gene_id:22948|Hs108|chr5 ( 541) 1046 235.2 1.5e-61
CCDS33206.1 CCT4 gene_id:10575|Hs108|chr2 ( 539) 1039 233.7 4.2e-61
CCDS82988.1 CCT5 gene_id:22948|Hs108|chr5 ( 520) 1028 231.3 2.1e-60
CCDS77996.1 CCT5 gene_id:22948|Hs108|chr5 ( 503) 1019 229.4 7.8e-60
CCDS46336.1 CCT7 gene_id:10574|Hs108|chr2 ( 543) 987 222.5 1e-57
CCDS5523.1 CCT6A gene_id:908|Hs108|chr7 ( 531) 920 208.1 2.2e-53
CCDS32617.1 CCT6B gene_id:10693|Hs108|chr17 ( 530) 894 202.5 1e-51
CCDS54367.1 CCT7 gene_id:10574|Hs108|chr2 ( 499) 892 202.1 1.3e-51
CCDS5269.1 TCP1 gene_id:6950|Hs108|chr6 ( 556) 848 192.6 1e-48
CCDS58711.1 CCT4 gene_id:10575|Hs108|chr2 ( 509) 826 187.8 2.6e-47
CCDS8991.1 CCT2 gene_id:10576|Hs108|chr12 ( 535) 795 181.2 2.7e-45
CCDS82990.1 CCT5 gene_id:22948|Hs108|chr5 ( 448) 770 175.8 9.8e-44
CCDS82989.1 CCT5 gene_id:22948|Hs108|chr5 ( 486) 770 175.8 1.1e-43
CCDS33528.1 CCT8 gene_id:10694|Hs108|chr21 ( 548) 761 173.9 4.5e-43
CCDS68181.1 CCT8 gene_id:10694|Hs108|chr21 ( 529) 756 172.8 9.2e-43
CCDS54366.1 CCT7 gene_id:10574|Hs108|chr2 ( 456) 750 171.5 2e-42
CCDS55843.1 CCT2 gene_id:10576|Hs108|chr12 ( 488) 729 166.9 4.8e-41
CCDS34640.1 CCT6A gene_id:908|Hs108|chr7 ( 486) 644 148.6 1.5e-35
CCDS68180.1 CCT8 gene_id:10694|Hs108|chr21 ( 475) 635 146.7 5.8e-35
CCDS54105.1 CCT6B gene_id:10693|Hs108|chr17 ( 485) 620 143.5 5.5e-34
CCDS43522.1 TCP1 gene_id:6950|Hs108|chr6 ( 401) 577 134.2 2.9e-31
CCDS42696.1 CCT7 gene_id:10574|Hs108|chr2 ( 339) 556 129.6 5.7e-30
CCDS54106.1 CCT6B gene_id:10693|Hs108|chr17 ( 493) 363 88.1 2.6e-17
CCDS2382.1 PIKFYVE gene_id:200576|Hs108|chr2 (2098) 357 87.1 2.3e-16
CCDS13738.1 CCT8L2 gene_id:150160|Hs108|chr22 ( 557) 296 73.7 6.3e-13
CCDS13111.1 MKKS gene_id:8195|Hs108|chr20 ( 570) 287 71.8 2.5e-12
>>CCDS1140.2 CCT3 gene_id:7203|Hs108|chr1 (545 aa)
initn: 3512 init1: 3512 opt: 3512 Z-score: 4088.4 bits: 766.2 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 3512; 100.0% identity (100.0% similar) in 545 aa overlap (1-545:1-545)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MMGHRPVLVLSQNTKRESGRKVQSGNINAAKTIADIIRTCLGPKSMMKMLLDPMGGIVMT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 MMGHRPVLVLSQNTKRESGRKVQSGNINAAKTIADIIRTCLGPKSMMKMLLDPMGGIVMT
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 NDGNAILREIQVQHPAAKSMIEISRTQDEEVGDGTTSVIILAGEMLSVAEHFLEQQMHPT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 NDGNAILREIQVQHPAAKSMIEISRTQDEEVGDGTTSVIILAGEMLSVAEHFLEQQMHPT
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB3 VVISAYRKALDDMISTLKKISIPVDISDSDMMLNIINSSITTKAISRWSSLACNIALDAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 VVISAYRKALDDMISTLKKISIPVDISDSDMMLNIINSSITTKAISRWSSLACNIALDAV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB3 KMVQFEENGRKEIDIKKYARVEKIPGGIIEDSCVLRGVMINKDVTHPRMRRYIKNPRIVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 KMVQFEENGRKEIDIKKYARVEKIPGGIIEDSCVLRGVMINKDVTHPRMRRYIKNPRIVL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB3 LDSSLEYKKGESQTDIEITREEDFTRILQMEEEYIQQLCEDIIQLKPDVVITEKGISDLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 LDSSLEYKKGESQTDIEITREEDFTRILQMEEEYIQQLCEDIIQLKPDVVITEKGISDLA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB3 QHYLMRANITAIRRVRKTDNNRIARACGARIVSRPEELREDDVGTGAGLLEIKKIGDEYF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 QHYLMRANITAIRRVRKTDNNRIARACGARIVSRPEELREDDVGTGAGLLEIKKIGDEYF
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB3 TFITDCKDPKACTILLRGASKEILSEVERNLQDAMQVCRNVLLDPQLVPGGGASEMAVAH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 TFITDCKDPKACTILLRGASKEILSEVERNLQDAMQVCRNVLLDPQLVPGGGASEMAVAH
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB3 ALTEKSKAMTGVEQWPYRAVAQALEVIPRTLIQNCGASTIRLLTSLRAKHTQENCETWGV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 ALTEKSKAMTGVEQWPYRAVAQALEVIPRTLIQNCGASTIRLLTSLRAKHTQENCETWGV
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB3 NGETGTLVDMKELGIWEPLAVKLQTYKTAVETAVLLLRIDDIVSGHKKKGDDQSRQGGAP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 NGETGTLVDMKELGIWEPLAVKLQTYKTAVETAVLLLRIDDIVSGHKKKGDDQSRQGGAP
490 500 510 520 530 540
pF1KB3 DAGQE
:::::
CCDS11 DAGQE
>>CCDS30888.1 CCT3 gene_id:7203|Hs108|chr1 (507 aa)
initn: 3072 init1: 3072 opt: 3072 Z-score: 3576.8 bits: 671.5 E(32554): 6.5e-193
Smith-Waterman score: 3176; 93.0% identity (93.0% similar) in 545 aa overlap (1-545:1-507)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MMGHRPVLVLSQNTKRESGRKVQSGNINAAKTIADIIRTCLGPKSMMKMLLDPMGGIVMT
:::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 MMGHRPVLVLSQNTKRESGRKVQSGNINAAK-----------------------------
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 NDGNAILREIQVQHPAAKSMIEISRTQDEEVGDGTTSVIILAGEMLSVAEHFLEQQMHPT
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 ---------IQVQHPAAKSMIEISRTQDEEVGDGTTSVIILAGEMLSVAEHFLEQQMHPT
40 50 60 70 80
130 140 150 160 170 180
pF1KB3 VVISAYRKALDDMISTLKKISIPVDISDSDMMLNIINSSITTKAISRWSSLACNIALDAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 VVISAYRKALDDMISTLKKISIPVDISDSDMMLNIINSSITTKAISRWSSLACNIALDAV
90 100 110 120 130 140
190 200 210 220 230 240
pF1KB3 KMVQFEENGRKEIDIKKYARVEKIPGGIIEDSCVLRGVMINKDVTHPRMRRYIKNPRIVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 KMVQFEENGRKEIDIKKYARVEKIPGGIIEDSCVLRGVMINKDVTHPRMRRYIKNPRIVL
150 160 170 180 190 200
250 260 270 280 290 300
pF1KB3 LDSSLEYKKGESQTDIEITREEDFTRILQMEEEYIQQLCEDIIQLKPDVVITEKGISDLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 LDSSLEYKKGESQTDIEITREEDFTRILQMEEEYIQQLCEDIIQLKPDVVITEKGISDLA
210 220 230 240 250 260
310 320 330 340 350 360
pF1KB3 QHYLMRANITAIRRVRKTDNNRIARACGARIVSRPEELREDDVGTGAGLLEIKKIGDEYF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 QHYLMRANITAIRRVRKTDNNRIARACGARIVSRPEELREDDVGTGAGLLEIKKIGDEYF
270 280 290 300 310 320
370 380 390 400 410 420
pF1KB3 TFITDCKDPKACTILLRGASKEILSEVERNLQDAMQVCRNVLLDPQLVPGGGASEMAVAH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 TFITDCKDPKACTILLRGASKEILSEVERNLQDAMQVCRNVLLDPQLVPGGGASEMAVAH
330 340 350 360 370 380
430 440 450 460 470 480
pF1KB3 ALTEKSKAMTGVEQWPYRAVAQALEVIPRTLIQNCGASTIRLLTSLRAKHTQENCETWGV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 ALTEKSKAMTGVEQWPYRAVAQALEVIPRTLIQNCGASTIRLLTSLRAKHTQENCETWGV
390 400 410 420 430 440
490 500 510 520 530 540
pF1KB3 NGETGTLVDMKELGIWEPLAVKLQTYKTAVETAVLLLRIDDIVSGHKKKGDDQSRQGGAP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 NGETGTLVDMKELGIWEPLAVKLQTYKTAVETAVLLLRIDDIVSGHKKKGDDQSRQGGAP
450 460 470 480 490 500
pF1KB3 DAGQE
:::::
CCDS30 DAGQE
>>CCDS3877.1 CCT5 gene_id:22948|Hs108|chr5 (541 aa)
initn: 541 init1: 541 opt: 1046 Z-score: 1218.6 bits: 235.2 E(32554): 1.5e-61
Smith-Waterman score: 1046; 34.0% identity (68.0% similar) in 535 aa overlap (5-533:14-540)
10 20 30 40
pF1KB3 MMGHRPVLVLS-QNTK-RESGRKVQSGNINAAKTIADIIRTCLGPKSMMKM
:: :... :. : : : .. ...: :::..:. .:: :::... ::
CCDS38 MASMGTLAFDEYGRPFLIIKDQDRKSRLMGLEALKSHIMAAKAVANTMRTSLGPNGLDKM
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KB3 LLDPMGGIVMTNDGNAILREIQVQHPAAKSMIEISRTQDEEVGDGTTSVIILAGEMLSVA
..: : ...:::: .:: ..:.: :: :.:.:..::.:.:::::.:..::: .: :
CCDS38 MVDKDGDVTVTNDGATILSMMDVDHQIAKLMVELSKSQDDEIGDGTTGVVVLAGALLEEA
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KB3 EHFLEQQMHPTVVISAYRKALDDMISTLKKIS--IPVDISDSDMMLNIINSSITTKAISR
:..:.. .:: . ..:..: : : ::: . :::.:.. ... .... .:...
CCDS38 EQLLDRGIHPIRIADGYEQAARVAIEHLDKISDSVLVDIKDTEPLIQTAKTTLGSKVVNS
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KB3 WSSLACNIALDAVKMVQFEENGRKEIDIKKYARVEKIPGGIIEDSCVLRGVMINKDVTHP
.::..:: : : :...:.. .:: :: .::. ...::...:: .::
CCDS38 CHRQMAEIAVNAVLTVADME--RRDVDFE-LIKVEGKVGGRLEDTKLIKGVIVDKDFSHP
190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KB3 RMRRYIKNPRIVLLDSSLEYKKGESQTDIEITREEDFTRILQMEEEYIQQLCEDIIQLKP
.: . ... .:..: .: : ... ...: ::. . ..:.: .... ..: .
CCDS38 QMPKKVEDAKIAILTCPFEPPKPKTKHKLDVTSVEDYKALQKYEKEKFEEMIQQIKETGA
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KB3 DVVITEKGISDLAQHYLMRANITAIRRVRKTDNNRIARACGARIVSRPEELREDDVGTGA
...: . :..: :.: :.. :. :.: : . . :: : :.::: : :: . .: :
CCDS38 NLAICQWGFDDEANHLLLQNNLPAVRWVGGPEIELIAIATGGRIVPRFSELTAEKLGF-A
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KB3 GLLEIKKIGD--EYFTFITDCKDPKACTILLRGASKEILSEVERNLQDAMQVCRNVLLDP
::.. ..: . . : .::. .: ::..::..: :. :..:.:.::. : ::.. :
CCDS38 GLVQEISFGTTKDKMLVIEQCKNSRAVTIFIRGGNKMIIEEAKRSLHDALCVIRNLIRDN
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450 460
pF1KB3 QLVPGGGASEMAVAHALTEKSKAMTGVEQWPYRAVAQALEVIPRTLIQNCGASTIRLLTS
..: ::::.:.. : :..... .::. .:: :.:::::: .: .: : . :. .:
CCDS38 RVVYGGGAAEISCALAVSQEADKCPTLEQYAMRAFADALEVIPMALSENSGMNPIQTMTE
420 430 440 450 460 470
470 480 490 500 510 520
pF1KB3 LRAKHTQENCETWGVNGETGTLVDMKELGIWEPLAVKLQTYKTAVETAVLLLRIDDIVSG
.::....: . :.. :::. . : : : : . :.. . ..:.::::
CCDS38 VRARQVKEMNPALGIDCLHKGTNDMKQQHVIETLIGKKQQISLATQMVRMILKIDDI---
480 490 500 510 520 530
530 540
pF1KB3 HKKKGDDQSRQGGAPDAGQE
.: :...
CCDS38 -RKPGESEE
540
>>CCDS33206.1 CCT4 gene_id:10575|Hs108|chr2 (539 aa)
initn: 799 init1: 486 opt: 1039 Z-score: 1210.4 bits: 233.7 E(32554): 4.2e-61
Smith-Waterman score: 1039; 34.6% identity (69.3% similar) in 515 aa overlap (16-524:27-537)
10 20 30 40
pF1KB3 MMGHRPVLVLSQNTKRESGRKVQSGNINAAKTIADIIRTCLGPKSMMKM
:.. ... .::.:::..:: ::: ::::.: ::
CCDS33 MPENVAPRSGATAGAAGGRGKGAYQDRDKPAQIRFSNISAAKAVADAIRTSLGPKGMDKM
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KB3 LLDPMGGIVMTNDGNAILREIQVQHPAAKSMIEISRTQDEEVGDGTTSVIILAGEMLSVA
. : : ...:::: .::...:: ::::. ..:.:..:: :.:::::::.:.:: .:.
CCDS33 IQDGKGDVTITNDGATILKQMQVLHPAARMLVELSKAQDIEAGDGTTSVVIIAGSLLDSC
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KB3 EHFLEQQMHPTVVISAYRKALDDMISTLKKISIPVDISDSDMMLNIINSSITTKAISRWS
..:.. .:::.. ...:::. : : .: ::..:: . .:: ..:...:..:..:
CCDS33 TKLLQKGIHPTIISESFQKALEKGIEILTDMSRPVELSDRETLLNSATTSLNSKVVSQYS
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KB3 SLACNIALDAVKMVQFEENGRKEIDIKKYARVEKIPGGIIEDSCVLRGVMINKDVTHPRM
:: ....:: : .. .:.. :.:. :: :.: ...:..... :.. .
CCDS33 SLLSPMSVNAV-MKVIDPATATSVDLRDIKIVKKL-GGTIDDCELVEGLVLTQKVSNSGI
190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KB3 RRYIKNPRIVLLDSSLEYKKGESQTDIEITREEDFTRILQMEEEYIQQLCEDIIQLKPDV
: ... .: :.. : : . ...: .. .. :.:. :. :: .: ..: . .:
CCDS33 TR-VEKAKIGLIQFCLSAPKTDMDNQIVVSDYAQMDRVLREERAYILNLVKQIKKTGCNV
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KB3 VITEKGI-----SDLAQHYLMRANITAIRRVRKTDNNRIARACGARIVSRPEELREDDVG
.. .:.: :::: :.: . .: .:. ... : . : .. :.. :.. ... : .:
CCDS33 LLIQKSILRDALSDLALHFLNKMKIMVIKDIEREDIEFICKTIGTKPVAHIDQFTADMLG
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KB3 TGAGLLEIKKIGDEYFTFITDCKDP-KACTILLRGASKEILSEVERNLQDAMQVCRNVLL
.. :.. :. . :: : .: :. ::..::..: .. :.::...::. : : ..
CCDS33 SAELAEEVNLNGSGKLLKITGCASPGKTVTIVVRGSNKLVIEEAERSIHDALCVIRCLVK
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450 460
pF1KB3 DPQLVPGGGASEMAVAHALTEKSKAMTGVEQWPYRAVAQALEVIPRTLIQNCGASTIRLL
:. :::: :. .: ::: :....:.:.. :: :.:.:::: :: .: : . : .
CCDS33 KRALIAGGGAPEIELALRLTEYSRTLSGMESYCVRAFADAMEVIPSTLAENAGLNPISTV
420 430 440 450 460 470
470 480 490 500 510 520
pF1KB3 TSLRAKHTQENCETWGVNGETGTLVDMKELGIWEPLAVKLQTYKTAVETAVLLLRIDDIV
: :: .:.: . .: :.: . : . .. : . .:: :.... :.::. .:.:::.:
CCDS33 TELRNRHAQGE-KTAGINVRKGGISNILEELVVQPLLVSVSALTLATETVRSILKIDDVV
480 490 500 510 520 530
530 540
pF1KB3 SGHKKKGDDQSRQGGAPDAGQE
.
CCDS33 NTR
>>CCDS82988.1 CCT5 gene_id:22948|Hs108|chr5 (520 aa)
initn: 542 init1: 542 opt: 1028 Z-score: 1197.9 bits: 231.3 E(32554): 2.1e-60
Smith-Waterman score: 1028; 34.0% identity (68.3% similar) in 517 aa overlap (21-533:11-519)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MMGHRPVLVLSQNTKRESGRKVQSGNINAAKTIADIIRTCLGPKSMMKMLLDPMGGIVMT
:.. ..: :::..:. .:: :::... ::..: : ...:
CCDS82 MNSSLGPTIEKLSVSHIMAAKAVANTMRTSLGPNGLDKMMVDKDGDVTVT
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 NDGNAILREIQVQHPAAKSMIEISRTQDEEVGDGTTSVIILAGEMLSVAEHFLEQQMHPT
::: .:: ..:.: :: :.:.:..::.:.:::::.:..::: .: ::..:.. .::
CCDS82 NDGATILSMMDVDHQIAKLMVELSKSQDDEIGDGTTGVVVLAGALLEEAEQLLDRGIHPI
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170
pF1KB3 VVISAYRKALDDMISTLKKIS--IPVDISDSDMMLNIINSSITTKAISRWSSLACNIALD
. ..:..: : : ::: . :::.:.. ... .... .:... .::..
CCDS82 RIADGYEQAARVAIEHLDKISDSVLVDIKDTEPLIQTAKTTLGSKVVNSCHRQMAEIAVN
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB3 AVKMVQFEENGRKEIDIKKYARVEKIPGGIIEDSCVLRGVMINKDVTHPRMRRYIKNPRI
:: : : :...:.. .:: :: .::. ...::...:: .::.: . ... .:
CCDS82 AVLTVADME--RRDVDFE-LIKVEGKVGGRLEDTKLIKGVIVDKDFSHPQMPKKVEDAKI
180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KB3 VLLDSSLEYKKGESQTDIEITREEDFTRILQMEEEYIQQLCEDIIQLKPDVVITEKGISD
..: .: : ... ...: ::. . ..:.: .... ..: . ...: . :..:
CCDS82 AILTCPFEPPKPKTKHKLDVTSVEDYKALQKYEKEKFEEMIQQIKETGANLAICQWGFDD
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KB3 LAQHYLMRANITAIRRVRKTDNNRIARACGARIVSRPEELREDDVGTGAGLLEIKKIGD-
:.: :.. :. :.: : . . :: : :.::: : :: . .: :::.. ..:
CCDS82 EANHLLLQNNLPAVRWVGGPEIELIAIATGGRIVPRFSELTAEKLGF-AGLVQEISFGTT
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KB3 -EYFTFITDCKDPKACTILLRGASKEILSEVERNLQDAMQVCRNVLLDPQLVPGGGASEM
. . : .::. .: ::..::..: :. :..:.:.::. : ::.. : ..: ::::.:.
CCDS82 KDKMLVIEQCKNSRAVTIFIRGGNKMIIEEAKRSLHDALCVIRNLIRDNRVVYGGGAAEI
350 360 370 380 390 400
420 430 440 450 460 470
pF1KB3 AVAHALTEKSKAMTGVEQWPYRAVAQALEVIPRTLIQNCGASTIRLLTSLRAKHTQENCE
. : :..... .::. .:: :.:::::: .: .: : . :. .: .::....:
CCDS82 SCALAVSQEADKCPTLEQYAMRAFADALEVIPMALSENSGMNPIQTMTEVRARQVKEMNP
410 420 430 440 450 460
480 490 500 510 520 530
pF1KB3 TWGVNGETGTLVDMKELGIWEPLAVKLQTYKTAVETAVLLLRIDDIVSGHKKKGDDQSRQ
. :.. :::. . : : : : . :.. . ..:.:::: .: :...
CCDS82 ALGIDCLHKGTNDMKQQHVIETLIGKKQQISLATQMVRMILKIDDI----RKPGESEE
470 480 490 500 510 520
540
pF1KB3 GGAPDAGQE
>>CCDS77996.1 CCT5 gene_id:22948|Hs108|chr5 (503 aa)
initn: 533 init1: 533 opt: 1019 Z-score: 1187.7 bits: 229.4 E(32554): 7.8e-60
Smith-Waterman score: 1019; 34.2% identity (68.2% similar) in 509 aa overlap (29-533:2-502)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MMGHRPVLVLSQNTKRESGRKVQSGNINAAKTIADIIRTCLGPKSMMKMLLDPMGGIVMT
:::..:. .:: :::... ::..: : ...:
CCDS77 MAAKAVANTMRTSLGPNGLDKMMVDKDGDVTVT
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 NDGNAILREIQVQHPAAKSMIEISRTQDEEVGDGTTSVIILAGEMLSVAEHFLEQQMHPT
::: .:: ..:.: :: :.:.:..::.:.:::::.:..::: .: ::..:.. .::
CCDS77 NDGATILSMMDVDHQIAKLMVELSKSQDDEIGDGTTGVVVLAGALLEEAEQLLDRGIHPI
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170
pF1KB3 VVISAYRKALDDMISTLKKIS--IPVDISDSDMMLNIINSSITTKAISRWSSLACNIALD
. ..:..: : : ::: . :::.:.. ... .... .:... .::..
CCDS77 RIADGYEQAARVAIEHLDKISDSVLVDIKDTEPLIQTAKTTLGSKVVNSCHRQMAEIAVN
100 110 120 130 140 150
180 190 200 210 220 230
pF1KB3 AVKMVQFEENGRKEIDIKKYARVEKIPGGIIEDSCVLRGVMINKDVTHPRMRRYIKNPRI
:: : : :...:.. .:: :: .::. ...::...:: .::.: . ... .:
CCDS77 AVLTVADME--RRDVDFE-LIKVEGKVGGRLEDTKLIKGVIVDKDFSHPQMPKKVEDAKI
160 170 180 190 200 210
240 250 260 270 280 290
pF1KB3 VLLDSSLEYKKGESQTDIEITREEDFTRILQMEEEYIQQLCEDIIQLKPDVVITEKGISD
..: .: : ... ...: ::. . ..:.: .... ..: . ...: . :..:
CCDS77 AILTCPFEPPKPKTKHKLDVTSVEDYKALQKYEKEKFEEMIQQIKETGANLAICQWGFDD
220 230 240 250 260 270
300 310 320 330 340 350
pF1KB3 LAQHYLMRANITAIRRVRKTDNNRIARACGARIVSRPEELREDDVGTGAGLLEIKKIGD-
:.: :.. :. :.: : . . :: : :.::: : :: . .: :::.. ..:
CCDS77 EANHLLLQNNLPAVRWVGGPEIELIAIATGGRIVPRFSELTAEKLGF-AGLVQEISFGTT
280 290 300 310 320
360 370 380 390 400 410
pF1KB3 -EYFTFITDCKDPKACTILLRGASKEILSEVERNLQDAMQVCRNVLLDPQLVPGGGASEM
. . : .::. .: ::..::..: :. :..:.:.::. : ::.. : ..: ::::.:.
CCDS77 KDKMLVIEQCKNSRAVTIFIRGGNKMIIEEAKRSLHDALCVIRNLIRDNRVVYGGGAAEI
330 340 350 360 370 380
420 430 440 450 460 470
pF1KB3 AVAHALTEKSKAMTGVEQWPYRAVAQALEVIPRTLIQNCGASTIRLLTSLRAKHTQENCE
. : :..... .::. .:: :.:::::: .: .: : . :. .: .::....:
CCDS77 SCALAVSQEADKCPTLEQYAMRAFADALEVIPMALSENSGMNPIQTMTEVRARQVKEMNP
390 400 410 420 430 440
480 490 500 510 520 530
pF1KB3 TWGVNGETGTLVDMKELGIWEPLAVKLQTYKTAVETAVLLLRIDDIVSGHKKKGDDQSRQ
. :.. :::. . : : : : . :.. . ..:.:::: .: :...
CCDS77 ALGIDCLHKGTNDMKQQHVIETLIGKKQQISLATQMVRMILKIDDI----RKPGESEE
450 460 470 480 490 500
540
pF1KB3 GGAPDAGQE
>>CCDS46336.1 CCT7 gene_id:10574|Hs108|chr2 (543 aa)
initn: 872 init1: 492 opt: 987 Z-score: 1149.9 bits: 222.5 E(32554): 1e-57
Smith-Waterman score: 987; 31.8% identity (66.2% similar) in 544 aa overlap (2-537:1-534)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MMGHRPVLVLSQNTKRESGRKVQSGNINAAKTIADIIRTCLGPKSMMKMLLDPMGGIVMT
: ::..:...: .: .::.: ..::. .:: :::..: :...: : ...
CCDS46 MMPTPVILLKEGTDSSQGIPQLVSNISACQVIAEAVRTTLGPRGMDKLIVDGRGKATIS
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 NDGNAILREIQVQHPAAKSMIEISRTQDEEVGDGTTSVIILAGEMLSVAEHFLEQQMHPT
::: .::. ..: :::::....:...:: ::::::::: .::.:.:. .. ..:. .::
CCDS46 NDGATILKLLDVVHPAAKTLVDIAKSQDAEVGDGTTSVTLLAAEFLKQVKPYVEEGLHPQ
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170
pF1KB3 VVISAYRKALDDMISTLKKISIPVDISDS----DMMLNIINSSITTKAISRWSSLACNIA
..: :.: : . .. .:.:.. : .:. .. . .....: ::. ... ...
CCDS46 IIIRAFRTATQLAVNKIKEIAVTVKKADKVEQRKLLEKCAMTALSSKLISQQKAFFAKMV
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB3 LDAVKMVQFEENGRKEIDIKKYARVEKIPGGIIEDSCVLRGVMINKDVTHP--RMR-RYI
.::: :.. .. :. ..:. :: .::: .. :: ..: .. .:. .
CCDS46 VDAVMMLD-------DLLQLKMIGIKKVQGGALEDSQLVAGVAFKKTFSYAGFEMQPKKY
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB3 KNPRIVLLDSSLEYKKGESQTDIEITREEDFTRILQMEEEYIQQLCEDIIQLKPDVVITE
.::.:.::. :: : .....:.. ::. :.. : . . . : : . ::...
CCDS46 HNPKIALLNVELELKAEKDNAEIRVHTVEDYQAIVDAEWNILYDKLEKIHHSGAKVVLSK
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB3 KGISDLAQHYLMRANITAIRRVRKTDNNRIARACGARIVSRPEELREDDVGTGAGLLEIK
:.:.: .:. .. :: . : .: :::. : . . : : .: ..:
CCDS46 LPIGDVATQYFADRDMFCAGRVPEEDLKRTMMACGGSIQTSVNALSADVLGR-CQVFEET
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KB3 KIGDEYFTFITDCKDPKACTILLRGASKEILSEVERNLQDAMQVCRNVLLDPQLVPGGGA
.:: : ..:.: : :.::..:::...... :.::.:.::... : .. . ..: ::::
CCDS46 QIGGERYNFFTGCPKAKTCTFILRGGAEQFMEETERSLHDAIMIVRRAIKNDSVVAGGGA
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KB3 SEMAVAHALTEKSKAMTGVEQWPYRAVAQALEVIPRTLIQNCGASTIRLLTSLRAKHTQE
:: ... : . :... : .: : :.:::.::: : .: : .. .:..:::.:.:
CCDS46 IEMELSKYLRDYSRTIPGKQQLLIGAYAKALEIIPRQLCDNAGFDATNILNKLRARHAQG
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KB3 NCETW-GVNGETGTLVDMKELGIWEPLAVKLQTYKTAVETAVLLLRIDDIVSGHKKKGDD
. :: ::. .. ..: : .::: :.... .: :.: :.. .:. ... .. :
CCDS46 G--TWYGVDINNEDIADNFEAFVWEPAMVRINALTAASEAACLIVSVDETIKNPRSTVDA
480 490 500 510 520
540
pF1KB3 QSRQGGAPDAGQE
. :
CCDS46 PTAAGRGRGRGRPH
530 540
>>CCDS5523.1 CCT6A gene_id:908|Hs108|chr7 (531 aa)
initn: 868 init1: 334 opt: 920 Z-score: 1072.1 bits: 208.1 E(32554): 2.2e-53
Smith-Waterman score: 920; 29.4% identity (67.6% similar) in 527 aa overlap (9-523:4-522)
10 20 30 40 50
pF1KB3 MMGHRPVLVLSQNTKRESGRKVQSG---NINAAKTIADIIRTCLGPKSMMKMLLDPMGGI
: . : : : .: .:.. ::.::. . :..:: ::::. ::::.. : :
CCDS55 MAAVKTLNPKAEVAR-AQAALAVNISAARGLQDVLRTNLGPKGTMKMLVSGAGDI
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB3 VMTNDGNAILREIQVQHPAAKSMIEISRTQDEEVGDGTTSVIILAGEMLSVAEHFLEQQM
.:.:::..:.:.:.:::.:. . ... .::. .:::::: ... ::.:. :. .. . .
CCDS55 KLTKDGNVLLHEMQIQHPTASLIAKVATAQDDITGDGTTSNVLIIGELLKQADLYISEGL
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB3 HPTVVISAYRKALDDMISTLKKISIPVDISDSDMMLNIINSSITTKAISRWSSLACNIAL
:: .. ... : . .. :..... .. : . .... .:. ::. .. ... . ..
CCDS55 HPRIITEGFEAAKEKALQFLEEVKVSREM-DRETLIDVARTSLRTKVHAELADVLTEAVV
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB3 DAVKMVQFEENGRKEIDIKKYARVEKIPGGIIEDSCVLRGVMINKDVTHPRMRRYIKNPR
:.. .. .. . ::. . .. .. :. ..::..... . :: :.. ...
CCDS55 DSILAIKKQD---EPIDLF-MIEIMEMKHKSETDTSLIRGLVLDHGARHPDMKKRVEDAY
180 190 200 210 220
240 250 260 270 280
pF1KB3 IVLLDSSLEYKKGESQTDIEITREEDFTRILQMEEEYIQQLCEDIIQLK------PD---
:. . ::::.: : .. . :. .... :...:.. . ::.:: :
CCDS55 ILTCNVSLEYEKTEVNSGFFYKSAEEREKLVKAERKFIEDRVKKIIELKRKVCGDSDKGF
230 240 250 260 270 280
290 300 310 320 330 340
pF1KB3 VVITEKGISDLAQHYLMRANITAIRRVRKTDNNRIARACGARIVSRPEELREDDVGTGAG
:::..:::. .. : . .:.:.::... . .:.. :::. .. ..: : .: ::
CCDS55 VVINQKGIDPFSLDALSKEGIVALRRAKRRNMERLTLACGGVALNSFDDLSPDCLGH-AG
290 300 310 320 330 340
350 360 370 380 390 400
pF1KB3 LLEIKKIGDEYFTFITDCKDPKACTILLRGASKEILSEVERNLQDAMQVCRNVLLDPQLV
:. .:.: :::: :..:.. :.:..: .:. :.... ..:.... .:.. : .:
CCDS55 LVYEYTLGEEKFTFIEKCNNPRSVTLLIKGPNKHTLTQIKDAVRDGLRAVKNAIDDGCVV
350 360 370 380 390 400
410 420 430 440 450 460
pF1KB3 PGGGASEMAVAHALTEKSKAMTGVEQWPYRAVAQALEVIPRTLIQNCGASTIRLLTSLRA
::.:: :.:.:.:: ... .. : : .: :.:: .::..: :: : . . :....:
CCDS55 PGAGAVEVAMAEALIKHKPSVKGRAQLGVQAFADALLIIPKVLAQNSGFDLQETLVKIQA
410 420 430 440 450 460
470 480 490 500 510 520
pF1KB3 KHTQENCETWGVNGETGTLVDMKELGIWEPLAVKLQTYKTAVETAVLLLRIDDIVSGHKK
.:. :. . ::. .:: . :.:.:. :: : .. . :. .: .:.:.
CCDS55 EHS-ESGQLVGVDLNTGEPMVAAEVGVWDNYCVKKQLLHSCTVIATNILLVDEIMRAGMS
470 480 490 500 510 520
530 540
pF1KB3 KGDDQSRQGGAPDAGQE
CCDS55 SLKG
530
>>CCDS32617.1 CCT6B gene_id:10693|Hs108|chr17 (530 aa)
initn: 784 init1: 324 opt: 894 Z-score: 1041.8 bits: 202.5 E(32554): 1e-51
Smith-Waterman score: 894; 29.7% identity (67.2% similar) in 522 aa overlap (13-523:8-522)
10 20 30 40 50
pF1KB3 MMGHRPVLVLSQNTKRE--SGRKVQSGNINAAKTIADIIRTCLGPKSMMKMLLDPMGGIV
:.: : .: . . :: ::. . :..:: ::::. ::::.. : :
CCDS32 MAAIKAVNSKAEVARARAALAVNICAARGLQDVLRTNLGPKGTMKMLVSGAGDIK
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB3 MTNDGNAILREIQVQHPAAKSMIEISRTQDEEVGDGTTSVIILAGEMLSVAEHFLEQQMH
.:.:::..: :.:.:::.:. . ... .::. .:::::: ... ::.:. :. .. . .:
CCDS32 LTKDGNVLLDEMQIQHPTASLIAKVATAQDDVTGDGTTSNVLIIGELLKQADLYISEGLH
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB3 PTVVISAYRKALDDMISTLKKISIPVDISDSDMMLNIINSSITTKAISRWSSLACNIALD
: .. ... : . .:..... ... . ..:.. .:. ::. .. ... ....:
CCDS32 PRIIAEGFEAAKIKALEVLEEVKVTKEMKRK-ILLDVARTSLQTKVHAELADVLTEVVVD
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB3 AVKMVQFEENGRKEIDIKKYARVEKIPGGIIEDSCVLRGVMINKDVTHPRMRRYIKNPRI
.: :. . : ::. .... .. . :. ...:..... . :: :.. ... :
CCDS32 SVLAVR--RPGYP-IDLF-MVEIMEMKHKLGTDTKLIQGLVLDHGARHPDMKKRVEDAFI
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280
pF1KB3 VLLDSSLEYKKGESQTDIEITREEDFTRILQMEEEYIQQLCEDIIQLKPDV---------
.. . ::::.: : .. . :. .... :...:.. . ::.:: :
CCDS32 LICNVSLEYEKTEVNSGFFYKTAEEKEKLVKAERKFIEDRVQKIIDLKDKVCAQSNKGFV
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KB3 VITEKGISDLAQHYLMRANITAIRRVRKTDNNRIARACGARIVSRPEELREDDVGTGAGL
::..:::. .. : . .:.:.::... . .:.. :::. :. :.: : .: :::
CCDS32 VINQKGIDPFSLDSLAKHGIVALRRAKRRNMERLSLACGGMAVNSFEDLTVDCLGH-AGL
300 310 320 330 340
350 360 370 380 390 400
pF1KB3 LEIKKIGDEYFTFITDCKDPKACTILLRGASKEILSEVERNLQDAMQVCRNVLLDPQLVP
. .:.: :::: .: .: . :.:..: .:. :..:. ..:.... .:.. : .::
CCDS32 VYEYTLGEEKFTFIEECVNPCSVTLLVKGPNKHTLTQVKDAIRDGLRAIKNAIEDGCMVP
350 360 370 380 390 400
410 420 430 440 450 460
pF1KB3 GGGASEMAVAHALTEKSKAMTGVEQWPYRAVAQALEVIPRTLIQNCGASTIRLLTSLRAK
:.:: :.:.:.::. .... : . .: :.:: .::..: :: : . . :....:.
CCDS32 GAGAIEVAMAEALVTYKNSIKGRARLGVQAFADALLIIPKVLAQNAGYDPQETLVKVQAE
410 420 430 440 450 460
470 480 490 500 510 520
pF1KB3 HTQENCETWGVNGETGTLVDMKELGIWEPLAVKLQTYKTAVETAVLLLRIDDIVSGHKKK
:. :. . ::. .:: . . :.:. :: : .. . :. .: .:.:.
CCDS32 HV-ESKQLVGVDLNTGEPMVAADAGVWDNYCVKKQLLHSCTVIATNILLVDEIMRAGMSS
470 480 490 500 510 520
530 540
pF1KB3 GDDQSRQGGAPDAGQE
CCDS32 LK
530
>>CCDS54367.1 CCT7 gene_id:10574|Hs108|chr2 (499 aa)
initn: 778 init1: 398 opt: 892 Z-score: 1039.9 bits: 202.1 E(32554): 1.3e-51
Smith-Waterman score: 892; 31.4% identity (66.0% similar) in 500 aa overlap (46-537:1-490)
20 30 40 50 60 70
pF1KB3 RESGRKVQSGNINAAKTIADIIRTCLGPKSMMKMLLDPMGGIVMTNDGNAILREIQVQHP
: :...: : ...::: .::. ..: ::
CCDS54 MDKLIVDGRGKATISNDGATILKLLDVVHP
10 20 30
80 90 100 110 120 130
pF1KB3 AAKSMIEISRTQDEEVGDGTTSVIILAGEMLSVAEHFLEQQMHPTVVISAYRKALDDMIS
:::....:...:: ::::::::: .::.:.:. .. ..:. .:: ..: :.: : . ..
CCDS54 AAKTLVDIAKSQDAEVGDGTTSVTLLAAEFLKQVKPYVEEGLHPQIIIRAFRTATQLAVN
40 50 60 70 80 90
140 150 160 170 180 190
pF1KB3 TLKKISIPVDISDS----DMMLNIINSSITTKAISRWSSLACNIALDAVKMVQFEENGRK
.:.:.. : .:. .. . .....: ::. ... ....::: :..
CCDS54 KIKEIAVTVKKADKVEQRKLLEKCAMTALSSKLISQQKAFFAKMVVDAVMMLD-------
100 110 120 130 140
200 210 220 230 240
pF1KB3 EIDIKKYARVEKIPGGIIEDSCVLRGVMINKDVTHP--RMR-RYIKNPRIVLLDSSLEYK
.. :. ..:. :: .::: .. :: ..: .. .:. . .::.:.::. :: :
CCDS54 DLLQLKMIGIKKVQGGALEDSQLVAGVAFKKTFSYAGFEMQPKKYHNPKIALLNVELELK
150 160 170 180 190 200
250 260 270 280 290 300
pF1KB3 KGESQTDIEITREEDFTRILQMEEEYIQQLCEDIIQLKPDVVITEKGISDLAQHYLMRAN
.....:.. ::. :.. : . . . : : . ::... :.:.: .:. .
CCDS54 AEKDNAEIRVHTVEDYQAIVDAEWNILYDKLEKIHHSGAKVVLSKLPIGDVATQYFADRD
210 220 230 240 250 260
310 320 330 340 350 360
pF1KB3 ITAIRRVRKTDNNRIARACGARIVSRPEELREDDVGTGAGLLEIKKIGDEYFTFITDCKD
. :: . : .: :::. : . . : : .: ..: .:: : ..:.: :
CCDS54 MFCAGRVPEEDLKRTMMACGGSIQTSVNALSADVLGR-CQVFEETQIGGERYNFFTGCPK
270 280 290 300 310 320
370 380 390 400 410 420
pF1KB3 PKACTILLRGASKEILSEVERNLQDAMQVCRNVLLDPQLVPGGGASEMAVAHALTEKSKA
:.::..:::...... :.::.:.::... : .. . ..: :::: :: ... : . :..
CCDS54 AKTCTFILRGGAEQFMEETERSLHDAIMIVRRAIKNDSVVAGGGAIEMELSKYLRDYSRT
330 340 350 360 370 380
430 440 450 460 470 480
pF1KB3 MTGVEQWPYRAVAQALEVIPRTLIQNCGASTIRLLTSLRAKHTQENCETW-GVNGETGTL
. : .: : :.:::.::: : .: : .. .:..:::.:.: . :: ::. .. .
CCDS54 IPGKQQLLIGAYAKALEIIPRQLCDNAGFDATNILNKLRARHAQGG--TWYGVDINNEDI
390 400 410 420 430 440
490 500 510 520 530 540
pF1KB3 VDMKELGIWEPLAVKLQTYKTAVETAVLLLRIDDIVSGHKKKGDDQSRQGGAPDAGQE
.: : .::: :.... .: :.: :.. .:. ... .. : . :
CCDS54 ADNFEAFVWEPAMVRINALTAASEAACLIVSVDETIKNPRSTVDAPTAAGRGRGRGRPH
450 460 470 480 490
545 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sat Nov 5 04:52:55 2016 done: Sat Nov 5 04:52:56 2016
Total Scan time: 2.390 Total Display time: 0.090
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]