Result of FASTA (ccds) for pFN21AE4150
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KE4150, 585 aa
  1>>>pF1KE4150 585 - 585 aa - 585 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.5831+/-0.00117; mu= 16.8631+/- 0.070
 mean_var=68.1431+/-13.968, 0's: 0 Z-trim(102.3): 191  B-trim: 355 in 1/48
 Lambda= 0.155369
 statistics sampled from 6678 (6877) to 6678 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.562), E-opt: 0.2 (0.211), width:  16
 Scan time:  3.210

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS76675.1 KLHL28 gene_id:54813|Hs108|chr14       ( 585) 3972 900.0       0
CCDS9680.1 KLHL28 gene_id:54813|Hs108|chr14        ( 571) 3866 876.3       0
CCDS1310.1 KLHL20 gene_id:27252|Hs108|chr1         ( 609) 1538 354.5 2.3e-97
CCDS30550.1 KLHL17 gene_id:339451|Hs108|chr1       ( 642) 1446 333.8 3.9e-91
CCDS4192.1 KLHL3 gene_id:26249|Hs108|chr5          ( 587) 1342 310.5 3.7e-84
CCDS33749.1 KLHL18 gene_id:23276|Hs108|chr3        ( 574) 1340 310.1   5e-84
CCDS58970.1 KLHL3 gene_id:26249|Hs108|chr5         ( 555) 1334 308.7 1.2e-83
CCDS1429.1 KLHL12 gene_id:59349|Hs108|chr1         ( 568) 1322 306.0 8.1e-83
CCDS34094.1 KLHL2 gene_id:11275|Hs108|chr4         ( 593) 1322 306.0 8.5e-83
CCDS54815.1 KLHL2 gene_id:11275|Hs108|chr4         ( 597) 1322 306.0 8.5e-83
CCDS3617.1 KLHL8 gene_id:57563|Hs108|chr4          ( 620) 1213 281.6   2e-75
CCDS58969.1 KLHL3 gene_id:26249|Hs108|chr5         ( 505) 1169 271.7 1.6e-72
CCDS54816.1 KLHL2 gene_id:11275|Hs108|chr4         ( 505) 1155 268.6 1.4e-71
CCDS42340.1 KLHL10 gene_id:317719|Hs108|chr17      ( 608) 1105 257.4 3.8e-68
CCDS82974.1 KLHL2 gene_id:11275|Hs108|chr4         ( 496) 1103 256.9 4.3e-68
CCDS54756.1 KLHL5 gene_id:51088|Hs108|chr4         ( 568)  993 232.3 1.3e-60
CCDS33975.1 KLHL5 gene_id:51088|Hs108|chr4         ( 709)  993 232.3 1.6e-60
CCDS33974.1 KLHL5 gene_id:51088|Hs108|chr4         ( 755)  993 232.3 1.7e-60
CCDS77937.1 KLHL8 gene_id:57563|Hs108|chr4         ( 544)  990 231.6   2e-60
CCDS9445.1 KLHL1 gene_id:57626|Hs108|chr13         ( 748)  987 231.0 4.2e-60
CCDS55479.1 KLHL13 gene_id:90293|Hs108|chrX        ( 613)  964 225.8 1.2e-58
CCDS55481.1 KLHL13 gene_id:90293|Hs108|chrX        ( 639)  964 225.8 1.3e-58
CCDS14571.1 KLHL13 gene_id:90293|Hs108|chrX        ( 655)  964 225.8 1.3e-58
CCDS55480.1 KLHL13 gene_id:90293|Hs108|chrX        ( 658)  964 225.8 1.3e-58
CCDS6503.1 KLHL9 gene_id:55958|Hs108|chr9          ( 617)  963 225.6 1.5e-58
CCDS14456.1 KLHL4 gene_id:56062|Hs108|chrX         ( 720)  951 222.9 1.1e-57
CCDS14457.1 KLHL4 gene_id:56062|Hs108|chrX         ( 718)  947 222.0   2e-57
CCDS44132.1 IPP gene_id:3652|Hs108|chr1            ( 582)  927 217.5 3.7e-56
CCDS30702.1 IPP gene_id:3652|Hs108|chr1            ( 584)  924 216.8   6e-56
CCDS73582.1 KLHL1 gene_id:57626|Hs108|chr13        ( 687)  900 211.5 2.9e-54
CCDS3449.1 KLHL5 gene_id:51088|Hs108|chr4          ( 694)  889 209.0 1.6e-53
CCDS54335.1 KLHL29 gene_id:114818|Hs108|chr2       ( 875)  884 207.9 4.2e-53
CCDS34609.1 KLHL7 gene_id:55975|Hs108|chr7         ( 586)  849 200.0 6.9e-51
CCDS43766.1 KLHL38 gene_id:340359|Hs108|chr8       ( 581)  846 199.3 1.1e-50
CCDS4021.1 ENC1 gene_id:8507|Hs108|chr5            ( 589)  845 199.1 1.3e-50
CCDS10339.1 KLHL25 gene_id:64410|Hs108|chr15       ( 589)  838 197.5 3.8e-50
CCDS3245.2 KLHL6 gene_id:89857|Hs108|chr3          ( 621)  826 194.9 2.6e-49
CCDS12384.1 KLHL26 gene_id:55295|Hs108|chr19       ( 615)  812 191.7 2.3e-48
CCDS5378.2 KLHL7 gene_id:55975|Hs108|chr7          ( 538)  792 187.2 4.5e-47
CCDS75163.1 KLHL8 gene_id:57563|Hs108|chr4         ( 437)  768 181.8 1.6e-45
CCDS13780.1 KLHL22 gene_id:84861|Hs108|chr22       ( 634)  768 181.9 2.2e-45
CCDS58958.1 ENC1 gene_id:8507|Hs108|chr5           ( 516)  729 173.1 7.7e-43
CCDS3246.1 KLHL24 gene_id:54800|Hs108|chr3         ( 600)  691 164.6 3.2e-40
CCDS5038.1 KLHL32 gene_id:114792|Hs108|chr6        ( 620)  670 159.9 8.7e-39
CCDS12239.1 KEAP1 gene_id:9817|Hs108|chr19         ( 624)  669 159.7   1e-38
CCDS10935.1 GAN gene_id:8139|Hs108|chr16           ( 597)  615 147.6 4.3e-35
CCDS10948.1 KLHL36 gene_id:79786|Hs108|chr16       ( 616)  605 145.3 2.1e-34
CCDS34614.1 KBTBD2 gene_id:25948|Hs108|chr7        ( 623)  604 145.1 2.5e-34
CCDS30575.1 KLHL21 gene_id:9903|Hs108|chr1         ( 597)  594 142.9 1.1e-33
CCDS1368.1 IVNS1ABP gene_id:10625|Hs108|chr1       ( 642)  582 140.2 7.7e-33


>>CCDS76675.1 KLHL28 gene_id:54813|Hs108|chr14            (585 aa)
 initn: 3972 init1: 3972 opt: 3972  Z-score: 4810.3  bits: 900.0 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 3972; 100.0% identity (100.0% similar) in 585 aa overlap (1-585:1-585)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE4 MHFKCKYSYPALYQMDHTSPTYMLANLTHLHSEQLLQGLNLLRQHHELCDIILRVGDVKI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 MHFKCKYSYPALYQMDHTSPTYMLANLTHLHSEQLLQGLNLLRQHHELCDIILRVGDVKI
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE4 HAHKVVLASVSPYFKAMFTGNLSEKENSEVEFQCIDETALQAIVEYAYTGTVFISQDTVE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 HAHKVVLASVSPYFKAMFTGNLSEKENSEVEFQCIDETALQAIVEYAYTGTVFISQDTVE
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE4 SLLPAANLLQIKLVLKECCAFLESQLDPGNCIGISRFAETYGCRDLYLAATKYICQNFEA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 SLLPAANLLQIKLVLKECCAFLESQLDPGNCIGISRFAETYGCRDLYLAATKYICQNFEA
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE4 VCQTEEFFELTHADLDEIVSNDCLNVATEETVFYALESWIKYDVQERQKYLAQLLNSVRL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 VCQTEEFFELTHADLDEIVSNDCLNVATEETVFYALESWIKYDVQERQKYLAQLLNSVRL
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE4 PLLSVKFLTRLYEANHLIRDDRTCKHLLNEALKYHFMPEHRLSHQTVLMTRPRCAPKVLC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 PLLSVKFLTRLYEANHLIRDDRTCKHLLNEALKYHFMPEHRLSHQTVLMTRPRCAPKVLC
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE4 AVGGKSGLFACLDSVEMYFPQNDSWIGLAPLNIPRYEFGICVLDQKVYVIGGIATNVRPG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 AVGGKSGLFACLDSVEMYFPQNDSWIGLAPLNIPRYEFGICVLDQKVYVIGGIATNVRPG
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KE4 VTIRKHENSVECWNPDTNTWTSLERMNESRSTLGVVVLAGELYALGGYDGQSYLQSVEKY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 VTIRKHENSVECWNPDTNTWTSLERMNESRSTLGVVVLAGELYALGGYDGQSYLQSVEKY
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KE4 IPKIRKWQPVAPMTTTRSCFAAAVLDGMIYAIGGYGPAHMNSVERYDPSKDSWEMVASMA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 IPKIRKWQPVAPMTTTRSCFAAAVLDGMIYAIGGYGPAHMNSVERYDPSKDSWEMVASMA
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KE4 DKRIHFGVGVMLGFIFVVGGHNGVSHLSSIERYDPHQNQWTVCRPMKEPRTGVGAAVIDN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 DKRIHFGVGVMLGFIFVVGGHNGVSHLSSIERYDPHQNQWTVCRPMKEPRTGVGAAVIDN
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580     
pF1KE4 YLYVVGGHSGSSYLNTVQKYDPISDTWLDSAGMIYCRCNFGLTAL
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 YLYVVGGHSGSSYLNTVQKYDPISDTWLDSAGMIYCRCNFGLTAL
              550       560       570       580     

>>CCDS9680.1 KLHL28 gene_id:54813|Hs108|chr14             (571 aa)
 initn: 3866 init1: 3866 opt: 3866  Z-score: 4682.1  bits: 876.3 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 3866; 100.0% identity (100.0% similar) in 571 aa overlap (15-585:1-571)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE4 MHFKCKYSYPALYQMDHTSPTYMLANLTHLHSEQLLQGLNLLRQHHELCDIILRVGDVKI
                     ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS96               MDHTSPTYMLANLTHLHSEQLLQGLNLLRQHHELCDIILRVGDVKI
                             10        20        30        40      

               70        80        90       100       110       120
pF1KE4 HAHKVVLASVSPYFKAMFTGNLSEKENSEVEFQCIDETALQAIVEYAYTGTVFISQDTVE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS96 HAHKVVLASVSPYFKAMFTGNLSEKENSEVEFQCIDETALQAIVEYAYTGTVFISQDTVE
         50        60        70        80        90       100      

              130       140       150       160       170       180
pF1KE4 SLLPAANLLQIKLVLKECCAFLESQLDPGNCIGISRFAETYGCRDLYLAATKYICQNFEA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS96 SLLPAANLLQIKLVLKECCAFLESQLDPGNCIGISRFAETYGCRDLYLAATKYICQNFEA
        110       120       130       140       150       160      

              190       200       210       220       230       240
pF1KE4 VCQTEEFFELTHADLDEIVSNDCLNVATEETVFYALESWIKYDVQERQKYLAQLLNSVRL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS96 VCQTEEFFELTHADLDEIVSNDCLNVATEETVFYALESWIKYDVQERQKYLAQLLNSVRL
        170       180       190       200       210       220      

              250       260       270       280       290       300
pF1KE4 PLLSVKFLTRLYEANHLIRDDRTCKHLLNEALKYHFMPEHRLSHQTVLMTRPRCAPKVLC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS96 PLLSVKFLTRLYEANHLIRDDRTCKHLLNEALKYHFMPEHRLSHQTVLMTRPRCAPKVLC
        230       240       250       260       270       280      

              310       320       330       340       350       360
pF1KE4 AVGGKSGLFACLDSVEMYFPQNDSWIGLAPLNIPRYEFGICVLDQKVYVIGGIATNVRPG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS96 AVGGKSGLFACLDSVEMYFPQNDSWIGLAPLNIPRYEFGICVLDQKVYVIGGIATNVRPG
        290       300       310       320       330       340      

              370       380       390       400       410       420
pF1KE4 VTIRKHENSVECWNPDTNTWTSLERMNESRSTLGVVVLAGELYALGGYDGQSYLQSVEKY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS96 VTIRKHENSVECWNPDTNTWTSLERMNESRSTLGVVVLAGELYALGGYDGQSYLQSVEKY
        350       360       370       380       390       400      

              430       440       450       460       470       480
pF1KE4 IPKIRKWQPVAPMTTTRSCFAAAVLDGMIYAIGGYGPAHMNSVERYDPSKDSWEMVASMA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS96 IPKIRKWQPVAPMTTTRSCFAAAVLDGMIYAIGGYGPAHMNSVERYDPSKDSWEMVASMA
        410       420       430       440       450       460      

              490       500       510       520       530       540
pF1KE4 DKRIHFGVGVMLGFIFVVGGHNGVSHLSSIERYDPHQNQWTVCRPMKEPRTGVGAAVIDN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS96 DKRIHFGVGVMLGFIFVVGGHNGVSHLSSIERYDPHQNQWTVCRPMKEPRTGVGAAVIDN
        470       480       490       500       510       520      

              550       560       570       580     
pF1KE4 YLYVVGGHSGSSYLNTVQKYDPISDTWLDSAGMIYCRCNFGLTAL
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS96 YLYVVGGHSGSSYLNTVQKYDPISDTWLDSAGMIYCRCNFGLTAL
        530       540       550       560       570 

>>CCDS1310.1 KLHL20 gene_id:27252|Hs108|chr1              (609 aa)
 initn: 1678 init1: 798 opt: 1538  Z-score: 1861.5  bits: 354.5 E(32554): 2.3e-97
Smith-Waterman score: 1538; 42.7% identity (70.1% similar) in 586 aa overlap (4-582:24-596)

                                   10        20        30        40
pF1KE4                     MHFKCKYSYPALYQMDHTSPTYMLANLTHLHSEQLLQGLN
                              .:  . :        .:. :   ..  : .: :. .:
CCDS13 MEGKPMRRCTNIRPGETGMDVTSRCTLGDPNKLPEGVPQPARM-PYISDKHPRQTLEVIN
               10        20        30        40         50         

               50        60        70        80        90       100
pF1KE4 LLRQHHELCDIILRVGDVKIHAHKVVLASVSPYFKAMFTGNLSEKENSEVEFQCIDETAL
       :::.:.::::..: ::  ::.::.:.:.. ::::.:::::.:.:....:: .. ::: :.
CCDS13 LLRKHRELCDVVLVVGAKKIYAHRVILSACSPYFRAMFTGELAESRQTEVVIRDIDERAM
      60        70        80        90       100       110         

              110       120       130       140       150       160
pF1KE4 QAIVEYAYTGTVFISQDTVESLLPAANLLQIKLVLKECCAFLESQLDPGNCIGISRFAET
       . ....:::. . . . .:..::::: :::.  . . :: ::. ::::.::.::  ::.:
CCDS13 ELLIDFAYTSQITVEEGNVQTLLPAACLLQLAEIQEACCEFLKRQLDPSNCLGIRAFADT
     120       130       140       150       160       170         

              170       180       190       200       210       220
pF1KE4 YGCRDLYLAATKYICQNFEAVCQTEEFFELTHADLDEIVSNDCLNVATEETVFYALESWI
       ..::.:   : :.  .::. : ..:::. :   .: .:.:.: ::: .:: :: :. .:.
CCDS13 HSCRELLRIADKFTQHNFQEVMESEEFMLLPANQLIDIISSDELNVRSEEQVFNAVMAWV
     180       190       200       210       220       230         

              230       240       250       260       270       280
pF1KE4 KYDVQERQKYLAQLLNSVRLPLLSVKFLTRLYEANHLIRDDRTCKHLLNEALKYHFMPEH
       ::..:::.  : :.:. ::::::: :::.    .. ::..:. :. :..:: .: ..:..
CCDS13 KYSIQERRPQLPQVLQHVRLPLLSPKFLVGTVGSDPLIKSDEECRDLVDEAKNYLLLPQE
     240       250       260       270       280       290         

              290           300        310       320       330     
pF1KE4 RLSHQTVLMTRPR----CAPKVLCAVGGK-SGLFACLDSVEMYFPQNDSWIGLAPLNIPR
       :   :    ::::    :. .:: ::::  ::    ..::: : ::.. :  .: ..  :
CCDS13 RPLMQGP-RTRPRKPIRCG-EVLFAVGGWCSG--DAISSVERYDPQTNEWRMVASMSKRR
     300        310        320         330       340       350     

         340       350       360       370       380        390    
pF1KE4 YEFGICVLDQKVYVIGGIATNVRPGVTIRKHENSVECWNPDTNTWTS-LERMNESRSTLG
          :. :::. .:..::     . : .   . :::: ..: :: :.: .   .  :...:
CCDS13 CGVGVSVLDDLLYAVGG-----HDGSS---YLNSVERYDPKTNQWSSDVAPTSTCRTSVG
         360       370               380       390       400       

          400       410       420       430       440       450    
pF1KE4 VVVLAGELYALGGYDGQSYLQSVEKYIPKIRKWQPVAPMTTTRSCFAAAVLDGMIYAIGG
       :.::.: :::.:: :: : :. ::.: ::  ::  :: :.: :   :.::: :..::.::
CCDS13 VAVLGGFLYAVGGQDGVSCLNIVERYDPKENKWTRVASMSTRRLGVAVAVLGGFLYAVGG
       410       420       430       440       450       460       

           460       470       480       490       500       510   
pF1KE4 Y-GPAHMNSVERYDPSKDSWEMVASMADKRIHFGVGVMLGFIFVVGGHNGVSHLSSIERY
         : . .:.::::.:... :. .: :. .: :.: .:.  .:..:::.. ...::: :::
CCDS13 SDGTSPLNTVERYNPQENRWHTIAPMGTRRKHLGCAVYQDMIYAVGGRDDTTELSSAERY
       470       480       490       500       510       520       

           520       530       540       550       560       570   
pF1KE4 DPHQNQWTVCRPMKEPRTGVGAAVIDNYLYVVGGHSGSSYLNTVQKYDPISDTWLDSAGM
       .:. :::.    :   :.::: ::... :..::: .:..::.:.. .:: ..::   .::
CCDS13 NPRTNQWSPVVAMTSRRSGVGLAVVNGQLMAVGGFDGTTYLKTIEVFDPDANTWRLYGGM
       530       540       550       560       570       580       

           580               
pF1KE4 IYCRCNFGLTAL          
        : : . :.             
CCDS13 NYRRLGGGVGVIKMTHCESHIW
       590       600         

>>CCDS30550.1 KLHL17 gene_id:339451|Hs108|chr1            (642 aa)
 initn: 1935 init1: 766 opt: 1446  Z-score: 1749.7  bits: 333.8 E(32554): 3.9e-91
Smith-Waterman score: 1446; 42.2% identity (70.0% similar) in 566 aa overlap (24-585:67-622)

                      10        20        30        40        50   
pF1KE4        MHFKCKYSYPALYQMDHTSPTYMLANLTHLHSEQLLQGLNLLRQHHELCDIIL
                                     .:. .. : .. . ... .::.  ::::.:
CCDS30 PEAERTRPRQARPAAPMEGAVQLLSREGHSVAHNSKRHYHDAFVAMSRMRQRGLLCDIVL
         40        50        60        70        80        90      

            60        70        80        90       100       110   
pF1KE4 RVGDVKIHAHKVVLASVSPYFKAMFTGNLSEKENSEVEFQCIDETALQAIVEYAYTGTVF
       .:.  .:.:::::::: ::::.::::...::.....: .. ::  ::. .:..:::. . 
CCDS30 HVAAKEIRAHKVVLASCSPYFHAMFTNEMSESRQTHVTLHDIDPQALDQLVQFAYTAEIV
        100       110       120       130       140       150      

           120       130       140       150       160       170   
pF1KE4 ISQDTVESLLPAANLLQIKLVLKECCAFLESQLDPGNCIGISRFAETYGCRDLYLAATKY
       ... .:..:::::.:::.. :   :: :: :::::.::.::  ::....: ::  :: .:
CCDS30 VGEGNVQTLLPAASLLQLNGVRDACCKFLLSQLDPSNCLGIRGFADAHSCSDLLKAAHRY
        160       170       180       190       200       210      

           180       190       200       210       220       230   
pF1KE4 ICQNFEAVCQTEEFFELTHADLDEIVSNDCLNVATEETVFYALESWIKYDVQERQKYLAQ
       . :.:  : .::::. :   .. :.::.: ::: .:: :. :. ::.:.::. :.... .
CCDS30 VLQHFVDVAKTEEFMLLPLKQVLELVSSDSLNVPSEEEVYRAVLSWVKHDVDARRQHVPR
        220       230       240       250       260       270      

           240       250       260       270       280       290   
pF1KE4 LLNSVRLPLLSVKFLTRLYEANHLIRDDRTCKHLLNEALKYHFMPEHRLSHQTVLMTRPR
       :.. :::::::  ::    .:. :.:    :: :: ::::.:..::.:    :   ::::
CCDS30 LMKCVRLPLLSRDFLLGHVDAESLVRHHPDCKDLLIEALKFHLLPEQRGVLGTS-RTRPR
        280       290       300       310       320       330      

              300       310       320       330       340       350
pF1KE4 -C--APKVLCAVGGKSGLFACLDSVEMYFPQNDSWIGLAPLNIPRYEFGICVLDQKVYVI
        :  :  :: :::: : :::   . : :  ..: :  .: ..  : . :. .. ...:..
CCDS30 RCEGAGPVLFAVGGGS-LFAIHGDCEAYDTRTDRWHVVASMSTRRARVGVAAVGNRLYAV
         340       350        360       370       380       390    

              360       370       380       390       400       410
pF1KE4 GGIATNVRPGVTIRKHENSVECWNPDTNTWTSLERMNESRSTLGVVVLAGELYALGGYDG
       ::       :..      .:: ..: ::::     :.  :: :::..: : ::. :::::
CCDS30 GGY-----DGTS---DLATVESYDPVTNTWQPEVSMGTRRSCLGVAALHGLLYSAGGYDG
               400          410       420       430       440      

              420       430       440       450        460         
pF1KE4 QSYLQSVEKYIPKIRKWQPVAPMTTTRSCFAAAVLDGMIYAIGGY-GPAHMNSVERYDPS
        : :.:.:.: :    :  :: :.: :    .:.::: .::.::: . .:. .::.:.:.
CCDS30 ASCLNSAERYDPLTGTWTSVAAMSTRRRYVRVATLDGNLYAVGGYDSSSHLATVEKYEPQ
        450       460       470       480       490       500      

     470       480       490       500       510       520         
pF1KE4 KDSWEMVASMADKRIHFGVGVMLGFIFVVGGHNGVSHLSSIERYDPHQNQWTVCRPMKEP
        . :  :::: ..:   ::.:. : ..:.::..:.: :.:.:::.:. . :    ::.  
CCDS30 VNVWSPVASMLSRRSSAGVAVLEGALYVAGGNDGTSCLNSVERYSPKAGAWESVAPMNIR
        510       520       530       540       550       560      

     530       540       550       560       570       580         
pF1KE4 RTGVGAAVIDNYLYVVGGHSGSSYLNTVQKYDPISDTWLDSAGMIYCRCNFGLTAL    
       :.    ...:..::.:::..::: ::...::.: .. :. .. :.  : . :...:    
CCDS30 RSTHDLVAMDGWLYAVGGNDGSSSLNSIEKYNPRTNKWVAASCMFTRRSSVGVAVLELLN
        570       580       590       600       610       620      

CCDS30 FPPPSSPTLSVSSTSL
        630       640  

>>CCDS4192.1 KLHL3 gene_id:26249|Hs108|chr5               (587 aa)
 initn: 1719 init1: 710 opt: 1342  Z-score: 1624.3  bits: 310.5 E(32554): 3.7e-84
Smith-Waterman score: 1342; 38.7% identity (67.3% similar) in 569 aa overlap (6-567:7-564)

                10        20        30        40        50         
pF1KE4  MHFKCKYSYPALYQMDHTSPTYMLANLTHLHSEQLLQGLNLLRQHHELCDIILRVGDVK
             : :  .: :      .    ...  :  . .. .: ::... :::... . ::.
CCDS41 MEGESVKLSSQTLIQAGDDEKNQRTITVNPAHMGKAFKVMNELRSKQLLCDVMIVAEDVE
               10        20        30        40        50        60

      60        70        80        90       100       110         
pF1KE4 IHAHKVVLASVSPYFKAMFTGNLSEKENSEVEFQCIDETALQAIVEYAYTGTVFISQDTV
       :.::.::::. :::: :::::..::.. ...:.. .:  .:. ...: ::. . .....:
CCDS41 IEAHRVVLAACSPYFCAMFTGDMSESKAKKIEIKDVDGQTLSKLIDYIYTAEIEVTEENV
               70        80        90       100       110       120

     120       130       140       150       160       170         
pF1KE4 ESLLPAANLLQIKLVLKECCAFLESQLDPGNCIGISRFAETYGCRDLYLAATKYICQNFE
       . :::::.:::.  : ..:: ::.::: : ::.::  ::... : ::   :. :  :.: 
CCDS41 QVLLPAASLLQLMDVRQNCCDFLQSQLHPTNCLGIRAFADVHTCTDLLQQANAYAEQHFP
              130       140       150       160       170       180

     180       190       200       210       220       230         
pF1KE4 AVCQTEEFFELTHADLDEIVSNDCLNVATEETVFYALESWIKYDVQERQKYLAQLLNSVR
        :   :::. :.  ..  ..:.: :.:..:: :: :. :::.:. . : ...:.:.. ::
CCDS41 EVMLGEEFLSLSLDQVCSLISSDKLTVSSEEKVFEAVISWINYEKETRLEHMAKLMEHVR
              190       200       210       220       230       240

     240       250       260       270        280       290        
pF1KE4 LPLLSVKFLTRLYEANHLIRDDRTCKHLLNEALKYHFMP-EHRLSHQTVLMTRPRCA---
       ::::   .:..  : . ::... ::: .: ::.:::..: ..::  ..   :.::     
CCDS41 LPLLPRDYLVQTVEEEALIKNNNTCKDFLIEAMKYHLLPLDQRLLIKNP-RTKPRTPVSL
              250       260       270       280        290         

         300       310       320       330       340       350     
pF1KE4 PKVLCAVGGKSGLFACLDSVEMYFPQNDSWIGLAPLNIPRYEFGICVLDQKVYVIGGIAT
       :::. .:::..     . ::: :  ..: :  .: :   : . :.  .  .::..::.  
CCDS41 PKVMIVVGGQAP--KAIRSVECYDFEEDRWDQIAELPSRRCRAGVVFMAGHVYAVGGFNG
     300       310         320       330       340       350       

         360       370       380       390       400       410     
pF1KE4 NVRPGVTIRKHENSVECWNPDTNTWTSLERMNESRSTLGVVVLAGELYALGGYDGQSYLQ
       ..:    .:    .:. ..   . :::.  :.: :::::..::   :::.::.::.. : 
CCDS41 SLR----VR----TVDVYDGVKDQWTSIASMQERRSTLGAAVLNDLLYAVGGFDGSTGLA
       360               370       380       390       400         

         420       430       440       450          460       470  
pF1KE4 SVEKYIPKIRKWQPVAPMTTTRSCFAAAVLDGMIYAIGGYGPAH---MNSVERYDPSKDS
       ::: :  :  .:  ::::.: ::  ...:..: .::.:::  :    ...::.:.:. . 
CCDS41 SVEAYSYKTNEWFFVAPMNTRRSSVGVGVVEGKLYAVGGYDGASRQCLSTVEQYNPATNE
     410       420       430       440       450       460         

            480       490       500       510       520       530  
pF1KE4 WEMVASMADKRIHFGVGVMLGFIFVVGGHNGVSHLSSIERYDPHQNQWTVCRPMKEPRTG
       : .::.:. .:   ::::. : ....:::.:    .:.: :::  : :     :.  : .
CCDS41 WIYVADMSTRRSGAGVGVLSGQLYATGGHDGPLVRKSVEVYDPGTNTWKQVADMNMCRRN
     470       480       490       500       510       520         

            540       550       560       570       580          
pF1KE4 VGAAVIDNYLYVVGGHSGSSYLNTVQKYDPISDTWLDSAGMIYCRCNFGLTAL     
       .:. .... :::::: .::  : .:. :.:..: :                       
CCDS41 AGVCAVNGLLYVVGGDDGSCNLASVEYYNPVTDKWTLLPTNMSTGRSYAGVAVIHKSL
     530       540       550       560       570       580       

>>CCDS33749.1 KLHL18 gene_id:23276|Hs108|chr3             (574 aa)
 initn: 1306 init1: 704 opt: 1340  Z-score: 1622.0  bits: 310.1 E(32554): 5e-84
Smith-Waterman score: 1340; 38.9% identity (68.4% similar) in 566 aa overlap (24-581:9-562)

               10        20        30         40           50      
pF1KE4 MHFKCKYSYPALYQMDHTSPTYMLANLTHLH-SEQLLQGLNLL---RQHHELCDIILRVG
                              : .:.:.  ::   .: ...   :.. .:::. :..:
CCDS33                MVEDGAEELEDLVHFSVSELPSRGYGVMEEIRRQGKLCDVTLKIG
                              10        20        30        40     

         60        70        80        90       100       110      
pF1KE4 DVKIHAHKVVLASVSPYFKAMFTGNLSEKENSEVEFQCIDETALQAIVEYAYTGTVFISQ
       : :. ::..:::.  :::.::::... : ...:. .: .: .::.:....::.:.. :.:
CCDS33 DHKFSAHRIVLAASIPYFHAMFTNDMMECKQDEIVMQGMDPSALEALINFAYNGNLAIDQ
          50        60        70        80        90       100     

        120       130       140       150       160       170      
pF1KE4 DTVESLLPAANLLQIKLVLKECCAFLESQLDPGNCIGISRFAETYGCRDLYLAATKYICQ
       ..:.::: .:..::.. .   ::.::. .: : ::.:. .::::. :  :: ::...: :
CCDS33 QNVQSLLMGASFLQLQSIKDACCTFLRERLHPKNCLGVRQFAETMMCAVLYDAANSFIHQ
         110       120       130       140       150       160     

        180       190       200       210       220       230      
pF1KE4 NFEAVCQTEEFFELTHADLDEIVSNDCLNVATEETVFYALESWIKYDVQERQKYLAQLLN
       .:  : ..:::. :   :. :.:: : ::: .:: :: :  .:..:: ..:  :: .::.
CCDS33 HFVEVSMSEEFLALPLEDVLELVSRDELNVKSEEQVFEAALAWVRYDREQRGPYLPELLS
         170       180       190       200       210       220     

        240       250       260       270       280       290      
pF1KE4 SVRLPLLSVKFLTRLYEANHLIRDDRTCKHLLNEALKYHFMPEHRLSHQTVLMTRPRCAP
       ..::::   .::.   . . :.:  . :. :..::  ::.:::.:  :  .. :::::  
CCDS33 NIRLPLCRPQFLSDRVQQDDLVRCCHKCRDLVDEAKDYHLMPERR-PHLPAFRTRPRCCT
         230       240       250       260       270        280    

           300       310       320       330       340       350   
pF1KE4 KV---LCAVGGKSGLFACLDSVEMYFPQNDSWIGLAPLNIPRYEFGICVLDQKVYVIGGI
       ..   . :::: ..    :. ::.. :  . :    :..  : . :. :..  .:.::: 
CCDS33 SIAGLIYAVGGLNSAGDSLNVVEVFDPIANCWERCRPMTTARSRVGVAVVNGLLYAIGGY
          290       300       310       320       330       340    

           360       370       380       390       400       410   
pF1KE4 ATNVRPGVTIRKHENSVECWNPDTNTWTSLERMNESRSTLGVVVLAGELYALGGYDGQSY
         ..:         ..:: .::.:.::: .  :: .::..:.::: :..:. :::::.: 
CCDS33 DGQLR--------LSTVEAYNPETDTWTRVGSMNSKRSAMGTVVLDGQIYVCGGYDGNSS
                  350       360       370       380       390      

           420       430       440       450        460       470  
pF1KE4 LQSVEKYIPKIRKWQPVAPMTTTRSCFAAAVLDGMIYAIGGY-GPAHMNSVERYDPSKDS
       :.::: : :.  ::  :. :...::  ...:..: ::. ::. :   ..:::.:.    .
CCDS33 LSSVETYSPETDKWTVVTSMSSNRSAAGVTVFEGRIYVSGGHDGLQIFSSVEHYNHHTAT
        400       410       420       430       440       450      

            480       490       500       510       520       530  
pF1KE4 WEMVASMADKRIHFGVGVMLGFIFVVGGHNGVSHLSSIERYDPHQNQWTVCRPMKEPRTG
       :. .:.: .:: . :.. . . .:: ::..: . ::  : :.   .:: .  ::.  :. 
CCDS33 WHPAAGMLNKRCRHGAASLGSKMFVCGGYDGSGFLSIAEMYSSVADQWCLIVPMHTRRSR
        460       470       480       490       500       510      

            540       550       560       570       580            
pF1KE4 VGAAVIDNYLYVVGGHSGSSYLNTVQKYDPISDTWLDSAGMIYCRCNFGLTAL       
       :. ..  . ::.:::..:.: :..:. ::: .: :   : :    :. :           
CCDS33 VSLVASCGRLYAVGGYDGQSNLSSVEMYDPETDCWTFMAPMA---CHEGGVGVGCIPLLT
        520       530       540       550          560       570   

CCDS33 I
        

>>CCDS58970.1 KLHL3 gene_id:26249|Hs108|chr5              (555 aa)
 initn: 1719 init1: 710 opt: 1334  Z-score: 1615.0  bits: 308.7 E(32554): 1.2e-83
Smith-Waterman score: 1334; 40.1% identity (69.0% similar) in 536 aa overlap (39-567:8-532)

       10        20        30        40        50        60        
pF1KE4 YPALYQMDHTSPTYMLANLTHLHSEQLLQGLNLLRQHHELCDIILRVGDVKIHAHKVVLA
                                     .: ::... :::... . ::.:.::.::::
CCDS58                        MGKAFKVMNELRSKQLLCDVMIVAEDVEIEAHRVVLA
                                      10        20        30       

       70        80        90       100       110       120        
pF1KE4 SVSPYFKAMFTGNLSEKENSEVEFQCIDETALQAIVEYAYTGTVFISQDTVESLLPAANL
       . :::: :::::..::.. ...:.. .:  .:. ...: ::. . .....:. :::::.:
CCDS58 ACSPYFCAMFTGDMSESKAKKIEIKDVDGQTLSKLIDYIYTAEIEVTEENVQVLLPAASL
        40        50        60        70        80        90       

      130       140       150       160       170       180        
pF1KE4 LQIKLVLKECCAFLESQLDPGNCIGISRFAETYGCRDLYLAATKYICQNFEAVCQTEEFF
       ::.  : ..:: ::.::: : ::.::  ::... : ::   :. :  :.:  :   :::.
CCDS58 LQLMDVRQNCCDFLQSQLHPTNCLGIRAFADVHTCTDLLQQANAYAEQHFPEVMLGEEFL
       100       110       120       130       140       150       

      190       200       210       220       230       240        
pF1KE4 ELTHADLDEIVSNDCLNVATEETVFYALESWIKYDVQERQKYLAQLLNSVRLPLLSVKFL
        :.  ..  ..:.: :.:..:: :: :. :::.:. . : ...:.:.. ::::::   .:
CCDS58 SLSLDQVCSLISSDKLTVSSEEKVFEAVISWINYEKETRLEHMAKLMEHVRLPLLPRDYL
       160       170       180       190       200       210       

      250       260       270        280       290          300    
pF1KE4 TRLYEANHLIRDDRTCKHLLNEALKYHFMP-EHRLSHQTVLMTRPRCA---PKVLCAVGG
       ..  : . ::... ::: .: ::.:::..: ..::  ..   :.::     :::. .:::
CCDS58 VQTVEEEALIKNNNTCKDFLIEAMKYHLLPLDQRLLIKNP-RTKPRTPVSLPKVMIVVGG
       220       230       240       250        260       270      

          310       320       330       340       350       360    
pF1KE4 KSGLFACLDSVEMYFPQNDSWIGLAPLNIPRYEFGICVLDQKVYVIGGIATNVRPGVTIR
       ..     . ::: :  ..: :  .: :   : . :.  .  .::..::.  ..:    .:
CCDS58 QAP--KAIRSVECYDFEEDRWDQIAELPSRRCRAGVVFMAGHVYAVGGFNGSLR----VR
          280       290       300       310       320           330

          370       380       390       400       410       420    
pF1KE4 KHENSVECWNPDTNTWTSLERMNESRSTLGVVVLAGELYALGGYDGQSYLQSVEKYIPKI
           .:. ..   . :::.  :.: :::::..::   :::.::.::.. : ::: :  : 
CCDS58 ----TVDVYDGVKDQWTSIASMQERRSTLGAAVLNDLLYAVGGFDGSTGLASVEAYSYKT
                  340       350       360       370       380      

          430       440       450          460       470       480 
pF1KE4 RKWQPVAPMTTTRSCFAAAVLDGMIYAIGGYGPAH---MNSVERYDPSKDSWEMVASMAD
        .:  ::::.: ::  ...:..: .::.:::  :    ...::.:.:. . : .::.:. 
CCDS58 NEWFFVAPMNTRRSSVGVGVVEGKLYAVGGYDGASRQCLSTVEQYNPATNEWIYVADMST
        390       400       410       420       430       440      

             490       500       510       520       530       540 
pF1KE4 KRIHFGVGVMLGFIFVVGGHNGVSHLSSIERYDPHQNQWTVCRPMKEPRTGVGAAVIDNY
       .:   ::::. : ....:::.:    .:.: :::  : :     :.  : ..:. .... 
CCDS58 RRSGAGVGVLSGQLYATGGHDGPLVRKSVEVYDPGTNTWKQVADMNMCRRNAGVCAVNGL
        450       460       470       480       490       500      

             550       560       570       580          
pF1KE4 LYVVGGHSGSSYLNTVQKYDPISDTWLDSAGMIYCRCNFGLTAL     
       :::::: .::  : .:. :.:..: :                       
CCDS58 LYVVGGDDGSCNLASVEYYNPVTDKWTLLPTNMSTGRSYAGVAVIHKSL
        510       520       530       540       550     

>>CCDS1429.1 KLHL12 gene_id:59349|Hs108|chr1              (568 aa)
 initn: 1695 init1: 798 opt: 1322  Z-score: 1600.3  bits: 306.0 E(32554): 8.1e-83
Smith-Waterman score: 1322; 39.0% identity (68.4% similar) in 564 aa overlap (27-585:11-565)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE4 MHFKCKYSYPALYQMDHTSPTYMLANLTHLHSEQLLQGLNLLRQHHELCDIILRVGDVKI
                                 .:. :....:...: ::. . :::. ::: .  .
CCDS14                 MGGIMAPKDIMTNTHAKSILNSMNSLRKSNTLCDVTLRVEQKDF
                               10        20        30        40    

               70        80        90       100       110       120
pF1KE4 HAHKVVLASVSPYFKAMFTGNLSEKENSEVEFQCIDETALQAIVEYAYTGTVFISQDTVE
        ::..:::. : :: ::::..:::: .  :..: .  .... .....:: :: .. ..:.
CCDS14 PAHRIVLAACSDYFCAMFTSELSEKGKPYVDIQGLTASTMEILLDFVYTETVHVTVENVQ
           50        60        70        80        90       100    

              130       140       150       160       170       180
pF1KE4 SLLPAANLLQIKLVLKECCAFLESQLDPGNCIGISRFAETYGCRDLYLAATKYICQNFEA
        ::::: :::.: : . :: ::::::::.::.::  ::::..: ::. ::  .  ..:  
CCDS14 ELLPAACLLQLKGVKQACCEFLESQLDPSNCLGIRDFAETHNCVDLMQAAEVFSQKHFPE
          110       120       130       140       150       160    

              190       200       210       220       230       240
pF1KE4 VCQTEEFFELTHADLDEIVSNDCLNVATEETVFYALESWIKYDVQERQKYLAQLLNSVRL
       : : :::. :.......... : ..: .:: :: :. .:.:.  .::.. : .::. ::.
CCDS14 VVQHEEFILLSQGEVEKLIKCDEIQVDSEEPVFEAVINWVKHAKKEREESLPNLLQYVRM
          170       180       190       200       210       220    

              250       260       270       280       290          
pF1KE4 PLLSVKFLTRLYEANHLIRDDRTCKHLLNEALKYHFMPEHRLSHQTVLMTRPRC-APKVL
       :::. ...: . .:. .:: .  :. :..:: :.:. :: : . :    :: :  : .::
CCDS14 PLLTPRYITDVIDAEPFIRCSLQCRDLVDEAKKFHLRPELRSQMQGP-RTRARLGANEVL
          230       240       250       260       270        280   

     300       310       320       330       340       350         
pF1KE4 CAVGGKSGLFACLDSVEMYFPQNDSWIGLAPLNIPRYEFGICVLDQKVYVIGGIATNVRP
        .::: ..  . .: :: : :... :  :  ..  :   .   : ...:::::       
CCDS14 LVVGGFGSQQSPIDVVEKYDPKTQEWSFLPSITRKRRYVASVSLHDRIYVIGG-----YD
           290       300       310       320       330             

     360       370          380       390       400       410      
pF1KE4 GVTIRKHENSVEC--WNPDTN-TWTSLERMNESRSTLGVVVLAGELYALGGYDGQSYLQS
       :   :.. .::::  .. : . .: :.  ::  :.  :...:.  .:. ::.::.    :
CCDS14 G---RSRLSSVECLDYTADEDGVWYSVAPMNVRRGLAGATTLGDMIYVSGGFDGSRRHTS
         340       350       360       370       380       390     

        420       430       440       450        460       470     
pF1KE4 VEKYIPKIRKWQPVAPMTTTRSCFAAAVLDGMIYAIGGY-GPAHMNSVERYDPSKDSWEM
       .:.: :.: .:. .. : :.:   . .: .:.:: .::: :   .::::.:::    :  
CCDS14 MERYDPNIDQWSMLGDMQTAREGAGLVVASGVIYCLGGYDGLNILNSVEKYDPHTGHWTN
         400       410       420       430       440       450     

         480       490       500       510       520       530     
pF1KE4 VASMADKRIHFGVGVMLGFIFVVGGHNGVSHLSSIERYDPHQNQWTVCRPMKEPRTGVGA
       :. :: ::   ::...   :.:::: .:..::::.: :. . ..::.   :  ::  :::
CCDS14 VTPMATKRSGAGVALLNDHIYVVGGFDGTAHLSSVEAYNIRTDSWTTVTSMTTPRCYVGA
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       .:. . ::...:..:.: :.... :::: :.:   ..:   ::. :. .:   
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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