Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE0891
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0891, 316 aa
1>>>pF1KE0891 316 - 316 aa - 316 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7232+/-0.00108; mu= 13.3799+/- 0.063
mean_var=166.2681+/-56.466, 0's: 0 Z-trim(104.0): 386 B-trim: 440 in 1/46
Lambda= 0.099465
statistics sampled from 7183 (7663) to 7183 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.596), E-opt: 0.2 (0.235), width: 16
Scan time: 2.560
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS35132.1 OR1K1 gene_id:392392|Hs108|chr9 ( 316) 2057 308.1 6e-84
CCDS10496.1 OR1F1 gene_id:4992|Hs108|chr16 ( 312) 1110 172.2 4.8e-43
CCDS35129.1 OR1L4 gene_id:254973|Hs108|chr9 ( 311) 1104 171.3 8.7e-43
CCDS35130.2 OR1L6 gene_id:392390|Hs108|chr9 ( 311) 1098 170.4 1.6e-42
CCDS32896.1 OR1M1 gene_id:125963|Hs108|chr19 ( 313) 1039 162.0 5.6e-40
CCDS11024.1 OR1E1 gene_id:8387|Hs108|chr17 ( 314) 1023 159.7 2.8e-39
CCDS41481.1 OR1C1 gene_id:26188|Hs108|chr1 ( 314) 1019 159.1 4.1e-39
CCDS35120.1 OR1J1 gene_id:347168|Hs108|chr9 ( 322) 1011 158.0 9.3e-39
CCDS35122.1 OR1J4 gene_id:26219|Hs108|chr9 ( 313) 1005 157.1 1.7e-38
CCDS11020.1 OR1G1 gene_id:8390|Hs108|chr17 ( 313) 1004 156.9 1.8e-38
CCDS35127.2 OR1L1 gene_id:26737|Hs108|chr9 ( 310) 1003 156.8 2e-38
CCDS35124.1 OR1L8 gene_id:138881|Hs108|chr9 ( 309) 986 154.4 1.1e-37
CCDS11022.1 OR1A1 gene_id:8383|Hs108|chr17 ( 309) 981 153.6 1.8e-37
CCDS6844.1 OR1N1 gene_id:138883|Hs108|chr9 ( 311) 977 153.1 2.7e-37
CCDS35128.1 OR1L3 gene_id:26735|Hs108|chr9 ( 324) 961 150.8 1.3e-36
CCDS35123.1 OR1N2 gene_id:138882|Hs108|chr9 ( 330) 961 150.8 1.4e-36
CCDS35125.1 OR1Q1 gene_id:158131|Hs108|chr9 ( 314) 955 149.9 2.4e-36
CCDS31545.1 OR1S2 gene_id:219958|Hs108|chr11 ( 325) 954 149.8 2.7e-36
CCDS35121.1 OR1J2 gene_id:26740|Hs108|chr9 ( 313) 951 149.3 3.6e-36
CCDS11019.1 OR1D2 gene_id:4991|Hs108|chr17 ( 312) 941 147.9 9.6e-36
CCDS32900.1 OR7D2 gene_id:162998|Hs108|chr19 ( 312) 928 146.0 3.5e-35
CCDS32937.1 OR1I1 gene_id:126370|Hs108|chr19 ( 355) 918 144.7 1e-34
CCDS58499.1 OR1D5 gene_id:8386|Hs108|chr17 ( 312) 912 143.7 1.7e-34
CCDS32901.1 OR7D4 gene_id:125958|Hs108|chr19 ( 312) 911 143.6 1.9e-34
CCDS12318.1 OR7A5 gene_id:26659|Hs108|chr19 ( 319) 898 141.7 7e-34
CCDS12320.1 OR7C2 gene_id:26658|Hs108|chr19 ( 319) 896 141.5 8.6e-34
CCDS12317.1 OR7C1 gene_id:26664|Hs108|chr19 ( 320) 894 141.2 1e-33
CCDS32032.1 OR11G2 gene_id:390439|Hs108|chr14 ( 345) 892 140.9 1.3e-33
CCDS32936.1 OR7A10 gene_id:390892|Hs108|chr19 ( 309) 891 140.7 1.4e-33
CCDS32899.1 OR7G3 gene_id:390883|Hs108|chr19 ( 312) 891 140.7 1.4e-33
CCDS41647.1 OR8U1 gene_id:219417|Hs108|chr11 ( 309) 885 139.9 2.5e-33
CCDS32897.1 OR7G2 gene_id:390882|Hs108|chr19 ( 345) 882 139.5 3.6e-33
CCDS12319.1 OR7A17 gene_id:26333|Hs108|chr19 ( 309) 881 139.3 3.7e-33
CCDS32034.1 OR11H4 gene_id:390442|Hs108|chr14 ( 324) 878 138.9 5.2e-33
CCDS31119.1 OR2G6 gene_id:391211|Hs108|chr1 ( 316) 877 138.7 5.6e-33
CCDS11021.1 OR1A2 gene_id:26189|Hs108|chr17 ( 309) 875 138.4 6.8e-33
CCDS31090.1 OR2B11 gene_id:127623|Hs108|chr1 ( 317) 873 138.2 8.4e-33
CCDS11025.1 OR3A3 gene_id:8392|Hs108|chr17 ( 321) 871 137.9 1e-32
CCDS31526.1 OR8H1 gene_id:219469|Hs108|chr11 ( 311) 864 136.9 2e-32
CCDS31706.1 OR8D1 gene_id:283159|Hs108|chr11 ( 308) 862 136.6 2.5e-32
CCDS31098.1 OR11L1 gene_id:391189|Hs108|chr1 ( 322) 862 136.6 2.5e-32
CCDS31099.1 OR2W3 gene_id:343171|Hs108|chr1 ( 314) 858 136.0 3.7e-32
CCDS53391.1 OR6P1 gene_id:128366|Hs108|chr1 ( 317) 857 135.9 4.1e-32
CCDS32042.1 OR5AU1 gene_id:390445|Hs108|chr14 ( 362) 857 135.9 4.5e-32
CCDS31534.1 OR5AP2 gene_id:338675|Hs108|chr11 ( 316) 853 135.3 6.1e-32
CCDS34358.1 OR2B3 gene_id:442184|Hs108|chr6 ( 313) 851 135.0 7.4e-32
CCDS30899.1 OR6Y1 gene_id:391112|Hs108|chr1 ( 325) 850 134.9 8.4e-32
CCDS31525.1 OR5T1 gene_id:390155|Hs108|chr11 ( 326) 849 134.7 9.3e-32
CCDS31510.1 OR5D18 gene_id:219438|Hs108|chr11 ( 313) 847 134.4 1.1e-31
CCDS34365.1 OR2H2 gene_id:7932|Hs108|chr6 ( 312) 846 134.3 1.2e-31
>>CCDS35132.1 OR1K1 gene_id:392392|Hs108|chr9 (316 aa)
initn: 2057 init1: 2057 opt: 2057 Z-score: 1620.6 bits: 308.1 E(32554): 6e-84
Smith-Waterman score: 2057; 100.0% identity (100.0% similar) in 316 aa overlap (1-316:1-316)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MEAANESSEGISFVLLGLTTSPGQQRPLFVLFLLLYVASLLGNGLIVAAIQASPALHAPM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 MEAANESSEGISFVLLGLTTSPGQQRPLFVLFLLLYVASLLGNGLIVAAIQASPALHAPM
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 YFLLAHLSFADLCFASVTVPKMLANLLAHDHSISLAGCLTQMYFFFALGVTDSCLLAAMA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 YFLLAHLSFADLCFASVTVPKMLANLLAHDHSISLAGCLTQMYFFFALGVTDSCLLAAMA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 YDCYVAIRHPLPYATRMSRAMCAALVGMAWLVSHVHSLLYILLMARLSFCASHQVPHFFC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 YDCYVAIRHPLPYATRMSRAMCAALVGMAWLVSHVHSLLYILLMARLSFCASHQVPHFFC
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 DHQPLLRLSCSDTHHIQLLIFTEGAAVVVTPFLLILASYGAIAAAVLQLPSASGRLRAVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 DHQPLLRLSCSDTHHIQLLIFTEGAAVVVTPFLLILASYGAIAAAVLQLPSASGRLRAVS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 TCGSHLAVVSLFYGTVIAVYFQATSRREAEWGRVATVMYTVVTPMLNPIIYSLWNRDVQG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 TCGSHLAVVSLFYGTVIAVYFQATSRREAEWGRVATVMYTVVTPMLNPIIYSLWNRDVQG
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE0 ALRALLIGRRISASDS
::::::::::::::::
CCDS35 ALRALLIGRRISASDS
310
>>CCDS10496.1 OR1F1 gene_id:4992|Hs108|chr16 (312 aa)
initn: 1160 init1: 1085 opt: 1110 Z-score: 886.2 bits: 172.2 E(32554): 4.8e-43
Smith-Waterman score: 1110; 55.0% identity (80.7% similar) in 311 aa overlap (1-311:1-309)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MEAANESSEGISFVLLGLTTSPGQQRPLFVLFLLLYVASLLGNGLIVAAIQASPALHAPM
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CCDS10 MSGTNQSSVS-EFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILSVSIDSCLHTPM
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 YFLLAHLSFADLCFASVTVPKMLANLLAHDHSISLAGCLTQMYFFFALGVTDSCLLAAMA
::.:..:::.:.::. .:::::::: . . ..::. :::::::: : . :. :::.::
CCDS10 YFFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMFVDMDNFLLAVMA
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 YDCYVAIRHPLPYATRMSRAMCAALVGMAWLVSHVHSLLYILLMARLSFCASHQVPHFFC
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CCDS10 YDHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFCADNAITHFFC
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 DHQPLLRLSCSDTHHIQLLIFTEGAAVVVTPFLLILASYGAIAAAVLQLPSASGRLRAVS
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CCDS10 DVTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKVPSTKGRWKAFS
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 TCGSHLAVVSLFYGTVIAVYFQATSRREAEWGRVATVMYTVVTPMLNPIIYSLWNRDVQG
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CCDS10 TCGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFIYSLRNRYLKG
240 250 260 270 280 290
310
pF1KE0 ALRALLIGRRISASDS
::. . .:: .
CCDS10 ALKKV-VGRVVFSV
300 310
>>CCDS35129.1 OR1L4 gene_id:254973|Hs108|chr9 (311 aa)
initn: 1127 init1: 1104 opt: 1104 Z-score: 881.6 bits: 171.3 E(32554): 8.7e-43
Smith-Waterman score: 1104; 55.4% identity (78.4% similar) in 305 aa overlap (1-305:1-305)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MEAANESSEGISFVLLGLTTSPGQQRPLFVLFLLLYVASLLGNGLIVAAIQASPALHAPM
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CCDS35 METKNYSSSTSGFILLGLSSNPKLQKPLFAIFLIMYLLTAVGNVLIILAIYSDPRLHTPM
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 YFLLAHLSFADLCFASVTVPKMLANLLAHDHSISLAGCLTQMYFFFALGVTDSCLLAAMA
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CCDS35 YFFLSNLSFMDICFTTVIVPKMLVNFLSETKIISYVGCLIQMYFFMAFGNTDSYLLASMA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 YDCYVAIRHPLPYATRMSRAMCAALVGMAWLVSHVHSLLYILLMARLSFCASHQVPHFFC
: ::: .:: : . :. : .. . .::.:::. .:::.:::::::: . ::::
CCDS35 IDRLVAICNPLHYDVVMKPWHCLLMLLGSCSISHLHSLFRVLLMSRLSFCASHIIKHFFC
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 DHQPLLRLSCSDTHHIQLLIFTEGAAVVVTPFLLILASYGAIAAAVLQLPSASGRLRAVS
: ::.:.:::::: :....:: ::.::::: . :: : ..::..:::.:. .: :
CCDS35 DTQPVLKLSCSDTSSSQMVVMTETLAVIVTPFLCTIFSYLQIIVTVLRIPSAAGKWKAFS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 TCGSHLAVVSLFYGTVIAVYFQATSRREAEWGRVATVMYTVVTPMLNPIIYSLWNRDVQG
::::::.:: ::::.:: :::. : . :::::::::::::::::.:::: :.:..
CCDS35 TCGSHLTVVVLFYGSVIYVYFRPLSMYSVMKGRVATVMYTVVTPMLNPFIYSLRNKDMKR
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE0 ALRALLIGRRISASDS
.:. :
CCDS35 GLKKLRHRIYS
310
>>CCDS35130.2 OR1L6 gene_id:392390|Hs108|chr9 (311 aa)
initn: 1121 init1: 1098 opt: 1098 Z-score: 877.0 bits: 170.4 E(32554): 1.6e-42
Smith-Waterman score: 1098; 54.8% identity (78.7% similar) in 305 aa overlap (1-305:1-305)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MEAANESSEGISFVLLGLTTSPGQQRPLFVLFLLLYVASLLGNGLIVAAIQASPALHAPM
:: : :: .:.::::...: :.:::..::..:. . .:: ::. :: ..: ::.::
CCDS35 MEIKNYSSSTSGFILLGLSSNPQLQKPLFAIFLIMYLLAAVGNVLIIPAIYSDPRLHTPM
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 YFLLAHLSFADLCFASVTVPKMLANLLAHDHSISLAGCLTQMYFFFALGVTDSCLLAAMA
::.:..::: :.::..: :::::.:.:.. . :: .:::.:::::.:.: ::: :::.::
CCDS35 YFFLSNLSFMDICFTTVIVPKMLVNFLSETKVISYVGCLAQMYFFMAFGNTDSYLLASMA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 YDCYVAIRHPLPYATRMSRAMCAALVGMAWLVSHVHSLLYILLMARLSFCASHQVPHFFC
: ::: .:: : . :. : .. . .::.:::. .:::.:::::::: . ::::
CCDS35 IDRLVAICNPLHYDVVMKPRHCLLMLLGSCSISHLHSLFRVLLMSRLSFCASHIIKHFFC
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 DHQPLLRLSCSDTHHIQLLIFTEGAAVVVTPFLLILASYGAIAAAVLQLPSASGRLRAVS
: ::.:.:::::: :....:: ::.::::: :. :: : ..::..:::.:. .: :
CCDS35 DTQPVLKLSCSDTSSSQMVVMTETLAVIVTPFLCIIFSYLRIMVTVLRIPSAAGKWKAFS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 TCGSHLAVVSLFYGTVIAVYFQATSRREAEWGRVATVMYTVVTPMLNPIIYSLWNRDVQG
::::::..:.::::..: :::. : . ::::::::::::::::.:::: :.:..
CCDS35 TCGSHLTAVALFYGSIIYVYFRPLSMYSVVRDRVATVMYTVVTPMLNPFIYSLRNKDMKR
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE0 ALRALLIGRRISASDS
.:. :
CCDS35 GLKKLQDRIYR
310
>>CCDS32896.1 OR1M1 gene_id:125963|Hs108|chr19 (313 aa)
initn: 1049 init1: 1000 opt: 1039 Z-score: 831.2 bits: 162.0 E(32554): 5.6e-40
Smith-Waterman score: 1039; 51.6% identity (78.0% similar) in 314 aa overlap (1-314:1-312)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MEAANESSEGISFVLLGLTTSPGQQRPLFVLFLLLYVASLLGNGLIVAAIQASPALHAPM
:: :..: . .:.::::. .: :. :: ::. .:.. ..:: ::. ::. . ::.::
CCDS32 MEPRNQTSAS-QFILLGLSEKPEQETLLFSLFFCMYLVMVVGNLLIILAISIDSHLHTPM
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 YFLLAHLSFADLCFASVTVPKMLANLLAHDHSISLAGCLTQMYFFFALGVTDSCLLAAMA
::.::.::..:.:.:. :.::::..: . ...:: :: ::::: .:..:: ..: ::
CCDS32 YFFLANLSLVDFCLATNTIPKMLVSLQTGSKAISYPCCLIQMYFFHFFGIVDSVIIAMMA
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 YDCYVAIRHPLPYATRMSRAMCAALVGMAWLVSHVHSLLYILLMARLSFCASHQVPHFFC
:: .::: ::: :: :: .: ::: : : :: .::::::: ::.::.:::.::
CCDS32 YDRFVAICHPLHYAKIMSLRLCRLLVGALWAFSCFISLTHILLMARLVFCGSHEVPHYFC
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 DHQPLLRLSCSDTHHIQLLIFTEGAAVVVTPFLLILASYGAIAAAVLQLPSASGRLRAVS
: :.:::::.:: ...:. .. :..:::. :::::. : .:....:::.:: .: :
CCDS32 DLTPILRLSCTDTSVNRIFILIVAGMVIATPFVCILASYARILVAIMKVPSAGGRKKAFS
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 TCGSHLAVVSLFYGTVIAVYFQATSRREAEWGRVATVMYTVVTPMLNPIIYSLWNRDVQG
::.:::.::.:::::.:.::. .: . ....::::.:::::::.:::: :::..:
CCDS32 TCSSHLSVVALFYGTTIGVYLCPSSVLTTVKEKASAVMYTAVTPMLNPFIYSLRNRDLKG
240 250 260 270 280 290
310
pF1KE0 ALRALLIGRRISASDS
::: : ..:.:..:
CCDS32 ALRKL-VNRKITSSS
300 310
>>CCDS11024.1 OR1E1 gene_id:8387|Hs108|chr17 (314 aa)
initn: 1019 init1: 1019 opt: 1023 Z-score: 818.7 bits: 159.7 E(32554): 2.8e-39
Smith-Waterman score: 1023; 52.3% identity (78.8% similar) in 302 aa overlap (1-302:1-301)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MEAANESSEGISFVLLGLTTSPGQQRPLFVLFLLLYVASLLGNGLIVAAIQASPALHAPM
: . :..: . .:.:::: .: :: ..::: .:...:::: ::.. :. . ::.::
CCDS11 MMGQNQTSIS-DFLLLGLPIQPEQQNLCYALFLAMYLTTLLGNLLIIVLIRLDSHLHTPM
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 YFLLAHLSFADLCFASVTVPKMLANLLAHDHSISLAGCLTQMYFFFALGVTDSCLLAAMA
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