Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE0880
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0880, 309 aa
1>>>pF1KE0880 309 - 309 aa - 309 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6658+/-0.0014; mu= 13.8249+/- 0.081
mean_var=182.2262+/-62.428, 0's: 0 Z-trim(101.2): 430 B-trim: 323 in 1/48
Lambda= 0.095010
statistics sampled from 5901 (6433) to 5901 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.532), E-opt: 0.2 (0.198), width: 16
Scan time: 2.340
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS11022.1 OR1A1 gene_id:8383|Hs108|chr17 ( 309) 2003 287.9 6.6e-78
CCDS11021.1 OR1A2 gene_id:26189|Hs108|chr17 ( 309) 1699 246.2 2.3e-65
CCDS10496.1 OR1F1 gene_id:4992|Hs108|chr16 ( 312) 1127 167.9 9.3e-42
CCDS35127.2 OR1L1 gene_id:26737|Hs108|chr9 ( 310) 1084 162.0 5.5e-40
CCDS35121.1 OR1J2 gene_id:26740|Hs108|chr9 ( 313) 1074 160.6 1.4e-39
CCDS35122.1 OR1J4 gene_id:26219|Hs108|chr9 ( 313) 1074 160.6 1.4e-39
CCDS6844.1 OR1N1 gene_id:138883|Hs108|chr9 ( 311) 1056 158.1 7.9e-39
CCDS35130.2 OR1L6 gene_id:392390|Hs108|chr9 ( 311) 1052 157.6 1.2e-38
CCDS35120.1 OR1J1 gene_id:347168|Hs108|chr9 ( 322) 1052 157.6 1.2e-38
CCDS35129.1 OR1L4 gene_id:254973|Hs108|chr9 ( 311) 1041 156.1 3.3e-38
CCDS11024.1 OR1E1 gene_id:8387|Hs108|chr17 ( 314) 1041 156.1 3.3e-38
CCDS32896.1 OR1M1 gene_id:125963|Hs108|chr19 ( 313) 1036 155.4 5.3e-38
CCDS35123.1 OR1N2 gene_id:138882|Hs108|chr9 ( 330) 1031 154.7 8.8e-38
CCDS11019.1 OR1D2 gene_id:4991|Hs108|chr17 ( 312) 1026 154.0 1.4e-37
CCDS11020.1 OR1G1 gene_id:8390|Hs108|chr17 ( 313) 1015 152.5 3.9e-37
CCDS41481.1 OR1C1 gene_id:26188|Hs108|chr1 ( 314) 1013 152.2 4.7e-37
CCDS35124.1 OR1L8 gene_id:138881|Hs108|chr9 ( 309) 1002 150.7 1.3e-36
CCDS35128.1 OR1L3 gene_id:26735|Hs108|chr9 ( 324) 1001 150.6 1.5e-36
CCDS32937.1 OR1I1 gene_id:126370|Hs108|chr19 ( 355) 979 147.7 1.3e-35
CCDS58499.1 OR1D5 gene_id:8386|Hs108|chr17 ( 312) 971 146.5 2.5e-35
CCDS35132.1 OR1K1 gene_id:392392|Hs108|chr9 ( 316) 970 146.3 2.8e-35
CCDS31545.1 OR1S2 gene_id:219958|Hs108|chr11 ( 325) 970 146.4 2.9e-35
CCDS12320.1 OR7C2 gene_id:26658|Hs108|chr19 ( 319) 965 145.7 4.5e-35
CCDS32899.1 OR7G3 gene_id:390883|Hs108|chr19 ( 312) 960 145.0 7.2e-35
CCDS32900.1 OR7D2 gene_id:162998|Hs108|chr19 ( 312) 960 145.0 7.2e-35
CCDS12317.1 OR7C1 gene_id:26664|Hs108|chr19 ( 320) 944 142.8 3.4e-34
CCDS12319.1 OR7A17 gene_id:26333|Hs108|chr19 ( 309) 934 141.4 8.5e-34
CCDS32936.1 OR7A10 gene_id:390892|Hs108|chr19 ( 309) 928 140.6 1.5e-33
CCDS4657.1 OR5V1 gene_id:81696|Hs108|chr6 ( 321) 914 138.7 5.8e-33
CCDS32901.1 OR7D4 gene_id:125958|Hs108|chr19 ( 312) 909 138.0 9.2e-33
CCDS31534.1 OR5AP2 gene_id:338675|Hs108|chr11 ( 316) 903 137.2 1.6e-32
CCDS32897.1 OR7G2 gene_id:390882|Hs108|chr19 ( 345) 889 135.3 6.5e-32
CCDS4658.1 OR12D3 gene_id:81797|Hs108|chr6 ( 316) 884 134.6 1e-31
CCDS12318.1 OR7A5 gene_id:26659|Hs108|chr19 ( 319) 883 134.4 1.1e-31
CCDS31105.1 OR2M5 gene_id:127059|Hs108|chr1 ( 312) 882 134.3 1.2e-31
CCDS31524.1 OR5T3 gene_id:390154|Hs108|chr11 ( 340) 881 134.2 1.4e-31
CCDS31552.1 OR5B21 gene_id:219968|Hs108|chr11 ( 309) 877 133.6 1.9e-31
CCDS31106.1 OR2M2 gene_id:391194|Hs108|chr1 ( 347) 877 133.7 2e-31
CCDS31519.1 OR8H3 gene_id:390152|Hs108|chr11 ( 312) 875 133.3 2.3e-31
CCDS31525.1 OR5T1 gene_id:390155|Hs108|chr11 ( 326) 875 133.3 2.4e-31
CCDS35125.1 OR1Q1 gene_id:158131|Hs108|chr9 ( 314) 873 133.0 2.8e-31
CCDS31107.1 OR2M3 gene_id:127062|Hs108|chr1 ( 312) 871 132.8 3.4e-31
CCDS45955.1 OR7E24 gene_id:26648|Hs108|chr19 ( 339) 871 132.8 3.6e-31
CCDS30905.1 OR6N1 gene_id:128372|Hs108|chr1 ( 312) 870 132.6 3.7e-31
CCDS31104.1 OR2L3 gene_id:391192|Hs108|chr1 ( 312) 869 132.5 4.1e-31
CCDS31417.1 OR2D3 gene_id:120775|Hs108|chr11 ( 330) 868 132.4 4.7e-31
CCDS32042.1 OR5AU1 gene_id:390445|Hs108|chr14 ( 362) 868 132.4 4.9e-31
CCDS31526.1 OR8H1 gene_id:219469|Hs108|chr11 ( 311) 866 132.1 5.5e-31
CCDS31551.1 OR5B12 gene_id:390191|Hs108|chr11 ( 314) 862 131.5 8e-31
CCDS30899.1 OR6Y1 gene_id:391112|Hs108|chr1 ( 325) 862 131.6 8.2e-31
>>CCDS11022.1 OR1A1 gene_id:8383|Hs108|chr17 (309 aa)
initn: 2003 init1: 2003 opt: 2003 Z-score: 1512.1 bits: 287.9 E(32554): 6.6e-78
Smith-Waterman score: 2003; 99.7% identity (99.7% similar) in 309 aa overlap (1-309:1-309)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MRENNQSSTLEFILLGVTGQQEQEDFFYILFLFIYPITLIGNLLIVLAICSDVRLHNPMY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 MRENNQSSTLEFILLGVTGQQEQEDFFYILFLFIYPITLIGNLLIVLAICSDVRLHNPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 FLLANLSLVDIFFSSVTIPKMLANHLLGSKSISFGGCLTQMYFMIALGNTDSYILAAMAY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 FLLANLSLVDIFFSSVTIPKMLANHLLGSKSISFGGCLTQMYFMIALGNTDSYILAAMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 DRAVAISRPLHYTTIMSPRSCIWLIAGSWVIGNANALPHTLLTASLSFCGNQEVANFYCD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 DRAVAISRPLHYTTIMSPRSCIWLIAGSWVIGNANALPHTLLTASLSFCGNQEVANFYCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 ITPLLKLSCSDIHFHVKMMYLGVGIFSVPLLCIIVSYIRVFSTVFQVPSTKGVLKAFSTC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 ITPLLKLSCSDIHFHVKMMYLGVGIFSVPLLCIIVSYIRVFSTVFQVPSTKGVLKAFSTC
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 GSHLTVVSLYYGTVMGTYFRPLTNYSLKDAVITVMYTAVTPMLNSFIYSLRNRDMKAALR
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::
CCDS11 GSHLTVVSLYYGTVMGTYFRPLTNYSLKDAVITVMYTAVTPMLNPFIYSLRNRDMKAALR
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 KLFNKRISS
:::::::::
CCDS11 KLFNKRISS
>>CCDS11021.1 OR1A2 gene_id:26189|Hs108|chr17 (309 aa)
initn: 1699 init1: 1699 opt: 1699 Z-score: 1286.9 bits: 246.2 E(32554): 2.3e-65
Smith-Waterman score: 1699; 83.2% identity (94.5% similar) in 309 aa overlap (1-309:1-309)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MRENNQSSTLEFILLGVTGQQEQEDFFYILFLFIYPITLIGNLLIVLAICSDVRLHNPMY
:...::: .:.:::::::.::::.. :...:: :::::: :::::.::::.:.:::::::
CCDS11 MKKENQSFNLDFILLGVTSQQEQNNVFFVIFLCIYPITLTGNLLIILAICADIRLHNPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 FLLANLSLVDIFFSSVTIPKMLANHLLGSKSISFGGCLTQMYFMIALGNTDSYILAAMAY
:::::::::::.::::::::.::::::::: ::::::: ::::::::...::: ::::::
CCDS11 FLLANLSLVDIIFSSVTIPKVLANHLLGSKFISFGGCLMQMYFMIALAKADSYTLAAMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 DRAVAISRPLHYTTIMSPRSCIWLIAGSWVIGNANALPHTLLTASLSFCGNQEVANFYCD
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CCDS11 DRAVAISCPLHYTTIMSPRSCILLIAGSWVIGNTSALPHTLLTASLSFCGNQEVANFYCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 ITPLLKLSCSDIHFHVKMMYLGVGIFSVPLLCIIVSYIRVFSTVFQVPSTKGVLKAFSTC
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CCDS11 IMPLLKLSCSDVHFNVKMMYLGVGVFSLPLLCIIVSYVQVFSTVFQVPSTKSLFKAFCTC
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 GSHLTVVSLYYGTVMGTYFRPLTNYSLKDAVITVMYTAVTPMLNSFIYSLRNRDMKAALR
::::::: :::::.:: ::::::.:: :::::::::.:::: :: ::::::: ::::::.
CCDS11 GSHLTVVFLYYGTTMGMYFRPLTSYSPKDAVITVMYVAVTPALNPFIYSLRNWDMKAALQ
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 KLFNKRISS
:::.:::::
CCDS11 KLFSKRISS
>>CCDS10496.1 OR1F1 gene_id:4992|Hs108|chr16 (312 aa)
initn: 1164 init1: 738 opt: 1127 Z-score: 863.2 bits: 167.9 E(32554): 9.3e-42
Smith-Waterman score: 1127; 53.4% identity (82.6% similar) in 311 aa overlap (1-309:1-311)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MRENNQSSTLEFILLGVTGQQEQEDFFYILFLFIYPITLIGNLLIVLAICSDVRLHNPMY
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CCDS10 MSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILSVSIDSCLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 FLLANLSLVDIFFSSVTIPKMLANHLLGSKSISFGGCLTQMYFMIALGNTDSYILAAMAY
:.:.:::.::: :: .:.:::::::.: ...::: ::::::::.. . . :...::.:::
CCDS10 FFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMFVDMDNFLLAVMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 DRAVAISRPLHYTTIMSPRSCIWLIAGSWVIGNANALPHTLLTASLSFCGNQEVANFYCD
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CCDS10 DHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFCADNAITHFFCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230
pF1KE0 ITPLLKLSCSDIHFH-VKMMYLGVGIFSVPLLCIIVSYIRVFSTVFQVPSTKGVLKAFST
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CCDS10 VTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKVPSTKGRWKAFST
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 CGSHLTVVSLYYGTVMGTYFRPLTNYSL-KDAVITVMYTAVTPMLNSFIYSLRNRDMKAA
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CCDS10 CGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFIYSLRNRYLKGA
250 260 270 280 290 300
300
pF1KE0 LRKLFNKRISS
:.:. .. . :
CCDS10 LKKVVGRVVFSV
310
>>CCDS35127.2 OR1L1 gene_id:26737|Hs108|chr9 (310 aa)
initn: 1053 init1: 659 opt: 1084 Z-score: 831.3 bits: 162.0 E(32554): 5.5e-40
Smith-Waterman score: 1084; 53.7% identity (80.5% similar) in 307 aa overlap (1-305:1-306)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MRENNQSSTLEFILLGVTGQQEQEDFFYILFLFIYPITLIGNLLIVLAICSDVRLHNPMY
: .:: . ::::::.... :.. .. .:: :: ::.::::::.::: ::.::..:::
CCDS35 MGRNNLTRPSEFILLGLSSRPEDQKPLFAVFLPIYLITVIGNLLIILAIRSDTRLQTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 FLLANLSLVDIFFSSVTIPKMLANHLLGSKSISFGGCLTQMYFMIALGNTDSYILAAMAY
:.:. ::.::: . .: :::::.: : .:.::.. :::::::..:.::::::.:::::
CCDS35 FFLSILSFVDICYVTVIIPKMLVNFLSETKTISYSECLTQMYFFLAFGNTDSYLLAAMAI
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 DRAVAISRPLHYTTIMSPRSCIWLIAGSWVIGNANALPHTLLTASLSFCGNQEVANFYCD
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CCDS35 DRYVAICNPFHYITIMSHRCCVLLLVLSFCIPHFHSLLHILLTNQLIFCASNVIHHFFCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230
pF1KE0 ITPLLKLSCSDIHF--HVKMMYLGVGIFSVPLLCIIVSYIRVFSTVFQVPSTKGVLKAFS
:.::::::. :: .. .: :.... .:. :::.::.:.. ::...::. : ::::
CCDS35 DQPVLKLSCSS-HFVKEITVMTEGLAVIMTPFSCIIISYLRILITVLKIPSAAGKRKAFS
190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 TCGSHLTVVSLYYGTVMGTYFRPLTNYSLKDAVITVMYTAVTPMLNSFIYSLRNRDMKAA
:::::::::.:.::.. ::.::.::..:: . :..::..::::: :::::::.::: .
CCDS35 TCGSHLTVVTLFYGSISYLYFQPLSNYTVKDQIATIIYTVLTPMLNPFIYSLRNKDMKQG
240 250 260 270 280 290
300
pF1KE0 LRKLFNKRISS
: ::...
CCDS35 LAKLMHRMKCQ
300 310
>>CCDS35121.1 OR1J2 gene_id:26740|Hs108|chr9 (313 aa)
initn: 1112 init1: 645 opt: 1074 Z-score: 823.9 bits: 160.6 E(32554): 1.4e-39
Smith-Waterman score: 1074; 52.4% identity (80.1% similar) in 307 aa overlap (1-305:1-307)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MRENNQSSTLEFILLGVTGQQEQEDFFYILFLFIYPITLIGNLLIVLAICSDVRLHNPMY
: .::::. ::.:::. . ::. :. ::: .: :..:::::.: : : .::.:::
CCDS35 MSPENQSSVSEFLLLGLPIRPEQQAVFFTLFLGMYLTTVLGNLLIMLLIQLDSHLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 FLLANLSLVDIFFSSVTIPKMLANHLLGSKSISFGGCLTQMYFMIALGNTDSYILAAMAY
:.:..:.:.:: :::::.:::: . ::: . :..::::.: . . ::.....:::
CCDS35 FFLSHLALTDISFSSVTVPKMLMDMRTKYKSILYEECISQMYFFIFFTDLDSFLITSMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 DRAVAISRPLHYTTIMSPRSCIWLIAGSWVIGNANALPHTLLTASLSFCGNQEVANFYCD
:: ::: .:::::.:: . :..:.: ::... :..: :::: . ::::. . . . .::
CCDS35 DRYVAICHPLHYTVIMREELCVFLVAVSWILSCASSLSHTLLLTRLSFCAANTIPHVFCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230
pF1KE0 ITPLLKLSCSDIHFHVKMMY-LGVGIFSVPLLCIIVSYIRVFSTVFQVPSTKGVLKAFST
.. ::::::::: .. .:. .:: ....:..::.::: . .:...::::::. ::.::
CCDS35 LAALLKLSCSDIFLNELVMFTVGVVVITLPFMCILVSYGYIGATILRVPSTKGIHKALST
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 CGSHLTVVSLYYGTVMGTYFRPLTNYSL-KDAVITVMYTAVTPMLNSFIYSLRNRDMKAA
:::::.:::::::...: :. : .. :. ::.....:::.:::::: ::::::::::: :
CCDS35 CGSHLSVVSLYYGSIFGQYLFPTVSSSIDKDVIVALMYTVVTPMLNPFIYSLRNRDMKEA
250 260 270 280 290 300
300
pF1KE0 LRKLFNKRISS
: :::..
CCDS35 LGKLFSRATFFSW
310
>>CCDS35122.1 OR1J4 gene_id:26219|Hs108|chr9 (313 aa)
initn: 1078 init1: 644 opt: 1074 Z-score: 823.9 bits: 160.6 E(32554): 1.4e-39
Smith-Waterman score: 1074; 51.8% identity (82.1% similar) in 307 aa overlap (1-305:1-307)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MRENNQSSTLEFILLGVTGQQEQEDFFYILFLFIYPITLIGNLLIVLAICSDVRLHNPMY
:...::::. ::.:: . ::. :. ::: .: ::..:::::.: : : .::.::.
CCDS35 MKRENQSSVSEFLLLDLPIWPEQQAVFFTLFLGMYLITVLGNLLIILLIRLDSHLHTPMF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 FLLANLSLVDIFFSSVTIPKMLANHLLGSKSISFGGCLTQMYFMIALGNTDSYILAAMAY
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300
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CCDS68 LKRLFSHRSIVSS
300 310
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CCDS35 GLKKL-RHRIYS
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]