Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE0877
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0877, 319 aa
1>>>pF1KE0877 319 - 319 aa - 319 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.9512+/-0.00154; mu= 12.6100+/- 0.089
mean_var=184.0604+/-59.530, 0's: 0 Z-trim(100.1): 399 B-trim: 375 in 1/45
Lambda= 0.094535
statistics sampled from 5496 (5970) to 5496 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.507), E-opt: 0.2 (0.183), width: 16
Scan time: 2.340
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS35087.1 OR13F1 gene_id:138805|Hs108|chr9 ( 319) 2046 292.6 2.8e-79
CCDS6778.1 OR2K2 gene_id:26248|Hs108|chr9 ( 316) 1305 191.5 7.4e-49
CCDS35094.1 OR13D1 gene_id:286365|Hs108|chr9 ( 346) 1182 174.8 8.8e-44
CCDS35092.1 OR13C2 gene_id:392376|Hs108|chr9 ( 318) 1118 166.0 3.5e-41
CCDS35093.1 OR13C9 gene_id:286362|Hs108|chr9 ( 318) 1115 165.6 4.7e-41
CCDS35089.1 OR13C3 gene_id:138803|Hs108|chr9 ( 347) 1097 163.2 2.7e-40
CCDS35091.1 OR13C5 gene_id:138799|Hs108|chr9 ( 318) 1083 161.2 9.7e-40
CCDS35090.1 OR13C8 gene_id:138802|Hs108|chr9 ( 320) 1081 161.0 1.2e-39
CCDS35088.1 OR13C4 gene_id:138804|Hs108|chr9 ( 318) 1062 158.4 7.1e-39
CCDS31093.1 OR2G3 gene_id:81469|Hs108|chr1 ( 309) 1043 155.7 4.2e-38
CCDS6596.2 OR2S2 gene_id:56656|Hs108|chr9 ( 319) 1032 154.3 1.2e-37
CCDS35011.1 OR13J1 gene_id:392309|Hs108|chr9 ( 312) 1028 153.7 1.7e-37
CCDS31119.1 OR2G6 gene_id:391211|Hs108|chr1 ( 316) 987 148.1 8.5e-36
CCDS4641.1 OR2B2 gene_id:81697|Hs108|chr6 ( 357) 985 147.9 1.1e-35
CCDS1634.2 OR2C3 gene_id:81472|Hs108|chr1 ( 320) 981 147.3 1.5e-35
CCDS43433.1 OR2J3 gene_id:442186|Hs108|chr6 ( 311) 978 146.9 2e-35
CCDS43434.1 OR2J2 gene_id:26707|Hs108|chr6 ( 312) 964 145.0 7.4e-35
CCDS31815.1 OR10A7 gene_id:121364|Hs108|chr12 ( 316) 963 144.8 8.2e-35
CCDS4642.1 OR2B6 gene_id:26212|Hs108|chr6 ( 313) 949 142.9 3.1e-34
CCDS43673.1 OR2A1 gene_id:346528|Hs108|chr7 ( 310) 947 142.7 3.7e-34
CCDS56515.1 OR2A42 gene_id:402317|Hs108|chr7 ( 310) 947 142.7 3.7e-34
CCDS43670.1 OR2A12 gene_id:346525|Hs108|chr7 ( 310) 947 142.7 3.7e-34
CCDS7774.1 OR10A4 gene_id:283297|Hs108|chr11 ( 315) 947 142.7 3.7e-34
CCDS31560.1 OR5A2 gene_id:219981|Hs108|chr11 ( 324) 943 142.1 5.5e-34
CCDS31417.1 OR2D3 gene_id:120775|Hs108|chr11 ( 330) 941 141.9 6.7e-34
CCDS34358.1 OR2B3 gene_id:442184|Hs108|chr6 ( 313) 935 141.0 1.1e-33
CCDS43668.1 OR2A5 gene_id:393046|Hs108|chr7 ( 311) 934 140.9 1.3e-33
CCDS34365.1 OR2H2 gene_id:7932|Hs108|chr6 ( 312) 932 140.6 1.5e-33
CCDS43669.1 OR2A25 gene_id:392138|Hs108|chr7 ( 310) 930 140.3 1.8e-33
CCDS34364.1 OR10C1 gene_id:442194|Hs108|chr6 ( 312) 924 139.5 3.2e-33
CCDS30899.1 OR6Y1 gene_id:391112|Hs108|chr1 ( 325) 924 139.5 3.3e-33
CCDS7773.1 OR10A5 gene_id:144124|Hs108|chr11 ( 317) 922 139.3 3.9e-33
CCDS35396.1 OR13H1 gene_id:347468|Hs108|chrX ( 308) 921 139.1 4.3e-33
CCDS31516.1 OR5AS1 gene_id:219447|Hs108|chr11 ( 324) 920 139.0 4.8e-33
CCDS4656.1 OR2W1 gene_id:26692|Hs108|chr6 ( 320) 919 138.9 5.3e-33
CCDS31416.1 OR2D2 gene_id:120776|Hs108|chr11 ( 308) 917 138.6 6.2e-33
CCDS31090.1 OR2B11 gene_id:127623|Hs108|chr1 ( 317) 916 138.4 7e-33
CCDS30905.1 OR6N1 gene_id:128372|Hs108|chr1 ( 312) 915 138.3 7.6e-33
CCDS4657.1 OR5V1 gene_id:81696|Hs108|chr6 ( 321) 915 138.3 7.7e-33
CCDS1185.1 OR10J1 gene_id:26476|Hs108|chr1 ( 320) 914 138.2 8.5e-33
CCDS4461.1 OR2V2 gene_id:285659|Hs108|chr5 ( 315) 911 137.8 1.1e-32
CCDS31561.1 OR5A1 gene_id:219982|Hs108|chr11 ( 315) 909 137.5 1.3e-32
CCDS31415.1 OR10A2 gene_id:341276|Hs108|chr11 ( 303) 906 137.0 1.7e-32
CCDS12333.1 OR10H2 gene_id:26538|Hs108|chr19 ( 315) 905 136.9 2e-32
CCDS31098.1 OR11L1 gene_id:391189|Hs108|chr1 ( 322) 905 137.0 2e-32
CCDS58992.1 OR2V1 gene_id:26693|Hs108|chr5 ( 315) 902 136.5 2.6e-32
CCDS31565.1 OR10V1 gene_id:390201|Hs108|chr11 ( 309) 899 136.1 3.4e-32
CCDS31711.1 OR8B12 gene_id:219858|Hs108|chr11 ( 310) 899 136.1 3.4e-32
CCDS31559.1 OR5AN1 gene_id:390195|Hs108|chr11 ( 311) 895 135.6 5e-32
CCDS7772.1 OR6A2 gene_id:8590|Hs108|chr11 ( 327) 895 135.6 5.2e-32
>>CCDS35087.1 OR13F1 gene_id:138805|Hs108|chr9 (319 aa)
initn: 2046 init1: 2046 opt: 2046 Z-score: 1536.7 bits: 292.6 E(32554): 2.8e-79
Smith-Waterman score: 2046; 98.7% identity (99.4% similar) in 319 aa overlap (1-319:1-319)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MFPANWTSVKVFFFLGFSHYPKVQVIIFAVCLLMYLITLLGNIFLISITILDSHLHTPMY
::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 MFPANWTSVKVFFFLGFFHYPKVQVIIFAVCLLMYLITLLGNIFLISITILDSHLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 LFLSNLSFLDIWYSSSALSPMLANFVSGRNTISFSGCATQVYLSLAMGSTECVLLPMMAY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::
CCDS35 LFLSNLSFLDIWYSSSALSPMLANFVSGRNTISFSGCATQMYLSLAMGSTECVLLPMMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 DRYVAICNPLRYPIIMNRRTCVQIAAGSWMTGCLTAMVEMMSVLPLSLCGNSIINHFTCE
:::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 DRYVAICNPLRYPVIMNRRTCVQIAAGSWMTGCLTAMVEMMSVLPLSLCGNSIINHFTCE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 ILAILKLVCVDTSLVQLIMLVISVLLLPMPMLLICISYAFILASILRISSVEGRSKAFST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 ILAILKLVCVDTSLVQLIMLVISVLLLPMPMLLICISYAFILASILRISSVEGRSKAFST
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 CTAHLMVVVLFYGMALSMHLKPSAVDSQEIDKFMALVYAGQTPMLNPIIYSLRNKEVKVA
::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 CTAHLMVVVLFYGTALSMHLKPSAVDSQEIDKFMALVYAGQTPMLNPIIYSLRNKEVKVA
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE0 LKKLLIRNHFNTAFISILK
:::::::::::::::::::
CCDS35 LKKLLIRNHFNTAFISILK
310
>>CCDS6778.1 OR2K2 gene_id:26248|Hs108|chr9 (316 aa)
initn: 714 init1: 692 opt: 1305 Z-score: 990.6 bits: 191.5 E(32554): 7.4e-49
Smith-Waterman score: 1305; 65.4% identity (88.7% similar) in 301 aa overlap (5-305:5-304)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MFPANWTSVKVFFFLGFSHYPKVQVIIFAVCLLMYLITLLGNIFLISITILDSHLHTPMY
:.: ..::. :::.:: ..:..:. :.::: ::::: :: ::::::.:.::::
CCDS67 MQGENFTIWSIFFLEGFSQYPGLEVVLFVFSLVMYLTTLLGNSTLILITILDSRLKTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 LFLSNLSFLDIWYSSSALSPMLANFVSGRNTISFSGCATQVYLSLAMGSTECVLLPMMAY
:::.::::.:: :.:... .:.:..:...:: :::::.:.:::::::::::::: .:::
CCDS67 LFLGNLSFMDICYTSASVPTLLVNLLSSQKTIIFSGCAVQMYLSLAMGSTECVLLAVMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 DRYVAICNPLRYPIIMNRRTCVQIAAGSWMTGCLTAMVEMMSVLPLSLCGNSIINHFTCE
:::::::::::: ::::: .:...:. ::.::::::..: .: . :::: .:.:::::
CCDS67 DRYVAICNPLRYSIIMNRCVCARMATVSWVTGCLTALLETSFALQIPLCGN-LIDHFTCE
130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 ILAILKLVCVDTSLVQLIMLVISVLLLPMPMLLICISYAFILASILRISSVEGRSKAFST
:::.:::.:... :.. ::::.:.::::.::::.:::: :::..::::.:.:::.:::::
CCDS67 ILAVLKLACTSSLLMNTIMLVVSILLLPIPMLLVCISYIFILSTILRITSAEGRNKAFST
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 CTAHLMVVVLFYGMALSMHLKPSAVDSQEIDKFMALVYAGQTPMLNPIIYSLRNKEVKVA
: ::: ::.:.:: ::::.::::. ..:.:::...:.:. ::::::::::::::::: :
CCDS67 CGAHLTVVILYYGAALSMYLKPSSSNAQKIDKIISLLYGVLTPMLNPIIYSLRNKEVKDA
240 250 260 270 280 290
310
pF1KE0 LKKLLIRNHFNTAFISILK
.::::
CCDS67 MKKLLGKITLHQTHEHL
300 310
>>CCDS35094.1 OR13D1 gene_id:286365|Hs108|chr9 (346 aa)
initn: 1192 init1: 1172 opt: 1182 Z-score: 899.5 bits: 174.8 E(32554): 8.8e-44
Smith-Waterman score: 1182; 58.1% identity (83.4% similar) in 308 aa overlap (1-308:33-340)
10 20 30
pF1KE0 MFPANWTSVKVFFFLGFSHYPKVQVIIFAV
: :.... ::..:.:.::..:...: .
CCDS35 RFTDFDVSNISIYLNHVLFYTTQQAGDLEHMETRNYSAMTEFFLVGLSQYPELQLFLFLL
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KE0 CLLMYLITLLGNIFLISITILDSHLHTPMYLFLSNLSFLDIWYSSSALSPMLANFVSGRN
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CCDS35 CLIMYMIILLGNSLLIIITILDSRLHTPMYFFLGNLSFLDICYTSSSIPPMLIIFMSERK
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KE0 TISFSGCATQVYLSLAMGSTECVLLPMMAYDRYVAICNPLRYPIIMNRRTCVQIAAGSWM
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CCDS35 SISFIGCALQMVVSLGLGSTECVLLAVMAYDHYVAICNPLRYSIIMNGVLYVQMAAWSWI
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KE0 TGCLTAMVEMMSVLPLSLCGNSIINHFTCEILAILKLVCVDTSLVQLIMLVISVLLLPMP
::::.... . .. : .:::..:.:.::::::.::::: : .. ::: : ... : .
CCDS35 IGCLTSLLQTVLTMMLPFCGNNVIDHITCEILALLKLVCSDITINVLIMTVTNIVSLVIL
190 200 210 220 230 240
220 230 240 250 260 270
pF1KE0 MLLICISYAFILASILRISSVEGRSKAFSTCTAHLMVVVLFYGMALSMHLKPSAVDSQEI
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CCDS35 LLLIFISYVFILSSILRINCAEGRKKAFSTCSAHSIVVILFYGSALFMYMKPKSKNTNTS
250 260 270 280 290 300
280 290 300 310
pF1KE0 DKFMALVYAGQTPMLNPIIYSLRNKEVKVALKKLLIRNHFNTAFISILK
:....: :. .:::::::::::::::: :.::.: :.
CCDS35 DEIIGLSYGVVSPMLNPIIYSLRNKEVKEAVKKVLSRHLHLLKM
310 320 330 340
>>CCDS35092.1 OR13C2 gene_id:392376|Hs108|chr9 (318 aa)
initn: 1156 init1: 985 opt: 1118 Z-score: 852.7 bits: 166.0 E(32554): 3.5e-41
Smith-Waterman score: 1118; 54.0% identity (82.7% similar) in 313 aa overlap (5-311:5-317)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MFPANWTSVKVFFFLGFSHYPKVQVIIFAVCLLMYLITLLGNIFLISITILDSHLHTPMY
: : . ::. :.: .:......:.. ..::.. :::: :: :.::: :::::::
CCDS35 MEWENHTILVEFFLKGLSGHPRLELLFFVLIFIMYVVILLGNGTLILISILDPHLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 LFLSNLSFLDIWYSSSALSPMLANFVSGRNTISFSGCATQVYLSLAMGSTECVLLPMMAY
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CCDS35 FFLGNLSFLDICYTTTSIPSTLVSFLSERKTISLSGCAVQMFLGLAMGTTECVLLGMMAF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 DRYVAICNPLRYPIIMNRRTCVQIAAGSWMTGCLTAMVEMMSVLPLSLCGNSIINHFTCE
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CCDS35 DRYVAICNPLRYPIIMSKDAYVPMAAGSWIIGAVNSAVQSVFVVQLPFCRNNIINHFTCE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 ILAILKLVCVDTSLVQLIMLVISVLLLPMPMLLICISYAFILASILRISSVEGRSKAFST
:::..::.:.: : ..:::: ..:.. :.::: .::..:..::..::: :::::: ::
CCDS35 ILAVMKLACADISDNEFIMLVATTLFILTPLLLIIVSYTLIIVSIFKISSSEGRSKASST
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290
pF1KE0 CTAHLMVVVLFYGMALSMHLKPSA---VDSQEID---KFMALVYAGQTPMLNPIIYSLRN
:.::: ::..::: : :..::.. ..:...: :.... :. .:::.::.::::::
CCDS35 CSAHLTVVIIFYGTILFMYMKPKSKETLNSDDLDATDKIISMFYGVMTPMMNPLIYSLRN
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KE0 KEVKVALKKLLIRNHFNTAFISILK
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CCDS35 KDVKEAVKHLLNRRFFSK
310
>>CCDS35093.1 OR13C9 gene_id:286362|Hs108|chr9 (318 aa)
initn: 1160 init1: 989 opt: 1115 Z-score: 850.5 bits: 165.6 E(32554): 4.7e-41
Smith-Waterman score: 1115; 53.4% identity (82.1% similar) in 313 aa overlap (5-311:5-317)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MFPANWTSVKVFFFLGFSHYPKVQVIIFAVCLLMYLITLLGNIFLISITILDSHLHTPMY
: : . ::. : : .:......:.. ..::.. :::: :: :.::: :::::::
CCDS35 MEWENQTILVEFFLKGHSVHPRLELLFFVLIFIMYVVILLGNGTLILISILDPHLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 LFLSNLSFLDIWYSSSALSPMLANFVSGRNTISFSGCATQVYLSLAMGSTECVLLPMMAY
.::.::::::: :..... :..:.: :.::::::::.:..:.::::.:::::: :::.
CCDS35 FFLGNLSFLDICYTTTSIPSTLVSFLSERKTISFSGCAVQMFLGLAMGTTECVLLGMMAF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 DRYVAICNPLRYPIIMNRRTCVQIAAGSWMTGCLTAMVEMMSVLPLSLCGNSIINHFTCE
::::::::::::::::.. . : .:.:::..: ... :. :. : .: ...::::.::
CCDS35 DRYVAICNPLRYPIIMSKNAYVPMAVGSWFAGIVNSAVQTTFVVQLPFCRKNVINHFSCE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 ILAILKLVCVDTSLVQLIMLVISVLLLPMPMLLICISYAFILASILRISSVEGRSKAFST
:::..::.:.: : ...::: ..:. ::.::: :::..:..:::.: : :::::::::
CCDS35 ILAVMKLACADISGNEFLMLVATILFTLMPLLLIVISYSLIISSILKIHSSEGRSKAFST
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290
pF1KE0 CTAHLMVVVLFYGMALSMHLKPSA---VDSQEID---KFMALVYAGQTPMLNPIIYSLRN
:.::: ::..::: : :..::.. ..:...: :.... :. .:::.::.::::::
CCDS35 CSAHLTVVIIFYGTILFMYMKPKSKETLNSDDLDATDKIISMFYGVMTPMMNPLIYSLRN
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KE0 KEVKVALKKLLIRNHFNTAFISILK
:.:: :.:.: : :.
CCDS35 KDVKEAVKHLPNRRFFSK
310
>>CCDS35089.1 OR13C3 gene_id:138803|Hs108|chr9 (347 aa)
initn: 974 init1: 974 opt: 1097 Z-score: 836.9 bits: 163.2 E(32554): 2.7e-40
Smith-Waterman score: 1097; 52.4% identity (80.4% similar) in 311 aa overlap (1-305:31-341)
10 20 30
pF1KE0 MFPANWTSVKVFFFLGFSHYPKVQVIIFAV
: : : :. :..::.: :::.... ::.
CCDS35 MIVQLICTVCFLAVNTFHVRSSFDFLKADDMGEINQTLVSEFLLLGLSGYPKIEIVYFAL
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KE0 CLLMYLITLLGNIFLISITILDSHLHTPMYLFLSNLSFLDIWYSSSALSPMLANFVSGRN
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100 110 120 130 140 150
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CCDS35 NISFSGCAVQMFFGFAMGSTECLLLGMMAFDRYVAICNPLRYPIILSKVAYVLMASVSWL
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160 170 180 190 200 210
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220 230 240 250 260
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...: .:: ::: .::...:. :: ::::::.::: ::..::: . :. ::.. :
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270 280 290 300 310
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310 320 330 340
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310
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CCDS35 CSAHLTVVIIFYGTIFFMYAKPESKASVDSGNEDIIEALISLFYGVMTPMLNPLIYSLRN
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310 320
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]