Result of FASTA (omim) for
pFN21AE0874
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0874, 318 aa
1>>>pF1KE0874 318 - 318 aa - 318 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.7373+/-0.000529; mu= 19.2970+/- 0.033
mean_var=98.6862+/-25.857, 0's: 0 Z-trim(106.7): 340 B-trim: 914 in 1/48
Lambda= 0.129106
statistics sampled from 14327 (14772) to 14327 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.511), E-opt: 0.2 (0.173), width: 16
Scan time: 5.880
The best scores are: opt bits E(85289)
XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 983 194.4 2.6e-49
NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [H ( 317) 983 194.4 2.6e-49
XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 983 194.4 2.6e-49
NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [H ( 314) 965 191.0 2.6e-48
NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory recep ( 311) 962 190.5 3.9e-48
NP_009091 (OMIM: 600578) olfactory receptor 2H2 [H ( 312) 958 189.7 6.5e-48
NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [H ( 308) 939 186.2 7.5e-47
XP_011513214 (OMIM: 600578) PREDICTED: olfactory r ( 300) 937 185.8 9.5e-47
NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [H ( 314) 928 184.2 3.1e-46
NP_001001957 (OMIM: 616729) olfactory receptor 2W3 ( 314) 905 179.9 6.1e-45
NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [ ( 317) 881 175.4 1.4e-43
NP_003687 (OMIM: 608495) olfactory receptor 6A2 [H ( 327) 863 172.1 1.4e-42
NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [H ( 312) 858 171.1 2.6e-42
XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 312) 858 171.1 2.6e-42
XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 322) 858 171.1 2.7e-42
NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN ( 311) 853 170.2 5e-42
NP_001005191 (OMIM: 611538) olfactory receptor 7D4 ( 312) 810 162.2 1.3e-39
NP_001005487 (OMIM: 611677) olfactory receptor 13G ( 307) 774 155.5 1.3e-37
NP_002539 (OMIM: 164342) olfactory receptor 1D2 [H ( 312) 772 155.1 1.7e-37
NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C4 ( 309) 661 134.4 2.9e-31
NP_689643 (OMIM: 611267) olfactory receptor 51E1 [ ( 318) 580 119.3 1e-26
NP_110401 (OMIM: 611268) olfactory receptor 51E2 [ ( 320) 530 110.0 6.5e-24
NP_000721 (OMIM: 118444) cholecystokinin receptor ( 428) 227 53.8 7.6e-07
NP_001699 (OMIM: 190900,613522) short-wave-sensiti ( 348) 212 50.8 4.7e-06
NP_000530 (OMIM: 136880,180380,610445,613731) rhod ( 348) 211 50.7 5.3e-06
NP_001718 (OMIM: 300107) bombesin receptor subtype ( 399) 209 50.4 7.5e-06
NP_000903 (OMIM: 165196) kappa-type opioid recepto ( 380) 208 50.2 8.2e-06
NP_001305426 (OMIM: 165196) kappa-type opioid rece ( 409) 208 50.2 8.6e-06
NP_004239 (OMIM: 600895) prolactin-releasing pepti ( 370) 205 49.6 1.2e-05
NP_001517 (OMIM: 602393) orexin receptor type 2 [H ( 444) 204 49.5 1.5e-05
XP_016866287 (OMIM: 602393) PREDICTED: orexin rece ( 461) 204 49.5 1.6e-05
NP_444264 (OMIM: 607449) neuropeptide FF receptor ( 420) 199 48.5 2.8e-05
NP_001138228 (OMIM: 607449) neuropeptide FF recept ( 423) 199 48.5 2.8e-05
NP_004876 (OMIM: 607449) neuropeptide FF receptor ( 522) 199 48.7 3.2e-05
NP_071640 (OMIM: 142703) histamine H2 receptor iso ( 359) 192 47.1 6.3e-05
XP_006714928 (OMIM: 142703) PREDICTED: histamine H ( 362) 192 47.1 6.3e-05
NP_001124527 (OMIM: 142703) histamine H2 receptor ( 397) 192 47.2 6.7e-05
XP_006714927 (OMIM: 142703) PREDICTED: histamine H ( 422) 192 47.2 6.9e-05
XP_016864915 (OMIM: 142703) PREDICTED: histamine H ( 422) 192 47.2 6.9e-05
XP_005265961 (OMIM: 142703) PREDICTED: histamine H ( 422) 192 47.2 6.9e-05
XP_011532851 (OMIM: 142703) PREDICTED: histamine H ( 422) 192 47.2 6.9e-05
XP_011532850 (OMIM: 142703) PREDICTED: histamine H ( 422) 192 47.2 6.9e-05
NP_778237 (OMIM: 608923) trace amine-associated re ( 345) 190 46.7 7.9e-05
NP_859528 (OMIM: 609042) opsin-5 [Homo sapiens] ( 354) 189 46.6 9.2e-05
XP_016865905 (OMIM: 609042) PREDICTED: opsin-5 iso ( 408) 189 46.7 0.0001
NP_000016 (OMIM: 109691,601665) beta-3 adrenergic ( 408) 186 46.1 0.00015
NP_057624 (OMIM: 605569) probable G-protein couple ( 423) 185 45.9 0.00017
NP_150598 (OMIM: 606665) melanopsin isoform 1 [Hom ( 478) 185 46.0 0.00018
XP_016872445 (OMIM: 606665) PREDICTED: melanopsin ( 528) 185 46.1 0.0002
NP_064552 (OMIM: 605108) neuromedin-U receptor 2 [ ( 415) 183 45.5 0.00022
>>XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory recep (317 aa)
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>>NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [Homo (317 aa)
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NP_036 CASHLTVVALCYGVAIFTYIQPHSSPSV------LQEKLFSVFYAILTPMLNPMIYSLRN
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pF1KE0 KDVKEAVKHLLNRRFFSK
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NP_036 KEVKGAWQKLLWKFSGLTSKLAT
300 310
>>XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory recep (317 aa)
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Smith-Waterman score: 983; 46.9% identity (78.8% similar) in 311 aa overlap (1-311:1-305)
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pF1KE0 MEWENHTILVEFFLKGLSGHPRLELLFFVLIFIMYVVILLGNGTLILISILDPHLHTPMY
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pF1KE0 ILAVMKLACADISDNEFIMLVATTLFILTPLLLIIVSYTLIIVSIFKISSSEGRSKASST
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pF1KE0 CSAHLTVVIIFYGTILFMYMKPKSKETLNSDDLDATDKIISMFYGVMTPMMNPLIYSLRN
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XP_011 CASHLTVVALCYGVAIFTYIQPHSSPSV------LQEKLFSVFYAILTPMLNPMIYSLRN
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pF1KE0 KDVKEAVKHLLNRRFFSK
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XP_011 KEVKGAWQKLLWKFSGLTSKLAT
300 310
>>NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [Homo (314 aa)
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Smith-Waterman score: 965; 44.9% identity (78.0% similar) in 314 aa overlap (1-314:1-308)
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pF1KE0 MEWENHTILVEFFLKGLSGHPRLELLFFVLIFIMYVVILLGNGTLILISILDPHLHTPMY
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pF1KE0 FFLGNLSFLDICYTTTSIPSTLVSFLSERKTISLSGCAVQMFLGLAMGTTECVLLGMMAF
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pF1KE0 DRYVAICNPLRYPIIMSKDAYVPMAAGSWIIGAVNSAVQSVFVVQLPFCRNNIINHFTCE
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pF1KE0 ILAVMKLACADISDNEFIMLVATTLFILTPLLLIIVSYTLIIVSIFKISSSEGRSKASST
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NP_003 SPPLFKLSCSDTILKESISSILAGVNIVGTLLVILSSYSYVLFSIFSMHSGEGRHRAFST
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NP_003 CASHLTAIILFYATCIYTYLRPSSSYSLNQD------KVASVFYTVVIPMLNPLIYSLRS
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pF1KE0 KDVKEAVKHLLNRRFFSK
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NP_003 KEVKKALANVISRKRTSSFL
300 310
>>NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory receptor (311 aa)
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pF1KE0 TCEILAVMKLACADISDNEFIMLVATTLFILTPLLLIIVSYTLIIVSIFKISSSEGRSKA
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NP_001 FCEVPALLRLSCVDTHVNELTLMITSSIFVLIPLILILTSYGAIVRAILRMQSTTGLQKV
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NP_001 LRNKVVRGAVKRLMGWE
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>>NP_009091 (OMIM: 600578) olfactory receptor 2H2 [Homo (312 aa)
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pF1KE0 MEWENHTILVEFFLKGLSGHPRLELLFFVLIFIMYVVILLGNGTLILISILDPHLHTPMY
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NP_009 MVNQSSTPGFLLLGFSEHPGLERTLFVVVLTSYLLTLVGNTLIILLSALDPKLHSPMY
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pF1KE0 FFLGNLSFLDICYTTTSIPSTLVSFLSERKTISLSGCAVQMFLGLAMGTTECVLLGMMAF
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NP_009 FFLSNLSFLDLCFTTSCVPQMLVNLWGPKKTISFLDCSVQIFIFLSLGTTECILLTVMAF
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 DRYVAICNPLRYPIIMSKDAYVPMAAGSWIIGAVNSAVQSVFVVQLPFCRNNIINHFTCE
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NP_009 DRYVAVCQPLHYATIIHPRLCWQLASVAWVIGLVESVVQTPSTLHLPFCPDRQVDDFVCE
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 ILAVMKLACADISDNEFIMLVATTLFILTPLLLIIVSYTLIIVSIFKISSSEGRSKASST
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NP_009 VPALIRLSCEDTSYNEIQVAVASVFILVVPLSLILVSYGAITWAVLRINSAKGRRKAFGT
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 CSAHLTVVIIFYGTILFMYMKPKSKETLNSDDLDATDKIISMFYGVMTPMMNPLIYSLRN
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NP_009 CSSHLTVVTLFYSSVIAVYLQPKNPYA------QERGKFFGLFYAVGTPSLNPLIYTLRN
240 250 260 270 280 290
310
pF1KE0 KDVKEAVKHLLNRRFFSK
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NP_009 KEVTRAFRRLLGKEMGLTQS
300 310
>>NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [Homo (308 aa)
initn: 996 init1: 788 opt: 939 Z-score: 962.1 bits: 186.2 E(85289): 7.5e-47
Smith-Waterman score: 939; 45.4% identity (76.5% similar) in 315 aa overlap (1-315:1-307)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MEWENHTILVEFFLKGLSGHPRLELLFFVLIFIMYVVILLGNGTLILISILDPHLHTPMY
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NP_003 MRQINQTQVTEFLLLGLSDGPHTEQLLFIVLLGVYLVTVLGNLLLISLVHVDSQLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 FFLGNLSFLDICYTTTSIPSTLVSFLSERKTISLSGCAVQMFLGLAMGTTECVLLGMMAF
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NP_003 FFLCNLSLADLCFSTNIVPQALVHLLSRKKVIAFTLCAARLLFFLIFGCTQCALLAVMSY
70 80 90 100 110 120
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pF1KE0 DRYVAICNPLRYPIIMSKDAYVPMAAGSWIIGAVNSAVQSVFVVQLPFCRNNIINHFTCE
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NP_003 DRYVAICNPLRYPNIMTWKVCVQLATGSWTSGILVSVVDTTFILRLPYRGSNSIAHFFCE
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pF1KE0 ILAVMKLACADISDNEFIMLVATTLFILTPLLLIIVSYTLIIVSIFKISSSEGRSKASST
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NP_003 APALLILASTDTHASEMAIFLMGVVILLIPVFLILVSYGRIIVTVVKMKSTVGSLKAFST
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pF1KE0 CSAHLTVVIIFYGTILFMYMKPKSKETLNSDDLDATDKIISMFYGVMTPMMNPLIYSLRN
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NP_003 CGSHLMVVILFYGSAIITYMTPKSSKQ--------QEKSVSVFYAIVTPMLNPLIYSLRN
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310
pF1KE0 KDVKEAVKHLLNRRFFSK
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NP_003 KDVKAALRKVATRNFP
300
>>XP_011513214 (OMIM: 600578) PREDICTED: olfactory recep (300 aa)
initn: 958 init1: 833 opt: 937 Z-score: 960.3 bits: 185.8 E(85289): 9.5e-47
Smith-Waterman score: 937; 46.4% identity (77.8% similar) in 293 aa overlap (12-304:10-296)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MEWENHTILVEFFLKGLSGHPRLELLFFVLIFIMYVVILLGNGTLILISILDPHLHTPMY
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XP_011 MVNQSSTPGFLLLGFSEHPGLERTLFVVVLTSYLLTLVGNTLIILLSALDPKLHSPMY
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 FFLGNLSFLDICYTTTSIPSTLVSFLSERKTISLSGCAVQMFLGLAMGTTECVLLGMMAF
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XP_011 FFLSNLSFLDLCFTTSCVPQMLVNLWGPKKTISFLDCSVQIFIFLSLGTTECILLTVMAF
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 DRYVAICNPLRYPIIMSKDAYVPMAAGSWIIGAVNSAVQSVFVVQLPFCRNNIINHFTCE
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XP_011 DRYVAVCQPLHYATIIHPRLCWQLASVAWVIGLVESVVQTPSTLHLPFCPDRQVDDFVCE
120 130 140 150 160 170
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pF1KE0 ILAVMKLACADISDNEFIMLVATTLFILTPLLLIIVSYTLIIVSIFKISSSEGRSKASST
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XP_011 VPALIRLSCEDTSYNEIQVAVASVFILVVPLSLILVSYGAITWAVLRINSAKGRRKAFGT
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 CSAHLTVVIIFYGTILFMYMKPKSKETLNSDDLDATDKIISMFYGVMTPMMNPLIYSLRN
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XP_011 CSSHLTVVTLFYSSVIAVYLQPKNPYA------QERGKFFGLFYAVGTPSLNPLIYTLRN
240 250 260 270 280 290
310
pF1KE0 KDVKEAVKHLLNRRFFSK
:. :
XP_011 KEQKRRGS
300
>>NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [Homo (314 aa)
initn: 977 init1: 770 opt: 928 Z-score: 951.0 bits: 184.2 E(85289): 3.1e-46
Smith-Waterman score: 928; 43.9% identity (76.5% similar) in 310 aa overlap (5-314:7-310)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MEWENHTILVEFFLKGLSGHPRLELLFFVLIFIMYVVILLGNGTLILISILDPHLHTP
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NP_006 MEFTDRNYTLVTEFILLGFPTRPELQIVLFLMFLTLYAIILIGNIGLMLLIRIDPHLQTP
10 20 30 40 50 60
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pF1KE0 MYFFLGNLSFLDICYTTTSIPSTLVSFLSERKTISLSGCAVQMFLGLAMGTTECVLLGMM
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NP_006 MYFFLSNLSFVDLCYFSDIVPKMLVNFLSENKSISYYGCALQFYFFCTFADTESFILAAM
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120 130 140 150 160 170
pF1KE0 AFDRYVAICNPLRYPIIMSKDAYVPMAAGSWIIGAVNSAVQSVFVVQLPFCRNNIINHFT
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NP_006 AYDRYVAICNPLLYTVVMSRGICMRLIVLSYLGGNMSSLVHTSFAFILKYCDKNVINHFF
130 140 150 160 170 180
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pF1KE0 CEILAVMKLACADISDNEFIMLVATTLFILTPLLLIIVSYTLIIVSIFKISSSEGRSKAS
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NP_006 CDLPPLLKLSCTDTTINEWLLSTYGSSVEIICFIIIIISYFFILLSVLKIRSFSGRKKTF
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 STCSAHLTVVIIFYGTILFMYMKPKSKETLNSDDLDATDKIISMFYGVMTPMMNPLIYSL
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NP_006 STCASHLTSVTIYQGTLLFIYSRPSYLYSPN------TDKIISVFYTIFIPVLNPLIYSL
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300 310
pF1KE0 RNKDVKEAVKHLLNRRFFSK
::::::.:....: .
NP_006 RNKDVKDAAEKVLRSKVDSS
300 310
>>NP_001001957 (OMIM: 616729) olfactory receptor 2W3 [Ho (314 aa)
initn: 868 init1: 754 opt: 905 Z-score: 927.8 bits: 179.9 E(85289): 6.1e-45
Smith-Waterman score: 905; 43.6% identity (77.4% similar) in 319 aa overlap (1-318:1-313)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MEWENHTILVEFFLKGLSGHPRLELLFFVLIFIMYVVILLGNGTLILISILDPHLHTPMY
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NP_001 MDGTNGSTQTHFILLGFSDRPHLERILFVVILIAYLLTLVGNTTIILVSRLDPHLHTPMY
10 20 30 40 50 60
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pF1KE0 FFLGNLSFLDICYTTTSIPSTLVSFLSERKTISLSGCAVQMFLGLAMGTTECVLLGMMAF
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NP_001 FFLAHLSFLDLSFTTSSIPQLLYNLNGCDKTISYMGCAIQLFLFLGLGGVECLLLAVMAY
70 80 90 100 110 120
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pF1KE0 DRYVAICNPLRYPIIMSKDAYVPMAAGSWIIGAVNSAVQSVFVVQLPFCRNNIINHFTCE
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NP_001 DRCVAICKPLHYMVIMNPRLCRGLVSVTWGCGVANSLAMSPVTLRLPRCGHHEVDHFLRE
130 140 150 160 170 180
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pF1KE0 ILAVMKLACADISDNEFIMLVATTLFILTPLLLIIVSYTLIIVSIFKISSSEGRSKASST
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NP_001 MPALIRMACVSTVAIEGTVFVLAVGVVLSPLVFILLSYSYIVRAVLQIRSASGRQKAFGT
190 200 210 220 230 240
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pF1KE0 CSAHLTVVIIFYGTILFMYMKPKSKETLNSDDLDATDKIISMFYGVMTPMMNPLIYSLRN
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]