Result of FASTA (omim) for
pFN21AE0848
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0848, 314 aa
1>>>pF1KE0848 314 - 314 aa - 314 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.9235+/-0.000507; mu= 18.4543+/- 0.032
mean_var=120.2456+/-36.810, 0's: 0 Z-trim(107.7): 356 B-trim: 1847 in 2/51
Lambda= 0.116961
statistics sampled from 15154 (15739) to 15154 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.517), E-opt: 0.2 (0.185), width: 16
Scan time: 6.720
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [ ( 317) 1165 208.6 1.4e-53
XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 944 171.3 2.4e-42
NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [H ( 317) 944 171.3 2.4e-42
XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 944 171.3 2.4e-42
NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [H ( 314) 943 171.1 2.6e-42
NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [H ( 308) 917 166.7 5.5e-41
NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory recep ( 311) 910 165.5 1.2e-40
NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [H ( 314) 900 163.8 4e-40
NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [H ( 312) 890 162.1 1.3e-39
XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 312) 890 162.1 1.3e-39
XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 322) 890 162.2 1.3e-39
NP_009091 (OMIM: 600578) olfactory receptor 2H2 [H ( 312) 888 161.8 1.6e-39
XP_011513214 (OMIM: 600578) PREDICTED: olfactory r ( 300) 882 160.8 3.2e-39
NP_001001957 (OMIM: 616729) olfactory receptor 2W3 ( 314) 876 159.8 6.7e-39
NP_001005191 (OMIM: 611538) olfactory receptor 7D4 ( 312) 875 159.6 7.5e-39
NP_002539 (OMIM: 164342) olfactory receptor 1D2 [H ( 312) 847 154.9 2e-37
NP_001005487 (OMIM: 611677) olfactory receptor 13G ( 307) 834 152.7 9e-37
NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN ( 311) 802 147.3 3.8e-35
NP_003687 (OMIM: 608495) olfactory receptor 6A2 [H ( 327) 792 145.6 1.3e-34
NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C4 ( 309) 785 144.4 2.8e-34
NP_110401 (OMIM: 611268) olfactory receptor 51E2 [ ( 320) 591 111.7 2e-24
NP_689643 (OMIM: 611267) olfactory receptor 51E1 [ ( 318) 571 108.3 2.1e-23
NP_000668 (OMIM: 600445) adenosine receptor A3 iso ( 318) 265 56.7 7.3e-08
NP_000667 (OMIM: 600446) adenosine receptor A2b [H ( 332) 252 54.5 3.4e-07
NP_612200 (OMIM: 609333) trace amine-associated re ( 339) 243 53.0 9.9e-07
NP_000721 (OMIM: 118444) cholecystokinin receptor ( 428) 224 50.0 1e-05
NP_001265429 (OMIM: 102776) adenosine receptor A2a ( 412) 222 49.6 1.3e-05
NP_001265426 (OMIM: 102776) adenosine receptor A2a ( 412) 222 49.6 1.3e-05
NP_001265428 (OMIM: 102776) adenosine receptor A2a ( 412) 222 49.6 1.3e-05
NP_000666 (OMIM: 102776) adenosine receptor A2a [H ( 412) 222 49.6 1.3e-05
NP_001265427 (OMIM: 102776) adenosine receptor A2a ( 412) 222 49.6 1.3e-05
NP_001041695 (OMIM: 102775) adenosine receptor A1 ( 326) 218 48.8 1.8e-05
NP_000665 (OMIM: 102775) adenosine receptor A1 [Ho ( 326) 218 48.8 1.8e-05
NP_057624 (OMIM: 605569) probable G-protein couple ( 423) 218 48.9 2.1e-05
XP_006712258 (OMIM: 604153) PREDICTED: neuromedin- ( 370) 217 48.7 2.2e-05
XP_011508790 (OMIM: 604153) PREDICTED: neuromedin- ( 376) 216 48.5 2.5e-05
NP_001028252 (OMIM: 604849) trace amine-associated ( 351) 215 48.3 2.7e-05
XP_016856596 (OMIM: 602392) PREDICTED: orexin rece ( 389) 212 47.9 4e-05
NP_001516 (OMIM: 602392) orexin receptor type 1 [H ( 425) 212 47.9 4.3e-05
XP_016856595 (OMIM: 602392) PREDICTED: orexin rece ( 425) 212 47.9 4.3e-05
XP_016856594 (OMIM: 602392) PREDICTED: orexin rece ( 425) 212 47.9 4.3e-05
NP_001154889 (OMIM: 603071) uracil nucleotide/cyst ( 339) 209 47.3 5.3e-05
NP_001154888 (OMIM: 603071) uracil nucleotide/cyst ( 339) 209 47.3 5.3e-05
NP_005282 (OMIM: 603071) uracil nucleotide/cystein ( 367) 209 47.3 5.6e-05
NP_001154887 (OMIM: 603071) uracil nucleotide/cyst ( 367) 209 47.3 5.6e-05
XP_016859322 (OMIM: 603071) PREDICTED: uracil nucl ( 367) 209 47.3 5.6e-05
NP_055441 (OMIM: 604849) trace amine-associated re ( 306) 208 47.1 5.6e-05
NP_000612 (OMIM: 103780,164230,181500,182135,60678 ( 471) 208 47.3 7.2e-05
NP_001307687 (OMIM: 601122) 5-hydroxytryptamine re ( 439) 202 46.3 0.00014
XP_006712545 (OMIM: 601122) PREDICTED: 5-hydroxytr ( 456) 202 46.3 0.00014
>>NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [Homo (317 aa)
initn: 1165 init1: 1107 opt: 1165 Z-score: 1082.9 bits: 208.6 E(85289): 1.4e-53
Smith-Waterman score: 1165; 55.8% identity (82.8% similar) in 308 aa overlap (5-311:5-312)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MERQNQSCVVEFILLGFSNYP-ELQGQLFVAFLVIYLVTLIGNAIIIVIVSLDQSLHVPM
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NP_835 MAIGNWTEISEFILMSFSSLPTEIQSLLFLTFLTIYLVTLKGNSLIILVTLADPMLHSPM
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pF1KE0 YLFLLNLSVVDLSFSAVIMPEMLVVLSTEKTTISFGGCFAQMYFILLFGGAECFLLGVMA
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NP_835 YFFLRNLSFLEIGFNLVIVPKMLGTLLAQDTTISFLGCATQMYFFFFFGVAECFLLATMA
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pF1KE0 YDRFAAICHPLNYQMIMNKGGFMKLIIFSWALGFMLGTVQTSWVSSFPFCGLNEINHISC
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NP_835 YDRYVAICSPLHYPVIMNQRTRAKLAAASWFPGFPVATVQTTWLFSFPFCGTNKVNHFFC
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pF1KE0 ETPAVLELACADTFLFEIYAFTGTFLIILVPFLLILLSYIRVLFAILKMPSTTGRQKAFS
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NP_835 DSPPVLKLVCADTALFEIYAIVGTILVVMIPCLLILCSYTRIAAAILKIPSAKGKHKAFS
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240 250 260 270 280 290
pF1KE0 TCAAHLTSVTLFYGTASMTYLQPKSGYSPETKKVMSLSYSLLTPLLNPLIYSLRNSEMKR
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NP_835 TCSSHLLVVSLFYISSSLTYFWPKSNNSPESKKLLSLSYTVVTPMLNPIIYSLRNSEVKN
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KE0 ALMKLWRRRVVLHTI
:: . ... ..:
NP_835 ALSRTFHKVLALRNCIP
310
>>XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory recep (317 aa)
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Smith-Waterman score: 944; 47.6% identity (78.2% similar) in 307 aa overlap (1-306:1-307)
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pF1KE0 LFLLNLSVVDLSFSAVIMPEMLVVLSTEKTTISFGGCFAQMYFILLFGGAECFLLGVMAY
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pF1KE0 DRFAAICHPLNYQMIMNKGGFMKLIIFSWALGFMLGTVQTSWVSSFPFCGLNEINHISCE
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XP_011 DRYVAVCDALRYSAIMHGGLCARLAITSWVSGFISSPVQTAITFQLPMCRNKFIDHISCE
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pF1KE0 TPAVLELACADTFLFEIYAFTGTFLIILVPFLLILLSYIRVLFAILKMPSTTGRQKAFST
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XP_011 LLAVVRLACVDTSSNEVTIMVSSIVLLMTPFCLVLLSYIQIISTILKIQSREGRKKAFHT
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pF1KE0 CAAHLTSVTLFYGTASMTYLQPKSGYSPETKKVMSLSYSLLTPLLNPLIYSLRNSEMKRA
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XP_011 CASHLTVVALCYGVAIFTYIQPHSSPSVLQEKLFSVFYAILTPMLNPMIYSLRNKEVKGA
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310
pF1KE0 LMKL-WRRRVVLHTI
.:: :.
XP_011 WQKLLWKFSGLTSKLAT
310
>>NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [Homo (317 aa)
initn: 938 init1: 938 opt: 944 Z-score: 881.4 bits: 171.3 E(85289): 2.4e-42
Smith-Waterman score: 944; 47.6% identity (78.2% similar) in 307 aa overlap (1-306:1-307)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MERQNQSCVVEFILLGFSNYPELQGQLFVAFLVIYLVTLIGNAIIIVIVSLDQSLHVPMY
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NP_036 MGTDNQTWVSEFILLGLSSDWDTRVSLFVLFLVMYVVTVLGNCLIVLLIRLDSRLHTPMY
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pF1KE0 LFLLNLSVVDLSFSAVIMPEMLVVLSTEKTTISFGGCFAQMYFILLFGGAECFLLGVMAY
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NP_036 FFLTNLSLVDVSYATSVVPQLLAHFLAEHKAIPFQSCAAQLFFSLALGGIEFVLLAVMAY
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pF1KE0 DRFAAICHPLNYQMIMNKGGFMKLIIFSWALGFMLGTVQTSWVSSFPFCGLNEINHISCE
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NP_036 DRYVAVCDALRYSAIMHGGLCARLAITSWVSGFISSPVQTAITFQLPMCRNKFIDHISCE
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pF1KE0 TPAVLELACADTFLFEIYAFTGTFLIILVPFLLILLSYIRVLFAILKMPSTTGRQKAFST
::..:::.:: :. ..........:: :.:::::... .:::. : ::.::: :
NP_036 LLAVVRLACVDTSSNEVTIMVSSIVLLMTPFCLVLLSYIQIISTILKIQSREGRKKAFHT
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pF1KE0 CAAHLTSVTLFYGTASMTYLQPKSGYSPETKKVMSLSYSLLTPLLNPLIYSLRNSEMKRA
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NP_036 CASHLTVVALCYGVAIFTYIQPHSSPSVLQEKLFSVFYAILTPMLNPMIYSLRNKEVKGA
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE0 LMKL-WRRRVVLHTI
.:: :.
NP_036 WQKLLWKFSGLTSKLAT
310
>>XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory recep (317 aa)
initn: 938 init1: 938 opt: 944 Z-score: 881.4 bits: 171.3 E(85289): 2.4e-42
Smith-Waterman score: 944; 47.6% identity (78.2% similar) in 307 aa overlap (1-306:1-307)
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pF1KE0 MERQNQSCVVEFILLGFSNYPELQGQLFVAFLVIYLVTLIGNAIIIVIVSLDQSLHVPMY
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XP_011 MGTDNQTWVSEFILLGLSSDWDTRVSLFVLFLVMYVVTVLGNCLIVLLIRLDSRLHTPMY
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pF1KE0 LFLLNLSVVDLSFSAVIMPEMLVVLSTEKTTISFGGCFAQMYFILLFGGAECFLLGVMAY
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XP_011 FFLTNLSLVDVSYATSVVPQLLAHFLAEHKAIPFQSCAAQLFFSLALGGIEFVLLAVMAY
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pF1KE0 DRFAAICHPLNYQMIMNKGGFMKLIIFSWALGFMLGTVQTSWVSSFPFCGLNEINHISCE
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XP_011 DRYVAVCDALRYSAIMHGGLCARLAITSWVSGFISSPVQTAITFQLPMCRNKFIDHISCE
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pF1KE0 TPAVLELACADTFLFEIYAFTGTFLIILVPFLLILLSYIRVLFAILKMPSTTGRQKAFST
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XP_011 LLAVVRLACVDTSSNEVTIMVSSIVLLMTPFCLVLLSYIQIISTILKIQSREGRKKAFHT
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pF1KE0 CAAHLTSVTLFYGTASMTYLQPKSGYSPETKKVMSLSYSLLTPLLNPLIYSLRNSEMKRA
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XP_011 CASHLTVVALCYGVAIFTYIQPHSSPSVLQEKLFSVFYAILTPMLNPMIYSLRNKEVKGA
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310
pF1KE0 LMKL-WRRRVVLHTI
.:: :.
XP_011 WQKLLWKFSGLTSKLAT
310
>>NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [Homo (314 aa)
initn: 965 init1: 920 opt: 943 Z-score: 880.5 bits: 171.1 E(85289): 2.6e-42
Smith-Waterman score: 943; 47.7% identity (77.9% similar) in 308 aa overlap (1-308:1-308)
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pF1KE0 MERQNQSCVVEFILLGFSNYPELQGQLFVAFLVIYLVTLIGNAIIIVIVSLDQSLHVPMY
: :.: . ..::.:::... ::: ::. ::::: .:..:: .:... .:..::.:::
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pF1KE0 LFLLNLSVVDLSFSAVIMPEMLVVLSTEKTTISFGGCFAQMYFILLFGGAECFLLGVMAY
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NP_003 FFLANLSFVDVCNSTTITPKMLADLLSEKKTISFAGCFLQMYFFISLATTECILFGLMAY
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pF1KE0 DRFAAICHPLNYQMIMNKGGFMKLIIFSWALGFMLGTVQTSWVSSFPFCGLNEINHISCE
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NP_003 DRYAAICRPLLYSLIMSRTVYLKMAAGAFAAGLLNFMVNTSHVSSLSFCDSNVIHHFFCD
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pF1KE0 TPAVLELACADTFLFEIYAFTGTFLIILVPFLLILLSYIRVLFAILKMPSTTGRQKAFST
.: ...:.:.::.: : . . . :. .:.:: :: :::.:..: : ::..::::
NP_003 SPPLFKLSCSDTILKESISSILAGVNIVGTLLVILSSYSYVLFSIFSMHSGEGRHRAFST
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pF1KE0 CAAHLTSVTLFYGTASMTYLQPKSGYSPETKKVMSLSYSLLTPLLNPLIYSLRNSEMKRA
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NP_003 CASHLTAIILFYATCIYTYLRPSSSYSLNQDKVASVFYTVVIPMLNPLIYSLRSKEVKKA
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310
pF1KE0 LMKLWRRRVVLHTI
: .. :.
NP_003 LANVISRKRTSSFL
310
>>NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [Homo (308 aa)
initn: 917 init1: 796 opt: 917 Z-score: 856.9 bits: 166.7 E(85289): 5.5e-41
Smith-Waterman score: 917; 46.6% identity (76.2% similar) in 307 aa overlap (1-307:1-305)
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pF1KE0 MERQNQSCVVEFILLGFSNYPELQGQLFVAFLVIYLVTLIGNAIIIVIVSLDQSLHVPMY
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NP_003 MRQINQTQVTEFLLLGLSDGPHTEQLLFIVLLGVYLVTVLGNLLLISLVHVDSQLHTPMY
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70 80 90 100 110 120
pF1KE0 LFLLNLSVVDLSFSAVIMPEMLVVLSTEKTTISFGGCFAQMYFILLFGGAECFLLGVMAY
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NP_003 FFLCNLSLADLCFSTNIVPQALVHLLSRKKVIAFTLCAARLLFFLIFGCTQCALLAVMSY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 DRFAAICHPLNYQMIMNKGGFMKLIIFSWALGFMLGTVQTSWVSSFPFCGLNEINHISCE
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NP_003 DRYVAICNPLRYPNIMTWKVCVQLATGSWTSGILVSVVDTTFILRLPYRGSNSIAHFFCE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 TPAVLELACADTFLFEIYAFTGTFLIILVPFLLILLSYIRVLFAILKMPSTTGRQKAFST
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NP_003 APALLILASTDTHASEMAIFLMGVVILLIPVFLILVSYGRIIVTVVKMKSTVGSLKAFST
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 CAAHLTSVTLFYGTASMTYLQPKSGYSPETKKVMSLSYSLLTPLLNPLIYSLRNSEMKRA
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NP_003 CGSHLMVVILFYGSAIITYMTPKS--SKQQEKSVSVFYAIVTPMLNPLIYSLRNKDVKAA
250 260 270 280 290
310
pF1KE0 LMKLWRRRVVLHTI
: :. :
NP_003 LRKVATRNFP
300
>>NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory receptor (311 aa)
initn: 957 init1: 908 opt: 910 Z-score: 850.4 bits: 165.5 E(85289): 1.2e-40
Smith-Waterman score: 910; 45.5% identity (74.6% similar) in 303 aa overlap (5-305:8-310)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MERQNQSCVVEFILLGFSNYPELQGQLFVAFLVIYLVTLIGNAIIIVIVSLDQSLHV
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NP_001 MNDDGKVNASSEGYFILVGFSNWPHLEVVIFVVVLIFYLMTLIGNLFIIILSYLDSHLHT
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 PMYLFLLNLSVVDLSFSAVIMPEMLVVLSTEKTTISFGGCFAQMYFILLFGGAECFLLGV
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NP_001 PMYFFLSNLSFLDLCYTTSSIPQLLVNLWGPEKTISYAGCMIQLYFVLALGTTECVLLVV
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 MAYDRFAAICHPLNYQMIMNKGGFMKLIIFSWALGFMLGTVQTSWVSSFPFCGLNEINHI
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NP_001 MSYDRYAAVCRPLHYTVLMHPRFCHLLAVASWVSGFTNSALHSSFTFWVPLCGHRQVDHF
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 SCETPAVLELACADTFLFEIYAFTGTFLIILVPFLLILLSYIRVLFAILKMPSTTGRQKA
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NP_001 FCEVPALLRLSCVDTHVNELTLMITSSIFVLIPLILILTSYGAIVRAILRMQSTTGLQKV
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 FSTCAAHLTSVTLFYGTASMTYLQPKSGYSPETKKVMSLSYSLLTPLLNPLIYSLRNSEM
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NP_001 FGTCGAHLMAVSLFFIPAMCMYLQPPSGNSQDQGKFIALFYTVVTPSLNPLIYTLRNKVV
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KE0 KRALMKL--WRRRVVLHTI
. :. .: :
NP_001 RGAVKRLMGWE
310
>>NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [Homo (314 aa)
initn: 952 init1: 888 opt: 900 Z-score: 841.3 bits: 163.8 E(85289): 4e-40
Smith-Waterman score: 900; 44.8% identity (74.8% similar) in 306 aa overlap (4-309:6-311)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MERQNQSCVVEFILLGFSNYPELQGQLFVAFLVIYLVTLIGNAIIIVIVSLDQSLHVP
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NP_006 MEFTDRNYTLVTEFILLGFPTRPELQIVLFLMFLTLYAIILIGNIGLMLLIRIDPHLQTP
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 MYLFLLNLSVVDLSFSAVIMPEMLVVLSTEKTTISFGGCFAQMYFILLFGGAECFLLGVM
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NP_006 MYFFLSNLSFVDLCYFSDIVPKMLVNFLSENKSISYYGCALQFYFFCTFADTESFILAAM
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120 130 140 150 160 170
pF1KE0 AYDRFAAICHPLNYQMIMNKGGFMKLIIFSWALGFMLGTVQTSWVSSFPFCGLNEINHIS
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NP_006 AYDRYVAICNPLLYTVVMSRGICMRLIVLSYLGGNMSSLVHTSFAFILKYCDKNVINHFF
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 CETPAVLELACADTFLFEIYAFTGTFLIILVPFLLILLSYIRVLFAILKMPSTTGRQKAF
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NP_006 CDLPPLLKLSCTDTTINEWLLSTYGSSVEIICFIIIIISYFFILLSVLKIRSFSGRKKTF
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 STCAAHLTSVTLFYGTASMTYLQPKSGYSPETKKVMSLSYSLLTPLLNPLIYSLRNSEMK
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NP_006 STCASHLTSVTIYQGTLLFIYSRPSYLYSPNTDKIISVFYTIFIPVLNPLIYSLRNKDVK
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KE0 RALMKLWRRRVVLHTI
: :. : .:
NP_006 DAAEKVLRSKVDSS
310
>>NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [Homo (312 aa)
initn: 909 init1: 885 opt: 890 Z-score: 832.2 bits: 162.1 E(85289): 1.3e-39
Smith-Waterman score: 890; 45.3% identity (71.8% similar) in 309 aa overlap (1-309:1-309)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MERQNQSCVVEFILLGFSNYPELQGQLFVAFLVIYLVTLIGNAIIIVIVSLDQSLHVPMY
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NP_036 MSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILSVSIDSCLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 LFLLNLSVVDLSFSAVIMPEMLVVLSTEKTTISFGGCFAQMYFILLFGGAECFLLGVMAY
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NP_036 FFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMFVDMDNFLLAVMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 DRFAAICHPLNYQMIMNKGGFMKLIIFSWALGFMLGTVQTSWVSSFPFCGLNEINHISCE
:.:.:.::::.: :.. :. :... . ..: .. . ::. : :.:. :.
NP_036 DHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFCADNAITHFFCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 TPAVLELACADTFLFEIYAFTGTFLIILVPFLLILLSYIRVLFAILKMPSTTGRQKAFST
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NP_036 VTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKVPSTKGRWKAFST
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 CAAHLTSVTLFYGTASMTYLQPKSGYSPETKKVMSLSYSLLTPLLNPLIYSLRNSEMKRA
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NP_036 CGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFIYSLRNRYLKGA
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE0 LMKLWRRRVVLHTI
: :. : :
NP_036 LKKVVGRVVFSV
310
>>XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory recep (312 aa)
initn: 909 init1: 885 opt: 890 Z-score: 832.2 bits: 162.1 E(85289): 1.3e-39
Smith-Waterman score: 890; 45.3% identity (71.8% similar) in 309 aa overlap (1-309:1-309)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MERQNQSCVVEFILLGFSNYPELQGQLFVAFLVIYLVTLIGNAIIIVIVSLDQSLHVPMY
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XP_011 MSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILSVSIDSCLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 LFLLNLSVVDLSFSAVIMPEMLVVLSTEKTTISFGGCFAQMYFILLFGGAECFLLGVMAY
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XP_011 FFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMFVDMDNFLLAVMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 DRFAAICHPLNYQMIMNKGGFMKLIIFSWALGFMLGTVQTSWVSSFPFCGLNEINHISCE
:.:.:.::::.: :.. :. :... . ..: .. . ::. : :.:. :.
XP_011 DHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFCADNAITHFFCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 TPAVLELACADTFLFEIYAFTGTFLIILVPFLLILLSYIRVLFAILKMPSTTGRQKAFST
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XP_011 VTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKVPSTKGRWKAFST
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
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250 260 270 280 290 300
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310
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]