Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE0848
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0848, 314 aa
1>>>pF1KE0848 314 - 314 aa - 314 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.8990+/-0.0013; mu= 12.6159+/- 0.076
mean_var=217.5869+/-81.461, 0's: 0 Z-trim(102.1): 427 B-trim: 392 in 1/46
Lambda= 0.086948
statistics sampled from 6265 (6799) to 6265 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.546), E-opt: 0.2 (0.209), width: 16
Scan time: 2.090
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS31421.1 OR10A3 gene_id:26496|Hs108|chr11 ( 314) 1774 236.4 2.2e-62
CCDS7773.1 OR10A5 gene_id:144124|Hs108|chr11 ( 317) 1165 160.0 2.2e-39
CCDS31815.1 OR10A7 gene_id:121364|Hs108|chr12 ( 316) 1130 155.6 4.7e-38
CCDS31415.1 OR10A2 gene_id:341276|Hs108|chr11 ( 303) 1117 153.9 1.4e-37
CCDS7774.1 OR10A4 gene_id:283297|Hs108|chr11 ( 315) 1089 150.4 1.7e-36
CCDS34364.1 OR10C1 gene_id:442194|Hs108|chr6 ( 312) 972 135.8 4.3e-32
CCDS31565.1 OR10V1 gene_id:390201|Hs108|chr11 ( 309) 951 133.1 2.7e-31
CCDS31526.1 OR8H1 gene_id:219469|Hs108|chr11 ( 311) 951 133.1 2.7e-31
CCDS34358.1 OR2B3 gene_id:442184|Hs108|chr6 ( 313) 951 133.1 2.7e-31
CCDS43670.1 OR2A12 gene_id:346525|Hs108|chr7 ( 310) 950 133.0 2.9e-31
CCDS35093.1 OR13C9 gene_id:286362|Hs108|chr9 ( 318) 949 132.9 3.2e-31
CCDS31098.1 OR11L1 gene_id:391189|Hs108|chr1 ( 322) 944 132.3 5e-31
CCDS31515.1 OR5F1 gene_id:338674|Hs108|chr11 ( 314) 943 132.1 5.4e-31
CCDS30896.1 OR10K2 gene_id:391107|Hs108|chr1 ( 312) 941 131.9 6.4e-31
CCDS12335.1 OR10H1 gene_id:26539|Hs108|chr19 ( 318) 939 131.6 7.7e-31
CCDS31534.1 OR5AP2 gene_id:338675|Hs108|chr11 ( 316) 938 131.5 8.3e-31
CCDS35088.1 OR13C4 gene_id:138804|Hs108|chr9 ( 318) 938 131.5 8.4e-31
CCDS31093.1 OR2G3 gene_id:81469|Hs108|chr1 ( 309) 935 131.1 1.1e-30
CCDS31561.1 OR5A1 gene_id:219982|Hs108|chr11 ( 315) 933 130.9 1.3e-30
CCDS43668.1 OR2A5 gene_id:393046|Hs108|chr7 ( 311) 932 130.7 1.4e-30
CCDS35094.1 OR13D1 gene_id:286365|Hs108|chr9 ( 346) 929 130.4 1.9e-30
CCDS31519.1 OR8H3 gene_id:390152|Hs108|chr11 ( 312) 928 130.2 2e-30
CCDS32940.1 OR10H5 gene_id:284433|Hs108|chr19 ( 315) 926 130.0 2.4e-30
CCDS31518.1 OR8H2 gene_id:390151|Hs108|chr11 ( 312) 923 129.6 3e-30
CCDS34323.1 OR2Y1 gene_id:134083|Hs108|chr5 ( 311) 921 129.4 3.6e-30
CCDS35092.1 OR13C2 gene_id:392376|Hs108|chr9 ( 318) 921 129.4 3.7e-30
CCDS4657.1 OR5V1 gene_id:81696|Hs108|chr6 ( 321) 921 129.4 3.7e-30
CCDS30897.1 OR10K1 gene_id:391109|Hs108|chr1 ( 313) 920 129.2 4e-30
CCDS6778.1 OR2K2 gene_id:26248|Hs108|chr9 ( 316) 920 129.3 4e-30
CCDS31417.1 OR2D3 gene_id:120775|Hs108|chr11 ( 330) 920 129.3 4.1e-30
CCDS4641.1 OR2B2 gene_id:81697|Hs108|chr6 ( 357) 920 129.3 4.2e-30
CCDS31119.1 OR2G6 gene_id:391211|Hs108|chr1 ( 316) 918 129.0 4.7e-30
CCDS31416.1 OR2D2 gene_id:120776|Hs108|chr11 ( 308) 917 128.9 5.1e-30
CCDS31828.1 OR10P1 gene_id:121130|Hs108|chr12 ( 313) 916 128.7 5.6e-30
CCDS31115.1 OR2T1 gene_id:26696|Hs108|chr1 ( 369) 915 128.7 6.7e-30
CCDS30895.1 OR10T2 gene_id:128360|Hs108|chr1 ( 314) 914 128.5 6.7e-30
CCDS35090.1 OR13C8 gene_id:138802|Hs108|chr9 ( 320) 914 128.5 6.8e-30
CCDS31514.1 OR10AG1 gene_id:282770|Hs108|chr11 ( 301) 913 128.3 7.1e-30
CCDS30898.1 OR10R2 gene_id:343406|Hs108|chr1 ( 335) 912 128.3 8.2e-30
CCDS43433.1 OR2J3 gene_id:442186|Hs108|chr6 ( 311) 910 128.0 9.4e-30
CCDS4656.1 OR2W1 gene_id:26692|Hs108|chr6 ( 320) 909 127.9 1e-29
CCDS31517.1 OR8I2 gene_id:120586|Hs108|chr11 ( 310) 908 127.7 1.1e-29
CCDS31552.1 OR5B21 gene_id:219968|Hs108|chr11 ( 309) 906 127.5 1.3e-29
CCDS43672.1 OR2A14 gene_id:135941|Hs108|chr7 ( 310) 905 127.4 1.5e-29
CCDS30905.1 OR6N1 gene_id:128372|Hs108|chr1 ( 312) 904 127.2 1.6e-29
CCDS35089.1 OR13C3 gene_id:138803|Hs108|chr9 ( 347) 904 127.3 1.7e-29
CCDS43666.1 OR2F2 gene_id:135948|Hs108|chr7 ( 317) 903 127.1 1.7e-29
CCDS35128.1 OR1L3 gene_id:26735|Hs108|chr9 ( 324) 903 127.1 1.8e-29
CCDS43434.1 OR2J2 gene_id:26707|Hs108|chr6 ( 312) 901 126.9 2.1e-29
CCDS7949.1 OR5I1 gene_id:10798|Hs108|chr11 ( 314) 900 126.7 2.3e-29
>>CCDS31421.1 OR10A3 gene_id:26496|Hs108|chr11 (314 aa)
initn: 1774 init1: 1774 opt: 1774 Z-score: 1233.3 bits: 236.4 E(32554): 2.2e-62
Smith-Waterman score: 1774; 85.0% identity (95.5% similar) in 313 aa overlap (1-313:1-313)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MERQNQSCVVEFILLGFSNYPELQGQLFVAFLVIYLVTLIGNAIIIVIVSLDQSLHVPMY
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CCDS31 MKRQNQSCVVEFILLGFSNFPELQVQLFGVFLVIYVVTLMGNAIITVIISLNQSLHVPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 LFLLNLSVVDLSFSAVIMPEMLVVLSTEKTTISFGGCFAQMYFILLFGGAECFLLGVMAY
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CCDS31 LFLLNLSVVEVSFSAVITPEMLVVLSTEKTMISFVGCFAQMYFILLFGGTECFLLGAMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 DRFAAICHPLNYQMIMNKGGFMKLIIFSWALGFMLGTVQTSWVSSFPFCGLNEINHISCE
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CCDS31 DRFAAICHPLNYPVIMNRGVFMKLVIFSWISGIMVATVQTTWVFSFPFCGPNEINHLFCE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 TPAVLELACADTFLFEIYAFTGTFLIILVPFLLILLSYIRVLFAILKMPSTTGRQKAFST
:: ::::.:::::::::::::::.::..::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 TPPVLELVCADTFLFEIYAFTGTILIVMVPFLLILLSYIRVLFAILKMPSTTGRQKAFST
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 CAAHLTSVTLFYGTASMTYLQPKSGYSPETKKVMSLSYSLLTPLLNPLIYSLRNSEMKRA
::.::::::::::::.::::::::::::::::..::.:.::::::::::::::::::::.
CCDS31 CASHLTSVTLFYGTANMTYLQPKSGYSPETKKLISLAYTLLTPLLNPLIYSLRNSEMKRT
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE0 LMKLWRRRVVLHTI
:.:::::.:.:::
CCDS31 LIKLWRRKVILHTF
310
>>CCDS7773.1 OR10A5 gene_id:144124|Hs108|chr11 (317 aa)
initn: 1165 init1: 1107 opt: 1165 Z-score: 820.4 bits: 160.0 E(32554): 2.2e-39
Smith-Waterman score: 1165; 55.8% identity (82.8% similar) in 308 aa overlap (5-311:5-312)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MERQNQSCVVEFILLGFSNYP-ELQGQLFVAFLVIYLVTLIGNAIIIVIVSLDQSLHVPM
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CCDS77 MAIGNWTEISEFILMSFSSLPTEIQSLLFLTFLTIYLVTLKGNSLIILVTLADPMLHSPM
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 YLFLLNLSVVDLSFSAVIMPEMLVVLSTEKTTISFGGCFAQMYFILLFGGAECFLLGVMA
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CCDS77 YFFLRNLSFLEIGFNLVIVPKMLGTLLAQDTTISFLGCATQMYFFFFFGVAECFLLATMA
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 YDRFAAICHPLNYQMIMNKGGFMKLIIFSWALGFMLGTVQTSWVSSFPFCGLNEINHISC
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CCDS77 YDRYVAICSPLHYPVIMNQRTRAKLAAASWFPGFPVATVQTTWLFSFPFCGTNKVNHFFC
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 ETPAVLELACADTFLFEIYAFTGTFLIILVPFLLILLSYIRVLFAILKMPSTTGRQKAFS
..: ::.:.:::: ::::::..::.:....: :::: :: :. ::::.::. :..::::
CCDS77 DSPPVLKLVCADTALFEIYAIVGTILVVMIPCLLILCSYTRIAAAILKIPSAKGKHKAFS
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 TCAAHLTSVTLFYGTASMTYLQPKSGYSPETKKVMSLSYSLLTPLLNPLIYSLRNSEMKR
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CCDS77 TCSSHLLVVSLFYISSSLTYFWPKSNNSPESKKLLSLSYTVVTPMLNPIIYSLRNSEVKN
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KE0 ALMKLWRRRVVLHTI
:: . ... ..:
CCDS77 ALSRTFHKVLALRNCIP
310
>>CCDS31815.1 OR10A7 gene_id:121364|Hs108|chr12 (316 aa)
initn: 1145 init1: 1112 opt: 1130 Z-score: 796.7 bits: 155.6 E(32554): 4.7e-38
Smith-Waterman score: 1130; 52.1% identity (84.4% similar) in 307 aa overlap (4-310:4-310)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MERQNQSCVVEFILLGFSNYPELQGQLFVAFLVIYLVTLIGNAIIIVIVSLDQSLHVPMY
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CCDS31 MICENHTRVTEFILLGFTNNPEMQVSLFIFFLAIYTVTLLGNFLIVTVTSVDLALQTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 LFLLNLSVVDLSFSAVIMPEMLVVLSTEKTTISFGGCFAQMYFILLFGGAECFLLGVMAY
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CCDS31 FFLQNLSLLEVCFTLVMVPKMLVDLVSPRKIISFVGCGTQMYFFFFFGSSECFLLSMMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 DRFAAICHPLNYQMIMNKGGFMKLIIFSWALGFMLGTVQTSWVSSFPFCGLNEINHISCE
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CCDS31 DRFVAICNPLHYSVIMNRSLCLWMAIGSWMSGVPVSMLQTAWMMALPFCGPNAVDHFFCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 TPAVLELACADTFLFEIYAFTGTFLIILVPFLLILLSYIRVLFAILKMPSTTGRQKAFST
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CCDS31 GPPVLKLVTVDTTMYEMQALASTLLFIMFPFCLILVSYTRIIITILRMSSATGRQKAFST
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 CAAHLTSVTLFYGTASMTYLQPKSGYSPETKKVMSLSYSLLTPLLNPLIYSLRNSEMKRA
:..:: :.:::::::.:::.:::. :::.::..::::...::.:::.::.:::.:.: :
CCDS31 CSSHLIVVSLFYGTASLTYLRPKSNQSPESKKLVSLSYTVITPMLNPIIYGLRNNEVKGA
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE0 LMKLWRRRVVLHTI
. . ..:.
CCDS31 VKRTITQKVLQKLDVF
310
>>CCDS31415.1 OR10A2 gene_id:341276|Hs108|chr11 (303 aa)
initn: 1110 init1: 1088 opt: 1117 Z-score: 788.1 bits: 153.9 E(32554): 1.4e-37
Smith-Waterman score: 1117; 55.4% identity (82.2% similar) in 298 aa overlap (15-311:1-298)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MERQNQSCVVEFILLGFSNYP-ELQGQLFVAFLVIYLVTLIGNAIIIVIVSLDQSLHVPM
..::. : :.:. ::..::.::::::.:: .::... : :: ::
CCDS31 MSFSSLPTEIQSLLFLTFLTIYLVTLMGNCLIILVTLADPMLHSPM
10 20 30 40
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 YLFLLNLSVVDLSFSAVIMPEMLVVLSTEKTTISFGGCFAQMYFILLFGGAECFLLGVMA
:.:: ::: ....:. ::.:.:: .: .. ::::: :: .::::...:: ::::::..::
CCDS31 YFFLRNLSFLEIGFNLVIVPKMLGTLLAQDTTISFLGCATQMYFFFFFGVAECFLLATMA
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 YDRFAAICHPLNYQMIMNKGGFMKLIIFSWALGFMLGTVQTSWVSSFPFCGLNEINHISC
:::..::: ::.: .:::. :: :: :: ..::::.:. :::::: :..::. :
CCDS31 YDRYVAICSPLHYPVIMNQRTRAKLAAASWFPGFPVATVQTTWLFSFPFCGTNKVNHFFC
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 ETPAVLELACADTFLFEIYAFTGTFLIILVPFLLILLSYIRVLFAILKMPSTTGRQKAFS
..: ::.:.:::: ::::::..::.:....: :::: :: .. ::::.::. :..::::
CCDS31 DSPPVLRLVCADTALFEIYAIVGTILVVMIPCLLILCSYTHIAAAILKIPSAKGKNKAFS
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 TCAAHLTSVTLFYGTASMTYLQPKSGYSPETKKVMSLSYSLLTPLLNPLIYSLRNSEMKR
::..:: :.::: . :.::..:::. ::: ::..::::...::.:::.::::::.:.:
CCDS31 TCSSHLLVVSLFYISLSLTYFRPKSNNSPEGKKLLSLSYTVMTPMLNPIIYSLRNNEVKN
230 240 250 260 270 280
300 310
pF1KE0 ALMKLWRRRVVLHTI
:: . . ..:
CCDS31 ALSRTVSKALALRNCIP
290 300
>>CCDS7774.1 OR10A4 gene_id:283297|Hs108|chr11 (315 aa)
initn: 1133 init1: 1054 opt: 1089 Z-score: 768.9 bits: 150.4 E(32554): 1.7e-36
Smith-Waterman score: 1089; 53.2% identity (81.5% similar) in 308 aa overlap (1-307:1-308)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MERQNQSCVVEFILLGFSNYP-ELQGQLFVAFLVIYLVTLIGNAIIIVIVSLDQSLHVPM
: .: . : ::.:..:: :::. ::. ::.::::::.::..::... :..:. ::
CCDS77 MMWENWTIVSEFVLVSFSALSTELQALLFLLFLTIYLVTLMGNVLIILVTIADSALQSPM
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 YLFLLNLSVVDLSFSAVIMPEMLVVLSTEKTTISFGGCFAQMYFILLFGGAECFLLGVMA
:.:: ::: ....:. ::.:.:: .: . ::::: :: .::::...::.::: ::..::
CCDS77 YFFLRNLSFLEIGFNLVIVPKMLGTLIIQDTTISFLGCATQMYFFFFFGAAECCLLATMA
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 YDRFAAICHPLNYQMIMNKGGFMKLIIFSWALGFMLGTVQTSWVSSFPFCGLNEINHISC
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CCDS77 YDRYVAICDPLHYPVIMGHISCAQLAAASWFSGFSVATVQTTWIFSFPFCGPNRVNHFFC
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 ETPAVLELACADTFLFEIYAFTGTFLIILVPFLLILLSYIRVLFAILKMPSTTGRQKAFS
..: :. :.:::: .::. :.:.: :.:: :::::: ::.:.: .:..:::. :...:::
CCDS77 DSPPVIALVCADTSVFELEALTATVLFILFPFLLILGSYVRILSTIFRMPSAEGKHQAFS
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 TCAAHLTSVTLFYGTASMTYLQPKSGYSPETKKVMSLSYSLLTPLLNPLIYSLRNSEMKR
::.::: :.:::.:: .::..:.:. : :.::..::: ...::.:::.::: ::.:.:
CCDS77 TCSAHLLVVSLFYSTAILTYFRPQSSASSESKKLLSLSSTVVTPMLNPIIYSSRNKEVKA
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KE0 ALMKLWRRRVVLHTI
:: .: .:
CCDS77 ALKRLIHRTLGSQKL
310
>>CCDS34364.1 OR10C1 gene_id:442194|Hs108|chr6 (312 aa)
initn: 1002 init1: 958 opt: 972 Z-score: 689.6 bits: 135.8 E(32554): 4.3e-32
Smith-Waterman score: 972; 48.5% identity (77.4% similar) in 305 aa overlap (5-309:4-308)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MERQNQSCVVEFILLGFSNYPELQGQLFVAFLVIYLVTLIGNAIIIVIVSLDQSLHVPMY
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