Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE0846
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0846, 314 aa
1>>>pF1KE0846 314 - 314 aa - 314 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.8357+/-0.00138; mu= 12.9030+/- 0.080
mean_var=157.4363+/-47.498, 0's: 0 Z-trim(101.4): 401 B-trim: 747 in 2/44
Lambda= 0.102217
statistics sampled from 5978 (6485) to 5978 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.533), E-opt: 0.2 (0.199), width: 16
Scan time: 2.350
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS31421.1 OR10A3 gene_id:26496|Hs108|chr11 ( 314) 2040 313.7 1.2e-85
CCDS31815.1 OR10A7 gene_id:121364|Hs108|chr12 ( 316) 1225 193.6 1.8e-49
CCDS7773.1 OR10A5 gene_id:144124|Hs108|chr11 ( 317) 1214 191.9 5.4e-49
CCDS31415.1 OR10A2 gene_id:341276|Hs108|chr11 ( 303) 1171 185.6 4.3e-47
CCDS7774.1 OR10A4 gene_id:283297|Hs108|chr11 ( 315) 1152 182.8 3.1e-46
CCDS34364.1 OR10C1 gene_id:442194|Hs108|chr6 ( 312) 1038 166.0 3.5e-41
CCDS31514.1 OR10AG1 gene_id:282770|Hs108|chr11 ( 301) 985 158.1 7.7e-39
CCDS31098.1 OR11L1 gene_id:391189|Hs108|chr1 ( 322) 978 157.1 1.6e-38
CCDS43670.1 OR2A12 gene_id:346525|Hs108|chr7 ( 310) 977 157.0 1.8e-38
CCDS31561.1 OR5A1 gene_id:219982|Hs108|chr11 ( 315) 976 156.8 2e-38
CCDS31534.1 OR5AP2 gene_id:338675|Hs108|chr11 ( 316) 976 156.8 2e-38
CCDS43668.1 OR2A5 gene_id:393046|Hs108|chr7 ( 311) 972 156.2 3e-38
CCDS31526.1 OR8H1 gene_id:219469|Hs108|chr11 ( 311) 965 155.2 6.1e-38
CCDS31515.1 OR5F1 gene_id:338674|Hs108|chr11 ( 314) 962 154.8 8.3e-38
CCDS4657.1 OR5V1 gene_id:81696|Hs108|chr6 ( 321) 960 154.5 1e-37
CCDS30896.1 OR10K2 gene_id:391107|Hs108|chr1 ( 312) 957 154.0 1.4e-37
CCDS1185.1 OR10J1 gene_id:26476|Hs108|chr1 ( 320) 957 154.0 1.4e-37
CCDS35088.1 OR13C4 gene_id:138804|Hs108|chr9 ( 318) 953 153.4 2.1e-37
CCDS7949.1 OR5I1 gene_id:10798|Hs108|chr11 ( 314) 951 153.1 2.5e-37
CCDS30897.1 OR10K1 gene_id:391109|Hs108|chr1 ( 313) 948 152.7 3.5e-37
CCDS31560.1 OR5A2 gene_id:219981|Hs108|chr11 ( 324) 947 152.6 3.9e-37
CCDS30895.1 OR10T2 gene_id:128360|Hs108|chr1 ( 314) 946 152.4 4.3e-37
CCDS31828.1 OR10P1 gene_id:121130|Hs108|chr12 ( 313) 942 151.8 6.4e-37
CCDS32940.1 OR10H5 gene_id:284433|Hs108|chr19 ( 315) 940 151.5 7.9e-37
CCDS30898.1 OR10R2 gene_id:343406|Hs108|chr1 ( 335) 940 151.6 8.2e-37
CCDS43669.1 OR2A25 gene_id:392138|Hs108|chr7 ( 310) 939 151.4 8.6e-37
CCDS31416.1 OR2D2 gene_id:120776|Hs108|chr11 ( 308) 938 151.2 9.5e-37
CCDS7783.1 OR5P3 gene_id:120066|Hs108|chr11 ( 311) 934 150.6 1.4e-36
CCDS31565.1 OR10V1 gene_id:390201|Hs108|chr11 ( 309) 933 150.5 1.6e-36
CCDS43673.1 OR2A1 gene_id:346528|Hs108|chr7 ( 310) 933 150.5 1.6e-36
CCDS56515.1 OR2A42 gene_id:402317|Hs108|chr7 ( 310) 933 150.5 1.6e-36
CCDS34358.1 OR2B3 gene_id:442184|Hs108|chr6 ( 313) 933 150.5 1.6e-36
CCDS12335.1 OR10H1 gene_id:26539|Hs108|chr19 ( 318) 933 150.5 1.6e-36
CCDS31519.1 OR8H3 gene_id:390152|Hs108|chr11 ( 312) 931 150.2 2e-36
CCDS31417.1 OR2D3 gene_id:120775|Hs108|chr11 ( 330) 931 150.2 2e-36
CCDS30905.1 OR6N1 gene_id:128372|Hs108|chr1 ( 312) 930 150.0 2.2e-36
CCDS43672.1 OR2A14 gene_id:135941|Hs108|chr7 ( 310) 929 149.9 2.4e-36
CCDS31093.1 OR2G3 gene_id:81469|Hs108|chr1 ( 309) 928 149.7 2.7e-36
CCDS32042.1 OR5AU1 gene_id:390445|Hs108|chr14 ( 362) 925 149.4 4e-36
CCDS31552.1 OR5B21 gene_id:219968|Hs108|chr11 ( 309) 923 149.0 4.4e-36
CCDS31518.1 OR8H2 gene_id:390151|Hs108|chr11 ( 312) 923 149.0 4.4e-36
CCDS43671.1 OR2A2 gene_id:442361|Hs108|chr7 ( 318) 922 148.9 5e-36
CCDS35093.1 OR13C9 gene_id:286362|Hs108|chr9 ( 318) 920 148.6 6.1e-36
CCDS30910.1 OR10J5 gene_id:127385|Hs108|chr1 ( 309) 918 148.3 7.4e-36
CCDS30901.1 OR10Z1 gene_id:128368|Hs108|chr1 ( 313) 918 148.3 7.4e-36
CCDS4641.1 OR2B2 gene_id:81697|Hs108|chr6 ( 357) 914 147.8 1.2e-35
CCDS31119.1 OR2G6 gene_id:391211|Hs108|chr1 ( 316) 912 147.4 1.4e-35
CCDS32034.1 OR11H4 gene_id:390442|Hs108|chr14 ( 324) 908 146.8 2.1e-35
CCDS31517.1 OR8I2 gene_id:120586|Hs108|chr11 ( 310) 907 146.6 2.3e-35
CCDS31115.1 OR2T1 gene_id:26696|Hs108|chr1 ( 369) 908 146.9 2.3e-35
>>CCDS31421.1 OR10A3 gene_id:26496|Hs108|chr11 (314 aa)
initn: 2040 init1: 2040 opt: 2040 Z-score: 1651.4 bits: 313.7 E(32554): 1.2e-85
Smith-Waterman score: 2040; 100.0% identity (100.0% similar) in 314 aa overlap (1-314:1-314)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MKRQNQSCVVEFILLGFSNFPELQVQLFGVFLVIYVVTLMGNAIITVIISLNQSLHVPMY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MKRQNQSCVVEFILLGFSNFPELQVQLFGVFLVIYVVTLMGNAIITVIISLNQSLHVPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 LFLLNLSVVEVSFSAVITPEMLVVLSTEKTMISFVGCFAQMYFILLFGGTECFLLGAMAY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 LFLLNLSVVEVSFSAVITPEMLVVLSTEKTMISFVGCFAQMYFILLFGGTECFLLGAMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 DRFAAICHPLNYPVIMNRGVFMKLVIFSWISGIMVATVQTTWVFSFPFCGPNEINHLFCE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 DRFAAICHPLNYPVIMNRGVFMKLVIFSWISGIMVATVQTTWVFSFPFCGPNEINHLFCE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 TPPVLELVCADTFLFEIYAFTGTILIVMVPFLLILLSYIRVLFAILKMPSTTGRQKAFST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 TPPVLELVCADTFLFEIYAFTGTILIVMVPFLLILLSYIRVLFAILKMPSTTGRQKAFST
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 CASHLTSVTLFYGTANMTYLQPKSGYSPETKKLISLAYTLLTPLLNPLIYSLRNSEMKRT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 CASHLTSVTLFYGTANMTYLQPKSGYSPETKKLISLAYTLLTPLLNPLIYSLRNSEMKRT
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE0 LIKLWRRKVILHTF
::::::::::::::
CCDS31 LIKLWRRKVILHTF
310
>>CCDS31815.1 OR10A7 gene_id:121364|Hs108|chr12 (316 aa)
initn: 1264 init1: 1212 opt: 1225 Z-score: 1001.8 bits: 193.6 E(32554): 1.8e-49
Smith-Waterman score: 1225; 56.0% identity (87.3% similar) in 307 aa overlap (4-310:4-310)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MKRQNQSCVVEFILLGFSNFPELQVQLFGVFLVIYVVTLMGNAIITVIISLNQSLHVPMY
.:.. :.:::::::.: ::.::.:: ::.::.:::.:: .:... :.. .:..:::
CCDS31 MICENHTRVTEFILLGFTNNPEMQVSLFIFFLAIYTVTLLGNFLIVTVTSVDLALQTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 LFLLNLSVVEVSFSAVITPEMLVVLSTEKTMISFVGCFAQMYFILLFGGTECFLLGAMAY
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CCDS31 FFLQNLSLLEVCFTLVMVPKMLVDLVSPRKIISFVGCGTQMYFFFFFGSSECFLLSMMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 DRFAAICHPLNYPVIMNRGVFMKLVIFSWISGIMVATVQTTWVFSFPFCGPNEINHLFCE
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CCDS31 DRFVAICNPLHYSVIMNRSLCLWMAIGSWMSGVPVSMLQTAWMMALPFCGPNAVDHFFCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 TPPVLELVCADTFLFEIYAFTGTILIVMVPFLLILLSYIRVLFAILKMPSTTGRQKAFST
::::.:: .:: ..:. :...:.:..: :: :::.:: :....::.: :.:::::::::
CCDS31 GPPVLKLVTVDTTMYEMQALASTLLFIMFPFCLILVSYTRIIITILRMSSATGRQKAFST
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 CASHLTSVTLFYGTANMTYLQPKSGYSPETKKLISLAYTLLTPLLNPLIYSLRNSEMKRT
:.::: :.::::::..:::.:::. :::.:::.::.::..::.:::.::.:::.:.: .
CCDS31 CSSHLIVVSLFYGTASLTYLRPKSNQSPESKKLVSLSYTVITPMLNPIIYGLRNNEVKGA
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE0 LIKLWRRKVILHTF
. . .::.
CCDS31 VKRTITQKVLQKLDVF
310
>>CCDS7773.1 OR10A5 gene_id:144124|Hs108|chr11 (317 aa)
initn: 1194 init1: 1156 opt: 1214 Z-score: 993.0 bits: 191.9 E(32554): 5.4e-49
Smith-Waterman score: 1214; 58.1% identity (83.8% similar) in 308 aa overlap (5-311:5-312)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MKRQNQSCVVEFILLGFSNFP-ELQVQLFGVFLVIYVVTLMGNAIITVIISLNQSLHVPM
: . . ::::..::..: :.: :: .::.::.::: ::..: .. . :: ::
CCDS77 MAIGNWTEISEFILMSFSSLPTEIQSLLFLTFLTIYLVTLKGNSLIILVTLADPMLHSPM
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 YLFLLNLSVVEVSFSAVITPEMLVVLSTEKTMISFVGCFAQMYFILLFGGTECFLLGAMA
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CCDS77 YFFLRNLSFLEIGFNLVIVPKMLGTLLAQDTTISFLGCATQMYFFFFFGVAECFLLATMA
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 YDRFAAICHPLNYPVIMNRGVFMKLVIFSWISGIMVATVQTTWVFSFPFCGPNEINHLFC
:::..::: ::.::::::. . ::. ::. :. ::::::::.::::::: :..::.::
CCDS77 YDRYVAICSPLHYPVIMNQRTRAKLAAASWFPGFPVATVQTTWLFSFPFCGTNKVNHFFC
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 ETPPVLELVCADTFLFEIYAFTGTILIVMVPFLLILLSYIRVLFAILKMPSTTGRQKAFS
..::::.:::::: ::::::..::::.::.: :::: :: :. ::::.::. :..::::
CCDS77 DSPPVLKLVCADTALFEIYAIVGTILVVMIPCLLILCSYTRIAAAILKIPSAKGKHKAFS
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 TCASHLTSVTLFYGTANMTYLQPKSGYSPETKKLISLAYTLLTPLLNPLIYSLRNSEMKR
::.::: :.::: ....::. :::. :::.:::.::.::..::.:::.::::::::.:
CCDS77 TCSSHLLVVSLFYISSSLTYFWPKSNNSPESKKLLSLSYTVVTPMLNPIIYSLRNSEVKN
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KE0 TLIKLWRRKVILHTF
.: . ... . :
CCDS77 ALSRTFHKVLALRNCIP
310
>>CCDS31415.1 OR10A2 gene_id:341276|Hs108|chr11 (303 aa)
initn: 1187 init1: 1142 opt: 1171 Z-score: 959.0 bits: 185.6 E(32554): 4.3e-47
Smith-Waterman score: 1171; 58.1% identity (83.2% similar) in 298 aa overlap (15-311:1-298)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MKRQNQSCVVEFILLGFSNFP-ELQVQLFGVFLVIYVVTLMGNAIITVIISLNQSLHVPM
..::..: :.: :: .::.::.:::::: .: .. . :: ::
CCDS31 MSFSSLPTEIQSLLFLTFLTIYLVTLMGNCLIILVTLADPMLHSPM
10 20 30 40
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 YLFLLNLSVVEVSFSAVITPEMLVVLSTEKTMISFVGCFAQMYFILLFGGTECFLLGAMA
:.:: ::: .:..:. ::.:.:: .: .. : :::.:: .::::...:: .:::::..::
CCDS31 YFFLRNLSFLEIGFNLVIVPKMLGTLLAQDTTISFLGCATQMYFFFFFGVAECFLLATMA
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 YDRFAAICHPLNYPVIMNRGVFMKLVIFSWISGIMVATVQTTWVFSFPFCGPNEINHLFC
:::..::: ::.::::::. . ::. ::. :. ::::::::.::::::: :..::.::
CCDS31 YDRYVAICSPLHYPVIMNQRTRAKLAAASWFPGFPVATVQTTWLFSFPFCGTNKVNHFFC
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 ETPPVLELVCADTFLFEIYAFTGTILIVMVPFLLILLSYIRVLFAILKMPSTTGRQKAFS
..::::.:::::: ::::::..::::.::.: :::: :: .. ::::.::. :..::::
CCDS31 DSPPVLRLVCADTALFEIYAIVGTILVVMIPCLLILCSYTHIAAAILKIPSAKGKNKAFS
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 TCASHLTSVTLFYGTANMTYLQPKSGYSPETKKLISLAYTLLTPLLNPLIYSLRNSEMKR
::.::: :.::: . ..::..:::. ::: :::.::.::..::.:::.::::::.:.:
CCDS31 TCSSHLLVVSLFYISLSLTYFRPKSNNSPEGKKLLSLSYTVMTPMLNPIIYSLRNNEVKN
230 240 250 260 270 280
300 310
pF1KE0 TLIKLWRRKVILHTF
.: . . . :
CCDS31 ALSRTVSKALALRNCIP
290 300
>>CCDS7774.1 OR10A4 gene_id:283297|Hs108|chr11 (315 aa)
initn: 1180 init1: 1115 opt: 1152 Z-score: 943.7 bits: 182.8 E(32554): 3.1e-46
Smith-Waterman score: 1152; 54.5% identity (83.8% similar) in 308 aa overlap (1-307:1-308)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MKRQNQSCVVEFILLGFSNFP-ELQVQLFGVFLVIYVVTLMGNAIITVIISLNQSLHVPM
: .: . : ::.:..:: . :::. :: .::.::.::::::..: .. ...:. ::
CCDS77 MMWENWTIVSEFVLVSFSALSTELQALLFLLFLTIYLVTLMGNVLIILVTIADSALQSPM
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 YLFLLNLSVVEVSFSAVITPEMLVVLSTEKTMISFVGCFAQMYFILLFGGTECFLLGAMA
:.:: ::: .:..:. ::.:.:: .: . : :::.:: .::::...::..:: ::..::
CCDS77 YFFLRNLSFLEIGFNLVIVPKMLGTLIIQDTTISFLGCATQMYFFFFFGAAECCLLATMA
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 YDRFAAICHPLNYPVIMNRGVFMKLVIFSWISGIMVATVQTTWVFSFPFCGPNEINHLFC
:::..::: ::.:::::.. .:. ::.::. ::::::::.:::::::::..::.::
CCDS77 YDRYVAICDPLHYPVIMGHISCAQLAAASWFSGFSVATVQTTWIFSFPFCGPNRVNHFFC
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 ETPPVLELVCADTFLFEIYAFTGTILIVMVPFLLILLSYIRVLFAILKMPSTTGRQKAFS
..:::. :::::: .::. :.:.:.:... :::::: ::.:.: .:..:::. :...:::
CCDS77 DSPPVIALVCADTSVFELEALTATVLFILFPFLLILGSYVRILSTIFRMPSAEGKHQAFS
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 TCASHLTSVTLFYGTANMTYLQPKSGYSPETKKLISLAYTLLTPLLNPLIYSLRNSEMKR
::..:: :.:::.:: .::..:.:. : :.:::.::. :..::.:::.::: ::.:.:
CCDS77 TCSAHLLVVSLFYSTAILTYFRPQSSASSESKKLLSLSSTVVTPMLNPIIYSSRNKEVKA
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KE0 TLIKLWRRKVILHTF
.: .: .:
CCDS77 ALKRLIHRTLGSQKL
310
>>CCDS34364.1 OR10C1 gene_id:442194|Hs108|chr6 (312 aa)
initn: 1064 init1: 1024 opt: 1038 Z-score: 852.9 bits: 166.0 E(32554): 3.5e-41
Smith-Waterman score: 1038; 50.2% identity (79.7% similar) in 305 aa overlap (5-309:4-308)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MKRQNQSCVVEFILLGFSNFPELQVQLFGVFLVIYVVTLMGNAIITVIISLNQSLHVPMY
: : :.::.:::::.. .:: ::.:::.::..:. :: .:.:..: . .:. :::
CCDS34 MSANTSMVTEFLLLGFSHLADLQGLLFSVFLTIYLLTVAGNFLIVVLVSTDAALQSPMY
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]