Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE0823
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0823, 233 aa
1>>>pF1KE0823 233 - 233 aa - 233 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.0416+/-0.00107; mu= 15.7813+/- 0.063
mean_var=114.9699+/-34.729, 0's: 0 Z-trim(104.0): 357 B-trim: 845 in 2/47
Lambda= 0.119614
statistics sampled from 7268 (7705) to 7268 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.583), E-opt: 0.2 (0.237), width: 16
Scan time: 1.690
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS31542.1 OR9I1 gene_id:219954|Hs108|chr11 ( 314) 1072 196.3 1.9e-50
CCDS31544.1 OR9Q2 gene_id:219957|Hs108|chr11 ( 314) 763 143.0 2.1e-34
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CCDS31552.1 OR5B21 gene_id:219968|Hs108|chr11 ( 309) 701 132.3 3.5e-31
CCDS31511.1 OR5L2 gene_id:26338|Hs108|chr11 ( 311) 696 131.4 6.4e-31
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CCDS31551.1 OR5B12 gene_id:390191|Hs108|chr11 ( 314) 674 127.7 8.9e-30
CCDS31513.1 OR5W2 gene_id:390148|Hs108|chr11 ( 310) 671 127.1 1.3e-29
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CCDS31510.1 OR5D18 gene_id:219438|Hs108|chr11 ( 313) 622 118.7 4.5e-27
CCDS31706.1 OR8D1 gene_id:283159|Hs108|chr11 ( 308) 621 118.5 5e-27
CCDS43115.1 OR5K1 gene_id:26339|Hs108|chr3 ( 308) 621 118.5 5e-27
CCDS31550.1 OR5B2 gene_id:390190|Hs108|chr11 ( 309) 620 118.3 5.6e-27
CCDS53629.1 OR5M11 gene_id:219487|Hs108|chr11 ( 305) 619 118.1 6.3e-27
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CCDS31515.1 OR5F1 gene_id:338674|Hs108|chr11 ( 314) 614 117.3 1.2e-26
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CCDS31525.1 OR5T1 gene_id:390155|Hs108|chr11 ( 326) 611 116.8 1.7e-26
CCDS31528.1 OR8K1 gene_id:390157|Hs108|chr11 ( 319) 610 116.6 1.9e-26
CCDS33802.1 OR5K4 gene_id:403278|Hs108|chr3 ( 321) 609 116.5 2.1e-26
CCDS43433.1 OR2J3 gene_id:442186|Hs108|chr6 ( 311) 607 116.1 2.7e-26
CCDS43434.1 OR2J2 gene_id:26707|Hs108|chr6 ( 312) 607 116.1 2.7e-26
CCDS33804.1 OR5K2 gene_id:402135|Hs108|chr3 ( 316) 606 115.9 3e-26
CCDS31548.1 OR5B17 gene_id:219965|Hs108|chr11 ( 314) 603 115.4 4.3e-26
CCDS33803.1 OR5K3 gene_id:403277|Hs108|chr3 ( 321) 603 115.4 4.4e-26
>>CCDS31542.1 OR9I1 gene_id:219954|Hs108|chr11 (314 aa)
initn: 1072 init1: 1072 opt: 1072 Z-score: 1019.3 bits: 196.3 E(32554): 1.9e-50
Smith-Waterman score: 1072; 70.0% identity (89.3% similar) in 233 aa overlap (1-233:1-233)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MAKRNLSTVTEFILVVFTDHPELAVPLFLVFLSFYLVTFLGNGGMIILIQVDAQLHTPVY
::: ::. ::::::. : :::.: .:::::::::::::.::: :::.:::::..:.::.:
CCDS31 MAKNNLTRVTEFILMGFMDHPKLEIPLFLVFLSFYLVTLLGNVGMIMLIQVDVKLYTPMY
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pF1KE0 FFLSHLAFLDACCASVITPQILATLATDKTVISYGCRAVQFSFFTICAGTECYLLSVMAY
::::::..:::: .::::::::::::: ::::::: :.:: .:::::::::.::.::::
CCDS31 FFLSHLSLLDACYTSVITPQILATLATGKTVISYGHCAAQFFLFTICAGTECFLLAVMAY
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::..:: ::: ...:.: : ....:..::::::::.:::::::::: ::::::::::
CCDS31 DRYAAIRNPLLYTVAMNPRLCWSLVVGAYVCGVSGAILRTTCTFTLSFCKDNQINFFFCD
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190 200 210 220 230
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CCDS31 LPPLLKLACSDTANIEIVIIFFGNFVILANASVILISYLLIIKTILKVKSSGGRAKTFST
190 200 210 220 230 240
CCDS31 CASHITAVALFFGALIFMYLQSGSGKSLEEDKVVSVFYTVVIPMLNPLIYSLRNKDVKDA
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>>CCDS31544.1 OR9Q2 gene_id:219957|Hs108|chr11 (314 aa)
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10 20 30 40 50 60
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::.:: ..::::.:..::.: . :::::.::::::.:.::: :::.::. : .::::.:
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::::::...: : .:.: ::.::.: :.:: . :.:: .::. :. .::::..:::
CCDS31 FFLSHLSLVDICYSSAIIPQMLAVLWEHGTTISQARCAAQFFLFTFFASIDCYLLAIMAY
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pF1KE0 DRFVAISNPLHCNMTMTPGTCRVFLASAFICGVSGAILHTTCTFTLSFCCDNQINFFFCD
::..:. .:: .: . ....:.. : .:...:. .:::::: .:.:::.:::
CCDS31 DRYTAVCQPLLYVTIITEKARWGLVTGAYVAGFFSAFVRTVTAFTLSFCGNNEINFIFCD
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pF1KE0 LPPLLKLACSSMTQTEIVILLCAKCMFLANVMVILICYMLIIRAILRVKSAGG
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CCDS31 LPPLLKLSCGDSYTQEVVIIVFALFVMPACILVILVSYLFIIVAILQIHSAGGRAKTFST
190 200 210 220 230 240
CCDS31 CASHLTAVALFFGTLIFMYLRDNTGQSSEGDRVVSVLYTVVTPMLNPLIYSLRNKEVKEA
250 260 270 280 290 300
>>CCDS31543.1 OR9Q1 gene_id:219956|Hs108|chr11 (310 aa)
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Smith-Waterman score: 714; 47.4% identity (78.5% similar) in 228 aa overlap (1-228:1-228)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MAKRNLSTVTEFILVVFTDHPELAVPLFLVFLSFYLVTFLGNGGMIILIQVDAQLHTPVY
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CCDS31 MAEMNLTLVTEFLLIAFTEYPEWALPLFLLFLFMYLITVLGNLEMIILILMDHQLHAPMY
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pF1KE0 DRFVAISNPLHCNMTMTPGTCRVFLASAFICGVSGAILHTTCTFTLSFCCDNQINFFFCD
::..:. .:: .: . ..:.:.. :. .:...:. .:::::: ..:.:.:::
CCDS31 DRYLAVCQPLLYVTILTQQARLSLVAGAYVAGLISALVRTVSAFTLSFCGTSEIDFIFCD
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pF1KE0 LPPLLKLACSSMTQTEIVILLCAKCMFLANVMVILICYMLIIRAILRVKSAGG
:::::::.:. :..:.. : .. :...:::. :..:: ::. .
CCDS31 LPPLLKLTCGESYTQEVLIIMFAIFVIPASMVVILVSYLFIIVAIMGIPAGSQAKTFSTC
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CCDS31 TSHLTAVSLFFGTLIFMYLRGNSDQSSEKNRVVSVLYTEVIPMLNPLIYSLRNKEVKEAL
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>>CCDS31709.1 OR8B3 gene_id:390271|Hs108|chr11 (313 aa)
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pF1KE0 MAKRNLSTVTEFILVVFTDHPELAVPLFLVFLSFYLVTFLGNGGMIILIQVDAQLHTPVY
: :: : ::::::. .:::::. :::..:: :.::..:: :.:::. ....::::.:
CCDS31 MLARNNSLVTEFILAGLTDHPEFQQPLFFLFLVVYIVTMVGNLGLIILFGLNSHLHTPMY
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.:: .:.:.: : .::.::..: .... :..::: :: .:. :: . . .:::.:. ::
CCDS31 YFLFNLSFIDLCYSSVFTPKMLMNFVSKKNIISYVGC-MTQLFFFLFFVISECYMLTSMA
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:::.::: ::: ..::. .: .. .:.: :..:: :: : . :.:: : :: ..:
CCDS31 YDRYVAICNPLLYKVTMSHQVCSMLTFAAYIMGLAGATAHTGCMLRLTFCSANIINHYLC
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pF1KE0 DLPPLLKLACSSMTQTEIVILLCAKCMFLANVMVILICYMLIIRAILRVKSAGG
:. :::.:.:.: .:.:.:. . ... .::: :..:. .::..::. :
CCDS31 DILPLLQLSCTSTYVNEVVVLIVVGINIMVPSCTILISYVFIVTSILHIKSTQGRSKAFS
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CCDS31 TCSSHVIALSLFFGSAAFMYIKYSSGSMEQGKVSSVFYTNVVPMLNPLIYSLRNKDVKVA
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>>CCDS41647.1 OR8U1 gene_id:219417|Hs108|chr11 (309 aa)
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Smith-Waterman score: 703; 47.2% identity (74.7% similar) in 233 aa overlap (1-233:1-233)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MAKRNLSTVTEFILVVFTDHPELAVPLFLVFLSFYLVTFLGNGGMIILIQVDAQLHTPVY
::. : . .:::::: .::: :: .:::..:::.:: : .:: :.:.::..:..:.::.:
CCDS41 MAHINCTQATEFILVGLTDHQELKMPLFVLFLSIYLFTVVGNLGLILLIRADTSLNTPMY
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pF1KE0 FFLSHLAFLDACCASVITPQILATLATDKTVISYGCRAVQFSFFTICAGTECYLLSVMAY
::::.:::.: : .:::::..:... ..:::. :.:.. : .: ::. :::
CCDS41 FFLSNLAFVDFCYSSVITPKMLGNFLYKQNVISFDACATQLGCFLTFMISESLLLASMAY
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pF1KE0 DRFVAISNPLHCNMTMTPGTCRVFLASAFICGVSGAILHTTCTFTLSFCCDNQINFFFCD
::.::: ::: ..:::: : ..: . . :..:: :: ::.: .: .: :.::
CCDS41 DRYVAICNPLLYMVVMTPGICIQLVAVPYSYSFLMALFHTILTFRLSYCHSNIVNHFYCD
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pF1KE0 LPPLLKLACSSMTQTEIVILLCAKCMFLANVMVILICYMLIIRAILRVKSAGG
:::.:.::. .. :. :: ::......... ::.:: ::::..:: :
CCDS41 DMPLLRLTCSDTRFKQLWIFACAGIMFISSLLIVFVSYMFIISAILRMHSAEGRQKAFST
190 200 210 220 230 240
CCDS41 CGSHMLAVTIFYGTLIFMYLQPSSSHALDTDKMASVFYTVIIPMLNPLIYSLQNKEVKEA
250 260 270 280 290 300
>>CCDS31552.1 OR5B21 gene_id:219968|Hs108|chr11 (309 aa)
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Smith-Waterman score: 701; 47.0% identity (77.8% similar) in 230 aa overlap (5-233:3-230)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MAKRNLSTVTEFILVVFTDHPELAVPLFLVFLSFYLVTFLGNGGMIILIQVDAQLHTPVY
: . ::::::. .:: :.: .::.:.:: .::.:.::::::...:. :..::::.:
CCDS31 MENSTEVTEFILLGLTDDPNLQIPLLLAFLFIYLITLLGNGGMMVIIHSDSHLHTPMY
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pF1KE0 FFLSHLAFLDACCASVITPQILATLATDKTVISY-GCRAVQFSFFTICAGTECYLLSVMA
::::.:...: .:...:. .:.: . .::: :: :.:: ::. : .:::::. ::
CCDS31 FFLSNLSLVDLGYSSAVAPKTVAALRSGDKAISYDGC-AAQFFFFVGFATVECYLLASMA
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pF1KE0 YDRFVAISNPLHCNMTMTPGTCRVFLASAFICGVSGAILHTTCTFTLSFCCDNQINFFFC
::: .:. ::: . ::: :.: .. ..... : .: .:.. :: :::: .:.:: :::
CCDS31 YDRHAAVCRPLHYTTTMTAGVCALLATGSYVSGFLNASIHAAGTFRLSFCGSNEINHFFC
120 130 140 150 160 170
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pF1KE0 DLPPLLKLACSSMTQTEIVILLCAKCMFLANVMVILICYMLIIRAILRVKSAGG
:.:::: :.::. ...:... . .:.. ..:::: :..: .: :..:: :
CCDS31 DIPPLLALSCSDTRISKLVVFVAGFNVFFT-LLVILISYFFICITIQRMHSAEGQKKVFS
180 190 200 210 220 230
CCDS31 TCASHLTALSIFYGTIIFMYLQPNSSQSVDTDKIASVFYTVVIPMLNPLIYSLRNKEVKS
240 250 260 270 280 290
>>CCDS31511.1 OR5L2 gene_id:26338|Hs108|chr11 (311 aa)
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Smith-Waterman score: 696; 49.8% identity (76.0% similar) in 233 aa overlap (1-231:1-231)
10 20 30 40 50 60
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CCDS31 FFLSHLSFVDFCYSSIIVPKMLANIFNKDKAISFLGC-MVQFYLFCTCGVTEVFLLAVMA
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]