Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE0822
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0822, 232 aa
1>>>pF1KE0822 232 - 232 aa - 232 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.2881+/-0.00116; mu= 13.5932+/- 0.068
mean_var=76.9880+/-19.843, 0's: 0 Z-trim(101.8): 352 B-trim: 793 in 2/46
Lambda= 0.146172
statistics sampled from 6293 (6670) to 6293 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.557), E-opt: 0.2 (0.205), width: 16
Scan time: 1.920
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS31533.1 OR5M8 gene_id:219484|Hs108|chr11 ( 311) 1046 230.6 9.2e-61
CCDS31532.1 OR5M3 gene_id:219482|Hs108|chr11 ( 307) 1026 226.4 1.7e-59
CCDS31531.1 OR5M9 gene_id:390162|Hs108|chr11 ( 310) 1017 224.5 6.3e-59
CCDS53630.1 OR5M10 gene_id:390167|Hs108|chr11 ( 315) 968 214.1 8.3e-56
CCDS53631.1 OR5M1 gene_id:390168|Hs108|chr11 ( 315) 957 211.8 4.1e-55
CCDS53629.1 OR5M11 gene_id:219487|Hs108|chr11 ( 305) 910 201.9 3.9e-52
CCDS41647.1 OR8U1 gene_id:219417|Hs108|chr11 ( 309) 823 183.5 1.3e-46
CCDS31551.1 OR5B12 gene_id:390191|Hs108|chr11 ( 314) 736 165.2 4.4e-41
CCDS31560.1 OR5A2 gene_id:219981|Hs108|chr11 ( 324) 731 164.2 9.4e-41
CCDS31706.1 OR8D1 gene_id:283159|Hs108|chr11 ( 308) 727 163.3 1.6e-40
CCDS31552.1 OR5B21 gene_id:219968|Hs108|chr11 ( 309) 726 163.1 1.9e-40
CCDS31537.1 OR9G4 gene_id:283189|Hs108|chr11 ( 327) 721 162.1 4.1e-40
CCDS32042.1 OR5AU1 gene_id:390445|Hs108|chr14 ( 362) 721 162.1 4.4e-40
CCDS31521.1 OR8K5 gene_id:219453|Hs108|chr11 ( 307) 720 161.8 4.5e-40
CCDS31698.1 OR8D4 gene_id:338662|Hs108|chr11 ( 314) 719 161.6 5.3e-40
CCDS31525.1 OR5T1 gene_id:390155|Hs108|chr11 ( 326) 718 161.4 6.3e-40
CCDS31515.1 OR5F1 gene_id:338674|Hs108|chr11 ( 314) 711 159.9 1.7e-39
CCDS31516.1 OR5AS1 gene_id:219447|Hs108|chr11 ( 324) 710 159.7 2e-39
CCDS31520.1 OR8J3 gene_id:81168|Hs108|chr11 ( 315) 708 159.3 2.6e-39
CCDS31529.1 OR8J1 gene_id:219477|Hs108|chr11 ( 316) 708 159.3 2.7e-39
CCDS31517.1 OR8I2 gene_id:120586|Hs108|chr11 ( 310) 706 158.9 3.5e-39
CCDS31534.1 OR5AP2 gene_id:338675|Hs108|chr11 ( 316) 705 158.7 4.1e-39
CCDS31712.1 OR8A1 gene_id:390275|Hs108|chr11 ( 326) 698 157.2 1.2e-38
CCDS7782.1 OR5P2 gene_id:120065|Hs108|chr11 ( 322) 695 156.6 1.8e-38
CCDS31524.1 OR5T3 gene_id:390154|Hs108|chr11 ( 340) 695 156.6 1.9e-38
CCDS31523.1 OR5T2 gene_id:219464|Hs108|chr11 ( 359) 695 156.6 2e-38
CCDS31549.1 OR5B3 gene_id:441608|Hs108|chr11 ( 314) 690 155.5 3.7e-38
CCDS7949.1 OR5I1 gene_id:10798|Hs108|chr11 ( 314) 689 155.3 4.2e-38
CCDS31528.1 OR8K1 gene_id:390157|Hs108|chr11 ( 319) 689 155.3 4.3e-38
CCDS31814.1 OR9K2 gene_id:441639|Hs108|chr12 ( 335) 689 155.3 4.5e-38
CCDS31510.1 OR5D18 gene_id:219438|Hs108|chr11 ( 313) 686 154.7 6.6e-38
CCDS7783.1 OR5P3 gene_id:120066|Hs108|chr11 ( 311) 685 154.4 7.6e-38
CCDS66256.1 OR8G5 gene_id:219865|Hs108|chr11 ( 346) 684 154.3 9.5e-38
CCDS4641.1 OR2B2 gene_id:81697|Hs108|chr6 ( 357) 683 154.1 1.1e-37
CCDS31544.1 OR9Q2 gene_id:219957|Hs108|chr11 ( 314) 678 153.0 2.1e-37
CCDS73407.1 OR8G1 gene_id:26494|Hs108|chr11 ( 311) 675 152.3 3.3e-37
CCDS31512.1 OR5D16 gene_id:390144|Hs108|chr11 ( 328) 675 152.4 3.4e-37
CCDS31513.1 OR5W2 gene_id:390148|Hs108|chr11 ( 310) 673 151.9 4.4e-37
CCDS31709.1 OR8B3 gene_id:390271|Hs108|chr11 ( 313) 672 151.7 5.1e-37
CCDS31561.1 OR5A1 gene_id:219982|Hs108|chr11 ( 315) 672 151.7 5.1e-37
CCDS31522.1 OR5J2 gene_id:282775|Hs108|chr11 ( 312) 671 151.5 5.9e-37
CCDS4657.1 OR5V1 gene_id:81696|Hs108|chr6 ( 321) 670 151.3 6.9e-37
CCDS35124.1 OR1L8 gene_id:138881|Hs108|chr9 ( 309) 669 151.1 7.8e-37
CCDS4642.1 OR2B6 gene_id:26212|Hs108|chr6 ( 313) 667 150.7 1.1e-36
CCDS31511.1 OR5L2 gene_id:26338|Hs108|chr11 ( 311) 666 150.4 1.2e-36
CCDS11020.1 OR1G1 gene_id:8390|Hs108|chr17 ( 313) 666 150.4 1.2e-36
CCDS31711.1 OR8B12 gene_id:219858|Hs108|chr11 ( 310) 664 150.0 1.6e-36
CCDS31559.1 OR5AN1 gene_id:390195|Hs108|chr11 ( 311) 662 149.6 2.2e-36
CCDS34358.1 OR2B3 gene_id:442184|Hs108|chr6 ( 313) 662 149.6 2.2e-36
CCDS31538.1 OR5AK2 gene_id:390181|Hs108|chr11 ( 309) 659 149.0 3.4e-36
>>CCDS31533.1 OR5M8 gene_id:219484|Hs108|chr11 (311 aa)
initn: 1046 init1: 1046 opt: 1046 Z-score: 1204.4 bits: 230.6 E(32554): 9.2e-61
Smith-Waterman score: 1046; 71.6% identity (88.0% similar) in 225 aa overlap (1-225:80-304)
10 20 30
pF1KE0 MLENFLSEKKTISYAGCLMQCYVVIAVVLA
::: ::::::.::: .::.:::. ::.: .
CCDS31 ANAWLHMPMYFFLSHLSFVDLCFSSNVTPKMLEIFLSEKKSISYPACLVQCYLFIALVHV
50 60 70 80 90 100
40 50 60 70 80 90
pF1KE0 EHCMLAVMAYDRYMAICNPLLYSSKMSQGVCVHLVIVPYVYGFLLSVMETLRTYNLSFCG
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CCDS31 EIYILAVMAFDRYMAICNPLLYGSRMSKSVCSFLITVPYVYGALTGLMETMWTYNLAFCG
110 120 130 140 150 160
100 110 120 130 140 150
pF1KE0 TNEINHFYCADPPLIKLACSDTYSKELSMYIVAGYSNVQSLLIILTSYMFILVAILRSHS
::::::::::::::::::::::.:::::.::::.. ::.:: ::..:. :::. .:
CCDS31 PNEINHFYCADPPLIKLACSDTYNKELSMFIVAGWNLSFSLFIICISYLYIFPAILKIRS
170 180 190 200 210 220
160 170 180 190 200 210
pF1KE0 AEGRKKAFSTCGSHLTVVTIFYGTLFCMHLRRPTDESVEQGKMVAVFYTTVILMLNSMIY
.:::.:::::::::::.:::::.::: :.:: :. ::::::::::::::::: ::: .::
CCDS31 TEGRQKAFSTCGSHLTAVTIFYATLFFMYLRPPSKESVEQGKMVAVFYTTVIPMLNLIIY
230 240 250 260 270 280
220 230
pF1KE0 GLRNKDVKEALKKAIGKQTLGK
.::::.::::: : .
CCDS31 SLRNKNVKEALIKELSMKIYFS
290 300 310
>>CCDS31532.1 OR5M3 gene_id:219482|Hs108|chr11 (307 aa)
initn: 1054 init1: 1026 opt: 1026 Z-score: 1181.7 bits: 226.4 E(32554): 1.7e-59
Smith-Waterman score: 1026; 68.3% identity (86.3% similar) in 227 aa overlap (1-227:79-305)
10 20 30
pF1KE0 MLENFLSEKKTISYAGCLMQCYVVIAVVLA
::::.::.::::.:::::.::. ::.: .
CCDS31 VSPQLNNPMYFFLSHLSFVDVWFSSNVTPKMLENLLSDKKTITYAGCLVQCFFFIALVHV
50 60 70 80 90 100
40 50 60 70 80 90
pF1KE0 EHCMLAVMAYDRYMAICNPLLYSSKMSQGVCVHLVIVPYVYGFLLSVMETLRTYNLSFCG
: .::.::.:::::: :::::.::::. ::..:. ::.:::: :. :: ::.: :::
CCDS31 EIFILAAMAFDRYMAIGNPLLYGSKMSRVVCIRLITFPYIYGFLTSLAATLWTYGLYFCG
110 120 130 140 150 160
100 110 120 130 140 150
pF1KE0 TNEINHFYCADPPLIKLACSDTYSKELSMYIVAGYSNVQSLLIILTSYMFILVAILRSHS
::::::::::::::.::. :. :: .: :.:: . . :: .:. ::.:::.:::: .:
CCDS31 KIEINHFYCADPPLIKMACAGTFVKEYTMIILAGINFTYSLTVIIISYLFILIAILRMRS
170 180 190 200 210 220
160 170 180 190 200 210
pF1KE0 AEGRKKAFSTCGSHLTVVTIFYGTLFCMHLRRPTDESVEQGKMVAVFYTTVILMLNSMIY
::::.:::::::::::.: ::::::. :.:::::.::::::::::::::::: ::: :::
CCDS31 AEGRQKAFSTCGSHLTAVIIFYGTLIFMYLRRPTEESVEQGKMVAVFYTTVIPMLNPMIY
230 240 250 260 270 280
220 230
pF1KE0 GLRNKDVKEALKKAIGKQTLGK
.:::::::.:. :.:..
CCDS31 SLRNKDVKKAMMKVISRSC
290 300
>>CCDS31531.1 OR5M9 gene_id:390162|Hs108|chr11 (310 aa)
initn: 1058 init1: 1017 opt: 1017 Z-score: 1171.4 bits: 224.5 E(32554): 6.3e-59
Smith-Waterman score: 1017; 68.3% identity (87.2% similar) in 227 aa overlap (1-227:79-305)
10 20 30
pF1KE0 MLENFLSEKKTISYAGCLMQCYVVIAVVLA
::::.::: :::::.:::.::: :::: .
CCDS31 ISPQLQSPMYFFLSHLSFADVCFSSNVTPKMLENLLSETKTISYVGCLVQCYFFIAVVHV
50 60 70 80 90 100
40 50 60 70 80 90
pF1KE0 EHCMLAVMAYDRYMAICNPLLYSSKMSQGVCVHLVIVPYVYGFLLSVMETLRTYNLSFCG
: .:::::.::::: ::::::.::::. :::.:. ::::::: .:.. :: ::.: :::
CCDS31 EVYILAVMAFDRYMAGCNPLLYGSKMSRTVCVRLISVPYVYGFSVSLICTLWTYGLYFCG
110 120 130 140 150 160
100 110 120 130 140 150
pF1KE0 TNEINHFYCADPPLIKLACSDTYSKELSMYIVAGYSNVQSLLIILTSYMFILVAILRSHS
. :::::::::::::..::. .. ::..: ..:: . . :: ..: :: .:.::.:: .:
CCDS31 NFEINHFYCADPPLIQIACGRVHIKEITMIVIAGINFTYSLSVVLISYTLIVVAVLRMRS
170 180 190 200 210 220
160 170 180 190 200 210
pF1KE0 AEGRKKAFSTCGSHLTVVTIFYGTLFCMHLRRPTDESVEQGKMVAVFYTTVILMLNSMIY
:.::.:::::::::::.:..:::: . :.:::::.::::::::::::::::: ::: :::
CCDS31 ADGRRKAFSTCGSHLTAVSMFYGTPIFMYLRRPTEESVEQGKMVAVFYTTVIPMLNPMIY
230 240 250 260 270 280
220 230
pF1KE0 GLRNKDVKEALKKAIGKQTLGK
.:::::::::..::: :
CCDS31 SLRNKDVKEAVNKAITKTYVRQ
290 300 310
>>CCDS53630.1 OR5M10 gene_id:390167|Hs108|chr11 (315 aa)
initn: 956 init1: 956 opt: 968 Z-score: 1115.4 bits: 214.1 E(32554): 8.3e-56
Smith-Waterman score: 968; 60.8% identity (86.2% similar) in 232 aa overlap (1-232:81-312)
10 20 30
pF1KE0 MLENFLSEKKTISYAGCLMQCYVVIAVVLA
::.:::::.::::::::. :: . ::.:..
CCDS53 TNSQLQTPMYFFLGHLSFVDICYSSNVTPNMLHNFLSEQKTISYAGCFTQCLLFIALVIT
60 70 80 90 100 110
40 50 60 70 80 90
pF1KE0 EHCMLAVMAYDRYMAICNPLLYSSKMSQGVCVHLVIVPYVYGFLLSVMETLRTYNLSFCG
: .:: :: :::.:::.:: :::.::...:. :: :::.:::: .. .:: :..:::::
CCDS53 EFYFLASMALDRYVAICSPLHYSSRMSKNICISLVTVPYMYGFLNGLSQTLLTFHLSFCG
120 130 140 150 160 170
100 110 120 130 140 150
pF1KE0 TNEINHFYCADPPLIKLACSDTYSKELSMYIVAGYSNVQSLLIILTSYMFILVAILRSHS
. ::::::::::::: :::::: :...:..:::.. .::.::: ::.::..::.: .:
CCDS53 SLEINHFYCADPPLIMLACSDTRVKKMAMFVVAGFTLSSSLFIILLSYLFIFAAIFRIRS
180 190 200 210 220 230
160 170 180 190 200 210
pF1KE0 AEGRKKAFSTCGSHLTVVTIFYGTLFCMHLRRPTDESVEQGKMVAVFYTTVILMLNSMIY
::::.::::::.::::.::.::::::::..: :...:::..:..::::: . ::: .::
CCDS53 AEGRHKAFSTCASHLTIVTLFYGTLFCMYVRPPSEKSVEESKIIAVFYTFLSPMLNPLIY
240 250 260 270 280 290
220 230
pF1KE0 GLRNKDVKEALKKAIGKQTLGK
.:::.:: :... : ... :
CCDS53 SLRNRDVILAIQQMIRGKSFCKIAV
300 310
>>CCDS53631.1 OR5M1 gene_id:390168|Hs108|chr11 (315 aa)
initn: 943 init1: 943 opt: 957 Z-score: 1102.9 bits: 211.8 E(32554): 4.1e-55
Smith-Waterman score: 957; 60.3% identity (85.3% similar) in 232 aa overlap (1-232:81-312)
10 20 30
pF1KE0 MLENFLSEKKTISYAGCLMQCYVVIAVVLA
::.:::::.::::::::. :: . ::.:..
CCDS53 TNSHLQTPMYFFLGHLSFVDICYSSNVTPNMLHNFLSEQKTISYAGCFTQCLLFIALVIT
60 70 80 90 100 110
40 50 60 70 80 90
pF1KE0 EHCMLAVMAYDRYMAICNPLLYSSKMSQGVCVHLVIVPYVYGFLLSVMETLRTYNLSFCG
: .:: :: :::.:::.:: :::.::...:: :: .::.:::: . ..: :..:::::
CCDS53 EFYILASMALDRYVAICSPLHYSSRMSKNICVCLVTIPYMYGFLSGFSQSLLTFHLSFCG
120 130 140 150 160 170
100 110 120 130 140 150
pF1KE0 TNEINHFYCADPPLIKLACSDTYSKELSMYIVAGYSNVQSLLIILTSYMFILVAILRSHS
. ::::::::::::: :::::: :...:..:::.. .::.::: ::.::..::.: .:
CCDS53 SLEINHFYCADPPLIMLACSDTRVKKMAMFVVAGFNLSSSLFIILLSYLFIFAAIFRIRS
180 190 200 210 220 230
160 170 180 190 200 210
pF1KE0 AEGRKKAFSTCGSHLTVVTIFYGTLFCMHLRRPTDESVEQGKMVAVFYTTVILMLNSMIY
::::.::::::.::::.::.::::::::..: :...:::..:..::::: . ::: .::
CCDS53 AEGRHKAFSTCASHLTIVTLFYGTLFCMYVRPPSEKSVEESKITAVFYTFLSPMLNPLIY
240 250 260 270 280 290
220 230
pF1KE0 GLRNKDVKEALKKAIGKQTLGK
.::: :: :... : ... :
CCDS53 SLRNTDVILAMQQMIRGKSFHKIAV
300 310
>>CCDS53629.1 OR5M11 gene_id:219487|Hs108|chr11 (305 aa)
initn: 925 init1: 900 opt: 910 Z-score: 1049.5 bits: 201.9 E(32554): 3.9e-52
Smith-Waterman score: 910; 60.9% identity (84.4% similar) in 225 aa overlap (1-225:81-304)
10 20 30
pF1KE0 MLENFLSEKKTISYAGCLMQCYVVIAVVLA
: :..::: :::.:::. :::. ::..:.
CCDS53 LDSRLHTPMYFFLTNLAFVDLCYTSNATPQMSTNIVSEK-TISFAGCFTQCYIFIALLLT
60 70 80 90 100
40 50 60 70 80 90
pF1KE0 EHCMLAVMAYDRYMAICNPLLYSSKMSQGVCVHLVIVPYVYGFLLSVMETLRTYNLSFCG
: :::.::::::.:: .:: :: : :. ::. :. :::::: ...... :. :.::
CCDS53 EFYMLAAMAYDRYVAIYDPLRYSVKTSRRVCICLATFPYVYGFSDGLFQAILTFRLTFCR
110 120 130 140 150 160
100 110 120 130 140 150
pF1KE0 TNEINHFYCADPPLIKLACSDTYSKELSMYIVAGYSNVQSLLIILTSYMFILVAILRSHS
.. ::::::::::::::.::::: :: .:.: ::.. .:: :.:.:: :::.:::: .:
CCDS53 SSVINHFYCADPPLIKLSCSDTYVKEHAMFISAGFNLSSSLTIVLVSYAFILAAILRIKS
170 180 190 200 210 220
160 170 180 190 200 210
pF1KE0 AEGRKKAFSTCGSHLTVVTIFYGTLFCMHLRRPTDESVEQGKMVAVFYTTVILMLNSMIY
::::.:::::::::. .::.::::::::..: :::..::..:..::::: : .:: .::
CCDS53 AEGRHKAFSTCGSHMMAVTLFYGTLFCMYIRPPTDKTVEESKIIAVFYTFVSPVLNPLIY
230 240 250 260 270 280
220 230
pF1KE0 GLRNKDVKEALKKAIGKQTLGK
.:::::::.:::...
CCDS53 SLRNKDVKQALKNVLR
290 300
>>CCDS41647.1 OR8U1 gene_id:219417|Hs108|chr11 (309 aa)
initn: 866 init1: 823 opt: 823 Z-score: 950.3 bits: 183.5 E(32554): 1.3e-46
Smith-Waterman score: 823; 53.8% identity (80.4% similar) in 225 aa overlap (1-225:81-305)
10 20 30
pF1KE0 MLENFLSEKKTISYAGCLMQCYVVIAVVLA
:: ::: ....::. .: : .. ...
CCDS41 ADTSLNTPMYFFLSNLAFVDFCYSSVITPKMLGNFLYKQNVISFDACATQLGCFLTFMIS
60 70 80 90 100 110
40 50 60 70 80 90
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100 110 120 130 140 150
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CCDS41 SNIVNHFYCDDMPLLRLTCSDTRFKQLWIFACAGIMFISSLLIVFVSYMFIISAILRMHS
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160 170 180 190 200 210
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220 230
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CCDS41 SLQNKEVKEALKKIIINKN
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CCDS31 SLRNKEVKSAFKKTVGKAKASIGFIF
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CCDS31 ECFLLAAMAYDRYAAICNPLLYTVLISHTLCLKMVVGAYVGGFLSSFIETYSVYQHDFCG
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CCDS31 PYMINHFFCDLPPVLALSCSDTFTSEVVTFIVSVVVGIVSVLVVLISYGYIVAAVVKISS
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CCDS31 ATGRTKAFSTCASHLTAVTLFYGSGFFMYMRPSSSYSLNRDKVVSIFYALVIPVVNPIIY
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CCDS31 SFRNKEIKNAMRKAMERDPGISHGGPFIFMTLG
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10 20 30
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]