Result of FASTA (omim) for
pFN21AE0760
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0760, 432 aa
1>>>pF1KE0760 432 - 432 aa - 432 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.0195+/-0.000693; mu= 17.0914+/- 0.043
mean_var=290.0056+/-59.353, 0's: 0 Z-trim(112.6): 2071 B-trim: 114 in 2/54
Lambda= 0.075313
statistics sampled from 19213 (21562) to 19213 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.576), E-opt: 0.2 (0.253), width: 16
Scan time: 7.510
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_001073376 (OMIM: 606043) zinc finger protein 33 ( 463) 1497 177.2 7.7e-44
NP_001073375 (OMIM: 606043) zinc finger protein 33 ( 463) 1497 177.2 7.7e-44
NP_001304047 (OMIM: 606043) zinc finger protein 33 ( 463) 1497 177.2 7.7e-44
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NP_001304050 (OMIM: 606043) zinc finger protein 33 ( 463) 1497 177.2 7.7e-44
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XP_016882428 (OMIM: 606043) PREDICTED: zinc finger ( 463) 1497 177.2 7.7e-44
NP_001304048 (OMIM: 606043) zinc finger protein 33 ( 463) 1497 177.2 7.7e-44
XP_011525378 (OMIM: 606043) PREDICTED: zinc finger ( 463) 1497 177.2 7.7e-44
XP_016882427 (OMIM: 606043) PREDICTED: zinc finger ( 463) 1497 177.2 7.7e-44
NP_001304043 (OMIM: 606043) zinc finger protein 33 ( 463) 1497 177.2 7.7e-44
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XP_016882425 (OMIM: 606043) PREDICTED: zinc finger ( 463) 1497 177.2 7.7e-44
XP_016882426 (OMIM: 606043) PREDICTED: zinc finger ( 463) 1497 177.2 7.7e-44
NP_001240729 (OMIM: 606043) zinc finger protein 33 ( 463) 1497 177.2 7.7e-44
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NP_001276331 (OMIM: 604077) zinc finger protein 13 ( 616) 1373 164.0 1e-39
XP_016882731 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 621) 1373 164.0 1e-39
XP_016882730 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 628) 1373 164.0 1e-39
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XP_006723425 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 670) 1373 164.0 1e-39
NP_003427 (OMIM: 604077) zinc finger protein 135 i ( 670) 1373 164.0 1e-39
XP_005259268 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 670) 1373 164.0 1e-39
XP_006723426 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 670) 1373 164.0 1e-39
NP_009065 (OMIM: 604077) zinc finger protein 135 i ( 682) 1373 164.0 1e-39
NP_653291 (OMIM: 615600) zinc finger protein 582 i ( 517) 1370 163.5 1.2e-39
NP_001307300 (OMIM: 615600) zinc finger protein 58 ( 548) 1370 163.5 1.2e-39
NP_001291422 (OMIM: 194527) zinc finger protein 23 ( 585) 1359 162.4 2.8e-39
NP_001291423 (OMIM: 194527) zinc finger protein 23 ( 585) 1359 162.4 2.8e-39
NP_666016 (OMIM: 194527) zinc finger protein 23 is ( 643) 1359 162.5 2.9e-39
NP_001291421 (OMIM: 194527) zinc finger protein 23 ( 643) 1359 162.5 2.9e-39
XP_016881832 (OMIM: 614275) PREDICTED: zinc finger ( 434) 1348 161.0 5.6e-39
XP_016881831 (OMIM: 614275) PREDICTED: zinc finger ( 434) 1348 161.0 5.6e-39
XP_011524816 (OMIM: 614275) PREDICTED: zinc finger ( 499) 1348 161.1 6e-39
XP_011524814 (OMIM: 614275) PREDICTED: zinc finger ( 499) 1348 161.1 6e-39
NP_001035939 (OMIM: 614275) zinc finger protein 56 ( 499) 1348 161.1 6e-39
NP_689690 (OMIM: 614275) zinc finger protein 565 [ ( 499) 1348 161.1 6e-39
XP_016881830 (OMIM: 614275) PREDICTED: zinc finger ( 499) 1348 161.1 6e-39
NP_001273627 (OMIM: 194552) zinc finger protein 79 ( 364) 1346 160.6 6e-39
XP_006717342 (OMIM: 194552) PREDICTED: zinc finger ( 474) 1346 160.8 6.8e-39
NP_001273626 (OMIM: 194552) zinc finger protein 79 ( 474) 1346 160.8 6.8e-39
NP_001273625 (OMIM: 194552) zinc finger protein 79 ( 474) 1346 160.8 6.8e-39
>>NP_001073376 (OMIM: 606043) zinc finger protein 331 [H (463 aa)
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.::.:: ::: .: :..:.:::: ::::.:.::::::: : .::.:.:::::: :: :
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>>NP_001073375 (OMIM: 606043) zinc finger protein 331 [H (463 aa)
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>>NP_001304047 (OMIM: 606043) zinc finger protein 331 [H (463 aa)
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pF1KE0 MPHSPLISIPHVWCHPEEEERMHDELLQAVSKGPVMFRDVSIDFSQEEWECLDADQMNLY
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NP_001 MAQGLVTFADVAIDFSQEEWACLNSAQRDLY
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pF1KE0 KEVMLENFSNLVSVGL-----SNSKPAVISLLEQGKEPWMVDRELTRGLCSDLESMCETK
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>>XP_016882429 (OMIM: 606043) PREDICTED: zinc finger pro (463 aa)
initn: 1321 init1: 1321 opt: 1497 Z-score: 908.1 bits: 177.2 E(85289): 7.7e-44
Smith-Waterman score: 1497; 53.8% identity (75.5% similar) in 413 aa overlap (30-432:1-407)
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pF1KE0 MPHSPLISIPHVWCHPEEEERMHDELLQAVSKGPVMFRDVSIDFSQEEWECLDADQMNLY
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XP_016 MAQGLVTFADVAIDFSQEEWACLNSAQRDLY
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