Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE0733
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0733, 311 aa
1>>>pF1KE0733 311 - 311 aa - 311 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.7226+/-0.000777; mu= 0.2626+/- 0.046
mean_var=255.0587+/-55.037, 0's: 0 Z-trim(116.5): 476 B-trim: 3 in 1/52
Lambda= 0.080307
statistics sampled from 16492 (17112) to 16492 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.829), E-opt: 0.2 (0.526), width: 16
Scan time: 3.100
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS14312.1 PIM2 gene_id:11040|Hs108|chrX ( 311) 2214 269.0 3.3e-72
CCDS33678.1 PIM3 gene_id:415116|Hs108|chr22 ( 326) 1197 151.2 1e-36
CCDS4830.1 PIM1 gene_id:5292|Hs108|chr6 ( 313) 1146 145.3 5.9e-35
CCDS43075.1 SNRK gene_id:54861|Hs108|chr3 ( 765) 486 69.2 1.2e-11
CCDS2545.1 PASK gene_id:23178|Hs108|chr2 (1323) 483 69.1 2.2e-11
CCDS53651.1 MARK2 gene_id:2011|Hs108|chr11 ( 709) 461 66.3 8.1e-11
CCDS53650.1 MARK2 gene_id:2011|Hs108|chr11 ( 719) 461 66.3 8.2e-11
CCDS8051.2 MARK2 gene_id:2011|Hs108|chr11 ( 724) 461 66.3 8.3e-11
CCDS41665.1 MARK2 gene_id:2011|Hs108|chr11 ( 745) 461 66.3 8.4e-11
CCDS53649.1 MARK2 gene_id:2011|Hs108|chr11 ( 788) 461 66.3 8.8e-11
>>CCDS14312.1 PIM2 gene_id:11040|Hs108|chrX (311 aa)
initn: 2214 init1: 2214 opt: 2214 Z-score: 1409.8 bits: 269.0 E(32554): 3.3e-72
Smith-Waterman score: 2214; 100.0% identity (100.0% similar) in 311 aa overlap (1-311:1-311)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MLTKPLQGPPAPPGTPTPPPGGKDREAFEAEYRLGPLLGKGGFGTVFAGHRLTDRLQVAI
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CCDS14 MLTKPLQGPPAPPGTPTPPPGGKDREAFEAEYRLGPLLGKGGFGTVFAGHRLTDRLQVAI
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 KVIPRNRVLGWSPLSDSVTCPLEVALLWKVGAGGGHPGVIRLLDWFETQEGFMLVLERPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 KVIPRNRVLGWSPLSDSVTCPLEVALLWKVGAGGGHPGVIRLLDWFETQEGFMLVLERPL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 PAQDLFDYITEKGPLGEGPSRCFFGQVVAAIQHCHSRGVVHRDIKDENILIDLRRGCAKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 PAQDLFDYITEKGPLGEGPSRCFFGQVVAAIQHCHSRGVVHRDIKDENILIDLRRGCAKL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 IDFGSGALLHDEPYTDFDGTRVYSPPEWISRHQYHALPATVWSLGILLYDMVCGDIPFER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 IDFGSGALLHDEPYTDFDGTRVYSPPEWISRHQYHALPATVWSLGILLYDMVCGDIPFER
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 DQEILEAELHFPAHVSPDCCALIRRCLAPKPSSRPSLEEILLDPWMQTPAEDVPLNPSKG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 DQEILEAELHFPAHVSPDCCALIRRCLAPKPSSRPSLEEILLDPWMQTPAEDVPLNPSKG
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE0 GPAPLAWSLLP
:::::::::::
CCDS14 GPAPLAWSLLP
310
>>CCDS33678.1 PIM3 gene_id:415116|Hs108|chr22 (326 aa)
initn: 1013 init1: 1013 opt: 1197 Z-score: 772.7 bits: 151.2 E(32554): 1e-36
Smith-Waterman score: 1197; 61.9% identity (78.0% similar) in 291 aa overlap (6-294:12-301)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MLTKPLQGPPAPPGTPTP--PPGGKDREAFEAEYRLGPLLGKGGFGTVFAGHRL
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CCDS33 MLLSKFGSLAHLCGPGGVDHLPVKILQPAKADKESFEKAYQVGAVLGSGGFGTVYAGSRI
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 TDRLQVAIKVIPRNRVLGWSPLSDSVTCPLEVALLWKVGAGGGHPGVIRLLDWFETQEGF
.: : ::.: . ..:: :. :. . : ::::.:: ::::.:: :::::::::: .::
CCDS33 ADGLPVAVKHVVKERVTEWGSLGGA-TVPLEVVLLRKVGAAGGARGVIRLLDWFERPDGF
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 MLVLERPLPAQDLFDYITEKGPLGEGPSRCFFGQVVAAIQHCHSRGVVHRDIKDENILID
.:::::: :::::::.:::.: : : .: ::.::.::..:::: :::::::::::.:.:
CCDS33 LLVLERPEPAQDLFDFITERGALDEPLARRFFAQVLAAVRHCHSCGVVHRDIKDENLLVD
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 LRRGCAKLIDFGSGALLHDEPYTDFDGTRVYSPPEWISRHQYHALPATVWSLGILLYDMV
:: : :::::::::::.: :::::::::::::::: :.::. :::::::.::::::
CCDS33 LRSGELKLIDFGSGALLKDTVYTDFDGTRVYSPPEWIRYHRYHGRSATVWSLGVLLYDMV
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 CGDIPFERDQEILEAELHFPAHVSPDCCALIRRCLAPKPSSRPSLEEILLDPWMQTPAED
:::::::.:.:::...: : .:::.: ::: ::. .:: ::::..: :::
CCDS33 CGDIPFEQDEEILRGRLLFRRRVSPECQQLIRWCLSLRPSERPSLDQIAAHPWMLGADGG
240 250 260 270 280 290
300 310
pF1KE0 VPLNPSKGGPAPLAWSLLP
::
CCDS33 VPESCDLRLCTLDPDDVASTTSSSESL
300 310 320
>>CCDS4830.1 PIM1 gene_id:5292|Hs108|chr6 (313 aa)
initn: 907 init1: 907 opt: 1146 Z-score: 741.0 bits: 145.3 E(32554): 5.9e-35
Smith-Waterman score: 1146; 56.3% identity (77.2% similar) in 302 aa overlap (6-304:12-311)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MLTKPLQGPPAPPGTPTPPPGGKDREAFEAEYRLGPLLGKGGFGTVFAGHRLTD
:.. : : ::..: .:..:..:::::.::::.:..: :..:
CCDS48 MLLSKINSLAHLRAAPCNDLHATKLAPGKEKEPLESQYQVGPLLGSGGFGSVYSGIRVSD
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 RLQVAIKVIPRNRVLGWSPLSDSVTCPLEVALLWKVGAGGGHPGVIRLLDWFETQEGFML
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CCDS48 NLPVAIKHVEKDRISDWGELPNGTRVPMEVVLLKKVSS--GFSGVIRLLDWFERPDSFVL
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 VLERPLPAQDLFDYITEKGPLGEGPSRCFFGQVVAAIQHCHSRGVVHRDIKDENILIDLR
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CCDS48 ILERPEPVQDLFDFITERGALQEELARSFFWQVLEAVRHCHNCGVLHRDIKDENILIDLN
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 RGCAKLIDFGSGALLHDEPYTDFDGTRVYSPPEWISRHQYHALPATVWSLGILLYDMVCG
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CCDS48 RGELKLIDFGSGALLKDTVYTDFDGTRVYSPPEWIRYHRYHGRSAAVWSLGILLYDMVCG
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 DIPFERDQEILEAELHFPAHVSPDCCALIRRCLAPKPSSRPSLEEILLDPWMQT---PAE
:::::.:.::..... : .:: .: ::: ::: .::.::..::: :::: : :
CCDS48 DIPFEHDEEIIRGQVFFRQRVSSECQHLIRWCLALRPSDRPTFEEIQNHPWMQDVLLPQE
240 250 260 270 280 290
300 310
pF1KE0 DVPLNPSKGGPAPLAWSLLP
. .. . .:.:
CCDS48 TAEIHLHSLSPGPSK
300 310
>>CCDS43075.1 SNRK gene_id:54861|Hs108|chr3 (765 aa)
initn: 461 init1: 203 opt: 486 Z-score: 322.9 bits: 69.2 E(32554): 1.2e-11
Smith-Waterman score: 507; 36.9% identity (62.4% similar) in 282 aa overlap (32-295:16-284)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 LTKPLQGPPAPPGTPTPPPGGKDREAFEAEYRLGPLLGKGGFGTV-FAGHRLTDRLQVAI
: : ::.: :..: .: : .: . .::.
CCDS43 MAGFKRGYDGKIAGLYDLDKTLGRGHFAVVKLARHVFTGE-KVAV
10 20 30 40
70 80 90 100 110
pF1KE0 KVIPRNRV--LGWSPLSDSVTCPLEVALLWKVGAGGGHPGVIRLLDWFETQEGFMLVLER
::: .... :. . : . : : . :. ::...:: . ..:: ..:.::
CCDS43 KVIDKTKLDTLATGHLFQEVRC---MKLVQ-------HPNIVRLYEVIDTQTKLYLILEL
50 60 70 80 90
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 PLPAQDLFDYIT--EKGPLGEGPSRCFFGQVVAAIQHCHSRGVVHRDIKDENILIDLRRG
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CCDS43 G-DGGDMFDYIMKHEEG-LNEDLAKKYFAQIVHAISYCHKLHVVHRDLKPENVVFFEKQG
100 110 120 130 140 150
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 CAKLIDFG-SGALLHDEPYTDFDGTRVYSPPEWISRHQYHALPATVWSLGILLYDMVCGD
.:: ::: :. . . : :. .:: :: . .: : . .::::..:. .:::.
CCDS43 LVKLTDFGFSNKFQPGKKLTTSCGSLAYSAPEILLGDEYDAPAVDIWSLGVILFMLVCGQ
160 170 180 190 200 210
240 250 260 270 280
pF1KE0 IPFER--DQE----ILEAELHFPAHVSPDCCALIRRCLAPKPSSRPSLEEILLDPWMQ--
::.. :.: :.. . :.::: .: :: : : :. : ::::: ::.:
CCDS43 PPFQEANDSETLTMIMDCKYTVPSHVSKECKDLITRMLQRDPKRRASLEEIENHPWLQGV
220 230 240 250 260 270
290 300 310
pF1KE0 --TPAE--DVPLNPSKGGPAPLAWSLLP
.:: ..::
CCDS43 DPSPATKYNIPLVSYKNLSEEEHNSIIQRMVLGDIADRDAIVEALETNRYNHITATYFLL
280 290 300 310 320 330
>>CCDS2545.1 PASK gene_id:23178|Hs108|chr2 (1323 aa)
initn: 419 init1: 351 opt: 483 Z-score: 318.0 bits: 69.1 E(32554): 2.2e-11
Smith-Waterman score: 483; 35.9% identity (60.2% similar) in 284 aa overlap (19-289:979-1254)
10 20 30 40
pF1KE0 MLTKPLQGPPAPPGTPTPPPGGKDRE---AFEAEYR-----LGPLLGK
:: . . : : :.:: ..:: :.
CCDS25 SLPGSTHSTAAELTGPSLVEVLRARPWFEEPPKAVELEGLAACEGEYSQKYSTMSPL-GS
950 960 970 980 990 1000
50 60 70 80 90
pF1KE0 GGFGTVFAGHRLTDRLQVAIKVIPRNRVLG--W--SPLSDSVTCPLEVALLWKVGAGGGH
:.:: :... .:..: : ...:: : .: .:: ::.:.: .: :
CCDS25 GAFGFVWTAVDKEKNKEVVVKFIKKEKVLEDCWIEDPKLGKVT--LEIAILSRVE----H
1010 1020 1030 1040 1050 1060
100 110 120 130 140 150
pF1KE0 PGVIRLLDWFETQEGFMLVLERPLPAQDLFDYITEKGPLGEGPSRCFFGQVVAAIQHCHS
..:..:: ::.: :.::.:. . ::: .: .. : : . .: :.:.:. . .
CCDS25 ANIIKVLDIFENQGFFQLVMEKHGSGLDLFAFIDRHPRLDEPLASYIFRQLVSAVGYLRL
1070 1080 1090 1100 1110 1120
160 170 180 190 200 210
pF1KE0 RGVVHRDIKDENILIDLRRGCAKLIDFGSGALLH-DEPYTDFDGTRVYSPPEWISRHQYH
. ..:::::::::.: . :::::::.: :. . . : :: : :: . . :.
CCDS25 KDIIHRDIKDENIVIA-EDFTIKLIDFGSAAYLERGKLFYTFCGTIEYCAPEVLMGNPYR
1130 1140 1150 1160 1170 1180
220 230 240 250 260 270
pF1KE0 ALPATVWSLGILLYDMVCGDIPFERDQEILEAELHFPAHVSPDCCALIRRCLAPKPSSRP
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CCDS25 GPELEMWSLGVTLYTLVFEENPFCELEETVEAAIHPPYLVSKELMSLVSGLLQPVPERRT
1190 1200 1210 1220 1230 1240
280 290 300 310
pF1KE0 SLEEILLDPWMQTPAEDVPLNPSKGGPAPLAWSLLP
.::... :::. :
CCDS25 TLEKLVTDPWVTQPVNLADYTWEEVFRVNKPESGVLSAASLEMGNRSLSDVAQAQELCGG
1250 1260 1270 1280 1290 1300
>>CCDS53651.1 MARK2 gene_id:2011|Hs108|chr11 (709 aa)
initn: 465 init1: 259 opt: 461 Z-score: 307.7 bits: 66.3 E(32554): 8.1e-11
Smith-Waterman score: 515; 34.4% identity (66.0% similar) in 282 aa overlap (24-297:45-315)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MLTKPLQGPPAPPGTPTPPPGGKDREAFEAEYRLGPLLGKGGFGTV-FAGHRL
:.. ..::: .:::.:. : .: : :
CCDS53 DTEQPTLGHLDSKPSSKSNMIRGRNSATSADEQPHIGNYRLLKTIGKGNFAKVKLARHIL
20 30 40 50 60 70
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 TDRLQVAIKVIPRNRVLGWSPLSDSVTCPLEVALLWKVGAGGGHPGVIRLLDWFETQEGF
: . .::.:.: ... :. : :. :: .. :: .::....:.. .::.. .
CCDS53 TGK-EVAVKIIDKTQ-LNSSSLQKLFR---EVRIM-KVL---NHPNIVKLFEVIETEKTL
80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 MLVLERPLPAQDLFDYITEKGPLGEGPSRCFFGQVVAAIQHCHSRGVVHRDIKDENILID
.::.: . ..:::.. .: . : .: : :.:.:.:.::.. .::::.: ::.:.:
CCDS53 YLVMEYA-SGGEVFDYLVAHGRMKEKEARAKFRQIVSAVQYCHQKFIVHRDLKAENLLLD
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 LRRGCAKLIDFG-SGALLHDEPYTDFDGTRVYSPPEWISRHQYHALPATVWSLGILLYDM
. :. ::: :. . . : :. :. :: .. ..: . . :::::..:: .
CCDS53 ADMN-IKIADFGFSNEFTFGNKLDTFCGSPPYAAPELFQGKKYDGPEVDVWSLGVILYTL
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280
pF1KE0 VCGDIPF------ERDQEILEAELHFPAHVSPDCCALIRRCLAPKPSSRPSLEEILLDPW
: :..:: : ...:... ..: ..: :: :... : .::.: .::.:. : :
CCDS53 VSGSLPFDGQNLKELRERVLRGKYRIPFYMSTDCENLLKKFLILNPSKRGTLEQIMKDRW
250 260 270 280 290 300
290 300 310
pF1KE0 MQTPAEDVPLNPSKGGPAPLAWSLLP
:.. :: :.:
CCDS53 MNVGHEDDELKPYVEPLPDYKDPRRTELMVSMGYTREEIQDSLVGQRYNEVMATYLLLGY
310 320 330 340 350 360
>>CCDS53650.1 MARK2 gene_id:2011|Hs108|chr11 (719 aa)
initn: 465 init1: 259 opt: 461 Z-score: 307.6 bits: 66.3 E(32554): 8.2e-11
Smith-Waterman score: 515; 34.4% identity (66.0% similar) in 282 aa overlap (24-297:45-315)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MLTKPLQGPPAPPGTPTPPPGGKDREAFEAEYRLGPLLGKGGFGTV-FAGHRL
:.. ..::: .:::.:. : .: : :
CCDS53 DTEQPTLGHLDSKPSSKSNMIRGRNSATSADEQPHIGNYRLLKTIGKGNFAKVKLARHIL
20 30 40 50 60 70
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 TDRLQVAIKVIPRNRVLGWSPLSDSVTCPLEVALLWKVGAGGGHPGVIRLLDWFETQEGF
: . .::.:.: ... :. : :. :: .. :: .::....:.. .::.. .
CCDS53 TGK-EVAVKIIDKTQ-LNSSSLQKLFR---EVRIM-KVL---NHPNIVKLFEVIETEKTL
80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 MLVLERPLPAQDLFDYITEKGPLGEGPSRCFFGQVVAAIQHCHSRGVVHRDIKDENILID
.::.: . ..:::.. .: . : .: : :.:.:.:.::.. .::::.: ::.:.:
CCDS53 YLVMEYA-SGGEVFDYLVAHGRMKEKEARAKFRQIVSAVQYCHQKFIVHRDLKAENLLLD
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 LRRGCAKLIDFG-SGALLHDEPYTDFDGTRVYSPPEWISRHQYHALPATVWSLGILLYDM
. :. ::: :. . . : :. :. :: .. ..: . . :::::..:: .
CCDS53 ADMN-IKIADFGFSNEFTFGNKLDTFCGSPPYAAPELFQGKKYDGPEVDVWSLGVILYTL
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280
pF1KE0 VCGDIPF------ERDQEILEAELHFPAHVSPDCCALIRRCLAPKPSSRPSLEEILLDPW
: :..:: : ...:... ..: ..: :: :... : .::.: .::.:. : :
CCDS53 VSGSLPFDGQNLKELRERVLRGKYRIPFYMSTDCENLLKKFLILNPSKRGTLEQIMKDRW
250 260 270 280 290 300
290 300 310
pF1KE0 MQTPAEDVPLNPSKGGPAPLAWSLLP
:.. :: :.:
CCDS53 MNVGHEDDELKPYVEPLPDYKDPRRTELMVSMGYTREEIQDSLVGQRYNEVMATYLLLGY
310 320 330 340 350 360
>>CCDS8051.2 MARK2 gene_id:2011|Hs108|chr11 (724 aa)
initn: 465 init1: 259 opt: 461 Z-score: 307.5 bits: 66.3 E(32554): 8.3e-11
Smith-Waterman score: 515; 34.4% identity (66.0% similar) in 282 aa overlap (24-297:45-315)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MLTKPLQGPPAPPGTPTPPPGGKDREAFEAEYRLGPLLGKGGFGTV-FAGHRL
:.. ..::: .:::.:. : .: : :
CCDS80 DTEQPTLGHLDSKPSSKSNMIRGRNSATSADEQPHIGNYRLLKTIGKGNFAKVKLARHIL
20 30 40 50 60 70
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 TDRLQVAIKVIPRNRVLGWSPLSDSVTCPLEVALLWKVGAGGGHPGVIRLLDWFETQEGF
: . .::.:.: ... :. : :. :: .. :: .::....:.. .::.. .
CCDS80 TGK-EVAVKIIDKTQ-LNSSSLQKLFR---EVRIM-KVL---NHPNIVKLFEVIETEKTL
80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 MLVLERPLPAQDLFDYITEKGPLGEGPSRCFFGQVVAAIQHCHSRGVVHRDIKDENILID
.::.: . ..:::.. .: . : .: : :.:.:.:.::.. .::::.: ::.:.:
CCDS80 YLVMEYA-SGGEVFDYLVAHGRMKEKEARAKFRQIVSAVQYCHQKFIVHRDLKAENLLLD
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 LRRGCAKLIDFG-SGALLHDEPYTDFDGTRVYSPPEWISRHQYHALPATVWSLGILLYDM
. :. ::: :. . . : :. :. :: .. ..: . . :::::..:: .
CCDS80 ADMN-IKIADFGFSNEFTFGNKLDTFCGSPPYAAPELFQGKKYDGPEVDVWSLGVILYTL
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